View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13114_low_16 (Length: 416)

Name: NF13114_low_16
Description: NF13114
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13114_low_16
NF13114_low_16
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (13-251)||(37260164-37260418)
chr8 (261-400)||(32984113-32984252)
chr8 (262-400)||(24079937-24080075)
chr8 (261-400)||(2714556-2714695)
chr8 (261-400)||(5946054-5946193)
chr8 (261-400)||(6365993-6366132)
chr8 (261-400)||(37956428-37956567)
chr8 (261-393)||(9734262-9734393)
chr8 (261-384)||(31831007-31831130)
chr8 (261-400)||(32114256-32114395)
chr8 (261-384)||(37419947-37420070)
chr8 (261-400)||(40435189-40435328)
chr8 (261-400)||(41231953-41232092)
chr8 (261-392)||(41862227-41862358)
chr8 (261-384)||(43328714-43328837)
chr8 (261-400)||(45236601-45236740)
chr8 (261-400)||(10646130-10646269)
chr8 (261-400)||(25185906-25186045)
chr8 (261-400)||(33730677-33730816)
chr8 (261-400)||(44088479-44088618)
chr8 (262-400)||(9303610-9303748)
chr8 (262-400)||(13356156-13356294)
chr8 (262-400)||(33981699-33981837)
chr8 (262-392)||(35628785-35628915)
chr8 (261-390)||(9013691-9013820)
chr8 (263-400)||(13760684-13760821)
chr8 (261-392)||(17718766-17718897)
chr8 (261-400)||(29048439-29048578)
chr8 (261-400)||(37301361-37301500)
chr8 (261-400)||(41653902-41654041)
chr8 (262-400)||(45258518-45258656)
chr8 (261-384)||(2275920-2276042)
chr8 (262-384)||(45066644-45066766)
chr8 (261-400)||(22878398-22878537)
chr8 (262-400)||(41639922-41640060)
chr8 (261-400)||(42701325-42701465)
chr8 (261-392)||(25248046-25248171)
chr8 (265-361)||(39915887-39915983)
chr8 (310-400)||(12032986-12033076)
chr8 (275-353)||(41981454-41981532)
chr8 (265-346)||(117408-117489)
chr8 (265-346)||(31940326-31940407)
chr8 (265-346)||(40458851-40458932)
chr8 (303-400)||(3904126-3904222)
chr8 (265-346)||(4975486-4975567)
chr8 (265-346)||(27243218-27243299)
chr8 (265-346)||(27254793-27254874)
chr8 (320-400)||(41981534-41981614)
chr8 (265-346)||(4447374-4447455)
chr8 (265-346)||(10378320-10378401)
chr8 (265-346)||(32373805-32373886)
chr8 (265-346)||(41843264-41843345)
chr8 (261-353)||(33896915-33897006)
chr8 (265-319)||(33622571-33622625)
chr8 (265-400)||(2379151-2379275)
chr8 (265-346)||(3211217-3211297)
chr8 (265-338)||(3490486-3490559)
chr8 (265-346)||(9509479-9509560)
chr8 (261-363)||(31148953-31149054)
chr8 (265-346)||(38631663-38631744)
chr8 (265-346)||(9713700-9713778)
chr8 (262-353)||(26196389-26196479)
chr8 (261-333)||(164729-164800)
chr8 (266-321)||(40649935-40649990)
chr8 (323-393)||(31336163-31336233)
chr8 (361-400)||(33622502-33622541)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (261-400)||(2324925-2325064)
chr2 (261-400)||(13815254-13815393)
chr2 (261-400)||(23901785-23901924)
chr2 (261-400)||(746472-746611)
chr2 (261-400)||(6594494-6594633)
chr2 (261-400)||(11184978-11185117)
chr2 (261-400)||(38997107-38997246)
chr2 (262-400)||(34518374-34518512)
chr2 (261-400)||(4034598-4034737)
chr2 (261-400)||(6430479-6430618)
chr2 (261-392)||(14660452-14660583)
chr2 (261-400)||(17600842-17600981)
chr2 (261-400)||(26710351-26710490)
chr2 (261-400)||(32608386-32608525)
chr2 (265-400)||(40635228-40635363)
chr2 (261-400)||(45370996-45371135)
chr2 (262-400)||(10244618-10244756)
chr2 (261-400)||(5726135-5726274)
chr2 (261-400)||(10424601-10424740)
chr2 (261-400)||(27024421-27024560)
chr2 (261-400)||(27400409-27400548)
chr2 (261-400)||(27651070-27651209)
chr2 (261-400)||(32327367-32327506)
chr2 (261-400)||(32948452-32948590)
chr2 (262-384)||(2914190-2914312)
chr2 (262-400)||(4609633-4609771)
chr2 (264-400)||(12842112-12842248)
chr2 (261-400)||(33427683-33427822)
chr2 (262-400)||(37620903-37621044)
chr2 (262-400)||(1091987-1092125)
chr2 (261-400)||(7892724-7892863)
chr2 (261-400)||(40037149-40037288)
chr2 (261-400)||(37255373-37255507)
chr2 (261-384)||(40735470-40735593)
chr2 (262-400)||(14697573-14697711)
chr2 (261-379)||(42899921-42900039)
chr2 (261-400)||(9444689-9444835)
chr2 (261-400)||(15925086-15925225)
chr2 (264-400)||(11159631-11159766)
chr2 (261-400)||(8432952-8433091)
chr2 (269-400)||(32856472-32856603)
chr2 (265-400)||(41172468-41172603)
chr2 (306-400)||(25294886-25294980)
chr2 (261-334)||(12814620-12814693)
chr2 (265-400)||(35158086-35158210)
chr2 (265-400)||(145292-145416)
chr2 (265-346)||(28641371-28641452)
chr2 (265-346)||(39301276-39301357)
chr2 (261-353)||(44481834-44481926)
chr2 (303-400)||(1229675-1229772)
chr2 (265-400)||(4258500-4258623)
chr2 (265-346)||(8056636-8056717)
chr2 (265-346)||(12333574-12333655)
chr2 (265-346)||(29687051-29687132)
chr2 (261-353)||(35126786-35126878)
chr2 (265-346)||(3266306-3266387)
chr2 (265-346)||(21734979-21735060)
chr2 (265-346)||(27331308-27331389)
chr2 (265-346)||(27764941-27765022)
chr2 (265-338)||(34249275-34249348)
chr2 (265-346)||(40544155-40544236)
chr2 (265-345)||(12730071-12730151)
chr2 (331-400)||(447669-447738)
chr2 (265-346)||(13543703-13543784)
chr2 (269-346)||(19428505-19428582)
chr2 (265-346)||(39103057-39103138)
chr2 (265-346)||(43899049-43899130)
chr2 (265-321)||(2000441-2000497)
chr2 (326-398)||(28014856-28014928)
chr2 (265-346)||(43356109-43356187)
chr2 (265-346)||(28566777-28566858)
chr2 (262-362)||(30545828-30545928)
chr2 (262-353)||(38985350-38985439)
chr2 (334-400)||(12827142-12827207)
chr2 (265-346)||(2688808-2688889)
chr2 (285-346)||(3711663-3711724)
chr2 (261-298)||(28019959-28019996)
chr2 (261-321)||(10176565-10176625)
[»] chr7 (92 HSPs)
chr7 (261-400)||(33839751-33839890)
chr7 (262-400)||(2341698-2341836)
chr7 (264-400)||(33411271-33411407)
chr7 (265-400)||(25893953-25894088)
chr7 (261-400)||(33423311-33423450)
chr7 (261-400)||(15877558-15877697)
chr7 (261-400)||(22979683-22979822)
chr7 (261-400)||(23393087-23393226)
chr7 (261-400)||(33695857-33695996)
chr7 (261-400)||(35355896-35356035)
chr7 (261-384)||(45063407-45063530)
chr7 (265-400)||(45690133-45690268)
chr7 (261-400)||(47067013-47067152)
chr7 (261-400)||(49171398-49171537)
chr7 (261-400)||(10028496-10028635)
chr7 (261-400)||(17855436-17855575)
chr7 (261-384)||(20165866-20165989)
chr7 (261-392)||(27018124-27018255)
chr7 (261-400)||(31586856-31586995)
chr7 (265-400)||(35328105-35328240)
chr7 (261-400)||(45482666-45482805)
chr7 (261-400)||(47740367-47740506)
chr7 (262-400)||(41990894-41991032)
chr7 (261-400)||(46913117-46913258)
chr7 (261-392)||(31625712-31625843)
chr7 (261-400)||(33720072-33720211)
chr7 (261-400)||(33870253-33870392)
chr7 (261-400)||(37846052-37846191)
chr7 (261-400)||(40670571-40670710)
chr7 (261-400)||(48609713-48609852)
chr7 (274-400)||(36389377-36389503)
chr7 (270-400)||(5183861-5183991)
chr7 (262-400)||(43499494-43499632)
chr7 (265-400)||(5712180-5712315)
chr7 (261-384)||(33332797-33332919)
chr7 (278-392)||(29446863-29446977)
chr7 (261-391)||(31429520-31429650)
chr7 (261-390)||(19563455-19563584)
chr7 (261-393)||(35757064-35757195)
chr7 (265-400)||(26579753-26579888)
chr7 (261-400)||(10618306-10618438)
chr7 (271-400)||(44564356-44564485)
chr7 (299-398)||(28233974-28234073)
chr7 (261-400)||(35767489-35767621)
chr7 (261-353)||(16482855-16482947)
chr7 (265-346)||(26941611-26941692)
chr7 (265-346)||(35752113-35752194)
chr7 (265-346)||(36816924-36817005)
chr7 (265-400)||(46817457-46817581)
chr7 (265-345)||(37127949-37128029)
chr7 (262-353)||(29863024-29863115)
chr7 (305-384)||(30076579-30076658)
chr7 (265-346)||(24228553-24228634)
chr7 (265-338)||(24923111-24923184)
chr7 (265-346)||(25037587-25037668)
chr7 (265-400)||(32556642-32556766)
chr7 (265-346)||(43489230-43489311)
chr7 (265-346)||(48085870-48085951)
chr7 (265-345)||(29098763-29098843)
chr7 (320-400)||(41904272-41904352)
chr7 (265-353)||(44003442-44003530)
chr7 (265-346)||(498267-498348)
chr7 (265-346)||(2332031-2332112)
chr7 (265-346)||(7876407-7876488)
chr7 (265-346)||(29610647-29610728)
chr7 (265-346)||(39323628-39323709)
chr7 (265-338)||(39453562-39453635)
chr7 (265-346)||(39866677-39866758)
chr7 (261-338)||(45502903-45502980)
chr7 (265-346)||(47906838-47906919)
chr7 (261-353)||(33393336-33393428)
chr7 (265-345)||(41855071-41855151)
chr7 (265-346)||(21718129-21718210)
chr7 (265-400)||(26371061-26371185)
chr7 (265-346)||(44659856-44659936)
chr7 (261-353)||(7257389-7257481)
chr7 (261-353)||(15644018-15644110)
chr7 (262-321)||(35557739-35557798)
chr7 (262-353)||(47460844-47460935)
chr7 (261-318)||(30077043-30077100)
chr7 (265-346)||(33455108-33455189)
chr7 (317-400)||(44405412-44405495)
chr7 (265-346)||(35484648-35484730)
chr7 (265-338)||(45237620-45237693)
chr7 (265-346)||(46103133-46103213)
chr7 (265-346)||(46898095-46898176)
chr7 (265-365)||(38448508-38448608)
chr7 (265-316)||(35823302-35823353)
chr7 (264-353)||(7720575-7720664)
chr7 (293-353)||(37443674-37443734)
chr7 (301-351)||(26456157-26456207)
chr7 (262-353)||(21649450-21649542)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (261-400)||(2892195-2892334)
chr6 (261-400)||(5882513-5882652)
chr6 (261-400)||(599899-600038)
chr6 (261-400)||(7393622-7393761)
chr6 (261-400)||(14891415-14891554)
chr6 (261-400)||(18101531-18101670)
chr6 (262-400)||(34527898-34528036)
chr6 (261-400)||(2593888-2594027)
chr6 (261-400)||(7345148-7345287)
chr6 (261-400)||(8615247-8615386)
chr6 (261-400)||(16703373-16703512)
chr6 (261-400)||(22551097-22551236)
chr6 (261-400)||(24168098-24168237)
chr6 (265-400)||(26377240-26377375)
chr6 (266-400)||(24224106-24224240)
chr6 (261-400)||(1970718-1970857)
chr6 (261-400)||(30743484-30743623)
chr6 (267-400)||(11989010-11989143)
chr6 (261-400)||(959940-960079)
chr6 (261-392)||(19415577-19415708)
chr6 (261-383)||(30467656-30467778)
chr6 (261-398)||(10507946-10508083)
chr6 (267-400)||(22341824-22341959)
chr6 (261-400)||(19281091-19281230)
chr6 (261-400)||(28947094-28947233)
chr6 (261-381)||(5294856-5294976)
chr6 (261-381)||(5299408-5299528)
chr6 (261-400)||(33452608-33452747)
chr6 (286-400)||(23261965-23262079)
chr6 (261-336)||(929666-929741)
chr6 (265-338)||(28948932-28949005)
chr6 (261-353)||(7167589-7167681)
chr6 (265-400)||(13329392-13329516)
chr6 (273-346)||(4487546-4487619)
chr6 (265-338)||(15965444-15965517)
chr6 (265-345)||(3291019-3291099)
chr6 (265-338)||(1398564-1398637)
chr6 (265-350)||(1939579-1939664)
chr6 (265-346)||(3786760-3786841)
chr6 (265-345)||(13844847-13844927)
chr6 (261-310)||(11743070-11743119)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (261-400)||(739740-739879)
chr5 (261-400)||(15398518-15398657)
chr5 (261-400)||(24253389-24253528)
chr5 (261-400)||(18479704-18479843)
chr5 (261-400)||(43326415-43326554)
chr5 (262-400)||(39932587-39932725)
chr5 (261-400)||(3466717-3466856)
chr5 (261-400)||(5184979-5185118)
chr5 (261-400)||(15683798-15683937)
chr5 (265-400)||(35626049-35626184)
chr5 (261-400)||(6901806-6901945)
chr5 (261-400)||(7722056-7722195)
chr5 (261-400)||(25831528-25831666)
chr5 (261-400)||(27938904-27939043)
chr5 (265-400)||(31938908-31939043)
chr5 (261-400)||(40886064-40886202)
chr5 (261-400)||(12648804-12648943)
chr5 (261-400)||(13504778-13504917)
chr5 (265-400)||(40278894-40279029)
chr5 (265-400)||(43262219-43262354)
chr5 (261-400)||(27278509-27278652)
chr5 (262-400)||(27501091-27501229)
chr5 (261-384)||(5137722-5137845)
chr5 (262-400)||(38756524-38756662)
chr5 (261-392)||(2484336-2484467)
chr5 (261-400)||(890913-891051)
chr5 (291-400)||(29789331-29789440)
chr5 (261-400)||(28424831-28424968)
chr5 (265-373)||(40110245-40110352)
chr5 (261-400)||(763730-763869)
chr5 (265-400)||(4149705-4149830)
chr5 (261-352)||(40632506-40632597)
chr5 (296-400)||(34451292-34451396)
chr5 (261-361)||(2585469-2585569)
chr5 (261-365)||(12558090-12558193)
chr5 (265-346)||(42658741-42658822)
chr5 (265-362)||(5120036-5120132)
chr5 (265-346)||(6973074-6973155)
chr5 (265-346)||(9424671-9424752)
chr5 (265-346)||(13957681-13957762)
chr5 (265-346)||(23195327-23195408)
chr5 (265-346)||(27503390-27503471)
chr5 (265-346)||(33617596-33617677)
chr5 (265-346)||(36365524-36365605)
chr5 (261-361)||(36472347-36472448)
chr5 (265-346)||(38015593-38015674)
chr5 (265-338)||(42247869-42247942)
chr5 (265-400)||(5497284-5497408)
chr5 (265-346)||(9374581-9374662)
chr5 (265-338)||(14971989-14972062)
chr5 (265-346)||(19295741-19295822)
chr5 (261-353)||(18327245-18327337)
chr5 (261-353)||(38637982-38638074)
chr5 (262-321)||(9527124-9527183)
chr5 (262-353)||(27390605-27390696)
chr5 (265-338)||(9171112-9171185)
chr5 (261-374)||(31294051-31294164)
chr5 (261-353)||(1402577-1402669)
chr5 (261-353)||(24167856-24167948)
chr5 (261-361)||(40686906-40687006)
chr5 (265-336)||(15300962-15301033)
chr5 (288-400)||(38492647-38492748)
chr5 (281-346)||(3656647-3656712)
chr5 (265-346)||(6206895-6206976)
chr5 (278-338)||(3940418-3940478)
chr5 (265-321)||(33624043-33624099)
chr5 (287-350)||(36948564-36948626)
chr5 (287-361)||(20207080-20207154)
chr5 (261-314)||(28756085-28756138)
chr5 (364-400)||(9424628-9424664)
[»] chr4 (117 HSPs)
chr4 (261-400)||(21366645-21366784)
chr4 (261-392)||(51363014-51363145)
chr4 (261-393)||(49881106-49881238)
chr4 (261-400)||(23437599-23437738)
chr4 (265-400)||(34276558-34276693)
chr4 (265-400)||(44984772-44984907)
chr4 (261-400)||(53854465-53854604)
chr4 (261-400)||(55056295-55056434)
chr4 (262-400)||(397410-397548)
chr4 (262-400)||(9798473-9798611)
chr4 (261-393)||(407761-407892)
chr4 (261-400)||(146465-146604)
chr4 (261-400)||(237484-237623)
chr4 (261-400)||(2826717-2826856)
chr4 (261-400)||(6019935-6020074)
chr4 (261-400)||(27373083-27373222)
chr4 (261-400)||(42085214-42085353)
chr4 (261-391)||(18462058-18462188)
chr4 (262-400)||(45797487-45797625)
chr4 (262-400)||(55776053-55776190)
chr4 (262-400)||(55840231-55840368)
chr4 (265-400)||(6285318-6285453)
chr4 (261-400)||(31532171-31532310)
chr4 (261-400)||(32366696-32366835)
chr4 (261-400)||(39077552-39077691)
chr4 (261-400)||(41702495-41702634)
chr4 (261-400)||(47344663-47344802)
chr4 (265-400)||(53461852-53461987)
chr4 (261-400)||(54607969-54608108)
chr4 (261-400)||(41949389-41949530)
chr4 (261-390)||(22618559-22618687)
chr4 (261-400)||(3170633-3170772)
chr4 (261-400)||(29478367-29478506)
chr4 (261-400)||(31070110-31070248)
chr4 (261-400)||(31972372-31972511)
chr4 (261-400)||(42222298-42222437)
chr4 (261-400)||(42765878-42766016)
chr4 (261-400)||(43471731-43471870)
chr4 (261-400)||(54424989-54425128)
chr4 (261-400)||(54574976-54575115)
chr4 (261-400)||(56023034-56023173)
chr4 (262-400)||(42033183-42033321)
chr4 (261-400)||(1932770-1932909)
chr4 (261-400)||(19387724-19387863)
chr4 (265-392)||(26091302-26091429)
chr4 (261-400)||(29777293-29777432)
chr4 (265-400)||(41560339-41560474)
chr4 (261-400)||(50457846-50457985)
chr4 (262-400)||(31914206-31914343)
chr4 (262-384)||(33897547-33897669)
chr4 (262-400)||(50534639-50534777)
chr4 (261-381)||(53834109-53834229)
chr4 (261-400)||(22468806-22468945)
chr4 (261-400)||(23609094-23609233)
chr4 (261-400)||(39587815-39587954)
chr4 (262-400)||(48657832-48657964)
chr4 (261-400)||(50234007-50234146)
chr4 (261-400)||(38591675-38591810)
chr4 (262-384)||(48654822-48654944)
chr4 (262-400)||(50536660-50536798)
chr4 (261-384)||(2243465-2243588)
chr4 (261-400)||(35446513-35446651)
chr4 (261-400)||(41632043-41632181)
chr4 (261-400)||(47662138-47662277)
chr4 (261-400)||(55519834-55519973)
chr4 (261-400)||(14017412-14017549)
chr4 (261-400)||(3692246-3692385)
chr4 (261-384)||(48259563-48259685)
chr4 (261-360)||(48313564-48313662)
chr4 (261-400)||(54086417-54086554)
chr4 (261-391)||(51951689-51951819)
chr4 (261-400)||(54805650-54805793)
chr4 (294-400)||(52728342-52728448)
chr4 (265-346)||(5117517-5117598)
chr4 (261-338)||(42557589-42557666)
chr4 (265-346)||(45633858-45633939)
chr4 (261-353)||(14335173-14335265)
chr4 (261-353)||(27580126-27580218)
chr4 (261-361)||(34835184-34835284)
chr4 (310-390)||(36532876-36532956)
chr4 (265-399)||(46708778-46708901)
chr4 (261-364)||(27398664-27398767)
chr4 (262-353)||(38547673-38547764)
chr4 (265-346)||(15060368-15060449)
chr4 (265-400)||(20351878-20352002)
chr4 (265-346)||(31881393-31881474)
chr4 (265-346)||(34552330-34552411)
chr4 (265-346)||(37239169-37239250)
chr4 (265-346)||(43890939-43891020)
chr4 (265-400)||(54216772-54216896)
chr4 (261-353)||(1662331-1662423)
chr4 (309-400)||(42509351-42509442)
chr4 (261-360)||(49057933-49058032)
chr4 (302-392)||(52396774-52396865)
chr4 (268-346)||(49014112-49014190)
chr4 (265-346)||(3293102-3293183)
chr4 (265-346)||(11972208-11972289)
chr4 (265-346)||(22620604-22620685)
chr4 (261-354)||(43231510-43231602)
chr4 (265-346)||(54216324-54216405)
chr4 (265-346)||(54715046-54715127)
chr4 (261-353)||(46720032-46720124)
chr4 (265-338)||(4486668-4486741)
chr4 (261-338)||(6371336-6371413)
chr4 (265-346)||(9998010-9998091)
chr4 (265-346)||(47811917-47811998)
chr4 (261-353)||(573810-573902)
chr4 (265-346)||(27873627-27873708)
chr4 (277-346)||(52461386-52461455)
chr4 (265-346)||(52688360-52688441)
chr4 (340-400)||(35595773-35595833)
chr4 (265-351)||(33289714-33289800)
chr4 (265-346)||(33558021-33558102)
chr4 (261-305)||(17555617-17555661)
chr4 (334-390)||(35344868-35344924)
chr4 (287-353)||(27872612-27872678)
chr4 (265-338)||(18206609-18206682)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (261-400)||(41464359-41464498)
chr3 (261-400)||(47257800-47257939)
chr3 (261-400)||(49330044-49330183)
chr3 (261-400)||(7855150-7855289)
chr3 (261-400)||(27067014-27067153)
chr3 (261-400)||(29625863-29626002)
chr3 (261-400)||(40130995-40131134)
chr3 (261-400)||(43125838-43125977)
chr3 (261-400)||(43612083-43612222)
chr3 (261-400)||(52215083-52215222)
chr3 (261-400)||(52628961-52629100)
chr3 (261-391)||(44806691-44806821)
chr3 (262-392)||(51170077-51170207)
chr3 (261-390)||(2666007-2666136)
chr3 (265-393)||(47809640-47809768)
chr3 (265-400)||(20754429-20754564)
chr3 (265-384)||(28048444-28048563)
chr3 (261-400)||(38416760-38416899)
chr3 (261-400)||(39053401-39053540)
chr3 (261-400)||(40419842-40419981)
chr3 (261-400)||(46134363-46134502)
chr3 (262-400)||(35748347-35748485)
chr3 (261-400)||(18946910-18947049)
chr3 (261-400)||(22399104-22399242)
chr3 (261-400)||(24100290-24100428)
chr3 (261-400)||(32234434-32234572)
chr3 (265-400)||(40643811-40643946)
chr3 (261-400)||(42291849-42291988)
chr3 (261-400)||(43183919-43184058)
chr3 (261-400)||(51452786-51452925)
chr3 (261-400)||(24376580-24376719)
chr3 (261-400)||(37313406-37313545)
chr3 (261-400)||(39634608-39634746)
chr3 (277-400)||(46126010-46126133)
chr3 (261-400)||(48739269-48739408)
chr3 (261-400)||(51102414-51102553)
chr3 (261-400)||(53832520-53832659)
chr3 (261-400)||(55453280-55453419)
chr3 (261-399)||(7755344-7755481)
chr3 (263-400)||(48609732-48609869)
chr3 (261-373)||(54159051-54159163)
chr3 (261-400)||(36368946-36369085)
chr3 (265-400)||(37324552-37324687)
chr3 (261-384)||(40804562-40804685)
chr3 (262-400)||(43021722-43021861)
chr3 (261-400)||(53637848-53637987)
chr3 (261-400)||(53943623-53943762)
chr3 (262-400)||(35594129-35594267)
chr3 (261-402)||(37758936-37759077)
chr3 (261-400)||(41293355-41293493)
chr3 (261-400)||(41732535-41732674)
chr3 (265-400)||(44222840-44222975)
chr3 (262-381)||(47894875-47894994)
chr3 (261-400)||(5560061-5560207)
chr3 (261-400)||(41216462-41216601)
chr3 (261-384)||(52638849-52638972)
chr3 (261-373)||(48546894-48547004)
chr3 (261-392)||(46949382-46949512)
chr3 (261-384)||(51146267-51146390)
chr3 (261-361)||(41882055-41882155)
chr3 (261-361)||(53115454-53115554)
chr3 (265-400)||(25641657-25641781)
chr3 (265-346)||(34279800-34279881)
chr3 (265-346)||(42589841-42589922)
chr3 (265-346)||(54401198-54401279)
chr3 (261-353)||(21597220-21597312)
chr3 (265-361)||(48726062-48726158)
chr3 (261-353)||(55379992-55380084)
chr3 (262-360)||(50731979-50732077)
chr3 (262-360)||(50780779-50780877)
chr3 (265-346)||(17665603-17665684)
chr3 (265-346)||(31286872-31286953)
chr3 (265-346)||(37028734-37028815)
chr3 (265-346)||(39141205-39141286)
chr3 (265-346)||(41635879-41635960)
chr3 (265-346)||(45058894-45058975)
chr3 (303-384)||(47182049-47182130)
chr3 (265-346)||(47511019-47511100)
chr3 (265-346)||(51415980-51416061)
chr3 (265-346)||(54707299-54707380)
chr3 (261-353)||(25353561-25353653)
chr3 (261-361)||(28576176-28576276)
chr3 (262-353)||(51143825-51143916)
chr3 (263-365)||(47402810-47402911)
chr3 (265-346)||(38156711-38156792)
chr3 (261-353)||(30251573-30251665)
chr3 (261-353)||(42998861-42998952)
chr3 (265-346)||(24688125-24688206)
chr3 (265-346)||(40022085-40022166)
chr3 (265-338)||(44946016-44946089)
chr3 (265-346)||(49130589-49130670)
chr3 (265-346)||(51224117-51224197)
chr3 (314-391)||(52864550-52864627)
chr3 (265-346)||(55000257-55000338)
chr3 (261-365)||(2227995-2228099)
chr3 (261-353)||(43176810-43176902)
chr3 (321-400)||(33550503-33550582)
chr3 (262-329)||(48752093-48752160)
chr3 (261-329)||(52434146-52434215)
chr3 (286-353)||(40165683-40165750)
chr3 (286-365)||(41609099-41609178)
chr3 (265-365)||(8847718-8847818)
chr3 (262-306)||(37741443-37741487)
chr3 (262-351)||(177169-177258)
chr3 (289-346)||(52756150-52756207)
chr3 (261-298)||(51942543-51942580)
[»] chr1 (101 HSPs)
chr1 (261-400)||(24245061-24245200)
chr1 (261-400)||(31308008-31308147)
chr1 (261-400)||(43251718-43251857)
chr1 (261-400)||(45538160-45538299)
chr1 (261-393)||(23220972-23221104)
chr1 (265-400)||(3611147-3611282)
chr1 (261-400)||(4068719-4068858)
chr1 (261-400)||(6327584-6327722)
chr1 (261-400)||(17994987-17995126)
chr1 (261-400)||(21139448-21139587)
chr1 (261-400)||(44661977-44662116)
chr1 (262-400)||(25678295-25678433)
chr1 (261-392)||(5981177-5981308)
chr1 (261-400)||(26085434-26085572)
chr1 (261-400)||(26277184-26277323)
chr1 (261-400)||(33112853-33112992)
chr1 (261-400)||(33884095-33884234)
chr1 (261-400)||(33960018-33960157)
chr1 (261-400)||(38790233-38790372)
chr1 (261-400)||(39646575-39646714)
chr1 (265-400)||(50774228-50774363)
chr1 (261-400)||(25058695-25058834)
chr1 (261-392)||(25518821-25518952)
chr1 (261-400)||(31040716-31040855)
chr1 (261-400)||(31844383-31844522)
chr1 (265-400)||(36003141-36003276)
chr1 (261-392)||(46784430-46784561)
chr1 (261-400)||(46967077-46967216)
chr1 (265-400)||(47383768-47383903)
chr1 (262-400)||(37620228-37620366)
chr1 (264-384)||(23932561-23932681)
chr1 (261-400)||(5980075-5980214)
chr1 (261-400)||(23984762-23984901)
chr1 (265-400)||(26794315-26794450)
chr1 (261-400)||(38331895-38332034)
chr1 (261-400)||(41999822-41999961)
chr1 (261-400)||(42863872-42864011)
chr1 (265-400)||(47317326-47317461)
chr1 (261-400)||(47671593-47671732)
chr1 (261-400)||(49254011-49254150)
chr1 (261-390)||(47187112-47187241)
chr1 (261-400)||(35692699-35692839)
chr1 (261-400)||(24885508-24885647)
chr1 (261-400)||(26524925-26525064)
chr1 (261-400)||(28888588-28888727)
chr1 (261-400)||(46616556-46616695)
chr1 (261-373)||(48373511-48373623)
chr1 (261-400)||(36566337-36566476)
chr1 (261-400)||(49399024-49399163)
chr1 (261-370)||(51403074-51403182)
chr1 (261-384)||(3285409-3285531)
chr1 (265-384)||(35273607-35273726)
chr1 (265-384)||(51057082-51057201)
chr1 (261-373)||(31979998-31980110)
chr1 (289-400)||(2450529-2450640)
chr1 (261-400)||(42313397-42313540)
chr1 (261-400)||(27983639-27983762)
chr1 (261-373)||(2556909-2557021)
chr1 (261-393)||(45475885-45476009)
chr1 (265-346)||(2657314-2657395)
chr1 (265-346)||(26472258-26472339)
chr1 (265-346)||(41467711-41467792)
chr1 (295-384)||(51045648-51045737)
chr1 (267-350)||(13313249-13313332)
chr1 (265-346)||(6626103-6626184)
chr1 (265-346)||(30289989-30290070)
chr1 (265-346)||(32448659-32448740)
chr1 (265-346)||(42234851-42234932)
chr1 (261-361)||(2954862-2954962)
chr1 (308-400)||(4808699-4808791)
chr1 (261-353)||(26685863-26685955)
chr1 (265-346)||(4953063-4953144)
chr1 (265-346)||(10928078-10928159)
chr1 (265-346)||(29770681-29770762)
chr1 (265-346)||(33073222-33073303)
chr1 (265-346)||(44544125-44544206)
chr1 (265-346)||(51155668-51155749)
chr1 (261-345)||(24649802-24649886)
chr1 (261-353)||(27924730-27924822)
chr1 (261-365)||(39475843-39475946)
chr1 (266-353)||(48683402-48683489)
chr1 (265-338)||(4243577-4243650)
chr1 (265-346)||(13281641-13281722)
chr1 (261-362)||(33187347-33187448)
chr1 (265-346)||(46428332-46428413)
chr1 (261-353)||(1388480-1388572)
chr1 (261-313)||(4156188-4156240)
chr1 (261-353)||(10920207-10920299)
chr1 (261-353)||(38716319-38716411)
chr1 (261-353)||(39637907-39637996)
chr1 (262-338)||(52323946-52324022)
chr1 (265-335)||(7561632-7561702)
chr1 (265-346)||(34752393-34752474)
chr1 (265-346)||(35991678-35991759)
chr1 (265-346)||(44293534-44293615)
chr1 (264-353)||(52367893-52367982)
chr1 (261-353)||(5961339-5961431)
chr1 (304-392)||(47772216-47772304)
chr1 (265-346)||(41895243-41895324)
chr1 (261-306)||(10919313-10919358)
chr1 (343-400)||(13312567-13312624)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (261-400)||(39592-39731)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (261-400)||(11169-11307)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (261-400)||(13798-13937)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (261-400)||(75280-75419)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (261-392)||(1876-2007)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (261-400)||(18890-19029)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (261-400)||(2468-2607)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (261-400)||(32568-32707)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (266-400)||(176666-176800)
scaffold0007 (262-400)||(278014-278154)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (261-400)||(3095-3225)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (261-353)||(109-201)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (296-400)||(4632-4736)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (261-361)||(4618-4719)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (261-361)||(3399-3500)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (261-353)||(14751-14843)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (261-353)||(20549-20641)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (265-346)||(7101-7183)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (265-335)||(17917-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (265-338)||(19228-19301)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 37260164 - 37260418
Alignment:
Q  13 aatattagctagaaattattctgttaannnnnnnn-gtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260164 aatattagctagaaattattctgttaatttttttttgtccatcttggtgttaaccttttatgttcgttccattatcatattattattggcatgttattga 37260263  T
Q  112 gatcacaaggatctaaaat---------------gttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 196  Q
    |||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37260264 gatcacaaggatctaaaatgtcgtgaatttaaatgttgtaagtttaatcatataaaattcgaaagtatttcttcataaagctaggttaaaagtgtatata 37260363  T
Q  197 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttacgtatacaaaaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37260364 aatattttatactttcaagtatactctcatttctacacacttatgtataaaaaaa 37260418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32984252 - 32984113
