View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13139_low_44 (Length: 234)

Name: NF13139_low_44
Description: NF13139
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13139_low_44
NF13139_low_44
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (1-224)||(42362247-42362471)
chr2 (1-224)||(723793-724017)
chr2 (1-224)||(11690396-11690620)
chr2 (1-224)||(11151640-11151864)
chr2 (1-224)||(33162499-33162723)
chr2 (1-224)||(38312135-38312359)
chr2 (1-224)||(34139819-34140044)
chr2 (1-224)||(2334467-2334690)
chr2 (1-224)||(29867764-29867988)
chr2 (1-224)||(36318058-36318282)
chr2 (1-224)||(14633874-14634099)
chr2 (1-220)||(17057418-17057638)
chr2 (1-220)||(17085401-17085621)
chr2 (1-224)||(36773444-36773681)
chr2 (1-224)||(36988125-36988348)
chr2 (1-224)||(5723305-5723527)
chr2 (1-224)||(6595055-6595279)
chr2 (2-224)||(45099650-45099872)
chr2 (2-224)||(4503183-4503405)
chr2 (18-197)||(24885583-24885763)
chr2 (2-224)||(36205715-36205936)
chr2 (2-216)||(4484380-4484596)
chr2 (1-224)||(14202461-14202680)
chr2 (3-131)||(1631783-1631911)
chr2 (1-131)||(35446933-35447063)
chr2 (1-131)||(45726918-45727048)
chr2 (1-173)||(11067251-11067424)
chr2 (1-131)||(42288159-42288289)
chr2 (2-216)||(30833248-30833464)
chr2 (7-184)||(13121703-13121880)
chr2 (76-224)||(39284780-39284929)
chr2 (1-222)||(7815322-7815558)
chr2 (1-142)||(24398033-24398177)
chr2 (1-185)||(17490197-17490376)
chr2 (1-99)||(26353204-26353303)
chr2 (7-184)||(11049484-11049667)
chr2 (1-89)||(33648202-33648291)
chr2 (40-155)||(17450555-17450670)
chr2 (12-224)||(12123644-12123858)
chr2 (1-72)||(7451166-7451237)
chr2 (13-216)||(32289475-32289671)
chr2 (12-99)||(42261545-42261633)
chr2 (11-105)||(30218103-30218198)
chr2 (32-106)||(41446153-41446227)
chr2 (2-117)||(6266694-6266809)
chr2 (12-100)||(34811281-34811370)
chr2 (12-100)||(41454254-41454343)
chr2 (1-100)||(42019919-42020021)
chr2 (1-100)||(24197916-24198016)
chr2 (32-106)||(2869643-2869717)
chr2 (2-100)||(13656082-13656181)
chr2 (16-98)||(7597074-7597158)
chr2 (32-106)||(15903841-15903913)
chr2 (158-224)||(2837818-2837887)
chr2 (28-71)||(4561137-4561180)
chr2 (49-106)||(28770725-28770781)
chr2 (1-98)||(3897012-3897110)
chr2 (174-224)||(11067187-11067237)
chr2 (158-224)||(40015164-40015230)
chr2 (192-224)||(8389940-8389972)
chr2 (192-224)||(14698800-14698832)
chr2 (192-224)||(17865479-17865511)
chr2 (192-224)||(20522496-20522528)
chr2 (192-224)||(33118409-33118441)
chr2 (192-224)||(33528415-33528447)
chr2 (192-224)||(34682122-34682154)
chr2 (192-224)||(36757553-36757585)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (1-224)||(22835051-22835275)
chr3 (1-222)||(5236505-5236727)
chr3 (1-224)||(19683938-19684162)
chr3 (1-224)||(40734393-40734617)
chr3 (1-224)||(760742-760966)
chr3 (1-224)||(29810763-29810987)
chr3 (1-224)||(39153410-39153634)
chr3 (1-224)||(29682254-29682478)
chr3 (1-224)||(32890998-32891223)
chr3 (1-224)||(9581178-9581401)
chr3 (1-224)||(7762161-7762384)
chr3 (1-224)||(29812958-29813182)
chr3 (1-224)||(40735278-40735502)
chr3 (1-224)||(45095060-45095282)
chr3 (1-224)||(51398709-51398933)
chr3 (1-224)||(53921552-53921776)
chr3 (1-224)||(9666515-9666741)
chr3 (2-224)||(5260373-5260596)
chr3 (1-224)||(37408354-37408577)
chr3 (2-214)||(5258194-5258407)
chr3 (1-194)||(44331470-44331664)
chr3 (1-224)||(16498925-16499148)
chr3 (1-224)||(44700527-44700765)
chr3 (1-224)||(7764363-7764583)
chr3 (1-224)||(29196435-29196674)
chr3 (1-165)||(46860427-46860593)
chr3 (1-185)||(31314379-31314564)
chr3 (1-131)||(30236114-30236244)
chr3 (1-165)||(4569906-4570071)
chr3 (2-224)||(9636176-9636400)
chr3 (1-225)||(23410378-23410604)
chr3 (1-224)||(32744485-32744699)
chr3 (1-124)||(34491208-34491331)
chr3 (2-214)||(23200188-23200400)
chr3 (1-131)||(54593693-54593823)
chr3 (1-225)||(23391958-23392184)
chr3 (1-131)||(49199518-49199649)
chr3 (2-214)||(23197989-23198201)
chr3 (68-224)||(26386597-26386754)
chr3 (3-131)||(43401852-43401981)
chr3 (1-131)||(43403793-43403924)
chr3 (1-112)||(46173365-46173476)
chr3 (1-131)||(47304240-47304370)
chr3 (1-131)||(6095648-6095778)
chr3 (2-128)||(36018844-36018970)
chr3 (3-131)||(41819574-41819702)
chr3 (19-127)||(31340268-31340376)
chr3 (1-224)||(5373118-5373353)
chr3 (28-150)||(5433952-5434077)
chr3 (1-108)||(20937668-20937775)
chr3 (9-105)||(35138762-35138859)
chr3 (2-117)||(7780054-7780168)
chr3 (1-140)||(51352160-51352298)
chr3 (1-100)||(55302021-55302129)
chr3 (1-98)||(25491016-25491114)
chr3 (2-117)||(801094-801210)
chr3 (1-61)||(40913352-40913412)
chr3 (3-100)||(54739004-54739102)
chr3 (1-105)||(4055812-4055917)
chr3 (2-117)||(6716503-6716617)
chr3 (2-117)||(54635128-54635242)
chr3 (1-87)||(33191865-33191950)
chr3 (32-99)||(4386875-4386941)
chr3 (12-99)||(8166516-8166604)
chr3 (1-87)||(1313853-1313940)
chr3 (16-98)||(3148054-3148137)
chr3 (50-142)||(2075156-2075247)
chr3 (3-100)||(26323124-26323222)
chr3 (12-100)||(24635277-24635366)
chr3 (53-105)||(39127562-39127614)
chr3 (15-72)||(2020187-2020245)
chr3 (1-61)||(4075519-4075581)
chr3 (31-100)||(28253346-28253416)
chr3 (13-142)||(40519258-40519383)
chr3 (158-224)||(6794495-6794562)
chr3 (158-224)||(25929176-25929243)
chr3 (31-90)||(37761548-37761608)
chr3 (2-117)||(45282986-45283104)
chr3 (159-224)||(4386757-4386823)
chr3 (175-216)||(2075294-2075335)
chr3 (158-224)||(16264588-16264655)
chr3 (47-106)||(25517070-25517128)
chr3 (17-46)||(31340242-31340271)
chr3 (31-100)||(50432733-50432802)
chr3 (192-224)||(1417271-1417303)
chr3 (192-224)||(1736084-1736116)
chr3 (192-224)||(8370269-8370301)
chr3 (192-224)||(21711496-21711528)
chr3 (192-224)||(24694946-24694978)
chr3 (79-119)||(26386560-26386600)
chr3 (192-224)||(27026980-27027012)
chr3 (192-224)||(27974732-27974764)
chr3 (192-224)||(39032335-39032367)
chr3 (192-224)||(40592562-40592594)
chr3 (192-224)||(40844929-40844961)
chr3 (192-224)||(48438489-48438521)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (1-224)||(4731553-4731777)
chr8 (1-224)||(15212681-15212905)
chr8 (1-224)||(30143237-30143459)
chr8 (1-224)||(27811173-27811397)
chr8 (1-224)||(33352045-33352269)
chr8 (1-224)||(43036318-43036542)
chr8 (2-224)||(1345421-1345644)
chr8 (1-224)||(42498089-42498313)
chr8 (1-224)||(3303719-3303943)
chr8 (1-224)||(5689166-5689390)
chr8 (1-224)||(6598867-6599091)
chr8 (1-224)||(6674320-6674544)
chr8 (1-222)||(18141717-18141939)
chr8 (3-224)||(1292514-1292736)
chr8 (2-224)||(9765642-9765863)
chr8 (1-224)||(12702683-12702911)
chr8 (2-224)||(17982548-17982771)
chr8 (2-224)||(31218152-31218375)
chr8 (1-224)||(34254380-34254601)
chr8 (1-224)||(34256556-34256777)
chr8 (3-219)||(4162400-4162613)
chr8 (8-226)||(19491755-19491976)
chr8 (2-214)||(44303759-44303973)
chr8 (1-173)||(4283470-4283643)
chr8 (1-224)||(40320962-40321199)
chr8 (1-216)||(41366663-41366879)
chr8 (1-224)||(30291487-30291726)
chr8 (31-224)||(41364926-41365120)
chr8 (2-224)||(19945409-19945633)
chr8 (2-224)||(1746269-1746491)
chr8 (3-131)||(42435042-42435170)
chr8 (1-135)||(40328764-40328899)
chr8 (7-142)||(44353771-44353906)
chr8 (1-224)||(10929696-10929907)
chr8 (1-127)||(18655393-18655519)
chr8 (1-131)||(40221734-40221864)
chr8 (1-150)||(3772161-3772311)
chr8 (1-131)||(10930248-10930378)
chr8 (12-224)||(18106139-18106351)
chr8 (1-210)||(4743263-4743462)
chr8 (1-173)||(8965740-8965914)
chr8 (3-131)||(11383975-11384102)
chr8 (1-224)||(8153656-8153877)
chr8 (1-82)||(10015119-10015199)
chr8 (1-98)||(1822313-1822412)
chr8 (1-98)||(1856758-1856857)
chr8 (1-224)||(29796369-29796596)
chr8 (1-95)||(11712049-11712145)
chr8 (1-87)||(7597647-7597734)
chr8 (11-89)||(10240185-10240264)
chr8 (158-224)||(4733704-4733770)
chr8 (2-117)||(2627738-2627854)
chr8 (16-185)||(3231859-3232031)
chr8 (2-117)||(25689958-25690072)
chr8 (158-224)||(10015043-10015109)
chr8 (1-99)||(30909389-30909486)
chr8 (12-224)||(41266862-41267078)
chr8 (1-60)||(3073922-3073981)
chr8 (2-117)||(3439507-3439621)
chr8 (1-42)||(4733784-4733825)
chr8 (1-105)||(32902222-32902327)
chr8 (3-100)||(11137045-11137146)
chr8 (163-224)||(19948533-19948594)
chr8 (74-107)||(31513281-31513314)
chr8 (13-79)||(40585754-40585822)
chr8 (49-148)||(33655402-33655500)
chr8 (158-223)||(3051359-3051425)
chr8 (40-95)||(6813764-6813818)
chr8 (192-225)||(19752184-19752217)
chr8 (192-224)||(3318791-3318823)
chr8 (192-224)||(5702271-5702303)
chr8 (192-224)||(7412614-7412646)
chr8 (32-106)||(9054788-9054861)
chr8 (192-224)||(19175545-19175577)
chr8 (192-224)||(23799367-23799399)
chr8 (48-106)||(42093131-42093188)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (1-224)||(48491474-48491698)
chr7 (1-224)||(31105442-31105666)
chr7 (1-224)||(1113552-1113776)
chr7 (1-224)||(4586056-4586280)
chr7 (1-224)||(38671271-38671495)
chr7 (1-224)||(14069882-14070106)
chr7 (1-224)||(14379910-14380134)
chr7 (1-224)||(26417211-26417435)
chr7 (1-224)||(31733018-31733242)
chr7 (1-224)||(47673992-47674216)
chr7 (1-224)||(30024781-30025005)
chr7 (1-224)||(43864139-43864363)
chr7 (1-224)||(47676185-47676409)
chr7 (1-224)||(48489326-48489550)
chr7 (4-224)||(18126539-18126760)
chr7 (1-224)||(23554935-23555159)
chr7 (1-224)||(496032-496256)
chr7 (1-224)||(41649060-41649282)
chr7 (2-214)||(35853820-35854032)
chr7 (10-224)||(31518690-31518905)
chr7 (1-224)||(19502073-19502297)
chr7 (1-224)||(41317483-41317720)
chr7 (1-191)||(27347745-27347936)
chr7 (7-224)||(4178670-4178886)
chr7 (1-224)||(29990950-29991172)
chr7 (1-224)||(4253577-4253803)
chr7 (1-185)||(36146457-36146643)
chr7 (1-131)||(22269962-22270092)
chr7 (1-185)||(8153276-8153461)
chr7 (41-224)||(24525985-24526170)
chr7 (1-131)||(6431960-6432090)
chr7 (3-131)||(2361023-2361151)
chr7 (3-131)||(29608726-29608854)
chr7 (1-131)||(48599383-48599513)
chr7 (1-224)||(23565110-23565333)
chr7 (1-224)||(25615758-25615972)
chr7 (1-224)||(36574564-36574789)
chr7 (1-131)||(2390271-2390401)
chr7 (1-131)||(4508755-4508885)
chr7 (1-131)||(34310765-34310895)
chr7 (34-224)||(12097941-12098145)
chr7 (3-224)||(23343869-23344092)
chr7 (1-131)||(8359365-8359496)
chr7 (1-131)||(3258984-3259114)
chr7 (39-224)||(4538627-4538813)
chr7 (2-214)||(48408707-48408922)
chr7 (1-115)||(31518908-31519021)
chr7 (2-214)||(25767010-25767217)
chr7 (7-128)||(4510603-4510724)
chr7 (7-128)||(4512445-4512566)
chr7 (1-86)||(32358103-32358188)
chr7 (3-94)||(2759248-2759339)
chr7 (2-216)||(39731279-39731487)
chr7 (1-77)||(6360001-6360077)
chr7 (89-224)||(2761439-2761575)
chr7 (103-224)||(24514912-24515033)
chr7 (1-127)||(22328439-22328568)
chr7 (1-99)||(5116625-5116724)
chr7 (2-117)||(43504204-43504320)
chr7 (27-155)||(1360226-1360356)
chr7 (12-184)||(3904676-3904851)
chr7 (158-224)||(6570489-6570555)
chr7 (1-46)||(24525551-24525596)
chr7 (12-100)||(43363531-43363622)
chr7 (56-184)||(5514113-5514243)
chr7 (2-117)||(20343900-20344015)
chr7 (32-106)||(28617176-28617249)
chr7 (38-185)||(26639254-26639402)
chr7 (12-108)||(27073828-27073925)
chr7 (12-108)||(27204388-27204485)
chr7 (2-89)||(24789872-24789959)
chr7 (174-224)||(8153224-8153274)
chr7 (158-225)||(9184964-9185032)
chr7 (1-99)||(18396338-18396437)
chr7 (158-224)||(23402804-23402871)
chr7 (188-224)||(36146659-36146695)
chr7 (158-224)||(46516096-46516163)
chr7 (158-225)||(2580629-2580696)
chr7 (158-223)||(20284328-20284394)
chr7 (39-106)||(3047335-3047401)
chr7 (36-109)||(13065482-13065555)
chr7 (192-224)||(3047528-3047560)
chr7 (176-224)||(30843471-30843519)
chr7 (192-224)||(40808485-40808517)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-224)||(9183080-9183304)
chr6 (1-224)||(28137457-28137681)
chr6 (1-224)||(5406249-5406471)
chr6 (1-224)||(5410574-5410796)
chr6 (1-224)||(26954335-26954558)
chr6 (1-224)||(5413443-5413665)
chr6 (1-224)||(3038952-3039189)
chr6 (1-224)||(31404724-31404947)
chr6 (1-224)||(33211234-33211458)
chr6 (1-224)||(33160401-33160626)
chr6 (2-214)||(2171582-2171794)
chr6 (2-224)||(30834586-30834809)
chr6 (1-131)||(2972988-2973118)
chr6 (1-131)||(17758012-17758142)
chr6 (1-131)||(21588920-21589050)
chr6 (1-131)||(21593653-21593783)
chr6 (2-214)||(16452379-16452592)
chr6 (1-131)||(3808757-3808888)
chr6 (1-131)||(5043616-5043746)
chr6 (4-131)||(17762979-17763106)
chr6 (1-131)||(26830172-26830303)
chr6 (1-131)||(22424875-22425006)
chr6 (1-185)||(4045356-4045543)
chr6 (3-100)||(603139-603236)
chr6 (1-224)||(16568938-16569141)
chr6 (52-224)||(16567101-16567265)
chr6 (3-150)||(25073538-25073686)
chr6 (2-117)||(3072809-3072925)
chr6 (1-77)||(26800630-26800706)
chr6 (2-117)||(412104-412220)
chr6 (1-50)||(5409118-5409167)
chr6 (2-117)||(27647864-27647978)
chr6 (2-117)||(16554872-16554987)
chr6 (2-117)||(16631428-16631543)
chr6 (2-117)||(6097501-6097605)
chr6 (2-117)||(16578568-16578683)
chr6 (2-117)||(16616697-16616812)
chr6 (2-117)||(16653115-16653230)
chr6 (15-100)||(186734-186820)
chr6 (158-224)||(24435763-24435829)
chr6 (158-224)||(5757269-5757336)
chr6 (7-75)||(2908503-2908572)
chr6 (32-97)||(22615994-22616059)
chr6 (192-225)||(31936849-31936882)
chr6 (192-225)||(31979786-31979819)
chr6 (28-108)||(5740074-5740154)
chr6 (192-224)||(10076982-10077014)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (1-224)||(13488098-13488322)
chr5 (1-224)||(39468598-39468822)
chr5 (5-224)||(533664-533884)
chr5 (1-224)||(537920-538144)
chr5 (1-224)||(33831575-33831799)
chr5 (1-224)||(42428479-42428703)
chr5 (1-224)||(3075707-3075931)
chr5 (1-224)||(28750704-28750928)
chr5 (1-224)||(31182868-31183090)
chr5 (1-224)||(42426284-42426508)
chr5 (1-224)||(8565995-8566220)
chr5 (1-224)||(13239647-13239870)
chr5 (1-224)||(16451976-16452199)
chr5 (1-224)||(32636719-32636943)
chr5 (23-224)||(5887487-5887689)
chr5 (1-224)||(25412657-25412879)
chr5 (1-221)||(30682971-30683190)
chr5 (2-224)||(30182484-30182706)
chr5 (2-224)||(13342956-13343178)
chr5 (2-224)||(36074093-36074317)
chr5 (1-131)||(213454-213584)
chr5 (1-131)||(28278305-28278435)
chr5 (1-131)||(40147250-40147380)
chr5 (8-224)||(42309991-42310208)
chr5 (53-214)||(19806289-19806449)
chr5 (1-129)||(38746996-38747124)
chr5 (1-131)||(5058036-5058164)
chr5 (1-131)||(27637662-27637792)
chr5 (1-185)||(9049391-9049576)
chr5 (1-183)||(37439070-37439260)
chr5 (2-216)||(16409385-16409593)
chr5 (7-123)||(27015528-27015636)
chr5 (2-216)||(26177793-26178000)
chr5 (1-142)||(13695739-13695881)
chr5 (4-101)||(316781-316879)
chr5 (1-216)||(3325816-3326033)
chr5 (1-149)||(16640989-16641138)
chr5 (2-216)||(18441698-18441906)
chr5 (2-216)||(9789274-9789482)
chr5 (105-224)||(42926788-42926908)
chr5 (12-99)||(35616190-35616278)
chr5 (3-105)||(10054867-10054969)
chr5 (5-105)||(33906083-33906184)
chr5 (19-76)||(42926911-42926968)
chr5 (1-108)||(10700697-10700804)
chr5 (15-94)||(30802854-30802934)
chr5 (2-117)||(29751210-29751325)
chr5 (6-117)||(22536344-22536454)
chr5 (2-117)||(29720367-29720482)
chr5 (2-117)||(29722527-29722642)
chr5 (2-100)||(22097884-22097981)
chr5 (2-216)||(26170684-26170880)
chr5 (2-100)||(10593277-10593376)
chr5 (8-71)||(8445764-8445828)
chr5 (15-94)||(32609561-32609641)
chr5 (7-46)||(42926965-42927004)
chr5 (28-106)||(14689503-14689581)
chr5 (187-224)||(16649858-16649895)
chr5 (13-129)||(6016999-6017115)
chr5 (12-74)||(32576357-32576419)
chr5 (46-106)||(33030891-33030950)
chr5 (1-61)||(30793195-30793256)
chr5 (32-106)||(7160854-7160927)
chr5 (192-224)||(10282028-10282060)
chr5 (158-224)||(11181623-11181690)
chr5 (192-224)||(14520504-14520536)
chr5 (158-224)||(24553318-24553385)
chr5 (158-224)||(28832496-28832563)
chr5 (37-88)||(30899945-30899994)
[»] chr4 (99 HSPs)
chr4 (1-224)||(34570463-34570687)
chr4 (1-224)||(54199955-54200179)
chr4 (1-224)||(5429574-5429798)
chr4 (1-224)||(9927507-9927730)
chr4 (1-224)||(12739599-12739823)
chr4 (1-224)||(12747805-12748029)
chr4 (1-224)||(26175685-26175909)
chr4 (1-224)||(56178686-56178909)
chr4 (1-224)||(48142937-48143162)
chr4 (1-224)||(36994420-36994643)
chr4 (1-224)||(52095411-52095635)
chr4 (1-224)||(52467403-52467628)
chr4 (1-224)||(37740521-37740744)
chr4 (1-224)||(24969006-24969231)
chr4 (1-224)||(5871715-5871939)
chr4 (1-224)||(47038460-47038682)
chr4 (1-223)||(12745485-12745708)
chr4 (10-224)||(52082715-52082930)
chr4 (1-210)||(31474059-31474270)
chr4 (1-185)||(36463438-36463623)
chr4 (1-224)||(29254389-29254613)
chr4 (1-173)||(4587904-4588078)
chr4 (1-224)||(45687231-45687469)
chr4 (1-224)||(6542228-6542455)
chr4 (1-129)||(379371-379499)
chr4 (1-224)||(13009493-13009704)
chr4 (1-224)||(48893687-48893918)
chr4 (4-131)||(54883009-54883136)
chr4 (1-131)||(8665397-8665527)
chr4 (1-131)||(40632434-40632564)
chr4 (1-224)||(29999855-30000078)
chr4 (1-155)||(3913412-3913567)
chr4 (1-224)||(5370132-5370359)
chr4 (1-131)||(12073381-12073511)
chr4 (1-131)||(26364225-26364355)
chr4 (1-131)||(27417014-27417144)
chr4 (1-131)||(2209702-2209833)
chr4 (1-131)||(41964404-41964535)
chr4 (1-131)||(46703489-46703620)
chr4 (1-131)||(6655945-6656075)
chr4 (1-131)||(35662430-35662560)
chr4 (1-131)||(50673896-50674025)
chr4 (3-136)||(46147442-46147575)
chr4 (1-131)||(8648128-8648258)
chr4 (1-107)||(12743974-12744080)
chr4 (1-107)||(12745363-12745469)
chr4 (1-131)||(41639415-41639545)
chr4 (15-223)||(48142440-48142651)
chr4 (3-173)||(50262752-50262920)
chr4 (2-214)||(13992343-13992549)
chr4 (29-165)||(55085442-55085578)
chr4 (1-100)||(12744096-12744195)
chr4 (5-224)||(5207895-5208116)
chr4 (1-173)||(12119483-12119659)
chr4 (1-224)||(37229770-37230009)
chr4 (1-224)||(51336958-51337183)
chr4 (1-131)||(21688237-21688368)
chr4 (1-89)||(26699491-26699580)
chr4 (32-131)||(41639252-41639351)
chr4 (1-224)||(6677362-6677589)
chr4 (3-95)||(22882801-22882894)
chr4 (3-95)||(22934465-22934558)
chr4 (16-150)||(32091448-32091583)
chr4 (1-99)||(34112838-34112937)
chr4 (1-98)||(33089900-33089998)
chr4 (1-97)||(33989867-33989964)
chr4 (15-106)||(5349924-5350016)
chr4 (1-142)||(29056336-29056478)
chr4 (2-117)||(31495366-31495482)
chr4 (7-142)||(53345195-53345331)
chr4 (1-100)||(16422655-16422755)
chr4 (14-100)||(44570427-44570514)
chr4 (3-101)||(21703886-21703986)
chr4 (28-100)||(34788851-34788923)
chr4 (177-224)||(52093890-52093937)
chr4 (28-112)||(44967906-44967989)
chr4 (175-224)||(46147579-46147628)
chr4 (1-101)||(52065616-52065717)
chr4 (158-224)||(3910002-3910068)
chr4 (2-117)||(8393397-8393512)
chr4 (2-117)||(8395606-8395721)
chr4 (53-99)||(35369542-35369588)
chr4 (53-99)||(35370449-35370495)
chr4 (32-107)||(39774254-39774329)
chr4 (31-87)||(1983271-1983325)
chr4 (1-72)||(40975058-40975129)
chr4 (158-224)||(10047620-10047687)
chr4 (192-225)||(16628662-16628695)
chr4 (188-221)||(36463639-36463672)
chr4 (15-99)||(41961438-41961523)
chr4 (192-224)||(3777823-3777855)
chr4 (158-221)||(5147917-5147981)
chr4 (192-224)||(5268991-5269023)
chr4 (1-97)||(6199921-6200020)
chr4 (192-224)||(6375970-6376002)
chr4 (192-224)||(16623084-16623116)
chr4 (32-106)||(37781935-37782008)
chr4 (37-100)||(39593806-39593867)
chr4 (192-224)||(54867453-54867485)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (1-224)||(196957-197181)
chr1 (1-224)||(834216-834440)
chr1 (1-224)||(31659133-31659357)
chr1 (1-224)||(3156761-3156984)
chr1 (1-224)||(3847170-3847394)
chr1 (1-224)||(28220275-28220499)
chr1 (1-224)||(8550836-8551060)
chr1 (1-224)||(28223470-28223694)
chr1 (1-224)||(44455055-44455279)
chr1 (1-224)||(49918244-49918469)
chr1 (1-224)||(15820202-15820426)
chr1 (1-224)||(13138025-13138247)
chr1 (1-224)||(46064813-46065037)
chr1 (1-224)||(50169259-50169483)
chr1 (1-224)||(28265603-28265839)
chr1 (1-224)||(1833417-1833641)
chr1 (1-223)||(4552686-4552909)
chr1 (1-224)||(37503606-37503827)
chr1 (3-224)||(10925118-10925343)
chr1 (1-224)||(37559917-37560142)
chr1 (1-224)||(50167224-50167461)
chr1 (1-224)||(3189226-3189449)
chr1 (1-224)||(3198043-3198266)
chr1 (1-224)||(3206882-3207105)
chr1 (1-224)||(13659385-13659609)
chr1 (2-224)||(23555315-23555538)
chr1 (1-224)||(20762567-20762791)
chr1 (1-224)||(45644403-45644628)
chr1 (8-226)||(41360805-41361026)
chr1 (1-165)||(47255389-47255553)
chr1 (1-224)||(40122245-40122471)
chr1 (1-224)||(928025-928251)
chr1 (1-131)||(11348687-11348817)
chr1 (1-131)||(13547138-13547268)
chr1 (5-210)||(30476499-30476707)
chr1 (1-131)||(37168286-37168417)
chr1 (1-131)||(13549049-13549179)
chr1 (1-131)||(29136236-29136366)
chr1 (1-131)||(42298024-42298154)
chr1 (1-131)||(19754483-19754614)
chr1 (1-131)||(37033121-37033252)
chr1 (1-131)||(31925756-31925886)
chr1 (1-131)||(47115160-47115291)
chr1 (1-131)||(193600-193730)
chr1 (1-127)||(7482279-7482406)
chr1 (1-155)||(16455586-16455740)
chr1 (1-131)||(19752674-19752805)
chr1 (1-131)||(34603565-34603696)
chr1 (2-117)||(13316402-13316517)
chr1 (1-100)||(22079336-22079436)
chr1 (47-131)||(37879006-37879090)
chr1 (2-216)||(51765298-51765515)
chr1 (1-100)||(3460715-3460816)
chr1 (1-93)||(6808479-6808572)
chr1 (39-112)||(36683698-36683771)
chr1 (15-150)||(12318585-12318721)
chr1 (1-138)||(37282740-37282877)
chr1 (33-131)||(8871129-8871227)
chr1 (1-83)||(2263023-2263106)
chr1 (12-105)||(16914234-16914329)
chr1 (2-100)||(32471481-32471579)
chr1 (1-224)||(44650211-44650437)
chr1 (12-105)||(25652101-25652195)
chr1 (1-97)||(9109468-9109565)
chr1 (13-100)||(4535541-4535629)
chr1 (2-117)||(9987205-9987319)
chr1 (2-117)||(20622287-20622403)
chr1 (174-224)||(777125-777175)
chr1 (1-105)||(13938152-13938257)
chr1 (1-51)||(37876815-37876865)
chr1 (2-117)||(9036420-9036534)
chr1 (2-117)||(40282380-40282495)
chr1 (158-214)||(13316525-13316581)
chr1 (2-99)||(21053978-21054076)
chr1 (12-148)||(1050503-1050640)
chr1 (36-100)||(35109494-35109557)
chr1 (1-100)||(2926528-2926628)
chr1 (1-70)||(5459956-5460025)
chr1 (1-43)||(28242382-28242423)
chr1 (15-100)||(41135840-41135926)
chr1 (49-211)||(44646881-44647045)
chr1 (158-224)||(47102630-47102697)
chr1 (36-99)||(1485855-1485918)
chr1 (158-224)||(47703724-47703793)
chr1 (192-225)||(32889712-32889745)
chr1 (192-224)||(21536361-21536393)
chr1 (192-224)||(29652087-29652119)
chr1 (192-224)||(47098616-47098648)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (1-224)||(20464-20688)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-224)||(149146-149370)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (2-224)||(434428-434651)
scaffold0002 (12-99)||(490380-490468)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-224)||(114485-114721)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (2-214)||(822-1033)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (2-173)||(11504-11675)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (5-131)||(7316-7442)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (2-216)||(11211-11427)
scaffold0491 (2-216)||(8785-9001)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-127)||(18053-18178)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (7-131)||(80338-80462)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-142)||(10468-10608)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (1-185)||(27491-27678)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (12-109)||(25065-25162)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (192-224)||(36623-36655)
scaffold0087 (192-224)||(43752-43784)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (192-224)||(85957-85989)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42362471 - 42362247
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42362471 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 42362372  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  42362371 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 42362272  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42362271 ctcaaccctaaagttacctcctttg 42362247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 723793 - 724017
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  723793 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 723892  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  723893 cagttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagacc 723992  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  723993 ctcaaccctaaagttacctcctttg 724017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11690620 - 11690396
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690620 tctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 11690521  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  11690520 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactataatcaaagacc 11690421  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11690420 ctcaaccctaaagttacctcctttg 11690396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11151640 - 11151864
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11151640 tctctccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacc 11151739  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  11151740 cattttcccaatttcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 11151839  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11151840 ctcaaccctaaagttacctcctttg 11151864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33162499 - 33162723
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33162499 tctctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 33162598  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33162599 cattttcctaatttcaccaatgaacaagacactcgatgattttcaatcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaaccctaatcaaagacc 33162698  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  33162699 ctcaaccctaaaattacctcctttg 33162723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38312359 - 38312135
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38312359 tctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 38312260  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  38312259 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacacaaggtgtatacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaac 38312160  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38312159 ctcaaccctaaagttacctcctttg 38312135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 34139819 - 34140044
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139819 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 34139918  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  34139919 ccattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 34140018  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
      ||||||||||||||||||||||||    
T  34140019 tttcaaccctaaagttacctcctttg 34140044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2334467 - 2334690
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2334467 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacc 2334566  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||    
T  2334567 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaatacc 2334665  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2334666 ctcaaccctaaagttacctcctttg 2334690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29867988 - 29867764
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29867988 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 29867889  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  29867888 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 29867789  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||| | |||||||| |||||    
T  29867788 ctcaacccaatagttaccttctttg 29867764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36318058 - 36318282
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36318058 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 36318157  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||     
T  36318158 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagataactctaatcaaagaca 36318257  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  36318258 ttcaaccctaaagttacctcctttg 36318282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14633874 - 14634099
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14633874 tctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctac 14633973  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||    
T  14633974 ccattttaccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaaaac 14634073  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14634074 cctcaactctaaagttacctcctttg 14634099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17057418 - 17057638
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17057418 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacc 17057517  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17057518 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 17057617  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcc 220  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  17057618 ttcaaccctaaagttacctcc 17057638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17085401 - 17085621
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17085401 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacc 17085500  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17085501 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 17085600  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcc 220  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  17085601 ttcaaccctaaagttacctcc 17085621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36773681 - 36773444
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  36773681 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcc 36773582  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  36773581 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagagaacc 36773482  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773481 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 36773444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36988125 - 36988348
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36988125 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttctacc 36988224  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  36988225 cttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttactatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 36988323  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36988324 ctcaaccctaaagttacctcctttg 36988348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5723305 - 5723527
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5723305 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttctacc 5723404  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5723405 -cttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5723502  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |  |||||||||||| |||||||||    
T  5723503 ccaaaccctaaagttgcctcctttg 5723527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6595055 - 6595279
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6595055 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 6595154  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatt-tcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     | |||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || || |  |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  6595155 attttttcctaatctcaccaatgaacaagacacccaatgattctcactctcc-aaagtgtttacaatttttcccagcccaagagaactctaatcaaagac 6595253  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6595254 cctcaaccctaaagttacctcatttg 6595279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45099872 - 45099650
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45099872 ctctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 45099774  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  45099773 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 45099675  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  45099674 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 45099650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 4503183 - 4503405
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  4503183 ctctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 4503281  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  4503282 ttttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaac 4503380  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  4503381 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 4503405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885583
Alignment:
Q  18 caatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcac 117  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaattttac 24885664  T
Q  118 aaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  24885663 aaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccatgagaactctaatcaaaga 24885583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 36205715 - 36205936
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  36205715 ctctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 36205813  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  36205814 tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccc 36205912  T
Q  201 tcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  36205913 taaaccctaaagttgcttcctttg 36205936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 4484380 - 4484596
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4484380 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 4484479  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaaga 197  Q
    || || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  4484480 cttttctcccaatttcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 4484577  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttac 216  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  4484578 ccctaaaccctagagttac 4484596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14202461 - 14202680
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14202461 tctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagg-------atgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 14202553  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaag--acattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  14202554 cattttcccaatctcagaaatgaaaaagacacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 14202653  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14202654 ccctcaaccataaagttacctcatttg 14202680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 1631783 - 1631911
