View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1314_low_98 (Length: 310)

Name: NF1314_low_98
Description: NF1314
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1314_low_98
NF1314_low_98
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (11-283)||(2041-2313)
scaffold0234 (11-283)||(10932-11204)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (11-283)||(11651938-11652210)
chr6 (11-283)||(17684189-17684461)
chr6 (11-283)||(27380972-27381244)
chr6 (11-283)||(27471355-27471627)
chr6 (11-283)||(17691160-17691432)
chr6 (11-283)||(29309105-29309377)
chr6 (11-283)||(29316065-29316336)
chr6 (44-283)||(27296877-27297116)
chr6 (11-283)||(188697-188969)
chr6 (11-283)||(16394165-16394437)
chr6 (42-279)||(25536915-25537152)
chr6 (61-282)||(16559193-16559414)
chr6 (16-266)||(13359010-13359256)
chr6 (44-283)||(27508347-27508582)
chr6 (44-283)||(1586108-1586343)
chr6 (44-283)||(16789138-16789373)
chr6 (44-283)||(22859888-22860123)
chr6 (44-269)||(27527947-27528168)
chr6 (16-273)||(2669513-2669768)
chr6 (44-142)||(18019981-18020076)
chr6 (44-261)||(10359073-10359285)
chr6 (44-283)||(14074547-14074782)
chr6 (11-66)||(16566257-16566312)
chr6 (44-283)||(8612982-8613221)
chr6 (46-142)||(20736469-20736562)
chr6 (44-186)||(21994655-21994794)
chr6 (12-99)||(28172772-28172859)
chr6 (15-105)||(27925973-27926062)
chr6 (54-214)||(8510181-8510338)
chr6 (170-283)||(33317055-33317167)
chr6 (14-106)||(17850392-17850484)
chr6 (51-186)||(19218503-19218630)
chr6 (44-155)||(22560311-22560419)
chr6 (51-110)||(5758650-5758709)
chr6 (150-205)||(28172908-28172963)
chr6 (11-111)||(19347092-19347191)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (11-283)||(24695186-24695458)
chr5 (11-283)||(19714218-19714490)
chr5 (23-283)||(18569581-18569841)
chr5 (11-283)||(19706939-19707210)
chr5 (11-161)||(39538803-39538953)
chr5 (17-283)||(17298621-17298885)
chr5 (11-283)||(17285470-17285740)
chr5 (109-287)||(27347252-27347428)
chr5 (176-283)||(24701950-24702057)
chr5 (16-189)||(18806850-18807021)
chr5 (44-283)||(22941317-22941552)
chr5 (44-283)||(20941094-20941329)
chr5 (44-283)||(25805385-25805620)
chr5 (44-283)||(31966-32201)
chr5 (44-283)||(12789663-12789898)
chr5 (44-283)||(23545989-23546224)
chr5 (11-150)||(22546872-22547008)
chr5 (44-283)||(24933306-24933541)
chr5 (44-283)||(31096883-31097118)
chr5 (46-271)||(20100255-20100476)
chr5 (51-283)||(12764990-12765222)
chr5 (51-283)||(9811733-9811965)
chr5 (51-283)||(12703874-12704106)
chr5 (51-283)||(5097725-5097953)
chr5 (44-283)||(7865430-7865669)
chr5 (58-189)||(18806490-18806619)
chr5 (58-189)||(18806670-18806799)
chr5 (198-287)||(28719471-28719558)
chr5 (45-189)||(18829377-18829519)
chr5 (44-287)||(26129689-26129928)
chr5 (202-283)||(39538954-39539035)
chr5 (44-283)||(26245169-26245404)
chr5 (11-56)||(27347425-27347470)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (11-283)||(18262427-18262699)
chr4 (11-283)||(18269288-18269560)
chr4 (11-283)||(55612898-55613170)
chr4 (11-283)||(8858382-8858654)
chr4 (11-283)||(26963855-26964127)
chr4 (11-283)||(26970678-26970950)
chr4 (11-283)||(868812-869084)
chr4 (11-283)||(19926480-19926752)
chr4 (11-283)||(5707535-5707807)
chr4 (11-283)||(5714163-5714435)
chr4 (11-283)||(10621053-10621325)
chr4 (11-283)||(10628132-10628404)
chr4 (11-283)||(28392854-28393126)
chr4 (11-283)||(8845418-8845690)
chr4 (11-283)||(4426336-4426596)
chr4 (15-283)||(5667849-5668115)
chr4 (15-283)||(35223779-35224047)
chr4 (51-283)||(10677303-10677534)
chr4 (51-283)||(10890943-10891174)
chr4 (15-287)||(20311511-20311781)
chr4 (44-283)||(15461564-15461799)
chr4 (44-283)||(34975618-34975853)
chr4 (44-283)||(2677080-2677315)
chr4 (44-283)||(3369023-3369258)
chr4 (44-283)||(15815088-15815323)
chr4 (44-283)||(18111043-18111278)
chr4 (32-182)||(21453961-21454110)
chr4 (44-283)||(17299959-17300194)
chr4 (44-283)||(20244004-20244239)
chr4 (44-283)||(26531680-26531915)
chr4 (44-267)||(19365586-19365806)
chr4 (44-283)||(1941791-1942026)
chr4 (44-283)||(4675983-4676218)
chr4 (44-283)||(18163229-18163464)
chr4 (44-283)||(5870485-5870720)
chr4 (44-186)||(19362477-19362616)
chr4 (51-283)||(9487625-9487853)
chr4 (45-181)||(32636552-32636685)
chr4 (11-108)||(56516271-56516368)
chr4 (15-283)||(32646523-32646789)
chr4 (51-267)||(9538033-9538244)
chr4 (44-267)||(5528495-5528714)
chr4 (51-267)||(5616469-5616681)
chr4 (63-283)||(30040489-30040705)
chr4 (44-142)||(4546147-4546242)
chr4 (53-144)||(9937830-9937923)
chr4 (157-205)||(24701363-24701411)
chr4 (23-138)||(34777862-34777975)
chr4 (66-283)||(11421096-11421309)
chr4 (12-58)||(24700245-24700291)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (11-283)||(6110279-6110551)
chr3 (11-283)||(8490710-8490982)
chr3 (11-283)||(15341939-15342211)
chr3 (11-283)||(16482203-16482475)
chr3 (11-283)||(10579075-10579347)
chr3 (11-283)||(15357306-15357578)
chr3 (11-283)||(15600604-15600876)
chr3 (11-283)||(15607149-15607421)
chr3 (11-283)||(10572312-10572584)
chr3 (11-283)||(18520190-18520462)
chr3 (11-279)||(18522878-18523146)
chr3 (11-283)||(13211517-13211789)
chr3 (11-283)||(13248822-13249094)
chr3 (11-283)||(17780838-17781110)
chr3 (11-283)||(32056619-32056892)
chr3 (11-287)||(17199900-17200176)
chr3 (11-283)||(13517026-13517294)
chr3 (11-283)||(1647241-1647513)
chr3 (11-283)||(17136574-17136840)
chr3 (14-283)||(29925189-29925458)
chr3 (14-283)||(29974342-29974611)
chr3 (12-283)||(16200646-16200917)
chr3 (44-283)||(21034305-21034540)
chr3 (44-283)||(15846536-15846771)
chr3 (44-283)||(20147554-20147789)
chr3 (44-283)||(21398859-21399094)
chr3 (44-283)||(55427088-55427323)
chr3 (45-283)||(12299978-12300212)
chr3 (44-283)||(14890458-14890693)
chr3 (44-283)||(25978728-25978963)
chr3 (51-242)||(15526827-15527014)
chr3 (19-265)||(24253130-24253372)
chr3 (17-209)||(32280313-32280507)
chr3 (51-185)||(14147095-14147226)
chr3 (15-144)||(28953965-28954093)
chr3 (98-283)||(28088227-28088408)
chr3 (44-283)||(11787654-11787889)
chr3 (44-283)||(15317176-15317408)
chr3 (130-239)||(30464147-30464255)
chr3 (55-149)||(4189223-4189314)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (11-283)||(18252245-18252517)
chr1 (11-283)||(18532234-18532506)
chr1 (11-283)||(27131130-27131401)
chr1 (11-283)||(27310297-27310569)
chr1 (11-283)||(16358755-16359027)
chr1 (11-283)||(3855639-3855911)
chr1 (11-283)||(36816354-36816625)
chr1 (14-283)||(22641594-22641859)
chr1 (15-283)||(27277278-27277545)
chr1 (11-155)||(21171081-21171225)
chr1 (90-283)||(9916497-9916689)
chr1 (44-283)||(19706439-19706674)
chr1 (44-283)||(28134723-28134958)
chr1 (44-283)||(43802365-43802600)
chr1 (44-283)||(9456183-9456418)
chr1 (44-283)||(20391239-20391474)
chr1 (44-283)||(20779645-20779880)
chr1 (44-283)||(22670257-22670492)
chr1 (44-283)||(42816989-42817224)
chr1 (17-116)||(22657108-22657207)
chr1 (15-283)||(23507119-23507385)
chr1 (44-263)||(634001-634216)
chr1 (44-283)||(22612559-22612794)
chr1 (15-85)||(9917837-9917906)
chr1 (15-108)||(12014179-12014272)
chr1 (51-283)||(8727741-8727969)
chr1 (51-186)||(51997353-51997485)
chr1 (44-186)||(29096789-29096928)
chr1 (51-183)||(21881475-21881604)
chr1 (44-108)||(35930649-35930713)
chr1 (170-283)||(28145723-28145835)
chr1 (44-85)||(47667668-47667709)
chr1 (112-283)||(47667485-47667654)
chr1 (16-81)||(12006461-12006526)
chr1 (65-144)||(31236402-31236478)
chr1 (55-110)||(26923553-26923608)
chr1 (136-216)||(12006332-12006413)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (11-282)||(21940880-21941151)
chr8 (14-283)||(22171705-22171974)
chr8 (11-283)||(6094338-6094610)
chr8 (20-283)||(15326422-15326685)
chr8 (20-283)||(15506791-15507054)
chr8 (11-283)||(24642864-24643135)
chr8 (146-283)||(28548397-28548534)
chr8 (15-216)||(14983710-14983908)
chr8 (38-168)||(24797224-24797353)
chr8 (44-283)||(8371253-8371488)
chr8 (44-283)||(12562190-12562425)
chr8 (44-283)||(21969400-21969635)
chr8 (44-283)||(22659494-22659729)
chr8 (44-283)||(25611262-25611497)
chr8 (44-283)||(27007517-27007752)
chr8 (44-283)||(27014660-27014895)
chr8 (44-283)||(27880487-27880722)
chr8 (44-283)||(28020668-28020903)
chr8 (44-283)||(22130609-22130844)
chr8 (15-267)||(38232115-38232365)
chr8 (44-283)||(45534273-45534508)
chr8 (45-283)||(21916744-21916978)
chr8 (44-283)||(26240551-26240786)
chr8 (44-283)||(6430953-6431188)
chr8 (52-186)||(8781971-8782102)
chr8 (51-186)||(18835424-18835556)
chr8 (11-103)||(32872741-32872833)
chr8 (176-273)||(24796731-24796826)
chr8 (16-85)||(2375231-2375300)
chr8 (170-288)||(36970439-36970556)
chr8 (44-283)||(2962932-2963171)
chr8 (121-267)||(20535226-20535371)
chr8 (44-83)||(36970332-36970371)
chr8 (170-287)||(2375411-2375528)
chr8 (23-75)||(10920427-10920479)
chr8 (17-73)||(29645575-29645631)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-283)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (11-283)||(6654-6926)
scaffold0390 (11-283)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (11-287)||(25706-25982)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (11-279)||(15152658-15152926)
chr7 (11-283)||(29327999-29328271)
chr7 (11-283)||(11535782-11536054)
chr7 (11-283)||(11542700-11542972)
chr7 (11-283)||(12751041-12751313)
chr7 (11-283)||(12738751-12739023)
chr7 (11-283)||(18561222-18561485)
chr7 (15-283)||(13392369-13392637)
chr7 (11-289)||(18257559-18257834)
chr7 (43-283)||(2365169-2365407)
chr7 (44-283)||(2204619-2204854)
chr7 (44-283)||(8465066-8465301)
chr7 (44-283)||(18400171-18400406)
chr7 (44-283)||(18407155-18407390)
chr7 (44-283)||(48808496-48808731)
chr7 (44-283)||(15729818-15730053)
chr7 (44-283)||(18139338-18139573)
chr7 (44-283)||(41680968-41681203)
chr7 (44-283)||(19230955-19231190)
chr7 (44-271)||(30254205-30254428)
chr7 (51-283)||(34128647-34128875)
chr7 (44-271)||(47166871-47167094)
chr7 (44-283)||(10668901-10669137)
chr7 (44-283)||(28130628-28130863)
chr7 (51-186)||(19388626-19388762)
chr7 (51-186)||(14591924-14592056)
chr7 (51-186)||(16011515-16011647)
chr7 (44-283)||(18259124-18259359)
chr7 (44-239)||(19393468-19393659)
chr7 (55-261)||(25845498-25845700)
chr7 (55-261)||(25845917-25846119)
chr7 (44-261)||(24443349-24443562)
chr7 (51-183)||(22969024-22969153)
chr7 (135-272)||(39112138-39112275)
chr7 (58-184)||(31190537-31190660)
chr7 (11-85)||(10235377-10235451)
chr7 (16-99)||(7662569-7662651)
chr7 (41-99)||(7396469-7396527)
chr7 (32-109)||(3132910-3132986)
chr7 (44-76)||(19859189-19859221)
chr7 (15-85)||(47833875-47833945)
chr7 (95-283)||(15169290-15169474)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-283)||(18503-18774)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (11-283)||(21329968-21330240)
chr2 (11-283)||(18796721-18796993)
chr2 (15-289)||(18620023-18620296)
chr2 (12-283)||(20978091-20978360)
chr2 (25-283)||(36270395-36270650)
chr2 (44-283)||(30174444-30174679)
chr2 (15-271)||(18822302-18822556)
chr2 (11-283)||(22183206-22183475)
chr2 (39-269)||(6991847-6992076)
chr2 (44-283)||(24250032-24250267)
chr2 (44-271)||(15342014-15342237)
chr2 (44-283)||(24229215-24229450)
chr2 (16-108)||(19279508-19279600)
chr2 (51-285)||(29800545-29800775)
chr2 (15-85)||(18851977-18852047)
chr2 (120-233)||(17241034-17241146)
chr2 (51-186)||(19616509-19616641)
chr2 (51-185)||(40301034-40301164)
chr2 (47-110)||(28718943-28719006)
chr2 (216-283)||(41661694-41661761)
chr2 (53-150)||(41316412-41316506)
chr2 (11-85)||(36801899-36801974)
chr2 (44-85)||(24763751-24763792)
chr2 (44-85)||(28741220-28741261)
chr2 (136-216)||(36799745-36799826)
chr2 (122-186)||(28740922-28740986)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (11-264)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (27-283)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (11-287)||(5744-6013)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (44-283)||(250-485)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (44-271)||(12961-13184)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (44-283)||(3675-3910)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-283)||(119797-120032)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-283)||(67374-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (44-239)||(130268-130459)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-283)||(26609-26844)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (44-142)||(8372-8467)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-283)||(39988-40223)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (93-283)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (53-182)||(8807-8933)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (51-186)||(83111-83243)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (51-283)||(11526-11758)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (44-283)||(53832-54066)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (25-85)||(90033-90093)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2041
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2313 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 2214  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2213 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 2114  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 10932
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11204 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11105  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11104 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11005  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 11651938 - 11652210
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11651938 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11652037  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11652038 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11652137  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652138 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17684461 - 17684189