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32984252 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32984153  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  32984152 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 32984113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24080075 - 24079937
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24080075 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 24079976  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24079975 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 2714556 - 2714695
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2714556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2714655  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2714656 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2714695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 5946054 - 5946193
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5946054 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5946153  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5946154 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5946193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 6365993 - 6366132
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6365993 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 6366092  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6366093 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 6366132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 37956428 - 37956567
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37956428 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 37956527  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37956528 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37956567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Original strand, 9734262 - 9734393
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9734262 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 9734360  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9734361 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 9734393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31831130 - 31831007
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31831130 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31831031  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  31831030 atgtgcttatgtggctaatgtgta 31831007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 32114256 - 32114395
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  32114256 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 32114355  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32114356 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 32114395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 37419947 - 37420070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  37419947 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 37420046  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37420047 atgtgcttatgtgactaatgtgta 37420070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40435328 - 40435189
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40435328 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40435229  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40435228 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40435189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41231953 - 41232092
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41231953 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41232052  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  41232053 atgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaatt 41232092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 41862227 - 41862358
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41862227 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 41862326  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41862327 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 41862358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 43328714 - 43328837
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43328714 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43328813  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  43328814 atgtgcttatgtggctaatgtgta 43328837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45236740 - 45236601
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45236740 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45236641  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45236640 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45236601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 10646130 - 10646269
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10646130 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10646229  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  10646230 atgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 10646269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 25185906 - 25186045
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25185906 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 25186005  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  25186006 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 25186045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33730816 - 33730677
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33730816 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33730717  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33730716 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33730677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44088618 - 44088479
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44088618 ctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44088519  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44088518 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 44088479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9303748 - 9303610
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9303748 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9303649  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  9303648 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaatt 9303610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13356294 - 13356156
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13356294 tagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 13356195  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13356194 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 13356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33981837 - 33981699
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33981837 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33981738  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33981737 tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33981699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Original strand, 35628785 - 35628915
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  35628785 tagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaa 35628884  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35628885 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgg 35628915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 9013691 - 9013820
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9013691 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 9013790  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  9013791 atgtacttatgtggctaatgtgtattggtt 9013820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13760821 - 13760684
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13760821 agattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaat 13760722  T
Q  363 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  13760721 gtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 13760684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17718897 - 17718766
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17718897 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17718798  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17718797 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 17718766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29048578 - 29048439
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29048578 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29048479  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  29048478 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 29048439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37301500 - 37301361
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37301500 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaa 37301401  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  37301400 atgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 37301361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41653902 - 41654041
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  41653902 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaa 41654001  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41654002 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 41654041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 45258518 - 45258656
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45258518 tagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 45258617  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45258618 tgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaatt 45258656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 2275920 - 2276042
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2275920 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 2276018  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  2276019 atatgcttatgtggctaatgtgta 2276042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45066766 - 45066644
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45066766 tagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45066667  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  45066666 tgtgcttatgtggctaatgtgta 45066644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 22878398 - 22878537
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22878398 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22878497  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22878498 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22878537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 41639922 - 41640060
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  41639922 tagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaa 41640021  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  41640022 tatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaatt 41640060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42701465 - 42701325
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt---a 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||   |    
T  42701465 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 42701366  T
Q  358 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42701365 aaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 42701325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 25248046 - 25248171
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25248046 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaa 25248139  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  25248140 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgg 25248171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39915983 - 39915887
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39915983 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 310 - 400
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033076
Alignment:
Q  310 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12033076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 353
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981532
Alignment:
Q  275 aagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 117489 - 117408
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  117489 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 31940326 - 31940407
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31940326 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31940407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40458932 - 40458851
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40458932 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40458851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 400
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904222
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaatt 3904222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4975567 - 4975486
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4975567 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27243299 - 27243218
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27243299 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27254874 - 27254793
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||||||    
T  27254874 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 400
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981614
Alignment:
Q  320 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41981614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4447455 - 4447374
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  4447455 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 4447374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 10378320 - 10378401
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  10378320 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 10378401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32373886 - 32373805
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  32373886 attacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 32373805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 41843264 - 41843345
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||    
T  41843264 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg 41843345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33897006 - 33896915
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  33897006 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33622625 - 33622571
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622625 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 33622571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 2379151 - 2379275
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  |||| || |||||||           || ||||    
T  2379151 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg-----------aatatgt 2379239  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2379240 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 2379275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 3211217 - 3211297
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  3211217 attacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 3211297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3490559 - 3490486
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3490559 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 3490486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9509560 - 9509479
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  9509560 attacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 9509479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31149054 - 31148953
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31149054 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaa 31148956  T
Q  361 atg 363  Q
    |||    
T  31148955 atg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 38631663 - 38631744
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  38631663 attacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 9713700 - 9713778
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  9713700 attacctttgaagaatggtgggtaatttac---ccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 9713778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26196479 - 26196389
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  26196479 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 333
Target Start/End: Original strand, 164729 - 164800
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtc 333  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  164729 ctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttg-tggtggagtc 164800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649935
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaattt 40649935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 393
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336233
Alignment:
Q  323 ttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||| ||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggg 31336233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33622541 - 33622502
Alignment:
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33622541 atgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaatt 33622502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2325064 - 2324925
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2325064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2324965  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2324964 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 2324925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13815393 - 13815254
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13815393 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13815294  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13815293 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 13815254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 23901785 - 23901924
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23901785 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23901884  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23901885 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23901924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 746472 - 746611
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  746472 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 746571  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  746572 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 746611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6594633 - 6594494
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6594633 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6594534  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  6594533 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 6594494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 11184978 - 11185117
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11184978 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11185077  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11185078 atgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaatt 11185117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 38997107 - 38997246
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38997107 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38997206  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  38997207 atgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaatt 38997246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 34518374 - 34518512
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34518374 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 34518473  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34518474 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 34518512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 4034598 - 4034737
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4034598 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 4034697  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4034698 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4034737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 6430479 - 6430618
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6430479 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6430578  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  6430579 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 6430618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 14660452 - 14660583
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14660452 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14660551  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14660552 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 14660583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 17600842 - 17600981
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17600842 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 17600941  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17600942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 17600981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 26710351 - 26710490
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26710351 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26710450  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  26710451 atgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaatt 26710490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 32608386 - 32608525
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32608386 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 32608485  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  32608486 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 32608525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 40635228 - 40635363
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40635228 attacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 40635327  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40635328 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40635363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 45370996 - 45371135
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45370996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45371095  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45371096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45371135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10244756 - 10244618
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10244756 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 10244657  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||    
T  10244656 tgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaatt 10244618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 5726135 - 5726274
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  5726135 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaa 5726234  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||||| || ||||||    
T  5726235 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaatt 5726274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 10424601 - 10424740
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10424601 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10424700  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||    
T  10424701 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaatt 10424740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 27024421 - 27024560
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27024421 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27024520  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27024521 atatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 27024560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 27400409 - 27400548
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27400409 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27400508  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27400509 atgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 27400548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27651209 - 27651070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27651209 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27651110  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  27651109 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 27651070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 32327367 - 32327506
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  32327367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 32327466  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  32327467 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 32327506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 32948452 - 32948590
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32948452 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaa 32948550  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  32948551 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 32948590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2914312 - 2914190
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2914312 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 2914213  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||||||| || |||||||    
T  2914212 tgtgcttatgtggctgatgtgta 2914190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 4609633 - 4609771
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4609633 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 4609732  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4609733 tgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaatt 4609771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 400
Target Start/End: Original strand, 12842112 - 12842248
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  12842112 gattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatg 12842211  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12842212 tgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12842248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33427822 - 33427683
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33427822 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 33427723  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33427722 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33427683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37621044 - 37620903
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg---agtcaagatggttcatggataccatttaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37621044 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaa 37620945  T
