View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13105_low_13 (Length: 279)

Name: NF13105_low_13
Description: NF13105
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13105_low_13
NF13105_low_13
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (67-240)||(39858344-39858519)
chr1 (67-238)||(526909-527082)
chr1 (64-238)||(46845663-46845839)
chr1 (67-236)||(13276474-13276645)
chr1 (67-234)||(40314095-40314264)
chr1 (67-238)||(49430484-49430647)
chr1 (68-231)||(29731194-29731369)
chr1 (67-235)||(47571563-47571743)
chr1 (67-237)||(1994953-1995134)
chr1 (146-235)||(26040972-26041061)
chr1 (151-237)||(6487728-6487814)
chr1 (68-231)||(48489455-48489630)
chr1 (136-235)||(7178192-7178291)
chr1 (147-234)||(15225083-15225170)
chr1 (147-238)||(40294823-40294914)
chr1 (154-237)||(44797565-44797648)
chr1 (147-237)||(27325720-27325810)
chr1 (147-233)||(29637302-29637388)
chr1 (146-238)||(2403016-2403108)
chr1 (158-237)||(1673369-1673448)
chr1 (67-230)||(19989246-19989418)
chr1 (67-188)||(15066020-15066154)
chr1 (156-237)||(32267566-32267647)
chr1 (187-237)||(40030838-40030888)
chr1 (67-235)||(33502524-33502704)
chr1 (62-117)||(27325622-27325677)
chr1 (67-134)||(40030902-40030968)
chr1 (147-185)||(12907642-12907680)
chr1 (168-229)||(10146974-10147034)
chr1 (67-96)||(15224987-15225016)
chr1 (67-131)||(2402925-2402988)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (67-237)||(28897995-28898167)
chr8 (78-238)||(2599530-2599692)
chr8 (71-237)||(45413559-45413720)
chr8 (100-238)||(10391348-10391488)
chr8 (67-235)||(11904855-11905035)
chr8 (67-234)||(35200559-35200738)
chr8 (153-229)||(8368469-8368545)
chr8 (67-238)||(14342187-14342372)
chr8 (151-241)||(41075693-41075783)
chr8 (146-236)||(43065994-43066085)
chr8 (147-237)||(1993732-1993822)
chr8 (151-232)||(31774729-31774810)
chr8 (146-229)||(45502670-45502753)
chr8 (154-238)||(4077060-4077144)
chr8 (138-207)||(10592006-10592077)
chr8 (171-235)||(12142083-12142147)
chr8 (157-232)||(16465714-16465789)
chr8 (158-236)||(27497174-27497251)
chr8 (138-236)||(44081068-44081166)
chr8 (1-31)||(9502007-9502037)
chr8 (146-232)||(32093407-32093493)
chr8 (146-190)||(5749118-5749162)
chr8 (157-217)||(41880211-41880271)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (67-238)||(23915971-23916144)
chr6 (67-236)||(16717991-16718179)
chr6 (147-237)||(14314078-14314168)
chr6 (67-239)||(9045831-9046014)
chr6 (66-239)||(34792650-34792835)
chr6 (146-240)||(29429581-29429675)
chr6 (67-231)||(12748217-12748394)
chr6 (147-234)||(1244648-1244735)
chr6 (151-237)||(9521911-9521999)
chr6 (168-229)||(14022942-14023002)
chr6 (67-113)||(9521812-9521858)
chr6 (1-29)||(6419533-6419561)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (67-238)||(15285328-15285501)
chr5 (70-240)||(35905991-35906163)
chr5 (67-240)||(12248270-12248455)
chr5 (67-239)||(13988245-13988429)
chr5 (67-235)||(43100208-43100388)
chr5 (146-237)||(36890377-36890469)
chr5 (138-235)||(33687649-33687748)
chr5 (149-234)||(1447841-1447926)
chr5 (67-237)||(11247192-11247374)
chr5 (67-130)||(8076374-8076437)
chr5 (168-238)||(20151383-20151453)
chr5 (1-31)||(32347375-32347405)
chr5 (67-116)||(36890509-36890558)
chr5 (1-29)||(6281483-6281511)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (67-238)||(3121609-3121782)
chr2 (67-242)||(33299974-33300153)
chr2 (70-238)||(24475714-24475884)
chr2 (67-237)||(14945736-14945918)
chr2 (67-234)||(36272661-36272840)
chr2 (67-235)||(40216411-40216591)
chr2 (67-236)||(13696965-13697146)
chr2 (67-239)||(32599248-32599432)
chr2 (67-240)||(36709192-36709376)
chr2 (160-238)||(4434695-4434773)
chr2 (146-239)||(33555454-33555547)
chr2 (147-236)||(42061323-42061412)
chr2 (147-239)||(23860256-23860348)
chr2 (146-242)||(25333139-25333235)
chr2 (147-237)||(5562936-5563026)
chr2 (67-237)||(17823579-17823761)
chr2 (147-237)||(40095263-40095353)
chr2 (167-238)||(14242627-14242698)
chr2 (67-130)||(14242524-14242586)
chr2 (62-101)||(25333322-25333361)
chr2 (67-134)||(33555362-33555428)
chr2 (1-31)||(4603968-4603998)
chr2 (1-31)||(4739768-4739798)
chr2 (163-229)||(6376351-6376416)
chr2 (1-31)||(11942807-11942837)
chr2 (1-31)||(43473797-43473827)
chr2 (168-221)||(33732585-33732637)
chr2 (168-221)||(36315577-36315629)
chr2 (168-229)||(37914359-37914419)
chr2 (168-221)||(44958129-44958181)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (67-238)||(50498209-50498382)
chr4 (67-237)||(22364471-22364643)
chr4 (67-238)||(42179149-42179320)
chr4 (71-236)||(32290215-32290377)
chr4 (147-237)||(5817472-5817562)
chr4 (149-234)||(51579323-51579408)
chr4 (67-237)||(17044003-17044184)
chr4 (147-238)||(32525114-32525205)
chr4 (147-238)||(37605783-37605874)
chr4 (147-238)||(55281207-55281298)
chr4 (122-237)||(20107110-20107228)
chr4 (146-237)||(24059224-24059315)
chr4 (67-235)||(48525328-48525508)
chr4 (66-236)||(25164470-25164652)
chr4 (67-238)||(45995895-45996077)
chr4 (149-237)||(51579581-51579668)
chr4 (155-237)||(43749092-43749174)
chr4 (67-238)||(25783909-25784091)
chr4 (147-232)||(41277220-41277305)
chr4 (146-239)||(36851225-36851318)
chr4 (67-234)||(3287087-3287262)
chr4 (137-231)||(26719983-26720077)
chr4 (188-237)||(39631271-39631320)
chr4 (67-130)||(14149960-14150023)
chr4 (67-134)||(37605691-37605757)
chr4 (67-132)||(14786736-14786801)
chr4 (67-107)||(20107230-20107270)
chr4 (67-114)||(5817380-5817427)
chr4 (67-114)||(9118515-9118562)
chr4 (1-31)||(6882383-6882413)
chr4 (1-31)||(29266556-29266586)
chr4 (168-229)||(25437008-25437068)
chr4 (172-229)||(44275714-44275770)
chr4 (168-229)||(52191323-52191383)
chr4 (209-237)||(14786859-14786887)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (67-237)||(31741043-31741215)
chr7 (67-235)||(42974395-42974558)
chr7 (67-235)||(28713679-28713859)
chr7 (67-235)||(38349459-38349639)
chr7 (146-237)||(38754986-38755077)
chr7 (67-243)||(46576242-46576430)
chr7 (69-235)||(37536317-37536495)
chr7 (146-237)||(47480104-47480194)
chr7 (147-240)||(11752594-11752687)
chr7 (165-237)||(48460659-48460731)
chr7 (89-144)||(6220185-6220240)
chr7 (67-237)||(33496499-33496681)
chr7 (146-232)||(43970964-43971049)
chr7 (68-239)||(51936-52118)
chr7 (67-134)||(43359087-43359154)
chr7 (147-237)||(30922802-30922892)
chr7 (67-134)||(30922710-30922776)
chr7 (68-131)||(36675940-36676003)
chr7 (69-104)||(43659261-43659296)
chr7 (168-229)||(13108156-13108216)
chr7 (158-231)||(13768379-13768452)
chr7 (168-229)||(23980139-23980199)
chr7 (67-130)||(13768488-13768552)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (67-236)||(23004757-23004937)
chr3 (67-235)||(36674519-36674699)
chr3 (154-238)||(50989202-50989286)
chr3 (154-238)||(51092334-51092418)
chr3 (147-233)||(33288136-33288222)
chr3 (147-234)||(38247801-38247888)
chr3 (147-236)||(12224095-12224184)
chr3 (153-237)||(8330690-8330774)
chr3 (155-238)||(9271109-9271192)
chr3 (66-144)||(44092432-44092510)
chr3 (154-237)||(8496706-8496789)
chr3 (187-238)||(29915091-29915142)
chr3 (187-238)||(29964244-29964295)
chr3 (160-231)||(39947262-39947333)
chr3 (154-237)||(48034908-48034991)
chr3 (67-233)||(46135531-46135707)
chr3 (149-229)||(54713532-54713612)
chr3 (67-139)||(40725957-40726029)
chr3 (168-231)||(20856274-20856336)
chr3 (1-31)||(55446487-55446517)
chr3 (168-221)||(38231309-38231361)
chr3 (169-229)||(29820423-29820482)
chr3 (1-29)||(31462417-31462445)
chr3 (161-229)||(54413504-54413572)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (67-132)||(52929-52994)
scaffold0005 (209-237)||(52843-52871)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (1-31)||(3719-3749)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39858519 - 39858344
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39858519 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagagtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggaccacat 39858420  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858419 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 39858344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 526909 - 527082
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  526909 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccacttccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 527008  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  527009 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 527082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Original strand, 46845663 - 46845839
Alignment:
Q  64 ttgggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggacca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  46845663 ttgggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacattatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggacca 46845762  T
Q  162 catggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46845763 catggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactct 46845839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 13276474 - 13276645
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttct--tgtgtgtggggaccacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  13276474 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtgggtaccacat 13276573  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13276574 ggacacatgtcataattgtgtatgagtgtataagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatcactact 13276645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40314264 - 40314095
