View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13157_low_5 (Length: 377)

Name: NF13157_low_5
Description: NF13157
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13157_low_5
NF13157_low_5
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (40-365)||(23673345-23673671)
chr2 (39-365)||(36326845-36327172)
chr2 (40-365)||(32575685-32576013)
chr2 (38-365)||(16294817-16295145)
chr2 (40-363)||(13709991-13710315)
chr2 (40-365)||(31528307-31528635)
chr2 (110-365)||(31626468-31626726)
chr2 (46-336)||(40017924-40018218)
chr2 (40-135)||(24384925-24385022)
chr2 (40-181)||(29435969-29436113)
chr2 (40-181)||(38315801-38315944)
chr2 (40-178)||(32074156-32074297)
chr2 (107-365)||(8427144-8427402)
chr2 (53-104)||(1503204-1503256)
chr2 (53-104)||(1506408-1506460)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (48-365)||(19664674-19664991)
chr6 (48-365)||(15534975-15535292)
chr6 (40-304)||(32427281-32427544)
chr6 (40-365)||(14790537-14790864)
chr6 (40-365)||(14795565-14795892)
chr6 (38-365)||(1838393-1838722)
chr6 (48-280)||(15540574-15540806)
chr6 (39-309)||(27649077-27649347)
chr6 (144-365)||(20527266-20527490)
chr6 (140-365)||(16883594-16883820)
chr6 (204-361)||(32704420-32704577)
chr6 (40-365)||(13017189-13017517)
chr6 (140-365)||(12980594-12980818)
chr6 (40-365)||(22221642-22221967)
chr6 (40-365)||(22247477-22247802)
chr6 (140-364)||(12983481-12983704)
chr6 (189-365)||(30978360-30978539)
chr6 (244-365)||(7769594-7769715)
chr6 (40-181)||(11410983-11411127)
chr6 (140-239)||(11183937-11184037)
chr6 (88-181)||(35026936-35027030)
chr6 (303-343)||(15540529-15540569)
chr6 (40-131)||(28974136-28974230)
chr6 (37-181)||(33678938-33679087)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (48-365)||(26062698-26063020)
chr4 (40-365)||(2541803-2542128)
chr4 (40-365)||(647203-647530)
chr4 (40-365)||(650475-650802)
chr4 (236-365)||(26060506-26060635)
chr4 (40-365)||(12171901-12172218)
chr4 (38-181)||(15851393-15851539)
chr4 (231-295)||(11649426-11649490)
chr4 (40-148)||(19929134-19929242)
chr4 (55-121)||(21217350-21217416)
chr4 (40-156)||(33400075-33400192)
chr4 (38-173)||(2210869-2211004)
chr4 (132-239)||(11649296-11649405)
chr4 (100-181)||(13979355-13979437)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (40-365)||(13495906-13496232)
chr1 (40-365)||(39546161-39546486)
chr1 (40-365)||(13493181-13493508)
chr1 (40-365)||(10764838-10765165)
chr1 (140-364)||(34066264-34066489)
chr1 (40-365)||(32505857-32506181)
chr1 (48-363)||(16190187-16190503)
chr1 (41-361)||(1936549-1936873)
chr1 (115-365)||(27282183-27282434)
chr1 (53-365)||(15297251-15297559)
chr1 (140-365)||(21153174-21153400)
chr1 (140-365)||(22456594-22456818)
chr1 (140-357)||(49147825-49148042)
chr1 (40-181)||(34552438-34552582)
chr1 (40-181)||(49716591-49716735)
chr1 (43-181)||(49720073-49720214)
chr1 (140-239)||(8435280-8435380)
chr1 (318-365)||(22453415-22453462)
chr1 (40-181)||(6206101-6206245)
chr1 (50-127)||(18392669-18392747)
chr1 (311-365)||(23990361-23990415)
chr1 (40-128)||(50196715-50196804)
chr1 (35-83)||(11666755-11666803)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (39-366)||(14616428-14616756)
chr5 (38-365)||(7649940-7650268)
chr5 (40-365)||(34405767-34406094)
chr5 (29-365)||(22159663-22160003)
chr5 (43-361)||(33575011-33575331)
chr5 (40-365)||(15532200-15532528)
chr5 (42-365)||(15542384-15542710)
chr5 (42-296)||(11988864-11989125)
chr5 (212-365)||(26712516-26712669)
chr5 (212-365)||(26982254-26982407)
chr5 (40-175)||(21680585-21680721)
chr5 (40-181)||(2499762-2499905)
chr5 (40-156)||(33921343-33921459)
chr5 (47-174)||(1810197-1810326)
chr5 (40-144)||(26711464-26711567)
chr5 (40-144)||(26981201-26981304)
chr5 (48-130)||(36330992-36331074)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (40-365)||(36842937-36843264)
chr7 (40-365)||(6967066-6967393)
chr7 (40-365)||(17866353-17866680)
chr7 (40-366)||(9765710-9766046)
chr7 (40-365)||(24783327-24783654)
chr7 (39-365)||(3861906-3862225)
chr7 (204-365)||(17863260-17863421)
chr7 (140-365)||(23313361-23313587)
chr7 (40-361)||(294787-295106)
chr7 (139-336)||(23107935-23108133)
chr7 (96-365)||(46846367-46846639)
chr7 (46-374)||(11279401-11279730)
chr7 (110-365)||(36222378-36222635)
chr7 (38-365)||(33312913-33313241)
chr7 (40-365)||(23759609-23759936)
chr7 (40-181)||(3540924-3541065)
chr7 (39-150)||(17857879-17857991)
chr7 (40-181)||(38431614-38431757)
chr7 (49-183)||(28577687-28577820)
chr7 (47-181)||(6964508-6964644)
chr7 (140-181)||(16547225-16547267)
chr7 (140-181)||(16618395-16618437)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (40-359)||(12575300-12575620)
chr8 (40-304)||(14418445-14418707)
chr8 (144-365)||(41778847-41779068)
chr8 (205-365)||(13096940-13097099)
chr8 (219-334)||(44008245-44008360)
chr8 (40-181)||(39659712-39659856)
chr8 (40-181)||(9467286-9467429)
chr8 (231-295)||(41836415-41836479)
chr8 (40-181)||(453807-453951)
chr8 (63-181)||(13332308-13332429)
chr8 (132-239)||(41836285-41836394)
chr8 (232-271)||(14418396-14418435)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (40-365)||(13979405-13979730)
chr3 (40-365)||(22626312-22626638)
chr3 (219-364)||(46731414-46731559)
chr3 (40-365)||(39563510-39563837)
chr3 (40-183)||(46731556-46731699)
chr3 (40-365)||(11138570-11138896)
chr3 (97-365)||(35366295-35366562)
chr3 (40-234)||(20536333-20536530)
chr3 (91-365)||(47412101-47412368)
chr3 (40-156)||(19869226-19869343)
chr3 (39-181)||(27055092-27055237)
chr3 (40-173)||(25492128-25492263)
chr3 (46-178)||(46542550-46542683)
chr3 (140-239)||(50096825-50096925)
chr3 (40-131)||(26822039-26822130)
chr3 (40-104)||(3306147-3306213)
chr3 (40-104)||(18883509-18883575)
chr3 (40-104)||(30157797-30157863)
chr3 (145-181)||(36036817-36036854)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (40-304)||(11-273)
scaffold0363 (232-271)||(283-322)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (48-365)||(2627-2930)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (40-365)||(9781-10109)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (223-361)||(5995-6133)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (40-365)||(24185-24510)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (219-362)||(7173-7316)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (219-336)||(2641-2758)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (40-181)||(19509-19653)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (40-175)||(33730-33866)
[»] scaffold0766 (1 HSPs)
scaffold0766 (49-178)||(3613-3739)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (40-83)||(10253-10296)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 23673345 - 23673671
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  23673345 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaa 23673444  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673445 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 23673544  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23673545 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaa 23673644  T
Q  339 agtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||    
T  23673645 agtaattctacccaatctcttgaccta 23673671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 39 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36327172 - 36326845
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36327172 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatca 36327073  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36327072 aaaaagatgtattaaattcaaagttgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 36326973  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36326972 gagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctaatttaacgatagattaaca 36326873  T
Q  338 aagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  36326872 aagtaattctacccaatctcttgaccta 36326845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 32575685 - 32576013
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| |     
T  32575685 tgatagatatttggcaagtgaaccaacactattgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcaacgatttcgttataat 32575784  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||  | |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  32575785 aaatgatgtattaaattcaattgttaccctaggcagttggatt-gtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 32575883  T
Q  238 g--agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32575884 gaaagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagttcaaaaaatgattatttagtttcacgacagattaa 32575983  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |  ||||| | || | |||| |||||||||    
T  32575984 cttagtaactctaccaaatcccttgaccta 32576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16295145 - 16294817
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16295145 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcaaatccacgaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatc 16295046  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaat 233  Q
     ||| |||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||  |||||| |||||||| |||  |||| || ||||| |||||||    
T  16295045 gaaa-ggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgat-tttgtatcataaaccgattaaaaacaaataaagattagttttcagaaaat 16294948  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16294947 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtttaatcaatgattatttagtttcacgacagatt 16294849  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  16294848 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 16294817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13710315 - 13709991
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13710315 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 13710218  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| ||||| |   |  ||||  ||| |||||  |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  13710217 aaaaggatgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttg--agttgtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattt 13710120  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa-gttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13710119 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaatttaggcaatgattatctagttcaacaacagatta 13710020  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgacc 363  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||    
T  13710019 acaaagtaattctacccgatctcttgacc 13709991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31528307
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 31528537  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 233  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  31528536 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 31528439  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 332  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31528438 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 31528340  T
Q  333 taacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31528339 taacttagtaattctacccaatctcttgaccta 31528307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31626726 - 31626468
Alignment:
Q  110 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--a 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||| ||| |  |    
T  31626726 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaaaggaattaa 31626628  T
Q  206 aaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 305  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31626627 aaataataaaggattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattcaat 31626528  T
Q  306 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31626527 caattattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttgaccta 31626468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40018218 - 40017924
Alignment:
Q  46 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |   |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||    
T  40018218 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttattaaaaagg 40018120  T
Q  145 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagaga 241  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||| | ||||||    
