View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1318_high_36 (Length: 462)

Name: NF1318_high_36
Description: NF1318
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1318_high_36
NF1318_high_36
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (118-453)||(26884751-26885086)
chr6 (121-453)||(26862264-26862596)
chr6 (118-453)||(26656646-26656981)
chr6 (118-453)||(26762617-26762952)
chr6 (121-437)||(26647163-26647479)
chr6 (121-437)||(26753131-26753447)
chr6 (167-453)||(26143598-26143884)
chr6 (118-434)||(27337280-27337596)
chr6 (118-434)||(27398020-27398336)
chr6 (121-453)||(25580406-25580738)
chr6 (167-440)||(25539273-25539546)
chr6 (118-439)||(31285240-31285561)
chr6 (121-453)||(25483743-25484075)
chr6 (167-453)||(26056652-26056938)
chr6 (167-453)||(26076622-26076908)
chr6 (165-453)||(27530467-27530755)
chr6 (165-439)||(27610300-27610574)
chr6 (118-439)||(27717679-27718000)
chr6 (185-453)||(25511640-25511908)
chr6 (118-434)||(28786919-28787235)
chr6 (118-434)||(28793040-28793356)
chr6 (118-433)||(26623952-26624267)
chr6 (118-433)||(26729929-26730244)
chr6 (165-434)||(27603889-27604158)
chr6 (118-439)||(27679631-27679952)
chr6 (118-434)||(26803127-26803443)
chr6 (118-434)||(27705589-27705905)
chr6 (168-434)||(28781832-28782098)
chr6 (118-439)||(27426792-27427113)
chr6 (118-453)||(27592187-27592522)
chr6 (118-453)||(27676786-27677121)
chr6 (118-434)||(25492504-25492820)
chr6 (136-440)||(27697765-27698069)
chr6 (118-440)||(27215133-27215455)
chr6 (29-121)||(26884623-26884715)
chr6 (118-430)||(26824500-26824812)
chr6 (29-119)||(25539096-25539186)
chr6 (31-119)||(26143423-26143511)
chr6 (29-121)||(26647032-26647124)
chr6 (29-121)||(26753000-26753092)
chr6 (29-88)||(27530871-27530930)
chr6 (29-119)||(25580275-25580365)
chr6 (29-118)||(25511491-25511580)
chr6 (43-121)||(26656532-26656610)
chr6 (43-121)||(26762503-26762581)
chr6 (197-271)||(28140295-28140369)
chr6 (29-82)||(27604280-27604333)
chr6 (29-108)||(25483612-25483691)
chr6 (29-119)||(26056475-26056565)
chr6 (29-119)||(26076445-26076535)
chr6 (29-83)||(27427187-27427241)
chr6 (29-83)||(27718074-27718128)
chr6 (352-434)||(28235480-28235562)
chr6 (305-434)||(2185694-2185823)
chr6 (35-83)||(26862142-26862190)
chr6 (29-88)||(27215005-27215064)
chr6 (29-83)||(27592596-27592650)
chr6 (29-83)||(27610695-27610749)
chr6 (29-83)||(27677195-27677249)
chr6 (29-83)||(27679503-27679557)
chr6 (29-83)||(27705979-27706033)
chr6 (29-110)||(26802999-26803080)
chr6 (198-271)||(26937790-26937863)
chr6 (349-434)||(28296925-28297010)
chr6 (349-434)||(28326390-28326475)
chr6 (349-434)||(28504026-28504111)
chr6 (349-434)||(28515063-28515148)
chr6 (168-265)||(29843341-29843438)
chr6 (37-113)||(27337640-27337716)
chr6 (37-113)||(27398380-27398456)
chr6 (57-113)||(28243376-28243432)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (118-437)||(267522-267841)
chr1 (118-433)||(28126861-28127176)
chr1 (118-433)||(28163562-28163876)
chr1 (29-113)||(28127220-28127304)
chr1 (348-439)||(26136799-26136890)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (118-439)||(2719-3040)
scaffold0349 (29-83)||(3114-3168)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (165-434)||(3897-4166)
scaffold0277 (118-434)||(12860-13176)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (118-434)||(8168-8484)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (118-433)||(18678742-18679057)
chr4 (118-439)||(18723261-18723582)
chr4 (118-439)||(18730680-18731001)
chr4 (118-439)||(18698576-18698897)
chr4 (118-433)||(18654659-18654974)
chr4 (118-439)||(18074442-18074763)
chr4 (322-440)||(5090129-5090247)
chr4 (29-83)||(18723656-18723710)
chr4 (31-83)||(18655048-18655100)
chr4 (29-83)||(18074314-18074368)
chr4 (29-83)||(18679131-18679185)
chr4 (29-83)||(18731075-18731129)
chr4 (31-73)||(18698981-18699023)
chr4 (180-265)||(5090307-5090392)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (118-434)||(29273023-29273339)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (118-439)||(60250-60571)
scaffold0003 (29-83)||(60122-60176)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (198-434)||(16691628-16691864)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (346-437)||(3280568-3280659)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (352-434)||(35642-35724)
scaffold0038 (57-113)||(43538-43594)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (346-434)||(57479-57567)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Original strand, 26884751 - 26885086
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884751 tacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 26884850  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26884851 agcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggag 26884950  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26884951 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttt 26885050  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26885051 tgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctag 26885086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 121 - 453
Target Start/End: Original strand, 26862264 - 26862596
Alignment:
Q  121 aacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaaga 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  26862264 aacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtactggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagc 26862363  T
Q  221 aatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaa 320  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  26862364 aatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaattcaactcataatagcttgaaacatctccagaaggag 26862463  T
Q  321 ctccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttga 420  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26862464 cttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccacttataaaggaaagactaaatagaatgaagattcttttga 26862563  T
Q  421 ttcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  26862564 ttctcgatgatgttgacaaactggaacagctag 26862596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Original strand, 26656646 - 26656981
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26656646 tacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaa 26656745  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26656746 agcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggag 26656845  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||| ||||||  ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26656846 gagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttt 26656945  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||    
T  26656946 tgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctag 26656981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Original strand, 26762617 - 26762952
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26762617 tacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaa 26762716  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26762717 agcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggag 26762816  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||| ||||||  ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26762817 gagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagatgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttt 26762916  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||    
T  26762917 tgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctag 26762952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 121 - 437
Target Start/End: Original strand, 26647163 - 26647479