Q  359 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  37620944 aaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaatt 37620903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1092125 - 1091987
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1092125 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 1092026  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  1092025 tgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 1091987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7892863 - 7892724
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7892863 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaa 7892764  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  7892763 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaatt 7892724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 40037149 - 40037288
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  40037149 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 40037248  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  40037249 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatt 40037288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37255507 - 37255373
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37255507 ctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 37255413  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  37255412 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaatt 37255373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 40735470 - 40735593
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  40735470 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 40735569  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||| |||||| | ||||||||||    
T  40735570 atgtacttatgcggctaatgtgta 40735593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14697711 - 14697573
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14697711 tagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 14697612  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14697611 tgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaatt 14697573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 379
Target Start/End: Original strand, 42899921 - 42900039
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42899921 ctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42900020  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaat 379  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  42900021 atgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 9444689 - 9444835
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9444689 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggatacca 9444788  T
Q  354 tttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  9444789 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 9444835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 15925086 - 15925225
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15925086 ctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15925185  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  15925186 atatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaatt 15925225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 264 - 400
Target Start/End: Original strand, 11159631 - 11159766
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11159631 gattacctttgaaaaatggtg-gtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatg 11159729  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  11159730 tgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaatt 11159766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8433091 - 8432952
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8433091 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaa 8432992  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || | |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8432991 atatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 8432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856472
Alignment:
Q  269 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctt 368  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  369 atgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| || |||||| | ||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaatt 32856472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 41172468 - 41172603
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  41172468 attacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgt 41172567  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41172568 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41172603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 306 - 400
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25294980
Alignment:
Q  306 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Original strand, 12814620 - 12814693
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12814620 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35158210 - 35158086
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  35158210 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 35158122  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35158121 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 35158086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 145292 - 145416
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||           ||    
T  145292 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gt 145380  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  145381 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 145416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28641452 - 28641371
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  28641452 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 28641371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39301357 - 39301276
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39301357 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39301276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 44481834 - 44481926
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44481834 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 400
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229772
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaatt 1229772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 4258500 - 4258623
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  4258500 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgg-gtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4258587  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4258588 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 4258623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 8056636 - 8056717
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  8056636 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12333655 - 12333574
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  12333655 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 12333574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 29687051 - 29687132
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  29687051 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 29687132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 35126786 - 35126878
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  35126786 ctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 35126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 3266306 - 3266387
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3266306 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21735060 - 21734979
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  21735060 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg 21734979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 27331308 - 27331389
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  27331308 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 27331389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27765022 - 27764941
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  27765022 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 27764941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 34249275 - 34249348
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34249275 attatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 34249348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40544236 - 40544155
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40544236 attacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 12730071 - 12730151
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  12730071 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 12730151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 447738 - 447669
Alignment:
Q  331 gtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  447738 gtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 447669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543703
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13543703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428505
Alignment:
Q  269 cctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg 19428505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39103057 - 39103138
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||    
T  39103057 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg 39103138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43899130 - 43899049
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  43899130 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 43899049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2000497 - 2000441
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2000497 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 2000441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  326 gtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 398  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 43356109 - 43356187
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43356109 attacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28566858 - 28566777
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  28566858 attacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg 28566777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 30545828 - 30545928
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  30545828 tagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaa 30545927  T
Q  362 t 362  Q
    |    
T  30545928 t 30545928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38985439 - 38985350
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| ||||||||||||||    
T  38985439 tagattacatttga-gaacggtgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggatacca 38985350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 400
Target Start/End: Original strand, 12827142 - 12827207
Alignment:
Q  334 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12827142 aagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 12827207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2688889 - 2688808
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  2688889 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 2688808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 346
Target Start/End: Original strand, 3711663 - 3711724
Alignment:
Q  285 agtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3711663 agtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3711724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28019996 - 28019959
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28019996 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Original strand, 10176565 - 10176625
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176565 ctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 92)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33839890 - 33839751
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33839890 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33839791  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33839790 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33839751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2341836 - 2341698
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  2341836 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaa 2341737  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2341736 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 2341698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 400
Target Start/End: Original strand, 33411271 - 33411407
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33411271 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 33411370  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  33411371 tgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 33411407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25894088 - 25893953
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25894088 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 25893989  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25893988 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25893953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33423450 - 33423311
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33423450 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33423351  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33423350 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33423311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 15877558 - 15877697
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15877558 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15877657  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  15877658 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 15877697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22979822 - 22979683
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22979822 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22979723  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  22979722 atatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 22979683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23393226 - 23393087
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23393226 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23393127  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23393126 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23393087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33695996 - 33695857
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33695996 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33695897  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33695896 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33695857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 35355896 - 35356035
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35355896 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 35355995  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35355996 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35356035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45063530 - 45063407
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45063530 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45063431  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  45063430 atgtgcttatgtggctaatgtgta 45063407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45690268 - 45690133
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45690268 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 45690169  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45690168 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45690133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47067152 - 47067013
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47067152 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47067053  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47067052 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47067013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49171537 - 49171398
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49171537 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49171438  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  49171437 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 49171398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 10028496 - 10028635
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10028496 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 10028595  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  10028596 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 10028635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 17855436 - 17855575
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17855436 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 17855535  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  17855536 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 17855575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20165989 - 20165866
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20165989 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 20165890  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  20165889 atgtacttatgtggctaatgtgta 20165866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 27018124 - 27018255
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27018124 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27018223  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27018224 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 27018255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 31586856 - 31586995
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31586856 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31586955  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31586956 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31586995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35328240 - 35328105
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35328240 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35328141  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35328140 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 45482666 - 45482805
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45482666 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 45482765  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  45482766 atatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaatt 45482805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47740506 - 47740367
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  47740506 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 47740407  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47740406 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47740367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41991032 - 41990894
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41991032 tagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 41990933  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  41990932 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaatt 41990894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 46913117 - 46913258
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46913117 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46913216  T
Q  361 a--tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  46913217 atgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 46913258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 31625712 - 31625843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31625712 ctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 31625811  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31625812 atgtgcttatgtgactaatgtatattggttgg 31625843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33720211 - 33720072
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33720211 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33720112  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  33720111 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 33720072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 33870253 - 33870392
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33870253 ctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaa 33870352  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33870353 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33870392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37846191 - 37846052
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||| ||||||    
T  37846191 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaa 37846092  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37846091 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 37846052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 40670571 - 40670710
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40670571 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40670670  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40670671 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40670710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48609852 - 48609713
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  48609852 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 48609753  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  48609752 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 48609713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 274 - 400
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389503
Alignment:
Q  274 gaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtg 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  374 actaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaatt 36389503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 270 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183861
Alignment:
Q  270 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgctta 369  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  370 tgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 5183861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 43499494 - 43499632
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43499494 tagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 43499593  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | | |||||||| | ||||| || | |||||| ||||||    
T  43499594 tatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaatt 43499632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 5712180 - 5712315
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  5712180 attacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 5712279  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5712280 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5712315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 33332797 - 33332919
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33332797 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 33332895  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    || |||||||| | ||||||||||    
T  33332896 atatgcttatgcggctaatgtgta 33332919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 392
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29446977
Alignment:
Q  278 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgacta 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  378 atgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||| |||||||    
T  29446963 atgtgtattggttgg 29446977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31429650 - 31429520
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  31429650 ctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaa 31429551  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 391  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31429550 atgtgtttatgtgactaatgtgtattggttg 31429520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 19563455 - 19563584
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19563455 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19563554  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19563555 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 19563584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35757195 - 35757064
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  35757195 ctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 35757097  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35757096 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 35757064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26579888 - 26579753
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  26579888 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 26579789  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  26579788 gtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 26579753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 10618306 - 10618438
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10618306 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg-------gatagttcatgaataccacttaaaa 10618398  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10618399 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 10618438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 400
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564485
Alignment:
Q  271 tttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttat 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  371 gtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 44564485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233974
Alignment:
Q  299 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 35767489 - 35767621
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||       | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35767489 ctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 35767581  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35767582 atgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35767621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16482947 - 16482855
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16482947 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26941692 - 26941611
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  26941692 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26941611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35752194 - 35752113
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35752194 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35752113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36817005 - 36816924
