View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1318_high_47 (Length: 405)

Name: NF1318_high_47
Description: NF1318
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1318_high_47
NF1318_high_47
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (99-377)||(1108186-1108464)
chr2 (72-286)||(31517208-31517423)
chr2 (72-289)||(33906040-33906258)
chr2 (72-287)||(18806877-18807093)
chr2 (72-286)||(3873237-3873452)
chr2 (72-289)||(26323179-26323397)
chr2 (72-287)||(42937715-42937932)
chr2 (76-287)||(39635448-39635660)
chr2 (72-283)||(4016039-4016251)
chr2 (72-289)||(19901131-19901348)
chr2 (80-273)||(1482904-1483096)
chr2 (72-269)||(5733414-5733611)
chr2 (72-287)||(6174821-6175037)
chr2 (72-283)||(28329832-28330042)
chr2 (80-287)||(2178770-2178978)
chr2 (80-287)||(4232143-4232351)
chr2 (72-273)||(16066287-16066488)
chr2 (72-283)||(850997-851209)
chr2 (72-284)||(30420172-30420373)
chr2 (72-270)||(19383928-19384126)
chr2 (72-289)||(30270672-30270890)
chr2 (80-287)||(16588777-16588985)
chr2 (72-270)||(429830-430028)
chr2 (72-273)||(44947542-44947736)
chr2 (152-287)||(42446642-42446778)
chr2 (142-248)||(22101210-22101316)
chr2 (144-282)||(3585291-3585430)
chr2 (151-261)||(12517256-12517366)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (72-286)||(14422702-14422917)
chr8 (72-287)||(39206584-39206800)
chr8 (80-288)||(18594534-18594743)
chr8 (72-286)||(29938060-29938275)
chr8 (72-283)||(13110406-13110618)
chr8 (73-287)||(22260624-22260839)
chr8 (73-289)||(4035843-4036060)
chr8 (72-287)||(24113159-24113375)
chr8 (72-281)||(2042517-2042727)
chr8 (72-291)||(6144266-6144486)
chr8 (72-287)||(10836748-10836964)
chr8 (72-287)||(39218775-39218991)
chr8 (72-282)||(144397-144608)
chr8 (80-286)||(35118032-35118239)
chr8 (72-282)||(41575516-41575727)
chr8 (72-285)||(34842358-34842572)
chr8 (72-286)||(33278399-33278614)
chr8 (72-289)||(34998889-34999107)
chr8 (72-273)||(34679450-34679651)
chr8 (76-273)||(44804941-44805138)
chr8 (80-273)||(7774777-7774970)
chr8 (72-284)||(7791412-7791625)
chr8 (83-286)||(38167159-38167363)
chr8 (72-288)||(36491154-36491371)
chr8 (72-287)||(7811993-7812209)
chr8 (72-286)||(5320563-5320778)
chr8 (72-273)||(28639291-28639494)
chr8 (80-283)||(8021721-8021917)
chr8 (82-287)||(33287040-33287234)
chr8 (130-289)||(40117903-40118063)
chr8 (72-281)||(42571598-42571805)
chr8 (147-289)||(26783801-26783944)
chr8 (80-273)||(66180-66374)
chr8 (82-207)||(9807339-9807464)
chr8 (142-289)||(2322075-2322223)
chr8 (158-273)||(5005179-5005294)
chr8 (142-270)||(39220272-39220400)
chr8 (199-283)||(9806875-9806960)
chr8 (151-270)||(18683726-18683844)
chr8 (151-270)||(18729288-18729406)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (75-289)||(9008053-9008268)
chr5 (72-287)||(27679162-27679378)
chr5 (82-287)||(1579035-1579241)
chr5 (82-287)||(1605574-1605780)
chr5 (72-289)||(16069350-16069568)
chr5 (72-273)||(16737440-16737641)
chr5 (80-289)||(24105672-24105882)
chr5 (72-289)||(27420855-27421073)
chr5 (80-289)||(33491197-33491407)
chr5 (72-289)||(19358523-19358741)
chr5 (72-289)||(35782637-35782855)
chr5 (72-273)||(3386479-3386680)
chr5 (72-288)||(4120935-4121152)
chr5 (72-287)||(8374332-8374547)
chr5 (72-289)||(20992139-20992357)
chr5 (72-288)||(31883142-31883359)
chr5 (72-286)||(5202972-5203187)
chr5 (72-289)||(3921578-3921796)
chr5 (73-270)||(1165595-1165792)
chr5 (80-287)||(33991139-33991347)
chr5 (74-287)||(38598445-38598659)
chr5 (72-250)||(26602935-26603113)
chr5 (72-242)||(27025001-27025171)
chr5 (72-269)||(31410494-31410691)
chr5 (152-289)||(20992354-20992496)
chr5 (146-270)||(33284642-33284766)
chr5 (72-136)||(35420417-35420481)
chr5 (153-287)||(25634581-25634714)
chr5 (151-258)||(31638174-31638281)
chr5 (168-221)||(41818552-41818605)
chr5 (86-117)||(27024822-27024853)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (72-289)||(42307884-42308102)
chr3 (80-287)||(37698130-37698338)
chr3 (72-286)||(25999382-25999597)
chr3 (72-289)||(8042598-8042816)
chr3 (72-289)||(15520121-15520339)
chr3 (80-284)||(38856089-38856294)
chr3 (75-287)||(22174972-22175185)
chr3 (72-287)||(46452141-46452357)
chr3 (72-287)||(50528922-50529138)
chr3 (75-289)||(20842330-20842545)
chr3 (72-270)||(21581053-21581251)
chr3 (72-287)||(15520629-15520845)
chr3 (72-287)||(29445481-29445697)
chr3 (80-287)||(54534315-54534521)
chr3 (80-286)||(25494272-25494479)
chr3 (72-285)||(20699144-20699358)
chr3 (84-289)||(32244111-32244317)
chr3 (72-287)||(38933939-38934154)
chr3 (72-287)||(54870153-54870369)
chr3 (72-289)||(12117637-12117855)
chr3 (72-289)||(32359250-32359468)
chr3 (80-287)||(35226440-35226648)
chr3 (72-273)||(44609312-44609513)
chr3 (72-287)||(24835678-24835894)
chr3 (80-270)||(42104958-42105148)
chr3 (72-270)||(2895196-2895398)
chr3 (78-286)||(26122808-26123017)
chr3 (72-260)||(44688782-44688969)
chr3 (73-287)||(34700334-34700549)
chr3 (72-273)||(48924982-48925181)
chr3 (80-287)||(53028218-53028418)
chr3 (72-248)||(16354379-16354555)
chr3 (129-285)||(35643212-35643369)
chr3 (147-270)||(50529827-50529950)
chr3 (72-258)||(12915930-12916115)
chr3 (153-289)||(49128040-49128177)
chr3 (72-167)||(24366143-24366238)
chr3 (72-160)||(13696914-13697002)
chr3 (72-126)||(50528861-50528915)
chr3 (231-289)||(24366083-24366142)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (72-289)||(16052090-16052308)
chr1 (73-289)||(26663252-26663469)
chr1 (72-287)||(39260339-39260555)
chr1 (72-289)||(20089465-20089683)
chr1 (72-287)||(25897370-25897586)
chr1 (72-287)||(52753140-52753356)
chr1 (72-273)||(29078527-29078728)
chr1 (75-287)||(1940743-1940956)
chr1 (80-287)||(1168499-1168707)
chr1 (72-287)||(26580263-26580479)
chr1 (72-289)||(38829063-38829281)
chr1 (72-287)||(29288145-29288359)
chr1 (72-291)||(32671571-32671791)
chr1 (80-287)||(33510480-33510688)
chr1 (72-286)||(42370788-42371003)
chr1 (72-286)||(52696788-52697003)
chr1 (72-287)||(1170437-1170653)
chr1 (72-287)||(41928488-41928704)
chr1 (72-286)||(970517-970734)
chr1 (72-288)||(43905649-43905866)
chr1 (72-283)||(2473722-2473934)
chr1 (72-283)||(19715154-19715366)
chr1 (72-283)||(46760966-46761178)
chr1 (72-287)||(2347652-2347869)
chr1 (72-284)||(5215384-5215597)
chr1 (72-287)||(17591687-17591900)
chr1 (72-289)||(46409429-46409649)
chr1 (80-283)||(8079710-8079914)
chr1 (72-282)||(8120870-8121081)
chr1 (80-286)||(12682817-12683024)
chr1 (72-286)||(15203109-15203324)
chr1 (72-291)||(13996716-13996936)
chr1 (72-289)||(7145201-7145419)
chr1 (72-286)||(51359210-51359424)
chr1 (72-289)||(49146166-49146384)
chr1 (72-273)||(23498471-23498672)
chr1 (72-286)||(40092488-40092703)
chr1 (80-250)||(40149497-40149667)
chr1 (72-268)||(17587498-17587694)
chr1 (73-287)||(15554146-15554353)
chr1 (72-289)||(6765453-6765671)
chr1 (72-270)||(15717799-15717996)
chr1 (75-285)||(29695673-29695880)
chr1 (72-270)||(38171846-38172031)
chr1 (155-287)||(52086263-52086396)
chr1 (142-271)||(23322903-23323032)
chr1 (150-287)||(5217855-5217992)
chr1 (213-289)||(5675099-5675176)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (72-287)||(36701-36917)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (72-287)||(6086592-6086808)
chr6 (72-295)||(30691841-30692065)
chr6 (72-286)||(26946869-26947084)
chr6 (72-289)||(3347516-3347734)
chr6 (80-287)||(2837543-2837751)
chr6 (72-286)||(26704332-26704547)
chr6 (72-287)||(21893453-21893669)
chr6 (72-286)||(9459562-9459777)
chr6 (74-283)||(17261068-17261278)
chr6 (72-289)||(18613534-18613752)
chr6 (72-287)||(11167238-11167454)
chr6 (72-284)||(3955762-3955972)
chr6 (72-282)||(34887285-34887496)
chr6 (80-286)||(20726790-20726993)
chr6 (72-273)||(1153606-1153807)
chr6 (72-287)||(16307001-16307217)
chr6 (72-283)||(28199501-28199714)
chr6 (80-287)||(35198282-35198489)
chr6 (84-270)||(30698934-30699120)
chr6 (130-287)||(52834-52992)
chr6 (72-216)||(33464399-33464543)
chr6 (80-193)||(53001-53114)
chr6 (208-288)||(33463698-33463779)
chr6 (151-249)||(12835084-12835183)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (72-288)||(30181007-30181224)
chr7 (72-287)||(24792315-24792531)
chr7 (72-291)||(43067956-43068176)
chr7 (72-289)||(42204149-42204368)
chr7 (72-289)||(42964979-42965197)
chr7 (72-288)||(12101161-12101378)
chr7 (72-286)||(33359073-33359288)
chr7 (84-284)||(7164184-7164385)
chr7 (80-285)||(20346487-20346693)
chr7 (72-289)||(36890813-36891030)
chr7 (81-289)||(3511318-3511527)
chr7 (72-286)||(22649677-22649892)
chr7 (72-289)||(5280855-5281073)
chr7 (72-289)||(15655907-15656125)
chr7 (72-289)||(933280-933498)
chr7 (72-270)||(1803041-1803239)
chr7 (80-282)||(4477312-4477515)
chr7 (72-286)||(25748485-25748700)
chr7 (72-289)||(4347268-4347485)
chr7 (80-289)||(6394746-6394956)
chr7 (72-282)||(42673467-42673674)
chr7 (80-287)||(33846520-33846723)
chr7 (72-286)||(12097573-12097788)
chr7 (72-270)||(38866559-38866757)
chr7 (72-273)||(43156725-43156926)
chr7 (72-283)||(9452591-9452803)
chr7 (80-287)||(32041539-32041747)
chr7 (75-285)||(8630665-8630876)
chr7 (72-284)||(17753600-17753813)
chr7 (72-250)||(16894490-16894668)
chr7 (72-283)||(46891322-46891535)
chr7 (81-250)||(48865665-48865837)
chr7 (80-284)||(46134295-46134500)
chr7 (72-289)||(43021563-43021777)
chr7 (140-289)||(19828265-19828415)
chr7 (142-299)||(37005864-37006022)
chr7 (190-289)||(37704975-37705075)
chr7 (150-289)||(43405015-43405155)
chr7 (142-286)||(36849590-36849735)
chr7 (196-269)||(27691433-27691506)
chr7 (142-289)||(15655465-15655613)
chr7 (150-286)||(30075292-30075426)
chr7 (151-218)||(20163886-20163953)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (72-288)||(54189540-54189757)
chr4 (72-286)||(19913611-19913826)
chr4 (80-284)||(1756753-1756958)
chr4 (72-287)||(53717445-53717661)
chr4 (72-286)||(23776440-23776655)
chr4 (72-289)||(20877041-20877259)
chr4 (72-289)||(45424515-45424733)
chr4 (80-289)||(50353795-50354005)
chr4 (72-269)||(37968738-37968935)
chr4 (72-287)||(27488629-27488845)
chr4 (72-286)||(38055154-38055369)
chr4 (72-270)||(28032693-28032891)
chr4 (72-288)||(44784898-44785115)
chr4 (72-287)||(2481389-2481605)
chr4 (72-287)||(6611341-6611557)
chr4 (72-287)||(15241009-15241225)
chr4 (72-283)||(35490754-35490966)
chr4 (88-287)||(50055098-50055298)
chr4 (72-289)||(14987786-14988004)
chr4 (72-285)||(40428701-40428915)
chr4 (72-287)||(48909842-48910058)
chr4 (72-282)||(16700782-16700993)
chr4 (80-289)||(8932167-8932377)
chr4 (72-285)||(11639559-11639773)
chr4 (72-269)||(31969696-31969893)
chr4 (80-284)||(54412627-54412832)
chr4 (72-283)||(1617084-1617296)
chr4 (72-286)||(6688608-6688817)
chr4 (72-287)||(37464717-37464933)
chr4 (72-289)||(30423546-30423763)
chr4 (72-273)||(8591073-8591274)
chr4 (72-282)||(19164954-19165164)
chr4 (72-287)||(43289941-43290157)
chr4 (72-285)||(47632032-47632247)
chr4 (72-282)||(53875658-53875869)
chr4 (72-289)||(23704190-23704408)
chr4 (72-287)||(15669179-15669395)
chr4 (72-289)||(53353049-53353275)
chr4 (72-287)||(27536085-27536297)
chr4 (72-270)||(33703855-33704053)
chr4 (82-283)||(52139203-52139405)
chr4 (72-282)||(30171581-30171792)
chr4 (72-270)||(27583613-27583811)
chr4 (80-287)||(44379176-44379384)
chr4 (72-270)||(40680019-40680217)
chr4 (72-287)||(55344806-55345022)
chr4 (88-284)||(44375844-44376041)
chr4 (72-270)||(38071307-38071499)
chr4 (82-262)||(16703843-16704023)
chr4 (113-270)||(28360444-28360602)
chr4 (140-287)||(50053439-50053587)
chr4 (72-207)||(23269027-23269162)
chr4 (72-166)||(53408137-53408232)
chr4 (199-289)||(23265865-23265956)
chr4 (142-289)||(44548192-44548341)
chr4 (72-142)||(23261867-23261937)
chr4 (72-182)||(9595883-9595982)
chr4 (142-218)||(51780769-51780845)
chr4 (80-126)||(50055303-50055349)
chr4 (142-247)||(17493370-17493475)
chr4 (80-145)||(48748197-48748262)
chr4 (73-113)||(55344675-55344715)
chr4 (230-287)||(9595974-9596031)
chr4 (140-197)||(55344724-55344781)
chr4 (72-108)||(34615934-34615970)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (84-286)||(22956-23159)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (72-283)||(145238-145450)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (72-285)||(3708-3922)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (72-289)||(10232-10450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (75-287)||(2-215)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (72-284)||(288-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (74-283)||(1-212)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 99 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108186