T  40018119 atgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttg--atttgtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagaga 40018022  T
Q  242 tgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatct---agtttaacgacagattaac 336  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  40018021 agtatggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaattcaaccaatgattatttataagttttacgacagattaac 40017924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 135
Target Start/End: Original strand, 24384925 - 24385022
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttta 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24384925 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaataaaattaaattcgtattcacgatgactgttattaatttctacttagcaatttcttta 24385022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29436113 - 29435969
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  29436113 tgatagataattgacaagtgtatcaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 29436014  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| ||||||  |  |||||| |||||||||||||||    
T  29436013 taaaggatgtagtaaattttatgggttgcactaggcagttggatt 29435969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 38315801 - 38315944
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  38315801 tgataaatatttggtaagtgtatcaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaa-ttctacttagcaagttcgttaaaat 38315899  T
Q  140 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     ||||||||| ||||||   |  ||||| ||||||||||||||||    
T  38315900 taaggatgtagtaaattttacggggttgtcctaggcagttggatt 38315944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Original strand, 32074156 - 32074297
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||| ||||| |   |||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  32074156 tgatagatatttgacaagtataccaaaattatcgaagtaataataataaatttgtatccacgatggttgttgttaatttctacttagaaatttcattaat 32074255  T
Q  138 aaaaaggatgtatt-aaattcaaggttgccctaggcagttgg 178  Q
      |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32074256 gtaaaggatgtattaaaattgtgggttgccctaggcagttgg 32074297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8427402 - 8427144
Alignment:
Q  107 ttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaa 206  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||| | |||||| |||| |||||||| |||||  | ||||    
T  8427402 ttgtttacttttacttaacaatttcattatttaaa-ggatgtattaaatttaaggttgttctaagtagttgggttggtatttgtaacataaattgtttaa 8427304  T
Q  207 aaca-ataaaag-tttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 304  Q
    | |  ||||||| ||||||| |||||| |||   | |  ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||| ||   |||||    
T  8427303 agccgataaaagctttggttgtagaaatttatgaaaaaatatagttaagacattcgaatcatccgatgttcttatttggtaatttgcac-ccctgttcaa 8427205  T
Q  305 tcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| |  || ||  |||||||||||||||    
T  8427204 tcaatgtctttctagtttaacaacagattaataaaatggttctactcaatctcttgaccta 8427144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 104
Target Start/End: Original strand, 1503204 - 1503256
Alignment:
Q  53 gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 104  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1503204 gcaagtgtactaaaactatcgaagtaataaaataaattcgtatccacgaggac 1503256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 104
Target Start/End: Original strand, 1506408 - 1506460
Alignment:
Q  53 gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 104  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1506408 gcaagtgtactaaaactatcgaagtaataaaataaattcgtatccacgaggac 1506460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 48 - 365
Target Start/End: Original strand, 19664674 - 19664991
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19664674 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgtttatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggatg 19664773  T
Q  148 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19664774 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttaagaaaattagagagatgtat 19664873  T
Q  247 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |     
T  19664874 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctag-ttcacgacagattaacaaagtaactc 19664972  T
Q  347 tatccaatctcttgaccta 365  Q
    || ||||| ||||||||||    
T  19664973 tacccaatatcttgaccta 19664991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15535292 - 15534975
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 147  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15535292 atttcgcatgtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatg 15535193  T
Q  148 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15535192 tattaaattcaaggttgccctaggcagttgagttgat-tttgtaaaacaaatagattaaaaacaataaaagtttggttttacaaaattaaagtgatgtat 15535094  T
Q  247 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  15535093 ggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactc 15534994  T
Q  347 tatccaatctcttgaccta 365  Q
    || ||||||||||||||||    
T  15534993 taaccaatctcttgaccta 15534975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32427544 - 32427281
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32427544 tgatagatatttggtaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatctacgaggaccgttgttaa-ttctactcagcaatttctttatcaa 32427446  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32427445 aaaagatgtattaaattcaaggttgccctag-cagttggattggtatttgtaaaataaacgaattaaaaacaatgaaagtttggttttagaaaattagag 32427347  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 304  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32427346 agatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaa 32427281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790537
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14790765  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14790764 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14790667  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790666 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14790567  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14790566 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 14790537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14795892 - 14795565
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14795892 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14795793  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  14795792 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 14795695  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795694 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14795595  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14795594 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 14795565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1838722 - 1838393
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1838722 aatgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 1838623  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaagg---ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 234  Q
    ||||||||||||| || ||  |     ||  ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||| |||    
T  1838622 aaaaaggatgtataaatttatattgatttttcctagacagttggattggtttttataaagtaaacgtaataaaagaataaaagttggttttaagaatatt 1838523  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1838522 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctat-gtaattcgcactcctagttcaatcaacgattatttagttcaacgacagatta 1838424  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  1838423 acaaagtaactctacccaatctcttgaccta 1838393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15540806 - 15540574
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15540806 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtaaccaatcggaccattgttaacttctactcagcaatttctatatcaaaaaggatg 15540707  T
Q  148 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  15540706 tattaaattcaaggtttccctaggcagttgagttgat-tttctaaaataaagggattaaaaacaataaaagtttagttttagaaaattaaagagatttat 15540608  T
Q  247 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15540607 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 15540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27649347 - 27649077
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||     
T  27649347 atgatagagatttggcaagtgaactaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccacgaggaccgttgttaattcctactcagcaatttctttctcg 27649248  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |  | |||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  27649247 aaa-ggatgcattaaatttttggtcgccctaggcagttggattggtttttataacataaacgtagatgaaacaataaaagttggttttaagaaaattaga 27649149  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaat 309  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  27649148 gcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaattcaagcaat 27649077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Original strand, 20527266 - 20527490
Alignment:
Q  144 gatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacgga--ttaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagag 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||  |||||  |  | ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||    
T  20527266 gatgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaaagttggttttaagaatattagagag 20527365  T
Q  241 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  20527366 aagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaat 20527465  T
Q  341 taattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20527466 taactttacccaatctcttgaccta 20527490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16883820 - 16883594
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16883820 aaaggatgtattaaattcaagggttccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 16883721  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 338  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||||     
T  16883720 agaagtatggttaagacattcgaatccttcgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacac 16883621  T
Q  339 agtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    | |||   || ||||||||||||||||    
T  16883620 aataaccctacccaatctcttgaccta 16883594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 361
Target Start/End: Original strand, 32704420 - 32704577
Alignment:
Q  204 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 303  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32704420 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 32704519  T
Q  304 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  32704520 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttga 32704577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 13017189 - 13017517
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | |||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13017189 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattatta 13017287  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 233  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  13017288 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaat 13017385  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 332  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  13017386 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggat 13017484  T
Q  333 taacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  13017485 taacttagtaattctacccaatctcttgaccta 13017517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 365
Target Start/End: Original strand, 12980594 - 12980818
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattc-aaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||||||| |    
T  12980594 aaaggatgtattaaattctaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttct-gaaaattaaa 12980691  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12980692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12980790  T
Q  338 aagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12980791 aagtaattctacccaatctcttgaccta 12980818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221642