Alignment:
Q  121 aacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaaga 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  26647163 aacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagc 26647262  T
Q  221 aatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaa 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26647263 gatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggag 26647362  T
Q  321 ctccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttga 420  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26647363 ctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttga 26647462  T
Q  421 ttcttgatgatgttaac 437  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26647463 ttctcgatgatgttaac 26647479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 121 - 437
Target Start/End: Original strand, 26753131 - 26753447
Alignment:
Q  121 aacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaaga 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  26753131 aacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagc 26753230  T
Q  221 aatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaa 320  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26753231 gatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagagaattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggag 26753330  T
Q  321 ctccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttga 420  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26753331 ctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttga 26753430  T
Q  421 ttcttgatgatgttaac 437  Q
    |||| ||||||||||||    
T  26753431 ttctcgatgatgttaac 26753447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 167 - 453
Target Start/End: Original strand, 26143598 - 26143884
Alignment:
Q  167 catggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctg 266  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  26143598 catggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttctt 26143697  T
Q  267 cataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgtta 366  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  26143698 cataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggagatgtta 26143797  T
Q  367 gtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  26143798 gtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctag 26143884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27337596 - 27337280
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27337596 tacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaa 27337497  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || |||||||||||   ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||    
T  27337496 agcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaag 27337397  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||| ||||||| || || | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27337396 gagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttt 27337297  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27337296 tgattctcgatgatgtt 27337280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27398336 - 27398020
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27398336 tacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaa 27398237  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || |||||||||||   ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||    
T  27398236 agcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattcagctcgtaaaaacttgaaacatctccagaag 27398137  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||| ||||||| || || | |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27398136 gagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttt 27398037  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27398036 tgattctcgatgatgtt 27398020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 453
Target Start/End: Original strand, 25580406 - 25580738
Alignment:
Q  121 aacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaaga 220  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  ||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25580406 aacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagc 25580505  T
Q  221 aatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaa 320  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||  |  |     
T  25580506 agtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttcaattcttaataacttgaaacatctccattattat 25580605  T
Q  321 ctccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttga 420  Q
    |||||||||| || | |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25580606 ctccttttaataatagttaaattttactttaagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttga 25580705  T
Q  421 ttcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    || ||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  25580706 tttttgatgatgttgacaaactggagcagctag 25580738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 440
Target Start/End: Original strand, 25539273 - 25539546
Alignment:
Q  167 catggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctg 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||     
T  25539273 catggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaagttgtatgttttctt 25539372  T
Q  267 cataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgtta 366  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||| ||||| | |||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  25539373 cataatgtcagagagaattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgtta 25539472  T
Q  367 gtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaa 440  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25539473 gtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaa 25539546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Original strand, 31285240 - 31285561
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31285240 tacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaag 31285339  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| | ||| ||||||||||||  |  |||||||||| ||| | || || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||    
T  31285340 agcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagag 31285439  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | |||||||| |||||||||  |||  | ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31285440 aagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttt 31285539  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  31285540 tgattctcgatgatgttgacaa 31285561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 453
Target Start/End: Original strand, 25483743 - 25484075
Alignment:
Q  121 aacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaaga 220  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  ||| | || | ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25483743 aacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagc 25483842  T
Q  221 aatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaa 320  Q
    | ||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||       
T  25483843 agtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaaaagatg 25483942  T
Q  321 ctccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttga 420  Q
    ||||||| ||||| | |||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25483943 ctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttga 25484042  T
Q  421 ttcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    || ||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  25484043 ttgttgatgatgttgacaaactggagcagctag 25484075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 453