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36817005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36816924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46817581 - 46817457
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46817581 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46817493  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  46817492 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 46817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 37127949 - 37128029
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  37127949 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 37128029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 29863024 - 29863115
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  29863024 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggatacca 29863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076579
Alignment:
Q  305 atgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 30076579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 24228553 - 24228634
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  24228553 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 24228634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24923184 - 24923111
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  24923184 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 24923111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25037668 - 25037587
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  25037668 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 25037587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32556766 - 32556642
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||| |||||||           || ||||    
T  32556766 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg-----------aatatgt 32556678  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32556677 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 32556642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 43489230 - 43489311
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  43489230 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 43489311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 48085870 - 48085951
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  48085870 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 48085951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 29098763 - 29098843
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  29098763 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 400
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904352
Alignment:
Q  320 ttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 41904352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44003530 - 44003442
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44003530 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 498348 - 498267
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  498348 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 498267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 2332031 - 2332112
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  2332031 attatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg 2332112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7876488 - 7876407
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  7876488 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 7876407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 29610647 - 29610728
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  29610647 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 29610728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39323628 - 39323709
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39323628 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39453635 - 39453562
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39453635 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 39453562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 39866677 - 39866758
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39866677 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45502980 - 45502903
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  45502980 ctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagat 45502903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47906919 - 47906838
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  47906919 attacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 47906838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 33393336 - 33393428
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33393336 ctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 41855071 - 41855151
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41855071 attacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcat 41855151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 21718129 - 21718210
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  21718129 attacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 21718210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 26371061 - 26371185
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  26371061 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 26371149  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26371150 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 26371185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 44659856 - 44659936
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  44659856 attacctttgaagaatggtg-gtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 7257389 - 7257481
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  7257389 ctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15644110 - 15644018
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15644110 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Original strand, 35557739 - 35557798
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557739 tagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47460935 - 47460844
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  47460935 tagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 47460844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30077100 - 30077043
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077100 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 33455108 - 33455189
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  33455108 attacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405495
Alignment:
Q  317 aatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 44405495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 35484648 - 35484730
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  35484648 attatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 35484730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45237693 - 45237620
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  45237693 attacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagat 45237620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 46103133 - 46103213
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  46103133 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 46103213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46898176 - 46898095
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||    
T  46898176 attacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg 46898095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||  |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  365 g 365  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 316
Target Start/End: Original strand, 35823302 - 35823353
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 316  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823302 attaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 7720664 - 7720575
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | | | | || ||||| ||||||||||||||    
T  7720664 gattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatacca 7720575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443674
Alignment:
Q  293 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 37443674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 351
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456207
Alignment:
Q  301 accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 351  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatac 26456207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21649542 - 21649450
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaa-tggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || || || | ||||| ||| ||||||||||    
T  21649542 tagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggatacca 21649450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 2892195 - 2892334
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2892195 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2892294  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2892295 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2892334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 5882513 - 5882652
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5882513 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5882612  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5882613 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 5882652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 599899 - 600038
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  599899 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 599998  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  599999 atgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaatt 600038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7393761 - 7393622
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7393761 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7393662  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  7393661 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 7393622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14891554 - 14891415
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14891554 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 14891455  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  14891454 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 14891415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18101670 - 18101531
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18101670 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18101571  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18101570 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 18101531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34528036 - 34527898
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  34528036 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaa 34527937  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34527936 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 34527898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2594027 - 2593888
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2594027 ctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2593928  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2593927 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 2593888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7345287 - 7345148
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  7345287 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 7345188  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  7345187 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 7345148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 8615247 - 8615386
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8615247 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 8615346  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  8615347 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 8615386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 16703373 - 16703512
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16703373 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 16703472  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  16703473 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 16703512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22551236 - 22551097
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  22551236 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaa 22551137  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22551136 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 24168098 - 24168237
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24168098 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24168197  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24168198 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26377375 - 26377240
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26377375 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26377276  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  26377275 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 26377240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 266 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24224240 - 24224106
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24224240 ttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 24224141  T
Q  366 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24224140 cttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 24224106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 1970718 - 1970857
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  1970718 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 1970817  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1970818 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 1970857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30743623 - 30743484
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  30743623 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaa 30743524  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  30743523 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 30743484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 267 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11989010
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  367 ttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 11989010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 960079 - 959940
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  960079 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaa 959980  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  959979 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 959940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19415708 - 19415577
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19415708 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaa 19415609  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19415608 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 19415577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 30467778 - 30467656
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  30467778 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaac 30467679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgt 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  30467678 atgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10508083 - 10507946
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10508083 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 10507984  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaa 398  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10507983 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 10507946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 267 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341824
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 22341824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19281230 - 19281091
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  19281230 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 19281131  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  19281130 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 19281091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 28947094 - 28947233
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  28947094 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaa 28947193  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  28947194 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 28947233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5294976 - 5294856
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5294976 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5294877  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgt 381  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5294876 atgtgcttatgtgactaatgt 5294856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5299528 - 5299408
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5299528 ctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 5299429  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgt 381  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5299428 atgtgcttatgtgactaatgt 5299408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33452747 - 33452608
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33452747 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33452648  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33452647 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261965
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtac 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  386 tggttgggataaatt 400  Q
    |||||||| ||||||    
T  23261979 tggttggggtaaatt 23261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Original strand, 929666 - 929741
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  929666 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28949005 - 28948932
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  28949005 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 28948932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 7167589 - 7167681
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  7167589 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 13329392 - 13329516
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||           |||| ||||    
T  13329392 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgt 13329480  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13329481 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 13329516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487619
Alignment:
Q  273 tgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 4487619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 15965444 - 15965517
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  15965444 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagat 15965517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 3291019 - 3291099
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || ||||| ||||||    
T  3291019 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat 3291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 1398564 - 1398637
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  1398564 attatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagat 1398637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1939664 - 1939579
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 350  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||    
T  1939664 attatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 3786760 - 3786841
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  3786760 attacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg 3786841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 345
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844927
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcat 13844927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11743119 - 11743070
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743119 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 739879 - 739740
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  739879 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 739780  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  739779 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaatt 739740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15398657 - 15398518
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15398657 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15398558  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15398557 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 15398518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 24253389 - 24253528
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24253389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24253488  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  24253489 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 24253528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18479843 - 18479704
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18479843 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 18479744  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  18479743 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 18479704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43326554 - 43326415
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43326554 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43326455  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43326454 atgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43326415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 39932587 - 39932725
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39932587 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39932686  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  39932687 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 39932725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3466856 - 3466717
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3466856 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 3466757  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3466756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3466717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 5184979 - 5185118
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5184979 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 5185078  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  5185079 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 5185118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 15683798 - 15683937
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15683798 ctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 15683897  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  15683898 atgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaatt 15683937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 35626049 - 35626184
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35626049 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35626148  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35626149 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35626184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 6901806 - 6901945
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6901806 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 6901905  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  6901906 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 6901945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 7722056 - 7722195
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7722056 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 7722155  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  7722156 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaatt 7722195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 25831528 - 25831666
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25831528 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaa 25831626  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25831627 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 27938904 - 27939043
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27938904 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 27939003  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27939004 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 27939043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939043
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaatt 31939043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40886202 - 40886064
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  40886202 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 40886104  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  40886103 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 40886064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 12648804 - 12648943
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12648804 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 12648903  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  12648904 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 12648943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13504917 - 13504778
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13504917 ctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13504818  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  13504817 atgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaatt 13504778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278894
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaatt 40278894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43262354 - 43262219
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43262354 attacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 43262255  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43262254 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43262219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27278652 - 27278509
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatgg----ttcatggataccattt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||| ||    
T  27278652 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccactt 27278553  T
Q  357 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  27278552 aaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 27278509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27501229 - 27501091