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22221869  T
Q  139 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 234  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22221868 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22221773  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22221772 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22221674  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  22221673 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 22221642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247477
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||| |||| |    
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22247704  T
Q  139 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 234  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  |||||  ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  22247703 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 22247608  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc-caaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22247607 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggatt 22247509  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  22247508 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 22247477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 364
Target Start/End: Original strand, 12983481 - 12983704
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  12983481 aaaggatgtattaaattcaaatgttgccctaggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 12983578  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12983579 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtac-ccctattcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 12983677  T
Q  338 aagtaattttatccaatctcttgacct 364  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    
T  12983678 aagtaattctacccaatctcttgacct 12983704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Original strand, 30978360 - 30978539
Alignment:
Q  189 gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggta 285  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30978360 gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggta 30978458  T
Q  286 atttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30978459 atttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgaccta 30978539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 365
Target Start/End: Original strand, 7769594 - 7769715
Alignment:
Q  244 tatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7769594 tatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcaccctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaacaaagtaa 7769693  T
Q  344 ttttatccaatctcttgaccta 365  Q
    || ||  |||||| ||||||||    
T  7769694 ttctactcaatcttttgaccta 7769715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11411127 - 11410983
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  11411127 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgagtaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 11411028  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||| ||||    
T  11411027 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttcgatt 11410983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Original strand, 11183937 - 11184037
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11183937 aaaggatgtattaaattcaagagttccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 11184036  T
Q  239 a 239  Q
    |    
T  11184037 a 11184037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 181
Target Start/End: Original strand, 35026936 - 35027030
Alignment:
Q  88 ttcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  35026936 ttcgtatccacaaggaacgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 35027030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15540569 - 15540529
Alignment:
Q  303 aatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15540569 aatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaa 15540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 28974136 - 28974230
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtg-aaccaaaactatcaaagtaata--aataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 131  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||  |||| ||||||||  ||||||||  || |||||||||||||    
T  28974136 tgatagatatttggcaagtgtatccaaaactatcgaagtaataataataaatctgtatccacgaggattgttgttaatgtcaacttagcaatttc 28974230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Original strand, 33678938 - 33679087
Alignment:
Q  37 gaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa---ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctt 133  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||| ||||| ||   || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |    
T  33678938 gaatgataaatatttggcaagtgtaccaaaaaaactatcgaagtagtactaaagttcatatccacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttagt 33679037  T
Q  134 tatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctagg-cagttggatt 181  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  33679038 taaaataaaggatgtatgaaatttatgggttgccctaggacagttggatt 33679087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 48 - 365
Target Start/End: Original strand, 26062698 - 26063020
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggacc--gttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26062698 atttggcaagtgaaccaaaactatcgaaataataaataaattcgtatccacgaggaccccgttgttaacttctactcaacaatttctttatcaaaaagga 26062797  T
Q  146 tgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag--agat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26062798 tgtattaaattcaaggttgccctaggtagttggattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagagat 26062897  T
Q  243 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26062898 gtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagta 26062997  T
Q  343 attttatccaatctcttgaccta 365  Q
    | | || ||||||||||||||||    
T  26062998 actctacccaatctcttgaccta 26063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541803
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattatta 2542030  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttta-gaaaattag 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||     |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||  ||||||||     
T  2542029 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaattaa 2541930  T
Q  237 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 336  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2541929 agag--gtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcctatttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaac 2541832  T
Q  337 aaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2541831 aaagtaattttatccaatctcttgaccta 2541803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 647203 - 647530
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  647203 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 647302  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  647303 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 647400  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647401 gagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 647500  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  647501 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 647530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 650475 - 650802
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  650475 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctatatca 650574  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||| |||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  650575 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcataatatta 650672  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650673 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 650772  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  650773 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 650802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26060635 - 26060506
Alignment:
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  26060635 gagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagcttcccgatagattaa 26060536  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  26060535 caaagtaactctacccaatctcttgaccta 26060506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171901
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 12172119  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttt-tagaaaatt 234  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||        
T  12172118 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa---- 12172025  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
            ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12172024 --------gtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 12171933  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  12171932 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 12171901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15851539 - 15851393
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||      
T  15851539 aatgataaagatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtaatagtaaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaa 15851440  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    | |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  15851439 ataaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggctgttggatt 15851393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 11649426 - 11649490
Alignment:
Q  231 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 295  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11649426 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19929242 - 19929134
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaataaat-tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |    
T  19929242 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa-taaatatcgt-tccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttctttgac 19929145  T
Q  138 aaaaaggatgt 148  Q
    | |||||||||    
T  19929144 ataaaggatgt 19929134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 121
Target Start/End: Original strand, 21217350 - 21217416
Alignment:
Q  55 aagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctact 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21217350 aagtgtactaaaactatcaaagtaataataaaattcgtattcacgaggaccgttattaatttctact 21217416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Original strand, 33400075 - 33400192
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  33400075 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaggtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctgcttagcaagttcgttaaaa 33400174  T
Q  139 aaaaggatgtattaaatt 156  Q
     |||||||||| ||||||    
T  33400175 taaaggatgtaataaatt 33400192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2211004 - 2210869
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    |||||||||||||  ||||||| |   ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||      
T  2211004 aatgatagatattcagcaagtgtaaataaactatcaaagtaataataaaattcatatccacgagaaccgttgttgaattctactcaacaatttcgttaat 2210905  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggca 173  Q
      ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  2210904 ttaaaggatatattaaattgggggtggccctaggca 2210869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Original strand, 11649296 - 11649405
Alignment:
Q  132 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 228  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11649296 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 11649394  T
Q  229 aaaattagaga 239  Q
    |||||| ||||    
T  11649395 aaaatttgaga 11649405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13979437 - 13979355
Alignment:
Q  100 aggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||  || |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  13979437 aggaccgttgttaattcctacttagcaagttcgttgacataaaggatgtagtaaatttatgggttaccctaggcagttggatt 13979355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13496232 - 13495906