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17684461 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17684362  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17684361 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17684262  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684261 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27381244 - 27380972
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27381244 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27381145  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27381144 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27381045  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381044 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27471627 - 27471355
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471627 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27471528  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27471527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27471428  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471427 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17691432 - 17691160
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17691432 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17691333  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17691332 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17691233  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691232 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29309105 - 29309377
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29309105 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29309204  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  29309205 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtg 29309304  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309305 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29316065 - 29316336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29316065 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29316164  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29316165 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtg 29316263  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316264 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 188969 - 188697
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  188969 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 188870  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  188869 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 188770  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188769 ctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394165
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  42 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  142 atactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  242 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  61 aggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  161 ccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggt 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  261 tgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13359256 - 13359010
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   |  |||||  ||||||||| | |||  |    
T  13359256 atcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--t 13359161  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||    
T  13359160 tatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtatttt 13359062  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgg 266  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13359061 gttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27508582 - 27508347
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27508582 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 27508486  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27508485 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27508387  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27508386 ataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586108
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 1586247  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  1586246 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 1586148  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1586147 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 16789138 - 16789373
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  16789138 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 16789234  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  16789235 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 16789333  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16789334 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22860123 - 22859888
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22860123 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22860027  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22860026 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22859928  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22859927 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27528168 - 27527947
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27528168 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 27528072  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27528071 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27527973  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
     | |  |||| |||||||||||||||    
T  27527972 ataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669768
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatactga-tagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | |   |||| ||||||| |||||||||| |||  ||| || ||||||||  || ||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||  || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactcc 273  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18020076 - 18019981
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18020076 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || ||  | ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  244 gtgactataaagttggtt 261  Q
     | || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 14074547 - 14074782
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  14074547 acataggtataaatattgggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcac 14074643  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | |||||   || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| |||    
T  14074644 aatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaagg 14074742  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14074743 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16566312 - 16566257
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566312 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613221
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  141 catactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  241 agggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| | || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736469
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctca 20736469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994794
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaacgactatg 21994794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172859
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926062
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca 105  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 8510181 - 8510338
Alignment:
Q  54 aaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtg 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||||| || || ||||||| |||| |||    
T  8510181 aaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgtcattagttactctcatagtgatggtg 8510277  T
Q  154 gtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||  ||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  8510278 gtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  270 ctccatgaatcatg 283  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17850484 - 17850392
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacat 106  Q
    ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||    
T  17850484 agatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat 17850392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19218503 - 19218630
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||     | ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  19218503 tataaatattaggagtaaaatttatattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgata 19218594  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     || ||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  19218595 atgatatatactactcttagacctgaaaccactatg 19218630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  144 actgatagtggt 155  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758650
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagta 5758650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Original strand, 28172908 - 28172963
Alignment:
Q  150 agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtc 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  28172908 agtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24695458 - 24695186
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24695458 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 24695359  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24695358 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 24695259  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695258 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19714490 - 19714218
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19714490 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19714391  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19714390 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19714291  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714290 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18569841 - 18569581
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569841 ataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 18569742  T
Q  123 agtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18569741 agtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccat 18569642  T
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569641 tcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19707210 - 19706939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19707210 cacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19707111  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19707110 aaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtg 19707012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707011 ctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 39538803 - 39538953
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  39538803 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagta 39538902  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39538903 aaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298621
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttg 215  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | | |||||||||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |  || | |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285470
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    ||||||||| | | | ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| | | | ||| ||||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  109 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgag 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  176 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccat 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  276 gaatcatg 283  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18807021 - 18806850
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||    
T  18807021 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagt 18806924  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    | ||  || ||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806923 tttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941552
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 20941094 - 20941329
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20941094 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20941190  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  20941191 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 20941289  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20941290 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25805620 - 25805385
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  25805620 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 25805524  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | |||  ||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25805523 aatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25805425  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25805424 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 31966 - 32201
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31966 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 32062  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  32063 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 32161  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32162 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12789898 - 12789663
