View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13163_low_4 (Length: 438)

Name: NF13163_low_4
Description: NF13163
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13163_low_4
NF13163_low_4
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (1-431)||(42805368-42805798)
chr7 (111-294)||(47716413-47716596)
chr7 (111-295)||(21172008-21172188)
chr7 (111-265)||(46354148-46354302)
chr7 (111-297)||(42798623-42798807)
chr7 (110-294)||(2541019-2541202)
chr7 (111-296)||(43557426-43557612)
chr7 (110-296)||(32758214-32758396)
chr7 (109-294)||(48735122-48735304)
chr7 (129-293)||(11617589-11617751)
chr7 (118-294)||(10693073-10693245)
chr7 (119-296)||(27629596-27629771)
chr7 (139-296)||(42391098-42391251)
chr7 (129-296)||(19426888-19427052)
chr7 (131-290)||(33871914-33872070)
chr7 (158-296)||(7879639-7879775)
chr7 (109-292)||(35334818-35334997)
chr7 (110-293)||(42476826-42477005)
chr7 (295-431)||(42763053-42763192)
chr7 (111-294)||(22698967-22699151)
chr7 (117-295)||(40463837-40464012)
chr7 (109-296)||(34626206-34626390)
chr7 (111-296)||(47077853-47078034)
chr7 (133-293)||(16341254-16341413)
chr7 (133-293)||(29907393-29907552)
chr7 (133-294)||(23419674-23419833)
chr7 (133-296)||(19265791-19265950)
chr7 (115-294)||(14732821-14732999)
chr7 (133-285)||(28362155-28362304)
chr7 (148-296)||(38262194-38262340)
chr7 (107-230)||(12473254-12473377)
chr7 (158-292)||(18512455-18512586)
chr7 (158-295)||(31591108-31591241)
chr7 (1-108)||(42762967-42763070)
chr7 (143-293)||(18747472-18747621)
chr7 (133-293)||(3469176-3469338)
chr7 (112-215)||(18326989-18327091)
chr7 (140-296)||(32233133-32233286)
chr7 (111-284)||(2662946-2663112)
chr7 (112-280)||(5180169-5180337)
chr7 (111-215)||(7193039-7193143)
chr7 (112-254)||(8148985-8149126)
chr7 (161-285)||(21566439-21566562)
chr7 (136-293)||(11741774-11741927)
chr7 (129-235)||(1423967-1424073)
chr7 (120-273)||(19266414-19266564)
chr7 (110-275)||(28078151-28078313)
chr7 (133-270)||(48123508-48123643)
chr7 (109-212)||(42495916-42496018)
chr7 (133-250)||(14099050-14099165)
chr7 (133-250)||(14409067-14409182)
chr7 (132-295)||(39123865-39124031)
chr7 (132-249)||(7644931-7645047)
chr7 (132-296)||(13805077-13805237)
chr7 (179-286)||(38604549-38604654)
chr7 (209-296)||(27889314-27889399)
chr7 (182-295)||(35787268-35787378)
chr7 (116-214)||(7794582-7794682)
chr7 (111-203)||(21447544-21447636)
chr7 (158-249)||(35203440-35203531)
chr7 (187-296)||(1408487-1408594)
chr7 (134-230)||(6736867-6736962)
chr7 (209-294)||(45018923-45019010)
chr7 (133-279)||(42101899-42102044)
chr7 (133-214)||(5814447-5814528)
chr7 (114-296)||(25198679-25198863)
chr7 (247-296)||(36602535-36602584)
chr7 (200-297)||(39093436-39093532)
chr7 (193-297)||(13792147-13792250)
chr7 (187-294)||(23231587-23231692)
chr7 (200-291)||(33500556-33500645)
chr7 (179-292)||(27697459-27697572)
chr7 (232-297)||(23618974-23619039)
chr7 (120-229)||(44123685-44123792)
chr7 (132-224)||(22065563-22065654)
chr7 (114-214)||(29140438-29140538)
chr7 (232-296)||(45811920-45811983)
chr7 (263-296)||(44171635-44171668)
chr7 (194-250)||(17048859-17048914)
chr7 (188-295)||(23065924-23066029)
chr7 (188-283)||(25434050-25434144)
chr7 (188-281)||(21139761-21139851)
chr7 (243-291)||(42495865-42495913)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (111-295)||(20004089-20004273)
chr1 (117-295)||(30395725-30395903)
chr1 (111-296)||(46991781-46991964)
chr1 (111-296)||(18944620-18944806)
chr1 (110-295)||(34725097-34725278)
chr1 (111-296)||(46247951-46248134)
chr1 (111-295)||(10668197-10668386)
chr1 (110-296)||(27201623-27201809)
chr1 (111-295)||(32632556-32632737)
chr1 (109-295)||(14617013-14617197)
chr1 (129-289)||(23768325-23768483)
chr1 (153-295)||(35005142-35005284)
chr1 (116-297)||(18741954-18742137)
chr1 (111-296)||(38478280-38478461)
chr1 (111-296)||(45812535-45812716)
chr1 (108-292)||(19932755-19932936)
chr1 (130-296)||(6925096-6925260)
chr1 (111-296)||(47214488-47214669)
chr1 (105-295)||(41319805-41319993)
chr1 (115-295)||(19414420-19414596)
chr1 (116-296)||(45402077-45402256)
chr1 (117-295)||(12126836-12127010)
chr1 (110-296)||(8197019-8197203)
chr1 (110-295)||(27474257-27474439)
chr1 (136-300)||(9939463-9939628)
chr1 (133-274)||(18724565-18724704)
chr1 (133-294)||(35117765-35117927)
chr1 (148-297)||(35253184-35253329)
chr1 (195-294)||(4349699-4349796)
chr1 (134-272)||(25468285-25468421)
chr1 (134-296)||(19701570-19701731)
chr1 (133-296)||(35019229-35019389)
chr1 (158-282)||(45264411-45264534)
chr1 (133-284)||(2435796-2435946)
chr1 (179-296)||(23796510-23796625)
chr1 (179-296)||(31382212-31382326)
chr1 (220-296)||(50606487-50606563)
chr1 (187-296)||(1517309-1517417)
chr1 (133-284)||(27136661-27136811)
chr1 (133-274)||(11596512-11596650)
chr1 (166-292)||(22324925-22325049)
chr1 (198-296)||(42304205-42304303)
chr1 (132-295)||(6983810-6983969)
chr1 (134-291)||(39214961-39215117)
chr1 (200-296)||(43768205-43768299)
chr1 (134-285)||(44485119-44485267)
chr1 (132-292)||(15511150-15511311)
chr1 (132-297)||(20036218-20036381)
chr1 (111-249)||(22930114-22930248)
chr1 (114-264)||(25290143-25290300)
chr1 (199-291)||(10378738-10378828)
chr1 (120-249)||(17470390-17470517)
chr1 (136-240)||(22327101-22327204)
chr1 (133-245)||(33222983-33223093)
chr1 (133-296)||(50811938-50812100)
chr1 (131-230)||(4430088-4430187)
chr1 (179-280)||(43207540-43207640)
chr1 (110-185)||(34714599-34714674)
chr1 (190-295)||(20999849-20999952)
chr1 (112-230)||(24564322-24564440)
chr1 (197-287)||(31442396-31442485)
chr1 (133-231)||(50760287-50760385)
chr1 (179-295)||(19656104-19656219)
chr1 (198-297)||(6358185-6358283)
chr1 (120-202)||(2435983-2436064)
chr1 (113-175)||(40424721-40424783)
chr1 (232-289)||(4587568-4587625)
chr1 (234-295)||(33594130-33594191)
chr1 (180-292)||(34679217-34679331)
chr1 (181-299)||(20169084-20169200)
chr1 (202-283)||(15505632-15505710)
chr1 (153-295)||(19974073-19974213)
chr1 (153-285)||(23371143-23371271)
chr1 (206-282)||(7074588-7074663)
chr1 (232-296)||(30555211-30555275)
chr1 (179-285)||(34148969-34149073)
chr1 (197-296)||(46859129-46859227)
chr1 (120-291)||(52910204-52910379)
chr1 (144-296)||(31272379-31272522)
chr1 (239-296)||(16120819-16120876)
chr1 (232-282)||(1693222-1693273)
chr1 (258-297)||(21773636-21773675)
chr1 (241-291)||(28894561-28894611)
chr1 (198-250)||(21910693-21910743)
chr1 (252-297)||(24564450-24564495)
chr1 (180-221)||(25027989-25028030)
chr1 (112-224)||(18335914-18336026)
chr1 (232-296)||(41440600-41440664)
chr1 (261-297)||(50760237-50760273)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (111-296)||(13730600-13730785)
chr3 (110-296)||(40272810-40272994)
chr3 (109-295)||(13628789-13628976)
chr3 (112-295)||(29366719-29366902)
chr3 (111-296)||(46421032-46421218)
chr3 (109-292)||(8247688-8247872)
chr3 (109-297)||(1217064-1217248)
chr3 (110-277)||(9607178-9607345)
chr3 (111-295)||(12914034-12914216)
chr3 (179-296)||(49013471-49013588)
chr3 (110-296)||(5173717-5173903)
chr3 (110-293)||(22609742-22609921)
chr3 (133-297)||(53996562-53996725)
chr3 (110-294)||(39203491-39203671)
chr3 (193-292)||(353351-353450)
chr3 (143-296)||(516417-516571)
chr3 (111-296)||(52926217-52926391)
chr3 (111-283)||(6411833-6412002)
chr3 (115-293)||(22122918-22123092)
chr3 (129-296)||(26869701-26869865)
chr3 (179-294)||(14987001-14987116)
chr3 (134-297)||(34420640-34420802)
chr3 (146-293)||(45139479-45139624)
chr3 (110-295)||(16735416-16735598)
chr3 (133-292)||(26573125-26573282)
chr3 (181-294)||(45786214-45786327)
chr3 (156-284)||(45948848-45948974)
chr3 (163-294)||(10795423-10795554)
chr3 (153-296)||(54374343-54374485)
chr3 (106-296)||(4495674-4495850)
chr3 (179-297)||(54484734-54484851)
chr3 (138-296)||(7942993-7943149)
chr3 (110-293)||(7696893-7697067)
chr3 (112-295)||(25517169-25517353)
chr3 (164-294)||(31592878-31593004)
chr3 (134-296)||(25944468-25944629)
chr3 (146-295)||(54032570-54032705)
chr3 (187-296)||(15797274-15797379)
chr3 (199-297)||(34771361-34771457)
chr3 (111-216)||(10870028-10870132)
chr3 (137-274)||(30928167-30928302)
chr3 (146-278)||(33926094-33926224)
chr3 (108-231)||(45620889-45621012)
chr3 (110-296)||(12525385-12525566)
chr3 (133-290)||(19731000-19731155)
chr3 (232-296)||(24851299-24851363)
chr3 (234-295)||(30452892-30452953)
chr3 (180-284)||(829452-829555)
chr3 (187-294)||(9276316-9276419)
chr3 (181-290)||(55401222-55401330)
chr3 (181-256)||(47624088-47624160)
chr3 (118-293)||(33235513-33235687)
chr3 (187-297)||(44403552-44403661)
chr3 (180-296)||(50624951-50625065)
chr3 (239-295)||(10484615-10484671)
chr3 (114-227)||(21874999-21875106)
chr3 (232-296)||(24577930-24577994)
chr3 (232-296)||(24578020-24578084)
chr3 (187-297)||(26292384-26292490)
chr3 (114-230)||(26782345-26782461)
chr3 (179-293)||(31904857-31904970)
chr3 (232-296)||(35417999-35418063)
chr3 (133-209)||(53062036-53062112)
chr3 (141-274)||(8410887-8411016)
chr3 (133-290)||(19751576-19751731)
chr3 (246-296)||(47624208-47624258)
chr3 (137-226)||(39211992-39212081)
chr3 (179-280)||(43114882-43114983)
chr3 (143-230)||(52428539-52428627)
chr3 (261-296)||(40390365-40390400)
chr3 (232-295)||(40968613-40968676)
chr3 (133-207)||(35417914-35417988)
chr3 (252-296)||(6242283-6242327)
chr3 (179-230)||(31831243-31831292)
chr3 (252-296)||(43956470-43956514)
chr3 (252-294)||(31831301-31831343)
chr3 (109-150)||(9276248-9276289)
chr3 (235-296)||(10696211-10696272)
chr3 (261-294)||(14266372-14266405)
chr3 (172-293)||(16130312-16130432)
chr3 (261-294)||(23871490-23871523)
chr3 (141-230)||(29106555-29106644)
chr3 (107-175)||(4537003-4537071)
chr3 (134-242)||(32418221-32418329)
chr3 (232-280)||(46169981-46170029)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (111-296)||(7136525-7136710)
chr8 (110-297)||(28817623-28817808)
chr8 (109-296)||(6760775-6760961)
chr8 (110-295)||(36720749-36720932)
chr8 (109-295)||(39460993-39461179)
chr8 (111-295)||(26954086-26954271)
chr8 (111-295)||(44530103-44530285)
chr8 (109-297)||(25250474-25250662)
chr8 (111-296)||(35261633-35261816)
chr8 (111-296)||(12670248-12670429)
chr8 (111-294)||(29521685-29521866)
chr8 (110-296)||(30454095-30454277)
chr8 (110-294)||(13160655-13160836)
chr8 (111-293)||(45071219-45071398)
chr8 (179-296)||(20869945-20870062)
chr8 (129-296)||(8897762-8897927)
chr8 (129-295)||(12625861-12626026)
chr8 (115-288)||(20284075-20284250)
chr8 (109-294)||(2626471-2626657)
chr8 (115-288)||(21070703-21070879)
chr8 (110-294)||(17823529-17823711)
chr8 (133-281)||(44781517-44781665)
chr8 (187-294)||(16225049-16225156)
chr8 (110-296)||(18164758-18164941)
chr8 (111-271)||(20869523-20869677)
chr8 (161-285)||(8483947-8484069)
chr8 (112-297)||(44742515-44742698)
chr8 (163-297)||(5135287-5135418)
chr8 (120-294)||(28407379-28407538)
chr8 (179-292)||(29877116-29877227)
chr8 (139-295)||(31457155-31457308)
chr8 (133-282)||(22598133-22598279)
chr8 (187-297)||(10857858-10857967)
chr8 (134-283)||(24365071-24365218)
chr8 (112-250)||(11748254-11748392)
chr8 (187-291)||(17250879-17250982)
chr8 (218-297)||(16013515-16013594)
chr8 (158-284)||(389644-389770)
chr8 (110-295)||(40604905-40605087)
chr8 (199-295)||(19729382-19729476)
chr8 (136-249)||(35105902-35106014)
chr8 (181-254)||(43942348-43942421)
chr8 (111-275)||(24245405-24245565)
chr8 (217-296)||(26102577-26102654)
chr8 (133-293)||(42083699-42083858)
chr8 (187-289)||(5689661-5689761)
chr8 (143-294)||(23000228-23000365)
chr8 (133-273)||(14017989-14018128)
chr8 (181-294)||(33866973-33867087)
chr8 (245-296)||(27468090-27468141)
chr8 (234-293)||(27507985-27508044)
chr8 (232-295)||(35107310-35107373)
chr8 (135-230)||(36918102-36918197)
chr8 (204-296)||(26457776-26457864)
chr8 (136-216)||(30962849-30962929)
chr8 (133-246)||(11000997-11001109)
chr8 (233-293)||(36486567-36486627)
chr8 (132-175)||(40607841-40607884)
chr8 (252-294)||(23286337-23286379)
chr8 (109-151)||(23286434-23286476)
chr8 (232-296)||(2351719-2351780)
chr8 (239-296)||(18595918-18595975)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (114-295)||(4619103-4619284)
chr5 (110-295)||(38879534-38879719)
chr5 (106-295)||(41014268-41014454)
chr5 (111-296)||(24448844-24449027)
chr5 (114-297)||(43334159-43334342)
chr5 (111-296)||(35710267-35710448)
chr5 (137-293)||(12006329-12006485)
chr5 (111-297)||(8169981-8170163)
chr5 (114-295)||(27328709-27328890)
chr5 (166-294)||(13801767-13801895)
chr5 (179-293)||(20135626-20135740)
chr5 (144-295)||(32703411-32703558)
chr5 (111-294)||(1565385-1565566)
chr5 (133-295)||(28516432-28516593)
chr5 (110-274)||(22600407-22600569)
chr5 (110-294)||(22187238-22187422)
chr5 (110-216)||(23974734-23974839)
chr5 (110-222)||(37024626-37024736)
chr5 (133-285)||(208936-209086)
chr5 (133-285)||(39301099-39301249)
chr5 (179-291)||(7368420-7368528)
chr5 (160-285)||(43574609-43574732)
chr5 (140-296)||(1405170-1405324)
chr5 (182-294)||(16880647-16880757)
chr5 (161-254)||(41425952-41426043)
chr5 (132-296)||(19142941-19143102)
chr5 (179-295)||(29334417-29334532)
chr5 (203-294)||(34154814-34154903)
chr5 (153-294)||(42924830-42924973)
chr5 (112-271)||(2838733-2838890)
chr5 (223-294)||(25622524-25622595)
chr5 (218-295)||(16957375-16957450)
chr5 (129-290)||(30006297-30006456)
chr5 (141-284)||(1850624-1850764)
chr5 (181-282)||(7097772-7097870)
chr5 (161-296)||(11657697-11657835)
chr5 (235-296)||(16028622-16028683)
chr5 (179-294)||(12575660-12575775)
chr5 (114-295)||(22861668-22861844)
chr5 (179-274)||(24323725-24323818)
chr5 (179-274)||(24360349-24360442)
chr5 (197-295)||(3771379-3771475)
chr5 (199-284)||(9794388-9794471)
chr5 (234-295)||(39801591-39801652)
chr5 (230-294)||(30877564-30877628)
chr5 (142-254)||(22907904-22908014)
chr5 (179-294)||(5873322-5873434)
chr5 (238-296)||(10943843-10943900)
chr5 (153-215)||(22025539-22025601)
chr5 (193-282)||(31694120-31694207)
chr5 (219-275)||(10306493-10306548)
chr5 (181-296)||(24903694-24903807)
chr5 (243-295)||(32354211-32354263)
chr5 (232-291)||(21784335-21784394)
chr5 (208-282)||(12477132-12477205)
chr5 (135-295)||(24313571-24313732)
chr5 (135-295)||(24355908-24356069)
chr5 (137-285)||(34074573-34074717)
chr5 (137-214)||(10634224-10634301)
chr5 (132-173)||(31362454-31362495)
chr5 (261-293)||(29184062-29184094)
chr5 (230-282)||(29297862-29297914)
chr5 (116-151)||(31299591-31299626)
chr5 (232-282)||(4654427-4654477)
chr5 (258-292)||(11462924-11462958)
chr5 (247-289)||(18684361-18684403)
chr5 (111-149)||(19438703-19438741)
chr5 (133-175)||(39079883-39079925)
chr5 (194-247)||(2432342-2432395)
chr5 (252-293)||(19438759-19438800)
chr5 (240-296)||(19093894-19093950)
chr5 (218-290)||(39079755-39079826)
chr5 (109-149)||(41956884-41956924)
[»] chr4 (97 HSPs)
chr4 (118-296)||(16408599-16408777)
chr4 (111-291)||(21646918-21647098)
chr4 (111-296)||(23501747-23501926)
chr4 (111-298)||(13256395-13256578)
chr4 (110-294)||(20224937-20225117)
chr4 (110-297)||(5648212-5648396)
chr4 (110-293)||(6430627-6430807)
chr4 (109-296)||(48598823-48599006)
chr4 (111-296)||(47528528-47528709)
chr4 (114-295)||(16911519-16911700)
chr4 (110-296)||(30639333-30639516)
chr4 (308-431)||(33049064-33049188)
chr4 (130-294)||(44363130-44363294)
chr4 (111-296)||(10660358-10660543)
chr4 (111-296)||(10874503-10874688)
chr4 (107-296)||(5306658-5306848)
chr4 (111-296)||(11054146-11054327)
chr4 (111-294)||(20405047-20405224)
chr4 (111-280)||(37494805-37494972)
chr4 (179-296)||(20639656-20639772)
chr4 (133-296)||(35567146-35567307)
chr4 (132-284)||(19027823-19027973)
chr4 (202-294)||(20225119-20225211)
chr4 (130-293)||(40915802-40915962)
chr4 (158-296)||(47443958-47444094)
chr4 (114-295)||(14983791-14983970)
chr4 (137-297)||(54175043-54175203)
chr4 (129-293)||(8473621-8473783)
chr4 (137-296)||(17043393-17043549)
chr4 (135-297)||(9832310-9832468)
chr4 (116-296)||(30352578-30352767)
chr4 (143-297)||(25463108-25463259)
chr4 (179-297)||(25629071-25629187)
chr4 (188-294)||(48327763-48327869)
chr4 (153-292)||(29207900-29208035)
chr4 (135-294)||(30690176-30690340)
chr4 (133-296)||(54730225-54730389)
chr4 (112-291)||(54966977-54967151)
chr4 (179-296)||(9987832-9987947)
chr4 (132-296)||(25343162-25343326)
chr4 (135-278)||(30581481-30581624)
chr4 (138-296)||(39077794-39077948)
chr4 (110-243)||(14590790-14590922)
chr4 (217-296)||(33836485-33836564)
chr4 (133-276)||(39029078-39029220)
chr4 (181-295)||(51865037-51865149)
chr4 (120-285)||(487135-487306)
chr4 (136-276)||(49938611-49938746)
chr4 (111-294)||(55766466-55766647)
chr4 (133-296)||(20908634-20908797)
chr4 (135-294)||(32478792-32478942)
chr4 (136-283)||(30496333-30496476)
chr4 (233-296)||(32484307-32484370)
chr4 (199-285)||(16494259-16494345)
chr4 (179-289)||(21489109-21489218)
chr4 (140-281)||(41018807-41018945)
chr4 (114-219)||(17315372-17315476)
chr4 (229-294)||(38755908-38755973)
chr4 (111-294)||(55830721-55830902)
chr4 (179-293)||(7909281-7909393)
chr4 (232-296)||(38786682-38786746)
chr4 (133-217)||(43035224-43035308)
chr4 (133-216)||(42164225-42164307)
chr4 (140-271)||(7385499-7385628)
chr4 (194-297)||(10277754-10277855)
chr4 (133-256)||(47441568-47441689)
chr4 (145-295)||(7038041-7038188)
chr4 (232-294)||(11394925-11394987)
chr4 (232-294)||(11404652-11404714)
chr4 (198-296)||(36816382-36816479)
chr4 (243-297)||(56322984-56323038)
chr4 (135-296)||(23580206-23580365)
chr4 (233-294)||(40553937-40553998)
chr4 (233-294)||(44718641-44718702)
chr4 (134-274)||(3580860-3580994)
chr4 (109-173)||(5313113-5313177)
chr4 (232-296)||(28494224-28494288)
chr4 (179-273)||(49796820-49796911)
chr4 (201-294)||(2813169-2813263)
chr4 (181-293)||(12711450-12711561)
chr4 (234-296)||(19027986-19028048)
chr4 (232-294)||(25388249-25388311)
chr4 (137-229)||(51420553-51420646)
chr4 (244-296)||(35532077-35532129)
chr4 (179-291)||(36589765-36589876)
chr4 (132-256)||(44357195-44357318)
chr4 (229-296)||(50555654-50555721)
chr4 (108-165)||(29879624-29879681)
chr4 (226-295)||(47482849-47482918)
chr4 (166-249)||(17079696-17079777)
chr4 (142-278)||(32629285-32629418)
chr4 (229-280)||(8820578-8820629)
chr4 (191-250)||(35894505-35894563)
chr4 (133-202)||(54640429-54640498)
chr4 (114-151)||(18969698-18969735)
chr4 (233-293)||(21003410-21003469)
chr4 (242-294)||(34256982-34257034)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (110-294)||(14530271-14530455)
chr2 (106-294)||(10543647-10543835)
chr2 (111-295)||(8455315-8455497)
chr2 (111-295)||(5840982-5841166)
chr2 (112-295)||(24200622-24200805)
chr2 (113-295)||(11514392-11514571)
chr2 (103-295)||(21779260-21779448)
chr2 (110-294)||(25079717-25079900)
chr2 (111-295)||(9671134-9671315)
chr2 (109-294)||(23397718-23397899)
chr2 (129-296)||(17667974-17668139)
chr2 (109-296)||(25249736-25249920)
chr2 (132-294)||(40416871-40417031)
chr2 (129-296)||(17623536-17623701)
chr2 (148-296)||(10546153-10546300)
chr2 (111-284)||(12023929-12024099)
chr2 (131-295)||(39914305-39914467)
chr2 (113-297)||(17896215-17896398)
chr2 (148-296)||(14444720-14444865)
chr2 (135-297)||(31158436-31158598)
chr2 (111-296)||(7214488-7214673)
chr2 (108-256)||(22371008-22371151)
chr2 (132-274)||(32781308-32781448)
chr2 (133-297)||(21377071-21377232)
chr2 (117-297)||(27573581-27573758)
chr2 (113-296)||(19977712-19977893)
chr2 (111-229)||(17705449-17705567)
chr2 (133-274)||(33795261-33795400)
chr2 (112-294)||(14544018-14544201)
chr2 (179-296)||(36871515-36871628)
chr2 (129-296)||(24859986-24860149)
chr2 (179-294)||(40762234-40762347)
chr2 (133-291)||(4516354-4516510)
chr2 (132-295)||(44643497-44643659)
chr2 (135-249)||(5450263-5450376)
chr2 (146-282)||(19614981-19615116)
chr2 (133-275)||(44521392-44521532)
chr2 (134-278)||(99281-99421)
chr2 (111-299)||(26684615-26684803)
chr2 (197-281)||(24890451-24890533)
chr2 (133-256)||(23145736-23145857)
chr2 (133-256)||(23557526-23557647)
chr2 (192-294)||(25632544-25632644)
chr2 (128-211)||(44604825-44604907)
chr2 (137-294)||(17380238-17380391)
chr2 (179-296)||(30826059-30826172)
chr2 (234-295)||(34080176-34080237)
chr2 (133-230)||(29419947-29420048)
chr2 (220-295)||(23488544-23488619)
chr2 (142-296)||(25641487-25641638)
chr2 (233-292)||(41409936-41409995)
chr2 (240-294)||(3633708-3633762)
chr2 (151-284)||(17471542-17471675)
chr2 (233-293)||(40579750-40579810)
chr2 (166-296)||(15296404-15296533)
chr2 (234-296)||(34766330-34766392)
chr2 (243-296)||(39189502-39189555)
chr2 (181-282)||(44449395-44449495)
chr2 (206-293)||(13245096-13245181)
chr2 (122-296)||(45235815-45235988)
chr2 (230-295)||(1289093-1289159)
chr2 (246-295)||(22371199-22371248)
chr2 (239-294)||(8575975-8576030)
chr2 (232-291)||(31525779-31525838)
chr2 (232-286)||(31523304-31523358)
chr2 (110-156)||(39189557-39189603)
chr2 (246-290)||(124918-124962)
chr2 (200-294)||(19185743-19185837)
chr2 (247-297)||(23052962-23053012)
chr2 (232-281)||(4794875-4794924)
chr2 (158-230)||(12315714-12315785)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (110-297)||(29355852-29356040)
chr6 (129-295)||(12221913-12222080)
chr6 (111-296)||(1346918-1347099)
chr6 (111-295)||(1354756-1354936)
chr6 (129-296)||(2166408-2166575)
chr6 (129-296)||(2178041-2178208)
chr6 (108-296)||(9161074-9161261)
chr6 (105-290)||(14975094-14975267)
chr6 (111-296)||(1941809-1941992)
chr6 (129-262)||(6024205-6024338)
chr6 (113-287)||(3815084-3815256)
chr6 (221-296)||(12892071-12892146)
chr6 (109-225)||(8409195-8409311)
chr6 (179-297)||(26097182-26097296)
chr6 (114-295)||(32728156-32728334)
chr6 (179-297)||(25557747-25557861)
chr6 (112-230)||(13905041-13905158)
chr6 (153-294)||(7947371-7947511)
chr6 (115-227)||(20400625-20400737)
chr6 (111-292)||(15866041-15866218)
chr6 (213-295)||(12885967-12886049)
chr6 (122-272)||(14553477-14553626)
chr6 (158-296)||(18277191-18277327)
chr6 (129-296)||(24097553-24097714)
chr6 (133-294)||(12889402-12889562)
chr6 (133-293)||(2755422-2755583)
chr6 (115-295)||(23930126-23930303)
chr6 (187-285)||(19340858-19340954)
chr6 (162-283)||(33138838-33138957)
chr6 (231-296)||(6808467-6808532)
chr6 (135-295)||(28007604-28007761)
chr6 (153-294)||(17432336-17432483)
chr6 (181-296)||(9671082-9671196)
chr6 (153-296)||(3116127-3116262)
chr6 (220-297)||(13267788-13267863)
chr6 (110-222)||(22967124-22967235)
chr6 (110-222)||(23821158-23821269)
chr6 (206-277)||(32579474-32579543)
chr6 (115-276)||(24734591-24734760)
chr6 (218-294)||(383760-383834)
chr6 (239-296)||(20906784-20906841)
chr6 (179-250)||(11849075-11849145)
chr6 (143-292)||(23240826-23240971)
chr6 (185-247)||(32068121-32068182)
chr6 (114-175)||(12063424-12063485)
chr6 (234-294)||(10734905-10734965)
chr6 (158-222)||(17448325-17448389)
chr6 (214-287)||(16895704-16895778)
chr6 (259-297)||(25997749-25997787)
chr6 (217-284)||(16915996-16916064)
chr6 (179-247)||(31990096-31990163)
chr6 (111-175)||(33922945-33923009)
chr6 (190-296)||(24751066-24751176)
chr6 (261-296)||(30786372-30786407)
chr6 (234-284)||(11395836-11395886)
chr6 (198-292)||(18254559-18254651)
chr6 (235-297)||(33922854-33922916)
chr6 (179-299)||(12228380-12228498)
chr6 (129-185)||(8417444-8417500)
chr6 (196-228)||(14341134-14341166)
chr6 (239-275)||(29016301-29016337)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (132-296)||(46806-46968)
scaffold0057 (109-296)||(24770-24950)
scaffold0057 (204-280)||(46721-46796)
scaffold0057 (179-295)||(43681-43794)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (111-296)||(30533-30714)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (116-294)||(58936-59114)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (120-295)||(10773-10946)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (113-297)||(13021-13202)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (132-290)||(1591-1745)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (114-292)||(10052-10226)
scaffold0187 (114-292)||(20380-20554)
scaffold0187 (110-175)||(8898-8963)
scaffold0187 (110-175)||(19226-19291)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (166-295)||(48633-48758)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (118-294)||(11093-11264)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (129-256)||(4129-4257)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (110-243)||(226456-226588)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (205-296)||(24131-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (188-294)||(72867-72971)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (111-249)||(35062-35200)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (109-175)||(83827-83893)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (164-255)||(23606-23695)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (187-294)||(3574-3679)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (133-244)||(32906-33016)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (131-201)||(8865-8935)
[»] scaffold0194 (2 HSPs)
scaffold0194 (112-175)||(24619-24682)
scaffold0194 (205-296)||(24696-24785)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (129-201)||(43101-43173)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 42805368 - 42805798
Alignment:
Q  1 aaatggagggctgttcatttagttatttctttcttttataacatggttgcataatttcctattaattgcgtatcaaatgttttaattttattagggaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42805368 aaatggagggctgttcatttagttatttctttcttttataacatggttgcataatttcctattaattgcgtatcaaatgttttaattttattagtgaaaa 42805467  T
Q  101 ttataaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  42805468 ttataaaaatgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 42805567  T
Q  201 aacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtg 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805568 aacagggtaaggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtg 42805667  T
Q  301 aaaattataaaaataatatttctaactgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccatacctt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805668 aaaattataaaaataatatttctaagtgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccatacctt 42805767  T
Q  401 gaaccgcacactgtttcaaatgtctgtgctg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42805768 gaaccgcacactgtttcaaatgtctttgctg 42805798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716596
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 47716596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172008