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27501229 tagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 27501130  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  27501129 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaatt 27501091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 5137722 - 5137845
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5137722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5137821  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5137822 atgtgtttatgtggctaatatgta 5137845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756524
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaatt 38756524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2484467 - 2484336
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2484467 ctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 2484368  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2484367 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgg 2484336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 890913 - 891051
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  890913 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaa 891011  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  891012 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 891051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789331
Alignment:
Q  291 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  391 gggataaatt 400  Q
    ||||||||||    
T  29789340 gggataaatt 29789331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28424968 - 28424831
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28424968 ctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 28424871  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  28424870 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 28424831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 40110245 - 40110352
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  40110245 attacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt 40110343  T
Q  365 gcttatgtg 373  Q
    |||||||||    
T  40110344 gcttatgtg 40110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 763730 - 763869
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  763730 ctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaa 763829  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||    
T  763830 atgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaatt 763869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 4149705 - 4149830
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||| ||||||||||    
T  4149705 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgg---------ggtt-atggataccacttaaaaatgt 4149794  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4149795 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4149830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 352
Target Start/End: Original strand, 40632506 - 40632597
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacc 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40632506 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451396
Alignment:
Q  296 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  396 aaatt 400  Q
    |||||    
T  34451392 aaatt 34451396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 2585469 - 2585569
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  2585469 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 2585568  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  2585569 a 2585569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12558193 - 12558090
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  12558193 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 12558095  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  12558094 atgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42658822 - 42658741
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42658822 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42658741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 6973074 - 6973155
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6973074 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 6973155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9424752 - 9424671
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  9424752 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 9424671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 13957681 - 13957762
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  13957681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 13957762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23195408 - 23195327
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  23195408 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 23195327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 27503390 - 27503471
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  27503390 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 27503471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 33617596 - 33617677
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  33617596 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg 33617677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36365605 - 36365524
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  36365605 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 36365524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36472448 - 36472347
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca-tttaaa 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  36472448 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaa 36472349  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  36472348 aa 36472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38015674 - 38015593
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  38015674 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 38015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42247942 - 42247869
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  42247942 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 42247869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 5497284 - 5497408
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||           || ||||    
T  5497284 attatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgt 5497372  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5497373 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 5497408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9374662 - 9374581
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  9374662 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 9374581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 14971989 - 14972062
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  14971989 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 14972062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 19295741 - 19295822
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  19295741 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg 19295822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18327337 - 18327245
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18327337 ctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38638074 - 38637982
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38638074 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9527183 - 9527124
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390696
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27390696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9171185 - 9171112
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9171185 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 9171112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31294164 - 31294051
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||  | | || |||| |||||| ||||||    
T  31294164 ctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaa 31294065  T
Q  361 atgtgcttatgtga 374  Q
    || |||||| ||||    
T  31294064 atatgcttacgtga 31294051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1402669 - 1402577
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  1402669 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24167948 - 24167856
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24167948 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 40686906 - 40687006
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  40686906 ctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 40687005  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  40687006 a 40687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300962
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaag 336  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaag 15300962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 400
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492748
Alignment:
Q  288 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactg 387  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  388 gttgggataaatt 400  Q
    |||||| ||||||    
T  38492736 gttggggtaaatt 38492748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656647
Alignment:
Q  281 ggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg 3656647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 6206895 - 6206976
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||| || |||||||    
T  6206895 attacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg 6206976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940418
Alignment:
Q  278 aatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagat 3940418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33624099 - 33624043
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 321  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33624099 attacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 33624043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948564
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata 36948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20207154 - 20207080
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20207154 taatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggataccatctaaaaa 20207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 314
Target Start/End: Original strand, 28756085 - 28756138
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 314  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756085 ctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9424664 - 9424628
Alignment:
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9424664 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 9424628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 117)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21366784 - 21366645
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21366784 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21366685  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21366684 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 21366645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 51363014 - 51363145
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51363014 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51363113  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51363114 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 51363145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 49881238 - 49881106
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49881238 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49881139  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  49881138 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggg 49881106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 23437599 - 23437738
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23437599 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23437698  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  23437699 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 23437738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 34276558 - 34276693
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34276558 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 34276657  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  34276658 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 34276693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 44984772 - 44984907
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44984772 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 44984871  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44984872 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 44984907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53854604 - 53854465
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53854604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53854505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  53854504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 53854465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 55056434 - 55056295
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55056434 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaa 55056335  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55056334 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 55056295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 397410 - 397548
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  397410 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 397509  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  397510 tgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 397548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 9798473 - 9798611
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9798473 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9798572  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  9798573 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 9798611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Original strand, 407761 - 407892
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  407761 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaa 407859  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  407860 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 407892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 146604 - 146465
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  146604 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 146505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  146504 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 146465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 237484 - 237623
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  237484 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaa 237583  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  237584 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 237623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2826856 - 2826717
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2826856 ctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2826757  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2826756 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2826717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 6019935 - 6020074
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  6019935 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaa 6020034  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  6020035 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 6020074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 27373083 - 27373222
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27373083 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 27373182  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27373183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 27373222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 42085214 - 42085353
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42085214 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 42085313  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  42085314 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 42085353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18462188 - 18462058
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  18462188 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 18462089  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18462088 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttg 18462058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 45797487 - 45797625
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45797487 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45797586  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45797587 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 45797625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 55776053 - 55776190
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55776053 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55776151  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  55776152 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 55776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 55840231 - 55840368
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55840231 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55840329  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  55840330 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 55840368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 6285318 - 6285453
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6285318 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 6285417  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6285418 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 6285453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31532310 - 31532171
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31532310 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31532211  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  31532210 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 31532171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32366835 - 32366696
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32366835 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 32366736  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  32366735 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 32366696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 39077552 - 39077691
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39077552 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 39077651  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39077652 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 39077691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41702634 - 41702495
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41702634 ctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaa 41702535  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41702534 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41702495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 47344663 - 47344802
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47344663 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47344762  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47344763 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47344802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53461987 - 53461852
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53461987 attacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 53461888  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  53461887 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 53461852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 54607969 - 54608108
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  54607969 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaa 54608068  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  54608069 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 54608108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41949389 - 41949530
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41949389 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41949488  T
Q  361 atgtgct--tatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  41949489 atgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 41949530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22618687 - 22618559
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22618687 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 22618589  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  22618588 atgtgcttatgtggctaatatgtattggtt 22618559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 3170633 - 3170772
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  3170633 ctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 3170732  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3170733 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3170772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 29478367 - 29478506
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29478367 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29478466  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||| ||||||    
T  29478467 atgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaatt 29478506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31070248 - 31070110
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31070248 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 31070150  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  31070149 atgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaatt 31070110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31972511 - 31972372
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  31972511 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 31972412  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  31972411 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 31972372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 42222298 - 42222437
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42222298 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaa 42222397  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  42222398 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 42222437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42766016 - 42765878
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  42766016 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 42765918  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42765917 atgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42765878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43471870 - 43471731
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43471870 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43471771  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43471770 atgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43471731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 54424989 - 54425128
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54424989 ctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54425088  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  54425089 atgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaatt 54425128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54575115 - 54574976
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54575115 ctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 54575016  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  54575015 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 54574976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 56023173 - 56023034
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  56023173 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 56023074  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  56023073 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 56023034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 42033183 - 42033321
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  42033183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 42033282  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||||  ||||||| || |||||| ||||||||    
T  42033283 tgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaatt 42033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 1932770 - 1932909
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1932770 ctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 1932869  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1932870 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaatt 1932909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19387863 - 19387724
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19387863 ctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 19387764  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  19387763 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 19387724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26091429 - 26091302
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26091429 attatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 26091330  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||    
T  26091329 gtttatgtggctaatgtgtattggttgg 26091302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29777432 - 29777293
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  29777432 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaa 29777333  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  29777332 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 29777293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 41560339 - 41560474
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41560339 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41560438  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41560439 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 41560474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50457985 - 50457846
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50457985 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 50457886  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  50457885 atgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaatt 50457846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 31914206 - 31914343