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  40314264 ggataatgtttcatgaacaccattttttccatacatactatataccactcccatatgagagtgtgtgaatgtgagttttttgtgtgtgtggggaccacat 40314165  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||    
T  40314164 ggacacatgtcacaattgtgtatggatgtataaatggtacatactacctaaggtggtttatgtatcacta 40314095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 49430484 - 49430647
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgggga--ccacat 164  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  49430484 ggataatatttcatgaacactcttttctccatacacactatgtaccactcccat----------gtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtggagaccagat 49430573  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49430574 ggacacatgtcacaattgtgtattgatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcaccactct 49430647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29731369 - 29731194
Alignment:
Q  68 gataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg--g 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||| ||          ||| |||||||||||||  |    
T  29731369 gataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtatcacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgaatttcttgtgtgtgtag 29731270  T
Q  156 ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29731269 ggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtactagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatca 29731194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 47571563 - 47571743
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          |||||||||| ||||||      
T  47571563 ggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgtgtgta 47571662  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47571663 gggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggcatatgtcacctaaggtggtttatatatcactac 47571743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1995134 - 1994953
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| || ||||||||    
T  1995134 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgg 1995036  T
Q  156 -ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
     ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1995035 aggaccacaaagacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 1994953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26041061 - 26040972
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26041061 ttgtgtgtggggaccacgtggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtttgtgtatcactac 26040972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6487814 - 6487728
Alignment:
Q  151 tgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6487814 tgtggggaccacgtggacacatgtcacaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaattggtctatgtatcactactc 6487728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48489630 - 48489455
Alignment:
Q  68 gataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg--g 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||          ||||||||||||||| |  |    
T  48489630 gataatgtttcatgaacaccattttctctatacatacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgcgtag 48489531  T
Q  156 ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48489530 ggaccacatggacagatgtcacaattatatatggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtgatttatgtatca 48489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Original strand, 7178192 - 7178291
Alignment:
Q  136 agtgagtttcttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7178192 agtgagttttttgtgtgtcgagaccacatagacacttgtcacaattgtatgtgggtgtacaaatggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcactac 7178291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 15225083 - 15225170
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225083 tgtgtgtggggaccatgtggacatatgtcacaattgcatgtgggtgtataagttgtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 15225170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 40294823 - 40294914
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40294823 tgtgtgtgaggaccacatagatacatgtcacaattgtgtataggtggacaagtggtacgtgccacctaaagtggtctatgtatcactactct 40294914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 44797565 - 44797648
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44797565 ggggaccacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 44797648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 27325720 - 27325810
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325720 tgtgtgggggaaccacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 27325810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Original strand, 29637302 - 29637388
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcact 233  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29637302 tgtgtgggaggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcact 29637388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 2403016 - 2403108
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2403016 ttgtgtggggggaccacaagaacacttttcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccatctaagatggtctatgtatcactactct 2403108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1673448 - 1673369
Alignment:
Q  158 accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1673448 accacaaggacacttatcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 1673369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19989418 - 19989246
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtggg 156  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||          | ||||| || |||||||     
T  19989418 ggataatgtttcatagacactcttttctc-atacacacattgtaccactctcatgtgagagtgtgtgagagacacaaaatgtaagttttttatgtgtgga 19989320  T
Q  157 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatc 230  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19989319 aaccacatggacacatgtcacacttgtatgtggatgtacaagtggtatatgtcatctaaggtggtttatgtatc 19989246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 15066020 - 15066154
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttc---ttgtgtgt 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||          ||||||||   ||||||||    
T  15066020 ggataatgtttcatgaacactcttttttccatacatacaatgtaccactctcatgtgagagtgtgtgagagacaataaatatgagtttctttttgtgtgt 15066119  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatg 188  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066120 acggatcacatggacacatgtcacaattgtgtatg 15066154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 32267566 - 32267647
Alignment:
Q  156 ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32267566 ggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaaattgtacatgccacttaagatggtctatgtatcactactc 32267647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40030888 - 40030838
Alignment:
Q  187 tgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40030888 tgggtgtacaagtggtacatgctacctaaggtggtctatgtatcactactc 40030838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 33502524 - 33502704
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtggg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||  ||||||||  | || ||||||||||||||||          ||||||| ||||||||| |    
T  33502524 ggataatgtttcatgaacatccttttcttcgtacatacattgtaccacctctatgtgagagtgtgtgaaagatataaaatgtgagttttttgtgtgtgtg 33502623  T
Q  157 ga--ccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||  |||  || ||| ||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  33502624 gagaccatgtgaacatatgtcacaattgcatgtaggtgtacaagtggtacatgtcatctaatgtggtctatgtatcactac 33502704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 117
Target Start/End: Original strand, 27325622 - 27325677
Alignment:
Q  62 aattgggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcc 117  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  27325622 aattaggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc 27325677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40030968 - 40030902
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga 134  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40030968 ggataatgtttcatgtacacactttttttcatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtga 40030902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 185
Target Start/End: Original strand, 12907642 - 12907680
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgt 185  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12907642 tgtgtgtggggaccacataaacacatgtcacaattgtgt 12907680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10147034 - 10146974
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10147034 cacatgtcacaattgtgtgtgggggtcaaag-ggtgtatgccacctaaggtggtccatgtat 10146974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 96
Target Start/End: Original strand, 15224987 - 15225016
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctcc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224987 ggataatgtttcatgaacacccttttctcc 15225016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 131
Target Start/End: Original strand, 2402925 - 2402988