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 21172091  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21172090 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21172008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 265
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 265  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798807
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttttta 42798807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2541202 - 2541019
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaa-ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2541202 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 2541103  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2541102 aaggctgcgtactatacacca--aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttt 2541019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557612
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttttt 43557612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 32758214 - 32758396
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32758214 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 32758311  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32758312 aggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 32758396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48735304 - 48735122
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  48735304 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacac--gg 48735207  T
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48735206 taaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48735122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11617751 - 11617589
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11617751 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 11617652  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11617651 a--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693073
Alignment:
Q  118 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 217  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaga--gggtaaggctgcg 10693148  T
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10693147 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttt 10693073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629771
Alignment:
Q  119 accttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcat 218  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  219 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27629696 aaaatacacca--aatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 27629771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391098
Alignment:
Q  139 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 238  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtg 42391156  T
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42391155 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 42391098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19427052 - 19426888
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  19427052 aactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacacc 19426953  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19426952 a--aatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 19426888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871914
Alignment:
Q  131 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacca- 33871973  T
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33871972 -aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcc 33871914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879775
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 7879736  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7879737 gcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 7879775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35334997 - 35334818
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  35334997 atgagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaaca--gtctcgtgtaaaaaacagggt 35334900  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||| |||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35334899 aagactgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Original strand, 42476826 - 42477005
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||  |||||| ||||    
T  42476826 tgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggta 42476923  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42476924 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 431
Target Start/End: Original strand, 42763053 - 42763192
Alignment:
Q  295 ttagtgaaaattataaaaataatatttctaac---tgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcact 391  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||    
T  42763053 ttagtaaaaattataaaattaatatttctaaaaagtgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatctagctcttgcatatcttaagcgct 42763152  T
Q  392 ccataccttgaaccgcacactgtttcaaatgtctgtgctg 431  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  42763153 ccataccttgaactgcacacagtttcaaatgtctttgctg 42763192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698967
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 22698967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464012
Alignment:
Q  117 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgc 40463935  T
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
     || |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40463936 gtataatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgccctttt 40464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34626390 - 34626206
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||| | |||||||   ||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  34626390 atgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaa-cagggt 34626292  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34626291 aaggctgcgttcaatacaccaa--atggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttttt 34626206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077853
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||| || ||||    
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaatagagtaa 47077937  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     | ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  47077936 agttgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgcctttttt 47077853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaa-a 16341352  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16341353 atggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgt--catgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907493 -aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23419833 - 23419674
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  23419833 ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca--a 23419736  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  23419735 atggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttt 23419674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265950
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19265887  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19265888 atggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732821
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||   ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  215 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    || | ||||||||||| |||||||  || |||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccggattgtccttt 14732821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28362304 - 28362155
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  28362304 ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtacaatacacca--a 28362207  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28362206 atggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagcttt-gtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262194
Alignment:
Q  148 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacacca--aatgatgggacccctt 38262243  T
Q  248 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||  || | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38262242 cccgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 38262194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 230
Target Start/End: Original strand, 12473254 - 12473377
Alignment:
Q  107 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg 206  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||    
T  12473254 aaatgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagg 12473353  T
Q  207 gtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  12473354 gtaaggatgcgtacaatacaccaa 12473377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18512586 - 18512455
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  18512586 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaat-agggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttcccggaccct 18512490  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18512489 gcgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31591241 - 31591108
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||      
T  31591241 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa--cagagtaaggctgcgtacaatacaataa--atggtgggaccccttcccggacctt 31591146  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31591145 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 31591108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 42762967 - 42763070
Alignment:
Q  1 aaatggagggctgttcatttagttatttctttcttttataacatggttgcataatttcctattaattgcgtatcaaatgttttaattttattagggaaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42762967 aaatggagagctgttcatttagttatttctttcttttataacatggttgcata----cctcttaactgtgtatcaaatgttttaattttattagtaaaaa 42763062  T
Q  101 ttataaaa 108  Q
    ||||||||    
T  42763063 ttataaaa 42763070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 293
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 241  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaat--tggtggga 18747569  T
Q  242 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18747570 ccccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3469338 - 3469176
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa--cagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||    ||||||  |||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  3469338 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgtacaatacaccaa 3469239  T
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3469238 aaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327091
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 18327087  T
Q  212 gctg 215  Q
    ||||    
T  18327088 gctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233133
Alignment:
Q  140 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 239  Q
    |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||  |||||||    
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggcagcgtatattacaccaa--atggtgg 32233190  T
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||  |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32233189 gattccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttttt 32233133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662946
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 2663017  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2663016 ggctgcgtacaatacacca--aatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180169
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
     |||  ||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||| | ||  | ||||| ||||||||| ||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctttccaaatcctacgtatgcaggagctttaatgca 5180169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193143
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || | |||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaacaatatggtaa 7193138  T
Q  211 ggctg 215  Q
    |||||    
T  7193139 ggctg 7193143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148985
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtg-taaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||   | |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 254  Q
    || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagac 8148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 285
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  161 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 260  Q
    ||||| |||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtaggaccccttcccgaaccctgca 21566537  T
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21566538 tatgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 293
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatg 11741869  T
Q  236 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11741870 gtgggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1424073 - 1423967
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |   |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1424073 aactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgcatacactacacc 1423974  T
Q  229 aataatg 235  Q
    |||||||    
T  1423973 aataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 273
Target Start/End: Original strand, 19266414 - 19266564
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||   | ||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19266414 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 19266512  T
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 273  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19266513 caatacacca--aattgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28078313 - 28078151
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||  ||| |||  |||||||||||||    
T  28078313 tgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgta-aaaaaacagggta 28078215  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||||    
T  28078214 aggttgcatgcaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttta 28078151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48123643 - 48123508
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |    
T  48123643 ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcatacaatacacca--a 48123546  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggag 270  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||    
T  48123545 atggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42496018 - 42495916
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42496018 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggt 42495920  T
Q  209 aagg 212  Q
    ||||    
T  42495919 aagg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099050
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14099068  T
Q  233 atggtgggaccccttccc 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14099067 atggtgggaccccttccc 14099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409067
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14409085  T
Q  233 atggtgggaccccttccc 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14409084 atggtgggaccccttccc 14409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124031
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta----aggctgcatacaatacac 227  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    |||||   |||||||||||||| |||||||    ||||||| || |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaa-cagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  228 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcaccaagctgccctttt 39124031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaa- 7645029  T
Q  232 aatggtgggaccccttcc 249  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  7645030 aattgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Original strand, 13805077 - 13805237
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||      
T  13805077 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggtaaggctgtgtacaatacacca-- 13805173  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||    
T  13805174 aatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcactgggctacccttttt 13805237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Original strand, 38604549 - 38604654
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||    
T  38604549 ggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagt 38604645  T
Q  278 gcaccgggt 286  Q
    |||||||||    
T  38604646 gcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889314
Alignment:
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttttt 27889314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787268
Alignment:
Q  182 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| | |||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcac 35787282  T
Q  282 cgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||    
T  35787281 cgggttgccctttt 35787268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794582
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaaaacagggtaaggc 7794583  T
Q  214 t 214  Q
    |    
T  7794582 t 7794582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447636
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac 203  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||| |||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 35203440 - 35203531
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  35203440 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Original strand, 1408487 - 1408594
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| |||||| |    
T  1408487 cctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaatctttagttcaccggat 1408584  T
Q  287 tgcccttttt 296  Q
    |||| |||||    
T  1408585 tgcctttttt 1408594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736962
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaa 6736962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018923
Alignment:
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataa--tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||| |||| ||| | || |    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaa-a 42101946  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 279  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  42101945 gtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 5814447 - 5814528
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5814447 ggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggct 5814528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 296
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198863
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa---gtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||| ||||   ||   |||||||  || |||||||||||| || ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || | || || ||| ||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaa--atggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcacttttt 25198863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602584
Alignment:
Q  247 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 36602584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093436
Alignment:
Q  200 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacacca-taatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttttta 39093436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792147
Alignment:
Q  193 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacaccca-aatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgagctgccct 13792152  T
Q  293 tttta 297  Q
    |||||    
T  13792151 tttta 13792147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 23231587 - 23231692
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23231587 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagt 23231684  T
Q  287 tgcccttt 294  Q
    | ||||||    
T  23231685 ttcccttt 23231692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 291
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500645
Alignment:
Q  200 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggatcttcagtg--ccgggttgccc 33500645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 292
Target Start/End: Original strand, 27697459 - 27697572
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt--gggacccctt-cccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |    
T  27697459 ggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctg--tgtaatacaccaa-aatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcgggagcttaa 27697555  T
Q  276 gtgcaccgggttgccct 292  Q
     ||||||||| ||||||    
T  27697556 atgcaccgggatgccct 27697572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23619039 - 23618974
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23619039 aatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgcccttttta 23618974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44123792 - 44123685
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  44123792 ccttggtgcaac-ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggttgcatg 44123695  T
Q  220 caatacacca 229  Q
     |||||||||    
T  44123694 aaatacacca 44123685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065654
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaata 224  Q
    ||||||||||||||||| || | || || |||| | ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgt-aaaaatagggtaaagctgcatacaata 22065654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140438
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||   | |||||| |||||  |||||||| | ||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacacattcaagttttgaaaacaatctcttaggtaaaaaataaggtaaggc 29140439  T
Q  214 t 214  Q
    |    
T  29140438 t 29140438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 45811920 - 45811983
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45811920 aatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgcccttttt 45811983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44171668 - 44171635
Alignment:
Q  263 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44171668 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 44171635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17048914 - 17048859
Alignment:
Q  194 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 250  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17048914 tgtaaaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaa-aatggtggaaccccttccc 17048859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23066029 - 23065924
Alignment:
Q  188 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||  | || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  23066029 ctcttgtttaaaaaacaggataaagttgcgtacaatacacca--tatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggatt 23065932  T
Q  288 gccctttt 295  Q
    ||||||||    
T  23065931 gccctttt 23065924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 25434050 - 25434144
Alignment:
Q  188 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25434050 ctcttgtgcaaaaaacatggtaagagtgcatacaacacaccaa-aatggtatgacttcttcttggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 25434144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  188 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  || | |  ||||||| |||||||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaa--atggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495865
Alignment:
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccccgttgccc 42495865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004089
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaa 20004174  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20004173 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 20004089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395725
Alignment:
Q  117 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 30395725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991964
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccatttt 46991964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944806
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttttt 18944806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34725278 - 34725097
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  34725278 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 34725181  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34725180 aggctgcgtacaatacacta--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 34725097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247951
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 46247951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668386
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaa-----ctggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 205  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201809
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttttt 27201809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632556
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 32632639  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32632638 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttccctttt 32632556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 295
Target Start/End: Original strand, 14617013 - 14617197
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14617013 atgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggt 14617112  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14617113 aaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 14617197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23768483 - 23768325
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23768483 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 23768384  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 289  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23768383 a--aatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Original strand, 35005142 - 35005284
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35005142 actgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccgg 35005241  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35005242 accctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgccctttt 35005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741954