Alignment:
Q  99 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  199 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggccttactgctaaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggccttactgctaaac 1108265  T
Q  299 ttattgattaattggactctaagttggctttgttaattgtttttggttgattacacttgaagtgttagatcagataact 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108264 ttattgattaattggactctaagttggctttgttaattgtttttggttgattacacttgaagtgttagatcagataact 1108186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 31517208 - 31517423
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517208 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 31517307  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31517308 gcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagc 31517407  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  31517408 caatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 33906040 - 33906258
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906040 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 33906139  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33906140 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagt 33906239  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  33906240 caatccaaacagggcctta 33906258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 18806877 - 18807093
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18806877 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataa 18806976  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18806977 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagc 18807076  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  18807077 caatccaaacggggcct 18807093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 3873237 - 3873452
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873237 gtggatccagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 3873336  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873337 gcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagc 3873436  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||| ||||    
T  3873437 caatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 26323179 - 26323397
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323179 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 26323278  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26323279 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaac 26323378  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  26323379 caatccaaacggggcctta 26323397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42937932 - 42937715
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcata 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42937932 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcata 42937833  T
Q  171 agcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42937832 agcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataag 42937733  T
Q  271 cc-atccaaacggggcct 287  Q
    || |||||||||| ||||    
T  42937732 ccaatccaaacggagcct 42937715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 76 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39635660 - 39635448
Alignment:
Q  76 atctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39635660 atctagagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcag 39635561  T
Q  176 cttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-cat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  39635560 cttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaat 39635461  T
Q  275 ccaaacggggcct 287  Q
    |||||||||||||    
T  39635460 ccaaacggggcct 39635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4016251 - 4016039
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4016251 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataa 4016152  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4016151 gcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagc 4016052  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  4016051 caatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 19901131 - 19901348
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19901131 gtggatctagaaagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 19901230  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19901231 gcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagc 19901329  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19901330 caatccaaacggggcctta 19901348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Original strand, 1482904 - 1483096
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482904 agagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 1483003  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 273  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483004 tgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 1483096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5733611 - 5733414
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5733611 gtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 5733512  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733511 gcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 5733414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 6174821 - 6175037
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  6174821 gtggatccagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataa 6174920  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6174921 gcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagc 6175020  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  6175021 caatccaaacggggcct 6175037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 28329832 - 28330042
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28329832 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 28329929  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28329930 gcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagt 28330029  T
Q  271 ccatccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  28330030 caatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 2178770 - 2178978
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178770 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 2178869  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aagccatccaa 278  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || | ||||||    
T  2178870 tgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaa 2178969  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  2178970 acggggcct 2178978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 4232143 - 4232351
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4232143 agagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagctta 4232242  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4232243 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 4232342  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  4232343 acggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 16066287 - 16066488
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066287 gtggatccagagattatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 16066386  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066387 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataag 16066485  T
Q  271 cca 273  Q
    |||    
T  16066486 cca 16066488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 851209 - 850997
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  851209 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataa 851110  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  851109 gcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagc 851010  T
Q  272 -catccaaacggg 283  Q
      |||||||||||    
T  851009 aaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 30420172 - 30420373
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420172 gtggatcctgagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 30420259  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420260 gcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 30420359  T
Q  272 c-atccaaacgggg 284  Q
    | ||||||||||||    
T  30420360 caatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 19383928 - 19384126
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19383928 gtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 19384027  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
     || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19384028 acaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 30270672 - 30270890
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30270672 gtggatccagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 30270771  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||    
T  30270772 gcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagc 30270871  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  30270872 caatccaaacggggcctta 30270890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 16588777 - 16588985
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16588777 agagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctta 16588876  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16588877 tgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaa 16588976  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||| ||||    
T  16588977 acggagcct 16588985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 430028 - 429830
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  430028 gtggatccagcgagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataa 429929  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  429928 gcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataag 429830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 44947542 - 44947736
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||        |||||||||||||    
T  44947542 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataa 44947634  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  44947635 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagc 44947734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 287
Target Start/End: Original strand, 42446642 - 42446778
Alignment:
Q  152 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||      
T  42446642 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagtt 42446741  T
Q  252 cacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
    | ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  42446742 cgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcct 42446778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 248
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  242 tagataa 248  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3585430 - 3585291
Alignment:
Q  144 aatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||| || | |||||  |||     
T  3585430 aattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggtttatgttagtg 3585331  T
Q  244 gataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 282  Q
    |||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585330 gataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 261
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517366
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  || |||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  251 ccacataagct 261  Q
     ||||||||||    
T  12517356 tcacataagct 12517366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14422917 - 14422702
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422917 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 14422818  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14422817 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaac 14422718  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  14422717 caatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39206800 - 39206584
