View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1314_low_113 (Length: 282)

Name: NF1314_low_113
Description: NF1314
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1314_low_113
NF1314_low_113
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (11-282)||(2042-2313)
scaffold0234 (11-282)||(10933-11204)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (11-282)||(21940880-21941151)
chr8 (14-282)||(22171705-22171973)
chr8 (11-282)||(6094338-6094609)
chr8 (20-282)||(15326422-15326684)
chr8 (20-282)||(15506791-15507053)
chr8 (11-282)||(24642864-24643134)
chr8 (142-282)||(28548393-28548533)
chr8 (15-216)||(14983710-14983908)
chr8 (38-168)||(24797224-24797353)
chr8 (44-282)||(8371254-8371488)
chr8 (44-282)||(12562190-12562424)
chr8 (44-282)||(21969400-21969634)
chr8 (44-239)||(25611262-25611453)
chr8 (44-282)||(22659495-22659729)
chr8 (44-282)||(27007518-27007752)
chr8 (44-282)||(27014661-27014895)
chr8 (44-282)||(27880488-27880722)
chr8 (44-282)||(28020669-28020903)
chr8 (44-282)||(22130610-22130844)
chr8 (15-267)||(38232115-38232365)
chr8 (44-282)||(45534274-45534508)
chr8 (45-282)||(21916744-21916977)
chr8 (44-282)||(26240551-26240785)
chr8 (52-245)||(8781913-8782102)
chr8 (51-186)||(18835424-18835556)
chr8 (44-282)||(6430953-6431187)
chr8 (176-273)||(24796731-24796826)
chr8 (11-103)||(32872741-32872833)
chr8 (16-85)||(2375231-2375300)
chr8 (121-186)||(20535306-20535371)
chr8 (44-282)||(2962933-2963171)
chr8 (222-282)||(8968016-8968076)
chr8 (44-83)||(36970332-36970371)
chr8 (23-75)||(10920427-10920479)
chr8 (17-73)||(29645575-29645631)
chr8 (223-271)||(41368106-41368154)
chr8 (223-271)||(41375077-41375125)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (11-282)||(29327999-29328270)
chr7 (11-279)||(15152658-15152926)
chr7 (11-282)||(11535783-11536054)
chr7 (11-282)||(11542701-11542972)
chr7 (11-282)||(12751041-12751312)
chr7 (11-282)||(12738751-12739022)
chr7 (11-282)||(18561222-18561484)
chr7 (15-282)||(13392369-13392636)
chr7 (11-271)||(18257577-18257834)
chr7 (44-282)||(2204619-2204853)
chr7 (44-282)||(8465066-8465300)
chr7 (44-282)||(18400171-18400405)
chr7 (44-282)||(18407155-18407389)
chr7 (44-282)||(48808497-48808731)
chr7 (44-282)||(15729818-15730052)
chr7 (44-282)||(18139339-18139573)
chr7 (44-282)||(41680969-41681203)
chr7 (43-282)||(2365169-2365406)
chr7 (44-271)||(30254205-30254428)
chr7 (44-282)||(19230955-19231189)
chr7 (51-282)||(34128647-34128874)
chr7 (51-186)||(19388626-19388762)
chr7 (44-271)||(47166871-47167094)
chr7 (44-282)||(10668902-10669137)
chr7 (51-186)||(14591924-14592056)
chr7 (51-186)||(16011515-16011647)
chr7 (44-239)||(19393468-19393659)
chr7 (55-258)||(25845501-25845700)
chr7 (55-258)||(25845920-25846119)
chr7 (44-258)||(24443352-24443562)
chr7 (44-282)||(28130628-28130862)
chr7 (58-184)||(31190537-31190660)
chr7 (51-183)||(22969024-22969153)
chr7 (44-282)||(18259125-18259359)
chr7 (11-85)||(10235377-10235451)
chr7 (135-272)||(39112138-39112275)
chr7 (46-186)||(3587978-3588118)
chr7 (16-99)||(7662569-7662651)
chr7 (134-209)||(22948499-22948574)
chr7 (41-99)||(7396469-7396527)
chr7 (32-109)||(3132910-3132986)
chr7 (95-186)||(15169386-15169474)
chr7 (44-76)||(19859189-19859221)
chr7 (129-192)||(29984308-29984371)
chr7 (15-85)||(47833875-47833945)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (11-282)||(17684190-17684461)
chr6 (11-282)||(27380973-27381244)
chr6 (11-282)||(27471356-27471627)
chr6 (11-282)||(11651938-11652209)
chr6 (11-282)||(17691161-17691432)
chr6 (11-282)||(29309105-29309376)
chr6 (11-282)||(29316065-29316335)
chr6 (11-282)||(188698-188969)
chr6 (44-282)||(27296877-27297115)
chr6 (11-282)||(16394166-16394437)
chr6 (42-279)||(25536915-25537152)
chr6 (61-282)||(16559193-16559414)
chr6 (16-266)||(13359010-13359256)
chr6 (44-282)||(27508348-27508582)
chr6 (44-282)||(1586109-1586343)
chr6 (44-282)||(16789138-16789372)
chr6 (44-282)||(22859889-22860123)
chr6 (44-269)||(27527947-27528168)
chr6 (44-186)||(18019937-18020076)
chr6 (46-186)||(20736425-20736562)
chr6 (44-258)||(10359076-10359285)
chr6 (16-273)||(2669513-2669768)
chr6 (44-282)||(14074547-14074781)
chr6 (44-282)||(8612982-8613220)
chr6 (11-66)||(16566257-16566312)
chr6 (44-186)||(21994655-21994794)
chr6 (14-180)||(17850321-17850484)
chr6 (54-214)||(8510181-8510338)
chr6 (51-186)||(5758577-5758709)
chr6 (44-282)||(17120506-17120740)
chr6 (15-149)||(27925973-27926103)
chr6 (12-99)||(28172772-28172859)
chr6 (51-186)||(19218503-19218630)
chr6 (44-155)||(22560311-22560419)
chr6 (53-186)||(4073652-4073781)
chr6 (142-205)||(28172899-28172963)
chr6 (170-282)||(33317055-33317166)
chr6 (127-266)||(28756145-28756283)
chr6 (11-111)||(19347092-19347191)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (11-282)||(24695187-24695458)
chr5 (11-282)||(19714219-19714490)
chr5 (23-282)||(18569582-18569841)
chr5 (11-282)||(19706940-19707210)
chr5 (11-155)||(39538803-39538947)
chr5 (17-282)||(17298622-17298885)
chr5 (11-282)||(17285471-17285740)
chr5 (109-282)||(27347257-27347428)
chr5 (176-282)||(24701951-24702057)
chr5 (16-189)||(18806850-18807021)
chr5 (44-282)||(22941317-22941551)
chr5 (44-282)||(20941094-20941328)
chr5 (44-282)||(25805386-25805620)
chr5 (44-282)||(31966-32200)
chr5 (44-282)||(12789664-12789898)
chr5 (44-282)||(23545989-23546223)
chr5 (44-282)||(24933307-24933541)
chr5 (11-150)||(22546872-22547008)
chr5 (44-282)||(31096883-31097117)
chr5 (46-271)||(20100255-20100476)
chr5 (51-282)||(12764991-12765222)
chr5 (51-282)||(9811734-9811965)
chr5 (51-282)||(12703875-12704106)
chr5 (58-189)||(18806490-18806619)
chr5 (58-189)||(18806670-18806799)
chr5 (51-270)||(5097725-5097940)
chr5 (44-282)||(7865431-7865669)
chr5 (45-282)||(18829282-18829519)
chr5 (44-186)||(26129789-26129928)
chr5 (198-282)||(28719476-28719558)
chr5 (44-186)||(26245169-26245308)
chr5 (202-282)||(39538954-39539034)
chr5 (54-150)||(31651917-31652009)
chr5 (11-56)||(27347425-27347470)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (11-282)||(18262427-18262698)
chr4 (11-282)||(18269288-18269559)
chr4 (11-282)||(55612898-55613169)
chr4 (11-282)||(8858382-8858653)
chr4 (11-282)||(26963855-26964126)
chr4 (11-282)||(26970678-26970949)
chr4 (11-282)||(868812-869083)
chr4 (11-282)||(19926481-19926752)
chr4 (11-282)||(5707535-5707806)
chr4 (11-282)||(5714163-5714434)
chr4 (11-282)||(10621054-10621325)
chr4 (11-282)||(10628133-10628404)
chr4 (11-282)||(28392855-28393126)
chr4 (11-282)||(8845418-8845689)
chr4 (11-282)||(4426337-4426596)
chr4 (15-282)||(5667850-5668115)
chr4 (15-282)||(35223779-35224046)
chr4 (51-278)||(10677308-10677534)
chr4 (51-278)||(10890948-10891174)
chr4 (15-282)||(20311511-20311776)
chr4 (44-282)||(15461564-15461798)
chr4 (44-282)||(34975618-34975852)
chr4 (32-182)||(21453961-21454110)
chr4 (44-282)||(2677080-2677314)
chr4 (44-282)||(3369024-3369258)
chr4 (44-282)||(15815088-15815322)
chr4 (44-282)||(18111044-18111278)
chr4 (44-282)||(17299960-17300194)
chr4 (44-253)||(19365586-19365792)
chr4 (44-282)||(20244004-20244238)
chr4 (44-282)||(26531680-26531914)
chr4 (44-282)||(1941791-1942025)
chr4 (44-282)||(4675984-4676218)
chr4 (44-282)||(18163229-18163463)
chr4 (44-186)||(19362477-19362616)
chr4 (45-181)||(32636552-32636685)
chr4 (44-186)||(5870485-5870624)
chr4 (51-186)||(9487625-9487757)
chr4 (51-267)||(5616469-5616681)
chr4 (11-108)||(56516271-56516368)
chr4 (44-267)||(5528495-5528714)
chr4 (63-216)||(30040556-30040705)
chr4 (51-267)||(9538033-9538244)
chr4 (15-270)||(32646536-32646789)
chr4 (44-186)||(4546147-4546286)
chr4 (66-186)||(11421096-11421213)
chr4 (32-186)||(33888594-33888743)
chr4 (23-150)||(34777850-34777975)
chr4 (53-144)||(9937830-9937923)
chr4 (12-58)||(24700245-24700291)
chr4 (155-205)||(24701361-24701411)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (11-282)||(6110279-6110550)
chr3 (11-282)||(8490710-8490981)
chr3 (11-282)||(15341940-15342211)
chr3 (11-282)||(16482204-16482475)
chr3 (11-282)||(10579076-10579347)
chr3 (11-282)||(15357307-15357578)
chr3 (11-282)||(15600605-15600876)
chr3 (11-282)||(15607150-15607421)
chr3 (11-282)||(10572313-10572584)
chr3 (11-279)||(18522878-18523146)
chr3 (11-282)||(18520190-18520461)
chr3 (11-282)||(13211517-13211788)
chr3 (11-282)||(13248822-13249093)
chr3 (11-282)||(17780839-17781110)
chr3 (11-282)||(32056620-32056892)
chr3 (11-282)||(13517026-13517293)
chr3 (11-282)||(17199905-17200176)
chr3 (11-282)||(1647242-1647513)
chr3 (11-282)||(17136574-17136839)
chr3 (14-282)||(29925189-29925457)
chr3 (14-282)||(29974342-29974610)
chr3 (12-282)||(16200646-16200916)
chr3 (44-282)||(21034305-21034539)
chr3 (44-282)||(15846537-15846771)
chr3 (44-282)||(20147555-20147789)
chr3 (44-282)||(21398859-21399093)
chr3 (44-282)||(55427088-55427322)
chr3 (45-282)||(12299978-12300211)
chr3 (44-282)||(14890458-14890692)
chr3 (44-282)||(25978729-25978963)
chr3 (51-241)||(15526827-15527013)
chr3 (51-185)||(14147095-14147226)
chr3 (19-216)||(24253179-24253372)
chr3 (17-150)||(32280313-32280444)
chr3 (98-282)||(28088227-28088407)
chr3 (44-186)||(11787654-11787793)
chr3 (44-186)||(15317269-15317408)
chr3 (15-144)||(28953965-28954093)
chr3 (130-239)||(30464147-30464255)
chr3 (122-186)||(36138033-36138097)
chr3 (55-164)||(4189223-4189329)
chr3 (122-186)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (11-282)||(18252245-18252516)
chr1 (11-282)||(18532235-18532506)
chr1 (11-282)||(27131131-27131401)
chr1 (11-282)||(27310298-27310569)
chr1 (11-282)||(16358756-16359027)
chr1 (11-282)||(3855640-3855911)
chr1 (11-274)||(36816363-36816625)
chr1 (14-282)||(22641595-22641859)
chr1 (15-282)||(27277279-27277545)
chr1 (11-155)||(21171081-21171225)
chr1 (90-282)||(9916498-9916689)
chr1 (44-282)||(19706440-19706674)
chr1 (44-282)||(28134724-28134958)
chr1 (44-282)||(43802366-43802600)
chr1 (44-282)||(9456183-9456417)
chr1 (44-282)||(20391240-20391474)
chr1 (44-282)||(20779646-20779880)
chr1 (44-282)||(22670258-22670492)
chr1 (44-282)||(42816990-42817224)
chr1 (15-282)||(23507119-23507384)
chr1 (44-239)||(634001-634192)
chr1 (44-234)||(22612559-22612745)
chr1 (17-116)||(22657108-22657207)
chr1 (51-239)||(8727741-8727925)
chr1 (15-205)||(12014084-12014272)
chr1 (15-85)||(9917837-9917906)
chr1 (51-183)||(21881475-21881604)
chr1 (44-186)||(29096789-29096928)
chr1 (51-186)||(51997353-51997485)
chr1 (41-174)||(24301713-24301845)
chr1 (44-108)||(35930649-35930713)
chr1 (112-282)||(47667486-47667654)
chr1 (44-85)||(47667668-47667709)
chr1 (155-282)||(28145724-28145850)
chr1 (16-81)||(12006461-12006526)
chr1 (65-144)||(31236402-31236478)
chr1 (122-181)||(10852402-10852461)
chr1 (55-110)||(26923553-26923608)
chr1 (225-282)||(35132342-35132399)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-282)||(7322-7593)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (11-282)||(6655-6926)
scaffold0390 (11-282)||(13671-13942)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-282)||(18503-18773)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (11-282)||(25711-25982)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (11-282)||(21329969-21330240)
chr2 (11-282)||(18796721-18796992)
chr2 (15-274)||(18620023-18620281)
chr2 (12-274)||(20978091-20978351)
chr2 (25-282)||(36270395-36270649)
chr2 (11-282)||(22183207-22183475)
chr2 (44-282)||(30174444-30174678)
chr2 (39-269)||(6991847-6992076)
chr2 (44-282)||(24250033-24250267)
chr2 (15-271)||(18822302-18822556)
chr2 (44-186)||(15342098-15342237)
chr2 (44-282)||(24229216-24229450)
chr2 (16-108)||(19279508-19279600)
chr2 (51-241)||(29800545-29800731)
chr2 (120-254)||(17241034-17241167)
chr2 (51-186)||(19616509-19616641)
chr2 (51-185)||(40301034-40301164)
chr2 (15-85)||(18851977-18852047)
chr2 (51-186)||(21626824-21626955)
chr2 (53-261)||(41316302-41316506)
chr2 (122-186)||(28740922-28740986)
chr2 (47-110)||(28718943-28719006)
chr2 (216-278)||(41661694-41661756)
chr2 (136-216)||(36799745-36799826)
chr2 (11-85)||(36801899-36801974)
chr2 (44-85)||(24763751-24763792)
chr2 (44-85)||(28741220-28741261)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (11-264)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (27-282)||(230112-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (11-282)||(5744-6008)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (44-282)||(250-484)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (44-271)||(12961-13184)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (44-282)||(3676-3910)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-282)||(119797-120031)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-282)||(67375-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (44-239)||(130268-130459)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (44-186)||(8372-8511)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-186)||(26609-26748)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (53-255)||(8807-9005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-186)||(40084-40223)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (93-282)||(102-287)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (51-186)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (51-282)||(11527-11758)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (25-85)||(90033-90093)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (63-161)||(11328-11423)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (44-142)||(53832-53927)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2042
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2313 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 2214  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2213 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 2114  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2113 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 2042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 10933
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11204 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11105  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11104 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11005  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11004 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 10933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21940880 - 21941151
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21940880 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21940979  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940980 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21941079  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21941080 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 22171705 - 22171973
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22171705 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 22171804  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22171805 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 22171904  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22171905 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 22171973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6094338 - 6094609
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094338 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagta 6094437  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6094438 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6094537  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6094538 ctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 6094609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326684