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1631783 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctaccca 1631882  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  1631883 tttttccaatctcaccaatgaacaagaca 1631911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35446933 - 35447063
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35446933 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctacc 35447032  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  35447033 aattttaccaatctcaccaatgaacaagaca 35447063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45727048 - 45726918
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45727048 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacc 45726949  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  45726948 cattttcccaatctcaccaatgaataagaca 45726918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11067424 - 11067251
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  11067424 tctcttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacc 11067325  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca 173  Q
     ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  11067324 catttttccaatttcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccca 11067251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42288159 - 42288289
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42288159 tctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacc 42288258  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  42288259 cattttcccaatctcaccaatgcacaagaca 42288289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30833464 - 30833248
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30833464 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 30833365  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaaga 197  Q
    || || ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||| |    
T  30833364 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactcacc-aaagtgtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaaaa 30833267  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttac 216  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  30833266 ccctaaaccctagagttac 30833248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13121880 - 13121703
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattt 105  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13121880 caatccactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attt 13121784  T
Q  106 tcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaa 184  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13121783 tcccagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaa 13121703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284780
Alignment:
Q  76 acaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccac 174  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaa 39284830  T
Q  175 ctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284829 cccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 39284780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7815322 - 7815558
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||    
T  7815322 tctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaaca----------- 186  Q
    || ||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||| || | ||| |||||                
T  7815422 ct-ttttctcaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcacccacctaaggtgtttacaaatgtttctcaacccaatagaacctctcaagatta 7815520  T
Q  187 --ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctt 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7815521 tcctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctt 7815558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24398177 - 24398033
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24398177 tctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttcta 24398078  T
Q  99 -cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
     ||| | ||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  24398077 ccctttcttcacaatctcaccaatgaacaagacactcattgattt 24398033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 17490197 - 17490376
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||    
T  17490197 tctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaa----atttctacc 17490292  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
     ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |  ||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17490293 -attttcc-aatctcaacaatgaacaagacattcaatgattttcacccacccactgtgtttgcaatgttttccaactcaagagaac 17490376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26353303 - 26353204
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26353303 tctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctac 26353204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11049667 - 11049484
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaa---agaacaaa-cctaatttctacct 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||     
T  11049667 caatctactatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttatacc- 11049569  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaa 184  Q
    ||||||| ||| |||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  11049568 attttcctaatctcaccaaaaaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacacaagagaa 11049484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33648291 - 33648202
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 89  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33648291 tctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 33648202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17450670 - 17450555
Alignment:
Q  40 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  17450670 acaaatgggttacaa-aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctcaccaatgaacaagacactcaatga 17450572  T
Q  140 -tttcactcacctaagg 155  Q
     ||||||||||| ||||    
T  17450571 ttttcactcacccaagg 17450555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 12123644 - 12123858
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccca 110  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||  ||||||| |    
T  12123644 cactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactcattttcc-a 12123742  T
Q  111 atttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccct 208  Q
    || || ||||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||  |||| || ||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| |    
T  12123743 atctctcaaatgaacaagacactcgatgattttcactcatccaaggtgtttataaatgtttcccaacctaagagaactctaaccaaagaccatcaacctt 12123842  T
Q  209 aaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||| |||||    
T  12123843 aaagttacctactttg 12123858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7451237 - 7451166
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 72  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7451237 tctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagcttcaacaag 7451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32289671 - 32289475
Alignment:
Q  13 actatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||    
T  32289671 actatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc--cttttccaa 32289574  T
Q  112 tttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagaccctcaacccta 209  Q
    | ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | | |||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  32289573 tctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttaccatgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaagactctaaacccta 32289482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 42261545 - 42261633
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  42261545 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 30218103 - 30218198
Alignment:
Q  11 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattt 105  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30218103 ccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaagaacaaacctaacttctacccattt 30218198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41446227 - 41446153
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41446227 aaagagatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttctacctttttt 41446153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6266809 - 6266694
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6266809 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 6266711  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  6266710 c-cttttcccaatctcac 6266694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41454343 - 41454254
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  41454343 cactatcaatgagttctttacaaatatatacaaaagagttgctagaaattagcttcaacaagctctcaaaaaacaaatctaatttctacc 41454254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 42019919 - 42020021
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct 97  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||| ||||    
T  42019919 tctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagctttataagaacaaacataaattct 42020018  T
Q  98 acc 100  Q
    |||    
T  42020019 acc 42020021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24198016 - 24197916
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag-cttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttct 97  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||  ||||||||    
T  24198016 tctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaagagatacaa--gggttacaagaaattagccttcaacaagttctccaagaaaaaactttaatttct 24197919  T
Q  98 acc 100  Q
    |||    
T  24197918 acc 24197916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2869717 - 2869643
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac--aaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2869717 aaagtgatacaaaggagttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaaacctaatttctacccatttt 2869643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 13656082 - 13656181
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  13656082 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 13656179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 7597074 - 7597158
Alignment:
Q  16 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttcta 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  7597074 atcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttcataaggaacaaaacctaatttcta 7597158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15903913 - 15903841
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  15903913 aaagtgatacaaaggggttacaagaaat-agctt--acaagctcacaaagaacaaattctaatttctacccatttt 15903841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2837887 - 2837818
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttccca--cctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2837887 tttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 2837818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4561180 - 4561137
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 71  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4561180 ttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagcttcaacaa 4561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28770781 - 28770725
Alignment:
Q  49 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28770781 ttacaagaaattagcttaaa--agctcacaaagaacaaactctaatttctacccatttt 28770725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 3897110 - 3897012
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||   |||||||| | |||||||||    
T  3897110 tctctctaatccactttcaatgagttctttacaaaattatacaaaagagttacaaaaaattagcttcaacgagttcttcaagaacaatcttaatttcta 3897012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11067237 - 11067187
Alignment:
Q  174 cctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11067237 cctcaagagaaccttaatcaaagacaatcaaccataaagttacctcctttg 11067187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 40015164 - 40015230
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   |||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  40015164 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcaatacaaaacactcaaccctaaagttacctcctttg 40015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8389972 - 8389940
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8389972 caaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 8389940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14698832 - 14698800
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14698832 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 14698800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 17865479 - 17865511
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17865479 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 17865511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 20522496 - 20522528
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20522496 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 20522528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 33118409 - 33118441
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33118409 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 33118441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33528447 - 33528415
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33528447 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 33528415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34682154 - 34682122
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34682154 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 34682122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36757585 - 36757553
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36757585 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 36757553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22835051 - 22835275
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22835051 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 22835150  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22835151 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgattacaatgtttcccaacacaagagaactctaatcaaagacc 22835250  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22835251 ctcaaccctaaagttacctcctttg 22835275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 5236505 - 5236727
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5236505 tctctcgaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 5236604  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5236605 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5236704  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5236705 ctcaaccctaaagttacctcctt 5236727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19683938 - 19684162
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19683938 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 19684037  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  19684038 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 19684137  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  19684138 cttaaccctaaagttaactcctttg 19684162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40734617 - 40734393
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40734617 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 40734518  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  40734517 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 40734418  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  40734417 ctcaaccctaaagttatctcctttg 40734393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 760966 - 760742
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  760966 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctacc 760867  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  760866 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 760767  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  760766 cttaaccctaaagttaactcctttg 760742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29810987 - 29810763
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  29810987 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctaca 29810888  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  29810887 tattttcctaatctcaccaatgaataagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagacc 29810788  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  29810787 ctcaaccctaaaattacctcctttg 29810763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39153410 - 39153634
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39153410 tctctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacc 39153509  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  39153510 cattttcccaatctcacacatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 39153609  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39153610 ctcaaccctaaagttacctcctttg 39153634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29682478 - 29682254
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682478 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 29682379  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  29682378 cattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 29682279  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  29682278 cttaaccctaaatttaactcctttg 29682254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32891223 - 32890998
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32891223 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctac 32891124  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||| |||| ||||  | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32891123 ccattttctcaatctcaccgaagaacaagacactcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaatcaaagac 32891024  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32891023 cctcaaccctaaagttacctcctttg 32890998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9581401 - 9581178
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581401 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 9581302  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     | ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  9581301 ca-tttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 9581203  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  9581202 cttaaccctaaagttaactcctttg 9581178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7762384 - 7762161
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7762384 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 7762285  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      ||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  7762284 ctttttctcaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgttcacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 7762186  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7762185 ctcaaccctaaagttacctcctttg 7762161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29813182 - 29812958
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29813182 tctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 29813083  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  29813082 tatttttccaatctcaccaattaacaagcccctcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgcttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 29812983  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29812982 ctcaaccctaaagttacctcctttg 29812958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40735502 - 40735278
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40735502 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 40735403  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||  |||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||    
T  40735402 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagaactttaatcaaagacc 40735303  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40735302 ctcaaccctaaagttacctcctttg 40735278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45095282 - 45095060
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095282 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 45095183  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  45095182 -attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 45095085  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||| ||||    
T  45095084 ctaaaccctaaagttgcctcttttg 45095060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51398933 - 51398709
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  51398933 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctacc 51398834  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||||||||     
T  51398833 catttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagaaaactctaatcaaagact 51398734  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51398733 ctcaaccctaaagttacctcctttg 51398709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 53921552 - 53921776
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53921552 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattagctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacc 53921651  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||     
T  53921652 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtttttacaatgttttccaacccaagaaaaccctaatcaaagact 53921751  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  53921752 ctcaaccctaaagttacctcatttg 53921776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9666515 - 9666741
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9666515 tctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctac 9666614  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9666615 ccatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaactgaagagaaccctaatcaaaga 9666714  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9666715 ccctcaaccctaaagttacctcatttg 9666741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 5260373 - 5260596
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5260373 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 5260472  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5260473 ttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5260571  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  5260572 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 5260596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37408577 - 37408354
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37408577 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 37408478  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  37408477 ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactca-ctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 37408379  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     | |||||||||||| |||||||||    
T  37408378 ataaaccctaaagttgcctcctttg 37408354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5258194 - 5258407
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5258194 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 5258293  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5258294 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5258392  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||||||||||||    
T  5258393 ctaaaccctaaagtt 5258407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44331664 - 44331470
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44331664 tctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 44331565  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaa 194  Q
     ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  44331564 cattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaa 44331470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16499148 - 16498925
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16499148 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatc 16499050  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||    
T  16499049 cgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagacc 16498950  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  16498949 ctcaacccacaagttacctcctttg 16498925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44700527 - 44700765
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44700527 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 44700626  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttccca-------------cctcaagagaac 185  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||             |||||||| |||    
T  44700627 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagataac 44700726  T
Q  186 actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44700727 cctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctcctttg 44700765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7764583 - 7764363
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7764583 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 7764484  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||    
T  7764483 -cttttccc--tctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcctaacccaagagaaatctaatcaaagacc 7764388  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  7764387 ctcaactctaaagttacctcctttg 7764363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29196435 - 29196674
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29196435 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctac 29196534  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttccca-------------cctcaagagaa 184  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||              ||||||| ||    
T  29196535 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacctctcaagaaaa 29196634  T
Q  185 cactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29196635 ccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 29196674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46860593 - 46860427
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860593 tctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 46860494  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga--tttcactcacctaaggcatttacaat 165  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||| || ||||  ||||||||    
T  46860493 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgaattttcactctcccaaggtgtttacaat 46860427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31314564 - 31314379
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  31314564 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacc 31314465  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
     |||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  31314464 cattttctcaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 31314379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30236244 - 30236114
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30236244 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 30236145  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30236144 cattttcccaatctcatcaatgaacaagaca 30236114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4570071 - 4569906
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4570071 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 4569972  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaat 165  Q
     ||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  4569971 cattttcccaatctcaccaaagaacaaaacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 4569906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 9636176 - 9636400
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9636176 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 9636275  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagaga-acactaatcaaagac 198  Q
    | || ||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  9636276 ttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaagac 9636374  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||    
T  9636375 cctaaaccctaaagtttcttcctttg 9636400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23410378 - 23410604
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23410378 tctctccaatccattatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacc 23410477  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaag 196  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| ||| | |||||||||   ||||  |||||    
T  23410478 cattttccaaatttcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcacta--caaag 23410575  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||    
T  23410576 acactcaaccctaaagttctctcctttgc 23410604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 32744485 - 32744699
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32744485 tctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-ctaatttctacc 32744583  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||  |||| |||||||        | | ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  32744584 cattttttcaatctcacaaa--------atactcaatgattttcactcacc-aatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 32744674  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32744675 ctcaaccctaaagttacctcctttg 32744699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34491331 - 34491208
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34491331 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 34491232  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaa 124  Q
     ||||||||||| |||| ||||||    
T  34491231 cattttcccaatctcaccaatgaa 34491208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 23200188 - 23200400
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||     
T  23200188 ctctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacca 23200287  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagag-aacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  23200288 tttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagacc 23200385  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||||||| ||||    
T  23200386 ctaaaccctagagtt 23200400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54593823 - 54593693
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  54593823 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgca 54593724  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54593723 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 54593693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23391958 - 23392184
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23391958 tctctacaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctact 23392057  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaag 196  Q
     ||||||||||  |||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  |||||    
T  23392058 cattttcccaaactcaccaatgaaaaagacactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaag 23392155  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    || |||||||||||| ||  |||||||||    
T  23392156 acactcaaccctaaatttctctcctttgc 23392184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 49199518 - 49199649
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49199518 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctac 49199617  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  49199618 ccattttcccaatctcaccaacgaacaagaca 49199649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 23197989 - 23198201
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||     
T  23197989 ctctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctacca 23198088  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagag-aacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  23198089 tttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagacc 23198186  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||||||| ||||    
T  23198187 ctaaaccctagagtt 23198201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386754
Alignment:
Q  68 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | ||||||  ||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtatttaccctg 26386696  T
Q  167 tttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26386697 tttcccaacctaagagaactctaatcaaagactctcaaccctaaagttacctcctttg 26386754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 43401852 - 43401981
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  43401852 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 43401951  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43401952 attttcccaatctcaccaatgaacaagaca 43401981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 43403793 - 43403924
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa-atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43403793 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctac 43403892  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43403893 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 43403924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 46173476 - 46173365
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46173476 tctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 46173377  T
Q  101 tattttcccaat 112  Q
     ||||| |||||    
T  46173376 aattttaccaat 46173365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47304370 - 47304240
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  47304370 tctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaagatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacc 47304271  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47304270 cattttctcaatctcacaaatgaacaagaca 47304240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 6095648 - 6095778