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12789898 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 12789802  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | ||| |  | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  12789801 aatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 12789703  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12789702 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 23545989 - 23546224
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  23545989 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 23546085  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  23546086 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 23546184  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23546185 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22547008 - 22546872
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |    
T  22547008 cacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacata--a 22546911  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||| |||||    
T  22546910 aaagttatgtaaa-tatcataagttattttcataatgata 22546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933306
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24933445  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  24933444 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24933346  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24933345 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 31096883 - 31097118
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31096883 acataggtataaattataggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 31096979  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  31096980 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 31097078  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31097079 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20100476 - 20100255
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatac 145  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  20100476 ataggtatcaatattaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaa 20100380  T
Q  146 tgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggt 245  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||| |    
T  20100379 tgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggat 20100281  T
Q  246 gactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     || |||| |||||||||||||||||    
T  20100280 aaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764990
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatactg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |   | |||||||||| ||||||| | ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  148 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtga 247  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  | |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811733
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatactg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  148 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtga 247  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  | |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703874
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcatactg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  148 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtga 247  Q
    ||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  | |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097953
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||  |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||| | || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865430
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  141 catactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  241 agggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| | || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806490
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata-gtggta 156  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |     
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806670
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata-gtggta 156  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |     
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtac 18806670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  198 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18829519 - 18829377
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||    
T  18829519 catatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataagttattctcata 18829423  T
Q  145 ctgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtac 189  Q
     |||| |||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  18829422 atgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtac 18829377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |||| |||  ||| ||| ||| |||||||||||||  | || |||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
     | || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  202 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245404
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | || || | || |||  | | ||| |||||||||||| ||||  | || |||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27347470 - 27347425
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaa 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  27347470 cacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18262427 - 18262699
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18262427 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18262526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18262527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18262626  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262627 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18269288 - 18269560
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18269288 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18269387  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18269388 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18269487  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269488 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 55612898 - 55613170
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55612898 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 55612997  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55612998 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 55613097  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613098 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8858382 - 8858654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8858382 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8858481  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8858482 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8858581  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858582 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26963855 - 26964127
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26963855 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26963954  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26963955 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26964054  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964055 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26970678 - 26970950
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26970678 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26970777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26970778 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26970877  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970878 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 868812 - 869084
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  868812 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 868911  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868912 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 869011  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869012 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19926752 - 19926480
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19926752 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19926653  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19926652 aaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19926553  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926552 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5707535 - 5707807
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5707535 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5707634  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5707635 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5707734  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707735 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5714163 - 5714435
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5714163 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5714262  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5714263 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5714362  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714363 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10621325 - 10621053
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10621325 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10621226  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10621225 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10621126  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621125 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10628404 - 10628132
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10628404 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10628305  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628304 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10628205  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628204 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28393126 - 28392854
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28393126 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 28393027  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28393026 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 28392927  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392926 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8845418 - 8845690
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8845418 cacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8845517  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8845518 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8845617  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845618 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4426596 - 4426336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4426596 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 4426497  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||  ||||||||||            ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4426496 aaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 4426409  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426408 ctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5668115 - 5667849
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5668115 gatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaag 5668016  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5668015 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgcttt 5667918  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667917 gtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 35223779 - 35224047
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  35223779 gatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaag 35223878  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35223879 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgcttt 35223978  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35223979 atcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | | |||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | | |||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 20311511 - 20311781
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||    
T  20311511 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acag 20311608  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    |||||  || | |||||   |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  20311609 ttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactt 20311707  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311708 tgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15461564 - 15461799
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15461564 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15461660  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15461661 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15461759  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15461760 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 34975618 - 34975853
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  34975618 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 34975714  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  34975715 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 34975813  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34975814 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 2677080 - 2677315
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2677080 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 2677176  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  2677177 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 2677275  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2677276 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3369258 - 3369023