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 15326684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507053
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 15507053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 24642864 - 24643134
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24642864 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagta 24642963  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24642964 aaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtg 24643062  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24643063 ttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 24643134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 282
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548533
Alignment:
Q  142 atagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  242 tgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 28548533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14983908 - 14983710
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  14983908 gatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaag 14983812  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||    
T  14983811 ttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactt 14983713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24797353 - 24797224
Alignment:
Q  38 gtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatat 137  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797353 gtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatat 24797254  T
Q  138 tctcatagtgatagtggtgtataccaccctt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24797253 tctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8371488 - 8371254
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8371488 acataggtataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 8371392  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  8371391 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 8371293  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  8371292 atgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 8371254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 12562190 - 12562424
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12562190 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 12562286  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  12562287 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 12562385  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12562386 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 12562424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 21969400 - 21969634
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  21969400 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 21969496  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  21969497 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21969595  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  21969596 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 21969634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 25611262 - 25611453
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  25611262 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcac 25611358  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| |  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  25611359 aatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 25611453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659495
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 22659495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27007752 - 27007518
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27007752 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27007656  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  27007655 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27007557  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  27007556 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 27007518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27014895 - 27014661
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27014895 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27014799  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  27014798 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27014700  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  27014699 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 27014661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27880722 - 27880488
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27880722 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27880626  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  27880625 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27880527  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  27880526 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 27880488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28020903 - 28020669
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28020903 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 28020807  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  28020806 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 28020708  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  28020707 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 28020669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22130844 - 22130610
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22130844 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22130748  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | |    
T  22130747 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 22130649  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22130648 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 22130610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38232365 - 38232115
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  38232365 gatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaag 38232268  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  38232267 ttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactt 38232169  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatggg 267  Q
    |||   | | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  38232168 tgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534274
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 45534412  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | |    
T  45534411 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 45534313  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  45534312 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 45534274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 21916744 - 21916977
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  21916744 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 21916840  T
Q  145 gtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatga 244  Q
     ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||    
T  21916841 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 21916939  T
Q  245 tgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | || ||||  ||| |||||||| |||  |||||||||    
T  21916940 taacaataactttggttgatgggcacttgatgaatcat 21916977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240785
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||  |  |||||| | | ||| ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| | |    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 26240785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781913
Alignment:
Q  52 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  152 tggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgat 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgtcattcaaacgttgtttgtaacatgat 8781913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 18835424 - 18835556
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18835424 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgata 18835520  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18835521 atggtgtatatcactcttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431187
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||  ||||||||| |||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 6431187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  176 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactcc 273  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375300
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535306
Alignment:
Q  121 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatg 20535306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962933
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  ||||||    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  141 catagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | | ||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| || | |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  241 atgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | ||| || |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcat 2962933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968016
Alignment:
Q  222 ttcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcat 8968016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 83
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 75  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 73  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 29327999 - 29328270
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29327999 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29328098  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29328099 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 29328198  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29328199 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcat 29328270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 15152658 - 15152926
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15152658 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15152757  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15152758 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15152857  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15152858 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11536054 - 11535783
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11536054 cacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11535955  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11535954 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11535855  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11535854 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 11535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11542972 - 11542701
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11542972 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11542873  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11542872 aatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtg 11542773  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11542772 atttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 11542701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 12751041 - 12751312
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12751041 cacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12751140  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12751141 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtg 12751240  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12751241 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcat 12751312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 12738751 - 12739022
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12738751 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12738850  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12738851 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtg 12738950  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12738951 ctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 12739022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18561222 - 18561484
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  18561222 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagta 18561321  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18561322 aaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtg 18561412  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  18561413 atttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcat 18561484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392636
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcat 13392636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18257834 - 18257577
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||     
T  18257834 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt- 18257736  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
     | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||    
T  18257735 -atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtg 18257638  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18257637 ctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtact 18257577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 2204619 - 2204853
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2204619 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 2204715  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  2204716 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 2204814  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  2204815 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 2204853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 8465066 - 8465300
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8465066 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 8465162  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  || | |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  8465163 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 8465261  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  8465262 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 8465300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 18400171 - 18400405
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18400171 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18400267  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18400268 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18400366  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  18400367 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 18400405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 18407155 - 18407389
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18407155 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18407251  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18407252 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18407350  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  18407351 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 18407389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48808731 - 48808497