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||     
T  6095648 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctact 6095747  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  6095748 cattttcccaatctcaccaatgaataagaca 6095778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 36018970 - 36018844
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36018970 ctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcaacc 36018872  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaag 128  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36018871 cattttcccaatttcaccaatgaacaag 36018844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 41819574 - 41819702
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  41819574 tctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccc 41819672  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41819673 attttcccaatctcaccaatgaacaagaca 41819702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340376
Alignment:
Q  19 aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcaca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||     
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctcacc 31340367  T
Q  119 aatgaacaa 127  Q
    |||||||||    
T  31340368 aatgaacaa 31340376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373118
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  99 -cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacc-------taaggcattta-caatgtttcccacctcaagagaacact 188  Q
     ||| |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||       |||||  |||| |||||||||||| | |||||||||  |    
T  5373253 cccttttttcccaatctcttcaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccacccaataaggtgtttaccaatgtttcccaacccaagagaacctt 5373154  T
Q  189 aatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5373153 caccaaagactctcaaccttaaagttacctcctttg 5373118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 5433952 - 5434077
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc-tattttcccaatttcacaaatgaac 125  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||    
T  5433952 ttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaatgaac 5434051  T
Q  126 aagacattcaatga-tttcactcacc 150  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  5434052 aagacactcaatgattttcactcacc 5434077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20937775 - 20937668
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  20937775 tctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaacaaacataatttctac 20937677  T
Q  100 ctattttcc 108  Q
    |||||||||    
T  20937676 ctattttcc 20937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 35138762 - 35138859
Alignment:
Q  9 atccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35138762 atccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacataatttctacccattt 35138859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 7780054 - 7780168
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7780054 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc 7780152  T
Q  101 tattttcccaatttcac 117  Q
      |||||||||| ||||    
T  7780153 -cttttcccaatctcac 7780168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 51352160 - 51352298
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  51352160 tctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaatgg-ttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccctaacttctat 51352258  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgat 140  Q
    | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  51352259 c-attttcctaatctcaccaataaacaagacactcaatgat 51352298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 55302021 - 55302129
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt---------tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccta 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  55302021 tctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatacaagaaattagcttcaacaaacttacaaagaacaacccta 55302120  T
Q  92 atttctacc 100  Q
    |||||||||    
T  55302121 atttctacc 55302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 25491016 - 25491114
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25491016 tctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttcta 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 801210 - 801094
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  801210 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctac 801111  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  801110 c-cttttcccaatctcac 801094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40913412 - 40913352
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 61  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40913412 tctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739102
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttacat-aaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 4055812 - 4055917
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatg-ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  4055812 tctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaac-aacctaatttcta 4055910  T
Q  99 cctattt 105  Q
    || ||||    
T  4055911 cccattt 4055917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 6716617 - 6716503
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6716617 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 6716520  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  6716519 c-cttttcccaatctcac 6716503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 54635242 - 54635128
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  54635242 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 54635145  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  54635144 c-cttttcccaatctcac 54635128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33191950 - 33191865
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33191950 tctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacata-aaatgg-ttacaagaacttagcttcaacaagctctctaagaacaaa 33191865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386875
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 4386875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 8166516 - 8166604
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  8166516 cactatcaacaagttctttacaaagagatacaaaaaggttataagatattaacttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctac 8166604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 1313853 - 1313940
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctta-caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 87  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  1313853 tctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaaa 1313940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 3148054 - 3148137
Alignment:
Q  16 atcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  3148054 atcaatgagattcttacaaacaaatacaataaggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaagaaacctaatttcta 3148137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Original strand, 2075156 - 2075247
Alignment:
Q  50 tacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2075156 tacaataaattagcttaaa--agctcacaaagaaccaactctaattactaccatttttcccaatatcaccaatgaacaagacactcaatgattt 2075247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 26323124 - 26323222
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||||    
T  26323124 tctccacttcactatcaatgagttttttaccaagatatacaaaaaggttacaagaaattagcttcaacaaactcttcaaaaacaaacctaatttttacc 26323222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24635366 - 24635277
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  24635366 cactatcaatgaattgattataaagagatacaaaatagttacaaaaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacttaatttctacc 24635277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39127614 - 39127562
Alignment:
Q  53 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  39127614 aagaaattagcttcaacaagctcaccaagaacaaacataatttatacttattt 39127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2020245 - 2020187
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 72  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2020245 tatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaag 2020187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 4075519 - 4075581
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatg-ggttacaagaaatta 61  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  4075519 tctctccaatccactatcaaagagtttcttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaatta 4075581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Original strand, 28253346 - 28253416
Alignment:
Q  31 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  28253346 caaagaaatacaaaatcgttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctacc 28253416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Original strand, 40519258 - 40519383
Alignment:
Q  13 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctacctattttccca 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||    | ||||||||||| ||||||||||  | |||||| |    
T  40519258 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaata-ttacaagaaattaacttcaacaa----ataaagaacaaactctaatttctat-tgttttccta 40519351  T
Q  111 atttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    || || | |||||| |||||||||||||||||    
T  40519352 atatctccaatgaataagacattcaatgattt 40519383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6794562 - 6794495
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6794562 tttacaatgtttcccaactcaagagaacctcacta--caatgacactcaaccctaaagttacctcctttg 6794495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25929243 - 25929176
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25929243 tttacaatgttttccaactcaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 25929176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 37761548 - 37761608
Alignment:
Q  31 caaagagata-caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacct 90  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  37761548 caaagagatatcaaaagggttacaataaattagttttaacaagcccacaaagaacaaacct 37761608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 45283104 - 45282986
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaaga----gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaattt 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  45283104 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaattt 45283007  T
Q  96 ctacctattttcccaatttcac 117  Q
    |||||  |||||||||| ||||    
T  45283006 ctacc-cttttcccaatctcac 45282986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4386823 - 4386757
Alignment:
Q  159 ttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4386823 ttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 4386757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 216
Target Start/End: Original strand, 2075294 - 2075335
Alignment:
Q  175 ctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttac 216  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2075294 ctcaaaagaactctaatcaaagactctcaaccctaaagttac 2075335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 16264588 - 16264655
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat--caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16264588 tttacaatgtttcccaacccaagagatc-ctcattacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 16264655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 106
Target Start/End: Original strand, 25517070 - 25517128
Alignment:
Q  47 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25517070 ggttataagaaattagcttaaa--agctcacaaagaacaaaccctaatttctacttatttt 25517128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 31340242 - 31340271
Alignment:
Q  17 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340242 tcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 31340271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Original strand, 50432733 - 50432802
Alignment:
Q  31 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||| | |||| || ||||||||||||||    
T  50432733 caaagagatacaaaagatttgcaagaaattaacttcaacacgctctccaagagcagacctaatttctacc 50432802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1417303 - 1417271
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1417303 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 1417271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1736116 - 1736084
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1736116 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 1736084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8370301 - 8370269
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8370301 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 8370269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 21711496 - 21711528
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21711496 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 21711528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24694978 - 24694946
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24694978 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 24694946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Original strand, 26386560 - 26386600
Alignment:
Q  79 aagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  26386560 aagaacaaacctaatttctaccgaatttcccaatctcacaa 26386600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 27026980 - 27027012
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27026980 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 27027012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27974764 - 27974732
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27974764 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 27974732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39032367 - 39032335
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39032367 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 39032335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40592594 - 40592562
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40592594 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 40592562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 40844929 - 40844961
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40844929 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 40844961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 48438489 - 48438521
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48438489 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 48438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4731777 - 4731553
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4731777 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctacc 4731678  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4731677 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 4731578  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4731577 ctcaaccctaaagttacctcctttg 4731553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15212905 - 15212681
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15212905 tctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 15212806  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15212805 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 15212706  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  15212705 ctcaaccctaaagttacctcatttg 15212681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30143459 - 30143237
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30143459 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 30143360  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |  | |||||||||||||  |||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  30143359 cattttcccaatctggccaatgaacaagaca--caatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 30143262  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30143261 ctcaaccctaaagttacctcctttg 30143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27811397 - 27811173
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27811397 tctcttcaatccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 27811298  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  27811297 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacctaagagaactctaatcaaagacc 27811198  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27811197 ctcaaccctaaatttacctcctttg 27811173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33352269 - 33352045
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33352269 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacc 33352170  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  33352169 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 33352070  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  33352069 ctcaaccctaaagttaccttctttg 33352045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43036542 - 43036318
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43036542 tctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 43036443  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  43036442 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 43036343  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43036342 ctcaaccctaaagttacctcctttg 43036318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 1345421 - 1345644
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||      
T  1345421 ctcttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacac 1345520  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1345521 attttcccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaactcaagagaactctaatcaaaaaccc 1345620  T
Q  201 tcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  1345621 tcaaccctaaagttacatcctttg 1345644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42498313 - 42498089
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42498313 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 42498214  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42498213 tttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaacgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagac 42498115  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42498114 cctcaaccctaaagttacctcctttg 42498089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3303719 - 3303943
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3303719 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacc 3303818  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  3303819 cattttcccaatctcaccaataaacaagatactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaccctaatcaaagacc 3303918  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  3303919 ctcaaccgtaaagttacctcctttg 3303943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5689390 - 5689166
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  5689390 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacc 5689291  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5689290 catttttccaatctcattaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaaactcaagagaaccctaatcaaagacc 5689191  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  5689190 ctcaaccctaaagttatctcctttg 5689166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6599091 - 6598867
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6599091 tctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacc 6598992  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  6598991 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 6598892  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  6598891 ctcaaccctaaagttatctcctttg 6598867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6674544 - 6674320
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6674544 tctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacc 6674445  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  6674444 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacacttaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 6674345  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  6674344 ctcaaccctaaagttatctcctttg 6674320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18141939 - 18141717
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18141939 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aacctaatttctacc 18141841  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  18141840 cattttcacaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcccaacctaagagaaccctaatcaaagac 18141741  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  18141740 cctcaaccctaaaattacctcctt 18141717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 1292514 - 1292736
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1292514 tctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctaccca 1292613  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccct 201  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1292614 ttttctcaatctcaccaaagaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgttcacagtgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagaccct 1292713  T
Q  202 caaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  1292714 caaccctaaagttacctcatttg 1292736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765642
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9765863 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 9765764  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca--cctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||     
T  9765763 attttcccaatctcaccaatgaacaagacactca---atttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcactcaaagaca 9765667  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  9765666 ctcaaccctcaagttacctcctttg 9765642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12702683 - 12702911
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12702683 tctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12702782  T
Q  101 -----tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaa 194  Q
         | |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12702783 cttttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaa 12702881  T
Q  195 agaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12702882 agaccctcaaccctaaatttacctcctttg 12702911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17982771 - 17982548
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17982771 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 17982672  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  17982671 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 17982573  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  17982572 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 17982548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31218375 - 31218152
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc- 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  31218375 ctctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 31218276  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31218275 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 31218177  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  31218176 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 31218152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 34254380 - 34254601
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254380 tctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 34254479  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34254480 -cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtctccaacc-caagagaactctaatcaaagacc 34254576  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  34254577 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 34254601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 34256556 - 34256777
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256556 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 34256655  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  34256656 -atttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacacc-aaggtgtttacaatgtttccaacc-caagataactctaatcaaagacc 34256752  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  34256753 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 34256777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4162613 - 4162400
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |    
T  4162613 tctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctaccca 4162515  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccct 201  Q
    ||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  4162514 ttttcc---tctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcgctcaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaaccctaatcaaagaccct 4162418  T
Q  202 caaccctaaagttacctc 219  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4162417 caaccctaaagttacctc 4162400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 19491755 - 19491976
Alignment:
Q  8 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19491755 aatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttc 19491854  T
Q  108 ccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca--cctcaagagaa---cactaatcaaagaccctc 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  |||||||||||   |||||  || |  | |||    
T  19491855 ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcacta--cacatgcactc 19491952  T
Q  203 aaccctaaagttacctcctttgct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19491953 aaccctaaagttacctcctttgct 19491976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44303973 - 44303759
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc- 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||     
T  44303973 ctctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctaccc 44303874  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44303873 tttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 44303775  T
Q  199 cctcaaccctaaagtt 214  Q
    ||| ||||||||||||    
T  44303774 cctaaaccctaaagtt 44303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4283643 - 4283470
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4283643 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacc 4283544  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaa-tgtttccca 173  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||    
T  4283543 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcctaaggtgtttacaattgtttccca 4283470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40321199 - 40320962
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40321199 tctctccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 40321100  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  40321099 cattttcccaatctcacctatgaacaagacactcaatgattttcagtcactcaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaacccctcaagagaacc 40321000  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40320999 ctaatcaaagaccctcaacccgaaagttacctcctttg 40320962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 41366663 - 41366879
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41366663 tctctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctacc 41366762  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| |    
T  41366763 cattttctcaatctcagtcttgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagagaactctaatcaaagatc 41366862  T
Q  200 ctcaaccctaaagttac 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  41366863 ctcaaccctaaagttac 41366879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30291726 - 30291487
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30291726 tctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 30291627  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttccca-------------cctcaagagaa 184  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||             |||||||||||    
T  30291626 ccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcaatcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaaaaaaacccctcaagagaa 30291527  T
Q  185 cactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30291526 ccctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctcctttg 30291487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365120
Alignment:
Q  31 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagac 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    ||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctcagtcttgaacaagac 41365025  T
Q  131 attcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41365026 actcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaaaagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 41365120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 19945409 - 19945633
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg-ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |    
T  19945409 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacc 19945508  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  19945509 cttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccgacccaagagaactctaatcaaagac 19945607  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     || |||||||||||| | |||||||    
T  19945608 tctaaaccctaaagttgcttcctttg 19945633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 1746269 - 1746491
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  1746269 ctctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacct 1746367  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | ||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||    
T  1746368 ttttttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaaccaaagagaactctaatcaaggacc 1746466  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  1746467 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 1746491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 42435042 - 42435170
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42435042 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 42435141  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  42435142 tttttccaatctcaccaatgaacaagaca 42435170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40328899 - 40328764
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328899 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 40328800  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattca 135  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40328799 ccattttcccaatctcacaaatgaacaagacattca 40328764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44353906 - 44353771
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44353906 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 44353807  T
Q  107 cccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44353806 cccaatctcacaaatgaacaagatactcaatgattt 44353771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929696
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag-----------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||||  || |||| || |||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  10929818 cattttccatatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactaatccaaggtgtttacaatg-ttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 10929720  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  10929719 c-caaccctaaagttacctcctttg 10929696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18655519 - 18655393
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18655519 tctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacc 18655420  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaa 127  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||    
T  18655419 cattttctcaatctcaccaatgaacaa 18655393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40221864 - 40221734
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40221864 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 40221765  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  40221764 cattttaccaatctcaccaaagaacaagaca 40221734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3772311 - 3772161
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3772311 tctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaattagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatc 3772212  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacc 150  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  3772211 aattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatcattttcactcacc 3772161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 10930248 - 10930378
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  10930248 tctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatc 10930347  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10930348 cattttcccaatctcaccgatgaacaagaca 10930378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Original strand, 18106139 - 18106351
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| | ||||| ||||    
T  18106139 cactatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagtttctatccatttttccaa 18106237  T
Q  112 tttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaa 210  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||| | |||||    
T  18106238 tctcaccgatgaacaagacactcaacaattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaatctaattaaagaccctctatcctaa 18106337  T
Q  211 agttacctcctttg 224  Q
    ||||  ||||||||    
T  18106338 agttctctcctttg 18106351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 4743263 - 4743462
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  4743263 tctctccaatccactatcaatgagttcttaca----------aatgggttacaagattttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacc 4743351  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||    
T  4743352 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagattcctaatcaaagacc 4743451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 8965740 - 8965914