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13496232 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaa 13496133  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattag 236  Q
    ||||||||||| || ||  |  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| |||||    
T  13496132 aaaggatgtataaatttatattgattgtcctaggcagttgaattgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatattag 13496035  T
Q  237 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 336  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13496034 agagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctactttaacgacagattaag 13495935  T
Q  337 aaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13495934 aaagtaattatatccaatctcttgaccta 13495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39546486 - 39546161
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  39546486 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattattgaagtaataaataagatcgtat-cacgaggaccattgttaacttttactcagcaatttcattatcga 39546388  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaa-attag 236  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  39546387 aa-ggatgtattaaattcaattgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaaacaataaaagtt-ggttttaaaaatattag 39546290  T
Q  237 agagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39546289 agagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgacagattaac 39546190  T
Q  337 aaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  39546189 aaagtaactctacccaatctcttgaccta 39546161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13493181
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13493409  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  13493408 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 13493311  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493310 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 13493211  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13493210 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 13493181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10765165 - 10764838
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10765165 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 10765066  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  10765065 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 10764968  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764967 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 10764868  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10764867 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 10764838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 140 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34066489 - 34066264
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34066489 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattagag 34066390  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 338  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34066389 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaa 34066290  T
Q  339 agtaattttatccaatctcttgacct 364  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  34066289 agtaattctacccaatctcttgacct 34066264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 32505857 - 32506181
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttg----ttaacttctacttagcaatttcttta 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||    ||||||||||||   |||||||||||    
T  32505857 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccattgcatgttaacttctactcgacaatttcttta 32505956  T
Q  136 tcaaaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaat 233  Q
    ||||||||||||||| || ||  |  | |||   |||||||||        ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||    
T  32505957 tcaaaaaggatgtataaatttatattgatgcgtgaggcagttgt-------tttctaacataaacgaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatat 32506049  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506050 tatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagatt 32506149  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32506150 aacaaagtaattctacccaatctcttgaccta 32506181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 363
Target Start/End: Original strand, 16190187 - 16190503
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |   |||   | |||  | ||||||||    
T  16190187 atttgacaagtgaatcaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggactgttgttaatttttattcgacaaaaacgttaaaataaaggatg 16190286  T
Q  148 tattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 246  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16190287 tattaaattcaatggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaa-gattggttttagaaaattaaagagaagtat 16190385  T
Q  247 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaat-t 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  16190386 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaattcaagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatat 16190485  T
Q  346 ttatccaatctcttgacc 363  Q
     || ||||||||||||||    
T  16190486 atacccaatctcttgacc 16190503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1936873 - 1936549
Alignment:
Q  41 gatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||| ||| | | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  1936873 gatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaataa-ttcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaa 1936775  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||    |||||  |||||| || |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1936774 taacgatgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggttttagaaaatta 1936675  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  1936674 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatctagcttcacgaaagattaa 1936575  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttga 361  Q
    |||||||| | || | ||||||||||    
T  1936574 caaagtaactctaccaaatctcttga 1936549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 115 - 365
Target Start/End: Original strand, 27282183 - 27282434
Alignment:
Q  115 ttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaat 212  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |  | |||||||||    
T  27282183 ttctactcagcaatttctttataaaaaaa-atgtattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaatgtaaataaaacaat 27282281  T
Q  213 aaaagtttggtttta-gaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 311  Q
     |||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27282282 taaa-attggttttatgaatattagagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatga 27282380  T
Q  312 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27282381 ttatctagttcaacgaccgattaacaaagtaattctacccaatctcttgaccta 27282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15297559 - 15297251
Alignment:
Q  53 gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtatta 152  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  15297559 gcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaaatgaattcatatccacggggaccgttgttaacttctacaaagcaatttcattatc-aaaatgatgtatta 15297461  T
Q  153 aattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggtta 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||  || ||||   || ||||| ||||||  |||||| | | |||||| |||||  |||| |||    
T  15297460 aattcaaggttgccctaagcagttggattagtttttgt--aacaaactatttgaaaacgataaaaacttggttct-ggaaattaaagagaaatatgatta 15297364  T
Q  252 agaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatcc 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15297363 agaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcac-cccaattcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctaccc 15297265  T
Q  352 aatctcttgaccta 365  Q
    ||||||||||||||    
T  15297264 aatctcttgaccta 15297251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21153400 - 21153174
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaacaataaaag-tttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||   |||||||||| |||| |||||||||||||| |||      
T  21153400 aaaggatgtattaaatttatggttgccctaggcagttggattagttttttgtaacattaactatttaaaacaatcaaagctttggttttagaaa-ttaat 21153302  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacagattaaca 21153202  T
Q  338 aagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
     ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21153201 cagtaattctactcaatctcttgaccta 21153174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 365
Target Start/End: Original strand, 22456594 - 22456818
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||   |||||| | ||||||| |||||| | |||| ||| |    
T  22456594 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccataggcagttggattggtttttataaa-taaactatttaaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaa 22456691  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  22456692 gagaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaaca 22456790  T
Q  338 aagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22456791 aagtaattctacccaatctcttgaccta 22456818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 49148042 - 49147825
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||     ||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| ||    
T  49148042 aaaggatgtattaaattcaaaagttgccctaggcagttggattggtttttataaataaattattttaaaacgataaaagcttggttctggaaa-ttaaag 49147944  T
Q  239 agatgta-tggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  49147943 agaaaaaatggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta-ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaaca 49147845  T
Q  338 aagtaattttatccaatctc 357  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  49147844 aagtaattctacccaatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 34552438 - 34552582
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |     
T  34552438 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagtttgttaaaat 34552537  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  34552538 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 34552582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49716735 - 49716591
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  49716735 tgatagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 49716636  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  49716635 taaaggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttggatt 49716591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49720214 - 49720073
Alignment:
Q  43 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 141  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||    
T  49720214 tagataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataa 49720115  T
Q  142 aggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||| |||| ||||||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  49720114 agggtgtagtaaattttatgggttgccctaggtagttggatt 49720073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8435380 - 8435280
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaac-ggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||   || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8435380 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaaagttggtttttagaaaattagag 8435281  T
Q  239 a 239  Q
    |    
T  8435280 a 8435280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 365
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453462
Alignment:
Q  318 agtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgaccta 22453462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6206245 - 6206101
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||| |||| ||||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  |     
T  6206245 tgataaatatttagcaagtgtactaaaattatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaat 6206146  T
Q  140 aaaggatgtattaaatt---caaggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||| ||||||   || |||||||||||| |||| ||||    
T  6206145 aaaggatgtagtaaatttgacagggttgccctaggtagttcgatt 6206101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18392747 - 18392669