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  48808731 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 48808635  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  48808634 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 48808536  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  48808535 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 48808497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15730052
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15729914  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15729915 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15730013  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15730014 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 15730052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139339
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18139477  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18139476 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18139378  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18139377 ataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 18139339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680969
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcat 41680969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 282
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365406
Alignment:
Q  43 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  143 tagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    | ||||| ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  242 tgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
       |||||||||||| | |||||| || ||| | |||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcat 2365406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Original strand, 30254205 - 30254428
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  30254205 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 30254301  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||  || ||| ||| |||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  30254302 aatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 30254400  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||    
T  30254401 ataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 19230955 - 19231189
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  19230955 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcac 19231051  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  19231052 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 19231150  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  19231151 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 19231189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128874
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  251 taaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 34128874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388762
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  149 tagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatg 19388762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10669137 - 10668902
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-a 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  10669137 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgc 10669041  T
Q  143 tagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacat 242  Q
     | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  || |  ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |     
T  10669040 aattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaag 10668942  T
Q  243 gatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||| |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  10668941 gataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 10668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     |  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393468
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |   | |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| |||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaa 19393468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845501
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  155 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845920
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  155 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443352
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||  | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  |||||| |    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  244 atgactataaagttg 258  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24443366 atgaccataacgttg 24443352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130862
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | | ||| | ||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||  || | |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcat 28130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190537
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgtat--gttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  158 ataccacccttcgacctgaaaccacta 184  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccacta 31190537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259125
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 18259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235451
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  135 tattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  235 cgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactc 272  Q
     |||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Original strand, 3587978 - 3588118
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||||||||   |  | ||||||||| || ||| ||||||||||||     
T  3587978 ataggtataaatgttaggggtaatattgatactggattgacccaacgtgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtttcaaaagatattctcac 3588076  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  3588077 aatgatagtgatgtata-cactcttagacctgaaaccactatg 3588118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  134 atattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  41 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  32 tatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 109  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169386
Alignment:
Q  95 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||||    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatg 15169386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 19859189 - 19859221
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttata 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859189 acatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 192
Target Start/End: Original strand, 29984308 - 29984371
Alignment:
Q  129 ataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  29984308 ataagatattctcatagtggaagtgatgcatatcacccttcaacttgaaaccaccatgtaccct 29984371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47833945 - 47833875
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  47833945 gatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttatatttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17684461 - 17684190
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17684461 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17684362  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17684361 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17684262  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17684261 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 17684190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27381244 - 27380973
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27381244 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27381145  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27381144 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27381045  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27381044 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 27380973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27471627 - 27471356
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471627 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27471528  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27471527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27471428  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27471427 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 27471356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 11651938 - 11652209
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11651938 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11652037  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11652038 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11652137  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11652138 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 11652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17691432 - 17691161
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17691432 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17691333  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17691332 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17691233  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17691232 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 17691161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 29309105 - 29309376
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29309105 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29309204  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  29309205 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtg 29309304  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29309305 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 29309376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 29316065 - 29316335
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29316065 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29316164  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29316165 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtg 29316263  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29316264 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 29316335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 188969 - 188698
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  188969 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 188870  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  188869 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 188770  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  188769 ctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcat 188698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297115
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 27297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394166
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 16394166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  42 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  142 atagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  242 tgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaat 279  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  61 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtata 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  161 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgat 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  261 tgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13359256 - 13359010
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  |    
T  13359256 atcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--t 13359161  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||    
T  13359160 tatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtatttt 13359062  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgg 266  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  13359061 gttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27508582 - 27508348
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27508582 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 27508486  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  27508485 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27508387  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  27508386 ataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 27508348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586109
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 1586247  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  1586246 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 1586148  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  1586147 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 1586109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 16789138 - 16789372
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  16789138 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 16789234  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  16789235 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 16789333  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  16789334 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 16789372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22860123 - 22859889
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22860123 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22860027  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  22860026 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22859928  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22859927 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 22859889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27528168 - 27527947
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27528168 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 27528072  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  27528071 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27527973  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggta 269  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||    
T  27527972 ataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18020076 - 18019937
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18020076 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18019980  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| ||||||||| |||||||    
T  18019979 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaatcactatg 18019937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736425
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  146 tgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatg 20736425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359076
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||| |    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  244 atgactataaagttg 258  Q
    || || || ||||||    
T  10359090 ataaccattaagttg 10359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669768
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||  || ||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||  || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactcc 273  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 14074547 - 14074781