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8965740 tctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctac 8965839  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttccca 173  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  8965840 ct-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttccca 8965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11384102 - 11383975
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11384102 tctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctaccca 11384003  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  11384002 tttttccaatctca-taatgaacaagaca 11383975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8153877 - 8153656
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac-aagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |      || ||||||||||||    
T  8153877 tctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagatatacaaaagagttacacgaatttagcttcaacaaagctcaga------aaccctaatttctac 8153784  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaaca--agacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaa 195  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| | ||||  | ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  8153783 c-attttctcaatctcaccaatgaacatgacacactcaatgattttcactcatccaaggtgtatacaaatgtttcccaacccaaaagaacattaatcaaa 8153685  T
Q  196 gaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  8153684 gactctcaaccttaaaattacctcctttg 8153656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10015199 - 10015119
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10015199 tctctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1822412 - 1822313
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1822412 tctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttcta 1822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1856857 - 1856758
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1856857 tctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttcta 1856758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29796369 - 29796596
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt--acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccta-atttct 97  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||| || ||||||   |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||    
T  29796369 tctctccaatccattataaatgagtttttttacaaataggtacaaaaatgttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttct 29796468  T
Q  98 acctattttcccaat---ttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaacactaatca 193  Q
    || | ||||||||||   ||| |||  |||||||| | ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||   ||    
T  29796469 ac-tcttttcccaatctcttctcaa--gaacaagagactcaatgaattcactcgcccaagatatttacaaatgtttcccaacccaagagaaccctcgcca 29796565  T
Q  194 aagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29796566 aagatcctcaaccctaaagttacctcctttg 29796596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 11712049 - 11712145
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaattt 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  11712049 tctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagctctcaaggaacaaaacctaattt 11712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7597734 - 7597647
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7597734 tctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa 7597647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240185
Alignment:
Q  11 ccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacc 10240185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4733770 - 4733704
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4733770 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcttttg 4733704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2627854 - 2627738
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttaca-aagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  2627854 ctctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctac 2627755  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  2627754 c-cttttcccaatctcac 2627738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Original strand, 3231859 - 3232031
Alignment:
Q  16 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaatt 113  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||     
T  3231859 atcaataagttctttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttctacat-ttttctcaatc 3231957  T
Q  114 tc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
    ||  |  | |||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3231958 tcttcctaagaacaagagactcaatgaattcacccacccaaggtgtttactaatgtttcccaactcaagagaac 3232031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25690072 - 25689958
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25690072 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 25689975  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    || |||||||||| ||||    
T  25689974 ct-ttttcccaatctcac 25689958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10015109 - 10015043
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10015109 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccataaagttacgtcctttg 10015043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30909486 - 30909389
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  30909486 tctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagtttaaacaagctctccaagagtaaacctaatttctac 30909389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41267078 - 41266862
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttccc 109  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  41267078 cactatcaagaagttctttagaaagaaatacaaaagagttacaagaaattagtctcaacaagttctctaagaacaaaacctaatttctacc-attttctc 41266980  T
Q  110 aatttca-caaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagaccctcaacc 206  Q
    ||  ||  |  | |||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||| | |||||||| | || | |||||||  ||||||    
T  41266979 aaactcttcctaagaacaagagactcaatgatttcactcacccaaagtatttacaactgtctcccaacccaagagaacctctcaccaaagacattcaacc 41266880  T
Q  207 ctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  41266879 ctaaagttacctcatttg 41266862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 3073922 - 3073981
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 60  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3073922 tctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3439621 - 3439507
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  3439621 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gccaagttcataatgaacaaaccctaatttctac 3439524  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  3439523 c-cttttcccaatctcac 3439507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 4733825 - 4733784
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataca 42  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4733825 tctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 32902222 - 32902327
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||   || | | |||||||| ||||||||||    
T  32902222 tctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagcttcaacagagtctccatgaacaaacataatttctac 32902321  T
Q  100 ctattt 105  Q
    | ||||    
T  32902322 ccattt 32902327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11137146 - 11137045
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt----acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||   ||| ||| || |||||||||    
T  11137146 tctccaattcactatcaatgagtttttttttacaaagagatacaaaacggttataagaaattagcttcaacaagttcttcaaggacatacttaatttcta 11137047  T
Q  99 cc 100  Q
    ||    
T  11137046 cc 11137045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 224
Target Start/End: Original strand, 19948533 - 19948594
Alignment:
Q  163 aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  19948533 aatgtttcccaactcaaaagaactctaatcaaagactctaaaccctaaagttgcttcctttg 19948594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31513314 - 31513281
Alignment:
Q  74 tcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31513314 tcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 31513281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 40585822 - 40585754
Alignment:
Q  13 actatcaatgagttctt--acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaa 79  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  40585822 actatcaatgagttcttttacaaaaagatacaaaaggcttacaaaaaattcgtttcaacaagctcacaa 40585754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Original strand, 33655402 - 33655500
Alignment:
Q  49 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactca 148  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| ||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33655402 ttacgagaaatcagcttcaacaaactctctaagaacaaatctaatttctatcta-tttcttaatatcttccatgaacaagacactcaatgatttcactca 33655500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 3051359 - 3051425
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctccttt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  3051359 tttacaatgtttcccaactcaagagaaccccactacaaagacactcaaccctaaagttctctccttt 3051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 95
Target Start/End: Original strand, 6813764 - 6813818
Alignment:
Q  40 acaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaattt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6813764 acaaaggggttacaagaaattagctt--gcaagctcacaaagaacaaaacctaattt 6813818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19752217 - 19752184
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19752217 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 19752184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 3318791 - 3318823
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3318791 caaagaccctcaaccctaaagttacctcatttg 3318823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5702303 - 5702271
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5702303 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 5702271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 7412614 - 7412646
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7412614 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 7412646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9054861 - 9054788
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  9054861 aaagtgatacaaagtggttacaagaaattagctt--aaaagcgcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttt 9054788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19175577 - 19175545
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19175577 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 19175545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23799399 - 23799367
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23799399 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 23799367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 42093188 - 42093131
Alignment:
Q  48 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaca-aacctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  42093188 gttacaagaaattagctt--acaaactcacaaagaacatatcataatttctacctatttt 42093131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48491698 - 48491474
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48491698 tctctccaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 48491599  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  48491598 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 48491499  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48491498 ctcaaccctaaagttacctcctttg 48491474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31105442 - 31105666
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31105442 tctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacc 31105541  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  31105542 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttctcaccccaagataactataatcaaagacc 31105641  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31105642 ctcaaccctaaagttacctcctttg 31105666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1113776 - 1113552
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1113776 tctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatc 1113677  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  1113676 cattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 1113577  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  1113576 ctcaaccctaaagttacttcctttg 1113552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4586280 - 4586056
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4586280 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 4586181  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  4586180 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttacactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagagc 4586081  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  4586080 ctcaaccctaaagttacatcctttg 4586056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 38671271 - 38671495
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38671271 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 38671370  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  38671371 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 38671470  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38671471 ctcaaccctaaagttacctcctttg 38671495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14069882 - 14070106
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14069882 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 14069981  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14069982 ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaatcaaagacc 14070081  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  14070082 ctcagccctaaagttacctcctttg 14070106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14379910 - 14380134
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14379910 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 14380009  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14380010 ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttacccaacccaagagaactctaatcaaagacc 14380109  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  14380110 ctcagccctaaagttacctcctttg 14380134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26417435 - 26417211
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26417435 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 26417336  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  26417335 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacccgctcaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagacc 26417236  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26417235 ctcaaccctaaagttacctcctttg 26417211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31733018 - 31733242
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31733018 tctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 31733117  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31733118 cattttctcagtctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 31733217  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31733218 ctcaactctaaagttacctcttttg 31733242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47673992 - 47674216
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47673992 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 47674091  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  47674092 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacc 47674191  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     |||||| | |||||||||||||||    
T  47674192 ttcaaccttgaagttacctcctttg 47674216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 30024781 - 30025005
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30024781 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 30024880  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  || |  |||||||| |||||||||||||    
T  30024881 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaacgtttttcaacctaagagaactctaatcaaagacc 30024980  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  30024981 ctcaaccctaaagttacctcctttg 30025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43864363 - 43864139
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43864363 tctctccaatccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 43864264  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     | ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  43864263 cacttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 43864164  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43864163 ctcaaccctaaagttacctcctttg 43864139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47676185 - 47676409
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47676185 tctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacc 47676284  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  47676285 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 47676384  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  47676385 ctcaaccctaaagttatctcctttg 47676409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48489550 - 48489326
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  48489550 tctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctacc 48489451  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  48489450 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacatttaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 48489351  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  48489350 atcaaccctaaagttacctcctttg 48489326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18126760 - 18126539
Alignment:
Q  4 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  18126760 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacat 18126661  T
Q  104 tttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctc 202  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  18126660 ttttccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcactcacccaagttgtttacaatgtttcccaacccatgagaactctaatcaaagaccctc 18126561  T
Q  203 aaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18126560 aaccctaaagttacctcctttg 18126539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23555159 - 23554935
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23555159 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 23555060  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23555059 attttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaactctaatcaaagac 23554961  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  23554960 cttcaaccctgaagttacctcctttg 23554935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 496032 - 496256
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  496032 tctctccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacc 496131  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  496132 cattttcccaatctcacaaattaacaaaacactaaatgattttcactcacccaaggtttttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagacc 496231  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  496232 ctcaaccttaaagttacctcatttg 496256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 41649060 - 41649282
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41649060 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 41649158  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |    
T  41649159 aatttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaataaaaga-c 41649257  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  41649258 cttaaccctaaagttaactcctttg 41649282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35854032 - 35853820
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  35854032 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 35853933  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||    
T  35853932 tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactcaaatcaaagaccc 35853834  T
Q  201 tcaaccctaaagtt 214  Q
    | ||||||||||||    
T  35853833 taaaccctaaagtt 35853820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518690
Alignment:
Q  10 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  110 aatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccct 208  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31518805 aatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgttttccaacccaaaagaaccataatcaaagacccttaaccct 31518706  T
Q  209 aaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31518705 aaagttatctcctttg 31518690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19502297 - 19502073
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct-ac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||    
T  19502297 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttctaac 19502198  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatt-tcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    || ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  19502197 cttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 19502099  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502098 cctcaaccctaaagttacctcatttg 19502073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 41317483 - 41317720
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41317483 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 41317582  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  41317583 aattttcccaatctcaccaatgaacaagagactcaatgattttcactcatccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagagaacc 41317682  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317683 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 41317720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27347936 - 27347745
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27347936 tctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacc 27347837  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat 191  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  27347836 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacctaagagaactctaat 27347745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4178886 - 4178670
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4178886 caatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctttttt 4178788  T
Q  107 cccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaac 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4178787 cccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaac 4178689  T
Q  206 cctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  4178688 cctaaagttgcttcctttg 4178670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29991172 - 29990950
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29991172 tctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttctatc 29991073  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  29991072 -cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 29990975  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||  ||||||||    
T  29990974 ctaaaccctaaagttgtctcctttg 29990950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 4253577 - 4253803
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4253577 tctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 4253676  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaag 196  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||| || | ||||     
T  4253677 cc-attttaccaatttcaccaatgaacaagaaactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaaccctcaccaaat 4253775  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4253776 accctcaaccctaaagttacctcctttg 4253803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 36146457 - 36146643
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctac 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36146457 tctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctac 36146555  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  36146556 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaac 36146643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22270092 - 22269962
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22270092 tctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 22269993  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22269992 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 22269962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8153461 - 8153276
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  8153461 tctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctact 8153362  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  8153361 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac 8153276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526170
Alignment:
Q  41 caaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaatgaacaagacactcaatga 24526084  T
Q  140 ttt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24526085 ttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaaccataatcaaagaccctcaaccctaaagttatctcctttg 24526170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6432090 - 6431960
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6432090 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacc 6431991  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| | || |||||||||||||    
T  6431990 cattttcccaatctaaccaatgaacaagaca 6431960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 2361023 - 2361151
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2361023 tctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 2361122  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2361123 ttttcccaatctcaccaatgaacaagaca 2361151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29608854 - 29608726
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29608854 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 29608755  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  29608754 ttttcccaatctcaccaaagaacaagaca 29608726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48599383 - 48599513
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48599383 tctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 48599482  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48599483 cattttcccaatatcaccaatgaacaagaca 48599513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23565110 - 23565333
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-acctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23565110 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctac 23565209  T
Q  100 cta--ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaag 196  Q
    |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||| |  |||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||| | |   ||||||||| ||||||||||    
T  23565210 ctattttttcctaatctcaccaatgaacaagacacttcatg--ttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttctaaaccaagagaac-ctaatcaaag 23565306  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23565307 acccttaa-cctaaagttacctcctttg 23565333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25615972 - 25615758
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25615972 tctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttctacc 25615873  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |          ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25615872 cattttcccaatct----------caagacactcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacc 25615783  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||| |||||||| ||||||||    
T  25615782 cttaaccttaaagttaactcctttg 25615758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36574564 - 36574789
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  36574564 tctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta 36574663  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaag 196  Q
    ||  ||| |||||| || | ||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||| || |||||||    
T  36574664 cc--tttccccaatctctccaataaacaagacactcgataattttcactcacctaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaaccctcatcaaag 36574761  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36574762 accgtcaaccctaaagttacctcctttg 36574789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2390401 - 2390271
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2390401 tctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 2390302  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2390301 catttttcgaatttcaccaatgaacaagaca 2390271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4508755 - 4508885
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4508755 tctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctact 4508854  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  4508855 cattttcccaatctcaccaatcaacaagaca 4508885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34310765 - 34310895
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34310765 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacc 34310864  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34310865 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 34310895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Original strand, 12097941 - 12098145
Alignment:
Q  34 agagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  12097941 agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaatgaacaagacact 12098040  T
Q  134 caatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctc 219  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||              ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12098041 caatgattttcactcacccaagatgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctctcaagaaaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctc 12098140  T
Q  220 ctttg 224  Q
    |||||    
T  12098141 ctttg 12098145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23344092 - 23343869
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacct 101  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  23344092 tctccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacc- 23343994  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaagg-catttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||  ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||     
T  23343993 cttttccaaatctcaccaatgaactagacattcaatgattttcactcacccaaggtgttttgaaatgtttccaaacctaagagaaccctaatcaaagact 23343894  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  23343893 ctcgaccctaaagttacatcctttg 23343869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 8359365 - 8359496
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8359365 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctac 8359464  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8359465 ccattttcccaatctccccaatgaacaagaca 8359496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3259114 - 3258984
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3259114 tctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacc 3259015  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3259014 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 3258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 224
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538813
Alignment:
Q  39 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatg 4538726  T
Q  139 a-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  4538727 attttcactcacccaaggtgtttacaatttttcccaacccaagagaattctaatcaaagactctcaaccttaaaattacctcctttg 4538813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48408922 - 48408707
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatggg-ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||   ||||||||||    
T  48408922 ctctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaatttctac 48408823  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagag-aacactaatcaaaga 197  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  48408822 cctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaaga 48408724  T
Q  198 ccctcaaccctaaagtt 214  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  48408723 ccctaaaccctagagtt 48408707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31519021 - 31518908
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31519021 tctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaag-aactagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacc 31518923  T
Q  101 tattttcccaatttc 115  Q
    |||||||||||||||    
T  31518922 tattttcccaatttc 31518908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 25767010 - 25767217
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggg-ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25767010 ctctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 25767109  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagag-aacactaatcaaagac 198  Q
      |||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    ||||| ||| ||||||||||||    
T  25767110 cttttttccaatctc---aatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttccca----aagagaaactctaatcaaagac 25767201  T
Q  199 cctcaaccctaaagtt 214  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  25767202 cctaaaccctagagtt 25767217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 4510603 - 4510724
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  4510603 caatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccatttt 4510702  T
Q  107 cccaatttcacaaatgaacaag 128  Q
    || ||| |||| ||| ||||||    
T  4510703 ccaaatctcaccaatcaacaag 4510724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 4512445 - 4512566
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  4512445 caatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccatttt 4512544  T
