View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13095_high_4 (Length: 477)

Name: NF13095_high_4
Description: NF13095
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13095_high_4
NF13095_high_4
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (7-462)||(37015855-37016310)
chr1 (7-462)||(50116428-50116883)
chr1 (7-462)||(38691604-38692059)
chr1 (7-462)||(46974105-46974560)
chr1 (7-462)||(41454778-41455233)
chr1 (7-462)||(29355353-29355808)
chr1 (7-462)||(12649244-12649697)
chr1 (7-462)||(13174722-13175177)
chr1 (7-462)||(13630357-13630812)
chr1 (19-462)||(51663211-51663654)
chr1 (7-462)||(3947126-3947581)
chr1 (7-462)||(3984054-3984509)
chr1 (7-462)||(38774780-38775235)
chr1 (7-462)||(44466523-44466978)
chr1 (7-462)||(20350397-20350852)
chr1 (26-458)||(5078895-5079327)
chr1 (7-463)||(21943028-21943484)
chr1 (7-325)||(44619905-44620223)
chr1 (7-271)||(7980068-7980332)
chr1 (55-387)||(26466010-26466342)
chr1 (7-442)||(32106328-32106760)
chr1 (313-462)||(19498129-19498277)
chr1 (7-259)||(16246622-16246871)
chr1 (55-431)||(25231291-25231667)
chr1 (77-181)||(36360466-36360570)
chr1 (77-180)||(18887570-18887673)
chr1 (77-181)||(45472363-45472467)
chr1 (77-181)||(7403629-7403733)
chr1 (77-181)||(28862901-28863005)
chr1 (77-276)||(25593679-25593878)
chr1 (401-463)||(36360184-36360246)
chr1 (140-186)||(39914011-39914057)
chr1 (401-444)||(18887477-18887520)
chr1 (401-463)||(7403953-7404015)
chr1 (401-463)||(45472687-45472749)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (7-462)||(35965410-35965865)
chr8 (7-462)||(43370708-43371163)
chr8 (7-462)||(43688836-43689291)
chr8 (7-462)||(45455317-45455772)
chr8 (7-462)||(7341020-7341475)
chr8 (7-462)||(30304275-30304730)
chr8 (7-462)||(32377573-32378028)
chr8 (7-462)||(32431530-32431985)
chr8 (7-460)||(7168841-7169285)
chr8 (7-462)||(8422521-8422976)
chr8 (7-462)||(2145664-2146110)
chr8 (7-392)||(39751763-39752148)
chr8 (7-397)||(1115713-1116103)
chr8 (26-210)||(22580864-22581047)
chr8 (296-462)||(22581058-22581224)
chr8 (77-442)||(14401458-14401824)
chr8 (77-181)||(44320872-44320976)
chr8 (77-183)||(17316471-17316577)
chr8 (77-181)||(45116258-45116362)
chr8 (77-183)||(17340021-17340127)
chr8 (401-463)||(45116582-45116644)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (13-462)||(18537001-18537450)
chr5 (7-458)||(7799675-7800126)
chr5 (7-462)||(4202604-4203059)
chr5 (7-462)||(34078721-34079176)
chr5 (7-462)||(25895762-25896221)
chr5 (7-462)||(27866510-27866965)
chr5 (20-462)||(37819542-37819984)
chr5 (20-463)||(28885072-28885515)
chr5 (7-462)||(11032117-11032572)
chr5 (7-462)||(38858855-38859310)
chr5 (34-462)||(7020545-7020973)
chr5 (7-431)||(13566787-13567222)
chr5 (139-458)||(1036424-1036743)
chr5 (24-462)||(20285967-20286404)
chr5 (7-218)||(1035459-1035670)
chr5 (202-462)||(20287404-20287665)
chr5 (72-207)||(20286515-20286650)
chr5 (7-130)||(33994192-33994315)
chr5 (55-306)||(23028381-23028639)
chr5 (7-82)||(31097980-31098055)
chr5 (55-183)||(13157978-13158106)
chr5 (77-181)||(6552800-6552904)
chr5 (77-181)||(42343502-42343606)
chr5 (77-181)||(43295232-43295336)
chr5 (77-181)||(27013615-27013719)
chr5 (77-183)||(25048408-25048515)
chr5 (129-179)||(11819279-11819329)
chr5 (77-159)||(30617320-30617402)
chr5 (401-454)||(27013342-27013395)
chr5 (401-463)||(11819551-11819613)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (7-462)||(36816181-36816636)
chr3 (6-462)||(14399495-14399951)
chr3 (7-462)||(7841681-7842135)
chr3 (7-462)||(46991911-46992366)
chr3 (7-462)||(48249532-48249987)
chr3 (7-462)||(21954904-21955358)
chr3 (7-462)||(6504620-6505075)
chr3 (7-462)||(77685-78140)
chr3 (7-462)||(7838537-7838992)
chr3 (7-462)||(13746386-13746841)
chr3 (7-462)||(16445561-16446016)
chr3 (7-462)||(6741828-6742283)
chr3 (7-462)||(3949684-3950139)
chr3 (7-462)||(8159648-8160103)
chr3 (7-450)||(9428510-9428953)
chr3 (7-462)||(30946307-30946762)
chr3 (7-278)||(29930309-29930580)
chr3 (7-278)||(29979463-29979734)
chr3 (274-462)||(29908027-29908214)
chr3 (274-462)||(29949193-29949380)
chr3 (274-462)||(29998347-29998534)
chr3 (7-169)||(50954214-50954376)
chr3 (77-233)||(33399546-33399702)
chr3 (77-181)||(2285003-2285107)
chr3 (77-181)||(9556727-9556831)
chr3 (77-181)||(51548479-51548583)
chr3 (77-276)||(1275240-1275438)
chr3 (77-276)||(4510287-4510486)
chr3 (77-181)||(4120740-4120843)
chr3 (70-170)||(8263742-8263842)
chr3 (77-181)||(32426622-32426726)
chr3 (77-181)||(40468155-40468259)
chr3 (129-183)||(12491150-12491204)
chr3 (408-463)||(9556428-9556483)
chr3 (401-463)||(12491422-12491484)
chr3 (77-186)||(8117600-8117709)
chr3 (77-186)||(25059882-25059991)
chr3 (7-47)||(11389065-11389105)
chr3 (430-462)||(28610584-28610616)
chr3 (401-463)||(4120458-4120520)
chr3 (401-463)||(40467872-40467934)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (7-462)||(17010-17465)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (13-462)||(31147269-31147718)
chr6 (7-462)||(18606937-18607392)
chr6 (7-462)||(29287618-29288067)
chr6 (7-462)||(1611416-1611871)
chr6 (63-462)||(21358015-21358411)
chr6 (63-462)||(23961997-23962393)
chr6 (7-304)||(28250837-28251134)
chr6 (7-306)||(24220107-24220408)
chr6 (7-197)||(7362120-7362310)
chr6 (305-462)||(28357557-28357714)
chr6 (7-163)||(7362307-7362463)
chr6 (7-107)||(35243544-35243644)
chr6 (7-100)||(13387721-13387814)
chr6 (77-186)||(34111603-34111712)
chr6 (77-181)||(22864817-22864921)
chr6 (7-67)||(23985364-23985424)
chr6 (401-463)||(9095463-9095525)
chr6 (129-179)||(26684976-26685026)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (7-462)||(24604754-24605209)
chr2 (7-462)||(43948947-43949402)
chr2 (7-462)||(436252-436707)
chr2 (7-462)||(12907157-12907612)
chr2 (7-462)||(41007645-41008100)
chr2 (7-462)||(28354567-28355022)
chr2 (7-462)||(24750599-24751054)
chr2 (7-462)||(11692480-11692934)
chr2 (7-462)||(27275025-27275480)
chr2 (7-462)||(45476305-45476753)
chr2 (7-462)||(34920447-34920892)
chr2 (7-462)||(212106-212561)
chr2 (7-462)||(3802231-3802686)
chr2 (7-462)||(10623119-10623574)
chr2 (7-462)||(39794911-39795366)
chr2 (7-462)||(5348108-5348563)
chr2 (7-462)||(41560953-41561408)
chr2 (7-462)||(38946704-38947159)
chr2 (104-462)||(9655194-9655552)
chr2 (162-462)||(1098491-1098791)
chr2 (13-462)||(17996837-17997286)
chr2 (7-268)||(7263973-7264234)
chr2 (7-168)||(1100042-1100203)
chr2 (315-462)||(7264229-7264376)
chr2 (7-106)||(9652132-9652231)
chr2 (77-181)||(9639183-9639287)
chr2 (422-462)||(24941315-24941355)
chr2 (115-179)||(28423423-28423487)
chr2 (77-186)||(21535200-21535309)
chr2 (401-462)||(21535524-21535585)
chr2 (125-170)||(24683458-24683503)
chr2 (401-454)||(28423147-28423200)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (15-462)||(4976704-4977151)
chr4 (7-462)||(11502447-11502902)
chr4 (7-462)||(9890963-9891418)
chr4 (7-462)||(4978623-4979074)
chr4 (7-462)||(19072322-19072777)
chr4 (7-462)||(49565129-49565584)
chr4 (7-462)||(21471735-21472189)
chr4 (20-462)||(3404744-3405186)
chr4 (7-462)||(41024141-41024595)
chr4 (13-414)||(51643211-51643614)
chr4 (115-462)||(4769179-4769530)
chr4 (143-462)||(38463502-38463821)
chr4 (7-341)||(18580117-18580448)
chr4 (176-462)||(44049720-44050006)
chr4 (55-460)||(6182665-6183072)
chr4 (7-100)||(38463824-38463917)
chr4 (7-111)||(17140530-17140634)
chr4 (77-181)||(17916198-17916302)
chr4 (77-181)||(4617714-4617818)
chr4 (77-183)||(1590845-1590950)
chr4 (81-181)||(46517380-46517480)
chr4 (77-181)||(32716305-32716409)
chr4 (401-463)||(1591168-1591230)
chr4 (401-463)||(17916521-17916583)
chr4 (140-186)||(20971446-20971492)
chr4 (401-463)||(32716628-32716690)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (7-462)||(47061824-47062279)
chr7 (7-462)||(18106329-18106784)
chr7 (7-462)||(43622800-43623255)
chr7 (20-462)||(42500361-42500803)
chr7 (7-462)||(617414-617869)
chr7 (7-462)||(30787480-30787935)
chr7 (7-462)||(45764320-45764775)
chr7 (7-462)||(43827272-43827726)
chr7 (7-463)||(8400527-8400983)
chr7 (20-343)||(15060568-15060890)
chr7 (7-214)||(21799953-21800160)
chr7 (339-462)||(15067162-15067285)
chr7 (77-181)||(46791336-46791440)
chr7 (77-276)||(8194131-8194330)
chr7 (77-181)||(45172855-45172959)
chr7 (77-180)||(40445512-40445615)
chr7 (77-186)||(20908458-20908567)
chr7 (77-181)||(47867442-47867546)
chr7 (77-181)||(1296997-1297101)
chr7 (77-272)||(16794468-16794663)
chr7 (77-178)||(40793934-40794035)
chr7 (77-181)||(43379254-43379358)
chr7 (401-463)||(16795760-16795822)
chr7 (401-463)||(43378972-43379034)
chr7 (140-276)||(3761979-3762115)
chr7 (401-463)||(1297321-1297383)
chr7 (401-463)||(16794277-16794339)
chr7 (401-454)||(45172582-45172635)
chr7 (151-183)||(16796810-16796842)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (7-462)||(1822-2277)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (7-462)||(16022-16477)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (7-462)||(33750-34205)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (7-383)||(12203-12580)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (7-202)||(95-290)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (77-181)||(3847-3951)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 37015855 - 37016310
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015855 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 37015954  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015955 gagctggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtgcgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 37016054  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016055 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 37016154  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016155 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 37016254  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016255 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 37016310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 50116883 - 50116428
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50116883 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaataaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcactaccatgcgatg 50116784  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50116783 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgttcgtgacttgaccaagagttagatgcttccaagaaata 50116684  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116683 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 50116584  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116583 gaagccgttgcaatatctaatgtcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 50116484  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116483 gctcatctaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 50116428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38692059 - 38691604
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38692059 aagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 38691960  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691959 gagccgactttagaaggacacgttcttgccggtaaattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 38691860  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38691859 ttttgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaa 38691760  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691759 gaagccgttgcaatatctaatctcgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 38691660  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38691659 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttttcaacggttttggttatgga 38691604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 46974105 - 46974560
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46974105 aagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagtttacaaccatgcgatg 46974204  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974205 gagccgactttagaaggacacattcttgccggtacattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 46974304  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46974305 ttttgatacatttaaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaaacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaa 46974404  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974405 gaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 46974504  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46974505 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatcttccaacggttttggttatgga 46974560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 41454778 - 41455233
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41454778 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 41454877  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454878 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 41454977  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41454978 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 41455077  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455078 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgg 41455177  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455178 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 41455233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29355808 - 29355353
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29355808 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 29355709  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355708 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 29355609  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29355608 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 29355509  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  29355508 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 29355409  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355408 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 29355353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12649697 - 12649244
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12649697 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtgggtatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 12649598  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649597 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtaaattaa--gagcacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 12649500  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12649499 ttttgatacatttgaaaaataaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaa 12649400  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649399 gaagtcgttgcaatatctaatatctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 12649300  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649299 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 12649244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 13174722 - 13175177
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13174722 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattaatggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgtggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 13174821  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13174822 gagccggctttaggaggacacattctcgctggtagattaaaggaggacgacaagaagattgttcgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaataaata 13174921  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13174922 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 13175021  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13175022 gaagccgttgcaatttctaatttcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgt 13175121  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13175122 gctcatccaacatccgctaagttgtttaacaaatttccagcggttttggttatgga 13175177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 13630357 - 13630812
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13630357 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 13630456  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13630457 gagccggctttagaaggacacattctttccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 13630556  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13630557 ttttgatacatttgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 13630656  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  13630657 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgg 13630756  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630757 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 13630812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 462
Target Start/End: Original strand, 51663211 - 51663654
Alignment:
Q  19 gtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggcttta 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51663211 gtgcttgttcatgattagtgaatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacattcttaatggagctcacaaccatgcgatgaagccggcttta 51663310  T
Q  119 gaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatt 218  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51663311 gaatgacacattcttgctggtagattaaaggaggaggacaagaagattgtacgcgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatt 51663410  T
Q  219 tgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51663411 tgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgca 51663510  T
Q  319 atatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaaca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663511 atatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaaca 51663610  T
Q  419 tccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51663611 tcctttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatgga 51663654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3947581 - 3947126
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3947581 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 3947482  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947481 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 3947382  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3947381 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 3947282  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  3947281 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 3947182  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947181 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 3947126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 3984054 - 3984509
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3984054 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 3984153  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984154 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 3984253  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3984254 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 3984353  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  3984354 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 3984453  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984454 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 3984509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38775235 - 38774780