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  14074547 acataggtataaatattgggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcac 14074643  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | |||||   |||||||   | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| | |    
T  14074644 aatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaagg 14074742  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  14074743 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 14074781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613220
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  141 catagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  241 atgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | ||| || ||||  ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcat 8613220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16566312 - 16566257
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566312 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17850484 - 17850321
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | | |||||||||||| |         
T  17850484 agatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacattgggtt- 17850386  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaacc 180  Q
     ||||| || || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17850385 -ttatgtaa-gtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 8510181 - 8510338
Alignment:
Q  54 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||| || || |||||||||||| |||    
T  8510181 aaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgtcattagttactctcatagtgatggtg 8510277  T
Q  154 gtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||| ||  ||  ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  8510278 gtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758577
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||| | | || ||||||||||||||| | | |||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgccataagatattctcacaattata 5758613  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  5758612 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 5758577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120506
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||| ||| ||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | | |    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcat 17120506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926103
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| ||  |||     
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactacacag--aaaa 27926069  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat 149  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  27926070 ttatgtaaa-tgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172859
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19218503 - 19218630
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||     | ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  19218503 tataaatattaggagtaaaatttatattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgata 19218594  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     || | ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  19218595 atgatatatactactcttagacctgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  144 agtgatagtggt 155  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Original strand, 4073652 - 4073781
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |   | ||||||||||||||| ||   |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||      
T  4073652 taaatattagaggtaatatttatatttgattgacctaccgtgagaatactacataatat--gttatgaaaatt--cataagatattctcataatgataac 4073747  T
Q  153 ggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | |||||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  4073748 gatgtataccaatcttagacctaaaaccactatg 4073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  142 atagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtc 205  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317166
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggta 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  270 ctccatgaatcat 282  Q
    ||  |||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcat 33317166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  127 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  227 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgg 266  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24695458 - 24695187
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24695458 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 24695359  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24695358 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 24695259  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24695258 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 24695187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19714490 - 19714219
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19714490 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19714391  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19714390 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19714291  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19714290 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcat 19714219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18569841 - 18569582
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569841 ataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 18569742  T
Q  123 agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18569741 agtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccat 18569642  T
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18569641 tcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcat 18569582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19707210 - 19706940
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19707210 cacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19707111  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19707110 aaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtg 19707012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707011 ctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 19706940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 39538803 - 39538947
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  39538803 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagta 39538902  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39538903 aaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggt 39538947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298622
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttg 215  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |  || | |||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcat 17298622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285471
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    ||||||||| | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| | | | ||| ||||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||| |||||||| ||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcat 17285471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347257
Alignment:
Q  109 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgag 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcat 27347257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701951
Alignment:
Q  176 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  276 gaatcat 282  Q
    |||||||    
T  24701957 gaatcat 24701951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18807021 - 18806850
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||    
T  18807021 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagt 18806924  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    | ||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806923 tttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941551
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 22941551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 20941094 - 20941328
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20941094 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20941190  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  20941191 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 20941289  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  20941290 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 20941328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25805620 - 25805386
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  25805620 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 25805524  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | |||  ||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  25805523 aatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25805425  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  25805424 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 25805386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 31966 - 32200
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31966 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 32062  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  32063 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 32161  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  32162 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 32200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12789898 - 12789664
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12789898 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 12789802  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||||  | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  12789801 aatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 12789703  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12789702 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 12789664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 23545989 - 23546223
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  23545989 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 23546085  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  23546086 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 23546184  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  23546185 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 23546223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933307
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24933445  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  24933444 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24933346  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  24933345 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 24933307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22547008 - 22546872
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |    
T  22547008 cacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacata--a 22546911  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546910 aaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 31096883 - 31097117
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31096883 acataggtataaattataggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 31096979  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  31096980 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 31097078  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  31097079 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 31097117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20100476 - 20100255
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatag 145  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  20100476 ataggtatcaatattaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaa 20100380  T
Q  146 tgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgat 245  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| | |||    
T  20100379 tgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggat 20100281  T
Q  246 gactataaagttgattgatgggtact 271  Q
     || |||| |||| ||||||||||||    
T  20100280 aaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764991
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  148 atagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  248 ctataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 12764991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811734
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  148 atagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  248 ctataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 9811734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703875
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  148 atagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  248 ctataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 12703875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806490
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  157 tataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806670
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  157 tataccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097940
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||  |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  251 taaagttgattgatgggtac 270  Q
    ||| |||  |||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtac 5097940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865431
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  141 catagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  241 atgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | ||| || ||||  ||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcat 7865431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18829519 - 18829282
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||    
T  18829519 catatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataagttattctcata 18829423  T
Q  145 gtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
     |||| |||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||  ||  ||| |||    
T  18829422 atgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtcatctataaaatg 18829324  T
Q  244 atgactataaagttg---attgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  18829323 atgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcat 18829282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129789
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagtat--gttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatg 26129789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719476
Alignment:
Q  198 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcat 28719476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245308
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | || || | ||||||| | | ||| |||||||||||| ||||    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatg 26245308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 282
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539034
Alignment:
Q  202 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || | ||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcat 39539034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  54 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |    ||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagtat--gttatgaa--gtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27347470 - 27347425
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaa 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  27347470 cacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18262427 - 18262698
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18262427 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18262526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18262527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18262626  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18262627 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 18262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18269288 - 18269559
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18269288 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18269387  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18269388 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18269487  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18269488 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 18269559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 55612898 - 55613169
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55612898 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 55612997  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55612998 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 55613097  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55613098 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 55613169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 8858382 - 8858653
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8858382 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8858481  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8858482 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8858581  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8858582 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 8858653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 26963855 - 26964126
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26963855 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26963954  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963955 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26964054  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26964055 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 26964126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 26970678 - 26970949
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26970678 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26970777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26970778 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26970877  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26970878 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 26970949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 868812 - 869083
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  868812 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 868911  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868912 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 869011  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  869012 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 869083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19926752 - 19926481
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19926752 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19926653  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19926652 aaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19926553  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19926552 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 19926481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 5707535 - 5707806
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5707535 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5707634  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5707635 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5707734  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5707735 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 5707806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 5714163 - 5714434
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5714163 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5714262  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5714263 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5714362  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5714363 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 5714434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10621325 - 10621054
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10621325 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10621226  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621225 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10621126  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10621125 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 10621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10628404 - 10628133
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10628404 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10628305  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628304 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10628205  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10628204 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 10628133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28393126 - 28392855
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28393126 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 28393027  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28393026 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 28392927  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28392926 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcat 28392855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 8845418 - 8845689
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8845418 cacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8845517  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845518 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8845617  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8845618 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcat 8845689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4426596 - 4426337
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4426596 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 4426497  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||  ||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4426496 aaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 4426409  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4426408 ctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 4426337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5668115 - 5667850
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5668115 gatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaag 5668016  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5668015 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgcttt 5667918  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5667917 gtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcat 5667850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 35223779 - 35224046
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  35223779 gatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaag 35223878  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35223879 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgcttt 35223978  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  35223979 atcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcat 35224046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677308
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  251 taaagttgattgatgggtactccatgaa 278  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10677308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890948
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  251 taaagttgattgatgggtactccatgaa 278  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaa 10890948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 20311511 - 20311776
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||    
T  20311511 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acag 20311608  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    |||||  || | |||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  20311609 ttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactt 20311707  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| | || || ||||||||| |||||||    
T  20311708 tgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcat 20311776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 15461564 - 15461798
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15461564 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15461660  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15461661 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15461759  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15461760 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 15461798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 34975618 - 34975852
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  34975618 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 34975714  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  34975715 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 34975813  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  34975814 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 34975852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  32 tatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccac 182  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 2677080 - 2677314
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2677080 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 2677176  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  2677177 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 2677275  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  2677276 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 2677314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3369258 - 3369024
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3369258 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 3369162  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  3369161 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 3369063  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  3369062 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 3369024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 15815088 - 15815322
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15815088 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15815184  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15815185 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15815283  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  15815284 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 15815322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18111278 - 18111044
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18111278 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18111182  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18111181 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18111083  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  18111082 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 18111044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17300194 - 17299960
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  17300194 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 17300098  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  17300097 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 17299999  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||| | |||  |||||||||    
T  17299998 ataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatcat 17299960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365792
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  143 tagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacat 242  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||     
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  243 gatgactataa 253  Q
    |||||| ||||    
T  19365782 gatgaccataa 19365792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244238
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20244100  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20244101 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20244199  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  20244200 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 20244238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531914
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26531776  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  26531777 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 26531875  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  26531876 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 26531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942025
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| | |    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 1942025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4675984
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 4676122  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| | |    
T  4676121 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaagg 4676023  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  4676022 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 4675984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 18163229 - 18163463
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18163229 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18163325  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18163326 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18163424  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18163425 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 18163463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362616
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatg 19362616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  145 gtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaacca 181  Q
     ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 5870485 - 5870624
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||     
T  5870485 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcac 5870581  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  5870582 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 5870624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487757
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 9487757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  251 taaagttgattgatggg 267  Q