Q  107 cccaatttcacaaatgaacaag 128  Q
    || ||| |||| ||| ||||||    
T  4512545 ccaaatctcaccaatcaacaag 4512566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 32358103 - 32358188
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32358103 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagcacaa 32358188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 2759248 - 2759339
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2759248 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39731487 - 39731279
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39731487 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 39731388  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagac 198  Q
      |||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  39731387 -ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagac 39731297  T
Q  199 cctcaaccctaaagttac 216  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  39731296 cctaaaccctagagttac 39731279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6360001 - 6360077
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360001 tctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 2761439 - 2761575
Alignment:
Q  89 ctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacac 187  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  2761439 ctaatttctaccaattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcgatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactc 2761538  T
Q  188 taatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  2761539 taatcaaatatcatcaaccctaaagttacctcctttg 2761575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 24514912 - 24515033
Alignment:
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccct 201  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24514912 ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccct 24515010  T
Q  202 caaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  24515011 aaaccctaaagttgcttcctttg 24515033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 22328439 - 22328568
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttct- 97  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22328439 tctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 22328538  T
Q  98 acctattttcccaatttcacaaatgaacaa 127  Q
    |||| | |||||||| || | |||||||||    
T  22328539 acctttcttcccaatctctctaatgaacaa 22328568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5116724 - 5116625
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  5116724 tctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaacaaacctaatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 43504204 - 43504320
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  43504204 ctctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctac 43504303  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  43504304 c-cttttcccaatctcac 43504320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Original strand, 1360226 - 1360356
Alignment:
Q  27 cttacaaagagatacaaat--gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttca-caaatga 123  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||    
T  1360226 cttacaaagagatacaaaaaagggttacaagaaattcgcttcaacaagttctccaagacaaaacctaatttctacct-ttttcccaatctcattccatga 1360324  T
Q  124 acaagacattcaatgatttcactcacctaagg 155  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  1360325 acaagagactcaatgatttcactcaccaaagg 1360356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 3904676 - 3904851
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacctattttccc 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3904676 cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaaattacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttctacc-attttccc 3904774  T
Q  110 aatttc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaa 184  Q
    ||| ||  |  | |||||||| | ||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  3904775 aatctcttcctaagaacaagagactcaatgatttcactcgcccaaggtgtttacaaatgtttcttaactcaagagaa 3904851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6570555 - 6570489
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6570555 tttacaatgtttcccaccccaagagaaccctagtcaaagacactcaatcctaaagttacctcctttg 6570489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 24525551 - 24525596
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525551 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Original strand, 43363531 - 43363622
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaa--gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||  |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43363531 cactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 184
Target Start/End: Original strand, 5514113 - 5514243
Alignment:
Q  56 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  |||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||    
T  5514113 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacataatttcta-ctcttttttcaatctctcaaatgaacaagaaactcaatgattttcactcatcgaa 5514211  T
Q  154 ggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaa 184  Q
    ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  5514212 ggtgtttacaagtgtttcccaacccaagagaa 5514243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20344015 - 20343900
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  20344015 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 20343918  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  20343917 cc-cttttcccaatctcac 20343900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28617249 - 28617176
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28617249 aaagtgatacaatggggttacaagaaattagcttaaa--agctcacaaagaacaaaacctaatttctacctatttt 28617176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26639402 - 26639254
Alignment:
Q  38 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaat---ttcacaaatgaacaagacattc 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||| ||||  || |||| | ||    
T  26639402 atacaaaagggttacaagaaattaacatcaacaaactctccaagaacatacctaatttctacc-attttcacaatctcttcccaaa--aagaagagactc 26639306  T
Q  135 aatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  26639305 aatgattttactcacctaaagtgtttacaaatgtttcccaacgcaagagaac 26639254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27073925 - 27073828
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcc 108  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27073925 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaattttcc 27073828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 27204388 - 27204485
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcc 108  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  27204388 cactgtcaacgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaataaactcataacgaacaaaacatatttctaccaattttcc 27204485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24789959 - 24789872
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  24789959 ctctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatg-ttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaacc 24789872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8153274 - 8153224
Alignment:
Q  174 cctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8153274 cctcaagaggaccctaatcaaagacccccaaccttaaagttacctcctttg 8153224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9185032 - 9184964
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9185032 tttacaatgtttcccaacccaagagaaccttactacaaagatactcaaccctaaagttacctcctttgc 9184964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18396437 - 18396338
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttcta 98  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||   ||||||| ||| ||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  18396437 tctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa-atgttacaaaaaaataggttcaacaaactctccaagaacaaaacctaatttcta 18396339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23402871 - 23402804
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23402871 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 23402804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Original strand, 36146659 - 36146695
Alignment:
Q  188 taatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146659 taatcaaagaccctcaacactaaagttacctcctttg 36146695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46516163 - 46516096
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46516163 tttacaatgtttcccaactcaagagatcctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 46516096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Original strand, 2580629 - 2580696
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2580629 tttacaatgttttccaacccaagagaacctcacacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 2580696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 20284328 - 20284394
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctccttt 223  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20284328 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctccttt 20284394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Original strand, 3047335 - 3047401
Alignment:
Q  39 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-acctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3047335 tacaaatgagttacaagaaatcaactt--aaaagctcacaaagaacaagacctaatttctacccatttt 3047401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 13065482 - 13065555
Alignment:
Q  36 agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 109  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||||    
T  13065482 agatacaaaacggttacaataaattagtttcaacaaactctcaaagtgcaatcctaatttctaccatttttccc 13065555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 3047528 - 3047560
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3047528 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 3047560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Original strand, 30843471 - 30843519
Alignment:
Q  176 tcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  30843471 tcaagagaacccttatcaaagactctaaatcctaaagttacctcctttg 30843519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40808517 - 40808485
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40808517 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 40808485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9183080 - 9183304
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9183080 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacc 9183179  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  9183180 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaggagaactctaatcaaagacc 9183279  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9183280 ctcaaccctaaagttacctcctttg 9183304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28137457 - 28137681
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28137457 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 28137556  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28137557 cattttcccattctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 28137656  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  28137657 ctcaaccctaaagttaactcctttg 28137681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5406249 - 5406471
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406249 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 5406348  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  5406349 -attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagacc 5406446  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  5406447 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 5406471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5410574 - 5410796
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410574 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 5410673  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  5410674 -attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagacc 5410771  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  5410772 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 5410796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26954335 - 26954558
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26954335 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttatacc 26954434  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||     
T  26954435 -aatttcccaatctcacatatgaacaagacactcaatgattttcactccccaaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagataactctaatcaaagact 26954533  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26954534 ctcaaccctaaagttacctcctttg 26954558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5413443 - 5413665
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  5413443 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctacc 5413542  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  5413543 t-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aatgtgtttacaatgtttcccaacccgagagaactctaatcaaagacc 5413640  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||    
T  5413641 ctaaaccctaaagttgcctcctttg 5413665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3038952 - 3039189
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3038952 tctctccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 3039051  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||              ||||||| |||     
T  3039052 aattttcccaatctcaccaatgaacaagacattcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacctctcaagaaaacc 3039151  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3039152 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 3039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31404724 - 31404947
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31404724 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 31404823  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatc-aaagac 198  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  31404824 -attttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaaagac 31404921  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31404922 cctaaaccctaaagttgcctcctttg 31404947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33211234 - 33211458
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33211234 tctctccaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctacc 33211333  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  33211334 aattttcccaatctcaccaatgaacaaaacactcaatgattttcagtgacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 33211433  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||  |||||||||||||||||    
T  33211434 ctcaactgtaaagttacctcctttg 33211458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33160401 - 33160626
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  33160401 tctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctacc 33160500  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga--tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
     | |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  33160501 tttttttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgatttttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 33160599  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  33160600 ctctcaaccctaaagttacctcctttg 33160626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 2171582 - 2171794
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  2171582 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 2171680  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagag-aacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||    
T  2171681 tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaagacc 2171779  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||||||| ||||    
T  2171780 ctaaaccctagagtt 2171794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 30834586 - 30834809
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30834586 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 30834685  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  30834686 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-gaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaatcaaagacc 30834784  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     | |||||||||||| | |||||||    
T  30834785 ataaaccctaaagttgcttcctttg 30834809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2972988 - 2973118
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972988 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 2973087  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  2973088 cattttcccaatctcaccaatgaacacgaca 2973118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17758142 - 17758012
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17758142 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 17758043  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17758042 cattttcccaatctcacaaatgaagaagaca 17758012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21589050 - 21588920
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21589050 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 21588951  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21588950 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 21588920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21593783 - 21593653
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21593783 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 21593684  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21593683 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 21593653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 16452379 - 16452592
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16452379 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 16452478  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  16452479 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaactctaatcaaagacc 16452577  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||| ||||||||    
T  16452578 ctaaactctaaagtt 16452592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3808757 - 3808888
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3808757 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 3808856  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3808857 ctattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 3808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5043746 - 5043616
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5043746 tctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctact 5043647  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  5043646 cattttctcaatctcacgaatgaacaagaca 5043616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17763106 - 17762979
Alignment:
Q  4 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17763106 ctccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 17763007  T
Q  104 tttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  17763006 tttctcaatctcaccaatgaacaagaca 17762979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 26830172 - 26830303
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26830172 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacc 26830271  T
Q  101 tattttcccaatttca-caaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  26830272 catttttccaatctcacccaatgaacaagaca 26830303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 22424875 - 22425006
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa--tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22424875 tctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 22424973  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    || ||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  22424974 cccatttttccaatctcaccaacgaacaagaca 22425006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4045543 - 4045356
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4045543 tctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta 4045444  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
    || ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4045443 cc-attttcccaatctctccaataaacaagacactcaatgattttcactcaccctaggtgtttacaaatgtttcccaactcaagagaac 4045356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 603139 - 603236
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  603139 tctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttctacc 603236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16569141 - 16568938
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16569141 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaag------------gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctac 16569054  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||| |||| |          ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  16569053 ccattttctcaatct----------caagacactcaatgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagac 16568964  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| ||||||||| |||  |||||||    
T  16568963 ccttaaccctaaatttaattcctttg 16568938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16567265 - 16567101
Alignment:
Q  52 caagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcac 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||          ||||| |||||||||| |||||||    
T  16567265 caagaaattagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctca----------agacactcaatgattttcactcac 16567176  T
Q  150 ctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16567175 ccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagacccttaaccctaaagttaactcctttg 16567101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25073686 - 25073538
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  25073686 tctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatctaatttctacc- 25073588  T
Q  102 attttcccaat-ttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacc 150  Q
    |||||  |||| | | |  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25073587 attttttcaatctcctcccatgaacaagatactcaatgatttcactcacc 25073538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 3072809 - 3072925
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  3072809 ctctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctac 3072908  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  3072909 c-attttcccaatctcac 3072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 26800706 - 26800630
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac 77  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800706 tctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaaattagcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 412220 - 412104
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  | ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  412220 ctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttctac 412121  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    || |||||||||| ||||    
T  412120 ct-ttttcccaatctcac 412104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 5409118 - 5409167
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtt 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5409118 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5409167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27647978 - 27647864
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27647978 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 27647881  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  27647880 c-cttttcccaatctcac 27647864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16554987 - 16554872
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16554987 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 16554890  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  16554889 cc-cttttcccaatctcac 16554872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16631543 - 16631428
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16631543 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta 16631446  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  16631445 cc-cttttcccaatctcac 16631428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 6097501 - 6097605
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  6097501 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga---------gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacc- 6097589  T
Q  102 attttcccaatttcac 117  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  6097590 atttttccaatctcac 6097605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 16578568 - 16578683
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  16578568 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttcta 16578665  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  16578666 cc-cttttcccaatctcac 16578683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16616812 - 16616697
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  16616812 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgagcaaaccctaatttcta 16616715  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  16616714 cc-cttttcccaatctcac 16616697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16653230 - 16653115
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16653230 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaattttta 16653133  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  16653132 cc-cttttcccaatctcac 16653115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 186820 - 186734
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | || || || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  186820 tatcaatgaattctttacaaagagatacaaaagagctataaaaatttaacttcaacaagctctccaagaacaaaccttatttctacc 186734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24435829 - 24435763
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24435829 tttacaatgtttcccaactcaagagaacctcacacaaagacactcaaccctaaagttatctcctttg 24435763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5757336 - 5757269
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5757336 tttacaatgtttcccaacccaagagatcctaaatacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 5757269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2908572 - 2908503
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 75  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||  || |||||| |||||||||||||    
T  2908572 caatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaaagagttgtaaaaaattatcttcaacaagctc 2908503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22616059 - 22615994
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct 97  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | || ||||| | ||||||||    
T  22616059 aaagagatacaaagggattacaagaaatcagtttcaacaagctctctaaaaacaatcttaatttct 22615994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 31936849 - 31936882
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31936849 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 31936882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 31979786 - 31979819
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31979786 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 31979819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Original strand, 5740074 - 5740154
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcc 108  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||| | || | |||||||| |||||| | |||||||    
T  5740074 ttacaaagaaatacaaaaggtttacaataaattggtttcaacaagctctctaaaagcaaacctagtttctatccattttcc 5740154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10077014 - 10076982
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10077014 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 10076982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13488322 - 13488098
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13488322 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 13488223  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13488222 cattttcccaatcttaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacc 13488123  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13488122 ctcaaccctaaagttacctcctttg 13488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39468598 - 39468822
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39468598 tctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 39468697  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  39468698 cattttcccaatctcactaatgaacaagacactcaatgattttcactcactcaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatgaaagacc 39468797  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39468798 ctcaaccctaaagttacctcctttg 39468822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 533884 - 533664
Alignment:
Q  5 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  533884 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccatt 533785  T
Q  105 ttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctca 203  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  533784 ttcccaatctcaccaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccccca 533685  T
Q  204 accctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  533684 accctaaagttacctcctttg 533664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 538144 - 537920
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  538144 tctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacc 538045  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  538044 cattttcccaatctcactaatgaacaagacacgcaatgattttcactcacccaaggtgtttacgatgtttcccaagccaagagaactctaatcaaagacc 537945  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  537944 ctcaaccctaaagttacctcctttg 537920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33831799 - 33831575
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33831799 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 33831700  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  33831699 catttttccaatctcacaaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacc 33831600  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||    
T  33831599 cttaaccctaaaattaactcctttg 33831575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 42428479 - 42428703
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  42428479 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacc 42428578  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  42428579 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 42428678  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  42428679 ttcaaccctaaagttatctcctttg 42428703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3075707 - 3075931
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3075707 tctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 3075806  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  3075807 tattttctcaatctcacaaatgaacgagacactcaatgattttcactcatcaaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 3075906  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3075907 ctcaaccctaaagttacctcctttg 3075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28750704 - 28750928
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28750704 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacc 28750803  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28750804 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 28750903  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28750904 ctcaaccctaaagttacctcctttg 28750928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31183090 - 31182868
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31183090 tctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgg-ttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttctacc 31182992  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31182991 cattttcc-aatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 31182893  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31182892 ctcaaccctaaagttacctcctttg 31182868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 42426284 - 42426508
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42426284 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacc 42426383  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  42426384 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatctaagagaactctaatcaaagacc 42426483  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42426484 ctcaaccctaaagttacctcctttg 42426508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8565995 - 8566220
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8565995 tctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacc 8566094  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  8566095 cattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaagacc 8566194  T
Q  200 ctca-accctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  8566195 ctcatgccctaaagttacctcatttg 8566220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13239870 - 13239647
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13239870 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctacc 13239771  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13239770 attttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 13239672  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  13239671 ctcaaccataaagttacctcctttg 13239647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16452199 - 16451976
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16452199 tctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacc 16452100  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatt-tcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| |    
T  16452099 catttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcacttacc-aaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaagatc 16452001  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16452000 ctcaaccctaaagttacctcctttg 16451976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32636943 - 32636719