Target Start/End: Original strand, 26056652 - 26056938
Alignment:
Q  167 catggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctg 266  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  26056652 catggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttctt 26056751  T
Q  267 cataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgtta 366  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||| | |||||||  ||  | |||||| ||||||||    
T  26056752 cataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagttagaagatgtta 26056851  T
Q  367 gtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||    
T  26056852 gtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctag 26056938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 453
Target Start/End: Original strand, 26076622 - 26076908
Alignment:
Q  167 catggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctg 266  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  26076622 catggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttctt 26076721  T
Q  267 cataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgtta 366  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||| | |||||||  ||  | || ||| ||||||||    
T  26076722 cataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgtta 26076821  T
Q  367 gtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||    
T  26076822 gtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctag 26076908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27530755 - 27530467
Alignment:
Q  165 cacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttc 264  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  27530755 cacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttc 27530656  T
Q  265 tgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgt 364  Q
    |  | || || || | |||||| |||    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||    
T  27530655 tagaaaatgtgagagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgt 27530556  T
Q  365 tagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  27530555 tagtcagggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctag 27530467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 165 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27610574 - 27610300
Alignment:
Q  165 cacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttc 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27610574 cacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttc 27610475  T
Q  265 tgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgt 364  Q
    |  | || || || ||||||||||||   ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |  | |||||||| |||| |||    
T  27610474 ttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgt 27610375  T
Q  365 tagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610374 tagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaa 27610300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27718000 - 27717679
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |   |||| | || || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27718000 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaa 27717901  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||||||   ||||| || |||||||| ||| ||    
T  27717900 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaag 27717801  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||||||||||| || || |  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  27717800 gagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttt 27717701  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  27717700 tgattcttgatgatgttgacaa 27717679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 453
Target Start/End: Original strand, 25511640 - 25511908
Alignment:
Q  185 tactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaat 284  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25511640 tactagaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 25511739  T
Q  285 tcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactca 384  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||| | |||||||  ||  | || ||| |||||||||||||||||| ||| | |    
T  25511740 tcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaatta 25511839  T
Q  385 taaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||    
T  25511840 taaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctag 25511908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 28786919 - 28787235
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | | |||| | || || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28786919 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaa 28787018  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | || ||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||    
T  28787019 agcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggag 28787118  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |  ||||||||||||||| || || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||    
T  28787119 gtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttt 28787218  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28787219 tgattctcgatgatgtt 28787235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 28793040 - 28793356
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | | |||| | || || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28793040 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaa 28793139  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | || ||||||||||||||||   |||||||||  | || || || |||| |||| ||   ||||  || |||||||||||||||    
T  28793140 agcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggag 28793239  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |  ||||||||||||||| || || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  28793240 gtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttt 28793339  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28793340 tgattctcgatgatgtt 28793356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Original strand, 26623952 - 26624267
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| | |||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  26623952 tacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaag 26624051  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26624052 agcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagag 26624151  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | |||||||| ||||||| |  |||  | |||||||| |   ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26624152 aagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttt 26624251  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26624252 tgattctcgatgatgt 26624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Original strand, 26729929 - 26730244
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| | |||| | || ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  26729929 tacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaag 26730028  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26730029 agcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagag 26730128  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | |||||||| ||||||| |  |||  | |||||||| |   ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26730129 aagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttt 26730228  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  26730229 tgattctcgatgatgt 26730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27604158 - 27603889