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39206800 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataa 39206701  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206700 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 39206601  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  39206600 caatccaaacggggcct 39206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18594743 - 18594534
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18594743 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 18594644  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18594643 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 18594544  T
Q  279 acggggcctt 288  Q
    ||||||||||    
T  18594543 acggggcctt 18594534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29938275 - 29938060
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938275 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 29938176  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29938175 gcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagc 29938076  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  29938075 caatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13110618 - 13110406
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110618 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 13110519  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110518 gcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 13110419  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  13110418 caatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 73 - 287
Target Start/End: Original strand, 22260624 - 22260839
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260624 tggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 22260723  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22260724 cagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagcc 22260823  T
Q  273 -atccaaacggggcct 287  Q
     |||||||||||||||    
T  22260824 aatccaaacggggcct 22260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 73 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4036060 - 4035843
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036060 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 4035961  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  4035960 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaacc 4035861  T
Q  273 -atccaaacggggcctta 289  Q
     |||||||||||||||||    
T  4035860 aatccaaacggggcctta 4035843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 24113159 - 24113375
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24113159 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 24113258  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24113259 gcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagt 24113358  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  24113359 caatccaaacggggcct 24113375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 281
Target Start/End: Original strand, 2042517 - 2042727
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2042517 gtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 2042616  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042617 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagc 2042716  T
Q  272 c-atccaaacg 281  Q
    | |||||||||    
T  2042717 caatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Original strand, 6144266 - 6144486
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6144266 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataa 6144365  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6144366 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagt 6144465  T
Q  271 ccatccaaacggggccttact 291  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  6144466 caatccaaacggggccttact 6144486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 10836748 - 10836964
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836748 gtggatccagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 10836847  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836848 gcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 10836947  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | ||||||||| |||||    
T  10836948 caatccaaacgaggcct 10836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39218991 - 39218775
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39218991 gtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 39218892  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39218891 gcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagc 39218792  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  39218791 caatccaaacggggcct 39218775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 144608 - 144397
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144608 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 144509  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  144508 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagt 144409  T
Q  271 ccatccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  144408 caatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Original strand, 35118032 - 35118239
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35118032 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 35118131  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35118132 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 35118231  T
Q  279 acggggcc 286  Q
    ||||||||    
T  35118232 acggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41575727 - 41575516
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41575727 gtggatctagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataa 41575628  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41575627 gcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagc 41575528  T
Q  272 c-atccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  41575527 caatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Original strand, 34842358 - 34842572
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34842358 gtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataa 34842457  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842458 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 34842557  T
Q  272 c-atccaaacggggc 285  Q
    | |||||||||||||    
T  34842558 caatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33278614 - 33278399
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278614 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 33278515  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  33278514 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagc 33278415  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  33278414 caatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 34998889 - 34999107
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998889 gtggatccagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 34998988  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  34998989 gcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagc 34999088  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||| ||||| |||||    
T  34999089 caatccatacgggacctta 34999107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 34679450 - 34679651
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34679450 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataa 34679549  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34679550 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagc 34679649  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  34679650 ca 34679651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 44804941 - 44805138
Alignment:
Q  76 atctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44804941 atctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcag 44805040  T
Q  176 cttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44805041 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagcca 44805138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7774970 - 7774777
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7774970 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagctta 7774871  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7774870 tgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagcca 7774777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7791625 - 7791412
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  7791625 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataa 7791526  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  7791525 gcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagc 7791426  T
Q  272 c-atccaaacgggg 284  Q
    | ||||||||||||    
T  7791425 caatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 83 - 286
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167363
Alignment:
Q  83 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  183 aactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacg 281  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||     
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaaca 38167358  T
Q  282 gggcc 286  Q
    |||||    
T  38167359 gggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36491371 - 36491154
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36491371 gtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 36491272  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36491271 acaagttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagc 36491172  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  36491171 caatccaaatggggcctt 36491154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7812209 - 7811993
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  7812209 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataa 7812110  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  7812109 gcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagc 7812010  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | ||| |||||||||||    
T  7812009 caatcaaaacggggcct 7811993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5320778 - 5320563
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  5320778 gtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataa 5320679  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5320678 gcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagc 5320579  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  5320578 caatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28639494 - 28639291
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639494 gtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 28639397  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagct----tatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 267  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28639396 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaat 28639297  T
Q  268 aagcca 273  Q
    ||||||    
T  28639296 aagcca 28639291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8021917 - 8021721
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8021917 agagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 8021826  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8021825 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 8021726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287234
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcta------------gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  182 aaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaac 280  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 33287227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 289
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118063
Alignment:
Q  130 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 229  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  230 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 40118063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42571805 - 42571598
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  42571805 gtggatccagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataa 42571708  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42571707 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagc 42571609  T
Q  272 c-atccaaacg 281  Q
    | |||||||||    
T  42571608 caatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 289