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtg 131  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||    
T  2402925 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtacca-ttccatgtgagagtgtg 2402988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28898167 - 28897995
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28898167 ggataatgtttcatgaacaccattttctccatacacactatgtaccactctcatatgagagtgtgtgaaagggagtttcttgtgtgtgtggggaccacat 28898068  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28898067 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 28897995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2599692 - 2599530
Alignment:
Q  78 catgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggaccacatggacacatgtc 175  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  2599692 catgaacaccctttttttcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacatgaacacatgtc 2599593  T
Q  176 acaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2599592 acaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 2599530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 45413559 - 45413720
Alignment:
Q  71 aatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtggggaccacatggacac 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||     | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  45413559 aatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgcaccactcctatgtgagggtgcgtgaaa-----tcttgtgtgtgtggggaccatatggacac 45413653  T
Q  171 atgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45413654 atgtcacaattgtgtatggatgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 45413720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 238
Target Start/End: Original strand, 10391348 - 10391488
Alignment:
Q  100 cacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttctt--gtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataa 197  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10391348 cacattatgtactactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttatgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataa 10391447  T
Q  198 gtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  10391448 gtggcacatgccacctaagatgatctatgtatcattactct 10391488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11905035 - 11904855
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          ||||||||||||||| |      
T  11905035 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgagta 11904936  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11904935 gggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 11904855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35200738 - 35200559
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          |||||||||||| ||||      
T  35200738 ggataatgtttgatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtatgtgta 35200639  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35200638 gggaccgcatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtaatatatgccacctaaggtggtttatgtatcacta 35200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 229
Target Start/End: Original strand, 8368469 - 8368545
Alignment:
Q  153 tggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8368469 tggggaccacgtggacacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtat 8368545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 14342187 - 14342372
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgt--- 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||| ||| || |||||       
T  14342187 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgaattttttttgtgtatg 14342285  T
Q  154 -ggggaccacatggacacatgtcacaa-ttgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
     |||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342286 gggggaccacaaggacacttgtcaaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 14342372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 41075693 - 41075783
Alignment:
Q  151 tgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctata 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41075693 tgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcaccaccctata 41075783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 43065994 - 43066085
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtgggg-accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43065994 ttgtgtgtgggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 43066085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 1993732 - 1993822
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993732 tgtgtggggagaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 1993822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31774810 - 31774729
Alignment:
Q  151 tgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcac 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31774810 tgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgagtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatcac 31774729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45502753 - 45502670
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  45502753 ttgtgtatggagaccacatggacacatgtcacaattgtatatgaatgtacaagtggtacataccacttaaggtggtttatgtat 45502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Original strand, 4077060 - 4077144
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||| | |||| | ||| | |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4077060 ggggaccacaagaacacttatcaaagttgtgtgtgggtatacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatatatcactactct 4077144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10592077 - 10592006
Alignment:
Q  138 tgagtttcttgtgtgtg--gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  10592077 tgagtttcttgtgtgtgtagagaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatg 10592006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12142147 - 12142083
Alignment:
Q  171 atgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12142147 atgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 12142083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 232
Target Start/End: Original strand, 16465714 - 16465789
Alignment:
Q  157 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcac 232  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  16465714 gaccacgtagacacatgtcacaattgtatgtgggtatacaagtggtacatgccgtctaaggtggtctatgtatcac 16465789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27497251 - 27497174
Alignment:
Q  158 accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27497251 accacatgaacacatgtcgcaattgtctgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaagtggtct-tgtatcactact 27497174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44081166 - 44081068
Alignment:
Q  138 tgagtttcttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||  || ||| |||| || || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44081166 tgagttttttgtgtgtgggaatcacgtgggcacatgtcacaattacgtgtggatgtacaaatgatacatgccatctaaggtggtgtatgtatcactact 44081068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 9502007 - 9502037
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9502007 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 9502037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Original strand, 32093407 - 32093493
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcac 232  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||  ||  ||| |||| || |||||||||| ||||||||||    
T  32093407 ttgtgtgtagggaccacgtagacacatgtcacaattgtgtgcggatgttcaaaaggtgtatgtcatctaaggtggtttatgtatcac 32093493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Original strand, 5749118 - 5749162
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggg 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  5749118 ttgtgtgtggggatcacatggacacatgtcataattatgtgtggg 5749162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Original strand, 41880211 - 41880271
Alignment:
Q  157 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaagg 217  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||    
T  41880211 gaccacatagatacgtgtcacaattgtgtatagatgtacaaatggtacatgccacctaagg 41880271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23916144 - 23915971
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggaccacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23916144 ggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 23916045  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23916044 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccatctaaggtgatctatgtatcactactct 23915971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16718179 - 16717991
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||          |||||||||||||||||      
T  16718179 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgtgtgta 16718080  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtca-----caattgt--gtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||     ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16718079 gggaccaaatggacacatgtcatgtcacaattatatgtgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactact 16717991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 14314078 - 14314168