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  32636943 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacc 32636844  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||    
T  32636843 cattttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcactacccaagagaactctaatcaaagacc 32636744  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  32636743 cttaaccctaaagttacctcctttg 32636719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 5887487 - 5887689
Alignment:
Q  23 agttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatg 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  5887487 agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatccattttctcaatctcacaaatg 5887586  T
Q  123 aacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5887587 aacaagacattcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaataccctcaaccctaaagttacctcct 5887686  T
Q  222 ttg 224  Q
    |||    
T  5887687 ttg 5887689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25412879 - 25412657
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412879 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 25412780  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25412779 -cttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 25412682  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||| ||| |||||||||    
T  25412681 ctaaaccctaatgttgcctcctttg 25412657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 30682971 - 30683190
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagt--tcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  30682971 tctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac---cctaatttcta 30683067  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  30683068 ccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcgcaacccaagagaactctaatcaaaga 30683166  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcct 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  30683167 ccctcaaccctaaaattacctcct 30683190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30182706 - 30182484
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  30182706 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 30182607  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30182606 tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccc 30182508  T
Q  201 tcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | | |||||||||| | |||||||    
T  30182507 taatccctaaagttgcttcctttg 30182484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13343178 - 13342956
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13343178 ctctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 13343080  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  13343079 ttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcagagacc 13342981  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  13342980 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 13342956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 36074093 - 36074317
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc- 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||||||||     
T  36074093 ctctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttctaccc 36074191  T
Q  101 --tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
      | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  36074192 ttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaaga 36074290  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||    
T  36074291 ccctaaaccctaaagttgcttcctttg 36074317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 213584 - 213454
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  213584 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 213485  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  213484 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 213454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28278435 - 28278305
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28278435 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacc 28278336  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28278335 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 28278305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40147380 - 40147250
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40147380 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacc 40147281  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40147280 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 40147250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 224
Target Start/End: Original strand, 42309991 - 42310208
Alignment:
Q  8 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||    
T  42309991 aatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatcaaacttgatttctacccaatttc 42310090  T
Q  108 ccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaacc 206  Q
     |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||    |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  42310091 tcaatctcaccaatgagcaagacactcaatgattttcacttacccaaaatgtttacaatgttttccaaccaaagagaaccctaatcaaagaccataaacc 42310190  T
Q  207 ctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42310191 ctaaagttacctcctttg 42310208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19806449 - 19806289
Alignment:
Q  53 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcaccta 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19806449 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttcactcaccca 19806351  T
Q  153 aggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagtt 214  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19806350 aggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccctcaagtt 19806289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 38747124 - 38746996
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38747124 tctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 38747025  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaaga 129  Q
     ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38747024 cattttcccaatctcattaatgaacaaga 38746996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5058164 - 5058036
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5058164 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatacaagaaaatagcttcaacaagctcac--agaacaaccctaatttctacc 5058067  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5058066 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 5058036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27637662 - 27637792
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27637662 tctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctac 27637760  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  27637761 ccattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 27637792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 9049391 - 9049576
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  9049391 tctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-aacaaacactaatttctat 9049489  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
    | ||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9049490 c-attttcccaaactcactaatcaacaagacactcagtgatttttactcacccaaagtgtttacaaatgtttcccaaatcaagagaac 9049576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37439260 - 37439070
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37439260 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 37439161  T
Q  101 tatt--------ttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagaga 183  Q
    | ||        |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||    
T  37439160 ttttatttttccttcccaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacc-aaagtgtttacaatgtttcccaacccaagaga 37439070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16409593 - 16409385
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16409593 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 16409494  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagac 198  Q
      |||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  16409493 -ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagac 16409403  T
Q  199 cctcaaccctaaagttac 216  Q
     || ||||||| ||||||    
T  16409402 tctaaaccctagagttac 16409385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27015636 - 27015528
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27015636 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggt--------attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctatttt 27015545  T
Q  107 cccaatttcacaaatga 123  Q
    |||||| |||| |||||    
T  27015544 cccaatctcaccaatga 27015528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26178000 - 26177793
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26178000 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 26177901  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagac 198  Q
       ||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  26177900 --cttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagac 26177811  T
Q  199 cctcaaccctaaagttac 216  Q
     || ||||||| ||||||    
T  26177810 tctaaaccctagagttac 26177793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 13695739 - 13695881
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13695739 tctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgta 13695838  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    ||  |||||||||| || | || ||| |||| | ||||||||||    
T  13695839 cc-cttttcccaatctctccaaagaaaaagatactcaatgattt 13695881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 316879 - 316781
Alignment:
Q  4 ctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  316879 ctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaatttctacct 316781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3326033 - 3325816
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  3326033 tctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaatttctac 3325934  T
Q  100 ctattttcccaatttc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    || ||||  |||||||  |  | |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  3325933 ct-ttttttcaatttcttcctaagaacaagatacccaatggtttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttctcaactcaagagaacactcaccaaaga 3325835  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttac 216  Q
    | ||| |||||||| ||||    
T  3325834 cactcgaccctaaaattac 3325816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16640989 - 16641138
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16640989 tctctccaatccactatcaa---gttcttacaaagagatacaaaagagttatcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctac 16641085  T
Q  100 c--tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatg-atttcactcac 149  Q
    |  | ||||| |||| || | ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  16641086 catttttttctcaatctcgccaatgaacaagacacttaatgaatttcactcac 16641138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 18441698 - 18441906
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18441698 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctacc 18441797  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagac 198  Q
      |||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  18441798 -ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagac 18441888  T
Q  199 cctcaaccctaaagttac 216  Q
     || ||||||| ||||||    
T  18441889 tctaaaccctagagttac 18441906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 9789274 - 9789482
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| | |||||||||||    
T  9789274 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctacc 9789373  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagac 198  Q
      |||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  9789374 -ctttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaagac 9789464  T
Q  199 cctcaaccctaaagttac 216  Q
     || ||||||| ||||||    
T  9789465 tctaaaccctagagttac 9789482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42926908 - 42926788
Alignment:
Q  105 ttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctca 203  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  42926908 ttcccaatctcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagaccatca 42926809  T
Q  204 accctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  42926808 atcctaaagttacctcatttg 42926788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616190
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctac 35616190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054969
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||     
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaaagg-ttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaacaaacataatttctaccc 10054965  T
Q  102 attt 105  Q
    ||||    
T  10054966 attt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Original strand, 33906083 - 33906184
Alignment:
Q  5 tccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctat 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||| |||| ||    
T  33906083 tccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccat 33906182  T
Q  104 tt 105  Q
    ||    
T  33906183 tt 33906184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926911
Alignment:
Q  19 aatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctca 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaatctca 42926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 10700697 - 10700804
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10700697 tctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagctctctaagaacaaacctaatttctac 10700795  T
Q  100 ctattttcc 108  Q
    || ||||||    
T  10700796 cttttttcc 10700804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30802934 - 30802854
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatt 94  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30802934 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatt 30802854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 29751210 - 29751325
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29751210 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 29751308  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  29751309 c-cttttcccaatctcac 29751325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 22536344 - 22536454
Alignment:
Q  6 ccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctat 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  22536344 ccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacc-ct 22536440  T
Q  104 tttcccaatttcac 117  Q
    ||||||||| ||||    
T  22536441 tttcccaatctcac 22536454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29720482 - 29720367
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  29720482 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctac 29720384  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  29720383 c-cttttcccaatctcac 29720367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29722642 - 29722527
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  29722642 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctac 29722544  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  29722543 c-cttttcccaatctcac 29722527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22097981 - 22097884
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||  || | |||||||| |||||||||||||    
T  22097981 ctctctaatccactatcaatgagttttttacaaatagatacaa--gggttataagaaattaacttcaacaaattctccaagaacaaccctaatttctacc 22097884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26170880 - 26170684
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  26170880 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga---------gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctacc- 26170792  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaagacc 199  Q
      ||| ||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | |||||||| |  |||||||||||     
T  26170791 -cttttccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaagact 26170701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 10593376 - 10593277
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||    
T  10593376 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 10593279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8445828 - 8445764
Alignment:
Q  8 aatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 71  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8445828 aatctactatcaattagttctttataaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaa 8445764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32609641 - 32609561
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatt 94  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  32609641 tatcaataagttctttacaaagaaatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaaactctcaaagaataaacttaatt 32609561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 42927004 - 42926965
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 46  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42927004 caatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 14689503 - 14689581
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14689503 ttacaaagagatacaaaaatattacaaaaaattagcttcaacaagcactccatgaacaaacataatttctaccaatttt 14689581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Original strand, 16649858 - 16649895
Alignment:
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16649858 ctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctcctttg 16649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6017115 - 6016999
Alignment:
Q  13 actatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattag-cttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||  ||||||||||||||| ||||  |||    
T  6017115 actatcaatgagtttcttacgaagaaataaaaaaaggttacaagaaattagtcttcaacaggttctcaaagaa-gaacctaatttctaccaattt--cca 6017019  T
Q  111 atttca-caaatgaacaaga 129  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  6017018 atttcatctaatgaacaaga 6016999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 32576357 - 32576419
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagct 74  Q
    |||||| ||| |||||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32576357 cactattaattagttctttaaaagagatacaaaatggttataagtaattagcttcaacaagct 32576419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33030950 - 33030891
Alignment:
Q  46 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacctatttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  33030950 gggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacataatttctacccatttt 33030891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30793256 - 30793195
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 61  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  30793256 tctctccacttcactatcaattagttctttacaaagagatacaaaatggttacaataaatta 30793195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7160927 - 7160854
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-acctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  7160927 aaagtgatacaaaggggttacaaaaaattagatttaa--agctcacaaagaacaagacttaatttctacatatttt 7160854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 10282028 - 10282060
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10282028 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 10282060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11181690 - 11181623
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11181690 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaaccataaagttacctcctttg 11181623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 14520504 - 14520536
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14520504 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 14520536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24553385 - 24553318
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24553385 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaacccttaagttacctcctttg 24553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 28832496 - 28832563
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28832496 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaactctaaagttacctcctttg 28832563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 30899945 - 30899994
Alignment:
Q  37 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac 88  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  30899945 gatacaaagaggttacaagaaattagcct--acaagctcacaaagaacaaac 30899994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 99)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 34570463 - 34570687
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570463 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 34570562  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  34570563 tattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagatgttttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 34570662  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  34570663 ctcaaccctaaagctacctcctttg 34570687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 54199955 - 54200179
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54199955 tctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 54200054  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  54200055 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 54200154  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  54200155 ctcaaccctaaagttacctcctttg 54200179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5429798 - 5429574
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||     
T  5429798 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctact 5429699  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5429698 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5429599  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  5429598 ctcaaccctaaagttacttcctttg 5429574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9927507 - 9927730
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927507 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 9927606  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  9927607 cattttcccaatctcaccaatgaataagacactcagtgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 9927705  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9927706 ctcaaccctaaagttacctcctttg 9927730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12739599 - 12739823
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12739599 tctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc 12739698  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  12739699 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 12739798  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12739799 ctcaaccctaaagttacctcctttg 12739823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12747805 - 12748029
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12747805 tctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatc 12747904  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  12747905 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttccactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 12748004  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12748005 ctcaaccctaaagttacctcctttg 12748029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26175685 - 26175909
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26175685 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccc 26175784  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||    
T  26175785 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaacagaactttaatcaaagacc 26175884  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  26175885 ctcaactctaaagttacctcctttg 26175909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 56178686 - 56178909
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  56178686 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 56178785  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  56178786 ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 56178884  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  56178885 ttcaaccctaaagttacctcctttg 56178909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48143162 - 48142937
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  48143162 tctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 48143063  T
Q  101 -tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  48143062 tttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 48142963  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48142962 cctcaaccctaaagttacctcctttg 48142937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36994643 - 36994420
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36994643 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacc 36994544  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  36994543 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttgccaaatcaagagaactctaatcaaagacc 36994444  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  36994443 ctcaa-ccaaaagttacctcctttg 36994420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 52095411 - 52095635
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52095411 tctctccaatccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 52095510  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||    
T  52095511 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagtcc 52095610  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52095611 ctcaaccctaaagttacctcctttg 52095635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 52467403 - 52467628
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52467403 tctctccaatccactatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 52467502  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  52467503 cattttcccaacctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaaccctaatcaaagac 52467602  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  52467603 cctcaaccctaaaattacctcctttg 52467628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37740744 - 37740521
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37740744 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttatacc 37740645  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  37740644 ctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 37740546  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  37740545 ctcaaccctaaacttacctcctttg 37740521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24969231 - 24969006
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24969231 tctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacc 24969132  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     ||||| ||||| |||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  24969131 catttttccaatctcaccaaagaacaagactctcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 24969032  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | |||||| |||||||||||||||||    
T  24969031 cgtcaaccttaaagttacctcctttg 24969006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5871939 - 5871715
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871939 tctctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 5871840  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  5871839 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 5871740  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  5871739 cataaccctaaagttacctcctttg 5871715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47038460 - 47038682
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47038460 tctctccaatccactatcaatgagtccttacaaacagatacaaatga-ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 47038558  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  47038559 cattttcc-aatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 47038657  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  47038658 ctcaaccctaaagttaactcctttg 47038682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 12745485 - 12745708
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745485 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12745584  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  12745585 cattttcctaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacattgtttcccaaaccaagagaactctaatcaaagacc 12745684  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctccttt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  12745685 ctcaactctaaagttacctccttt 12745708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 52082715 - 52082930
Alignment:
Q  10 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 109  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  52082715 tccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttccc 52082814  T
Q  110 aatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccct 208  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52082815 aatctcaccaatgaacaagacagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctcaaccct 52082914  T
Q  209 aaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  52082915 aaagttacctcctttg 52082930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31474270 - 31474059
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-acctaatttctac 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31474270 tctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctac 31474171  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  31474170 ccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaagtgtttacaatgtttcccactccaagagaaccttaatcaaagac 31474071  T
Q  199 cctcaaccctaa 210  Q
    ||||||||||||    
T  31474070 cctcaaccctaa 31474059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 36463438 - 36463623
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  36463438 tctctccaatccactgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatc 36463537  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatg-atttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36463538 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgaatttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaac 36463623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29254613 - 29254389
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  29254613 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacc 29254514  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  29254513 caatttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcattcacccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctactcaaagacc 29254414  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  29254413 ttcaaccctaaagttatctcctttg 29254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4588078 - 4587904
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  4588078 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctac 4587979  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca 173  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4587978 cttttttcccaatttcaccaatgaacatgacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccca 4587904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 45687231 - 45687469
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  45687231 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttc 45687330  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattc-aatgatttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaac 185  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||    
T  45687331 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagacaatcaaaaaatttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagagaac 45687430  T
Q  186 actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45687431 cctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 45687469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6542228 - 6542455
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6542228 tctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctac 6542327  T
Q  100 c-tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat--caaa 195  Q
    | | |||||||||| || | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||    
T  6542328 cattttttcccaatctccccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaac-ctcattacaaa 6542426  T
Q  196 gaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6542427 gacactcaaccctaaagttacctcctttg 6542455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 379499 - 379371
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379499 tctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 379400  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaaga 129  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  379399 cattttctcaatctcacaaatgaacaaga 379371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13009493 - 13009704
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||             |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13009493 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgttttacaagaaa-------------gctcacgaagaacaaacctaatttctacc 13009579  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  13009580 cattttcacaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 13009679  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  13009680 cttaaccctaaagttacctcatttg 13009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 48893687 - 48893918
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa----gaacaaacctaatttc 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||    
T  48893687 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttc 48893786  T
Q  97 tacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca--cctcaagagaa---cactaa 190  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |  ||| |||||||   |||||     