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783944
Alignment:
Q  147 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  247 aagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctta 26783944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66374
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgga-gggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 178  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  179 atgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 273  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagcca 66374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9807464 - 9807339
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9807464 agagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9807365  T
Q  182 aaactacgataagctatttttattta 207  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  9807364 aagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Original strand, 2322075 - 2322223
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2322075 aaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttag 2322174  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    |||||||  ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2322175 tagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcctta 2322223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005179
Alignment:
Q  158 aaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacata 257  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  258 agctcaaaataagcca 273  Q
    |||| || ||||||||    
T  5005194 agcttaagataagcca 5005179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39220400 - 39220272
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||  |    
T  39220400 aaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatg 39220301  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39220300 tagataagttcatataagctcaaaataag 39220272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  199 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggg 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18683844 - 18683726
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  18683844 gcttatgaaaatatggtataagcggcttataaaattggtataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagc 18683746  T
Q  251 ccacataagctcaaaataag 270  Q
     |  ||||||| ||||||||    
T  18683745 tccaataagcttaaaataag 18683726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18729406 - 18729288
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||   ||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  18729406 gcttatgaaaatatggtataagcggcttataaaattggtataaactatttttatt-atttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataagc 18729308  T
Q  251 ccacataagctcaaaataag 270  Q
     |  ||||||| ||||||||    
T  18729307 tccaataagcttaaaataag 18729288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 75 - 289
Target Start/End: Original strand, 9008053 - 9008268
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008053 gatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 9008152  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-a 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9008153 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaa 9008252  T
Q  274 tccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  9008253 tccaaacggggcctta 9008268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 27679162 - 27679378
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679162 gtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 27679261  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679262 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagc 27679361  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  27679362 caatccaaacggggcct 27679378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579035
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  182 aaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaac 280  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1579042  T
Q  281 ggggcct 287  Q
    |||||||    
T  1579041 ggggcct 1579035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 82 - 287
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605780
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  182 aaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaac 280  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 1605773  T
Q  281 ggggcct 287  Q
    |||||||    
T  1605774 ggggcct 1605780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16069568 - 16069350
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069568 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 16069469  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16069468 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagt 16069369  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  16069368 caatccaaacgggacctta 16069350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 16737440 - 16737641
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737440 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 16737539  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16737540 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagc 16737639  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  16737640 ca 16737641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Original strand, 24105672 - 24105882
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24105672 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 24105771  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24105772 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 24105871  T
Q  279 acggggcctta 289  Q
    |||| ||||||    
T  24105872 acggagcctta 24105882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27421073 - 27420855
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421073 gtggatccagggagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 27420974  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27420973 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagc 27420874  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  27420873 caatccaaacggggcctta 27420855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Original strand, 33491197 - 33491407
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33491197 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagctta 33491296  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33491297 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 33491396  T
Q  279 acggggcctta 289  Q
    |||||||||||    
T  33491397 acggggcctta 33491407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19358741 - 19358523
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19358741 gtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataa 19358642  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-g 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19358641 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataagg 19358542  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19358541 caatccaaacggggcctta 19358523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 35782637 - 35782855
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35782637 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataa 35782736  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-g 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35782737 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagg 35782836  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  35782837 caatccaaacggggcctta 35782855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 3386479 - 3386680
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386479 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 3386578  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3386579 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagc 3386678  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  3386679 ca 3386680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4121152 - 4120935
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121152 gtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 4121053  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4121052 gcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 4120953  T
Q  272 ca-tccaaacggggcctt 288  Q
    || |||||||||||||||    
T  4120952 cattccaaacggggcctt 4120935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 8374332 - 8374547
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374332 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 8374430  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa-g 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  8374431 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataagg 8374530  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  8374531 caatccaaacggggcct 8374547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 20992139 - 20992357
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992139 gtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 20992238  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992239 tcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagc 20992338  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | || ||||||||||||||    
T  20992339 caattcaaacggggcctta 20992357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31883359 - 31883142
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883359 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 31883260  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31883259 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagt 31883160  T
Q  271 ccatccaaacggggcctt 288  Q
    | |||||||||| |||||    
T  31883159 caatccaaacggagcctt 31883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5203187 - 5202972
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5203187 gtggatctagagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 5203088  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||     
T  5203087 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagt 5202988  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  5202987 caatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3921796 - 3921578
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921796 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 3921697  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||     
T  3921696 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaat 3921597  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  3921596 caatccaaacgggacctta 3921578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Original strand, 1165595 - 1165792
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1165595 tggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataag 1165694  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1165695 caacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataag 1165792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33991347 - 33991139
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33991347 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactta 33991248  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||    
T  33991247 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaa 33991148  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  33991147 acggggcct 33991139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 287
Target Start/End: Original strand, 38598445 - 38598659
Alignment:
Q  74 ggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagc 173  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598445 ggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagc 38598544  T
Q  174 agcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc- 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  38598545 agcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagcca 38598644  T
Q  273 atccaaacggggcct 287  Q
    |||||||| ||||||    
T  38598645 atccaaaccgggcct 38598659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Original strand, 26602935 - 26603113
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26602935 gtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataa 26603034  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26603035 gcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 26603113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27025171 - 27025001