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt-gagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |   ||||||||  || |||| | |||||||||||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttttta 18741954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478280
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 38478364  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38478363 ggctgcgtacaatacaccaa--atggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 38478280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812535
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   | |||||  ||||||||||||| |  ||||||    
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaaga--gggtaa 45812619  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45812618 ggctgcatacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 45812535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19932936 - 19932755
Alignment:
Q  108 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19932936 aatgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtt--ggatacaacct-ttgtgtaaaaaacaggg 19932840  T
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  || | |||||||||| |||||||||    
T  19932839 taaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 296
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925260
Alignment:
Q  130 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
      ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcctttttt 6925260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214669
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgttt--aaaacagggtaa 47214585  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  47214586 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattacccttttt 47214669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41319993 - 41319805
Alignment:
Q  105 aaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca 204  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||   |||||||  |||||||||||||||||    
T  41319993 aaaattgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaaca 41319894  T
Q  205 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  41319893 gggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccctttt 41319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414596
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    |||| | |||||| |||  |||||||| |||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt--aaaacaggttaaggct 19414517  T
Q  215 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19414518 gcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 19414596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402256
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt--aagg- 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||      
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggttcaagtt 45402174  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45402175 ctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccgtttt 45402256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126836
Alignment:
Q  117 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgc 12126913  T
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
     |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  12126912 gtacaatacaccaa--attgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgccctttt 12126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197203
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| | |||| ||||||||  ||||| |||||||||| | ||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacaccaa--atggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 8197203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474439
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggca 27474355  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27474356 aagctgcgtacaatacactga--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 27474439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 9939463 - 9939628
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  9939463 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttgcgtgcaatacaccaaaaatg 9939562  T
Q  236 gtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagtg 300  Q
    |||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9939563 gtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttaagtg 9939628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724565
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 18724607  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18724606 atcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagcttt 18724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcat-atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253184
Alignment:
Q  148 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccctt 35253234  T
Q  248 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35253233 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttta 35253184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 294
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349796
Alignment:
Q  195 gtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4349796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacca--aa 25468324  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 272  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25468323 tggttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701731
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaa-aa 19701668  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19701669 tggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctacccttttt 19701731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Original strand, 35019229 - 35019389
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  35019229 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcatacaatacaccaat- 35019327  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35019328 -tggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgccattttt 35019389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45264534 - 45264411
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    ||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  45264534 aaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaa-aatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2435946 - 2435796
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  2435946 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtacaatacaccaa-a 2435848  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  2435847 atggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Original strand, 23796510 - 23796625
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23796510 ggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagtg 23796607  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  23796608 caccgggctgcccttttt 23796625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31382326 - 31382212
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31382326 ggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttactg 31382230  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
     |||||||||||||||||    
T  31382229 taccgggttgcccttttt 31382212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606563
Alignment:
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 50606563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1517417 - 1517309
Alignment:
Q  187 cctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  1517417 cctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T
Q  286 ttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||    
T  1517319 ttgcccttttt 1517309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaa-a 27136713  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 274
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596650
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||      
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtataatacaccaa-- 11596608  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  11596609 atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 11596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 292
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  166 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 265  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||| || |||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgc 22325022  T
Q  266 gggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||    
T  22325023 gggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304205
Alignment:
Q  198 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 42304205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983810
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||  || ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacaccaa- 6983873  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
     ||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6983872 -atggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccctttt 6983810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    |||||||| |||||| || |||  |||||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaa-aa 39215019  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  39215018 tggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 296
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768299
Alignment:
Q  200 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttttt 43768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485119
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 44485170  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||| |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  44485169 tggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagcttt-gtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511150
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc--atacaatacacca 229  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||   || ||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    | |||||||| |||||||||  ||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  15511211 a-aatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 297
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036381
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||| | ||||||||||     
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacca- 20036316  T
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20036317 -aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag-ttttgtgcaccgggctgctcttttta 20036381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930114
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggtaa 22930150  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    || ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22930149 ggttg-tgacaatacacca--aatggtgggaccccttcc 22930114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290300
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaa--acaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  212 gc-----tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg 264  Q
    ||     ||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  25290243 gcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccccttcccagactctgcatatg 25290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10378828 - 10378738
Alignment:
Q  199 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10378828 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17470517 - 17470390
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17470517 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 17470419  T
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  17470418 caatacaccaa-aatagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 240
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327204
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaa-aatg 22327199  T
Q  236 gtggg 240  Q
    |||||    
T  22327200 gtggg 22327204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 245
Target Start/End: Original strand, 33222983 - 33223093
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |    
T  33222983 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtacaatacaccaa-a 33223080  T
Q  233 atggtgggacccc 245  Q
    |||||||||||||    
T  33223081 atggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Original strand, 50811938 - 50812100
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||  ||| ||   ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  50811938 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaa- 50812036  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  50812037 aatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttttt 50812100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4430187 - 4430088
Alignment:
Q  131 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   | |||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4430187 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 4430088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 280
Target Start/End: Original strand, 43207540 - 43207640
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  43207540 ggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaa-attggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtg 43207638  T
Q  279 ca 280  Q
    ||    
T  43207639 ca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 34714599 - 34714674
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34714599 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaaca 34714674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999849
Alignment:
Q  190 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 289  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||   |||| || || |||||||||||||||||||||| |||    
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacacca--aatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgc 20999855  T
Q  290 cctttt 295  Q
    ||||||    
T  20999854 cctttt 20999849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564440
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||| | || |||||| | | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaa 230  Q
    | ||| |||||| ||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaa 24564440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442396
Alignment:
Q  197 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760287
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaat 50760287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19656219 - 19656104
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||| |||||| |||||| |||   ||||| ||||||||  |||||||| ||    
T  19656219 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaa-aatggtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaatg 19656121  T
Q  279 caccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||    
T  19656120 caccgggctgccctttt 19656104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 297
Target Start/End: Original strand, 6358185 - 6358283
Alignment:
Q  198 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  6358185 aaaatcagggtaaagctgcgtacaaaacaccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtgatcggggctgcccttttta 6358283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2436064 - 2435983
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 202  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  2436064 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424783
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagt 40424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4587625 - 4587568
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4587625 aatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594130
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctaccctttt 33594130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34679331 - 34679217
Alignment:
Q  180 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac----cccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||  |||| | ||||||    || || |||||||||||||||    
T  34679331 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatca--aatggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagcttta 34679234  T
Q  276 gtgcaccgggttgccct 292  Q
    || ||||||| ||||||    
T  34679233 gtacaccgggctgccct 34679217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20169200 - 20169084
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||| |||||   |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||      
T  20169200 aaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatc--ggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagcttttgtgtc 20169103  T
Q  281 ccgggttgccctttttagt 299  Q
    || || |||||||| ||||    
T  20169102 cctggctgccctttatagt 20169084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505710
Alignment:
Q  202 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcaccg 15505710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19974213 - 19974073
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  19974213 actgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaat-agggcaaggttgcgtacaatacaccaa-aatgatgggacccattcccgg 19974116  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    || |    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19974115 actctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgccctttt 19974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 285
Target Start/End: Original strand, 23371143 - 23371271
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  23371143 actgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacaccaa--atgctgggaccccttcc-ag 23371238  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  23371239 accctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 282
Target Start/End: Original strand, 7074588 - 7074663
Alignment:
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7074588 ggtatggctgcgtacaatacaccaa-aattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacc 7074663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 30555211 - 30555275
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  30555211 aatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgaccttttt 30555275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34149073 - 34148969
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||  |||||    
T  34149073 ggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagacca--aatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagtg 34148976  T
Q  279 caccggg 285  Q
    || ||||    
T  34148975 caacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 296
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859227
Alignment:
Q  197 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||| ||  || |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtgggactcattttcaggccttgcgtatgtgggagttttagtgcaccgggcttcccttttt 46859227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 291
Target Start/End: Original strand, 52910204 - 52910379
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcat 218  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||  |    
T  52910204 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgt 52910302  T
Q  219 acaatacaccaa----taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||||||| |    | |||||||||||||||||  || ||  | |||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  52910303 acaatacacctaatggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcaccaggctgccc 52910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272379
Alignment:
Q  144 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 243  Q
    ||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||       
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtacagcacatca--aatggtggg--- 31272429  T
Q  244 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
       | || ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  31272428 ---ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgcccttttt 31272379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Original strand, 16120819 - 16120876
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  16120819 ggaccccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttttt 16120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 282
Target Start/End: Original strand, 1693222 - 1693273
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcacc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1693222 aatggtgggaccccttcccagacccggcagatgcaggagcttttagtgcacc 1693273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21773675 - 21773636
Alignment:
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21773675 gcatatgtgggagctttggtgcaccgggttgcccttttta 21773636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28894611 - 28894561
Alignment:
Q  241 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  28894611 accccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21910743 - 21910693
Alignment:
Q  198 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 250  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21910743 aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttccc 21910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 297
Target Start/End: Original strand, 24564450 - 24564495
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24564450 gaccctgcctatgcaggagcgttagtgcaccgggttgcccttttta 24564495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Original strand, 25027989 - 25028030
Alignment:
Q  180 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25027989 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacgaggtaaggctgcataca 25028030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||| ||||| | || || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||  ||||||||   | ||| || || |||| |||| |||||||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  212 gctgcatacaata 224  Q
    ||||| |||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41440664 - 41440600
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  41440664 aatggtggaaccccttcctagactctgtgtatgcgggagctttagtgaaccggactgcccttttt 41440600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50760273 - 50760237
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50760273 tatgcgggagctttaatgcaccgggctgcccttttta 50760237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730600
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 13730600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40272994 - 40272810
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40272994 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 40272895  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40272894 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 40272810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 109 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13628976 - 13628789
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaa-gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13628976 atgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacaggg 13628877  T
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13628876 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13628789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366719
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccctttt 29366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421032
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttttt 46421032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8247872 - 8247688
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8247872 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 8247773  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgccct 292  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8247772 aaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 1217064 - 1217248
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1217064 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 1217161  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1217162 aaggctgcgtacaatacacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttta 1217248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607345
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggta 9607277  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9607278 aggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914034
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccctttt 12914034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 49013588 - 49013471
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49013588 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtg 49013489  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49013488 caccgggttgcccttttt 49013471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5173903 - 5173717
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaa-gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  5173903 tgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-caaagt 5173805  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5173804 aaggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 5173717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Original strand, 22609742 - 22609921
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22609742 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggta 22609839  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22609840 aggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 133 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996562
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaa-a 53996627  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53996626 atggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttta 53996562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 39203491 - 39203671
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  39203491 tgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 39203588  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203589 aggttgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353351
Alignment:
Q  193 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516571