T  48893787 tacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccaaaccctaaagagaacctcacta- 48893885  T
Q  191 tcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     ||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  48893886 -caaagacactcaaccctcaaattacctcctttg 48893918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54883136 - 54883009
Alignment:
Q  4 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  54883136 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccat 54883037  T
Q  104 tttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54883036 tttcccaatctcaccaatgaacaagaca 54883009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8665527 - 8665397
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8665527 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacc 8665428  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  8665427 cattttcccattctcaccaatgaacaagaca 8665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40632564 - 40632434
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40632564 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacc 40632465  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40632464 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 40632434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29999855 - 30000078
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga-gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29999855 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctac 29999954  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  29999955 cc-ttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagac 30000052  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30000053 cctaaaccctaaagttgtctcctttg 30000078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3913567 - 3913412
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||     
T  3913567 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctact 3913468  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaagg 155  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3913467 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 3913412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5370132 - 5370359
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc-ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5370132 tctctctagtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 5370231  T
Q  100 c---tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaa 195  Q
    |   | |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  5370232 ctcttttttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaagtgtttacaatgtttcccagcccaagagaactataatcaaa 5370330  T
Q  196 gaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  5370331 gaccctaaaccctaaagttgtctcctttg 5370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12073511 - 12073381
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073511 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 12073412  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  12073411 cattttcccaatctcaccaataagcaagaca 12073381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26364355 - 26364225
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26364355 tctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 26364256  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26364255 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 26364225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27417014 - 27417144
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27417014 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaca 27417113  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27417114 cattttaccaatctcaccaatgaacaagaca 27417144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2209833 - 2209702
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2209833 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctac 2209734  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  2209733 ccattttcccaatctcaacaatgaacaagaca 2209702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41964535 - 41964404
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41964535 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 41964436  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41964435 ccattttcccaatttcaccaacgaacaagaca 41964404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46703620 - 46703489
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46703620 tctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 46703521  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
      ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46703520 tcattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 46703489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6656075 - 6655945
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  6656075 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacc 6655976  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  6655975 cattttttcaatctcacaagtgaacaagaca 6655945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35662560 - 35662430
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35662560 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacc 35662461  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  35662460 cattttttcaatctcaccaatgaacaagaca 35662430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 50673896 - 50674025
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  50673896 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctact 50673994  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  50673995 cattttctcaatctcacaaatgaacacgaca 50674025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Original strand, 46147442 - 46147575
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  46147442 tctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccca 46147541  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaa 136  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  46147542 tttttccaatctcaccgatgaacaagacaatcaa 46147575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8648258 - 8648128
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  8648258 tctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatc 8648159  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  8648158 cattttcccattctcaccaatgaacaagaca 8648128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12743974 - 12744080
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12743974 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12744073  T
Q  101 tattttc 107  Q
    |||||||    
T  12744074 tattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12745363 - 12745469
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745363 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12745462  T
Q  101 tattttc 107  Q
    |||||||    
T  12745463 tattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41639545 - 41639415
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41639545 tctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 41639446  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  41639445 cattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 48142440 - 48142651
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaat 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  48142440 tatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatc-atgttcccaat 48142538  T
Q  113 ttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactca-cctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaa 210  Q
     |||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||| || |||   || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48142539 ctcatcaatgggcaagacactcaatgattttcactcacccgaagtgtttaaaaatgtttcccaactcaagagaaccctaatcaaagaccatcaaccctaa 48142638  T
Q  211 agttacctccttt 223  Q
    |||||||||||||    
T  48142639 agttacctccttt 48142651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 50262752 - 50262920
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccta 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | |    
T  50262752 tctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatcca 50262851  T
Q  103 ttttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaa-tgtttccca 173  Q
    |||||||||| ||   ||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  50262852 ttttcccaatctc---aataaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttccca 50262920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 13992343 - 13992549
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13992343 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 13992441  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagaga-acactaatcaaagac 198  Q
    | |||||||||| ||||       ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  13992442 ttttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaagac 13992533  T
Q  199 cctcaaccctaaagtt 214  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13992534 cctaaaccctaaagtt 13992549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085578
Alignment:
Q  29 tacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaag 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctatttt-ccaatctcaccaatgaacaag 55085540  T
Q  129 acattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaat 165  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  55085541 acagtcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaat 55085578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 12744096 - 12744195
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12744096 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 5207895 - 5208116
Alignment:
Q  5 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5207895 tccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctacc-ct 5207993  T
Q  104 tttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccct 201  Q
    ||| |||||  | | |||||||||| || | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| || | |||||||||     
T  5207994 ttttccaatcactccaatgaacaagtcactaaatgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaatccaagagaaccctcaccaaagacccg 5208093  T
Q  202 caaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  5208094 caaccctatagttacctcctttg 5208116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12119659 - 12119483
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12119659 tctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttcta 12119560  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaa-tgtttccca 173  Q
    |   |||| ||||| ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  12119559 ctcttttttccaatctcacctatgaacaagacactcattgattttcactctcccaaggtatttacaattgtttccca 12119483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37229770 - 37230009
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaat-gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37229770 tctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta 37229869  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaa-tgtttcccacctcaagagaaca---------- 186  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| | |||||||||               
T  37229870 cc-attttcccaatctcaccaatgaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgttttccaacccaagagaacctctcaagata 37229968  T
Q  187 ---ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37229969 accctaatcaaagaccctaaaccctaaagttacctcctttg 37230009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51337183 - 51336958
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc--taatttcta 98  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  51337183 tctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttataataaattatcttaaa--agctcacaaagaacaaatccgtaatttcta 51337086  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaa 194  Q
    ||  ||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||| | |||||||||   ||||  |||    
T  51337085 ccctttttctcaatctcaccaatgaacaggacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagagaacctcacta--caa 51336988  T
Q  195 agaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  51336987 agacattcaaccctaaagttacttcctttg 51336958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21688368 - 21688237
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21688368 tctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 21688269  T
Q  101 ta-ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     | ||||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  21688268 catttttctcaatctcaccgatgaacaagaca 21688237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 26699491 - 26699580
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 89  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699491 tctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc 26699580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639252
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaataaacaagaca 41639252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6677589 - 6677362
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag--aacaaacctaatttct 97  Q
    |||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||    
T  6677589 tctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaaaaaaaacctaatttct 6677490  T
Q  98 acctattttcccaatttc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaa 194  Q
    ||| ||||| ||||||||  |  | |||||||| | ||||| |||||||||| | || |  ||||| ||||||||||| | |||||||| | || | |||    
T  6677489 acc-atttt-ccaatttcttcccaagaacaagagactcaattatttcactcatccaatgtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaacccctgaacaa 6677392  T
Q  195 agaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6677391 agacactcaaccctaaagttacctcctttg 6677362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 22882801 - 22882894
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaattt 95  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22882801 tctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaattt 22882894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Original strand, 22934465 - 22934558
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaattt 95  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22934465 tctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaacctaattt 22934558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32091583 - 32091448
Alignment:
Q  16 atcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaat-t 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  32091583 atcaatgtgttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttctagc-attttcccaatct 32091485  T
Q  114 tcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacc 150  Q
    || |  |||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  32091484 tctcccatgaacaagagactcaatgatttcgctcacc 32091448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34112937 - 34112838
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  34112937 tctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttctac 34112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33089998 - 33089900
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  33089998 tctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacataatttcta 33089900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33989964 - 33989867
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct 97  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  33989964 tctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaactctctaagaacaaacctagtttct 33989867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5350016 - 5349924
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5350016 tatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaaacctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29056478 - 29056336
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttcta 98  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  29056478 tctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaattagttctaacaagcacacaaagaacaaactctaattccta 29056379  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    || ||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  29056378 cc-attttcccaatctctctaatgaacaaaacactcaatgattt 29056336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 31495366 - 31495482
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  31495366 ctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctac 31495465  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  31495466 c-cttttcccaatctcac 31495482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 53345331 - 53345195
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-caaacctaatttctacctatt 104  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||    
T  53345331 caatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaatttctatc-att 53345233  T
Q  105 ttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    ||| |||| || |  || ||||||||| ||||||||||    
T  53345232 ttctcaatctctccgataaacaagacactcaatgattt 53345195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 16422655 - 16422755
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16422655 tctctccacttcactatccatgagttcattacaaagatatacaaaagggtttctagaaattagcttcaaaaagctctcaaaaaacaaacataatttctac 16422754  T
Q  100 c 100  Q
    |    
T  16422755 c 16422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Original strand, 44570427 - 44570514
Alignment:
Q  14 ctatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||||||    
T  44570427 ctatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattagtttcaacaagctctccaacaacaaacataatttctacc 44570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 21703886 - 21703986
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  21703886 tctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaaaagggtacaagaaatcatcttcaacaagctttctaagaacaaaacctaatttctacc 21703985  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  21703986 t 21703986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Original strand, 34788851 - 34788923
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  34788851 ttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Original strand, 52093890 - 52093937
Alignment:
Q  177 caagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52093890 caagagaactctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 52093937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 44967906 - 44967989
Alignment:
Q  28 ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctacctattttcccaat 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44967906 ttacaaagagatacaaatgg-ttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctacc-attttcccaat 44967989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 46147579 - 46147628
Alignment:
Q  175 ctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46147579 ctcaagaaaaccctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 46147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 52065717 - 52065616
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  52065717 tctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaac-aacctaatttcta 52065619  T
Q  99 cct 101  Q
    |||    
T  52065618 cct 52065616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3910068 - 3910002
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  3910068 tttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaaggccctaaacccttaagttacctcctttg 3910002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8393512 - 8393397
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| |||||||||||    
T  8393512 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta 8393415  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  8393414 cc-cttttcccaatctcac 8393397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8395721 - 8395606
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||| |||||||||||    
T  8395721 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt-gacatgttcactatgaacaaaccctaatttcta 8395624  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  8395623 cc-cttttcccaatctcac 8395606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Original strand, 35369542 - 35369588
Alignment:
Q  53 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35369542 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctac 35369588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Original strand, 35370449 - 35370495
Alignment:
Q  53 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35370449 aagaaattagtttcatcaagctcaccaagaacaaacctaatttctac 35370495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39774329 - 39774254
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaag-aacaa-acctaatttctacctattttc 107  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39774329 aaagtgatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaaacaagacctaatttctaccaattttc 39774254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1983325 - 1983271
Alignment:
Q  31 caaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa 87  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1983325 caaagtgatacaaaggggttacaagaaattagctt--gcaagctcacaaagaacaaa 1983271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 40975058 - 40975129
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaag 72  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40975058 tctctctaatctactatcaaagagtcattacaaagagatacaatagagttaccagaaattaacttcaacaag 40975129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 10047620 - 10047687
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat--caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10047620 tttacaatgtttcccaacccaagagatc-ctcattacaaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 10047687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16628695 - 16628662
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16628695 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 16628662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Original strand, 36463639 - 36463672
Alignment:
Q  188 taatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcct 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36463639 taatcaaagaccctcaatcctaaagttacctcct 36463672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41961523 - 41961438
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||   | ||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  41961523 tatcaatgacttctttacaaagagatacaaaatgattacaagaaattagcactaccaagctctccatgaacaaacttaatttctac 41961438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 3777823 - 3777855
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3777823 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 3777855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 5147917 - 5147981
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaat-caaagaccctcaaccctaaagttacctcct 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || | ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5147917 tttacaatgtttcccaactcaagagatccttactacaaagacactaaaccctaaagttacctcct 5147981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5269023 - 5268991
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5269023 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 5268991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 6199921 - 6200020
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaaga--gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct 97  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || ||||| |  |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  6199921 tctctccacttcactatcaatgagttatttacaaatatagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaaagtgtctaagaacaaacctaatttct 6200020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6376002 - 6375970
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6376002 caaagaccctcaaccctaaaattacctcctttg 6375970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16623116 - 16623084
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16623116 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 16623084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 37781935 - 37782008
Alignment:
Q  32 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  37781935 aaagtgatacaaagaggttacaagaaattagctt--aaaaactcacaaagaacaaatcttaatttctacccatttt 37782008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 39593806 - 39593867
Alignment:
Q  37 gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  39593806 gatacaaataagttacaagaaattagttt--acaaactcacaaagaatcaacctaatttctacc 39593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 54867453 - 54867485
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54867453 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 54867485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 196957 - 197181
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  196957 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 197056  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  197057 aattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 197156  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  197157 ctcaaccctaaagttacctcctttg 197181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 834216 - 834440
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  834216 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatc 834315  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  834316 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcacgcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 834415  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  834416 ctcaaccctaaagttacctcctttg 834440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31659357 - 31659133
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31659357 tctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacc 31659258  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  31659257 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagagaactctaatcaaagacc 31659158  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31659157 ctcaaccctaaagttacctcctttg 31659133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3156984 - 3156761
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3156984 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 3156885  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  3156884 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-agggtgtttacaatgtttccaaacccaagagaactctaatcaaagacc 3156786  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3156785 ctcaaccctaaagttacctcctttg 3156761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3847170 - 3847394
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3847170 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacc 3847269  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  3847270 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 3847369  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  3847370 ctcgaccctaaagttacctcctttg 3847394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28220275 - 28220499
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28220275 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 28220374  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||| ||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28220375 cattttccgaatctcaccaatgaataagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttcaatgcttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 28220474  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28220475 ctcaaccctaaagttacctcctttg 28220499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8550836 - 8551060
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550836 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 8550935  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  8550936 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaatgtgtttacaatgtttcttaacccaagagaactctaatcaaagacc 8551035  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  8551036 cttaaccctaaagttaactcctttg 8551060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28223470 - 28223694
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  28223470 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacc 28223569  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  28223570 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtcttcaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 28223669  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28223670 ctcaaccctaaagttacctcctttg 28223694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44455279 - 44455055
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44455279 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 44455180  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaat-gatttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  44455179 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatggttttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaaaactctaatcaaagacc 44455080  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44455079 ctcaaccctaaagttacctcctttg 44455055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 49918469 - 49918244
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918469 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 49918370  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaagg-catttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  49918369 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgttttataatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagac 49918270  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  49918269 cttcaaccctaaagttacctcctttg 49918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15820426 - 15820202
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15820426 tctcttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacc 15820327  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     || || ||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15820326 catctttccaatatcaccaaagaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaactcaagagaactctaatcaaagacc 15820227  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  15820226 ctcaaccctaaagttacctcttttg 15820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13138025 - 13138247
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  13138025 tctcttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-gacctaatttctatc 13138123  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13138124 catttt-tcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaccccaagagaaccctaatcaaagacc 13138222  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13138223 ctcaaccctaaagttacctcctttg 13138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46065037 - 46064813
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  46065037 tctctccaatccactatgaatgagttcttacaaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatc 46064938  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  46064937 cattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaccccaagagaaccataatcaaagacc 46064838  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||    
T  46064837 ctcaacaataaagttaccttctttg 46064813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 50169259 - 50169483
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50169259 tctcttcaatccactatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 50169358  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||| |||    
T  50169359 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtatttacaatgtttcccaacccaagataaccctaataaaaaacc 50169458  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50169459 ctcaaccctaaagttacctcctttg 50169483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28265603 - 28265839
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28265603 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 28265702  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  28265703 tattttcccaatctcgccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacctaagagaacccctcaagagaac- 28265801  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28265802 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 28265839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1833641 - 1833417
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1833641 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcacaaagaacaaccctaatttctacc 1833542  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  1833541 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagagaactctaatcaaagacc 1833442  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    
T  1833441 ctcaaccttaaagttatctcctttg 1833417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4552686 - 4552909
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4552686 tctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacc 4552785  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| || | |||||||||   ||| |||||||    
T  4552786 cattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttccctcacccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagagaacctcaattaaagacc 4552885  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctccttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4552886 ctcaaccctaaagttacctccttt 4552909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37503606 - 37503827
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37503606 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa---ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacc 37503702  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37503703 cattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatattttccaacccaatagaactctaatcaaagacc 37503802  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  37503803 ctcaaccctaaagtcacctcctttg 37503827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10925343 - 10925118