Alignment:
Q  165 cacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttc 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27604158 cacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttc 27604059  T
Q  265 tgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgt 364  Q
    |  | || || || ||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |  | ||||||||||||| |||    
T  27604058 ttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgt 27603959  T
Q  365 tagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||  ||  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27603958 tagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgtt 27603889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Original strand, 27679631 - 27679952
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| |||  | || ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  27679631 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaag 27679730  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    | |||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||| ||| | || || ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  27679731 acaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaatatctccaagag 27679830  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | ||||||||||||||||     ||  | ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27679831 aagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttt 27679930  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  27679931 tgattctcgatgatgttgacaa 27679952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 26803127 - 26803443
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||| ||| | || | || ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26803127 tacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaag 26803226  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | || || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26803227 agcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagag 26803326  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | || ||| ||||||||| |  ||| || || |||||||   ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  26803327 aagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttt 26803426  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  26803427 tgattctcgatgatgtt 26803443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27705905 - 27705589
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||| | || | || ||||| || ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27705905 tacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaag 27705806  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | || || ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  27705805 agcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctcaaaatgacttgaaacatctccaagag 27705706  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | || ||| ||||||||| |  ||  || || |||||||   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  27705705 aagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttt 27705606  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  27705605 tgattctcgatgatgtt 27705589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 168 - 434
Target Start/End: Original strand, 28781832 - 28782098
Alignment:
Q  168 atggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgc 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |   |||||||||||||||||||   |||||||||      
T  28781832 atggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttg 28781931  T
Q  268 ataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttag 367  Q
    | || || || ||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || || || | || ||||||||||||| ||||||    
T  28781932 aaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttag 28782031  T
Q  368 tgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||||||||    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28782032 tgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgtt 28782098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27427113 - 27426792
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| | || | || ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  27427113 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaag 27427014  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||| ||||||||| ||   |||| ||| |||| | ||||||||    
T  27427013 agcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggag 27426914  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
       ||||||| ||| ||| || || | || |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  27426913 atgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttt 27426814  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||    
T  27426813 tgattctcgatgacgttgacaa 27426792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27592522 - 27592187
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| | | |||| |  | ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27592522 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaa 27592423  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||| | | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || |  |||| |||| ||   |||||||| ||| |||||||| ||    
T  27592422 agcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcag 27592323  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||||||||||| || || |  | ||||||||||||  |||||| || ||||||||    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  27592322 gagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttt 27592223  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  27592222 tgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctag 27592187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27677121 - 27676786
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| | | |||| |  | ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27677121 tacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaa 27677022  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || |  |||| |||| ||   |||||||| ||| |||||||| ||    
T  27677021 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcag 27676922  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||||||||||| || || |  | ||||||||||||  |||||| || ||||||||    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  27676921 gagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttt 27676822  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaaatgcaacagctag 453  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  27676821 tgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctag 27676786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25492820 - 25492504
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||| | || | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25492820 tacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaa 25492721  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    |  ||| ||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||||||     | || || |||||||||||||  |  ||||| ||| ||||||||||     
T  25492720 atcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaa 25492621  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     |||||||||  ||||   ||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| |||| ||||||||||||    
T  25492620 aaactcctttcgaaaatggttagattagacattaagttaagaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttt 25492521  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25492520 tgattctcgatgatgtt 25492504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27698069 - 27697765