Alignment:
Q  50 ttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 127  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18392747 ttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 18392669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 365
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990415
Alignment:
Q  311 attatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgaccta 23990415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Original strand, 50196715 - 50196804
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaat 128  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50196715 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaaactattgaagtaataataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaatctcaacttagcaat 50196804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Original strand, 11666755 - 11666803
Alignment:
Q  35 atgaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa 83  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  11666755 atgaatgatagatttttagcaagtctaccaaaactatcgaagtaataaa 11666803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 39 - 366
Target Start/End: Original strand, 14616428 - 14616756
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  14616428 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14616527  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | || ||||||| |||||  |||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| ||||    
T  14616528 aaaaggatgtatgaatttatattgattaccctaggaagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgattttaagaatatta 14616625  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616626 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 14616725  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgacctat 366  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14616726 caaagtaattctacccaatctcttgacctat 14616756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Original strand, 7649940 - 7650268
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  7649940 aatgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatc 7650039  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 234  Q
    ||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| |||    
T  7650040 aaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttgcttttaagaatatt 7650137  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7650138 agagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatctagtttaaagatagatta 7650237  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||| |||||    
T  7650238 acaaggtaattctactcaatctctttaccta 7650268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34406094 - 34405767
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  34406094 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 34405995  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  34405994 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tgtgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 34405897  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405896 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 34405797  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34405796 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 34405767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22160003 - 22159663
Alignment:
Q  29 aagatgatgaatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22160003 aagatgaagcatgatagatatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaa 22159905  T
Q  128 tttctttatcaaaaaggatgtat--taaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggt 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  ||||||||||||| || | |    
T  22159904 tttctttgtcaaaaaggatgtatattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaaattggtt 22159805  T
Q  224 tttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttta 323  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |    
T  22159804 ttaagaatattagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagttcaatcaatgactatctagttca 22159705  T
Q  324 acgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  22159704 acgatagattaacaaagtaactctacccaatctcttgaccta 22159663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33575331 - 33575011
Alignment:
Q  43 tagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaa 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  33575331 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaa 33575233  T
Q  142 aggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaattaga 237  Q
    ||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| |||||||| ||    
T  33575232 aggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-ga 33575136  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 336  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  33575135 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 33575036  T
Q  337 aaagtaattttatccaatctcttga 361  Q
      ||||||| || ||||||||||||    
T  33575035 ttagtaattctacccaatctcttga 33575011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532528
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 15532298  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 233  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  15532299 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 15532396  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 332  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15532397 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagat 15532495  T
Q  333 taacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15532496 taacttagtaattctacccaatctcttgaccta 15532528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 42 - 365
Target Start/End: Original strand, 15542384 - 15542710
Alignment:
Q  42 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15542384 atagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaa 15542482  T
Q  141 aaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaatta 235  Q
    |||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  ||||||||     
T  15542483 aaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatt- 15542579  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15542580 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagatta 15542679  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15542680 acttagtaattctacccaatctcttgaccta 15542710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 296
Target Start/End: Original strand, 11988864 - 11989125
Alignment:
Q  42 atagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttcta--cttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||  |    
T  11988864 atagatatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagta 11988962  T
Q  139 aaaaggatgtat--taaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    | ||||| ||||  ||||||||| | | |||||||||||||  |||   ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11988963 ataaggacgtatattaaattcaatggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgattttagaaaatta 11989062  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcc--tatggtaatttgcactcc 296  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11989063 gagagaagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctatatggtaatttgcactcc 11989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 365
Target Start/End: Original strand, 26712516 - 26712669
Alignment:
Q  212 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26712516 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26712615  T
Q  312 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26712616 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttgaccta 26712669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 365
Target Start/End: Original strand, 26982254 - 26982407
Alignment:
Q  212 taaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26982254 taaaagattggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatga 26982353  T
Q  312 ttatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26982354 ttatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttgaccta 26982407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21680721 - 21680585
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  21680721 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 21680622  T
Q  140 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 175  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21680621 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 21680585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 2499762 - 2499905
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaac-tatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  2499762 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagatatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 2499861  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  2499862 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaagcagttggatt 2499905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33921459 - 33921343
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33921459 tgatagatattcggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33921360  T
Q  140 aaaggatgtattaaatt 156  Q
     ||||||||||||||||    
T  33921359 taaggatgtattaaatt 33921343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 1810197 - 1810326
Alignment:
Q  47 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 145  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||  | ||||||    
T  1810197 tatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtattcacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaagga 1810296  T
Q  146 tgtattaaattca-aggttgccctaggcag 174  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  1810297 tgtagtaaatttatgggttgccctaggcag 1810326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Original strand, 26711464 - 26711567
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26711464 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26711561  T
Q  139 aaaagg 144  Q
    ||||||    
T  26711562 aaaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Original strand, 26981201 - 26981304
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26981201 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattatca 26981298  T
Q  139 aaaagg 144  Q
    ||||||    
T  26981299 aaaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36331074 - 36330992
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaattt 130  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||  ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36331074 atttgacaagtgtacctaatctatcgaagtaataataaaatttgcatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaattt 36330992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 36842937 - 36843264
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  36842937 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaattatcgaagtaataaataagatcgaatccacaaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgttatcga 36843036  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaagg--ttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggtttta-gaaaatta 235  Q
    || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  36843037 aa-ggatgtattaaattcaatggtttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaaag-ttggttttatgaatatta 36843134  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctacttcaatcaatgattatctagttcaacgacagattaa 36843234  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  36843235 caaattaactctacccaatctcttgaccta 36843264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6967066
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 6967294  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  6967293 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 6967196  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6967195 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgatagattaa 6967096  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  6967095 caaagtaattctacccaatctcttaaccta 6967066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17866680