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38775235 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 38775136  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775135 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 38775036  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38775035 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaa 38774936  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38774935 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 38774836  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774835 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 38774780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 44466523 - 44466978
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44466523 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 44466622  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466623 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 44466722  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44466723 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 44466822  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  44466823 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 44466922  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466923 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 44466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 20350397 - 20350852
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20350397 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattaaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 20350496  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350497 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 20350596  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20350597 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 20350696  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20350697 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 20350796  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350797 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 20350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 458
Target Start/End: Original strand, 5078895 - 5079327
Alignment:
Q  26 ttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5078895 ttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggac 5078994  T
Q  126 acattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaa 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5078995 acattcttgccggtagattaaaggaggacggcaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttaatacatttgaagaa 5079094  T
Q  226 caaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5079095 ccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttcta 5079194  T
Q  326 atctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgtta 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5079195 atctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccatta 5079294  T
Q  426 agttgtttaacaattttccaacggttttggtta 458  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5079295 agttgtttaacaattttcaaacggttttggtta 5079327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21943484 - 21943028
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21943484 aagaaaatgtgggtgcttgtttatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggaatggggattgaacattctcaatggagttcacaaccatgggatg 21943385  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943384 gagccgggtttagaaggacacattcttaccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 21943285  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21943284 ttttgataaatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtcaaacaagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaa 21943185  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943184 gaaactgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 21943085  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21943084 gctcatccatcattcgttaagttgtttaacaaattttcaacggttttggttatggat 21943028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44620223 - 44619905
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44620223 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 44620124  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44620123 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 44620024  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44620023 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 44619924  T
Q  307 gaagccgttgcaatatcta 325  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44619923 gaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7980332 - 7980068
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7980332 aagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatg 7980233  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980232 cagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 7980133  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980132 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 7980068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26466342 - 26466010
Alignment:
Q  55 aacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 154  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  26466342 aacaaatgattggagattaaacattcttaatggagttcacaaccatgagatggagccggctttagaatgacacatgcttgcgggtagattaaaggaggat 26466243  T
Q  155 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtga 254  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |    
T  26466242 gataagaagattgtacgtgacttgaccaagactaaggtgcttccaagaaatattttgttaaatttgaagaacaaaaaacaagattgcatgacaaatatca 26466143  T
Q  255 agcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatac 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| | || | |  |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  26466142 agcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagttgaaggagcacaactatgt 26466043  T
Q  355 ttattactcaagaacacaaagtgaaagtactac 387  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26466042 ttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactac 26466010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32106760 - 32106328
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaa-caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgat 105  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||  || ||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||    
T  32106760 aagaaaatgtgggtgaatgttcatggttcgtggatatcttag-aaggtaaacaaatgattggagattgaatattcttaa--gagttcacaatcatgagat 32106664  T
Q  106 ggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaat 205  Q
    ||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||   | |||||  || ||||    
T  32106663 ggagccaagtttagaaggacacatgattgctggtagattaaaggagaatgacaaaaagcttgtatgtgacttgaccaagagtttggtgctttgaaaaaat 32106564  T
Q  206 atttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgaca 305  Q
    | || | || ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  32106563 agttgt-taaatttgaagagcaaaagacaagattgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgaca 32106465  T
Q  306 agaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttg 405  Q
    ||| |  | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||     
T  32106464 agacgatgatgcattatataatctcaaagttggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatatttta 32106365  T
Q  406 ggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatttt 442  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32106364 agctcatccaacatccattaagttgtttaacaatttt 32106328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 313 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19498129
Alignment:
Q  313 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagata-cttttgggctcat 19498179  T
Q  413 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 19498129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16246871 - 16246622
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||   ||| |  |||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16246871 aagaaaatgtgggtgtatgttcatggttagtgaatatctgtgtaggcaaacaaatgaatggagattgaa-attgttaatgaagttcacaaccatgcgatg 16246773  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  16246772 gagccgactttagaaggacacatgcttaccggtagattaaaagaggatgacaagaagattgtacgtgactt-accaaaagcaaggtgcatccaag-aata 16246675  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaa 259  Q
    ||||  || |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||| | ||||||    
T  16246674 ttttgttaaatttgaagagaaaaagacaagattgcataacaaatatcaagcaa 16246622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 431
Target Start/End: Original strand, 25231291 - 25231667
Alignment:
Q  55 aacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 154  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| || || | ||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||     
T  25231291 aacaaatgactggagattgaatattttcaatggagttcacaaccgtgagacgaagccaagtttggaaggacacatgcttgcaggtagatcaagggaggat 25231390  T
Q  155 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtga 254  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |   | |||||  || |||||||||  || ||||||| |  ||||||  | | |||||||||||| | |    
T  25231391 accaagaagattgtacgtgacttgaccaaatgtttggtgcttttaacaaatattttgttaaatttgaaaagaaaaagataagagtgcatgacaaatatca 25231490  T
Q  255 agcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatac 354  Q
    ||||||| |||||  ||||  || || |||  ||| |||| |||||| ||| || |  | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||      
T  25231491 agcaagtatacaactaacggaaaaaattattcaagtcaaacagaggtaacatgacggtgatgcagtatctaatctcaaaattggaggagcacaactatgt 25231590  T
Q  355 ttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 431  Q
    ||||| | | | |||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25231591 ttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacatacgttaagttgt 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 36360570 - 36360466
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36360570 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcagtatgtagcaggacacattcttgtcggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 36360471  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  36360470 tgacc 36360466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18887673 - 18887570
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18887673 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 18887574  T
Q  177 tgac 180  Q
    ||||    
T  18887573 tgac 18887570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 45472363 - 45472467
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45472363 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgtggtatgtagtagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 45472462  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  45472463 tgacc 45472467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 7403629 - 7403733
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7403629 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcactttattgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtatatgact 7403728  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  7403729 tgacc 7403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 28862901 - 28863005
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28862901 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatgaaggacgacaagaagattgtacatgact 28863000  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  28863001 tgacc 28863005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 25593679 - 25593878
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||   ||||| ||| ||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25593679 attcttaatggtgttcacaaccataagatgttgccatatttagcagggcaccttcttgcgggaatattaatggaggacgacaaggcgattgtatgtgact 25593778  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtca 276  Q
    ||||||| ||   | |    |||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| | | | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  25593779 tgaccaatagttcggtaaaaccaaaaaatattttgacaaatttgaagaagaaaagacaagagtccatgacaaatatcaaacaagtctacaatgaacgtca 25593878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360184
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggat 36360184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 186
Target Start/End: Original strand, 39914011 - 39914057
Alignment:
Q  140 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 186  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914011 agattaatgaaggatgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 39914057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18887520 - 18887477
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttcc 444  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18887520 ttttggtctcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttcc 18887477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404015
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggat 7404015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472749
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggat 45472749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35965865 - 35965410
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965865 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 35965766  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965765 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 35965666  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965665 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 35965566  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35965565 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgg 35965466  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965465 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 35965410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 43370708 - 43371163
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43370708 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggtttgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 43370807  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43370808 gagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 43370907  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43370908 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaa 43371007  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371008 gaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 43371107  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371108 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 43371163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43689291 - 43688836
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689291 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggatttaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 43689192  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43689191 gagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaagaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttcgaagaaata 43689092  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43689091 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataa 43688992  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43688991 gaagccgttgcaatttctaatttcgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgg 43688892  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688891 gctcatccaaaatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 43688836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 45455317 - 45455772
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45455317 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattggacattcttaatggagttaacaaccatgcgatg 45455416  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45455417 gagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaaatgcttccaagaaata 45455516  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45455517 ttttgatacatttgaagaacaaaataccatattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaa 45455616  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  45455617 aaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgg 45455716  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45455717 gctcatccaacatccgttaagttgtttaaaatttttccaacggttttggttatgga 45455772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 7341020 - 7341475
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7341020 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 7341119  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341120 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 7341219  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7341220 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 7341319  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  7341320 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 7341419  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341420 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 7341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 30304730 - 30304275
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30304730 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 30304631  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304630 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 30304531  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30304530 ttttgatacacttgaagaaccatagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 30304431  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  30304430 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 30304331  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304330 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 30304275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32378028 - 32377573
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32378028 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 32377929  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377928 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 32377829  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32377828 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 32377729  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  32377728 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 32377629  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377628 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 32377573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 32431985 - 32431530
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32431985 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 32431886  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431885 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 32431786  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32431785 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 32431686  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  32431685 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 32431586  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431585 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 32431530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 7168841 - 7169285