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314078 tgtgtgggggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 14314168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9046014 - 9045831
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga----------aagtgagtttct-tgtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||          | || ||||| | |||||||||    
T  9046014 ggataatgtttcatgtacacactttttttcatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtaagtttttgtgtgtgtgg 9045916  T
Q  156 -ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
     |||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9045915 aggaccacaagaacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 9045831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 239
Target Start/End: Original strand, 34792650 - 34792835
Alignment:
Q  66 gggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg- 154  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| |||||||||     
T  34792650 gggataatgtttcatgtacacacttttttgcatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagttt-ttgtgtgtgt 34792747  T
Q  155 ---gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
       | ||||||| |||||| ||||| |||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792748 agagagaccacaaggacacttgtcaaaattatatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 34792835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29429675 - 29429581
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  29429675 ttgtgtgaggggaccatgtggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtagtctgtgtatcagtaccctat 29429581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12748394 - 12748217
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttct---tgtgtgt 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          ||| ||| |   |||||||    
T  12748394 ggataatgtttcataaacacccttttctttatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgattttttgtgtgtgtgt 12748295  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
     || |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12748294 aggaaccacatggacagatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaagtggtttatgtatca 12748217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 1244648 - 1244735
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1244648 tgtgtggggggaccacaaggacacttgccaaaattgtgtgtggatgtacaagtggtacatgccacttaaggtggtctatgtatcacta 1244735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Original strand, 9521911 - 9521999
Alignment:
Q  151 tgtggggaccacatggacacatgtcacaatt--gtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9521911 tgtggggatcacatgaatatatgtcacaattatgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtgatctatgtattactactc 9521999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14023002 - 14022942
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14023002 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggtttatgtat 14022942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 113
Target Start/End: Original strand, 9521812 - 9521858
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtacca 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  9521812 ggataatgtttcatgtacatccttttctccatacacacattgtacca 9521858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 6419561 - 6419533
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6419561 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 6419533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15285501 - 15285328
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggaccacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15285501 ggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 15285402  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15285401 ggacacatgtcacaattgtgtatgagtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactct 15285328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35906163 - 35905991
Alignment:
Q  70 taatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacatgga 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  35906163 taatgtttcatgaacacccttttctccatacatactatgtaccactctcatgtgagagtgtgtaaaagtgagtttcttgtgtgtgtagggactacatgga 35906064  T
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35906063 cacatgtcacaattgtatatgggtgtataagtgatacataccacctaaggtggtctatgtatcattactctat 35905991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12248455 - 12248270
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||          ||||||||||||| |||      
T  12248455 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttgtgcgtgta 12248356  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  12248355 gggaccacatggacacatgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaggtgatttatgtatcactaccctat 12248270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13988429 - 13988245
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga----------aagtgagtttct---tgtgtgt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||          | |||| ||| |   ||||||     
T  13988429 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 13988331  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988330 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 13988245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 43100208 - 43100388
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||| ||| ||||| ||| ||          ||| |||||||||||||      
T  43100208 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccactttcatgtgatagtgtttgagagacacaaaagatgaatttcttgtgtgtgta 43100307  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43100308 gagaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatataccacctaagatggtttatgtatcactac 43100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36890469 - 36890377
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtgggg-accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890469 ttgtgtgtgggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 36890377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33687748 - 33687649
Alignment:
Q  138 tgagtttcttgtgtgtg--gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33687748 tgagtttcttgtgtgtgtagagatcacatggacacatgtcacaattatatatggatgtacaagtggtatatgccacctaagatgatttatgtatcactac 33687649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 1447841 - 1447926
Alignment:
Q  149 tgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  1447841 tgtgtgggaactacatggacatatgtcacaattgtgcgtggatgtataagtggtacatgccacctaaagttgtctatatataacta 1447926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11247374 - 11247192
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgt-- 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| || ||||||      
T  11247374 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtag 11247276  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||| ||||  ||||  ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11247275 ggggatcacaaagacatttgtcaaaattgtgtgtggatgtacaagtagtatatgccatctaaggtagtctatgtatcactactc 11247192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8076437 - 8076374
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  8076437 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacatacattgtaccacttccatgtgagagtgt 8076374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20151453 - 20151383
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20151453 cacatgtcataattatgtgtgggtgttcaagtggtatatgctacctaaagtggtctatgtatcattactct 20151383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 32347405 - 32347375
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32347405 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 32347375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36890558 - 36890509
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactc 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  36890558 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactc 36890509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 6281483 - 6281511
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6281483 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 6281511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3121782 - 3121609
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgt--gtggggaccacat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3121782 ggataatgtttcatgaacacccttttctgcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtatgtggggaccacat 3121683  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3121682 ggacacatgtcacaattgtgtatgagtgtataagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactct 3121609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33300153 - 33299974
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg----gggaccac 162  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  33300153 ggataatgtttcatgaacaccgtattcttcatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtgtggggaccac 33300054  T
Q  163 atggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctataa 242  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300053 atgaacacatgtcacaattgtatatgggtgtataaatggtacatgccacttaaggtggtctatgtatcactactctataa 33299974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 238
Target Start/End: Original strand, 24475714 - 24475884
Alignment:
Q  70 taatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtg--tgtggggaccacatgga 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24475714 taatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccacttccacgtgagagtgtgtaaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggactacatgga 24475813  T
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24475814 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtgatacataccacctaaggtggtctatgtatcattactct 24475884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 14945736 - 14945918
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgt------------gtgtg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |            |||||    
T  14945736 ggataatgtttcatgaacacccttttcttcatacacattatgtaccactcctatgtgagagtgcgtgaatgtgagttttttttttttttttttttgtgtg 14945835  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||| ||  |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14945836 gggaccaaataaacacatgttacatttgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 14945918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 36272661 - 36272840
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt---gtgtgt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||          ||||||| ||   ||||||    
T  36272661 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatatacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgaaagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgt 36272759  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36272760 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 36272840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40216591 - 40216411
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          |||||||||| ||||||      
T  40216591 ggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacataaaagatgagtttcttatgtgtgta 40216492  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||||    
T  40216491 gggaccacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatatcatctaaggtggtttatatatcactac 40216411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 13696965 - 13697146
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||| ||| || ||||||||    
T  13696965 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 13697063  T
Q  156 gg--accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    ||  |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697064 gggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 13697146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Original strand, 32599248 - 32599432
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| || ||||||||    
T  32599248 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgacagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgg 32599346  T
Q  156 --ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
      |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599347 agggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 32599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Original strand, 36709192 - 36709376
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtggg 156  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||          ||||||| |||||||||||    
T  36709192 ggataatgtttcatgtacacatttttttccatacaaacattgtaccactcc-atatgagaatgtgtgacagacaatacatgtgagttttttgtgtgtggg 36709290  T
Q  157 g--accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    |  ||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36709291 gggaccacaatgacatttgtcaaaattgtgtgtgggtgtataagtggtacataccacctaagatggtctatgtatcagtactctat 36709376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Original strand, 4434695 - 4434773
Alignment:
Q  160 cacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4434695 cacatggacacatgtcacaatagtgtgtggaagtacaagtggtacatgccacataaggtggtctatatatcactactct 4434773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Original strand, 33555454 - 33555547
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33555454 ttgtgtggggggaccacaatgacacttgtcaaaattgtgtgtaagtgtacaagtggtacatgccacttaaggtgatctatgtatcactactcta 33555547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 42061323 - 42061412
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  42061323 tgtgtggggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacccaaagtgctctatgtatcactact 42061412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Original strand, 23860256 - 23860348
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
    |||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23860256 tgtgtggggggatcacaagaacacttgtcaaaatagtgtgtgagtatacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 23860348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25333235 - 25333139
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctataa 242  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25333235 ttgtgtgtgaggatcacatgaacacatgtcacaaatgtgtgttgatgtacaagtggtacatgcgatccaaggtggtctatgtataactactctataa 25333139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5563026 - 5562936
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  5563026 tgtgtgtggagaccacatcgacacatgtcaaaattatatatgaatgtataaatggtacatgccacctaaaatagtctatgtatcactactc 5562936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17823761 - 17823579
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt---gtgtgt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| ||   |||||     
T  17823761 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgg 17823663  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||| |||||| | ||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17823662 ggggaccacaaggacacttatcaaaattgtatgtgggtgtacaagtgatacataccatctaaggtggtttatgtatcactactc 17823579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40095353 - 40095263
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40095353 tgtgtggggggaccacaatgacacttgtcaaaattgtatgtggatgtacaagtggtacatgtcatctaaggtggtctatgtatcactactc 40095263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 14242627 - 14242698
Alignment:
Q  167 acacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14242627 acacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaggtggtacataccacctaagatggtctatgtatcactactct 14242698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Original strand, 14242524 - 14242586
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgt 130  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  14242524 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgt 14242586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25333361 - 25333322
Alignment:
Q  62 aattgggataatgtttcatgaacacccttttctccataca 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25333361 aatttggataatgtttcatgaacacccttttcttcataca 25333322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 33555362 - 33555428
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga 134  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33555362 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagaatgtgtga 33555428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 4603998 - 4603968
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4603998 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 4603968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 4739768 - 4739798
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4739768 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 4739798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 229
Target Start/End: Original strand, 6376351 - 6376416
Alignment:
Q  163 atggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6376351 atggccacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctatggtggtttatgtat 6376416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 11942807 - 11942837
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11942807 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 11942837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 43473827 - 43473797
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43473827 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 43473797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33732637 - 33732585
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggt 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33732637 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggt 33732585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36315629 - 36315577
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggt 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36315629 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggt 36315577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 37914359 - 37914419
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37914359 cacatgtcacaaatgtgtgtggatgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggtttatgtat 37914419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44958181 - 44958129
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggt 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44958181 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggt 44958129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50498382 - 50498209