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27025171 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataa 27025072  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagt 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||    
T  27025071 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31410691 - 31410494
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31410691 gtggatcaaaagagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 31410592  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  31410591 gcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataa 31410494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 289
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992496
Alignment:
Q  152 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  252 c----acataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    |    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctta 20992496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 270
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284766
Alignment:
Q  146 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtaga 245  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  246 taagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataag 33284766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 35420417 - 35420481
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggta 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35420417 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggta 35420481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25634714 - 25634581
Alignment:
Q  153 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagccc 252  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |   ||||||||||||   ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||  ||||||||| | |    
T  25634714 ttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttta--ttatttacccaaacgtatttgaaagagcttatgttagtagataaactc 25634617  T
Q  253 acataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
     |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  25634616 tcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcct 25634581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638174
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  251 ccacataa 258  Q
     |||||||    
T  31638181 tcacataa 31638174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  168 ataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacc 221  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  86 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 42307884 - 42308102
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307884 gtggatctagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 42307983  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307984 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 42308083  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  42308084 caatccaaacggggcctta 42308102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 37698130 - 37698338
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37698130 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 37698229  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37698230 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 37698329  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  37698330 acggggcct 37698338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25999597 - 25999382
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999597 gtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 25999498  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999497 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagc 25999398  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  25999397 caatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8042816 - 8042598
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042816 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 8042717  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8042716 gcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagc 8042617  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8042616 ccatccaaacggggcctta 8042598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 15520121 - 15520339
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520121 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 15520220  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520221 gcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 15520320  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15520321 caatccaaacggggcctta 15520339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38856294 - 38856089
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856294 agagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 38856195  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38856194 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 38856095  T
Q  279 acgggg 284  Q
    ||||||    
T  38856094 acgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Original strand, 22174972 - 22175185
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174972 gatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 22175071  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-a 273  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22175072 gcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaa 22175171  T
Q  274 tccaaacggggcct 287  Q
    ||||||||||||||    
T  22175172 tccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 46452141 - 46452357
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452141 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 46452240  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  46452241 gcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagc 46452340  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  46452341 caatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50529138 - 50528922
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529138 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 50529039  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529038 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagc 50528939  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  50528938 caatccaaacggggcct 50528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 289
Target Start/End: Original strand, 20842330 - 20842545
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20842330 gatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagca 20842429  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-a 273  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20842430 gcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaa 20842529  T
Q  274 tccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||||||||||||    
T  20842530 tccaaacggggcctta 20842545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21581251 - 21581053
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581251 gtggatccagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 21581152  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581151 gcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 21581053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15520845 - 15520629
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520845 gtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 15520746  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15520745 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagc 15520646  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  15520645 caatccaaacggggcct 15520629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29445697 - 29445481
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29445697 gtggatccagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataa 29445598  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29445597 acagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagc 29445498  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  29445497 caatccaaacggggcct 29445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 54534315 - 54534521
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  54534315 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagctta 54534413  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54534414 t-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54534512  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  54534513 acggggcct 54534521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Original strand, 25494272 - 25494479
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494272 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 25494371  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25494372 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 25494471  T
Q  279 acggggcc 286  Q
    ||||||||    
T  25494472 acggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20699358 - 20699144
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699358 gtggatcgagagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 20699259  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699258 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagc 20699159  T
Q  272 c-atccaaacggggc 285  Q
    | |||||||||||||    
T  20699158 caatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 84 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244111
Alignment:
Q  84 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  184 actacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 282  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 32244118  T
Q  283 ggcctta 289  Q
    | |||||    
T  32244117 gacctta 32244111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38934154 - 38933939
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38934154 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataa 38934055  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38934054 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagc 38933956  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  38933955 caatccaaacggggcct 38933939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 54870153 - 54870369
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54870153 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 54870252  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54870253 gcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagc 54870352  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  54870353 caatccaaacggggcct 54870369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 12117637 - 12117855
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12117637 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 12117736  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117737 gcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagc 12117836  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | || ||||||||||||||    
T  12117837 caattcaaacggggcctta 12117855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32359468 - 32359250
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359468 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 32359369  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32359368 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagc 32359269  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  32359268 caatccaaacgggacctta 32359250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35226648 - 35226440
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226648 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 35226549  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  35226548 tgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaa 35226449  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    || ||||||    
T  35226448 acagggcct 35226440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 44609312 - 44609513
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609312 gtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 44609411  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44609412 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagc 44609511  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  44609512 ca 44609513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 24835678 - 24835894