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7168841 aagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggagtggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 7168940  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7168941 gagccgactttagaaggatacattcttgctagtagattaaaggaggacgacaagatgattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 7169040  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  7169041 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattccatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---- 7169136  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
         ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169137 -----cgttgcaatatataatctcaaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 7169231  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatg 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7169232 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatg 7169285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8422976 - 8422521
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  8422976 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattaaacattcttaatggagttcacaactatcccatg 8422877  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422876 gagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 8422777  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8422776 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 8422677  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  8422676 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 8422577  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422576 gctcatccaacatccattatattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 8422521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 2146110 - 2145664
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2146110 aagaaaatgtggatgcttgttcgtgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggagattgaacatttttaatggagttcacaaccatgcgatg 2146011  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||    
T  2146010 gagccgactttagaaggacatattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtac--------------aacaagatgcttccaagaaata 2145925  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-----gaggt 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||    
T  2145924 ttttgatacatttgaagaacaaaagatcacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggt 2145825  T
Q  302 gacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatct 401  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145824 gacaagaagttgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatct 2145725  T
Q  402 tttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145724 tttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 2145664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 7 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39752148 - 39751763
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39752148 aagaaaatgtggatgtttgttcatgattggtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatg 39752049  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    || |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39752048 gaaccggctttagaatgacatatttatgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 39751949  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751948 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 39751849  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcg 392  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751848 gaaaccattgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcg 39751763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 7 - 397
Target Start/End: Original strand, 1115713 - 1116103
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  1115713 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccata 1115812  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115813 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatagtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 1115912  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1115913 ttttgatacaattgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaaacaaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 1116012  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagat 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||    
T  1116013 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagat 1116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 210
Target Start/End: Original strand, 22580864 - 22581047
Alignment:
Q  26 ttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22580864 ttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaag-aatggggattgaacattcttaatggagtttacaaccatgcgatggagccgactttagaaggac 22580962  T
Q  126 acattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580963 acattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttt 22581047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 296 - 462
Target Start/End: Original strand, 22581058 - 22581224
Alignment:
Q  296 agaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaag 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22581058 agaggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaa 22581157  T
Q  396 atatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22581158 atatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatgga 22581224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14401824 - 14401458
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtac--gtga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| |||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||   |||    
T  14401824 attcttaatggagttcacaaccatgaattggtgccaagtttagaatggcacattcttgcaggaagattaagggatgatgacaagaagattgtacatatga 14401725  T
Q  175 cttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgt 274  Q
    ||||||||||||   | |||  |||| ||||||||| ||  |||||||| | |||| || | | ||  | |||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  14401724 cttgaccaagagtttggtgccaccaaaaaatattttgatgaatttgaaggaaaaaaaacaagagtgtctcacaaatataaaacaagtatacaatgaacgt 14401625  T
Q  275 caacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaa 374  Q
    ||| ||||    | | |||  |||| |||||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| |||  |||  ||||| | | | |||||||     
T  14401624 caaaaaatcaaaaggtcaagcagagatgacaagacgaagatgcaatatatagtctcaaagttggaggagtacatatatgtttatttcaccataacacaat 14401525  T
Q  375 gtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatttt 442  Q
    ||||||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||    
T  14401524 gtgaaagta-tactattcatgatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttt 14401458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 44320872 - 44320976
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44320872 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagataaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 44320971  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  44320972 tgacc 44320976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 17316471 - 17316577
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||   ||   |||||| || ||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17316471 attcttaatggaattcacaaccatgagatgtttccatatttagatgggcaccttcttgcaagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacgtgact 17316570  T
Q  177 tgaccaa 183  Q
    |||||||    
T  17316571 tgaccaa 17316577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 45116258 - 45116362
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45116258 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttctttccggaagattaatggaggatgacaagaagattgtacatgact 45116357  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  45116358 tgacc 45116362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 17340021 - 17340127
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  | |   |||||| || ||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17340021 attcttaatggaattcacaaccatgagatgttgtcatatttagatgggcaccttcttgcaagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 17340120  T
Q  177 tgaccaa 183  Q
    |||||||    
T  17340121 tgaccaa 17340127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116644
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggat 45116644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18537450 - 18537001
Alignment:
Q  13 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18537450 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagaaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgattgagcca 18537351  T
Q  113 gctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  18537350 gctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagtgagatgcttccaagaaatattttga 18537251  T
Q  213 tacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537250 tacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagcc 18537151  T
Q  313 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537150 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 18537051  T
Q  413 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18537050 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggttttggttatgga 18537001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 7800126 - 7799675
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7800126 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgggaattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 7800027  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7800026 gagccggctttagaaggacacattcttgtcggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 7799927  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7799926 ttttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaa 7799827  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799826 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 7799727  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggtta 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799726 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggtta 7799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4203059 - 4202604
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203059 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaaagatgattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 4202960  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4202959 gagccggctttagaaggacacactcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgatcaagagcaagatgcttccaagtaata 4202860  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202859 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 4202760  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202759 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 4202660  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4202659 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacagttttggttatgga 4202604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 34078721 - 34079176
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  34078721 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcaaaaccatcccatg 34078820  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078821 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 34078920  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078921 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 34079020  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34079021 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgg 34079120  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079121 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 34079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 25896221 - 25895762
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25896221 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 25896122  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896121 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 25896022  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896021 ttttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 25895922  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctc----gaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25895921 gaagccgttgcaatatctaatatctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatctt 25895822  T
Q  403 ttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895821 ttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 25895762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27866965 - 27866510
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27866965 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 27866866  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866865 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 27866766  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27866765 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaa 27866666  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27866665 gaaacctttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgg 27866566  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866565 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 27866510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 37819984 - 37819542
Alignment:
Q  20 tgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttag 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37819984 tgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttag 37819885  T
Q  120 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacattt 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37819884 aaggacacattgttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacattt 37819785  T
Q  220 gaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaa 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37819784 gaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaa 37819685  T
Q  320 tatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37819684 tttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 37819585  T
Q  420 ccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819584 ccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 37819542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28885515 - 28885072
Alignment:
Q  20 tgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttag 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28885515 tgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagaaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttag 28885416  T
Q  120 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacattt 219  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28885415 aaggatagattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacattt 28885316  T
Q  220 gaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaa 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28885315 gaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaa 28885216  T
Q  320 tatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28885215 tttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 28885116  T
Q  420 ccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885115 ccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 28885072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11032572 - 11032117
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11032572 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 11032473  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11032472 gagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaaaagcaagatgcttccaagaaata 11032373  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11032372 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 11032273  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11032272 gaaaccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 11032173  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032172 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 11032117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38859310 - 38858855
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38859310 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 38859211  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  38859210 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaaaaacaagatgcttccaagaaata 38859111  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38859110 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 38859011  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38859010 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 38858911  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858910 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 38858855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7020973 - 7020545
Alignment:
Q  34 tagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattctt 133  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020973 tagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattctt 7020874  T
Q  134 gccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7020873 gccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtatgtgacttgaccaagaggaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagac 7020774  T
Q  234 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7020773 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaa 7020674  T
Q  334 gttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgttt 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7020673 gttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgttt 7020574  T
Q  434 aacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020573 aacaattttccaacggttttggttatgga 7020545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13567222 - 13566787
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13567222 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaacgtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 13567123  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567122 gagccagctttagaaggacacattcttgccggtagattaaagaaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 13567023  T
Q  207 tttttatacatttgaa-----------gaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaat 295  Q
    |||| |||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567022 ttttgatacatttgaagaagcaagtgtgaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaat 13566923  T
Q  296 agaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaag 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  13566922 agaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaag 13566823  T
Q  396 atatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 431  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13566822 atatcttttgggatcattcaacatccattaagttgt 13566787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 139 - 458
Target Start/End: Original strand, 1036424 - 1036743
Alignment:
Q  139 tagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1036424 tagattaaaggaggacgacaagaatattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacat 1036523  T