    ||| |||| || |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 56516271 - 56516368
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516271 cacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||  |||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||| |    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  244 atgactataaagttgattgatggg 267  Q
    || || |||| |||| || |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040556
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatacc 162  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  163 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||    
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgt 30040556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     ||| || | |||  ||| ||||| ||||||| |||  || |||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  9538130 atggcgtgt-ccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  251 taaagttgattgatggg 267  Q
    ||| |||| || |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646536
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||  ||| |    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaagg 32646692  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| | |  |||| | || |||| | ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| || |||    
T  32646691 ttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactt 32646593  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtac 270  Q
    |||   | | |||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  32646592 tgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtac 32646536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546286
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| ||||| |||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatg 4546286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421213
Alignment:
Q  66 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacc 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||| |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  166 cttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatg 11421213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  32 tatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||| ||  ||||| ||||| ||||| | |   ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatatttat---gaattgacccaccatgataataccacataatgat--ttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  123 agtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 24700245 - 24700291
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaata 58  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24700245 acagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  155 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtc 205  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 6110279 - 6110550
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6110279 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6110378  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6110379 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6110478  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6110479 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 6110550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 8490710 - 8490981
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8490710 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8490809  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8490810 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8490909  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8490910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 8490981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15342211 - 15341940
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342211 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 15342112  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15342111 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15342012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15342011 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 15341940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16482475 - 16482204
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16482475 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16482376  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16482375 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16482276  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16482275 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 16482204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10579347 - 10579076
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10579347 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 10579248  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10579247 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10579148  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10579147 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 10579076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15357578 - 15357307
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15357578 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagta 15357479  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15357478 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15357379  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15357378 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 15357307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15600876 - 15600605
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15600876 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15600777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15600776 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15600677  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15600676 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcat 15600605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15607421 - 15607150
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15607421 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15607322  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15607321 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15607222  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15607221 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcat 15607150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10572584 - 10572313
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10572584 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10572485  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10572484 aaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtg 10572385  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10572384 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 10572313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 18522878 - 18523146
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18522878 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagta 18522977  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18522978 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18523077  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18523078 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18520190 - 18520461
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18520190 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagta 18520289  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18520290 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18520389  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18520390 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 18520461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13211517 - 13211788
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13211517 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagta 13211616  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13211617 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13211716  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13211717 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 13211788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13248822 - 13249093
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  13248822 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagta 13248921  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13248922 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13249021  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13249022 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 13249093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17781110 - 17780839
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17781110 cacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17781011  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17781010 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17780911  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17780910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 17780839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32056892 - 32056620
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32056892 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 32056793  T
Q  110 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056792 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 32056693  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32056692 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcat 32056620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 13517026 - 13517293
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13517026 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagta 13517125  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13517126 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13517221  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13517222 ctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcat 13517293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17200176 - 17199905
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17200176 cacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagta 17200077  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17200076 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtg 17199977  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17199976 ttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 17199905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1647513 - 1647242
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  1647513 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataata 1647414  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1647413 aaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtg 1647314  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1647313 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcat 1647242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 17136574 - 17136839
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17136574 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 17136667  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17136668 aaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17136767  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17136768 cttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcat 17136839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 29925189 - 29925457
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  29925189 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29925288  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29925289 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29925388  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  29925389 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcat 29925457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 29974342 - 29974610
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  29974342 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29974441  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29974442 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29974541  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  29974542 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcat 29974610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 282
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200916
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc 211  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcat 16200916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 21034305 - 21034539
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  21034305 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 21034401  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  21034402 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21034500  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  21034501 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 21034539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15846771 - 15846537
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15846771 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15846675  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15846674 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15846576  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15846575 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 15846537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20147789 - 20147555
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20147789 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20147693  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20147692 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20147594  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  20147593 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 20147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 21398859 - 21399093
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  21398859 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattcttac 21398955  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  21398956 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21399054  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  21399055 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 21399093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427322
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 55427184  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  55427185 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 55427283  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  55427284 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 55427322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300211
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  145 gtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatga 244  Q
     ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  245 tgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 12300211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 14890458 - 14890692