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50498382 ggataatgtttcatgaacaccattttctccatacatactatataccactcccatatgagagtgtgtgaatgtgagtttcttgtgtgtgtggggaccacat 50498283  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50498282 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatactacctaaggtgatctatgtatcactactct 50498209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 22364471 - 22364643
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgt--ggggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22364471 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacatattatgtaccactcccatgtgagagtgtataaaagtgagtttcttgtgtgttaggggaccacat 22364570  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  22364571 ggacacatatcacaattgtatatgggtgtataagtggtatatgccacctaagttgatttatgtatcactactc 22364643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 42179149 - 42179320
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtg--tgtggggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  42179149 ggataatgtttcatgaacatcctttttttcatacacactatgtaccactcctatgtgagagtctg--aaagtgagttttttgtgtgtgtggggaccacat 42179246  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42179247 ggacacatgtcacaattgtgcatgggtgtataagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatcattactct 42179320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32290377 - 32290215
Alignment:
Q  71 aatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtggg--gaccacatggac 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||      
T  32290377 aatgtttcatgaacactcttttctccatacatactatgtaccactcccatgtgagagtgtatgaaagtgaatttcttgtgtgtgtgaggaccacatgg-- 32290280  T
Q  169 acatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32290279 ---tgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactact 32290215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 5817472 - 5817562
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5817472 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactc 5817562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51579408 - 51579323
Alignment:
Q  149 tgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51579408 tgtgtgggaaccacatggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 51579323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17044184 - 17044003
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag--------tgag---tttcttgtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||        || |   ||| ||||||||||    
T  17044184 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgggactttttttgtgtgtgg 17044086  T
Q  156 gga-ccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044085 ggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 17044003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 32525114 - 32525205
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32525114 tgtgtgtgtggaacacatagacacatatcacaattgtgtgtggatgtataagtggtatatgccacctaagatggtctatgtatcactactct 32525205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 37605783 - 37605874
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605783 tgtgtggggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 37605874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55281298 - 55281207
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281298 tgtgtggggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 55281207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20107228 - 20107110
Alignment:
Q  122 tgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtg--tggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatggg-tgtataagtggtatatgccacctaaggt 218  Q
    |||||||||||||| | |||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20107228 tgagagtgtgtgaatgcgagttttttatgcgcgtgggaaccacatggacacatgtcacaattgtgtgcggggtgtacaagtggtacatgccacctaaggt 20107129  T
Q  219 ggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20107128 ggtctatgtatcactactc 20107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 24059224 - 24059315
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24059224 ttgtgtgtgggaaccacatggacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaaatgatacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 24059315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48525508 - 48525328
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          | |||||||| ||||||      
T  48525508 ggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagataagtttcttatgtgtgta 48525409  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48525408 gggaacacatgaacacatgtcacaattatatgtggatgtacaagtggtatatgccacctaaagtggtttatgtatcactac 48525328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 25164470 - 25164652
Alignment:
Q  66 gggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtg 154  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| || |||||||    
T  25164470 gggataatgtttcatgtacacacttttttgcatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtg 25164568  T
Q  155 ggg--accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    | |  |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25164569 gaggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 25164652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 45995895 - 45996077
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||||||| || ||||||||    
T  45995895 ggataatgtttcatgtacacatttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgagtttttttgtgtgtgg 45995993  T
Q  156 g-gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    | ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45995994 gagaccacaagaacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaagatggtctatgtatcactactct 45996077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51579668 - 51579581
Alignment:
Q  149 tgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51579668 tgtgtgggaatcacatggacacatgtcacaattgtatttgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtct-tgtatcactactc 51579581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43749174 - 43749092
Alignment:
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43749174 gggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 43749092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 25783909 - 25784091
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtg----------aaagtgagtttcttgtgt--gtg 154  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||||| ||| || ||||||||||||          ||||||||||| ||||||  |||    
T  25783909 ggataatgtttcatgaacatctttttttctatacacacgttgtacca-tcctatgtgagagtgtgtgtgaaacaataaaagtgagttttttgtgtatgtg 25784007  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25784008 gggactacatgaatacatgtcacaattatgtgtggatgtacaagtggtacatgccacctaagatgatctatgtatcactactct 25784091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41277305 - 41277220
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcac 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41277305 tgtgtgtggggaccacatgaacacatgtcacaattgtatgtgggtgtacaggtggtacatgtcacctaaggtgatctatgtatcac 41277220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36851318 - 36851225
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  36851318 ttgtgtgtgaggactacatggacacatgtcacaatcatgcgtgggtgtacaagtggtacatgccacttaaggtggtctatgcatcactgctcta 36851225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3287262 - 3287087
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttct-ccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagt------gagtttcttgtgtgtgggga- 158  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||       |||||| || ||||||| ||     
T  3287262 ggataatgtttcatgtacacactttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagataatacgagttttttttgtgtggagag 3287164  T
Q  159 -ccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
     ||||| |||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3287163 accacaaggactcttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacataccatctaaggtggtttatgtatcacta 3287087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 26719983 - 26720077
Alignment:
Q  137 gtgagtttcttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  26719983 gtgagttttgtgcgtgtggggaccacaaagacacatgttacaattgaatgtgggtgtagaagtggtacacgccacctaaggtggtttatgtatca 26720077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 39631271 - 39631320
Alignment:
Q  188 gggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631271 gggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 39631320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Original strand, 14149960 - 14150023
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||    
T  14149960 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacacattgtaccacttccatgtgaaagtgt 14150023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 37605691 - 37605757
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga 134  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37605691 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtga 37605757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Original strand, 14786736 - 14786801
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgt 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  14786736 ggataatgtttcatggacaccatttttttcatacacattatgtaccactctcatgtgagattgtgt 14786801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20107270 - 20107230