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31914206 tagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 31914305  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31914306 tgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31914343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33897669 - 33897547
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33897669 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33897570  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    | || |||| || ||||||||||    
T  33897569 tatgattatatggctaatgtgta 33897547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 50534639 - 50534777
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50534639 tagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 50534738  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  50534739 tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 50534777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 53834229 - 53834109
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53834229 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 53834130  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgt 381  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  53834129 atgtgcttatgtgactaatgt 53834109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22468945 - 22468806
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22468945 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaa 22468846  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  22468845 atatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 22468806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 23609094 - 23609233
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23609094 ctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaa 23609193  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  23609194 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 23609233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39587954 - 39587815
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39587954 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39587855  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||||    
T  39587854 atgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaatt 39587815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 48657832 - 48657964
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48657832 tagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 48657925  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48657926 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 48657964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 50234007 - 50234146
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  50234007 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaa 50234106  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  50234107 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 50234146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 38591675 - 38591810
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |    
T  38591675 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----a 38591770  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  38591771 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 38591810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Original strand, 48654822 - 48654944
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  48654822 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaa 48654921  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  48654922 tgtacttatgtggctaatgtgta 48654944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50536798 - 50536660
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  50536798 tagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 50536699  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  50536698 tatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaatt 50536660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 2243465 - 2243588
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2243465 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2243564  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||  ||||||| || |||||||    
T  2243565 atgtatttatgtggcttatgtgta 2243588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 35446513 - 35446651
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35446513 ctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 35446611  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35446612 atgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35446651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41632181 - 41632043
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  41632181 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggatatcgcttaaaa 41632083  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41632082 atgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaatt 41632043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47662277 - 47662138
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  47662277 ctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaa 47662178  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47662177 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47662138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 55519834 - 55519973
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55519834 ctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 55519933  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  55519934 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaatt 55519973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14017549 - 14017412
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  14017549 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt--aa 14017452  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
     |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  14017451 gtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 14017412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3692385 - 3692246
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  3692385 ctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaa 3692286  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  3692285 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 3692246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48259685 - 48259563
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    
T  48259685 ctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaa 48259587  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  48259586 atgtgcttatgtggctaatatgta 48259563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Original strand, 48313564 - 48313662
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48313564 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48313662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 54086417 - 54086554
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  54086417 ctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgg-gtcaagatagttcatggataccgcttaaaa 54086514  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  54086515 atgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaatt 54086554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Original strand, 51951689 - 51951819
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51951689 ctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaa 51951788  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 391  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  51951789 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttg 51951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54805793 - 54805650
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54805793 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaa 54805694  T
Q  361 atgtg----cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54805693 atgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 54805650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728342
Alignment:
Q  294 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  394 ataaatt 400  Q
     ||||||    
T  52728348 gtaaatt 52728342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5117598 - 5117517
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  5117598 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 5117517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Original strand, 42557589 - 42557666
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  42557589 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45633939 - 45633858
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45633939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45633858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14335265 - 14335173
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  14335265 ctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagatacca 14335173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 27580126 - 27580218
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27580126 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27580218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 34835184 - 34835284
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  34835184 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaa 34835283  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  34835284 a 34835284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532876
Alignment:
Q  310 aatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 36532876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 46708901 - 46708778
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  46708901 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 46708813  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaat 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  46708812 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaat 46708778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27398767 - 27398664
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  27398767 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 27398668  T
Q  361 atgt 364  Q
    ||||    
T  27398667 atgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38547764 - 38547673
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  38547764 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15060449 - 15060368
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  15060449 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 15060368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20352002 - 20351878
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||||           || ||||    
T  20352002 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aatatgt 20351914  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20351913 gcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 20351878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31881474 - 31881393
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31881474 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31881393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 34552330 - 34552411
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||    
T  34552330 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg 34552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37239250 - 37239169
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  37239250 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 37239169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 43890939 - 43891020
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  43890939 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatg 43891020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54216896 - 54216772
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||           || ||||    
T  54216896 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 54216808  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54216807 gcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaatt 54216772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1662423 - 1662331
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  1662423 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 400
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509442
Alignment:
Q  309 aaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaatt 42509442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49058032 - 49057933
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  || || || |||||| ||||||||||||||    
T  49058032 ctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 392
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  302 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa-gatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 346
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014190
Alignment:
Q  268 acctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 49014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3293183 - 3293102
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  3293183 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11972289 - 11972208
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  11972289 attacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 22620604 - 22620685
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  22620604 attatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 22620685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 354
Target Start/End: Original strand, 43231510 - 43231602
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccat 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  43231510 ctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 43231602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 54216324 - 54216405
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  54216324 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 54216405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 54715046 - 54715127
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  54715046 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg 54715127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 46720032 - 46720124
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  46720032 ctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4486741 - 4486668
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4486741 attatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 4486668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6371413 - 6371336
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6371413 ctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagat 6371336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9998091 - 9998010
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  9998091 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatg 9998010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 47811917 - 47811998
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  47811917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatg 47811998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 573810 - 573902
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  573810 ctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 573902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27873708 - 27873627
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| || ||||| |||||||    
T  27873708 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg 27873627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461455
Alignment:
Q  277 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52461455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 52688360 - 52688441
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| || |||||||    
T  52688360 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg 52688441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 400
Target Start/End: Original strand, 35595773 - 35595833
Alignment:
Q  340 gttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  35595773 gttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 35595833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 351
Target Start/End: Original strand, 33289714 - 33289800
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 351  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||| ||||||| ||||    
T  33289714 attacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac 33289800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33558102 - 33558021
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||| |||||||    
T  33558102 attatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 33558021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17555661 - 17555617
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17555661 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 390
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344924
Alignment:
Q  334 aagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 35344924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872678
Alignment:
Q  287 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggatacca 27872678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206609
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 18206609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41464359 - 41464498
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41464359 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41464458  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  41464459 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 41464498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 47257800 - 47257939
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  47257800 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 47257899  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47257900 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47257939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 49330044 - 49330183
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49330044 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 49330143  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  49330144 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 49330183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7855289 - 7855150
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  7855289 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaa 7855190  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  7855189 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaatt 7855150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27067153 - 27067014
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  27067153 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 27067054  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27067053 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 27067014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29626002 - 29625863
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29626002 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 29625903  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  29625902 atatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 29625863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40131134 - 40130995
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40131134 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40131035  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40131034 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40130995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 43125838 - 43125977
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43125838 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43125937  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43125938 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 43125977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43612222 - 43612083
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43612222 ctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43612123  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43612122 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 43612083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 52215083 - 52215222
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52215083 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52215182  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52215183 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 52215222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 52628961 - 52629100
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52628961 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 52629060  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  52629061 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 52629100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Original strand, 44806691 - 44806821
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44806691 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaa 44806790  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 391  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  44806791 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttg 44806821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51170207 - 51170077
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51170207 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 51170108  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51170107 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 51170077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 2666007 - 2666136
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2666007 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2666106  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2666107 ctgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 2666136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 265 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 47809768 - 47809640
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47809768 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47809669  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47809668 gtttatgtggctaatgtgtattggttggg 47809640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20754564 - 20754429
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20754564 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatat 20754465  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20754464 gtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 20754429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28048563 - 28048444
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28048563 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 28048464  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  28048463 gcttatgtggctaatgtgta 28048444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38416899 - 38416760
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38416899 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 38416800  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  38416799 atgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 38416760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 39053401 - 39053540
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39053401 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39053500  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  39053501 atgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaatt 39053540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 40419842 - 40419981
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40419842 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 40419941  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  40419942 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 40419981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 46134363 - 46134502
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46134363 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46134462  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  46134463 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 46134502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35748485 - 35748347
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35748485 tagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 35748386  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35748385 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 35748347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 18946910 - 18947049
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18946910 ctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaa 18947009  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18947010 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaatt 18947049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 22399104 - 22399242
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||    
T  22399104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaa 22399202  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  22399203 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 22399242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 24100290 - 24100428
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24100290 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccacttaaaa 24100388  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  24100389 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 24100428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32234572 - 32234434
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  32234572 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 32234474  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  32234473 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 32234434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 40643811 - 40643946
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40643811 attatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgt 40643910  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  40643911 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 40643946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 42291849 - 42291988
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||    
T  42291849 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaa 42291948  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42291949 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42291988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 43183919 - 43184058
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43183919 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaa 43184018  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||    