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc-aataatggtggga 241  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  242 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926217
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||         ||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaa 52926301  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52926300 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttttt 52926217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6411904  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6411903 ggctgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaaggct 22122995  T
Q  215 gcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22122994 gcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 26869701 - 26869865
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26869701 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 26869799  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  |||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26869800 a--aatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttttt 26869865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Original strand, 14987001 - 14987116
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  14987001 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcgggagctttagtg 14987100  T
Q  279 caccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||| ||||||    
T  14987101 caccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420640
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaa-aa 34420704  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  34420703 tggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttttta 34420640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139479
Alignment:
Q  146 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 245  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaacttt-gtgcaccgggctgccctt 45139479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 16735416 - 16735598
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    |||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  16735416 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggta 16735514  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16735515 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccctttt 16735598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 292
Target Start/End: Original strand, 26573125 - 26573282
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26573125 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat- 26573223  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
     |||||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26573224 -tggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccct 26573282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786214
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  281 ccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||    
T  45786227 ccgggttgcccttt 45786214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45948974 - 45948848
Alignment:
Q  156 ggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 255  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  45948974 ggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcggacc 45948877  T
Q  256 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  45948876 ctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795423
Alignment:
Q  163 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 262  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  263 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttt 10795423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 54374485 - 54374343
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  54374485 actgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaa-aatggtgggaccccttcccgg 54374387  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||    
T  54374386 accctgcatatgcgggagctttagttcaccaggctgccattttt 54374343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4495850 - 4495674
Alignment:
Q  106 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 205  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| | ||| |||||||||||||||    
T  4495850 aaaaggaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacag 4495751  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||            ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4495750 ggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgg------------gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 4495674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Original strand, 54484734 - 54484851
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  54484734 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagt 54484831  T
Q  278 gcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54484832 gcaccgggttgcccttttta 54484851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943149
Alignment:
Q  138 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatca--aatggt 7943090  T
Q  238 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7943091 gggatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcctttttt 7943149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7697067 - 7696893
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  7697067 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggta 7696970  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||     ||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7696969 aggctgcgtacaatacacca--aatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517169
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag--ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggt 208  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   ||||||| |||||||||||||||| || | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    | |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccctttt 25517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 294
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  164 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatat 263  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggactccttcccggaccctgcatat 31592973  T
Q  264 gcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31592974 gcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944629
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||   ||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaa-aa 25944566  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25944567 tggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgcccttttt 25944629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032570
Alignment:
Q  146 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||          
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtgg------ 54032614  T
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
          ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54032613 ------gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 54032570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Original strand, 15797274 - 15797379
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15797274 cctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggt 15797369  T
Q  287 tgcccttttt 296  Q
    ||||||||||    
T  15797370 tgcccttttt 15797379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771361
Alignment:
Q  199 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttta 34771361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870028
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 10870034  T
Q  211 ggctgc 216  Q
    ||||||    
T  10870033 ggctgc 10870028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928167
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 236  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||  |||    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaat--tgg 30928205  T
Q  237 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  30928204 cgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 30928167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 278
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  146 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 245  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacaatacacca-taatggtgggacccc 33926191  T
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33926192 ttcctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45621012 - 45620889
Alignment:
Q  108 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagg 206  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45621012 aatgagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagg 45620914  T
Q  207 gtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  45620913 gtaaggctgcgtacaatacaccaat 45620889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525566
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||||| |||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||    | |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |  ||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  12525482 aggctgc--gaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctcttttt 12525566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||| ||||||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
     ||||||||||| ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19731098 ttggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24851363 - 24851299
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851363 aatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 24851299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 295
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452953
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30452953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 829555 - 829452
Alignment:
Q  180 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 279  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  829555 gaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgc 829457  T
Q  280 accgg 284  Q
    |||||    
T  829456 accgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 9276316 - 9276419
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  9276316 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta-tgcgcagggt 9276411  T
Q  287 tgcccttt 294  Q
    ||||||||    
T  9276412 tgcccttt 9276419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 290
Target Start/End: Original strand, 55401222 - 55401330
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||||||||  ||||    
T  55401222 aaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaa-aatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcgggagcttttttgca 55401320  T
Q  281 ccgggttgcc 290  Q
    ||||| ||||    
T  55401321 ccgggctgcc 55401330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624160
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccc 47624160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 293
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235687
Alignment:
Q  118 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaac-tggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctg 215  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||| |   | ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  216 catacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
      |||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||   | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33235613 tgtacaatacactaa--atggtgggacccct-cgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44403661 - 44403552
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||| | |||||||||||||||||     
T  44403661 cctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaa-aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggc 44403563  T
Q  287 tgcccttttta 297  Q
    |||| ||||||    
T  44403562 tgcctttttta 44403552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50625065 - 50624951
Alignment:
Q  180 gaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 279  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| |  ||||||||| ||||||  | ||| || || | ||||||||||||||    
T  50625065 gaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatt--tggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagctttagtgc 50624968  T
Q  280 accgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||    
T  50624967 accgggctgcccttttt 50624951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484615
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10484615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 227
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaagg 212  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  213 ctgcatacaatacac 227  Q
    |||| ||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 24577930 - 24577994
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24577930 aatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 24577994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 24578020 - 24578084
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24578020 aatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgcccttttt 24578084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 297
Target Start/End: Original strand, 26292384 - 26292490
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | || ||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26292384 cctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacgatacaccaa--atgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggt 26292479  T
Q  287 tgcccttttta 297  Q
    || ||||||||    
T  26292480 tgtccttttta 26292490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782461
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgc 26782444  T
Q  214 tgcatacaatacaccaa 230  Q
    || ||| ||||||||||    
T  26782445 tgtataaaatacaccaa 26782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31904970 - 31904857
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | | |||||||||||||||    
T  31904970 ggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacca--aatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagctttagt 31904873  T
Q  278 gcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||| || |||||||    
T  31904872 gcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 35417999 - 35418063
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  35417999 aatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgcccatttt 35418063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410887
Alignment:
Q  141 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 240  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||   ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacacca--actggtggg 8410921  T
Q  241 accccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8410920 acctcttctcagaccctgcataggcggaagcttt 8410887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751731
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||| || |||||| || | || |||||||||| | |||||   ||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19751673  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
     ||||||||||| |||||||||   |  |||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  19751674 ttggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624258
Alignment:
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 47624258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaataca 226  Q
    ||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43114983 - 43114882
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagg-ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc-gcatatgcgggagcttta 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  43114983 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaa--atggtgggaccc-ttcctggacccctgcgtatgcgggagcttta 43114887  T
Q  276 gtgca 280  Q
    |||||    
T  43114886 gtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52428627 - 52428539
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgag-ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52428627 ttgtcacgtagctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 52428539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 40390365 - 40390400
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390365 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 40390400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 295
Target Start/End: Original strand, 40968613 - 40968676
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  40968613 aatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgcatcgagctgccctttt 40968676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 35417914 - 35417988
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35417914 ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6242327 - 6242283
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6242327 gaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 6242283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 230
Target Start/End: Original strand, 31831243 - 31831292
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31831243 ggaaacagcctcttgtgtaaaata--gggtaaggctgcatacaatacaccaa 31831292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 43956514 - 43956470
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43956514 gacccagcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 43956470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 294
Target Start/End: Original strand, 31831301 - 31831343
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31831301 gaccctgcatatgcgggtgctctagtgcaccgggttgcccttt 31831343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 150
Target Start/End: Original strand, 9276248 - 9276289
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatg 150  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  9276248 atgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10696272 - 10696211
Alignment:
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  10696272 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtctacgggagcattagtgcactaggctgcccttttt 10696211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14266405 - 14266372
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14266405 tatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 16130312 - 16130432
Alignment:
Q  172 aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 271  Q
    |||||| | ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||  || ||  | |||||    
T  16130312 aagtgatgaaaacatcgtcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacaccaa-aatggtgggaccctgtcctagaccttgcgtacacaggagc 16130410  T
Q  272 tttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||  ||| |||||||    
T  16130411 tttagtgcattgggctgccctt 16130432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 294
Target Start/End: Original strand, 23871490 - 23871523
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23871490 tatgcgggaactttagtgcaccgggttgcccttt 23871523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 29106555 - 29106644
Alignment:
Q  141 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||    
T  29106555 tgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaa 29106644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 175
Target Start/End: Original strand, 4537003 - 4537071
Alignment:
Q  107 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  4537003 aaatgaggggtaaccttggcataatcggtaatgttgtggtcatgtgattgaaaggtcacgggtttaagt 4537071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Original strand, 32418221 - 32418329
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||| || |||| || ||||   ||| |||| |  |||||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||||||| || || ||    
T  32418221 gtaaagttgttgtcaagtgactgaaatgtcattagtttaagtcatagaaacaacctcttacataaaaatcaggataagactgcatacaataaacaaaaaa 32418320  T
Q  234 tggtgggac 242  Q
    |||||||||    
T  32418321 tggtgggac 32418329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46170029 - 46169981
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  46170029 aatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttcagtgca 46169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136525
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttt 7136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28817808 - 28817623
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28817808 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 28817709  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28817708 aggctgcgtacaatacacc--caatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttttta 28817623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Original strand, 6760775 - 6760961
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6760775 atgaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 6760873  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6760874 aaggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 36720749 - 36720932
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36720749 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 36720848  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36720849 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccctttt 36720932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 109 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39461179 - 39460993
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39461179 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagt 39461080  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461079 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 39460993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954271
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggta 209  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttt 26954271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530285
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgacctttt 44530285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 25250474 - 25250662
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  25250474 atgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggt 25250573  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25250574 atggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttttta 25250662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261816
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 35261816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670248
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 12670332  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12670331 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttttt 12670248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521685
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30454277 - 30454095
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  30454277 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggta 30454180  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30454179 aggctgcgtacgatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30454095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160836
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggta 13160753  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13160754 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttt 13160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 293
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071398
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 45071317  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45071318 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Original strand, 20869945 - 20870062
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20869945 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagctttagtg 20870044  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20870045 caccgggttgcccttttt 20870062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8897927 - 8897762
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  8897927 aactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacacc 8897828  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8897827 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttttt 8897762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Original strand, 12625861 - 12626026
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacac 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12625861 aactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacac 12625960  T
Q  228 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||  ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12625961 caa--atggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca--gggtaagg 212  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttg 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Original strand, 2626471 - 2626657
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt---aaaaaacag 205  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||   |||||||||    
T  2626471 atgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacag 2626570  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  2626571 ggtaagactgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca---gggtaag 211  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |   |||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttg 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 17823529 - 17823711
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  17823529 tgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggata 17823628  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    || |||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17823629 agactgcgtaaaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17823711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44781665 - 44781517
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  44781665 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 44781566  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44781565 atgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 16225049 - 16225156