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3369258 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 3369162  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  3369161 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 3369063  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3369062 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15815088 - 15815323
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15815088 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15815184  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15815185 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15815283  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15815284 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18111278 - 18111043
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18111278 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18111182  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18111181 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18111083  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18111082 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  32 tatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  132 agatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccac 182  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17300194 - 17299959
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  17300194 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 17300098  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  17300097 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 17299999  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  17299998 ataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244239
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20244100  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  20244101 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20244199  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20244200 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531915
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26531776  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  26531777 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 26531875  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  26531876 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  143 tactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 242  Q
     | ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  243 ggtgactataaagttggttgatggg 267  Q
    | |||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942026
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| |||    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4675983
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 4676122  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||    
T  4676121 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaagg 4676023  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4676022 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 18163229 - 18163464
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18163229 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18163325  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18163326 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18163424  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18163425 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 5870485 - 5870720
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||     
T  5870485 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcatatgatattctcac 5870581  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||   ||||| |||||||||  ||| |||    
T  5870582 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgttgtctataatagg 5870680  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5870681 ataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362616
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatg 19362616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| ||| | || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  145 ctgatagtggtatattccacccttcgacctgaaacca 181  Q
     ||||| |||| ||| |||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 56516271 - 56516368
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  56516271 cacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646523
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||| ||||| |||||||  ||| |    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaagg 32646692  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| | |  |||| | || |||| | || |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||| || |||    
T  32646691 ttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactt 32646593  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||   | | |||||||  ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646592 tgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     |||  |  ||||  ||| ||||| ||||||| |||  || |||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  251 taaagttggttgatggg 267  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |||| |||  ||| |||  |||||||||  |||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatggg 267  Q
     | || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |   | ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     |||| ||| |||  ||| || ||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| | | |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  251 taaagttggttgatggg 267  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattcc 162  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  163 acccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttg 262  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| ||| | || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  263 atgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546242
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctca 4546242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9937923 - 9937830
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactaca---tagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    |||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9937923 taaataatagaagtaatatttatattgcagtga-ccgtcatgagaatactactacttagtatgaattatgaaatgtgccataagatattctcata 9937830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 24701363 - 24701411
Alignment:
Q  157 tattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  24701363 tattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777862
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  123 agtgtcataagatatt 138  Q
    ||||||||||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatatt 34777862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 283
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  66 taatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacc 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||| |  | |||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  166 cttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatg 265  Q
    | | |||||||||||||||||  || | |||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| ||| | || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  266 ggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 24700245 - 24700291
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaata 58  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24700245 acagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6110279 - 6110551
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6110279 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6110378  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6110379 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6110478  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110479 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8490710 - 8490982
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8490710 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8490809  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8490810 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8490909  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15342211 - 15341939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342211 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 15342112  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15342111 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15342012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342011 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16482475 - 16482203
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16482475 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16482376  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16482375 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16482276  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482275 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10579347 - 10579075
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10579347 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 10579248  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10579247 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10579148  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579147 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15357578 - 15357306
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15357578 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagta 15357479  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15357478 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15357379  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357378 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15600876 - 15600604
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15600876 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15600777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15600776 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15600677  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15600676 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15607421 - 15607149
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15607421 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15607322  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15607321 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15607222  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15607221 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10572584 - 10572312
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10572584 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10572485  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10572484 aaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtg 10572385  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572384 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18520190 - 18520462
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18520190 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagta 18520289  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18520290 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18520389  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520390 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 18522878 - 18523146
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18522878 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagta 18522977  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18522978 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18523077  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523078 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13211517 - 13211789
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13211517 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagta 13211616  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13211617 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13211716  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211717 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13248822 - 13249094
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  13248822 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagta 13248921  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13248922 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13249021  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249022 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17781110 - 17780838
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17781110 cacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17781011  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17781010 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17780911  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32056892 - 32056619
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32056892 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 32056793  T
Q  110 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056792 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 32056693  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056692 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17200176 - 17199900
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17200176 cacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagta 17200077  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17200076 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtg 17199977  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199976 ttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13517026 - 13517294