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  14890458 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 14890554  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  ||||||   | ||| ||||||||| |||| ||  | || |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  14890555 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 14890653  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  14890654 ataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 14890692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978729
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 25978729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527013
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||   | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || |  ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaaca 15527013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 14147095 - 14147226
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  14147095 tataaatattaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgata 14147191  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactat 185  Q
      |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14147192 aaggtgtatatcactcttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24253372 - 24253179
Alignment:
Q  19 atggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||    
T  24253372 atggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat 24253275  T
Q  119 gaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
       |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||| ||||||    
T  24253274 -ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgt 24253179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280444
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| ||||||||   |||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagt--gagtc 32280410  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgata 32280444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088407
Alignment:
Q  98 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatg 197  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  198 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     |||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  28088324 -tggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcat 28088407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787793
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||| ||||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatg 11787793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317269
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| | ||||| | | | ||| |||||||||||||||||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatg 15317269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464255
Alignment:
Q  130 taagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  230 ttgtccgtaa 239  Q
    ||||| ||||    
T  30464246 ttgtctgtaa 30464255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 164
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189329
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 154  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata--aaatattatg-aaggtgtcataaaatattctcatattgattatgg 4189319  T
Q  155 tgtataccac 164  Q
    | ||||||||    
T  4189320 tttataccac 4189329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Original strand, 36142816 - 36142880
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  36142816 aagtgccataagatatttccaaagtgataatgatgtatgtcacccttcaacctgaaaccactatg 36142880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18252245 - 18252516
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18252245 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18252344  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18252345 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18252444  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18252445 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 18252516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18532506 - 18532235
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18532506 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18532407  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18532406 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18532307  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18532306 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 18532235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27131401 - 27131131
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27131401 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27131302  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27131301 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtg 27131203  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27131202 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 27131131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27310569 - 27310298
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310569 cacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27310470  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27310469 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27310370  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27310369 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 27310298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16359027 - 16358756
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359027 cacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16358928  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16358927 aaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16358828  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16358827 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcat 16358756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3855911 - 3855640
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3855911 cacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagta 3855812  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  3855811 aaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcg 3855712  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3855711 ctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcat 3855640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36816625 - 36816363
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  36816625 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 36816526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36816525 aaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcg 36816427  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactcca 274  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36816426 ttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactcca 36816363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641595
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcat 22641595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27277545 - 27277279
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||    
T  27277545 gatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaag 27277446  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27277445 tcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 27277347  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27277346 atcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcat 27277279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21171225 - 21171081
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21171225 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21171126  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171125 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916498
Alignment:
Q  90 tcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 187  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  188 accctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||  || ||| || ||||| |||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcat 9916498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19706674 - 19706440
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  19706674 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 19706578  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  19706577 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 19706479  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  19706478 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 19706440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28134958 - 28134724
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28134958 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 28134862  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  28134861 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 28134763  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  28134762 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 28134724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43802600 - 43802366
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  43802600 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 43802504  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  43802503 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 43802405  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  43802404 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 43802366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 9456183 - 9456417
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  9456183 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 9456279  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  9456280 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 9456378  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  9456379 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 9456417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20391474 - 20391240
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||     
T  20391474 acatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcac 20391378  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||||| | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20391377 aatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20391279  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  20391278 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 20391240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20779880 - 20779646
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20779880 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20779784  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20779783 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20779685  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  20779684 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 20779646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22670492 - 22670258
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22670492 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22670396  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  22670395 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22670297  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  22670296 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 22670258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42817224 - 42816990
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  42817224 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 42817128  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  42817127 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 42817029  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  42817028 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 42816990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507384
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| ||||| ||  || |    
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacg 23507216  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    || || |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||| |||    
T  23507217 ttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcat 23507384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634192
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 634192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 22612559 - 22612745
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22612559 acatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22612655  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 234  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22612656 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtc 22612745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22657207 - 22657108
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657207 tcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727925
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
       ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 8727925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12014272 - 12014084
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  12014272 gatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaat 12014173  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtc 205  Q
     | | ||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  12014172 atgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096928
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatagcat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatg 29096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     || | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24301845 - 24301713
Alignment:
Q  41 ttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattc 139  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | || ||| |||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||||||| ||||    
T  24301845 ttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatcataagacattc 24301748  T
Q  140 tcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacct 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24301747 tcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacct 24301713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47667654 - 47667486
Alignment:
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc 211  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||||    
T  47667654 aagttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgc 47667557  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  47667556 tttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 47667486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47667709 - 47667668
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47667709 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattga 47667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28145850 - 28145724
Alignment:
Q  155 tgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  ||||     
T  28145850 tgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataac 28145752  T
Q  255 gttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  28145751 gttggttgatgggtacttgatgaatcat 28145724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006461
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 81  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  65 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaacca 181  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 35132342 - 35132399
Alignment:
Q  225 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  35132342 aaacgttgtccataacatgataattataaagttgtttgatatgtacttcatgaatcat 35132399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7593