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225049 cctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 16225148  T
Q  287 tgcccttt 294  Q
    || |||||    
T  16225149 tgtccttt 16225156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18164941 - 18164758
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18164941 tgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggta 18164843  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||| ||| |||||||||||||  | | || ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18164842 aggttgcgtacaatacaccaa--aggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccattttt 18164758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 20869580  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 271  Q
    |||||  |||||||||||||    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20869579 ggctgtgtacaatacaccaa----ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8484069 - 8483947
Alignment:
Q  161 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgca 260  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||     
T  8484069 gtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccatcccagaccctgcg 8483972  T
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8483971 tatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742515
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  || | || ||||||| | ||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||  |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgcccctttta 44742515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135287
Alignment:
Q  163 cacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 262  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgta 5135321  T
Q  263 tgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  5135320 tgcaggagcttt-gtgcaccgggctgcccttttta 5135287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 294
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407538
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||           
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaagg------- 28407470  T
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
         |||||  ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28407471 -----cacca--aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 292
Target Start/End: Original strand, 29877116 - 29877227
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  29877116 ggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgttagtg 29877213  T
Q  279 caccgggttgccct 292  Q
    |||| || ||||||    
T  29877214 caccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457308
Alignment:
Q  139 gttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtg 238  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||| |||  |||||     
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaat-aggaaaaggctgcgtacaatacatcaa--atggta 31457251  T
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31457252 ggaccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 31457308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 282
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||     
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaat- 22598231  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  22598232 -tggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 297
Target Start/End: Original strand, 10857858 - 10857967
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10857858 cctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T
Q  286 ttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||    
T  10857956 ttgcccttttta 10857967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365071
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||      
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaa-- 24365121  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  24365120 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccg 24365071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 250
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748392
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 250  Q
     | || ||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccccttccc 11748392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17250982 - 17250879
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  17250982 cctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaaggagctttagtgca-cgggt 17250884  T
Q  287 tgccc 291  Q
    |||||    
T  17250883 tgccc 17250879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 297
Target Start/End: Original strand, 16013515 - 16013594
Alignment:
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16013515 tacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttttta 16013594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 284
Target Start/End: Original strand, 389644 - 389770
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt--aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 255  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  389644 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  256 ccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604905
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| | | | |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||| |||||||||| |  |||| | ||| ||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacacta--aatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgccctttt 40604905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Original strand, 19729382 - 19729476
Alignment:
Q  199 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  19729382 aaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcactggattgccctttt 19729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106014
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatg 35106000  T
Q  236 gtgggaccccttcc 249  Q
    |||||||| |||||    
T  35106001 gtgggacctcttcc 35106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942421
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 254  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagac 43942421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245565
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||   ||||| |||    ||||||||||    
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt----aacagggtaa 24245499  T
Q  211 ggctgcatacaatacacc-aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    | || | |||||| |||| || ||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  24245500 gactacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttta 24245565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 26102577 - 26102654
Alignment:
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26102577 atacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 26102654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42083858 - 42083699
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||||| |    
T  42083858 ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtacagtataccaa-a 42083760  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  || | |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  42083759 atggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgccctt 42083699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Original strand, 5689661 - 5689761
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||||||||| |    
T  5689661 cctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgggagctttagtgcaccggtt 5689758  T
Q  287 tgc 289  Q
    |||    
T  5689759 tgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000228
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 242  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cacggtaaggttccatacaatacacca--aatggtgggac 23000271  T
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23000270 cccttcccgg---------atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23000228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14018128 - 14017989
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |    
T  14018128 ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacactaa-a 14018030  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 273  Q
     |||||||||| |||||  ||||| ||| |||||| |||||    
T  14018029 ttggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 294
Target Start/End: Original strand, 33866973 - 33867087
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 279  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||||  ||  ||||||  |||| || ||||| | |||||||||||    
T  33866973 aaacaactttttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgc 33867072  T
Q  280 accgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||    
T  33867073 accgggttgcccttt 33867087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468090
Alignment:
Q  245 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 27468090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 293
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508044
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgtcctt 27508044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35107373 - 35107310
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35107373 aatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccctttt 35107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918197
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaa 36918197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457864
Alignment:
Q  204 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||  || |||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtttcctttttt 26457864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962849
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgc 30962849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000997
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |   | |||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||      
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacacca-- 11001012  T
Q  232 aatggtgggacccct 246  Q
    |||||||||||||||    
T  11001011 aatggtgggacccct 11000997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486567
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccctt 36486567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40607884 - 40607841
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  40607884 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaatgtcatgagttcaagt 40607841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23286379 - 23286337
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23286379 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 23286337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23286476 - 23286434
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 151  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  23286476 atgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 23286434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2351780 - 2351719
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2351780 aatggtgggaccc-ttcctagaccctgcat--gcgggagctttagtgcaccgagttgtccttttt 2351719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595975
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgcctttttt 18595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619103
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 4619103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879719
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 38879719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 106 - 295
Target Start/End: Original strand, 41014268 - 41014454
Alignment:
Q  106 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 205  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41014268 aaaatgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacag 41014366  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41014367 ggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 41014454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449027
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 24449027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334342
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaagg 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 43334342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710448
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 35710364  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35710365 ggctgcgttcaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 35710448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12006485 - 12006329
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12006485 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtctgg-aaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaatacaccaataatg 12006387  T
Q  236 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12006386 gtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169981
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaa--cagggtaa 8170066  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8170065 ggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttttta 8169981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328890
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcggattgccttttt 27328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801767
Alignment:
Q  166 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 265  Q
    ||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  266 gggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttt 13801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Original strand, 20135626 - 20135740
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20135626 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttcagtg 20135725  T
Q  279 caccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||||||||    
T  20135726 caccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 295
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703558
Alignment:
Q  144 tgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 243  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacc 32703506  T
Q  244 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32703507 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 32703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565566
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc-ttagtgcaccgggttgcccttt 1565566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516432
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaa-a 28516495  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28516494 atggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccctttt 28516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 274
Target Start/End: Original strand, 22600407 - 22600569
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  22600407 tgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggta 22600506  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  22600507 aggctgtgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 22187238 - 22187422
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  22187238 tgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgata 22187337  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    || |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  22187338 agactgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttt 22187422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Original strand, 23974734 - 23974839
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23974734 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggta 23974832  T
Q  210 aggctgc 216  Q
    |||||||    
T  23974833 aggctgc 23974839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37024736 - 37024626
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  37024736 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 37024639  T
Q  210 aggctgcatacaa 222  Q
    ||||||| |||||    
T  37024638 aggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaa-a 208989  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||||||    
T  208988 atggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 285
Target Start/End: Original strand, 39301099 - 39301249
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||| |    
T  39301099 ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtataatgcaccaa-a 39301197  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    | |||||||||||||||| |||||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  39301198 aaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 291
Target Start/End: Original strand, 7368420 - 7368528
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  7368420 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtg 7368515  T
Q  279 caccgggttgccc 291  Q
    |||||||||||||    
T  7368516 caccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 285
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  160 ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgc 259  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatatacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgc 43574706  T
Q  260 atatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  43574707 gtatgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405324
Alignment:
Q  140 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 239  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||| || |||||  ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacacca--aatggtgg 1405267  T
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1405268 gaccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttttt 1405324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880647
Alignment:
Q  182 aacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcac 16880660  T
Q  282 cgggttgcccttt 294  Q
    |||||| ||||||    
T  16880659 cgggtttcccttt 16880647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426043
Alignment:
Q  161 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagac 254  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagac 41426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142941
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||| ||||||||| || |||  || | ||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacagtacaccaa- 19143005  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  19143004 -atggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgcccttttt 19142941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 29334417 - 29334532
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||| ||    
T  29334417 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatg 29334515  T
Q  279 caccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||    
T  29334516 caccgggctgccctttt 29334532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154814
Alignment:
Q  203 cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttt 34154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42924973 - 42924830
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  42924973 actgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttcccag 42924874  T
Q  253 --accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
      |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  42924873 acaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccggattgtccttt 42924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 271
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactg-gaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||    |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgt-aaaaacagggtaa 2838831  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 271  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  2838832 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 294
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622595
Alignment:
Q  223 tacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 295
Target Start/End: Original strand, 16957375 - 16957450
Alignment:
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16957375 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 16957450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 290
Target Start/End: Original strand, 30006297 - 30006456
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||  | |||||||  || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||| |||||     
T  30006297 aactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgtgtacattacact 30006396  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006397 a--aatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  141 tgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggg 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatca--aatggtggg 1850720  T
Q  241 accccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||| |||||  ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1850721 accacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097772
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 7097774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11657835 - 11657697
Alignment:
Q  161 gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg----gtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |  |     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  11657835 gtcacgggttcaagttatggaaacaacctattatgtaaaatagtgtaactgtaaggctgcatacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccc 11657737  T
Q  257 cgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     ||| | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11657736 tgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgcccttttt 11657697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028622
Alignment:
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 16028622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12575775 - 12575660
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaa-aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  12575775 ggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagctttggt 12575677  T
Q  278 gcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||| ||||||||    
T  12575676 gcaccgggctgcccttt 12575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861668
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    ||| ||  ||||||||||||| |    ||||| |    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaa---gtaagac 22861748  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  22861747 tgctcacaatacatcaa--atggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgccctttt 22861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24323818 - 24323725
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24323818 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24323725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24360442 - 24360349
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24360442 ggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaa--atagtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24360349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 3771379 - 3771475
Alignment:
Q  197 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3771379 aaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 3771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  199 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaa--atagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 295
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801652
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttt 39801652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30877628 - 30877564
Alignment:
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30877628 ataaaggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30877564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907904
Alignment:
Q  142 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 241  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttgcatacaatacacca--aatggtggga 22907918  T
Q  242 cccct-tcccagac 254  Q
    ||||| ||||||||    
T  22907917 cccctctcccagac 22907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5873434 - 5873322
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||||||  ||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  5873434 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggctaagtacactacaccaat--tggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagctttagtg 5873338  T
Q  279 caccgggttgcccttt 294  Q
    || |||| ||||||||    
T  5873337 catcgggatgcccttt 5873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943843
Alignment:
Q  238 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 10943843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Original strand, 22025539 - 22025601
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 215  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22025539 actgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31694207 - 31694120
Alignment:
Q  193 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||    
T  31694207 gtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctat--tgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcacc 31694120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306493
Alignment:
Q  219 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 10306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24903807 - 24903694
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||| |||||    
T  24903807 aaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaat--tggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgca 24903710  T
Q  281 ccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||| || |||||||    
T  24903709 ccgggctgtccttttt 24903694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354263
Alignment:
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 32354263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21784394 - 21784335
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21784394 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||||||||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313571
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24313634  T