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13517026 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagta 13517125  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13517126 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13517221  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13517222 ctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1647513 - 1647241
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  1647513 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataata 1647414  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1647413 aaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtg 1647314  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647313 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 17136574 - 17136840
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17136574 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 17136667  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17136668 aaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17136767  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136768 cttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29925189 - 29925458
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  29925189 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29925288  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29925289 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29925388  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925389 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29974342 - 29974611
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  29974342 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29974441  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29974442 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29974541  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974542 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200917
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc 211  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21034305 - 21034540
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  21034305 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 21034401  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  21034402 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21034500  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21034501 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15846771 - 15846536
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15846771 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15846675  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15846674 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15846576  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15846575 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20147789 - 20147554
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20147789 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20147693  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  20147692 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20147594  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20147593 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21398859 - 21399094
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  21398859 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattcttac 21398955  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  21398956 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21399054  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21399055 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427323
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 55427184  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  55427185 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 55427283  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  55427284 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300212
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  145 ctgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggg 244  Q
     ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| |||     
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  245 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 14890458 - 14890693
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  14890458 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 14890554  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| ||||||||| |||| ||  | || |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  14890555 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 14890653  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14890654 ataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 242
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527014
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 242  Q
     |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  || |  ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaacag 15527014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24253372 - 24253130
Alignment:
Q  19 atggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | |||||  || |||||    
T  24253372 atggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat 24253275  T
Q  119 gaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtca 218  Q
       |||  ||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||||| ||||||      
T  24253274 -ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgttg 24253177  T
Q  219 ccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatg 265  Q
     | ||||||| |||||  | |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  24253176 tcgttcaaacattgtcaattacagagtgaccataaagttagttgatg 24253130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| ||   ||||||||| ||||||||   |||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagt--gagtc 32280410  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccac----tatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 14147095 - 14147226
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  14147095 tataaatattaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgata 14147191  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactat 185  Q
      ||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  14147192 aaggtgtatatcactcttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | || ||||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  98 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatg 197  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  198 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | ||| || || |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088324 t-ggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctcac 11787750  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||| ||||  |||| |||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317176
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || ||   | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||  ||    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464255
Alignment:
Q  130 taagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  230 ttgtccgtaa 239  Q
    ||||| ||||    
T  30464246 ttgtctgtaa 30464255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189314
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat 149  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata--aaatattatg-aaggtgtcataaaatattctcatattgat 4189314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18252245 - 18252517
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18252245 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18252344  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18252345 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18252444  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252445 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18532506 - 18532234
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18532506 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18532407  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18532406 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18532307  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532306 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27131401 - 27131130
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27131401 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27131302  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27131301 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtg 27131203  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131202 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27310569 - 27310297
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27310569 cacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27310470  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27310469 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27310370  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310369 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16359027 - 16358755
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359027 cacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16358928  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16358927 aaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16358828  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358827 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3855911 - 3855639
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  3855911 cacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagta 3855812  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  3855811 aaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcg 3855712  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3855711 ctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36816625 - 36816354
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  36816625 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 36816526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  36816525 aaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcg 36816427  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36816426 ttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641594
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27277545 - 27277278
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||| | |||||||||||    
T  27277545 gatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaag 27277446  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27277445 tcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 27277347  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||  |||||||| ||||  |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277346 atcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21171225 - 21171081
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21171225 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21171126  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21171125 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9916689 - 9916497
Alignment:
Q  90 tcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaa-ccactatgt 187  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916689 tcatgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgt 9916593  T
Q  188 accctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916592 accctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19706674 - 19706439
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  19706674 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 19706578  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  19706577 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 19706479  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19706478 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28134958 - 28134723
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28134958 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 28134862  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  28134861 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 28134763  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28134762 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43802600 - 43802365
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  43802600 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 43802504  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  43802503 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 43802405  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43802404 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 9456183 - 9456418
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  9456183 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 9456279  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  9456280 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 9456378  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9456379 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20391474 - 20391239
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||     
T  20391474 acatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcataagatattctcac 20391378  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | ||| || | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  20391377 aatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20391279  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20391278 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20779880 - 20779645
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20779880 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20779784  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  20779783 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20779685  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20779684 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22670492 - 22670257