Q  239 tgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttgg 338  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036524 tgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttgg 1036623  T
Q  339 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1036624 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagttgtttaacaa 1036723  T
Q  439 ttttccaacggttttggtta 458  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1036724 ttttccaacggttttggtta 1036743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 462
Target Start/End: Original strand, 20285967 - 20286404
Alignment:
Q  24 tgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaagg 123  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||| |  |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20285967 tgttcatggtaagtggatatcttagtaggcaaacaaatgaatggaaactgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatggagccggctttagaagg 20286066  T
Q  124 acacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaag 223  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  20286067 acacatgcttgcgggtagattaaaggaggatgacaagaagattgtatgtgacttaaccaagagtaaggtgcttccaagaaatattttgttaaatttgaag 20286166  T
Q  224 aacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatc 323  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    | |||| | ||    
T  20286167 agcaaaagacaagattgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttc 20286266  T
Q  324 taatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgt 423  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  20286267 taatctcaaagttggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgc 20286366  T
Q  424 taagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    | ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20286367 ttagttg-ttatgaattttccaacagttttggttatgga 20286404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1035670 - 1035459
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1035670 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgccatg 1035571  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035570 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaatattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 1035471  T
Q  207 tttttatacatt 218  Q
    |||| |||||||    
T  1035470 ttttgatacatt 1035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 462
Target Start/End: Original strand, 20287404 - 20287665
Alignment:
Q  202 aaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggt 301  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  20287404 aaatattttgttaaatttgaagagcaaaagacaagattgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggt 20287503  T
Q  302 gacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatct 401  Q
    ||||||| |  ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |  || |||||||||| || ||||| || |    
T  20287504 gacaagacggggttccagtttctaatctcaaagttggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatat 20287603  T
Q  402 tttgggctcatccaacatccgttaag-ttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20287604 tttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaacaattttccaacggttctggttatgga 20287665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Original strand, 20286515 - 20286650
Alignment:
Q  72 tgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  20286515 tgaacattcttaatggagtttacaaccatgtgatggagccggctttagaaggacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatgacaaaaagattgtaca 20286614  T
Q  172 tgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatat 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20286615 tgacttgaccaagagtaaggtgcatccaagaaatat 20286650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 33994192 - 33994315
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33994192 aagaaaatatgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaacgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatg 33994291  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacatt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33994292 gagccggctttagaaggacacatt 33994315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23028639 - 23028381
Alignment:
Q  55 aacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 154  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |   |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||     
T  23028639 aacaaatgattggagattgaatattattaatggagttcacaaccatgagatgaaggcaagtttagaagaacacatgcttgcgggtagattaagggaggat 23028540  T
Q  155 gacaagaagattgtac-------gtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaca 247  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||  || |||||||||  ||||||  | | |||||||||    
T  23028539 gacaagaagattgtacatgattggtgacttgaccaagagtttgatgctttcaaaaaatattttattaaatttgaagagaaaaagaaaagagtgcatgaca 23028440  T
Q  248 aatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||| || ||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  23028439 aatatcatgcaagtatacaatgaacgtaaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaa 23028381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 31098055 - 31097980
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattctt 82  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31098055 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattctt 31097980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13158106 - 13157978
Alignment:
Q  55 aacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 154  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||     
T  13158106 aacaaatgattggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatgaaatggagtcaaatttaaaaggacgcatgcttgcgggtagattaaaggaggat 13158007  T
Q  155 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 183  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||    
T  13158006 gacaagaaacttgtatgtgacttcaccaa 13157978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 6552800 - 6552904
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6552800 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtgtgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 6552899  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  6552900 tgacc 6552904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 42343502 - 42343606
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42343502 attcttaatggtgttcataaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 42343601  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  42343602 tgacc 42343606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 43295232 - 43295336
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43295232 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcaggccaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgatt 43295331  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  43295332 tgacc 43295336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27013719 - 27013615
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27013719 attcttaatggcattcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccgaaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 27013620  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  27013619 tgacc 27013615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 25048408 - 25048515
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaagga-cacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgac 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||   |||||||||  ||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25048408 attcttaatggtgttcagaacaatgcgatggtgccatatttagaaggggcaacttattgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtatatgac 25048507  T
Q  176 ttgaccaa 183  Q
    ||||||||    
T  25048508 ttgaccaa 25048515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Original strand, 11819279 - 11819329
Alignment:
Q  129 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 179  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11819279 ttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttga 11819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30617402 - 30617320
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaa 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30617402 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaa 30617320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013342
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttg 454  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttg 27013342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819613
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggat 11819613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36816636 - 36816181
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36816636 aagaaaatgtggttgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 36816537  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816536 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 36816437  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816436 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 36816337  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36816336 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgg 36816237  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816236 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 36816181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 462
Target Start/End: Original strand, 14399495 - 14399951
Alignment:
Q  6 gaagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgat 105  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14399495 gaagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattctaaatggagttcacaaccatgccat 14399594  T
Q  106 ggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399595 ggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaagaaggatgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaat 14399694  T
Q  206 atttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgaca 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399695 attttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgaca 14399794  T
Q  306 agaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399795 agaagccgttgcaatatctaatctcgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttg 14399894  T
Q  406 ggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399895 ggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 14399951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7842135 - 7841681
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842135 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 7842036  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842035 aagccggctttagaaggacacattcttgcctgtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 7841936  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841935 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 7841836  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841835 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacta-acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 7841737  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841736 gttcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 7841681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 46992366 - 46991911
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992366 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 46992267  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46992266 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatt 46992167  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46992166 ttttgatacatttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatatgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaa 46992067  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992066 gaagccgttgcaatatctaatctttatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 46991967  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991966 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 46991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 48249987 - 48249532
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249987 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 48249888  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249887 gagccggctttataaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagactgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 48249788  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249787 ttttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 48249688  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249687 gaagccgttgcaatatctaatctctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 48249588  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249587 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 48249532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 21955358 - 21954904
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955358 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagtaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 21955259  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955258 gagccggctctagaaggacacattattgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 21955159  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955158 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 21955059  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21955058 gaagccgttgcaatat-taatctcgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgg 21954960  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954959 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 21954904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6505075 - 6504620
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505075 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 6504976  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6504975 gagccggctttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacgaaaagaagattgtacatgacttgaccaagaacaagatgtttccaagaaata 6504876  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6504875 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaa 6504776  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504775 gaagccgttgcaatatctaacctcgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 6504676  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6504675 gctcatccaacatccgttaagttttttaacaattttccaaccgttttggttatgga 6504620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 78140 - 77685
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  78140 aagaaaatgtgagtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatttgatg 78041  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78040 gagccggctttagaaggacacattattgccggtagattaaaggaagacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 77941  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  77940 ttttgatacatttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaa 77841  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  77840 gaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgg 77741  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  77740 gctcatccaacatttgttaagttgtttaacaatttttcaacggttttggttatgga 77685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 7838537 - 7838992
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7838537 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttagtggagttcacaaccatgcgatg 7838636  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7838637 gagccggctttagaaggacacattctttccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaatatgcttccaagaaata 7838736  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7838737 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaa 7838836  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838837 gaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 7838936  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7838937 gctcatccgacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggtcatgga 7838992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13746841 - 13746386
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13746841 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 13746742  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746741 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 13746642  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13746641 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 13746542  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  13746541 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 13746442  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746441 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 13746386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 16445561 - 16446016
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16445561 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 16445660  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16445661 gagccggctttagaaggacacattctttccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 16445760  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16445761 ttttgatacatttgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 16445860  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  16445861 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgg 16445960  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445961 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 16446016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 6741828 - 6742283
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6741828 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 6741927  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741928 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 6742027  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6742028 ttttgatacacttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 6742127  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  6742128 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 6742227  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742228 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 6742283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 3949684 - 3950139
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3949684 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 3949783  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949784 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 3949883  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3949884 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 3949983  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  3949984 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 3950083  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950084 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 3950139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8160103 - 8159648