Q  234 tggtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313633 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgccctttt 24313571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355908
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctc-ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||||||||   |||||||||| | || |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24355971  T
Q  234 tggtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  |  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24355970 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgccctttt 24355908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074573
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 236  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||||  ||||||||    |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacacca--aatgg 34074620  T
Q  237 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
      || |||||||||| |||| || |||| ||||||  ||||||||||||    
T  34074619 cagggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagc--tagtgcaccggg 34074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10634301 - 10634224
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  10634301 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggct 10634224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 173  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29184094 - 29184062
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29184094 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29184062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Original strand, 29297862 - 29297914
Alignment:
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29297862 ataatggtgggatcccttcccggaccccgcaaatacgggtgctttagtgcacc 29297914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 151
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299626
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgt 31299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4654477 - 4654427
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4654477 aatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 4654427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 292
Target Start/End: Original strand, 11462924 - 11462958
Alignment:
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11462924 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11462958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Original strand, 18684361 - 18684403
Alignment:
Q  247 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 289  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18684361 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 18684403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438741
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcat 149  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 19438741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39079925 - 39079883
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  39079925 ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagt 39079883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2432395 - 2432342
Alignment:
Q  194 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  2432395 tgtaaaaaacaaggcaagggtgcatataatacaccaaaaatggtggaacccctt 2432342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 293
Target Start/End: Original strand, 19438759 - 19438800
Alignment:
Q  252 gaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19438759 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 296
Target Start/End: Original strand, 19093894 - 19093950
Alignment:
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19093894 gacccctacccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19093950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39079826 - 39079755
Alignment:
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  39079826 tacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcacagggctgcc 39079755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 149
Target Start/End: Original strand, 41956884 - 41956924
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcat 149  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  41956884 atgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 97)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 118 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408599
Alignment:
Q  118 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 217  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 16408599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 111 - 291
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647098
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501926
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |      || ||||||||||||||||||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtca------cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 23501926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256395
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||   |||     ||||||||||||||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctggag----cctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttag 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttag 13256395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 20224937 - 20225117
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20224937 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagggta 20225034  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20225035 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648396
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggta 5648310  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5648311 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttttta 5648396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6430807 - 6430627
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6430807 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggta 6430709  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6430708 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48599006 - 48598823
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  48599006 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 48598909  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48598908 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 48598823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528528
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 47528612  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47528611 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 47528528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911700
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccctttt 16911700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Original strand, 30639333 - 30639516
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30639333 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaa-cagggta 30639431  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30639432 aggctgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttttt 30639516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 308 - 431
Target Start/End: Original strand, 33049064 - 33049188
Alignment:
Q  308 taaaaataatatttct-aactgaagttcaaaataagtaactcaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaaccg 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33049064 taaaaataatatttcttaagtgaagttcaaaataagtaactgaagaccagttttttacatgtaactcttgcatatcctaagcactccataccttgaacca 33049163  T
Q  407 cacactgtttcaaatgtctgtgctg 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  33049164 cacactgtttcaaatgtctttgctg 33049188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363130
Alignment:
Q  130 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 44363130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660543
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcccctttt 10660543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874688
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcccctttt 10874688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5306848 - 5306658
Alignment:
Q  107 aaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagg 206  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  5306848 aaatgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagg 5306750  T
Q  207 gtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatg----cgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5306749 gtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttttt 5306658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054146
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaa--cagggtaa 11054230  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    | |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11054229 gactgcgtacaatacaccaa--atggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 11054146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405224
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggta 209  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |       |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggccta-------gaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  37494905 ggttgcatacaatatacca--aatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20639772 - 20639656
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20639772 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 20639674  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20639673 caccgggttgcccttttt 20639656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567307
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacca--a 35567243  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35567244 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 35567307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 284
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
      |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  19027923 --tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225211
Alignment:
Q  202 acagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 293
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  130 actggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 40915900  T
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
      |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40915901 --aatggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Original strand, 47443958 - 47444094
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  47443958 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 47444055  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47444056 gcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttttt 47444094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983970
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgccctttt 14983970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175203
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaa-caacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatg 54175140  T
Q  236 gtgggaccccttcccag-accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54175141 gtgggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttta 54175203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8473783 - 8473621
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8473783 aactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaa--cagggtaaggctgcatacaatacacc 8473686  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccag-acccc-gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8473685 aa--atggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043393
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 236  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgg 17043452  T
Q  237 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  17043451 tgggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta-tgcaccaggctgcccctttt 17043393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832310
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 234  Q
    |||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--at 9832373  T
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9832372 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttttta 9832310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352578
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-----cagggtaa 210  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||||     ||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  211 g----gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttttt 30352578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463259
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 242  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacca--aatggtgggac 25463205  T
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  25463206 cccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt-gtgcaccaggctacccttttta 25463259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Original strand, 25629071 - 25629187
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25629071 ggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  279 caccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25629169 caccgggttgcccttttta 25629187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48327869 - 48327763
Alignment:
Q  188 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48327869 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggtt 48327770  T
Q  288 gcccttt 294  Q
     ||||||    
T  48327769 acccttt 48327763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29208035 - 29207900
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  29208035 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690176
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-------cagggtaaggctgcatacaatacac 227  Q
    |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  228 caataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30690240 caat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttt 30690176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Original strand, 54730225 - 54730389
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  54730225 ggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataaggctgcgtataatacaccaat 54730324  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  54730325 aatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgaattacccttttt 54730389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 291
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967151
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    | ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54967076 gttgc-tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagcttt-gtgcaccgggctgccc 54967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9987947 - 9987832
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||    
T  9987947 ggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacca--aatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggagctttaatg 9987850  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  9987849 caccgggctgcctttttt 9987832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343326
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || ||| ||||||||||| ||| || || |||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttagagcacccggctgcccctttt 25343326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaa-aa 30581526  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077794
Alignment:
Q  138 agttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggt 237  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatatacca--aatggt 39077853  T
Q  238 gggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    | |||  ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39077852 gagacatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 39077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 14590790 - 14590922
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 208  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14590790 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 14590889  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  14590890 aaggctgcatacaatacatca--aatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33836564 - 33836485
Alignment:
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33836564 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttttt 33836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029078
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaa-a 39029122  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 276  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag 39029078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865037
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgca 51865052  T
Q  281 ccgggttgccctttt 295  Q
    ||||  |||||||||    
T  51865051 ccggactgccctttt 51865037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 487306 - 487135
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  487306 ccttggcgtaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgta 487208  T
Q  220 caatacaccaata-------atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||| || |       |||| ||||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  487207 caatacactaaaatggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938611
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cggggtaagg-tg--tacaatacaccaa-aatg 49938652  T
Q  236 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 276  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49938651 gtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagctttag 49938611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcac-gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||   |||||||   ||||||||   ||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggta 55766549  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| ||||||||||    |||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  55766548 aggctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908634
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||  |||||||| | ||||||| | |||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 20908699  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  20908698 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgcccttttt 20908634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478792
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 234  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     ||||||||||  ||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaa-cagggtaaggctg-----aatacaccaa--at 32478851  T
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32478850 ggtgggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagcttt-gtgcaccgggtggcccttt 32478792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30496476 - 30496333
Alignment:
Q  136 aaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatg 235  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30496476 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaaggctgcatacaatacacca--aatg 30496381  T
Q  236 gtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    | ||||| ||||||| ||||  || ||||  |||||||||||||||||    
T  30496380 gggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 296
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484370
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 32484370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 199 - 285
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  199 aaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 289
Target Start/End: Original strand, 21489109 - 21489218
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||    
T  21489109 ggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttcgtg 21489207  T
Q  279 caccgggttgc 289  Q
    ||| |||||||    
T  21489208 cactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  140 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 239  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacacca--aatagtgg 41018849  T
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||    
T  41018848 gaccccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315372
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggc 17315378  T
Q  214 tgcata 219  Q
    ||||||    
T  17315377 tgcata 17315372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38755973 - 38755908
Alignment:
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38755973 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38755908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830721
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgg-gttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||||   ||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgt-gtaaacagggta 55830804  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | ||||| ||||||||||    |||||||| ||||| |||| ||||  || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  55830803 atgctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7909393 - 7909281
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc-gggagctttagt 277  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  7909393 ggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttagt 7909297  T
Q  278 gcaccgggttgccctt 293  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7909296 gcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 38786682 - 38786746
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38786682 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 38786746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035308
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 217  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgca 43035308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164225
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgc 42164225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  140 ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgg 239  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||  ||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatggtgg 7385531  T
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc 271  Q
    ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  7385530 gaccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10277855 - 10277754
Alignment:
Q  194 tgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  10277855 tgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcgggagttctagtgaaccggattgccctt 10277758  T
Q  294 ttta 297  Q
    ||||    
T  10277757 ttta 10277754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441568
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 47441592  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  47441591 atggttggaccccttcccggaccc 47441568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038188
Alignment:
Q  145 gtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccc 244  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||   | ||||| | |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | |    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaa-aatggtggggcac 7038138  T
Q  245 cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    || ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7038139 ctacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccctttt 7038188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 11394925 - 11394987
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11394925 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 11404652 - 11404714
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404652 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816382
Alignment:
Q  198 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttttt 36816382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 297
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323038
Alignment:
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 56323038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580206
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 234  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||| |||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaa-aat 23580267  T
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || | |||||||||   || || |  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23580266 ggcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgcccttttt 23580206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553937
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718702
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttt 44718702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580860
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||  || ||    ||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||  ||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtctggaaa----cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacacca--aa 3580901  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    || | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  3580900 tgctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 3580860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5313177 - 5313113
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaa 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5313177 atgacgggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaa 5313113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Original strand, 28494224 - 28494288
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  28494224 aatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcctttttt 28494288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 273
Target Start/End: Original strand, 49796820 - 49796911
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctt 273  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||    
T  49796820 ggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 294
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  201 aacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt-agtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12711561 - 12711450