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 17866452  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||||||||||||||   ||   ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  17866453 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgt--tttgtaacataaacgtaaataaaacaataaaagttggttttcagaatatta 17866550  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866551 gagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttaacgacagattaa 17866650  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17866651 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 17866680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9766046 - 9765710
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  9766046 tgatagatatttggcaagttaaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgaatccataagggccgttgttaatttctactcagcattttctttatcga 9765947  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  9765946 aaaggatgtattaaatttctggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacataaataaaataataaaagttggttttaagaatattagag 9765847  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacga---------ca 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||         ||    
T  9765846 agaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgattatctagtttcacgagtttcacggca 9765747  T
Q  330 gattaacaaagtaattttatccaatctcttgacctat 366  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9765746 gattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctat 9765710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24783654 - 24783327
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcttt-atca 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  24783654 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttttatca 24783555  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||| || |||||||||  |||   ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  24783554 aaaaggatgtataaatttatattgattgtccaaggcagttgagttgt--tttgtaacataaacttaaataaaacaataaaagttggttttaagaatatta 24783457  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24783456 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaattcaatcaatgattatctagtttaacgagagattaa 24783357  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24783356 caaagtaattatacccaatctcttgaccta 24783327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 365
Target Start/End: Original strand, 3861906 - 3862225
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |  | ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  3861906 atgatagatatttggcaagtgtactagagtcaatcgaagtaataaataattt-gtatccacgaggattgttattaacttctacttagcaatttcattatt 3862004  T
Q  138 aaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattg-gcatttgtaaaataaacggatt-aaaacaataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3862005 aaaa-ggatgtattaaattcaatgatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaaaacaataaaagattggttttataaaatta 3862103  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3862104 gagagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcctaattcaagaaatgattatctagttcaacgacagattaa 3862195  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3862196 caaagtaattctacccaatctcttgaccta 3862225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 204 - 365
Target Start/End: Original strand, 17863260 - 17863421
Alignment:
Q  204 taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattca 303  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17863260 taaaacaataaaagttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaattca 17863359  T
Q  304 atcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17863360 agcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgaccta 17863421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 140 - 365
Target Start/End: Original strand, 23313361 - 23313587
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23313361 aaaggatgtattaaattcaagggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggttttagaaaattagag 23313460  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 338  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||     
T  23313461 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggttcacaacatattaacac 23313560  T
Q  339 agtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
     |||| | || ||||||||||| ||||    
T  23313561 tgtaactctacccaatctcttggccta 23313587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 295106 - 294787
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  295106 tgatggatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aaatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 295008  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    ||||||||||| |||||| |   |  ||||| ||||||| |  |||   ||||||| |||| | | |||||| |||  || | ||||||||||||||||     
T  295007 aaaaggatgtaataaatttatattgatgcccgaggcagtag--ttgt--tttgtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggttttagaaaatt- 294913  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaa 335  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  294912 gagagaagtatggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaa 294813  T
Q  336 caaagtaattttatccaatctcttga 361  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  294812 caaagtaattatacccaatctcttga 294787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 139 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23108133 - 23107935
Alignment:
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  |||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23108133 aaaaggatgtatttaattcaaggatgtcctagacagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 23108034  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaac 336  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23108033 gagaaatgtggttaagaccttcgaatcatccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaaacaatgattatttagtttcacaacagattaac 23107935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Original strand, 46846367 - 46846639
Alignment:
Q  96 cacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaa 193  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||  |||  ||      
T  46846367 cacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttga-attcttatt 46846465  T
Q  194 ataaacggattaaaa--caataaaagtttgg-ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttg 290  Q
    |||||| || |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846466 ataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttg 46846564  T
Q  291 cactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||    
T  46846565 cactcctagttcaatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaataattctacccaatctcttgaccta 46846639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11279730 - 11279401
Alignment:
Q  46 atatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  |||| || | ||| |||||  |  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11279730 atatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa--aatttgtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaagg 11279633  T
Q  145 atgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaac--aataaaagtttggttttagaaaattagagag 240  Q
    |||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||| ||||||||   ||||||  || | |||||||| ||| |||||    
T  11279632 atgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaactgattaaaaacgaataaagattggtttttagaagatt-gagag 11279535  T
Q  241 atgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaag 340  Q
    | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  11279534 aagtatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagttcaataaatgattatttagtttcacgacagattaacttag 11279435  T
Q  341 taattttatccaatctcttgacctatgcttctcc 374  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
T  11279434 taattctacccaatctcttgacctaggattctcc 11279401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 365
Target Start/End: Original strand, 36222378 - 36222635
Alignment:
Q  110 ttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaa 207  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||| ||| |||||| |||||||    
T  36222378 ttaatttctacgtagcaatttcattattaaaaaggatgtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttctaacataaactgattaaa 36222476  T
Q  208 a-caataaaagtttggtttt-agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaat 305  Q
    | |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  36222477 aacaaagaaagattggtttttagaagatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagttcaat 36222575  T
Q  306 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  36222576 caatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaattttacctaatctcttgaccta 36222635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33313241 - 33312913
Alignment:
Q  38 aatgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 136  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33313241 aatgatagatatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaa--aattcgtttctacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattat 33313145  T
Q  137 caaaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaa 232  Q
     ||||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||| |  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  33313144 taaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggttttagaaaa 33313046  T
Q  233 ttagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 332  Q
    |  ||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  33313045 tctgagagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaattcaatcaatgattatttagtttcacgacgaat 33312946  T
Q  333 taacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  33312945 taacttagtaattctacccaatcttttgaccta 33312913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 23759609 - 23759936
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || | |    
T  23759609 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaa-aagttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatttt-a 23759706  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt--agaaaat 233  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||  |||||||    
T  23759707 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaat 23759804  T
Q  234 tagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagat 332  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  23759805 c-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggat 23759903  T
Q  333 taacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23759904 taacttagtaattctacccaatctcttgcccta 23759936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 3540924 - 3541065
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  |     
T  3540924 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaacttctacttagcaagttcgttaaaat 3541023  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||    
T  3541024 aaaggatgtattaatttatgggttgccctaagcagttggatt 3541065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Original strand, 17857879 - 17857991
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatc 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17857879 atgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaaatagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 17857978  T
Q  138 aaaaaggatgtat 150  Q
    |||||||||||||    
T  17857979 aaaaaggatgtat 17857991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38431757 - 38431614
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |    
T  38431757 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccatgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttagttaaaa 38431658  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38431657 taaaggatgtagtaaatttatgggttgccctaggcagttggatt 38431614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Original strand, 28577687 - 28577820
Alignment:
Q  49 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| || ||| |||||    
T  28577687 tttggcaagtgtaccaaaactatcgaagcaataatcaaattcatatctacgaggaccgttgttaacttctactcaataatttcattaacataaa-gatgt 28577785  T
Q  149 attaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 183  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28577786 attaaatttatggttgtcctagacagtttgattgg 28577820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6964644 - 6964508