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8160103 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 8160004  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160003 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 8159904  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8159903 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 8159804  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  8159803 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 8159704  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159703 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 8159648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9428953 - 9428510
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9428953 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 9428854  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9428853 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 9428754  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9428753 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 9428654  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  9428653 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 9428554  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggt 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428553 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 30946762 - 30946307
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30946762 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 30946663  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946662 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 30946563  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946562 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 30946463  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  30946462 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 30946363  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946362 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 30946307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 29930309 - 29930580
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930309 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 29930408  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29930409 atgccggctttagaaggacacattcttggcggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagacata 29930508  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29930509 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29930580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 29979463 - 29979734
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979463 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 29979562  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29979563 atgccggctttagaaggacacattcttggcggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagacata 29979662  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29979663 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29979734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 274 - 462
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908214
Alignment:
Q  274 tcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  374 agtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 29908214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 274 - 462
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949380
Alignment:
Q  274 tcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  374 agtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 29949380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 274 - 462
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998534
Alignment:
Q  274 tcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  374 agtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 29998534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 50954214 - 50954376
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  50954214 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 50954313  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgta 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50954314 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgta 50954376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 233
Target Start/End: Original strand, 33399546 - 33399702
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  33399546 attcttaatggagttcacaaccaagagatgtaacgaagtttagaaagacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatggcaagaagcttgtacgtgact 33399645  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagac 233  Q
    ||||||||||   | ||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  33399646 tgaccaagagtttggtgcttccaaaaaatattttgttaaatttgaagaccaaaagac 33399702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2285107 - 2285003
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2285107 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagtagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 2285008  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  2285007 tgacc 2285003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9556831 - 9556727
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9556831 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgcagtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggagggcgacaagaagattgtacatgact 9556732  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  9556731 tgacc 9556727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 51548583 - 51548479
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51548583 attcttaacggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcaggacaccttcttgccgaaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 51548484  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  51548483 tgacc 51548479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1275438 - 1275240
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||   ||||| | | ||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1275438 attcttaatggtgttcacaaccatgagatagtgccatatttagtatg-caccttcttgtgggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 1275340  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtca 276  Q
    ||||||| ||   ||||   |||| ||||||||| | | |||| ||||| ||||||| | | | ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  1275339 tgaccaatagttcgatgaaaccaaaaaatattttgacaaatttaaagaaaaaaagacaagagtccatgaaaaatatcaagcaagtctacaatgaacgtca 1275240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Original strand, 4510287 - 4510486
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4510287 attctttatggtgttcacaaccacgagatggtgccgtttttagcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaaaattatacatgact 4510386  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtca 276  Q
    ||||||| ||   | ||   |||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| | | |  ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  4510387 tgaccaatagttcggtgaaaccaaaaaatattttgacaaatttgaagaagaaaagacaagagtctatgacaaatatcaagtaagtctacaatgaacgtca 4510486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4120843 - 4120740
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  | ||| ||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4120843 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagggcacct-cttgacggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 4120745  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  4120744 tgacc 4120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 170
Target Start/End: Original strand, 8263742 - 8263842
Alignment:
Q  70 attgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgta 169  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8263742 attgaccattcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggatgacaagaagattgta 8263841  T
Q  170 c 170  Q
    |    
T  8263842 c 8263842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 32426622 - 32426726
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  |  || ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32426622 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgcagcagggcaccttcttaccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 32426721  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  32426722 tgacc 32426726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40468259 - 40468155
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| |||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40468259 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggtaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacattact 40468160  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  40468159 tgacc 40468155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 183
Target Start/End: Original strand, 12491150 - 12491204
Alignment:
Q  129 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 183  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12491150 ttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacacgacttgaccaa 12491204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556428
Alignment:
Q  408 ctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggat 9556428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491484
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggat 12491484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 8117600 - 8117709
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||   ||||| ||| ||| ||||||| || | ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  8117600 attcttaatggtgttcacaaccatgagatgttgccatgtttagcagggcaccttcttgcaggaaaattaatgaaggacgacaaagagattgtacgtgatt 8117699  T
Q  177 tgaccaagag 186  Q
    |||| |||||    
T  8117700 tgactaagag 8117709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25059991 - 25059882
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||   ||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25059991 attcttaatggtgttcacaaccataagatgttaccatatttagcagggcacattcttgcggaaagattaatgaaggacgacaaggagattatatgtgact 25059892  T
Q  177 tgaccaagag 186  Q
    ||||||||||    
T  25059891 tgaccaagag 25059882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 11389105 - 11389065
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaa 47  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389105 aagaaaatgcgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaa 11389065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28610616 - 28610584
Alignment:
Q  430 gtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28610616 gtttaacaattttccaacggttttggttatgga 28610584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120458
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggat 4120458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467872
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggat 40467872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 17010 - 17465
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17010 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatagggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 17109  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17110 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtaagtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 17209  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17210 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 17309  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17310 gaagccgttgaaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttag 17409  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 17465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Original strand, 31147269 - 31147718
Alignment:
Q  13 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147269 atgtgggtggttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccg 31147368  T
Q  113 gctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttta 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31147369 actttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggagaatgacaagaagattgtacgtgacttgatcaagagcaagatgcttccaagtaatattttta 31147468  T
Q  213 tacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147469 tacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatttgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagcc 31147568  T
Q  313 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147569 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 31147668  T
Q  413 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147669 acaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 31147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 18606937 - 18607392
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606937 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 18607036  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607037 gagccgactttagaaggacacattcttgtcgatagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 18607136  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18607137 ttttgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataa 18607236  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607237 gaagccgttgcaatatctaatttttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 18607336  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607337 gctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 18607392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29288067 - 29287618
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288067 aagaaaatgtggatgtttgttcatgattag-ggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 29287969  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287968 gagtcggctttataaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 29287869  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287868 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 29287769  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287768 gaagtcgttgc----tctaatatcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 29287673  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29287672 gctcatccaacatccgttaatttgtttaa-aattttccaacggttttggttatgga 29287618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1611871 - 1611416
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1611871 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 1611772  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611771 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 1611672  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1611671 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 1611572  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  1611571 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 1611472  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611471 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 1611416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 63 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 21358411 - 21358015
Alignment:
Q  63 aatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21358411 aatggggattgaacattctcaatgaagttcacaaccaggcgatgaagttggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaa 21358312  T
Q  163 gattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  21358311 gattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcg 21358212  T
Q  263 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattact 362  Q
    || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  21358211 taaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgt 21358115  T
Q  363 caagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358114 caagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 21358015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 63 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 23962393 - 23961997
Alignment:
Q  63 aatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23962393 aatggggattgaacattctcaatgaagttcacaaccaggcgatgaagttggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaa 23962294  T
Q  163 gattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  23962293 gattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcg 23962194  T
Q  263 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattact 362  Q
    || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  23962193 taaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgt 23962097  T
Q  363 caagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962096 caagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 23961997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 304
Target Start/End: Original strand, 28250837 - 28251134
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28250837 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 28250936  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28250937 gagccagctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 28251036  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 304  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251037 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 24220107 - 24220408
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24220107 aagaaaatgtgggtgcttgtccatggttagtggatatcttagtaggaaaacaaatgaatggggattgaaaattcttaatgcagttcacaaccatgcgatg 24220206  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagc--aagatgcttccaagaaa 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24220207 gagtcggctttagaaggacacattcttgtcggtagattaaaggaggacgacaagaaaattatacgtgacttgaccaagagcataagatgcttccaagaaa 24220306  T
Q  205 tatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 304  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24220307 tattttgataaatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatatcaagtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 24220406  T
Q  305 aa 306  Q
    ||    
T  24220407 aa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Original strand, 7362120 - 7362310
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362120 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgtggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 7362219  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttc 197  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362220 gagtcgactttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttc 7362310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 305 - 462
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357714
Alignment:
Q  305 aagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatctttt 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  405 gggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 28357714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7362463 - 7362307
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362463 aagaaaatgtggatggttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 7362364  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaag 163  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7362363 gagtcgactttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaag 7362307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 35243544 - 35243644
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35243544 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatg 35243643  T