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgc 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||||||    
T  12711561 aaacaacatcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgc 12711464  T
Q  280 accgggttgccctt 293  Q
    |||  |||||||||    
T  12711463 acccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 296
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028048
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 19028048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388311
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25388311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 51420553 - 51420646
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacggg-ttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 229  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||   | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51420553 aagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532129
Alignment:
Q  244 ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 35532129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 291
Target Start/End: Original strand, 36589765 - 36589876
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||    |||||||||||||| |||    
T  36589765 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttgacagtacaccaa-aatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtg 36589863  T
Q  279 caccgggttgccc 291  Q
    ||||||| |||||    
T  36589864 caccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357318
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    |||||||||| |||||||| ||| || ||||| |  | |||||||||||||     
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaa- 44357293  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44357294 aatggcgggacctcttcccagaccc 44357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 50555721 - 50555654
Alignment:
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50555721 aataatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgcccttttt 50555654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29879681 - 29879624
Alignment:
Q  108 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcac 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29879681 aatgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgactagaaggtcac 29879624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47482918 - 47482849
Alignment:
Q  226 accaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  47482918 accaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaacgagctgccctttt 47482849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079696
Alignment:
Q  166 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    ||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgcta--aatggtgggaccctttcc 17079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629285
Alignment:
Q  142 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 241  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||| ||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaa-attggcggga 32629322  T
Q  242 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||||| ||||  || |||| ||||| |||||||    
T  32629321 ccccttcccggaccttgcgtatgtgggagttttagtg 32629285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Original strand, 8820578 - 8820629
Alignment:
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  8820578 aataatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894505
Alignment:
Q  191 ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 250  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 35894505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54640498 - 54640429
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 202  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  54640498 ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 151
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969735
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgt 151  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 18969735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Original strand, 21003410 - 21003469
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21003410 atggtgtgacctcttcccagaccctgcgtgtgcgggagcttt-gtgcaccgggctgccctt 21003469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34257034 - 34256982
Alignment:
Q  242 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34257034 ccccttctcagaccttgcacatgcgggagctttagtgcaccgggctgctcttt 34256982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Original strand, 14530271 - 14530455
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14530271 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 14530370  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14530371 aggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 14530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Original strand, 10543647 - 10543835
Alignment:
Q  106 aaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacag 205  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10543647 aaaataaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacag 10543746  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10543747 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455315
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccctttt 8455315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841166
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 5841166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200622
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 24200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 295
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514571
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 212  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacacca--aatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 11514571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21779448 - 21779260
Alignment:
Q  103 ataaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||  ||||    
T  21779448 ataaaagtgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt--aaaa 21779351  T
Q  203 cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21779350 cagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21779260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25079900 - 25079717
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 208  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25079900 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggt 25079801  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25079800 aaggatgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671315
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaag-gtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 9671231  T
Q  210 aggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671232 aggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 9671315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Original strand, 23397718 - 23397899
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  23397718 atgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggt 23397815  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23397816 aaggctacgtacaatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 23397899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 17667974 - 17668139
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17667974 aactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17668073  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  |||||||| |||||||| |  |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17668074 a--aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 17668139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25249920 - 25249736
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  25249920 atgatgggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggt 25249822  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249821 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttttt 25249736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416871
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
      || |||||||| ||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 40416871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 17623536 - 17623701
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17623536 aactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacc 17623635  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  |||||||| ||||||||||  | || || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17623636 a--aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttttt 17623701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546300
Alignment:
Q  148 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 246  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccct 10546250  T
Q  247 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546251 tcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 10546300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023929
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 12024001  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| || |||  || ||||||| ||||||||    
T  12024000 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39914467 - 39914305
Alignment:
Q  131 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaa-aaaacagggtaaggctgcatacaatacacca 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  39914467 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacacc- 39914369  T
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
      |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39914368 -gaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 39914305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896398
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaac-agggtaag 211  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaa--atggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttttta 17896398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444865
Alignment:
Q  148 atgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacgatacaccaa--atggtgggacccctt 14444816  T
Q  248 cccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14444817 cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttttt 14444865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158436
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataat 234  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||     ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacctgattgtccttttta 31158436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214673
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||| | ||| | || |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgcctttttt 7214673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 256
Target Start/End: Original strand, 22371008 - 22371151
Alignment:
Q  108 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||   ||||||||||    
T  22371008 aatgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacaggg 22371104  T
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  22371105 taaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccc 22371151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32781448 - 32781308
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      
T  32781448 tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca-- 32781351  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32781350 aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 32781308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377071
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacca--a 21377135  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  21377134 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccgagctgcccttttta 21377071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 297
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573758
Alignment:
Q  117 taaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 216  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgc 27573679  T
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
     ||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27573680 gtacaatacacca--aatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttttta 27573758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977712
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 212  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||  |  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattacccttttt 19977712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  211 ggctgcatacaatacacca 229  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 274
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795400
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatac-aatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttt 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 33795400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 294
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544201
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgta-aaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | |||| | |||||  | || |||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttt 14544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Original strand, 36871515 - 36871628
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  36871515 ggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggacct-gcgtatgcgggagctttagtg 36871610  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36871611 caccgggttgcccttttt 36871628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24860149 - 24859986
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  24860149 aactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggta-ggctgcgtacaatacacc 24860052  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||  ||||| | |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24860051 aa--atggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcctttttt 24859986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40762347 - 40762234
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||||||||||    
T  40762347 ggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaa--atggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  279 caccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||||||||    
T  40762249 caccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4516510 - 4516354
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||   |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4516510 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtacaatacaccaat- 4516412  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| |||||| |||||    
T  4516411 -tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643659
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||    |||| | ||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtacca- 44643595  T
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44643596 -aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgccctttt 44643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 5450360  T
Q  234 tggtgggaccccttcc 249  Q
     |||||||||||||||    
T  5450361 gggtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 282
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  146 tcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccc 245  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 282  Q
    |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521392
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacacca--a 44521435  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    |||| |||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  44521434 atggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttta 44521392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  134 gtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataa 233  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctct--tgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacacca--aa 99326  T
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684615
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca-acctcttgtgtaaaaaac-agggt 208  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||| ||||   | ||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttagt 299  Q
    |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaa--atggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtcctttttagt 26684615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890533
Alignment:
Q  197 aaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23145759  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23145758 -tggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23557549  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
     ||||||||||| ||||| |||||    
T  23557548 -tggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632644
Alignment:
Q  192 tgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||  |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 25632641  T
Q  292 ttt 294  Q
    |||    
T  25632642 ttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Original strand, 44604825 - 44604907
Alignment:
Q  128 taactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44604825 taactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380238
Alignment:
Q  137 aagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatgg 236  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||     
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatga 17380295  T
Q  237 tgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17380294 tggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagcttt-gtgcaccgggcttcccttt 17380238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Original strand, 30826059 - 30826172
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30826059 ggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtggaaccc-ttcccagaccctacatatgcgggagctttagtg 30826154  T
Q  279 caccgggttgcccttttt 296  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  30826155 caccagattgtccttttt 30826172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 295
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080237
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccctttt 34080237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419947
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg----taaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  229 aa 230  Q
    ||    
T  29419948 aa 29419947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Original strand, 23488544 - 23488619
Alignment:
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23488544 caatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctctttt 23488619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 296
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641638
Alignment:
Q  142 gttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtggga 241  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgt-gaaaacagggtaaagttgcgtacaatacacca--aattgtggga 25641583  T
Q  242 ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||  | || || |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  25641584 ccccttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtccttttt 25641638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633708
Alignment:
Q  240 gaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 3633708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 284
Target Start/End: Original strand, 17471542 - 17471675
Alignment:
Q  151 taactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    |||||| || ||||| |||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  17471542 taactgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaa-aatgatgagaccccttcc 17471640  T
Q  250 cagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17471641 ctgaccctgcctatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296404
Alignment:
Q  166 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 265  Q
    ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||| | ||||| || ||||     
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaa-aatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgt 15296435  T
Q  266 gggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    || |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15296434 ggaagctttggtgcgccaggctgcccttttt 15296404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 296
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766392
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttttt 34766392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189502
Alignment:
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcctttttt 39189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44449495 - 44449395
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || | || ||||| |||| ||||    
T  44449495 aaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa-aatagtgggaccccttcccggaccctgcgtttgtgggagttttaatgca 44449397  T
Q  281 cc 282  Q
    ||    
T  44449396 cc 44449395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13245181 - 13245096
Alignment:
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13245181 ggtaaggctgcgtacattacactaa--atggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagctttagtgtatcgggttgccctt 13245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45235988 - 45235815
Alignment:
Q  122 ttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa-aacagggtaaggctgcatac 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||    ||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| | |      
T  45235988 ttggtgtaaccagtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgt 45235889  T
Q  221 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  45235888 aatacacaaa--atggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgcccctttt 45235815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 1289093 - 1289159
Alignment:
Q  230 ataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1289093 ataatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgccctttt 1289159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371248
Alignment:
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 22371248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 294
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576030
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 8576030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Original strand, 31525779 - 31525838
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 291  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31525779 aatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 286
Target Start/End: Original strand, 31523304 - 31523358
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31523304 aatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggt 31523358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39189603 - 39189557
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactg 156  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39189603 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg 39189557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124918
Alignment:
Q  246 ttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124962 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 124918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19185837 - 19185743
Alignment:
Q  200 aaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  19185837 aaacatggtaaagttgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttt 19185743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23053012 - 23052962
Alignment:
Q  247 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23053012 tcccagaccctgcgtatgcaggagcttttgtgcaccgggctgcccttttta 23052962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Original strand, 4794875 - 4794924
Alignment:
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcac 281  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  4794875 aatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgcac 4794924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12315785 - 12315714
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 230  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  12315785 aaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttat-taaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaa 12315714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29356040 - 29355852
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaag-ttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29356040 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 29355941  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355940 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 29355852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12222080 - 12221913
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12222080 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 12221981  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagc-tttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12221980 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 12221913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347099
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt--aaaacagggtaa 1347015  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1347016 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 1347099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354756
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1354839  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1354838 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2166575 - 2166408
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2166575 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2166476  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2166475 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 2166408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2178208 - 2178041