Alignment:
Q  47 tatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaagga 145  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  | ||||||    
T  6964644 tatttggtaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaatgaagttcgtatccacgagggccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 6964545  T
Q  146 tgtattaaattca-aggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  6964544 tgtagtaaatttatgggttgccctaggtagttggatt 6964508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16547267 - 16547225
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16547267 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16547225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 16618395 - 16618437
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaagg-ttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16618395 aaaggatgtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatt 16618437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 359
Target Start/End: Original strand, 12575300 - 12575620
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||| |    
T  12575300 tgataaatatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattatta 12575398  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||   ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12575399 aaaaggatgtattaaattcaatggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggttttagaaaattaga 12575498  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaaca 337  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12575499 gagaagtatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaattcaagcaatgataatctagtttaacgacagattaaca 12575598  T
Q  338 aagtaattttatccaatctctt 359  Q
    |||||||| || | ||||||||    
T  12575599 aagtaattctacctaatctctt 12575620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14418707 - 14418445
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14418707 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 14418610  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  14418609 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 14418512  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14418511 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 14418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Original strand, 41778847 - 41779068
Alignment:
Q  144 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattagagagat 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||     
T  41778847 gatgtattaaattcaagggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt-agaagattaaagagaa 41778945  T
Q  243 gtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 342  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||    
T  41778946 gtatggttaagaccttcaaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaattcaaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaata 41779045  T
Q  343 attttatccaatctcttgaccta 365  Q
    | | || ||||||||||||||||    
T  41779046 actctacccaatctcttgaccta 41779068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13097099 - 13096940
Alignment:
Q  205 aaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  13097099 aaaacaataaaagattagttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctat-gtaatttgcactcctaatttaa 13097001  T
Q  305 tcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
     |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13097000 gcaatgattatctagttcaatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggccta 13096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44008360 - 44008245
Alignment:
Q  219 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  44008360 ttggttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagttcaaacaatgattattta 44008261  T
Q  319 gtttaacgacagatta 334  Q
    |||| |||| ||||||    
T  44008260 gtttcacgatagatta 44008245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 39659712 - 39659856
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  39659712 tgatagatatttggcaagtgtaccgaaactatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 39659811  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  39659812 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 39659856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9467429 - 9467286
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  |    
T  9467429 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttcttcttagcaagttcgttaaaa 9467330  T
Q  139 aaaaggatgtattaaat---tcaaggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     |||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9467329 taaaggatgtagtaaatttatcaa--ttgccctaggcagttggatt 9467286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 41836415 - 41836479
Alignment:
Q  231 aattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 295  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41836415 aatttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 453951 - 453807
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  453951 tgatagatatttgacaagtgtaccaaaaactatggaagtactaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 453852  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa--ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     ||||||| || ||||||  |  |||||||| |||||||||||||    
T  453851 taaaggatttagtaaattttatgggttgccccaggcagttggatt 453807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13332429 - 13332308
Alignment:
Q  63 caaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaa--- 159  Q
    |||||||||| ||||| |||  || || |||| || ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||  |       
T  13332429 caaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccatgaggaccgttgttaatttatacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaattttatgg 13332330  T
Q  160 ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13332329 ggttgccctaggcagttggatt 13332308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Original strand, 41836285 - 41836394
Alignment:
Q  132 tttatcaaaaaggatgtattaaattcaa-ggt-tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttag 228  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41836285 tttagcaataaggatgtataaaattcaatggtgtgccctaggcagttgagttgacttttgtaatataaacgaaataaaaacaataaaag-ttggttttag 41836383  T
Q  229 aaaattagaga 239  Q
    |||||| ||||    
T  41836384 aaaatttgaga 41836394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14418435 - 14418396
Alignment:
Q  232 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14418435 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 14418396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13979730 - 13979405
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13979730 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaactatcgaagtaataaataaaatcgaatccacgaggactgctgttaatttctactcagcaatttctttatcga 13979631  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggat-taaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    || |||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||  ||  |||| |||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  13979630 aa-ggatgtattaaatatctggttgcccaaggcagttggattggttttaataaagtaaacgtaaataaaacaataaaagttggttttaagaatattagag 13979532  T
Q  239 agatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaa 338  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||      
T  13979531 agaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactccaagttcaaacaatgattatttagtttcatgacagattaactt 13979432  T
Q  339 agtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13979431 agtaactctatccaatcccttgaccta 13979405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 22626312 - 22626638
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22626312 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 22626410  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||||     
T  22626411 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggatttagaaaatt- 22626507  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22626508 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 22626607  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626608 acttagtaattctatccaatctcttgaccta 22626638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46731559 - 46731414
Alignment:
Q  219 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46731559 ttggttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaattcaatcaatgattatcta 46731460  T
Q  319 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgacct 364  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  46731459 gttcaacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttgacct 46731414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 39563510 - 39563837
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  39563510 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaa-aaattcgtttccacgaggactgta-ttaacttctacttagcaatttcattataa 39563607  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaaggt--tgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggatt--aaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 234  Q
    |||||||||| | ||||| |   |  |||||||||||||||  |||   ||||||| ||||||  | |  |||| | |||||| |||||||||||||||     
T  39563608 aaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgat-tttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggttttagaaaatc 39563706  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  39563707 tgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaattcaatcaatggttatttagtttcacgacagatta 39563806  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  39563807 acttagtaattctacccaatctcttgaccta 39563837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 46731699 - 46731556
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46731699 tgatagagatttggcaagtgaacaaaaactatcgaagtaatgaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttctttatcaa 46731600  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattgg 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46731599 aaaggatgtattaaactcaaggttgccctaggcagttggattgg 46731556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11138896
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaa-aagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 11138668  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaatta 235  Q
    |||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| ||||| |   |||| || ||||||||     
T  11138669 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattcagaaaatt- 11138765  T
Q  236 gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatta 334  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11138766 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggatta 11138865  T
Q  335 acaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11138866 acttagtaattctatccaatctcttgaccta 11138896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35366562 - 35366295
Alignment:
Q  97 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaata 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||    
T  35366562 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcattat-aaaaaggatgtattaaattttaggttgccctaggcagtcgagttggtatttgtaacata 35366464  T
Q  197 aacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcact 294  Q
    ||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||||||||| |||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||||     
T  35366463 aactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaattaatgagaaaaatatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcac- 35366366  T
Q  295 ccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    || ||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  35366365 cccaattcaatcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgaccta 35366295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 234
Target Start/End: Original strand, 20536333 - 20536530
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaat--tcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttat 136  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20536333 tgatagatatttggaaagtgtaccaaaaactattgaagtagtaaataaaagatcgtatccacgaggactgtatttaacttctacttagaaatttcattat 20536432  T