Q  107 g 107  Q
    |    
T  35243644 g 35243644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13387814 - 13387721
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 100  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13387814 aagaaaatgtggttgcttattcatgattcgtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 13387721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34111712 - 34111603
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  34111712 attcttaatggagttcacaaccatgagatggcgccaaagttagaagggaaaattcttgcaggaagattaaaggaagatgactagaagattgtacgtgact 34111613  T
Q  177 tgaccaagag 186  Q
    ||||||||||    
T  34111612 tgaccaagag 34111603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 22864817 - 22864921
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    | ||| | | ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22864817 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcattatgtagcaaggcaccttcttgccggaagattaatggaggaggacaagaagattgtacatgact 22864916  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  22864917 tgacc 22864921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23985424 - 23985364
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatgg 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  23985424 aagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaagaatgg 23985364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095525
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggat 9095525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26685026 - 26684976
Alignment:
Q  129 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 179  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26685026 ttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagacgattgtacatgacttga 26684976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24605209 - 24604754
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605209 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 24605110  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605109 gagccggctttagaagtacacattcttgtcggtagactaaaggaggacgacaagaaaattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 24605010  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24605009 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaa 24604910  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24604909 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgg 24604810  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604809 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 24604754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43949402 - 43948947
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  43949402 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattattaatggagttcacaaccatgcgaag 43949303  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949302 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacggcaagaagattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 43949203  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43949202 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaa 43949103  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949102 gaagccgttgcgttatctaatctcgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 43949003  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949002 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 43948947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 436252 - 436707
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436252 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggttatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 436351  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436352 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 436451  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436452 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 436551  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  436552 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgg 436651  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  436652 gctcatctaacatcttttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatgga 436707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12907612 - 12907157
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907612 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 12907513  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907512 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 12907413  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907412 ttctgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 12907313  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12907312 gaagccgttgcaatttcaaatttcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttgg 12907213  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12907212 actcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggatttggttatgga 12907157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 41008100 - 41007645
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41008100 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 41008001  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41008000 tagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 41007901  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41007900 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaa 41007801  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007800 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 41007701  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  41007700 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttctcaacggttttgattatgga 41007645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28355022 - 28354567
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28355022 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcataaccatgcgatg 28354923  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28354922 gagcctgctttagaatgacacattcttgctggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccatgagcaagatgcttccaagaaata 28354823  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28354822 ttttgatacatttgaagaataaaagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaa 28354723  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354722 gaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 28354623  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354622 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 28354567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 24750599 - 24751054
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24750599 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 24750698  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24750699 gagccggatttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatgacaagaagattgtacatgaattgaccgagagcaagatgcttccaagaaata 24750798  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750799 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24750898  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  24750899 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgg 24750998  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750999 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 24751054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11692934 - 11692480
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11692934 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatc 11692835  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692834 gagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 11692735  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11692734 ttttgatacatttgaaga-caaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaa 11692636  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11692635 gaagccgttgcaatatttaatctcgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgg 11692536  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11692535 gcccatccaacatccgttaagttgtttaagaattttccaacggttttggttatgga 11692480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27275480 - 27275025
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27275480 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattaatggatatcaaagtaagcaaacaagggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 27275381  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275380 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 27275281  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27275280 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 27275181  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  27275180 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 27275081  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275080 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 27275025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 45476305 - 45476753
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||     ||||||| ||||||||||||    
T  45476305 aagaaaatgtgggttcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggtgattgaacat-ct-----gagttcataaccatgcgatg 45476398  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45476399 gatccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttacaagaaata 45476498  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45476499 ttttgatacgtttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaa 45476597  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476598 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 45476697  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476698 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 45476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 34920892 - 34920447
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  34920892 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaac--------- 34920802  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920801 -agccggctttagaaggacacattcttaccggtaaattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 34920703  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920702 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 34920603  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920602 gaagccgttgcaatatctaatttcgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 34920503  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34920502 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatattccaacggttttggttatgga 34920447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 212561 - 212106
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  212561 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 212462  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212461 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 212362  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  212361 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 212262  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  212261 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 212162  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212161 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 212106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 3802686 - 3802231
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3802686 aagaaaatgtggttgcttattcatgattattggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 3802587  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3802586 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaataaata 3802487  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3802486 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 3802387  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  3802386 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 3802287  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802286 gctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 3802231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 10623574 - 10623119
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10623574 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 10623475  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623474 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 10623375  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10623374 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 10623275  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10623274 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 10623175  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623174 gctcatctaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 10623119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 39794911 - 39795366
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39794911 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 39795010  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39795011 gagccggctttagaagggcacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaaaagcaagatgcttccaagaaata 39795110  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795111 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 39795210  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39795211 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgg 39795310  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795311 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 39795366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 5348108 - 5348563
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  5348108 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagcggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacagccatcccatg 5348207  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348208 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 5348307  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5348308 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 5348407  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5348408 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 5348507  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348508 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 5348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 41560953 - 41561408
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41560953 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaataaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 41561052  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561053 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 41561152  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41561153 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 41561252  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41561253 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 41561352  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561353 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 41561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 38946704 - 38947159
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38946704 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 38946803  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38946804 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacaacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccatgaaata 38946903  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38946904 ttttgatacacttgaagaactagagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 38947003  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  38947004 gaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 38947103  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947104 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 38947159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 104 - 462
Target Start/End: Original strand, 9655194 - 9655552
Alignment:
Q  104 atggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9655194 atggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttaaccaagagcaagatgcttccaagaa 9655293  T
Q  204 atatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtga 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655294 atattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtga 9655393  T
Q  304 caagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttt 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655394 caagaagtcgttgcaatatctaatgtcgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttt 9655493  T
Q  404 tgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9655494 tgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttgattatgga 9655552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 162 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1098791 - 1098491
Alignment:
Q  162 agattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagt 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098791 agattgtacgtgacttgaccgagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagt 1098692  T
Q  262 gtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattac 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1098691 gtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattat 1098592  T
Q  362 tcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098591 tcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgg 1098492  T
Q  462 a 462  Q
    |    
T  1098491 a 1098491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17997286 - 17996837
Alignment:
Q  13 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccg 112  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||||  ||||    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17997286 atgtgggttcatgttcaaggttagtggatatcttagtagacaaacaaaggaatggagattgaacattcttcatgaagttcgcaaccatgcgatggagccg 17997187  T
Q  113 gctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttta 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17997186 gctttagaaggacacatgcttgctggtagattaaaggaggatgataagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaggtgcttccaagaaatattttga 17997087  T
Q  213 tacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagcc 312  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  17997086 taaatttgaagagcaaaagacaacattgcatgccaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgat 17996987  T
Q  313 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcat 412  Q
    |||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  17996986 gttgtagtttctaatctcaaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcat 17996887  T
Q  413 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17996886 ccaacatccgttacgttgtttaacaatattccaatggttttggttatgga 17996837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 268
Target Start/End: Original strand, 7263973 - 7264234
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  7263973 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatctcatg 7264072  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7264073 gaaccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatggttccaagaaata 7264172  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 268  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7264173 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaattgtgaagcaagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1100203 - 1100042