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24835678 gtggatctagagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 24835777  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aag 270  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||     
T  24835778 gcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaat 24835877  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  24835878 caatccaaacggggcct 24835894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 270
Target Start/End: Original strand, 42104958 - 42105148
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42104958 agagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 42105057  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105058 tgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 42105148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2895398 - 2895196
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895398 gtggatccagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 2895299  T
Q  168 ataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2895298 ataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaat 2895199  T
Q  268 aag 270  Q
    |||    
T  2895198 aag 2895196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26123017 - 26122808
Alignment:
Q  78 ctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 177  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26123017 ctagagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagct 26122918  T
Q  178 tatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atcc 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26122917 tatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatcc 26122818  T
Q  277 aaacggggcc 286  Q
    |||| |||||    
T  26122817 aaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44688969 - 44688782
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44688969 gtggatctagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatat-gcataa 44688871  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagc 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44688870 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34700549 - 34700334
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34700549 tggatccagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataag 34700450  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34700449 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaacc 34700350  T
Q  273 -atccaaacggggcct 287  Q
     ||| |||||||||||    
T  34700349 aatctaaacggggcct 34700334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 48924982 - 48925181
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48924982 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataa 48925081  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  48925082 acagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagc 48925179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53028418 - 53028218
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  53028418 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttta 53028319  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||        |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53028318 tgaaaatatgataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 53028227  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    || ||||||    
T  53028226 acagggcct 53028218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16354555 - 16354379
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16354555 gtggatccagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcatta 16354456  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataa 248  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  16354455 gcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  129 ggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 228  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  229 aagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggc 285  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529950
Alignment:
Q  147 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagat 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  247 aagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataag 50529950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12916115 - 12915930
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  12916115 gtggatccaaagagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataa 12916016  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataa 258  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12916015 gcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128040
Alignment:
Q  153 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagccc 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  253 acataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcctta 49128040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24366238 - 24366143
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 167  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366238 gtggatcaagagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13697002 - 13696914
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaa 160  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13697002 gtggatccagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 126
Target Start/End: Original strand, 50528861 - 50528915
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528861 gtggatccagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaag 50528915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366083
Alignment:
Q  231 gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcctta 24366083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16052308 - 16052090
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16052308 gtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataa 16052209  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16052208 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagc 16052109  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  16052108 caatccaaacggggcctta 16052090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 73 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26663469 - 26663252
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26663469 tggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaa 26663370  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663369 cagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 26663270  T
Q  273 -atccaaacggggcctta 289  Q
     |||||||||||| ||||    
T  26663269 aatccaaacggggtctta 26663252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 39260339 - 39260555
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260339 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 39260438  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260439 gcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 39260538  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  39260539 caatccaaacggggcct 39260555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20089683 - 20089465
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20089683 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 20089584  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089583 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 20089484  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  20089483 caatccaaacggggcctta 20089465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25897586 - 25897370
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897586 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 25897487  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25897486 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagt 25897387  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  25897386 caatccaaacggggcct 25897370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 52753140 - 52753356
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753140 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 52753239  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753240 gtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 52753339  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  52753340 caatccaaacggggcct 52753356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29078728 - 29078527
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29078728 gtggatcaagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataa 29078629  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078628 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 29078529  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  29078528 ca 29078527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Original strand, 1940743 - 1940956
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1940743 gatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaaca 1940842  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-a 273  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1940843 acttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaa 1940942  T
Q  274 tccaaacggggcct 287  Q
    ||||||||||||||    
T  1940943 tccaaacggggcct 1940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1168707 - 1168499
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168707 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 1168608  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1168607 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 1168508  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  1168507 acggggcct 1168499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 26580263 - 26580479
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580263 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 26580362  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580363 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagc 26580462  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  26580463 caatccaaacggggcct 26580479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 38829281 - 38829063
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38829281 gtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaa 38829182  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38829181 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagc 38829082  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||| | ||||||    
T  38829081 caatccaaacagagcctta 38829063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29288359 - 29288145
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288359 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 29288262  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29288261 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagt 29288162  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  29288161 caatccaaacggggcct 29288145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32671791 - 32671571
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671791 gtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 32671692  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32671691 gtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagc 32671592  T
Q  272 c-atccaaacggggccttact 291  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  32671591 caatccaaacggggccttact 32671571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33510688 - 33510480
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510688 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 33510589  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  33510588 tgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 33510489  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  33510488 acggggcct 33510480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 42370788 - 42371003
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  42370788 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaa 42370887  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42370888 gcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagt 42370987  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  42370988 caatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52697003 - 52696788