Alignment:
Q  136 ttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgt 235  Q
    |||||||||| | |||| | || ||||| || ||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||  ||    
T  27698069 ttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggt 27697970  T
Q  236 tgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaaca 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||   ||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  27697969 tgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgagaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaaca 27697870  T
Q  336 attaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtta 435  Q
    | |  ||   | ||||| ||||   |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  27697869 actggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttg 27697770  T
Q  436 acaaa 440  Q
    |||||    
T  27697769 acaaa 27697765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 440
Target Start/End: Original strand, 27215133 - 27215455
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27215133 tacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaa 27215232  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||| |||||   |||||||||| |||||| ||  || ||||||  |  | || |  ||||||||||||   |||||||| ||||| || |||||     
T  27215233 agcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaa 27215332  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     |  ||||| | |||||  ||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||  |||  |||| |  ||||||||||||||    
T  27215333 aagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggattacaaagataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttt 27215432  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaaa 440  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  27215433 tgattcttgatgatgttgacaaa 27215455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 26884623 - 26884715
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884623 acttatcttattggacatgaatagatacgaatacgagtttatcgggaagatagtcgaagatatctccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 26884715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 430
Target Start/End: Original strand, 26824500 - 26824812
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | || | ||| || ||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26824500 tacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggactttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaa 26824599  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || || || ||||| | |||||||| ||||||||  | | ||||||||  | || || || ||||||||| || |  ||  |||  || ||||||| |||    
T  26824600 agcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagagaattcagctaagcatggcttggaaaatctccaagag 26824699  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     ||||||||||||||||||||  |  | | ||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||||||| || ||||||   ||||||||  |||||     
T  26824700 caactccttttaaaaacaattggagaagaaattaagttaggaggtgttagtcaaggtattcaaatcataaaagatagactacgcagaaagaaagttcttc 26824799  T
Q  418 tgattcttgatga 430  Q
    ||||||| |||||    
T  26824800 tgattctcgatga 26824812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 25539096 - 25539186
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  25539096 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgttttttta 25539186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 26143423 - 26143511
Alignment:
Q  31 ttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  26143423 ttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgttttttta 26143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 26647032 - 26647124
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 121  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  26647032 acttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttaca 26647124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 26753000 - 26753092
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 121  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  26753000 acttatcttgtgggacatgaatagatatgaatacaagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttaca 26753092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27530930 - 27530871
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaaga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27530930 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagtttattggaaagatagtcgaaga 27530871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 25580275 - 25580365
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttta 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  25580275 acttatcttattggacacgaatagatatgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaatatcaatcatgttttttta 25580365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 25511491 - 25511580
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  25511491 acttaccttattggacatgaatagatctgaatacaagtttattgagaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcatgttttttt 25511580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 121
Target Start/End: Original strand, 26656532 - 26656610
Alignment:
Q  43 acatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 121  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26656532 acatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttaca 26656610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 121
Target Start/End: Original strand, 26762503 - 26762581
Alignment:
Q  43 acatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgttttaca 121  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26762503 acatgaatagatatgaatacaagtttattgagaatatagtcaaagacatctccgacaagatcaatcgtgtttttttaca 26762581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140369
Alignment:
Q  197 gggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataa 271  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataa 28140369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27604333 - 27604280
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27604333 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagt 27604280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 25483612 - 25483691
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||| || | || ||| |||| |||||||    
T  25483612 acttatcttattggacatgaatagatatgaacacaagtttattgagaagatagtccaatacatctccaacaatatcaatc 25483691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 26056475 - 26056565
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttta 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  26056475 acttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgttttttta 26056565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 26076445 - 26076535
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgttgtttta 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  26076445 acttaccttattggacatgaatagatctgaatgcaagtttattgagaagatagtcgaaggcatctccaacaagatcaatcatgttttttta 26076535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27427241 - 27427187
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27427241 acttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtc 27427187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27718128 - 27718074
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27718128 acttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtc 27718074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 28235480 - 28235562
Alignment:
Q  352 agttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  28235480 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgtt 28235562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 434
Target Start/End: Original strand, 2185694 - 2185823
Alignment:
Q  305 acatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatataga 404  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||    |||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |        
T  2185694 acatctccaggagcaactcctcttccaaacagttgggctaaacgataagctaggacatgtcagtgagggaattcaattcataaaggaaagactacaacag 2185793  T
Q  405 aagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  2185794 aagaaggttttgttgattcttgatgatgtt 2185823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Original strand, 26862142 - 26862190
Alignment:
Q  35 cttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26862142 cttattggacgtgaatagatatgaatatgagtttattgggaagatagtc 26862190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 27215005 - 27215064
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaaga 88  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  27215005 acttatcttattggacattaacagatatgaatacaagtttattgagaagatagttgaaga 27215064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27592650 - 27592596
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27592650 acttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtc 27592596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27610749 - 27610695
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27610749 acttatcttattgggcatgaatagatatgaatacgagtttactggagagatagtc 27610695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27677249 - 27677195
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27677249 acttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtc 27677195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 27679503 - 27679557
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27679503 acttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtc 27679557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27706033 - 27705979
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  27706033 acttatcttattgcacatgaatagatatgaatacaagcttattggaaagatagtc 27705979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 26802999 - 26803080
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||| || | || ||| |||| |||||||||    
T  26802999 acttatcttgttggacatgaatagatatgaatacaagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgt 26803080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937863
Alignment:
Q  198 ggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataa 271  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataa 26937863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28297010 - 28296925
Alignment:
Q  349 ttaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  28297010 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgtt 28296925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 28326390 - 28326475
Alignment:
Q  349 ttaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  28326390 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgtt 28326475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 28504026 - 28504111
Alignment:
Q  349 ttaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  28504026 ttaagttaggagatgtcaatgatggagttccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctcgatgatgtt 28504111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 434
Target Start/End: Original strand, 28515063 - 28515148
Alignment:
Q  349 ttaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  28515063 ttaagttaggagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctagatgatgtt 28515148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29843438 - 29843341
Alignment:
Q  168 atggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttct 265  Q
    ||||| || |||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||   |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  29843438 atggtggggatttatggaattggtggattgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttct 29843341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27337716 - 27337640
Alignment:
Q  37 tattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgtt 113  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||| ||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||    
T  27337716 tattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtt 27337640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27398456 - 27398380
Alignment:
Q  37 tattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgtt 113  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||| ||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||    
T  27398456 tattggacatgaatagatatgagtacgagcttattgagaatatagtcgaacacatttccgataggatcaatcgtgtt 27398380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Original strand, 28243376 - 28243432
Alignment:
Q  57 gaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgtt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || || |||||  ||||||||||||||||    
T  28243376 gaatacgagtttattgagaagatagtaaaatatttatccagcaaaatcaatcgtgtt 28243432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 267841 - 267522
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  267841 tacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaag 267742  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataa-taactttaaacatctccagga 316  Q
    || ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| | || || || |||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  267741 agcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattcagct-ataagtaacttgaaacatctccaaga 267643  T
Q  317 ggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattctt 416  Q
    | | |||||||||||||||| |  |||  | ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  267642 gaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattctt 267543  T
Q  417 ttgattcttgatgatgttaac 437  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  267542 ttgattctcgatgatgttaac 267522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28127176 - 28126861
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| || | | || | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28127176 tacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 28127077  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||  |  | || || |||| ||||||||   |||| || ||||||||||| ||     
T  28127076 agcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaa 28126977  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     | |||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  28126976 aagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttt 28126877  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||    
T  28126876 tgattcttgatgatgt 28126861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28163876 - 28163562
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| || | | || | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163876 tacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggactttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 28163777  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||  |  | || || |||||||||||||     ||||| ||||||||||||||     
T  28163776 agcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaa 28163677  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || || |||||  ||||| ||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||||| || |||||||    
T  28163676 gagct-ctttttgaaacagttagatcggacattaagttaggaggtgttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttt 28163578  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||    