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2178208 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 2178109  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178108 aataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 2178041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 9161074 - 9161261
Alignment:
Q  108 aatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 207  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  9161074 aatgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagag 9161172  T
Q  208 taaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9161173 taaggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttttt 9161261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14975267 - 14975094
Alignment:
Q  105 aaaaatgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaaca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14975267 aaaaatgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 14975168  T
Q  205 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
     ||            |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14975167 agg------------caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941992
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||  || |  |  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgcccttttt 1941992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Original strand, 6024205 - 6024338
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  6024205 aactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtacaatacacc 6024304  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcata 262  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  6024305 aataatgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 212  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||| | |||| |     
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Original strand, 12892071 - 12892146
Alignment:
Q  221 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12892071 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 12892146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 8409195 - 8409311
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8409195 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggt 8409294  T
Q  209 aaggctgcatacaatac 225  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8409295 aaggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Original strand, 26097182 - 26097296
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26097182 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  279 caccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttttta 26097296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728156
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagac 32728235  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||  ||||||| |||||  || ||||  ||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  32728234 tgtgtacaatataccaa--atagtggt-ccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgccctttt 32728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Original strand, 25557747 - 25557861
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25557747 ggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  279 caccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttttta 25557861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905041
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 211  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  212 gctgcatacaatacaccaa 230  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaa 13905041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7947511 - 7947371
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| |||||||| ||||||| |   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  7947511 actgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggcccccttcccgg 7947413  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7947412 accttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttt 7947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400737
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggct 214  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  215 gcatacaatacac 227  Q
    || |||| |||||    
T  20400725 gcgtacagtacac 20400737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866041
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
     ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886049
Alignment:
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12886049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 272
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553626
Alignment:
Q  122 ttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcataca 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||   ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  222 atacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagct 272  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18277327 - 18277191
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacccc 257  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||| |     
T  18277327 aaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaa--atggtgggaccccttcctagactct 18277230  T
Q  258 gcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18277229 acgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtccttttt 18277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 24097553 - 24097714
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||    
T  24097553 aactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----acc 24097648  T
Q  229 aataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  24097649 a--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgcccttttt 24097714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 294
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889562
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||||||||||||||| || | || |||||||| |||||||||   | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacaccta-a 12889500  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | | ||||||||||| || |||||    | || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12889501 acgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttt 12889562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||   | ||||| |||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatat--gcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 293  Q
    |||||||||  |||||||| | || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930126
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttc-aagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    ||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||  ||  ||||||||| |||| |||| | |||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |     
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gt 23930206  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23930205 tgcgtacaatacaccag--atggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 23930126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Original strand, 19340858 - 19340954
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19340858 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaa-aatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacggg 19340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 283
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  162 tcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcat 261  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||| |  |    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacca--aatggtgggacccttttccggaccctgtgt 33138935  T
Q  262 atgcgggagctttagtgcaccg 283  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  33138936 atgcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 296
Target Start/End: Original strand, 6808467 - 6808532
Alignment:
Q  231 taatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6808467 taatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6808532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007761
Alignment:
Q  135 taaagttgttgtcatgtaactggaa--ggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||  |    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaa--cagggtcaggctgcgtacaatacacca--a 28007699  T
Q  233 atggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  28007700 atgctgggaccccttccctaacctc-catatgcggaagctctagtgcaccggattaccctttt 28007761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Original strand, 17432336 - 17432483
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg------ctgcatacaatacaccaataatggtgggacccct 246  Q
    |||| |||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||| || ||||||| ||||  |    
T  17432336 actgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagaccttt 17432435  T
Q  247 tcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||| || || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17432436 tcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17432483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9671196 - 9671082
Alignment:
Q  181 aaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  9671196 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaa-aatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  281 ccgggttgcccttttt 296  Q
     |||| ||||||||||    
T  9671097 tcgggctgcccttttt 9671082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3116262 - 3116127
Alignment:
Q  153 actggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccag 252  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |        ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  3116262 actgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaatga--------ctgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcgg 3116171  T
Q  253 accccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||  || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3116170 accttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttttt 3116127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 297
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267863
Alignment:
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttta 13267863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Original strand, 22967124 - 22967235
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  22967124 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgt-aaaaataggata 22967222  T
Q  210 aggctgcatacaa 222  Q
    |||||||||||||    
T  22967223 aggctgcatacaa 22967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23821269 - 23821158
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 209  Q
    |||||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  23821269 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgta-aaaataggata 23821171  T
Q  210 aggctgcatacaa 222  Q
    |||||||||||||    
T  23821170 aggctgcatacaa 23821158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 277
Target Start/End: Original strand, 32579474 - 32579543
Alignment:
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32579474 ggtaagcctgcgtacaataccccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 276
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734760
Alignment:
Q  115 ggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaa---------aacag 205  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||| |    |||||||||||||||||||||         |||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacag 24734690  T
Q  206 ggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttag 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  24734691 ggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgc-ggagctttag 24734760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 383834 - 383760
Alignment:
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  383834 tacaatacaccaa--attgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcccttt 383760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20906841 - 20906784
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  20906841 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgaaccaagttgctcttttt 20906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Original strand, 11849075 - 11849145
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11849075 ggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaa-aatggtgggaccccttccc 11849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  143 ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggac 242  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaat--tggtgggac 23240876  T
Q  243 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||||||   |||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23240875 cccttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 247
Target Start/End: Original strand, 32068121 - 32068182
Alignment:
Q  185 aacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32068121 aacctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaa-aatggtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 175
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063485
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagt 12063485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734905
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgcccttt 10734905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 222
Target Start/End: Original strand, 17448325 - 17448389
Alignment:
Q  158 aaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaa 222  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17448325 aaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16895778 - 16895704
Alignment:
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || || ||||||||||||||||    
T  16895778 tgcatacaatacactaaaaatggtgggacccccttcccggaccctacatatgtggaagttttagtgcaccgggtt 16895704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Original strand, 25997749 - 25997787
Alignment:
Q  259 catatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25997749 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttta 25997787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16916064 - 16915996
Alignment:
Q  217 atacaatacaccaataatggtgggacc-ccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16916064 atacaatacactaaaaatggtaggacctccttcctagaccctacatatgtgggagctttagtgcaccgg 16915996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Original strand, 31990096 - 31990163
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacccctt 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31990096 ggaaacaatctcttgtgtaaaaaacggagcaagcttgcatacaatacaccaa-aatggcgggacccctt 31990163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922945
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagt 33922945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751066
Alignment:
Q  190 cttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcg-----ggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |  |||  || ||||||     | ||||||||||||||||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaa-aatggtgagaccccttcacgaaccgtgcgtatgcgtatgagcagctttagtgcaccgg 24751078  T
Q  285 gttgcccttttt 296  Q
    |||||| |||||    
T  24751077 gttgccattttt 24751066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30786407 - 30786372
Alignment:
Q  261 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30786407 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttttt 30786372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395886
Alignment:
Q  234 tggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgg 284  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Original strand, 18254559 - 18254651
Alignment:
Q  198 aaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |  | |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18254559 aaaaacagggtaaagctgcatacaatac-ccaa-aatagtgggaccccttcacagactctacgtatatgggagttttggtgcaccgggctgccct 18254651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33922916 - 33922854
Alignment:
Q  235 ggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33922916 ggtggcaccccttcccggaccctgcttatgttggagctttagtgcacatggttgcccttttta 33922854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 299
Target Start/End: Original strand, 12228380 - 12228498
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtg 278  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| | ||  | || | ||||| |||||||    
T  12228380 ggaaacagactcttgtttaaaaaataggataaagttgcgtacaatacaccag--atagtgggaccccttcccataacctacgtaagtgggagttttagtg 12228477  T
Q  279 caccgggttgccctttttagt 299  Q
     || |||||||||||||||||    
T  12228478 tactgggttgccctttttagt 12228498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 8417444 - 8417500
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaaca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| || | |||||||    
T  8417444 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaaca 8417500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14341166 - 14341134
Alignment:
Q  196 taaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14341166 taaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29016337 - 29016301
Alignment:
Q  239 ggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagcttta 275  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29016337 ggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagcttta 29016301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 132 - 296
Target Start/End: Original strand, 46806 - 46968
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||      
T  46806 tggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca-- 46903  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46904 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 46968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24950 - 24770
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24950 atgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtca-----acagcctcttgtgtaaaaaacagggt 24856  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24855 aaggctgcgtacaacacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttttt 24770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46721
Alignment:
Q  204 agggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgca 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 46721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Original strand, 43681 - 43794
Alignment:
Q  179 ggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc-cagaccccgcatatgcgggagctttagt 277  Q
    ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43681 ggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagctctagt 43776  T
Q  278 gcaccgggttgccctttt 295  Q
    |||| | |||||||||||    
T  43777 gcactgagttgccctttt 43794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 111 - 296
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30714
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtag 30630  T
Q  211 ggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30631 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 294
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59114
Alignment:
Q  116 gtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 215  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  216 catacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 295
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10946
Alignment:
Q  120 ccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcata 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  220 caatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10873 caatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctctttt 10946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13021
Alignment:
Q  113 ggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 212  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| ||||||| || |||||||    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaa-caaggtaagg 13104  T
Q  213 ctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttta 297  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13103 ctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttttta 13021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1745 - 1591
Alignment:
Q  132 tggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  1745 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcatacaatacacca-- 1650  T
Q  232 aatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 290  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1649 aatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 10129  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10128 tgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  114 gggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 213  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 20457  T
Q  214 tgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 292  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20456 tgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 8898 - 8963
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  8898 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagt 8963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 19226 - 19291
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  19226 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48633
Alignment:
Q  166 gggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgc 265  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 48663  T
Q  266 gggagctttagtgcaccgggttgccctttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48662 gggagctctagtgcaccgggttgccctttt 48633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 294
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11264
Alignment:
Q  118 aaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 217  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||     
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaag--taaggctgct 11189  T
Q  218 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 294  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11190 tacaatacaccaa--atggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 256
Target Start/End: Original strand, 4129 - 4257
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  4129 aactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaatacacc 4228  T
Q  229 aataa-tggtgggaccccttcccagaccc 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4229 aataattggtgggaccccttcccggaccc 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 226588 - 226456
Alignment:
Q  110 tgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 208  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  226588 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 226489  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggacc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  226488 aaggctgcatacaatacatca--aatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24131
Alignment:
Q  205 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 24131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 72971 - 72867
Alignment:
Q  188 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  72971 ctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctacaatacaccaa--atggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggtt 72874  T
Q  288 gcccttt 294  Q
    |||||||    
T  72873 gcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35062
Alignment:
Q  111 gaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttg-ttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgt-aaaaaacagggt 208  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||  |||||||||   ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  209 aaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 249  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 175
Target Start/End: Original strand, 83827 - 83893
Alignment:
Q  109 atgaggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  83827 atgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt 83893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Original strand, 23606 - 23695
Alignment:
Q  164 acgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacc 255  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23606 acgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagca--aatggtgggaccccttcccagacc 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Original strand, 3574 - 3679
Alignment:
Q  187 cctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 286  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3574 cctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagt 3671  T
Q  287 tgcccttt 294  Q
    | ||||||    
T  3672 ttcccttt 3679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 244
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  133 ggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaata 232  Q
    |||| |||||||| || || |||  ||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaa-a 33004  T
Q  233 atggtgggaccc 244  Q
     |||||||||||    
T  33005 ttggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 201
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8935
Alignment:
Q  131 ctggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 175
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24682
Alignment:
Q  112 aggggtaaccttggtgtaactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagt 175  Q
    ||||||||||||||   || || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagt 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Original strand, 24696 - 24785
Alignment:
Q  205 gggtaaggctgcatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 296  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||  || ||||  |||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24696 gggtaagactgcgtataatacaccaa--atagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgcccttttt 24785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 201
Target Start/End: Original strand, 43101 - 43173
Alignment:
Q  129 aactggtaaagttgttgtcatgtaactggaaggtcacgggttcaagtgagggaaacaacctcttgtgtaaaaa 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| ||    |||||| |||||||||||||||    
T  43101 aactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University