T  43184019 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaatt 43184058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51452925 - 51452786
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  51452925 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 51452826  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||    
T  51452825 atgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaatt 51452786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 24376580 - 24376719
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24376580 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 24376679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||    
T  24376680 atgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaatt 24376719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 37313406 - 37313545
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  37313406 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 37313505  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37313506 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37313545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39634746 - 39634608
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39634746 ctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 39634648  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  39634647 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 39634608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 400
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126133
Alignment:
Q  277 gaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgact 376  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  377 aatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaatt 46126133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 48739408 - 48739269
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48739408 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 48739309  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  48739308 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 48739269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51102553 - 51102414
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  51102553 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 51102454  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  51102453 atgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 51102414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53832659 - 53832520
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53832659 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaa 53832560  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  53832559 aggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 53832520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 55453419 - 55453280
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  55453419 ctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 55453320  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  55453319 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 55453280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7755481 - 7755344
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||    
T  7755481 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaa 7755383  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaat 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  7755382 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaat 7755344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 263 - 400
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609869
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  363 gtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 48609869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54159163 - 54159051
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  54159163 ctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 54159064  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||||||||||||    
T  54159063 atgtgcttatgtg 54159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 36368946 - 36369085
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36368946 ctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36369045  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||    
T  36369046 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaatt 36369085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 37324552 - 37324687
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  37324552 attacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatat 37324651  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37324652 atttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 37324687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40804685 - 40804562
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40804685 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 40804586  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  40804585 atgtgtttatgtggctaatgtgta 40804562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 43021722 - 43021861
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-ggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43021722 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 43021821  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  43021822 atgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaatt 43021861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 53637848 - 53637987
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  53637848 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaa 53637947  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  53637948 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaatt 53637987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 53943762 - 53943623
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53943762 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 53943663  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || | |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  53943662 atatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaatt 53943623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 35594129 - 35594267
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  35594129 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 35594228  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  35594229 tatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaatt 35594267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 402
Target Start/End: Original strand, 37758936 - 37759077
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37758936 ctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaa 37759035  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaattga 402  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37759036 atgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattga 37759077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41293493 - 41293355
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||| || |||    
T  41293493 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaa 41293395  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  41293394 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaatt 41293355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41732535 - 41732674
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41732535 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 41732634  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  41732635 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 41732674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 44222840 - 44222975
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44222840 attacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgt 44222939  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  44222940 gcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 44222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47894994 - 47894875
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47894994 tagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 47894895  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgt 381  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47894894 tgtgcttatgtgactaatgt 47894875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5560207 - 5560061
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5560207 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccact 5560108  T
Q  356 taaaaatgtgcttatgtgac--taatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  5560107 taaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaatt 5560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41216462 - 41216601
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  41216462 ctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaa 41216561  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  41216562 atgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaatt 41216601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 52638849 - 52638972
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  52638849 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaa 52638948  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||| |||| ||||||||||    
T  52638949 atgtgcttctgtggctaatgtgta 52638972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48547004 - 48546894
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  48547004 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-gtcaa-atagttcatggataccacttaaaa 48546907  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||||||||||||    
T  48546906 atgtgcttatgtg 48546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 46949382 - 46949512
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46949382 ctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 46949480  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  46949481 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgg 46949512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51146390 - 51146267
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51146390 ctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51146291  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  51146290 atttgcttatgtggctaatgtgta 51146267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41882155 - 41882055
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  41882155 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 41882056  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  41882055 a 41882055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 53115454 - 53115554
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  53115454 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 53115553  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  53115554 a 53115554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 25641657 - 25641781
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||           |||| ||||    
T  25641657 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgt 25641745  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25641746 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25641781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34279881 - 34279800
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  34279881 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 34279800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 42589841 - 42589922
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42589841 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42589922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 54401198 - 54401279
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  54401198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 54401279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21597312 - 21597220
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  21597312 ctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48726158 - 48726062
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  48726158 attacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggataccatctaaaaa 48726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 55379992 - 55380084
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  55379992 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 50732077 - 50731979
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50732077 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50731979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 360
Target Start/End: Original strand, 50780779 - 50780877
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50780779 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaa 50780877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17665684 - 17665603
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  17665684 attacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 17665603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31286953 - 31286872
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  31286953 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 31286872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 37028734 - 37028815
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37028734 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg 37028815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39141286 - 39141205
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  39141286 attacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39141205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41635960 - 41635879
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  41635960 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 41635879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 45058894 - 45058975
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45058894 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 45058975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 384
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182130
Alignment:
Q  303 caatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgta 47182130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47511100 - 47511019
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  47511100 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 47511019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 51415980 - 51416061
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  51415980 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 51416061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54707380 - 54707299
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  54707380 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 54707299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 25353561 - 25353653
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  25353561 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28576276 - 28576176
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  28576276 ctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaa 28576177  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  28576176 a 28576176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Original strand, 51143825 - 51143916
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  51143825 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggatacca 51143916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  263 agattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaat 362  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  363 gtg 365  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38156792 - 38156711
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  38156792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 38156711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 30251665 - 30251573
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  30251665 ctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42998952 - 42998861
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  42998952 ctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 24688125 - 24688206
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  24688125 attacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 24688206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 40022085 - 40022166
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  40022085 attacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40022166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44946089 - 44946016
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  44946089 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagat 44946016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 49130589 - 49130670
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||    
T  49130589 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg 49130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 51224197 - 51224117
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  51224197 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 51224117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864627
Alignment:
Q  314 agcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttg 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttg 52864627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 55000338 - 55000257
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  55000338 attaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg 55000257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2228099 - 2227995
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||| || || |||    
T  2228099 ctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaa 2228000  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  2227999 atgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43176902 - 43176810
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  43176902 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggatacca 43176810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550503
Alignment:
Q  321 tgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 33550503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 329
Target Start/End: Original strand, 48752093 - 48752160
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  48752093 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtgg 48752160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 329
Target Start/End: Original strand, 52434146 - 52434215
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52434146 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg 52434215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 40165683 - 40165750
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40165683 gtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 40165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 365
Target Start/End: Original strand, 41609099 - 41609178
Alignment:
Q  286 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||| |  ||||||||||    
T  41609099 gtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8847818 - 8847718
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  8847818 attacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgt 8847719  T
Q  365 g 365  Q
    |    
T  8847718 g 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Original strand, 37741443 - 37741487
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 306  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37741443 tagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 351
Target Start/End: Original strand, 177169 - 177258
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatac 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  177169 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatac 177258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756150
Alignment:
Q  289 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 52756150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51942580 - 51942543
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51942580 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 101)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24245200 - 24245061
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24245200 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24245101  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  24245100 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaatt 24245061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 31308008 - 31308147
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31308008 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31308107  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31308108 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31308147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 43251718 - 43251857
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43251718 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 43251817  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  43251818 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 43251857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 45538160 - 45538299
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45538160 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 45538259  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  45538260 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 45538299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23221104 - 23220972
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23221104 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23221005  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23221004 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 23220972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 3611147 - 3611282
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3611147 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 3611246  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3611247 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3611282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4068858 - 4068719
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4068858 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 4068759  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  4068758 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 4068719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6327722 - 6327584
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6327722 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 6327623  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6327622 atgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaatt 6327584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17995126 - 17994987
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17995126 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 17995027  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  17995026 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 17994987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21139587 - 21139448
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21139587 ctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 21139488  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  21139487 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 21139448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 44661977 - 44662116
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44661977 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaa 44662076  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  44662077 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 44662116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25678433 - 25678295
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25678433 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 25678334  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  25678333 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 25678295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 5981177 - 5981308
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5981177 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 5981276  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5981277 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 5981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26085572 - 26085434
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  26085572 ctagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 26085474  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26085473 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 26085434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 26277184 - 26277323
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26277184 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 26277283  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26277284 atttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 26277323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33112992 - 33112853
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33112992 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 33112893  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33112892 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33112853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 33884095 - 33884234
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33884095 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33884194  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33884195 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33884234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33960157 - 33960018
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33960157 ctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaa 33960058  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  33960057 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 33960018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38790372 - 38790233
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  38790372 ctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 38790273  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38790272 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 38790233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 39646575 - 39646714
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  39646575 ctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaa 39646674  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39646675 atgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaatt 39646714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 50774228 - 50774363