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7322 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 7421  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7422 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 7521  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7522 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 7593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6655
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6926 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6827  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6826 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6727  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 6655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13671
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13942 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 13843  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13842 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13743  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13742 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcat 13671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18773
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18503 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18602  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18603 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18702  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18703 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcat 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25982 - 25711
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25982 cacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 25883  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25882 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 25783  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25782 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcat 25711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21330240 - 21329969
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21330240 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21330141  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21330140 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21330041  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  21330040 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcat 21329969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 18796721 - 18796992
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18796721 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagta 18796820  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18796821 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtg 18796920  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18796921 ctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcat 18796992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Original strand, 18620023 - 18620281
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18620023 gatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaag 18620122  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18620123 ttatgaaa-gtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgcttt 18620221  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactcca 274  Q
     |||||||||| |   |||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18620222 atcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactcca 18620281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978351
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactcca 274  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactcca 20978351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 36270395 - 36270649
Alignment:
Q  25 aaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaag 124  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||    
T  36270395 aaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag 36270492  T
Q  125 tgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 223  Q
     |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||  || |     
T  36270493 -gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtat-tcacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgta 36270590  T
Q  224 caaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||| || || ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  36270591 caaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcat 36270649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22183475 - 22183207
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||       
T  22183475 cacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--t 22183379  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    || |||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22183378 aatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagt 22183280  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     ||||||     | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22183279 actttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcat 22183207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 30174444 - 30174678
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  30174444 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 30174540  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  30174541 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 30174639  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  30174640 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 30174678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6992076 - 6991847
Alignment:
Q  39 tcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatatt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| |||||  ||||| |||||  ||||    
T  6992076 tcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattatg-taagtgacataaactatt 6991980  T
Q  139 ctcatagtgat-agtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccg 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||      
T  6991979 ctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtcta 6991880  T
Q  237 taacatgatgactataaagttgattgatgggta 269  Q
    | ||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6991879 tgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24250267 - 24250033
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24250267 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24250171  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  24250170 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24250072  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  24250071 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 24250033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 18822302 - 18822556
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |    
T  18822302 gatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacg 18822399  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  18822400 ttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtactt 18822498  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    | |   |||  ||||||  |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  18822499 ttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342098
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatg 15342098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24229450 - 24229216
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24229450 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24229354  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| | | |||||||||||||  |||| |||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  24229353 aatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 24229255  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  24229254 ataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatcat 24229216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800731
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| ||||||    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaaca 29800731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 254
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241167
Alignment:
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    |  |||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaa 17241167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616641
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagtatt--ttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 19616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactat 185  Q
     || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18852047 - 18851977
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18852047 gatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||   ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | |||| ||||||  || ||||||||| |||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316302
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  153 ggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactata 252  Q
    || | ||||||  ||| |||||||| ||||||||  |||| |||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  253 aagttgatt 261  Q
    |||||||||    
T  41316310 aagttgatt 41316302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740922
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatg 28740922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  47 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 278
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661756
Alignment:
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaa 278  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaa 41661756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  136 attctcatagtgata-gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36801974 - 36801899
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacataga-tataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  36801974 cacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1461
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1208 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagta 1307  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1308 aaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 1407  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  1408 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230112
Alignment:
Q  27 agagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  127 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  227 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcat 230112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 5744 - 6008
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5744 cacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagta 5843  T
Q  111 aaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatacca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| || ||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5844 aaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaag 5934  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5935 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcat 6008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 250 - 484
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  250 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 346  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  347 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 445  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || |  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  446 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtact 271  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3676
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3910 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 3814  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  3813 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 3715  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  3714 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 119797 - 120031
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  119797 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 119893  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  119894 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 119992  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| |||||||| |||  |||||||||    
T  119993 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcat 120031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67375
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  244 atgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    || || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 67375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 130459 - 130268
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  130459 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 130363  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  130362 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 8372 - 8511
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8372 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 8468  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  8469 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatg 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26748
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 26748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  153 ggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactata 252  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||  || |  ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40223 - 40084
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40223 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 40127  T
Q  144 agtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||||| |||||||||  || ||| ||| |||||||||||||    
T  40126 agtgataatggtgtatataactcttagacttgaaaccactatg 40084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 282
Target Start/End: Original strand, 102 - 287
Alignment:
Q  93 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  193 ggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
     |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  151 gtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     |||||||  |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11527
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  148 atagtggtgtataccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    |||   ||||| | | | ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  248 ctataaagttgattgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcat 11527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 90093 - 90033
Alignment:
Q  25 aaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  90093 aaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtataacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11423
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatac 161  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||  |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtatac 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 53832 - 53927
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctca 53927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University