T  28163577 tgattcttgatgatgt 28163562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28127304 - 28127220
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgtt 113  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  28127304 acttatcttattggagattaatagatatgaatacaagtttattcagaagataatcaaagacatatccgacaggatcaatcgtgtt 28127220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 439
Target Start/End: Original strand, 26136799 - 26136890
Alignment:
Q  348 attaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||||    
T  26136799 attaagttaggacatgttagtaaaggaattccaatcataaaagaaaggctacatcaaaagaaaattttgttgattctcgatgacgttgacaa 26136890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2719
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |   |||| | || || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3040 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaa 2941  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||||| || |||||||| |||  |    
T  2940 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttg 2841  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    || ||||||||||||||| || || |  | |||||||| |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2840 gagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagtttggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttt 2741  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  2740 tgattcttgatgatgttgacaa 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3168 - 3114
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3168 acttatcttactggacatgaatagatatgaatacgagtttattggagagatagtc 3114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4166 - 3897
Alignment:
Q  165 cacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttc 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  4166 cacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttc 4067  T
Q  265 tgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgt 364  Q
    |  | || || || ||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |  | ||||||||||||| |||    
T  4066 ttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaaattaagttaggaggtgt 3967  T
Q  365 tagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3966 tagtgagggaatttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgtt 3897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13176 - 12860
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| | | |||| | || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13176 tacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaa 13077  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | || ||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||    
T  13076 agcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggag 12977  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| || ||   || | ||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||    
T  12976 gaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttt 12877  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  12876 tgattctcgatgatgtt 12860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Original strand, 8168 - 8484
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    ||||||| || |||| |||||||||| | | |||| | || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8168 tacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaa 8267  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | || ||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||    
T  8268 agcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggag 8367  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| || ||   || | ||||||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||    
T  8368 gaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttt 8467  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  8468 tgattctcgatgatgtt 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18679057 - 18678742
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |   |||| | || || || | |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18679057 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaa 18678958  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||| | || |||||||||||||||    
T  18678957 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggag 18678858  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18678857 gaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttt 18678758  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18678757 tgattctcgatgatgt 18678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18723582 - 18723261
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |  || || | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18723582 tacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaa 18723483  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||| | || |||||||||||||||    
T  18723482 aggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggag 18723383  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18723382 gaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaaaggctacatacaaagaagattcttt 18723283  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  18723282 tgattctcgatgatgttgacaa 18723261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18731001 - 18730680
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||| | |  || || | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  18731001 tacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaa 18730902  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||| | || |||||||||||||||    
T  18730901 agtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggag 18730802  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| |   | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18730801 gaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttt 18730702  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  18730701 tgattctcgatgatgttgacaa 18730680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18698897 - 18698576
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| | |||| | || || || | |||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18698897 tacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaa 18698798  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || ||||||||| ||   ||| | || |||||||||||||||    
T  18698797 agcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggag 18698698  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| |   | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  18698697 gaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttt 18698598  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  18698597 tgattctcgatgatgttgacaa 18698576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18654974 - 18654659
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||| | |  || || | |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18654974 tacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaa 18654875  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    |  |||| |||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||  | || || || || |||||| ||   ||| | || |||||||||||||||    
T  18654874 atcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaacatctccaggag 18654775  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
    |||||||||||||||||| ||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18654774 gaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttt 18654675  T
Q  418 tgattcttgatgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||    