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20107270 ggataatgtttcatgaacaccctttttttcatacacactat 20107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 5817380 - 5817427
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccac 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5817380 ggataatgtttcatgtacatccttttctccatacacacattgtaccac 5817427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 9118515 - 9118562
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  9118515 ggataatatttcatgaacaccctttcctccatacatacaatgtaccac 9118562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 6882383 - 6882413
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6882383 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 6882413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 29266586 - 29266556
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29266586 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 29266556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 25437008 - 25437068
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  25437008 cacatgtcacaattgtgtatggatgt-taaaaggtgtatgtcacctaaggtggtccatgtat 25437068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44275770 - 44275714
Alignment:
Q  172 tgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44275770 tgtcacaaatgtgtgtgagtgtaaaa-tggtatatgccacctaaggtggtttatgtat 44275714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 52191323 - 52191383
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52191323 cacatgtcacaattctgtgtggctgt-taaaaggtatatgccacctaaggtggtccatgtat 52191383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 237
Target Start/End: Original strand, 14786859 - 14786887
Alignment:
Q  209 cacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14786859 cacctaaggtggtctatgtatcactactc 14786887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31741215 - 31741043
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtg--gggaccacat 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  31741215 ggataatgtttcatgaacatccttttttctatacacactatgtaccactcccatgtgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtgtggggagcacat 31741116  T
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31741115 agacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactc 31741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 42974395 - 42974558
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagtttcttgtgtgtggggaccacatgg 166  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    |  |||  ||||||||||||||| |||     
T  42974395 ggataatgtttcatgaacacctttgtttccatacacacattgtac-actcccatgtaagagtgtgtga----gttttttgtgtgtgtggggaccatatga 42974489  T
Q  167 acacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42974490 acacatgtcacaattgtatgtgggtgtataagtggtacatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 42974558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28713859 - 28713679
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||          |||||||||| ||||||      
T  28713859 ggataatgtttcatgaacacccttttctctatacacatattgtaccactttcatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgtgtgta 28713760  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28713759 gggaacacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaaggtggtttatgtatcactac 28713679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 38349459 - 38349639
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||          |||||||||| ||||||      
T  38349459 ggataatgtttcatgaacaccctttcctctatacacacattgtaccacttccatgtgagagtgtttgagagacacaaaagatgagtttcttatgtgtgta 38349558  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38349559 gggaacacatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacaagtggtatatgccacctaagatggtttatgtatcactac 38349639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 38754986 - 38755077
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38754986 ttgtgtgtggggatcacatggacacatgtcataattatgtatgggtgttcaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactc 38755077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 46576242 - 46576430
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttctt-gtgtgtgg 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||          ||| ||| || ||||||||    
T  46576242 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactcc-atgtgagagtgtgtgagagacaatacatgtgactttttttgtgtgtgg 46576340  T
Q  156 gg--accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctataat 243  Q
    ||  |||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46576341 gggaaccacaaggacacttgttaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcaataat 46576430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 235
Target Start/End: Original strand, 37536317 - 37536495
Alignment:
Q  69 ataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg--gg 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||          |||||||||||||||||  ||    
T  37536317 ataatgtttcatgaacaccattttctctatacacacattgtaccactttcatgtgagagtgtttgagagatacaaaagatgagtttcttgtgtgtgtagg 37536416  T
Q  157 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  37536417 gaccgcatggacacatgtcacaattatatgtgggtgtacatgtgatatatgccacctaagatgatttatgtatcactac 37536495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 47480104 - 47480194
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47480104 ttgtgtgtgggaaccatatggacacatgtcacaattgtat-tgggtgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcattactc 47480194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11752687 - 11752594
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactctat 240  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11752687 tgtgtgtggggaccacgtgaacacatgtcacaattatatgtaggtgtacaagtgatacatgccacctaaggtggtctatgtatcgcttctctat 11752594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48460731 - 48460659
Alignment:
Q  165 ggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48460731 ggacacttgtcaaaattgtatgtggatgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 48460659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 144
Target Start/End: Original strand, 6220185 - 6220240
Alignment:
Q  89 ttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagttt 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6220185 ttttttccatacacactatgtaccactctcatgtgagagtgtgtgaatgtgagttt 6220240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33496681 - 33496499
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttct---tgtgtgt 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||| ||          ||||||| |   ||||||     
T  33496681 ggataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattataccact-ccatgtgagagtgtgtgagagacaatacatatgagtttttttgtgtgtgg 33496583  T
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33496582 ggggatcacaaagacacttgtcaaaattatatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtctatgtatccctactc 33496499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43971049 - 43970964
Alignment:
Q  146 ttgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcac 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43971049 ttgtgtgtggggaccacgtggacacat-tcaaaattgtgtgtggagttttaaagggtgtatgccacctaaggtggtctatgtatcac 43970964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52118 - 51936
Alignment:
Q  68 gataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtgg-- 155  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| || ||          ||||||| || |||||||      
T  52118 gataatgtttcatgtacacacttttttccatacacacattgtaccactac-atatgagagtgtgagagagataatacatatgagttttttttgtgtggaa 52020  T
Q  156 ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 239  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||||| ||| | |||| || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52019 ggaccacaaggatacttgttaaaattgtatatagatgtacaaatagtacataccacctaaggtggtctatgtatcactactcta 51936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43359154 - 43359087
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga 134  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  43359154 ggataatgtttcattgacaccattttctccatacacacaatgtatcaccctcatgtgagagtgtgtga 43359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 30922802 - 30922892
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||| ||  |||| | |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30922802 tgtgtggggggactacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgaatgtacatgtggtacataccacctaaggtgatctatgtatcactactc 30922892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 30922710 - 30922776
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtga 134  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30922710 ggataatgtttcatgtacatacttttttccatacacacattgtaccact-ccatgtgagagtgtgtga 30922776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36676003 - 36675940
Alignment:
Q  68 gataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtg 131  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  36676003 gataatatttgatcaacacccttttctccatatatactatgtatcacttccatgtgagagtgtg 36675940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 43659296 - 43659261
Alignment:
Q  69 ataatgtttcatgaacacccttttctccatacacac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43659296 ataatgtttcatgaacacccttttttccatacacac 43659261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13108216 - 13108156