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22670492 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22670396  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  22670395 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22670297  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22670296 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42817224 - 42816989
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  42817224 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 42817128  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  42817127 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 42817029  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  42817028 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22657207 - 22657108
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22657207 tcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507385
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||| ||||| ||  || |    
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacg 23507216  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    || || |||  | |||||| |||||||||| |||| |||||  |||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || | |||| |||    
T  23507217 ttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| ||| |||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634216
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  244 gtgactataaagttggttga 263  Q
     | || |||| |||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 22612559 - 22612794
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22612559 acatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22612655  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||    
T  22612656 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 22612754  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22612755 ataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12014272 - 12014179
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  12014272 gatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatag 12014179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| || |||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
       || |||  ||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997485
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||  |||  ||||| || || ||||||| |||||||||| |||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactacgta--aaatattatg-aatgtatcataagttattctcatattgata 51997449  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     || ||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  51997450 atgatatataccacgcttagaccagaaactactatg 51997485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096928
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    | ||||| |||| | |  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatg 29096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      ||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  270 ctccatgaatcatg 283  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47667709 - 47667668
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47667709 acatagatataaatattatgagtaatatttatattggattga 47667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47667654 - 47667485
Alignment:
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc 211  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || ||||| ||| || |||||    
T  47667654 aagttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgc 47667557  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47667556 tttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006461
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 81  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236402
Alignment:
Q  65 gtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcata 31236402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  136 attctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21940880 - 21941151
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21940880 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21940979  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21940980 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21941079  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941080 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 22171705 - 22171974
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22171705 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 22171804  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22171805 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 22171904  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171905 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6094338 - 6094610
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094338 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagta 6094437  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6094438 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6094537  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094538 ctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 24642864 - 24643135
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24642864 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagta 24642963  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24642964 aaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtg 24643062  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643063 ttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 283
Target Start/End: Original strand, 28548397 - 28548534
Alignment:
Q  146 tgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggt 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548397 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggt 28548496  T
Q  246 gactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548497 gactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14983908 - 14983710
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  14983908 gatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaag 14983812  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||    
T  14983811 ttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactt 14983713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24797353 - 24797224
Alignment:
Q  38 gtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatat 137  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797353 gtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatat 24797254  T
Q  138 tctcatactgatagtggtatattccaccctt 168  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  24797253 tctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8371488 - 8371253
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8371488 acataggtataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 8371392  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  8371391 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 8371293  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8371292 atgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 12562190 - 12562425
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12562190 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 12562286  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  12562287 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 12562385  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12562386 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21969400 - 21969635
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  21969400 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 21969496  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  21969497 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 21969595  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21969596 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659494
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 25611262 - 25611497
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  25611262 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcataagatattctcac 25611358  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  ||| ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  25611359 aatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25611457  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  25611458 ataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27007752 - 27007517
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27007752 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27007656  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27007655 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27007557  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27007556 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27014895 - 27014660
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27014895 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27014799  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27014798 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27014700  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27014699 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27880722 - 27880487
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27880722 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 27880626  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  27880625 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 27880527  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27880526 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28020903 - 28020668
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28020903 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 28020807  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  28020806 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 28020708  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  28020707 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22130844 - 22130609
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22130844 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22130748  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||    
T  22130747 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 22130649  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22130648 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38232365 - 38232115
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  38232365 gatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaag 38232268  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||| ||||||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  38232267 ttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactt 38232169  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatggg 267  Q
    |||   | | |||||||||||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  38232168 tgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534273
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 45534412  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| |||    
T  45534411 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 45534313  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45534312 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 21916744 - 21916978
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  21916744 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 21916840  T
Q  145 ctgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggg 244  Q
     ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||     
T  21916841 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 21916939  T
Q  245 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | || ||||  |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21916940 taacaataactttggttgatgggcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240786
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||  |  | |||  | | ||| ||||| |||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| |||    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||  ||||||||| |||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781971
Alignment:
Q  52 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagt--ctgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  152 tggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatg 8781971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 18835424 - 18835556
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| || | |||||    
T  18835424 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgata 18835520  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     |||| |||  ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18835521 atggtgtatatcactcttagacctgaaaccattatg 18835556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatacta 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  176 aaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactcc 273  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |   || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375300
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattga 2375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  270 ctccatgaatcatgatgat 288  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   |  ||||||||||||||||| |  ||||||    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  141 catactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | |  |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| || | |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  241 agggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| | || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  121 aaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcacc 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| |||||| |||||||||| | |||  |   |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatg-atccttaaatatggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  221 attcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatggg 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 83