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100203 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 1100104  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100103 gagccggctttagatggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaagattgt 1100042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 462
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264376
Alignment:
Q  315 tgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  415 aacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatgga 7264376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 106
Target Start/End: Original strand, 9652132 - 9652231
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9652132 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatg 9652231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9639287 - 9639183
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9639287 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcactttcttgctggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 9639188  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  9639187 tgacc 9639183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24941355 - 24941315
Alignment:
Q  422 gttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24941355 gttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 24941315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28423487 - 28423423
Alignment:
Q  115 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 179  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28423487 tttagcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttga 28423423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 21535200 - 21535309
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||   ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  21535200 attcttaattgtgttcacaaccatgagatgttgccatatttagaagggcaccttcttgtgggaagattaatgaatgacgacaagaagattatacatgact 21535299  T
Q  177 tgaccaagag 186  Q
    ||| ||||||    
T  21535300 tgatcaagag 21535309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 462
Target Start/End: Original strand, 21535524 - 21535585
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||   ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21535524 ttttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatgga 21535585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Original strand, 24683458 - 24683503
Alignment:
Q  125 cacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtac 170  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24683458 cacattcttgcgggaagattaatggaggatgacaagaagattgtac 24683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28423200 - 28423147
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttg 454  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  28423200 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttg 28423147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 462
Target Start/End: Original strand, 4976704 - 4977151
Alignment:
Q  15 gtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggc 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4976704 gtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagtttgcaaccatgcgatggagccggc 4976803  T
Q  115 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttata 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4976804 tttagaaagacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgata 4976903  T
Q  215 catttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4976904 catttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgt 4977003  T
Q  315 tgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977004 tgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcc 4977103  T
Q  415 aacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977104 aacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 4977151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 11502447 - 11502902
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11502447 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgagtattgaacattcttaatggagttcacacccatgcgatg 11502546  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502547 gagccggctttagaaggacacattcatgccggtagattaaaggaagacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 11502646  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11502647 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaa 11502746  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502747 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 11502846  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502847 gctcatcaaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 11502902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 9890963 - 9891418
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9890963 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 9891062  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9891063 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 9891162  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9891163 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 9891262  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  9891263 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 9891362  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891363 actcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 9891418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4979074 - 4978623
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4979074 aagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcccaaccatgcgatg 4978975  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978974 gagccgactttagaaggacacattcttgccagcagactaaaggatgacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 4978875  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  4978874 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaa----aggtgacaa 4978779  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978778 gaagccgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 4978679  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4978678 gctcttccaacgtctgttaagttgtttaacaattttcgaacggttttggttatgga 4978623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19072777 - 19072322
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19072777 aagaaaatgtgtttgctttttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccattctatg 19072678  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072677 gagtctgctttataaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 19072578  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19072577 ttttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 19072478  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  19072477 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 19072378  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072377 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 19072322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 49565584 - 49565129
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  49565584 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 49565485  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565484 gagccggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 49565385  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49565384 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 49565285  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  49565284 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 49565185  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565184 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 49565129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 21471735 - 21472189
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21471735 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatacaatg 21471834  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| |  ||||| || ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471835 gagacaactttaaaaagacacattcttgaagatagaataaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 21471934  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471935 ttttgatacatttgatgaacaaaagaccacattggataa-aaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 21472033  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21472034 gaagtcgttgcaatatttaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgg 21472133  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472134 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 21472189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 462
Target Start/End: Original strand, 3404744 - 3405186
Alignment:
Q  20 tgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttag 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  3404744 tgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagttggctttag 3404843  T
Q  120 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacattt 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3404844 aaggacacattcttgccagtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacattt 3404943  T
Q  220 gaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaa 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3404944 gaagaaccaaagaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaa 3405043  T
Q  320 tatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacat 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  3405044 tttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 3405143  T
Q  420 ccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3405144 ccattaagttgtttaacaattttcaaacggttttggttatgga 3405186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 41024141 - 41024595
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  41024141 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggg-attgaacattcttaatggaattcacaaccatcccatg 41024239  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41024240 gagccggctttagaaggacacattcttgcaggtagattaaaggaggacgaaaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 41024339  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41024340 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 41024439  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41024440 aaagtcgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 41024539  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024540 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 41024595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 51643614 - 51643211
Alignment:
Q  13 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagtt-cacaaccatgcgatggagcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51643614 atgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaattgagattgaacattcttaatggagtttcacaaacatgcgatggagcc 51643515  T
Q  112 -ggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttt 210  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  51643514 cggctttataaggacacattcttgccagtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaaatgctttcaaaaaatatttt 51643415  T
Q  211 tatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaag 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  51643414 gatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtaaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacg 51643315  T
Q  311 ccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51643314 ccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctc 51643215  T
Q  411 atcc 414  Q
    ||||    
T  51643214 atcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 115 - 462
Target Start/End: Original strand, 4769179 - 4769530
Alignment:
Q  115 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttata 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4769179 tttagaaggacacattcttaccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgctttcaagaaatattttgata 4769278  T
Q  215 ----catttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaag 310  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769279 aattgatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaag 4769378  T
Q  311 ccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctc 410  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769379 ccgttgcaatttctgatttcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctc 4769478  T
Q  411 atccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769479 atccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 4769530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 143 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 38463821 - 38463502
Alignment:
Q  143 ttaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgca 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38463821 ttaaaggaggacgacaagaagattgcacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaaaaatattttgatacatttgaaggacaaaagaccacactgca 38463722  T
Q  243 tgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggagga 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463721 tgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggagga 38463622  T
Q  343 gcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatttt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38463621 gcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaatttt 38463522  T
Q  443 ccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38463521 ccaacggttttggttatgga 38463502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18580448 - 18580117
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18580448 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattaaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatg 18580349  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580348 aagccggctttagaatgacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaagattgtatgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 18580249  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18580248 ttttgatacatttgaagaactaaagacctcattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaa 18580152  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggagg 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18580151 gaagccgttgcaatatttaatctcgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 176 - 462
Target Start/End: Original strand, 44049720 - 44050006
Alignment:
Q  176 ttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44049720 ttgaccaatagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtc 44049819  T
Q  276 aacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaag 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44049820 aacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaag 44049919  T
Q  376 tgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049920 tgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 44050006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 460
Target Start/End: Original strand, 6182665 - 6183072
Alignment:
Q  55 aacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 154  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || |||||  ||| ||||| ||| |      
T  6182665 aacaaacgattggagattgaatattcttgatggagttcacaaccatgagatgaagccaagtttagaaggacatatgcttgcaagtatattaagggatggt 6182764  T
Q  155 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtga 254  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||||  || |||| ||||  ||||||| | | |||||||||||  | |    
T  6182765 gacaagaaaattgtacatgacttgaccaagagtttggtgctttcaaaaaatattttgttaaattttaagagaaaaagacaagagtgcatgacaaacatca 6182864  T
Q  255 ag--caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 352  Q
    |   ||| | |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6182865 aaaacaaatatacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactat 6182964  T
Q  353 acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttt 452  Q
      ||||| | | | |||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6182965 gtttatttcaccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttt 6183064  T
Q  453 tggttatg 460  Q
    || |||||    
T  6183065 tgattatg 6183072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38463917 - 38463824
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463917 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 38463824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 17140530 - 17140634
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140530 aagaaaatgtggatgtttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 17140629  T
Q  107 gagcc 111  Q
     ||||    
T  17140630 aagcc 17140634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 17916198 - 17916302
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17916198 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 17916297  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  17916298 tgacc 17916302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 4617714 - 4617818
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  | ||| ||   || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4617714 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagagaaccttcttgctggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 4617813  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  4617814 tgacc 4617818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 1590845 - 1590950
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1590845 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgtggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgac-agaagattgtacatgact 1590943  T
Q  177 tgaccaa 183  Q
    |||||||    
T  1590944 tgaccaa 1590950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 46517480 - 46517380
Alignment:
Q  81 ttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgac 180  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46517480 ttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatatagcagggcaccttcttgctagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttgac 46517381  T
Q  181 c 181  Q
    |    
T  46517380 c 46517380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 32716305 - 32716409
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32716305 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagcagggcaccttattaccggaagattaatggaggacgacaaaaagattgtacatgact 32716404  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  32716405 tgacc 32716409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591230
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggat 1591230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 17916521 - 17916583
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  17916521 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggat 17916583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20971492 - 20971446
Alignment:
Q  140 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 186  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20971492 agattaatggagaacgacaaggagattgtacgtgacttgactaagag 20971446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716690