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52697003 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 52696904  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696903 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagc 52696804  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  52696803 caatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 1170437 - 1170653
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1170437 gtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 1170536  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170537 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagc 1170636  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  1170637 caatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 41928488 - 41928704
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41928488 gtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataa 41928587  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41928588 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagc 41928687  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  41928688 caatccaaacggggcct 41928704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 970517 - 970734
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  970517 gtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataa 970616  T
Q  172 gcagcttatgaaac--tacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970617 gcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 970716  T
Q  270 g-ccatccaaacggggcc 286  Q
    | | ||||||||||||||    
T  970717 gtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43905866 - 43905649
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905866 gtggatccagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 43905767  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43905766 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagc 43905667  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | |||||||||| |||||    
T  43905666 caatccaaacggagcctt 43905649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2473934 - 2473722
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2473934 gtggatccaaagagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataa 2473835  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2473834 gcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaac 2473735  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  2473734 cgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 19715154 - 19715366
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19715154 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 19715253  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19715254 gcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaac 19715353  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  19715354 caatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46761178 - 46760966
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46761178 gtggatctagagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 46761079  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||     
T  46761078 gcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagt 46760979  T
Q  271 ccatccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  46760978 caatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2347869 - 2347652
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcata 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2347869 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacata 2347770  T
Q  171 agcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  2347769 agcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaa 2347670  T
Q  271 c-catccaaacggggcct 287  Q
    |  |||||||||||||||    
T  2347669 caaatccaaacggggcct 2347652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5215597 - 5215384
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215597 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 5215498  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215497 gcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagc 5215398  T
Q  272 c-atccaaacgggg 284  Q
    | ||||||||||||    
T  5215397 caatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17591900 - 17591687
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17591900 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataa 17591801  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  17591800 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagc 17591704  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  17591703 caatccaaacggggcct 17591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 46409649 - 46409429
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46409649 gtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcat 46409550  T
Q  170 aagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  46409549 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataa 46409450  T
Q  270 g-ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | | |||||||||| ||||||    
T  46409449 gtcaatccaaacggagcctta 46409429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 283
Target Start/End: Original strand, 8079710 - 8079914
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079710 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagctta 8079809  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079810 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T
Q  279 acggg 283  Q
    |||||    
T  8079910 acggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8121081 - 8120870
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8121081 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataa 8120982  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8120981 gcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagc 8120882  T
Q  272 c-atccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  8120881 caatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12683024 - 12682817
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12683024 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctta 12682925  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  12682924 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaa 12682825  T
Q  279 acggggcc 286  Q
    || |||||    
T  12682824 acagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15203324 - 15203109
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15203324 gtggatccagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 15203225  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  15203224 acagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagt 15203125  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | || |||||||||||    
T  15203124 caattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Original strand, 13996716 - 13996936
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996716 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 13996815  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  13996816 gcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagc 13996915  T
Q  272 c-atccaaacggggccttact 291  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  13996916 caatccaaacagggccttact 13996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7145419 - 7145201
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145419 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 7145320  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctc-aaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  7145319 gcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataag 7145221  T
Q  271 -ccatccaaacggggcctta 289  Q
     | ||||||||||| |||||    
T  7145220 tcaatccaaacgggacctta 7145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 51359210 - 51359424
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359210 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 51359309  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51359310 gcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagc 51359408  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  51359409 caatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49146384 - 49146166
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49146384 gtggatccagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 49146285  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |    
T  49146284 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaac 49146185  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  49146184 caatccaaacggagcctta 49146166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23498672 - 23498471
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23498672 gtggatccagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataa 23498573  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23498572 gcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagc 23498473  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  23498472 ca 23498471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40092703 - 40092488
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092703 gtggatccagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 40092604  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  40092603 gcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagt 40092504  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | |||||||| |||||    
T  40092503 caatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40149667 - 40149497
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40149667 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 40149568  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    | |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149567 taaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 17587498 - 17587694
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587498 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 17587597  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaata 268  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587598 gcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 287
Target Start/End: Original strand, 15554146 - 15554353
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataag 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15554146 tggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcag 15554245  T
Q  173 cagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc 272  Q
    ||| |||||||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  15554246 cagtttatgaa--------atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagcc 15554337  T
Q  273 -atccaaacggggcct 287  Q
     |||||||||||||||    
T  15554338 aatccaaacggggcct 15554353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6765671 - 6765453
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6765671 gtggatcgagatagaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 6765572  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  6765571 gcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagc 6765472  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  6765471 caatccaaacggggtctta 6765453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15717996 - 15717799
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15717996 gtggatccaaagagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataa 15717897  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15717896 gcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataag 15717799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29695880 - 29695673
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29695880 gatctagagagaattgaatgaggttacataatttt-----cttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagca 29695786  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaa-aaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc- 272  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29695785 gcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagcca 29695686  T
Q  273 atccaaacggggc 285  Q
    |||||||| ||||    