T  18654674 tgattctcgatgatgt 18654659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Original strand, 18074442 - 18074763
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| | || | || ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  18074442 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaag 18074541  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||| ||||||||| ||   |||| ||| |||| | ||||||||    
T  18074542 agcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggag 18074641  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
       ||||||| ||| ||| || || | || |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  18074642 atgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttt 18074741  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||    
T  18074742 tgattctcgatgacgttgacaa 18074763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5090247 - 5090129
Alignment:
Q  322 tccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgat 421  Q
    ||||||| |||||||||  |||  | |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  5090247 tcctttttaaaacaattggattggaaattaggtttggagatatcagtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgat 5090148  T
Q  422 tcttgatgatgttaacaaa 440  Q
    ||| |||||| || |||||    
T  5090147 tctcgatgatattgacaaa 5090129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18723710 - 18723656
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  18723710 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtc 18723656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18655100 - 18655048
Alignment:
Q  31 ttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  18655100 ttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggaaagatagtc 18655048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 18074314 - 18074368
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18074314 acttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtc 18074368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18679185 - 18679131
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18679185 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattggagagatagtc 18679131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18731129 - 18731075
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||||||    
T  18731129 acttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgaaaagatagtc 18731075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18699023 - 18698981
Alignment:
Q  31 ttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18699023 ttatcttattggacatgaatagatatgaatacaagtttattgg 18698981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090307
Alignment:
Q  180 tatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttct 265  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||   ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttct 5090307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 118 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29273339 - 29273023
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | |||| | || ||| | || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  29273339 tacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaag 29273240  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||| ||| | || || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||    
T  29273239 agcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagag 29273140  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
     |||||||||||||||||| |  |||  | ||||||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||||| || |||  ||||||||| |||||||    
T  29273139 aaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttt 29273040  T
Q  418 tgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||| |||||||||    
T  29273039 tgattctcgatgatgtt 29273023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 439
Target Start/End: Original strand, 60250 - 60571
Alignment:
Q  118 tacaacaagtaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaa 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||| | || | || ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  60250 tacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaag 60349  T
Q  218 agaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataataactttaaacatctccaggag 317  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||| ||||||||| ||   |||| ||| |||| | ||||||||    
T  60350 agcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaatagcttgaaacgtttccaggag 60449  T
Q  318 gaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttt 417  Q
       ||||||| ||| ||| || || | || |||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  60450 atgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttt 60549  T
Q  418 tgattcttgatgatgttaacaa 439  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||    
T  60550 tgattctcgatgacgttgacaa 60571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 60122 - 60176
Alignment:
Q  29 acttatcttattggacatgaatagaaacgaatacgagtttattgggaagatagtc 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  60122 acttatattattggacatgaatagatatgaatacgagcttattggaaagatagtc 60176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 434
Target Start/End: Original strand, 16691628 - 16691864
Alignment:
Q  198 ggtaaatcaacacttgcaaaagaaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtatatgttttctgcataaagtcagggagaattcaactcataata 297  Q
    |||||| ||||||||||   || |||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| | || || || |||||| || |  ||     
T  16691628 ggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattcatctaaacatg 16691727  T
Q  298 actttaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagact 397  Q
     |||  ||||||| || ||    |||||||  ||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||  |||| ||    
T  16691728 gcttagaacatcttcaagaaaggctcctttccaaaaccattggattagacattaagttaggacatgttagtgaaggaattccaataataaaacaaaggct 16691827  T
Q  398 atatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    | |   ||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16691828 acaacaaaaaaaggttcttttgattctcgatgatgtt 16691864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 437
Target Start/End: Original strand, 3280568 - 3280659
Alignment:
Q  346 acattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttaac 437  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |  | || ||| |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  3280568 acattaagttaggagatagtagtgagggaattccaatcataaagcaaaggctacaccggaaaaaggttctattggttcttgatgacgttaac 3280659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Original strand, 35642 - 35724
Alignment:
Q  352 agttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35642 agttaggagatgtcaatgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttctgttgattctagatgatgtt 35724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 113
Target Start/End: Original strand, 43538 - 43594
Alignment:
Q  57 gaatacgagtttattgggaagatagtcgaagatatatccgacaaaatcaatcgtgtt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || || |||||  ||||||||||||||||    
T  43538 gaatacgagtttattgagaagatagtaaaatatttatccagcaaaatcaatcgtgtt 43594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 57567 - 57479
Alignment:
Q  346 acattaagttaggagatgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactatatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtt 434  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  57567 acattaagttagtagatgtcaacgagggaattccaatcataaagcaaaggcttcaccgaaagaaggttttgttgattctcgatgatgtt 57479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University