Alignment:
Q  3 tctccaatccactatcaatgagttctt---acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  10925343 tctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctat 10925244  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  10925243 ccattttttcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactataatcaaagac 10925144  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10925143 cctcaaccctaaagttacctcctttg 10925118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37559917 - 37560142
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagc-ttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  37559917 tctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctac 37560016  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||    
T  37560017 ccattttcctaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacctaatgtgtttacaatgttttcaaacccaagagaactctaatcaaagac 37560116  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37560117 cctcaaccttaaagttacctcatttg 37560142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 50167224 - 50167461
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  50167224 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctact 50167323  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  50167324 aattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagagaacc 50167423  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50167424 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 50167461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3189449 - 3189226
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3189449 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttatacc 3189350  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  3189349 ctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 3189251  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3189250 ctcaaccctaaagttacctcctttg 3189226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3198266 - 3198043
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3198266 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttatacc 3198167  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  3198166 ctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 3198068  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3198067 ctcaaccctaaagttacctcctttg 3198043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3207105 - 3206882
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3207105 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttatacc 3207006  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  3207005 ctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagacc 3206907  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3206906 ctcaaccctaaagttacctcctttg 3206882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13659385 - 13659609
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13659385 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatc 13659484  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||    
T  13659485 cgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagacc 13659584  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  13659585 ctcaacccacaagttacctcctttg 13659609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 23555315 - 23555538
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  23555315 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 23555414  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| |||||| ||||| | ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| ||    
T  23555415 atttttccaatctcaccaaagaataagacactcaataattttcattcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactttaatcaaagatcc 23555514  T
Q  201 tcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  23555515 tcaaccctgaagttacctcctttg 23555538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20762791 - 20762567
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20762791 tctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 20762692  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    || ||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  20762691 cttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagac 20762593  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||    
T  20762592 cctaaaccctaaagttgcttcctttg 20762567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 45644403 - 45644628
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  45644403 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctat 45644502  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagac 198  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  45644503 ccattttctcaatctcaccaatgaacaagacacttaatgattttcactcacccaagatgtttacaatgttttccaacctaagagaaccctaatcaaagac 45644602  T
Q  199 cctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45644603 cctcaaccctaaagttatctcctttg 45644628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41361026 - 41360805
Alignment:
Q  8 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttc 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41361026 aatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttc 41360927  T
Q  108 ccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca--cctcaagagaa---cactaatcaaagaccctc 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  |||||||||||   |||||  || |  | |||    
T  41360926 ccaatctcaccaatgaacaagacactcaatattttcactcacccaagatgtttacgatgtttcccaaccctcaagagaacctcacta--cacatgcactc 41360829  T
Q  203 aaccctaaagttacctcctttgct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41360828 aaccctaaagttacctcctttgct 41360805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47255389 - 47255553
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47255389 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 47255488  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaat 165  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  47255489 catttttccaatctcaccaatgaacaagacactc-atgattttcactctcccaaggcatttacaat 47255553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40122245 - 40122471
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactat--caatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  40122245 tctctctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcga 40122344  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| || ||    
T  40122345 cccatttttccaatctcacaaatgaacaagacattcaatgatttttactcacccaaggtgtttacaatgtttcccaatccaagataactctaattaatga 40122444  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  40122445 tcctcaaccataaagttacctcctttg 40122471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 928025 - 928251
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  928025 tctctctaatccactattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctat 928124  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaaga 197  Q
    |  |||| ||||| |||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  928125 cattttttccaatatcaccaaagaacaagacactcattgattttcactcacccaaggtgtttacaaatgtttcccaacccaagagaatcctaatcaaaga 928224  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||| |||||||||||||||||    
T  928225 ccttcaaccataaagttacctcctttg 928251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11348817 - 11348687
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11348817 tctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 11348718  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11348717 aattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 11348687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13547138 - 13547268
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13547138 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 13547237  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13547238 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 13547268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 30476499 - 30476707
Alignment:
Q  5 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatt 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30476499 tccaatccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctatt 30476598  T
Q  105 ttcccaatttcacaaa---tgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccc 200  Q
    |||||||| |||| ||   ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  30476599 ttcccaatctcaccaatattgaacaaga-actcaatgattttcacccacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaataccc 30476697  T
Q  201 tcaaccctaa 210  Q
    ||| ||||||    
T  30476698 tcagccctaa 30476707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37168417 - 37168286
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37168417 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 37168318  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37168317 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 37168286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13549049 - 13549179
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13549049 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 13549148  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13549149 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 13549179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29136366 - 29136236
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29136366 tctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 29136267  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29136266 cattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 29136236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42298024 - 42298154
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42298024 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacc 42298123  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42298124 aattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 42298154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19754614 - 19754483
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19754614 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 19754515  T
Q  101 ta-ttttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     | ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  19754514 catttttctcaatctcaccaatgaacaagaca 19754483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37033121 - 37033252
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37033121 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 37033220  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37033221 ccattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 37033252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31925756 - 31925886
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  31925756 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacc 31925855  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  31925856 catttttccactctcaccaatgaacaagaca 31925886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47115291 - 47115160
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47115291 tctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 47115192  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47115191 caattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 47115160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 193730 - 193600
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  193730 tctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacc 193631  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  193630 cattttctcaatctcaccaatgaacaagaca 193600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 7482279 - 7482406
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7482279 tctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 7482378  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaa 127  Q
    | |||| |||||| |||| |||||||||    
T  7482379 ccatttacccaatctcaccaatgaacaa 7482406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16455740 - 16455586
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||  |    
T  16455740 tctctccaatccactatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcac 16455642  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaagg 155  Q
     ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16455641 cattttaccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 16455586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19752805 - 19752674
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19752805 tctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacc 19752706  T
Q  101 tatttt-cccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
     ||||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  19752705 cattttactcaatctcaccaatgaacaagaca 19752674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34603696 - 34603565
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-tgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34603696 tctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 34603597  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    | |||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  34603596 ccattttttcaatctcaccaatgaacaagaca 34603565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 13316402 - 13316517
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  13316402 ctctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 13316501  T
Q  102 attttcccaatttcac 117  Q
     |||||||||| ||||    
T  13316502 tttttcccaatctcac 13316517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22079436 - 22079336
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22079436 tctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaacataatttctac 22079337  T
Q  100 c 100  Q
    |    
T  22079336 c 22079336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 131
Target Start/End: Original strand, 37879006 - 37879090
Alignment:
Q  47 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37879006 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaatgaacaagaca 37879090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51765515 - 51765298
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaa-gaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||||||||||    
T  51765515 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttcta 51765416  T
Q  99 -cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaa 195  Q
     ||| || |||||||   || || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  51765415 cccttttctcccaatcaaaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttccaacc-caagagaagctctaatcaaa 51765319  T
Q  196 gaccctcaaccctaaagttac 216  Q
    |||||| ||||||| ||||||    
T  51765318 gaccctaaaccctagagttac 51765298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3460816 - 3460715
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaac-ctaatttcta 98  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3460816 tctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 3460717  T
Q  99 cc 100  Q
    ||    
T  3460716 cc 3460715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6808572 - 6808479
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaat 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6808572 tctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctctccaagaacaaacctaat 6808479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 36683771 - 36683698
Alignment:
Q  39 tacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaat 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36683771 tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctattttcccaat 36683698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318721
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttcttaca-aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttcccaatt 113  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| | ||||| |||     
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctaccca-tttccaaatc 12318683  T
Q  114 tc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacc 150  Q
    || ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12318684 tctacccatgaacaagaaactcaatgatttcactcacc 12318721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 37282740 - 37282877
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  37282740 tctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttata 37282839  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatg 138  Q
    ||  ||||  |||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  37282840 ccattttt--caatctctccaatgaacaagacactcaatg 37282877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 131
Target Start/End: Original strand, 8871129 - 8871227
Alignment:
Q  33 aagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  8871129 aagagttacaaaatggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctacc-attttccaaatctcacaaaagaacaagaca 8871227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 2263023 - 2263106
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa 83  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2263023 tctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Original strand, 16914234 - 16914329
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaa-ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattt 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16914234 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacataatttttacccattt 16914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471481
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagtt-cttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44650211 - 44650437
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttcta 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |  |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44650211 tctcttcaatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataattttta 44650310  T
Q  99 cctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaag 196  Q
    | | ||||| |||| || | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |  ||||| ||||||| ||| || |||||||| || | |||||    
T  44650311 cat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcactcacccaaagtgtttacaaatgttttccaacttaagagaaccctcaccaaag 44650409  T
Q  197 accctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||| ||||||| ||  ||||||||    
T  44650410 actctcatccctaaaattttctcctttg 44650437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25652195 - 25652101
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattt 105  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  25652195 cactatcaaagagttctttacaaagagatacaagagagttacaagaaattagcttcaacaaactctcaaataacacacttaatttctaccaattt 25652101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 9109468 - 9109565
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttct 97  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | ||| | |||| ||||||||    
T  9109468 tctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagttctccaagtaaaaacttaatttct 9109565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 4535541 - 4535629
Alignment:
Q  13 actatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  4535541 actatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaatgttacaagaaattgacttcaataagctctccaagaacaaacttaatttctacc 4535629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9987319 - 9987205
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  9987319 ctctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaa-aggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctacc 9987221  T
Q  101 tattttcccaatttcac 117  Q
      |||||||||| ||||    
T  9987220 -cttttcccaatctcac 9987205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 20622287 - 20622403
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaga---gatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  20622287 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta 20622385  T
Q  99 cctattttcccaatttcac 117  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  20622386 cc-cttttcccaatctcac 20622403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 777175 - 777125
Alignment:
Q  174 cctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  777175 cctcaagagaaccctaatcaaagaccatcaaccctaaagttacctcctttg 777125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13938257 - 13938152
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgag-ttcttacaaagagatac-aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  ||  ||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  13938257 tctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttctccaagaac-aacctaatttcta 13938159  T
Q  99 cctattt 105  Q
    || ||||    
T  13938158 cccattt 13938152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 37876815 - 37876865
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggtta 51  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37876815 tctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9036534 - 9036420
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9036534 ctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 9036437  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  9036436 c-cttttcccaatctcac 9036420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40282495 - 40282380
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  40282495 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctac 40282397  T
Q  100 ctattttcccaatttcac 117  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  40282396 c-cttttcccaatctcac 40282380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Original strand, 13316525 - 13316581
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaagtt 214  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13316525 tttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagaccctaaaccctaaagtt 13316581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21054076 - 21053978
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21054076 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctac 21053978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 1050503 - 1050640
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccca 110  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||| | |||||||    
T  1050503 cactatcaacgagttatttacaaagagacacaaaaatgttacaagaaattagcttcaataagctctcgaagaacacacctaattttcaccca-tttccca 1050601  T
Q  111 atttc-acaaatgaacaagacattcaatgatttcactca 148  Q
    || ||  || |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  1050602 atctcttcacatgaacaagagactcaataatttcactca 1050640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35109557 - 35109494
Alignment:
Q  36 agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35109557 agatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctacc 35109494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2926628 - 2926528
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||||| ||   ||| |||||||||||||||||    
T  2926628 tctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagttcttcaagcacaaacctaatttctac 2926529  T
Q  100 c 100  Q
    |    
T  2926528 c 2926528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 5460025 - 5459956
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttc-ttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 70  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  5460025 tctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaa-atgttacaagaaattagcttcaaca 5459956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 28242423 - 28242382
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaa 43  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28242423 tctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41135926 - 41135840
Alignment:
Q  15 tatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||||||||    
T  41135926 tatcaacgagttctttacaaatagatacaaaaggtttacaagaaattaacttcaaaaagttcttcaagaacaaatctaatttctacc 41135840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 211
Target Start/End: Original strand, 44646881 - 44647045
Alignment:
Q  49 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcact 146  Q
    |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||| || | ||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  44646881 ttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaaaccataatttttacat-ttttctcaatctctccaatgaacaagacactcaataattttcact 44646979  T
Q  147 cacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagaccctcaaccctaaa 211  Q
    || | || | |||||| ||| ||| ||| || |||||||| || | ||||||| |||| |||||||    
T  44646980 catccaaagtatttacaaatattttccaacttaagagaaccctcaccaaagactctcatccctaaa 44647045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47102697 - 47102630
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttcccacctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47102697 tttacaatgtttcccaacccaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 47102630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 1485855 - 1485918
Alignment:
Q  36 agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||    
T  1485855 agatacaaaagggttacaagaaattatattcaacaagcactccaagaaaaatcctaatttctac 1485918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47703793 - 47703724
Alignment:
Q  158 tttacaatgtttccca--cctcaagagaac---actaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47703793 tttacaatgtttcccaaccctcaagagaacctcacta--caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 47703724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 32889712 - 32889745
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttgc 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32889712 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttgc 32889745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21536393 - 21536361
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21536393 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 21536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 29652087 - 29652119
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29652087 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 29652119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47098648 - 47098616
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47098648 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 47098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20464 - 20688
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |     
T  20464 tctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgct 20563  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
     ||||||||||| |||| |||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  20564 cattttcccaatctcaccaatgaataataaactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtctcccaacccaagataactctaatcaaagacc 20663  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20664 ctcaaccctaaagttacctcctttg 20688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 149146 - 149370
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  149146 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatc 149245  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||    
T  149246 cgttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactaccccaaggtgtttacaatgtttctcaacctaagagaactctaatcaaagacc 149345  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  149346 ctcaacccacaagttacctcctttg 149370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 434651 - 434428
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  434651 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 434552  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  434551 tttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtatttaccatgttttccaacccaagagaactctaatcaaagacc 434453  T
Q  200 ctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    || |||||||||||| | |||||||    
T  434452 ctaaaccctaaagttgcttcctttg 434428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 490380 - 490468
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctac 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  490380 cactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaacttaatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 114721 - 114485
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  114721 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacc 114622  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca-------------cctcaagagaaca 186  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||             ||||||||||||     
T  114621 ctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaacccctcaagagaacc 114523  T
Q  187 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114522 ctaatcaaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 114485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1033 - 822
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-cc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1033 ctctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 935  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaacactaatcaaagacc 199  Q
    | |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  934 ttttttcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaactctaatcaaagacc 837  T
Q  200 ctcaaccctaaagtt 214  Q
    || ||||||||||||    
T  836 ctaaaccctaaagtt 822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11675 - 11504
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  11675 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacca 11576  T
Q  102 attttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatga-tttcactcacctaaggcatttacaatgtttccca 173  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  11575 tttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc-aaggtgtttacaatgtttccca 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7442 - 7316
Alignment:
Q  5 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  7442 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatt 7343  T
Q  105 ttcccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||    
T  7342 tttccaatctcaccaatgaacaagaca 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 11211 - 11427
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11211 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 11310  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaaga 197  Q
    || || ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  11311 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatgatttacactcacc-aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 11408  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttac 216  Q
    || | ||||||| ||||||    
T  11409 ccataaaccctagagttac 11427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 8785 - 9001
Alignment:
Q  2 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttcta-c 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8785 ctctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 8884  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt-cactcacctaaggcatttacaatgtttcccacctcaagagaa-cactaatcaaaga 197  Q
    || || ||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  8885 cttttctcccaatctcaccaa-gaacaagacactcaatggtttacactcacc-aaggtctttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaaga 8982  T
Q  198 ccctcaaccctaaagttac 216  Q
    |||| || |||| ||||||    
T  8983 ccctaaagcctagagttac 9001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 18053 - 18178
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18053 tctctccaatccactatcaatgagtt-ttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacc 18151  T
Q  101 tattttcccaatttcacaaatgaacaa 127  Q
     ||||||||| | |||| |||||||||    
T  18152 aattttcccactctcaccaatgaacaa 18178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80462
Alignment:
Q  7 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctatttt 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  107 cccaatttcacaaatgaacaagaca 131  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  80438 cccaatctcagcaatgaacaagaca 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10608 - 10468
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 99  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  10608 tctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataaattagc-acaa-gagctcacaaagaacaaaccctaatttatat 10511  T
Q  100 ctattttcccaatttcacaaatgaacaagacattcaatgattt 142  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10510 ctttttttccaatctcacaaatgaacaagacactcaaagattt 10468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 27491 - 27678
Alignment:
Q  1 tctctccaatccactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-acctaatttcta 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||    
T  27491 tctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaatacataatttcta 27590  T
Q  99 cctattttcccaat---ttcacaaatgaacaagacattcaatgatttcactcacctaaggcatttac-aatgtttcccacctcaagagaac 185  Q
     || ||||| ||||   ||| | |  |||||||| | |||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27591 -ctcttttcacaatctcttcccta--gaacaagagactcaaagatttcactcatccaaggtgtttacaaatgtttcccaactcaagagaac 27678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25162 - 25065
Alignment:
Q  12 cactatcaatgagttctt-acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25162 cactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttctacc-attttccc 25065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36655 - 36623
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36655 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 36623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43784 - 43752
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43784 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 43752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 224
Target Start/End: Original strand, 85957 - 85989
Alignment:
Q  192 caaagaccctcaaccctaaagttacctcctttg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85957 caaagacactcaaccctaaagttacctcctttg 85989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University