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggat 32716690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 47061824 - 47062279
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47061824 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 47061923  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47061924 gagccgacttttgaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaaaaagattgtatgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 47062023  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagg-tgaca 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47062024 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgaca 47062123  T
Q  306 agaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47062124 agaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcg 47062222  T
Q  406 ggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47062223 ggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaaatttccaacggttttggttatgga 47062279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 18106329 - 18106784
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18106329 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 18106428  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18106429 gagccggctttagaaggacacattcttgcaggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaata 18106528  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18106529 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 18106628  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  18106629 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 18106728  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106729 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 18106784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43623255 - 43622800
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  43623255 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 43623156  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623155 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 43623056  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43623055 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 43622956  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  43622955 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 43622856  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622855 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 43622800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 462
Target Start/End: Original strand, 42500361 - 42500803
Alignment:
Q  20 tgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttag 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42500361 tgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttag 42500460  T
Q  120 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacattt 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42500461 aaggaaacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacaaagatcaagatgctttcaagaaatattttgatacattt 42500560  T
Q  220 gaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaa 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42500561 gaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaa 42500660  T
Q  320 tatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacat 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42500661 tatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacat 42500760  T
Q  420 ccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500761 ccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 42500803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 617869 - 617414
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  617869 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 617770  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617769 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 617670  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  617669 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 617570  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  617569 gaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 617470  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  617469 gctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacgattttggttatgga 617414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 30787480 - 30787935
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30787480 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 30787579  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787580 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 30787679  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30787680 ttttgatacacttgaagaaccagataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaa 30787779  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  30787780 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 30787879  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787880 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 30787935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 45764320 - 45764775
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  45764320 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 45764419  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764420 gagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 45764519  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45764520 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgcgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 45764619  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  45764620 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 45764719  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764720 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 45764775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43827726 - 43827272
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43827726 aagaaaatgtgggtgtttgttcatggttagtggatatcttagtagacaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgaag 43827627  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43827626 gagccagctttagaatgacacattcttaccggtagattaaaggaggacgaaaagaagattgtacgtgacttgaccaagtgcaagatgcttccaagaaata 43827527  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43827526 ttttgataaatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatatcaagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 43827427  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43827426 gaagccgttgcaatatct-atctcgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgg 43827328  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43827327 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggttttggttatgga 43827272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 463
Target Start/End: Original strand, 8400527 - 8400983
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8400527 aagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcttagtaggcaaacaaaagaatggggattgaacattttcaatggagttcacaaccatgcgatg 8400626  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8400627 gagccggctttagaaggacacattcttgctggtacattaaaggaggatgacaagaagattgtaggtgacttgaccaagagcaagatgttaccaaaaaata 8400726  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8400727 ttttgataaatttgaagaacaaaagaccacattggatgacaaatatcaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 8400826  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  8400827 gacggcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgg 8400926  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8400927 gctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggat 8400983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 343
Target Start/End: Original strand, 15060568 - 15060890
Alignment:
Q  20 tgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttag 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15060568 tgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgggg-ttgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttag 15060666  T
Q  120 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacattt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15060667 aaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtaagtgacttgacaaagagcaagatgcttccaaggaatattttgatacattt 15060766  T
Q  220 gaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaa 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15060767 gaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaa 15060866  T
Q  320 tatctaatctcgaagttggaggag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15060867 tatctaatctcgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 21799953 - 21800160
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21799953 aagaaaatgtgggtgcatgttcatggttagtggatatcttagtaggaaaacaaagcaatggagattgaacattgttaatggagttcacaaccatgcgatg 21800052  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21800053 gagtcggctttagaaggacacatgtttgtcggtagattaaaggaggataacaagaaaattatacgtgacttaatcaagagcaaggtgcatccaaaaaata 21800152  T
Q  207 tttttata 214  Q
    ||||||||    
T  21800153 tttttata 21800160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 339 - 462
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067285
Alignment:
Q  339 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  439 ttttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatgga 15067285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 46791336 - 46791440
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46791336 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 46791435  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  46791436 tgacc 46791440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8194330 - 8194131
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||  ||| | ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8194330 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtggcgtattttgcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 8194231  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtca 276  Q
    ||| ||| ||   | ||   |||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||| | | | |||||||||| | |||||||| || |||| ||||||    
T  8194230 tgagcaatagttcggtgaaaccaaaaaatattttgacaaatttgaagaagaaaagacaagagtccatgacaaatatcaagcaagtctataatgtacgtca 8194131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45172959 - 45172855
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45172959 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttaccggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 45172860  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  45172859 tgacc 45172855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40445615 - 40445512
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  | ||| |||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40445615 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggaaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 40445516  T
Q  177 tgac 180  Q
    ||||    
T  40445515 tgac 40445512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20908567 - 20908458
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  | |    |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20908567 attcttaatggagttcacaaccatgagacgacggcaatgttagaagggcacattcttgcaggaagattaagggaggatgacaagaagattgtgcgtgact 20908468  T
Q  177 tgaccaagag 186  Q
    | ||||||||    
T  20908467 ttaccaagag 20908458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47867546 - 47867442
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |  | ||| ||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47867546 attcttaatggcgttcacaacaatgagatggtgcggtatgtagcagggcatcttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 47867447  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  47867446 tgacc 47867442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 1296997 - 1297101
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1296997 attcttaatggtgttaataaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacgagaagattgtacatgact 1297096  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  1297097 tgacc 1297101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16794663 - 16794468
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||   | | | |||  || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16794663 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccttatgttgcagggaaccttcttgccacaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 16794564  T
Q  177 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaac 272  Q
    ||||||| ||   | ||   |||| ||||||||| | | |||||||||| |||||   | | | |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16794563 tgaccaatagtttggtgaaaccaaaaaatattttgacaaatttgaagaagaaaaggaaagagtccatgacaaatatcaagcaagtctacaatgaac 16794468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 178
Target Start/End: Original strand, 40793934 - 40794035
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40793934 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagtagggcaccttcttgcaggaaaattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 40794033  T
Q  177 tg 178  Q
    ||    
T  40794034 tg 40794035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43379358 - 43379254
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||  | ||| | | ||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43379358 attcttaatggcgttcacaatcataagatggtgccgtatgtagcatggcaccttcttgccggaagattaacagagtacgacaagaagattgtacatgact 43379259  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  43379258 tgacc 43379254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16795822 - 16795760
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  16795822 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggat 16795760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378972
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggat 43378972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 276
Target Start/End: Original strand, 3761979 - 3762115
Alignment:
Q  140 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacatt 239  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||| || || |||||||||||||   |||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||   ||||||| | | |    
T  3761979 agattaagggaagatgacaaaaagattctaggtaacttgaccaagagtttgatgcagccaaaaaatattttgatgaatttgaagggaaaaagacaagagt 3762078  T
Q  240 gcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtca 276  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  3762079 gcatgacaaatgtaaagaaagcatacaatgaacgtca 3762115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297383
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggat 1297383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794277
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggat 463  Q
    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggat 16794277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172582
Alignment:
Q  401 ttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttg 454  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttg 45172582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16796842 - 16796810
Alignment:
Q  151 ggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16796842 ggacgacaagaagattgtacatgacttgaccaa 16796810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 1822 - 2277
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1822 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 1921  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1922 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 2021  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2022 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 2121  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2122 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 2221  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2222 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 16477 - 16022
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16477 aagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 16378  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggaagacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 16278  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16277 ttttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaa 16178  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  16177 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 16078  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16077 gctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 16022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Original strand, 33750 - 34205
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33750 aagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatg 33849  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33850 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 33949  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33950 ttttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 34049  T
Q  307 gaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgg 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  34050 gaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgg 34149  T
Q  407 gctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 462  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34150 gctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 34205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 383
Target Start/End: Original strand, 12203 - 12580
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12203 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcaaaaccatgccatg 12302  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaata 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12303 gagctggctttagaaggacacattctttccggtagattaatggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagaaagatgcttccaagaaata 12402  T
Q  207 tttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatat-ggaaggcaaatagaggtgaca 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12403 ttttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgaca 12502  T
Q  306 agaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12503 agaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 95
Alignment:
Q  7 aagaatatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  290 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggtgattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatg 191  T
Q  107 gagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  190 gagccggctttagaaggacacattcttacgagtagactaaaggagaacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaga 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 3847 - 3951
Alignment:
Q  77 attcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3847 attcttaatggagttcacaaccatgagatggtgcgttatgtagcagggcaccttcttaccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacataact 3946  T
Q  177 tgacc 181  Q
    |||||    
T  3947 tgacc 3951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University