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 287
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||  || | |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  270 ctccatgaatcatgatga 287  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  23 ataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 75  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 73  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7594
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7322 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 7421  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7422 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 7521  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6926 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6827  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6826 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6727  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13670
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  13942 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 13843  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13842 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13743  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13742 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25982 - 25706
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25982 cacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 25883  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25882 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 25783  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25782 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 15152658 - 15152926
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15152658 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15152757  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15152758 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15152857  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152858 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29327999 - 29328271
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29327999 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29328098  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29328099 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 29328198  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328199 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11536054 - 11535782
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11536054 cacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11535955  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11535954 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11535855  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535854 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11542972 - 11542700
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11542972 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11542873  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11542872 aatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtg 11542773  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542772 atttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12751041 - 12751313
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12751041 cacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12751140  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12751141 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtg 12751240  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751241 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12738751 - 12739023
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12738751 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12738850  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12738851 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtg 12738950  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738951 ctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18561222 - 18561485
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  18561222 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagta 18561321  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18561322 aaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtg 18561412  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561413 atttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392637
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18257834 - 18257559
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||| ||||||||     
T  18257834 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt- 18257736  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
     | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||    
T  18257735 -atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtg 18257638  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 289  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257637 ctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  43 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  143 tactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    |  |||| |||||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  242 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |  |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 2204619 - 2204854
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2204619 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 2204715  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  2204716 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 2204814  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2204815 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 8465066 - 8465301
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8465066 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 8465162  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  || | |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  8465163 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 8465261  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8465262 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 18400171 - 18400406
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18400171 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18400267  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18400268 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18400366  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18400367 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 18407155 - 18407390
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18407155 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18407251  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18407252 aatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18407350  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18407351 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48808731 - 48808496
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  48808731 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 48808635  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  48808634 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 48808536  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  48808535 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15730053
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15729914  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||    | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  15729915 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15730013  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15730014 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139338
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18139477  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18139476 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18139378  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18139377 ataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 19230955 - 19231190
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  19230955 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcataagatattctcac 19231051  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  19231052 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 19231150  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19231151 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Original strand, 30254205 - 30254428
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  30254205 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 30254301  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||   || ||| ||| |||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  30254302 aatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 30254400  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254401 ataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| ||| | || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     | || |||| |||||||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10669137 - 10668901
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc-a 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  10669137 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgc 10669041  T
Q  143 tactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacag 242  Q
     | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  || |  ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||    
T  10669040 aattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaag 10668942  T
Q  243 ggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10668941 gataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130863
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | | ||| | || |||  ||  ||| ||||||||| |||||||  || | |||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388762
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||   |  | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  149 tagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    || | || ||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatg 19388762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592056
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | || |||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccactatg 14592056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011647
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | |||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     |  | |||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 16011647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||| ||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||  ||||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393468
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |   | |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| |||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaa 19393468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845498
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  155 tatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaa 254  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | | | |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  255 gttggtt 261  Q
    |||||||    
T  25845504 gttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845917
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  155 tatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaa 254  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | | | |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  255 gttggtt 261  Q
    |||||||    
T  25845923 gttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443349
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||  | ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |||| |||  ||| ||| ||| |||||||| ||||  |||| |||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  244 gtgactataaagttggtt 261  Q
     |||| |||| |||||||    
T  24443366 atgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  | ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      ||| ||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  135 tattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 234  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||||||||| || ||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  235 cgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactc 272  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190537
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtat 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  158 attccacccttcgacctgaaaccacta 184  Q
    ||  |||  || |||||||||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccacta 31190537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235451
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattga 10235451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396527
Alignment:
Q  41 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaat 99  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggattaacccgtcataagaat 7396527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  32 tatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagt 109  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Original strand, 19859189 - 19859221
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttata 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859189 acatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47833945 - 47833875