Q  137 caaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaatt 234  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20536433 taaaaaggatgtagtaaattcaagggtgccctaggcagttgggttgacttgtgtaacacaaacgtaataaaacaataaaagttggtttatagaaaatt 20536530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47412368 - 47412101
Alignment:
Q  91 gtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgt 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| || | |  |||| ||||||    
T  47412368 gtatccacgaggaccgttgttaactt-------gcaatttcattatcaaaa-ggatgtattaaatttcaggttgctctagacaatcgagttggtatttgt 47412277  T
Q  191 aaaataaacggattaaa-acaataaaagtttggttttagaaaatta-gagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatt 288  Q
    || |||||| |  |||| ||  |||||| ||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||    
T  47412276 aacataaactgtgtaaagacggtaaaag-ttggttttagaaaataatgagaaaaatatgattaagacctttgaatcctctaatgttcttctacggtaatt 47412178  T
Q  289 tgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||    
T  47412177 tgcacccacaattcaatcaatgttcatctaatttaacaacagattaacacgataattctactcaatctcttgaccta 47412101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19869343 - 19869226
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  19869343 tgatagatatttggcaagtgtactaaaatctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 19869244  T
Q  139 aaaaggatgtattaaatt 156  Q
     |||||||||| ||||||    
T  19869243 taaaggatgtagtaaatt 19869226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27055237 - 27055092
Alignment:
Q  39 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  27055237 atgataaatatttggcaagcataccaaaactatcgaagtagtaataaatttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaa 27055138  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
     ||| |||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  27055137 taaaagatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 27055092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25492263 - 25492128
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |    
T  25492263 tgatagataattgacaagtgtaccaaaagctatcaaaatagtaataaagttcgtatccacgaggatcgttgttaatttctacttagcaagttcattaaaa 25492164  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggca 173  Q
     ||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  25492163 taaaagatgtagtaaatttatgggttgccctaggca 25492128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46542683 - 46542550
Alignment:
Q  46 atatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa--taaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaag 143  Q
    |||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||    |||     
T  46542683 atatttggtaagtgcagaaaaattatcaaagtaataaaattaaattcgtatctacgaggactgttattaatttctatttagcaatttcattaatgtaaaa 46542584  T
Q  144 gatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttgg 178  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  46542583 gatgtattaaatt-ggggttgccctaggcagttgg 46542550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50096925 - 50096825
Alignment:
Q  140 aaaggatgtattaaattcaaggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacg-gattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagag 238  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||   ||||||| |||||||  || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  50096925 aaaggatgtattaaattcaagagtgccctaagcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacagtaaaagttggtttttagaaaattagag 50096826  T
Q  239 a 239  Q
    |    
T  50096825 a 50096825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Original strand, 26822039 - 26822130
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttc 131  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  26822039 tgatagacttttggaaagtgtaccaaaactatcgaagtaataataaaattcgtatccacaaggaccgctgttaatttttactcaacaatttc 26822130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3306213 - 3306147
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3306213 tgatagatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 3306147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18883575 - 18883509
Alignment:
Q  40 tgatagatatttg-gcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 104  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18883575 tgatagatattttagcaagtgtactaaaactatcaaagtagtaaaataagttcgtattcacgaggac 18883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 104
Target Start/End: Original strand, 30157797 - 30157863
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaa-aactatcaaagtaataaa-taaattcgtattcacgaggac 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30157797 tgatagaaatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 30157863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 181
Target Start/End: Original strand, 36036817 - 36036854
Alignment:
Q  145 atgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36036817 atgtattaaattcaatggttgccctaggcagttggatt 36036854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Original strand, 11 - 273
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11 tgatagatttttggcaagtgaaccaaagctatcgaagtagtaaataa-ttcgt-tccacgaggaccgttgttaactacaacttagcaatttctttatcaa 108  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggttttagaaaattaga 237  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  109 aaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttgg--tttttaacataaacaaattaaaaacaataaaagttggttttaagaatattaga 206  T
Q  238 gagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaa 304  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  207 gagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaattcaa 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 271
Target Start/End: Original strand, 283 - 322
Alignment:
Q  232 attagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaa 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  283 attagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaa 322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 365
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2930
Alignment:
Q  48 atttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatg 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2627 atttggcaagtggaccaaaactatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttcgttatc-aaaaggatg 2725  T
Q  148 tattaaattcaa-ggttgccctaggcagttggattggcatttgtaaaataaacggattaaaacaataaaagtttggttttagaaaattagagagatgtat 246  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||| | || |             |||||| |||||| ||||    
T  2726 tattaaattcaattgttgcccaaggaagttggattggtttttgtaacatgaacggattaaaa-actata-------------aaaatttgagagaagtat 2811  T
Q  247 ggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattt 346  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||   |||||||     
T  2812 cgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagttcaatcaatgattatatagtttcacgaaagattaaggtagtaattc 2911  T
Q  347 tatccaatctcttgaccta 365  Q
    || | ||||||||||||||    
T  2912 taccaaatctcttgaccta 2930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10109 - 9781
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||  ||||||| | | |  |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10109 tgatagaaatttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 10010  T
Q  139 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 234  Q
    |||||||||||| || ||  |  | | |||||||||||||  |||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  10009 aaaaggatgtataaatttatattggtcccctaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaatt 9912  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  9911 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 9813  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  9812 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6133
Alignment:
Q  223 ttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatctagttt 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||    
T  5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaattcaaacaatgattatctaggtt 6094  T
Q  323 aacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttga 361  Q
     |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||    
T  6095 cacgacagattaacacaataactctacccaatctcttga 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 24185 - 24510
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatca 138  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || | ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  24185 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaa-taaatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattatta 24283  T
Q  139 aaaaggatgtattaaat-tcaaggttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaa-caataaaagtttggtttt-agaaaatt 234  Q
    |||||||||||| || | | |  | |||||||||||||||  |||  |||| ||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  24284 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttg--atttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 24379  T
Q  235 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcc-aaattcaatcaatgattatctagtttaacgacagatt 333  Q
     |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  24380 -gagagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggatt 24478  T
Q  334 aacaaagtaattttatccaatctcttgaccta 365  Q
    |||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  24479 aacttagtaattctacccaatctcttgaccta 24510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 7173 - 7316
Alignment:
Q  219 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 318  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7173 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaattcaatcaatgattattta 7272  T
Q  319 gtttaacgacagattaacaaagtaattttatccaatctcttgac 362  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  7273 gtttcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttgac 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2641
Alignment:
Q  219 ttggttttagaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactccaaattcaatcaatgattatcta 318  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2758 ttggttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaattcaatcaatgattattta 2659  T
Q  319 gtttaacgacagattaac 336  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2658 gtttcacgacagattaac 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 19509 - 19653
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  19509 tgataaatatttggcaagtgtaccaaaactgtcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 19608  T
Q  140 aaaggatgtattaaattcaa---ggttgccctaggcagttggatt 181  Q
    |||||||||| ||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  19609 aaaggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatt 19653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 175
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33866
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |     
T  33730 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaat 33829  T
Q  140 aaaggatgtattaaattca-aggttgccctaggcagt 175  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  33830 aaaggatgtactaaatttatgggttgccctaggcagt 33866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0766 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0766
Description:

Target: scaffold0766; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3739 - 3613
Alignment:
Q  49 tttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttctttatcaaaaaggatgt 148  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  | ||| |||||    
T  3739 tttggcaagtgtaccaattctatcgaagtaataaa---atttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttaattaagataaatgatgt 3643  T
Q  149 attaaattcaaggttgccctaggcagttgg 178  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3642 attaaattcaggattaccctaagcagttgg 3613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10296 - 10253
Alignment:
Q  40 tgatagatatttggcaagtgaaccaaaactatcaaagtaataaa 83  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10296 tgatagatatttagcaagtgtactaaaactatcaaagtaataaa 10253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University