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  13108216 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccgcctaaggtggtttatgtat 13108156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13768452 - 13768379
Alignment:
Q  158 accacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | | | |||||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  13768452 accatatggacacatatcacaattatatgtaggtgtgcaagtggtatatgtcatctaaggtggtttatgtatca 13768379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23980199 - 23980139
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  23980199 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctatggtggtttatgtat 23980139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13768552 - 13768488
Alignment:
Q  67 ggataatgttt-catgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  13768552 ggataatgttttcatgaacacccttttttctatacacatattgtatcacttccatatgagagtgt 13768488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23004937 - 23004757
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtg----------agtttct-tgtgtgtgg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  23004937 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgcaccacttccatgtgagagtgtgtgaaagtgtgtgaatgtgagtttttatgtgtgtgg 23004838  T
Q  156 ggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23004837 ggaccacatgaatacatgtcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 23004757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Original strand, 36674519 - 36674699
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaag----------tgagtttcttgtgtgtg-- 154  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||          |||||||||| ||||||      
T  36674519 ggattatgtttcatgaacatccttttctctatacacacattgtaccacttccatatgagagtgtttgagagacataaaagatgagtttcttatgtgtgta 36674618  T
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactac 235  Q
    | || |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36674619 gtgatcacatggacacatgtcacaattatatgtgagtgtacaagtggtatatgtcacctaaggtggtttatgtatcactac 36674699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50989286 - 50989202
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50989286 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 50989202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 51092418 - 51092334
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51092418 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 51092334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33288222 - 33288136
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcact 233  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33288222 tgtgtgtgaggaccacatagacacatatcacaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacataccacctaaggtggtctatgtatcact 33288136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38247888 - 38247801
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 234  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38247888 tgtgtgggggaaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcacta 38247801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 12224095 - 12224184
Alignment:
Q  147 tgtgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactact 236  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12224095 tgtgtgaggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtgtgtgggtgtacaaatggtacatgccacctaaggtggtttatgtatcactact 12224184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 237
Target Start/End: Original strand, 8330690 - 8330774
Alignment:
Q  153 tggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8330690 tggggaccacatggacatatatcacaattgtgtgtgaatgtacaagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactc 8330774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9271192 - 9271109
Alignment:
Q  155 gggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9271192 gggaccacaaggacacttgtcaaaattatgtgtgggtgtacaagtggtacatgccatctaaggtggtctatgtatcactactct 9271109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Original strand, 44092432 - 44092510
Alignment:
Q  66 gggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtgagttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||    
T  44092432 gggataatgtttcatgaacacccttttctctctacaaactatgtaccactctcatgtaagagtgtgtgaatgagagttt 44092510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8496789 - 8496706
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8496789 ggggaccacaaagacacttgtcaaaattgtatgtgggtggacaagtggtacatgccacctaaggtggtctatgtatcaatactc 8496706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 29915091 - 29915142
Alignment:
Q  187 tgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29915091 tgggtgtacaagtggtatatgccacataaggtggtctatgtatcactactct 29915142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 29964244 - 29964295
Alignment:
Q  187 tgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactct 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29964244 tgggtgtacaagtggtatatgccacataaggtggtctatgtatcactactct 29964295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Original strand, 39947262 - 39947333
Alignment:
Q  160 cacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  39947262 cacatggacacatatcacaattgtatgtgggtgtataagtggtacatgtcacttaaggtggtctatatatca 39947333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 48034908 - 48034991
Alignment:
Q  154 ggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48034908 ggggaccacaaggacacttgtcaaaattgtatgtgggtgtacaagtggtacatgtcacctaaggtggtttatgtatcaccactc 48034991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46135707 - 46135531
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtg--------aaagtgagtttcttgtg--tgtggg 156  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||        ||| ||||||| |||||  | ||||    
T  46135707 ggataatgtttcatgaacatcattttctccatacacacattgtaccacccctatgtgagagtgtgtgagagatataaaatgagttttttgtgtatatggg 46135608  T
Q  157 gaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatcact 233  Q
     ||||   ||||||||||||||||||| | | |||||| || || || ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  46135607 aaccatgcggacacatgtcacaattgtatgtaggtgtacaaatgatacatgccatttaagatggtctatgtatcact 46135531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54713612 - 54713532
Alignment:
Q  149 tgtgtggggaccacatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  54713612 tgtgtggggattacatggacacatgtcataattatgtgtggatgttcaagtggtacatgccacctaacgtggtctatgtat 54713532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40726029 - 40725957
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgtgaaagtg 139  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  40726029 ggataatgtttcatggacacattttttttcatacacactatgtatcactcctatgtgagaatgtgtgagagtg 40725957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 231
Target Start/End: Original strand, 20856274 - 20856336
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtatca 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20856274 cacatgtcacaaatgtgtatgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaagtggttcatgtatca 20856336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 55446487 - 55446517
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55446487 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 55446517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38231361 - 38231309
Alignment:
Q  168 cacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggt 221  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38231361 cacatgtcacaaatgtgtgtgggtgtaaaag-ggtgtatgccacctaaggtggt 38231309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 229
Target Start/End: Original strand, 29820423 - 29820482
Alignment:
Q  169 acatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||| |||||||||| | |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29820423 acatctcacaattgtatgtgggtgtcaaagtg-tgtatgccacctaaggtggtctatgtat 29820482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 31462445 - 31462417
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31462445 atttgaatgaatgaatatcgtttactttt 31462417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 54413504 - 54413572
Alignment:
Q  161 acatggacacatgtcacaattgtgtatgggtgtataagtggtatatgccacctaaggtggtctatgtat 229  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  || ||  |||||||||||||||||    
T  54413504 acatggtcacatgtcgcaattgtgtgtgggtgtacaagtgttagttgtcagttaaggtggtctatgtat 54413572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52994 - 52929
Alignment:
Q  67 ggataatgtttcatgaacacccttttctccatacacactatgtaccactcccatatgagagtgtgt 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  52994 ggataatgtttcatggacaccatttttttcatacacattatgtaccactctcatgtgagattgtgt 52929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52871 - 52843
Alignment:
Q  209 cacctaaggtggtctatgtatcactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52871 cacctaaggtggtctatgtatcactactc 52843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 3749 - 3719
Alignment:
Q  1 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3749 atttgaatgaatgaatatcgtttacttttgt 3719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University