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  50774228 attacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 50774327  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50774328 gcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaatt 50774363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 25058695 - 25058834
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25058695 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaa 25058794  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  25058795 atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 25058834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 25518821 - 25518952
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25518821 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 25518920  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25518921 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 31040716 - 31040855
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31040716 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31040815  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  31040816 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 31040855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 31844383 - 31844522
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31844383 ctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31844482  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31844483 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 31844522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 36003141 - 36003276
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36003141 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 36003240  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  36003241 gcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaatt 36003276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 46784430 - 46784561
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46784430 ctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaa 46784529  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46784530 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgg 46784561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 46967216 - 46967077
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46967216 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 46967117  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  46967116 atgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaatt 46967077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47383903 - 47383768
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47383903 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 47383804  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  47383803 gcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaatt 47383768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37620366 - 37620228
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37620366 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620267  T
Q  362 tgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  37620266 tgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37620228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23932681 - 23932561
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23932681 gattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatg 23932582  T
Q  364 tgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23932581 tgcttatgtggctaatgtgta 23932561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 5980075 - 5980214
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  5980075 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 5980174  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  5980175 attagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaatt 5980214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 23984762 - 23984901
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23984762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 23984861  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||    
T  23984862 atgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaatt 23984901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 26794315 - 26794450
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26794315 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 26794414  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  26794415 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 26794450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38332034 - 38331895
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  38332034 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 38331935  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38331934 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 38331895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 41999822 - 41999961
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41999822 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaa 41999921  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  41999922 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 41999961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 42863872 - 42864011
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  42863872 ctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaa 42863971  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42863972 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42864011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 400
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317461
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47317461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 47671593 - 47671732
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47671593 ctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 47671692  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  47671693 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 47671732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49254150 - 49254011
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49254150 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 49254051  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  49254050 atgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaatt 49254011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 390
Target Start/End: Original strand, 47187112 - 47187241
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  47187112 ctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaa 47187211  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggtt 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47187212 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 47187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35692839 - 35692699
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35692839 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaa 35692740  T
Q  360 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  35692739 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 35692699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 24885508 - 24885647
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24885508 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 24885607  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || || |||||||  ||||||||| ||||| || ||||||    
T  24885608 atatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaatt 24885647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26525064 - 26524925
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  26525064 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaa 26524965  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    || |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  26524964 atatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaatt 26524925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 28888588 - 28888727
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28888588 ctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaa 28888687  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||    
T  28888688 atgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaatt 28888727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 46616556 - 46616695
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  46616556 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaa 46616655  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  46616656 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 46616695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Original strand, 48373511 - 48373623
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48373511 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 48373610  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||||||||||||    
T  48373611 atgtgcttatgtg 48373623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 36566337 - 36566476
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36566337 ctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 36566436  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||    
T  36566437 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaatt 36566476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 49399163 - 49399024
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49399163 ctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaa 49399064  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  49399063 atgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaatt 49399024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 51403182 - 51403074
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51403182 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 51403084  T
Q  361 atgtgcttat 370  Q
    ||||||||||    
T  51403083 atgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 384
Target Start/End: Original strand, 3285409 - 3285531
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3285409 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaa 3285507  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3285508 atgtgcttatgtggctaatgtgta 3285531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Original strand, 35273607 - 35273726
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35273607 attatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 35273706  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  35273707 gcttatgtggctaatgtgta 35273726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Original strand, 51057082 - 51057201
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgt 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  51057082 attacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgt 51057181  T
Q  365 gcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  51057182 gcttatgtggttaatgtgta 51057201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31980110 - 31979998
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31980110 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 31980011  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    |||| ||||||||    
T  31980010 atgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 289 - 400
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450640
Alignment:
Q  289 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactgg 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  389 ttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||    
T  2450629 ttggggtaaatt 2450640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42313540 - 42313397
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagta----atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccattt 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||    
T  42313540 ctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccactt 42313441  T
Q  357 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  42313440 aaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 42313397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27983762 - 27983639
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  27983762 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg----------------ggataccatttaaaa 27983679  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  27983678 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 27983639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2557021 - 2556909
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  2557021 ctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 2556922  T
Q  361 atgtgcttatgtg 373  Q
    ||||| |||||||    
T  2556921 atgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45476009 - 45475885
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  45476009 ctagattacctttgaagaatggt--------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaa 45475918  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttggg 393  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45475917 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 45475885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 2657314 - 2657395
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  2657314 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 2657395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26472339 - 26472258
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  26472339 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 26472258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41467792 - 41467711
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  41467792 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 41467711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045648
Alignment:
Q  295 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgta 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 51045648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313249
Alignment:
Q  267 tacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata 350  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6626184 - 6626103
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6626184 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 6626103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30290070 - 30289989
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30290070 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg 30289989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 32448659 - 32448740
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  32448659 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 42234851 - 42234932
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42234851 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 42234932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 2954862 - 2954962
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  2954862 ctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaa 2954961  T
Q  361 a 361  Q
    |    
T  2954962 a 2954962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 400
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808791
Alignment:
Q  308 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||| |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatt 4808791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 26685863 - 26685955
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  26685863 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 4953063 - 4953144
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||    
T  4953063 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg 4953144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 10928078 - 10928159
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10928078 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg 10928159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 29770681 - 29770762
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  29770681 attacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 29770762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 33073222 - 33073303
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  33073222 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg 33073303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44544206 - 44544125
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44544206 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 51155749 - 51155668
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51155749 attacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg 51155668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24649886 - 24649802
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcat 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  24649886 ctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27924822 - 27924730
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  27924822 ctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39475946 - 39475843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||    
T  39475946 ctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgg-gtcaagatagtttatggataccacctaaaa 39475848  T
Q  361 atgtg 365  Q
    |||||    
T  39475847 atgtg 39475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683402
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 48683402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4243650 - 4243577
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  4243650 attacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagat 4243577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13281722 - 13281641
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  13281722 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg 13281641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 362
Target Start/End: Original strand, 33187347 - 33187448
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  33187347 ctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaa 33187446  T
Q  361 at 362  Q
    ||    
T  33187447 at 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46428413 - 46428332
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  46428413 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 1388480 - 1388572
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  1388480 ctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 1388572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4156240 - 4156188
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156240 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 10920207 - 10920299
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10920207 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38716411 - 38716319
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  38716411 ctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 39637907 - 39637996
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttc-atggatacca 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  39637907 ctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Original strand, 52323946 - 52324022
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52323946 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagat 52324022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7561702 - 7561632
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7561702 attacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34752474 - 34752393
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||    
T  34752474 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg 34752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35991759 - 35991678
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35991759 attacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 35991678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293534
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44293534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Original strand, 52367893 - 52367982
Alignment:
Q  264 gattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||    
T  52367893 gattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5961431 - 5961339
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  5961431 ctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772216
Alignment:
Q  304 aatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttgg 47772216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41895324 - 41895243
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||    
T  41895324 attacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatg 41895243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10919358 - 10919313
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaat 306  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10919358 ctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312567
Alignment:
Q  343 catggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaatt 13312567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39731 - 39592
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39731 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 39632  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  39631 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 39592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11307 - 11169
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11307 ctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 11209  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  11208 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 11169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13937 - 13798
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13937 ctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 13838  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  13837 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatt 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 75419 - 75280
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  75419 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaa 75320  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  75319 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 75280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2007
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1876 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 1975  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgg 392  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1976 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 2007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19029 - 18890
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19029 ctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaa 18930  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  18929 atgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaatt 18890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2468
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2607 ctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 2508  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  2507 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 32568 - 32707
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32568 ctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaa 32667  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  32668 atgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaatt 32707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 266 - 400
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176800
Alignment:
Q  266 ttacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtg 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  366 cttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 176800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 400
Target Start/End: Original strand, 278014 - 278154
Alignment:
Q  262 tagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggata--ccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||    
T  278014 tagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaa 278113  T
Q  360 aatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  278114 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatt 278154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3225
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||         ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3095 ctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaa 3185  T
Q  361 atgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggataaatt 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3186 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 3225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 109 - 201
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  109 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4632
Alignment:
Q  296 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtactggttgggat 395  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  396 aaatt 400  Q
    |||||    
T  4636 aaatt 4632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4719 - 4618
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4719 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 4620  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  4619 aa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 3399 - 3500
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggataccatttaaa 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3399 ctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaa 3498  T
Q  360 aa 361  Q
    ||    
T  3499 aa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Original strand, 14751 - 14843
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14751 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20549
Alignment:
Q  261 ctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatggatacca 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  20641 ctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 346
Target Start/End: Original strand, 7101 - 7183
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatggttcatg 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  7101 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 7183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 335
Target Start/End: Original strand, 17917 - 17987
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaa 335  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  17917 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaa 17987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 338
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19301
Alignment:
Q  265 attacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagat 338  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagat 19301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University