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  47833945 gatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttatatttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15169474 - 15169290
Alignment:
Q  95 agaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctgg 194  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||||||||||  |||  |    
T  15169474 agaatactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatgctactcttagtcctaaaaccactatgatcccaag 15169378  T
Q  195 atgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| |  | |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||| | || |||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  15169377 atg-tggacttaaatgctttattgccattcaaacgttatctataacaggataaccataacgttggttgataggcacttgatgaatcatg 15169290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18774
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18503 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18602  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18603 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18702  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18703 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21330240 - 21329968
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21330240 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21330141  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21330140 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21330041  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21330040 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18796721 - 18796993
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18796721 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagta 18796820  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18796821 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtg 18796920  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796921 ctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 18620023 - 18620296
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18620023 gatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaag 18620122  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18620123 ttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgcttt 18620221  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 289  Q
     |||||||||| |   |||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620222 atcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| | | |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 36270395 - 36270650
Alignment:
Q  25 aaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaag 124  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||||| |||  ||||| ||||    
T  36270395 aaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatagaaaa--ttatgtaaag 36270492  T
Q  125 tgtcataagatattctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 223  Q
     |||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||  || |     
T  36270493 -gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtattc-acccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgta 36270590  T
Q  224 caaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270591 caaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 30174444 - 30174679
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  30174444 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 30174540  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  30174541 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 30174639  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  30174640 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 18822302 - 18822556
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||  ||| |    
T  18822302 gatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacg 18822399  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  18822400 ttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtactt 18822498  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    | |   |||  ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822499 ttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22183475 - 22183206
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||||       
T  22183475 cacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--t 22183379  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagt 209  Q
    || |||||| |||  |||| | |  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22183378 aatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagt 22183280  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||     | ||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183279 actttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6992076 - 6991847
Alignment:
Q  39 tcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatatt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||  ||| |||||  ||||| |||||  ||||    
T  6992076 tcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatag--aaaattatg-taagtgacataaactatt 6991980  T
Q  139 ctcatactgat-agtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgc-tttgtcaccattcaaacgttgtccg 236  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||  |  || ||||||||||      
T  6991979 ctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgtttctgtttaaacgttgtcta 6991880  T
Q  237 taacagggtgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    | ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  6991879 tgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24250267 - 24250032
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24250267 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24250171  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  24250170 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24250072  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24250071 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | |||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  ||||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24229450 - 24229215
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24229450 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24229354  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| | | |||||||||||||  |||| |||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| |||    
T  24229353 aatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 24229255  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24229254 ataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgacta 250  Q
     |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||||| | |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatgat 285  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18852047 - 18851977
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18852047 gatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattga 18851977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241146
Alignment:
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  220 cattcaaacgttgt 233  Q
    |  |||||||||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgt 17241146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616641
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||  | |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 19616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactat 185  Q
     || | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  47 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316412
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || ||  |||||||||| || ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatactgata 41316412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36801974 - 36801899
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacataga-tataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  36801974 cacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  136 attctcatactgata-gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740922
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||  ||| || ||||||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatg 28740922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1461
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1208 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagta 1307  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1308 aaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 1407  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  1408 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  27 agagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  127 tcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  227 acgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 5744 - 6013
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5744 cacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagta 5843  T
Q  111 aaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattcca-cccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5844 aaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaag 5934  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5935 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 250 - 485
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  250 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 346  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  347 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 445  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  446 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     | || ||||||||||||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3675
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  3910 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 3814  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  3813 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 3715  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3714 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 119797 - 120032
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  119797 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 119893  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  119894 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 119992  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  119993 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67374
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |||    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 130459 - 130268
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  130459 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 130363  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| |  | |||  | | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  130362 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaa 130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||||||  ||||  ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| |||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 8372 - 8467
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8372 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctca 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40223 - 39988
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40223 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 40127  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
    | ||||| |||| |||   || ||| ||| |||||||||||||  ||||  ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  40126 agtgataatggtgtatataactcttagacttgaaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaagg 40028  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||||||||| | |||| ||||  ||||||||||    
T  40027 ataaccataaagttggctaatggttacttgatgaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 283
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  93 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccct 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | || |||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  193 ggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| ||| | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Original strand, 8807 - 8933
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgatagt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||   ||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagt--atgttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  153 ggtatattccacccttcgacctgaaaccac 182  Q
    ||| ||| |||| | | |||||||||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccac 8933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83111
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatactgata 150  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| ||||| | |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  151 gtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatg 186  Q
     |||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaaccagtatg 83111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa---agtgtcataagatattctcatactg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||||   ||||||  |   | |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  148 atagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagggtga 247  Q
    |||   || ||   | | ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| | |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| ||  | |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  144 actgatagtggtatattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 243  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||||||  |||| | || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  244 gtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 90093 - 90033
Alignment:
Q  25 aaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  90093 aaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtataacatttatattggattga 90033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University