T  29695685 atccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38172031 - 38171846
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||              |||||    
T  38172031 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc-------------acataa 38171945  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  38171944 gcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataag 38171846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086263
Alignment:
Q  155 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccac 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  255 ataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcct 287  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcct 52086263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 271
Target Start/End: Original strand, 23322903 - 23323032
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23322903 aaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggag 23323002  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23323003 tagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 287
Target Start/End: Original strand, 5217855 - 5217992
Alignment:
Q  150 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 249  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  5217855 ggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagcttatgttagtagataag 5217953  T
Q  250 cccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
    | | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  5217954 ctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcct 5217992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675099
Alignment:
Q  213 ccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcctta 5675099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36917 - 36701
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36917 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 36818  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36817 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 36718  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  36717 caatccaaacggggcct 36701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 6086592 - 6086808
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6086592 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 6086691  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086692 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 6086791  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  6086792 caatccaaacggggcct 6086808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30692065 - 30691841
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692065 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 30691966  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691965 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 30691866  T
Q  272 c-atccaaacggggccttactgcta 295  Q
    | ||||||||| |||| || |||||    
T  30691865 caatccaaacgaggccctaatgcta 30691841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 26946869 - 26947084
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26946869 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 26946968  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26946969 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagc 26947068  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  26947069 caatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 3347516 - 3347734
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3347516 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 3347615  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347616 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagc 3347715  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3347716 caatccaaacggggcctta 3347734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2837751 - 2837543
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2837751 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctca 2837652  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2837651 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2837552  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  2837551 acggggcct 2837543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 26704332 - 26704547
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704332 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 26704431  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26704432 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaac 26704531  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  26704532 caatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21893669 - 21893453
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21893669 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataa 21893570  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat-aag 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  21893569 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaat 21893470  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  21893469 cgatccaaacggggcct 21893453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9459777 - 9459562
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459777 gtggatccagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 9459678  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9459677 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagc 9459578  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  9459577 caatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 74 - 283
Target Start/End: Original strand, 17261068 - 17261278
Alignment:
Q  74 ggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17261068 ggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagc 17261167  T
Q  174 agcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc- 272  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17261168 agcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcca 17261267  T
Q  273 atccaaacggg 283  Q
    |||||||||||    
T  17261268 atccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18613752 - 18613534
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18613752 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 18613653  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  18613652 gcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagt 18613553  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  18613552 caatccaaacggggcctta 18613534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11167454 - 11167238
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11167454 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 11167355  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11167354 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagc 11167255  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  11167254 caatccaaacggggcct 11167238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 3955762 - 3955972
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3955762 gtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataa 3955858  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3955859 gcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 3955958  T
Q  272 c-atccaaacgggg 284  Q
    | ||||||||||||    
T  3955959 caatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Original strand, 34887285 - 34887496
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34887285 gtggatccagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 34887384  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  34887385 acagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagt 34887484  T
Q  271 ccatccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  34887485 caatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20726993 - 20726790
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726993 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 20726894  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20726893 tgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 20726798  T
Q  279 acggggcc 286  Q
    ||||||||    
T  20726797 acggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1153807 - 1153606
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153807 gtggatccagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 1153708  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1153707 gcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagc 1153608  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  1153607 ca 1153606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 16307001 - 16307217
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16307001 gtggatccagaaataatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataa 16307100  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16307101 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagt 16307200  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  16307201 caatccaaacggggcct 16307217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 28199501 - 28199714
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28199501 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataa 28199599  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaata 268  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  28199600 gcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaata 28199698  T
Q  269 ag-ccatccaaacggg 283  Q
    || | |||||||||||    
T  28199699 agtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35198489 - 35198282
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35198489 agagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 35198390  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  35198389 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaagcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaa 35198291  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  35198290 acggggcct 35198282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 270
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699120
Alignment:
Q  84 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  184 actacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | || |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataag 30699120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52992 - 52834
Alignment:
Q  130 gagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52992 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 52893  T
Q  230 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52892 tgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33464543 - 33464399
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464543 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 33464444  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaa 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33464443 gcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53114 - 53001
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53114 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 53015  T
Q  180 tgaaactacgataa 193  Q
    |||||||| |||||    
T  53014 tgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463698
Alignment:
Q  208 tttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctt 33463698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12835183 - 12835084
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacac-ctttaaaaaagcttatgggagtagataag 249  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| || || ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  12835183 gcttattaaaatattgcttaagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttttacaaaagcttatgttagtagataag 12835084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Original strand, 30181007 - 30181224
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181007 gtggatccagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 30181106  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181107 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 30181206  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30181207 caatccaaacggggcctt 30181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 24792315 - 24792531
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792315 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 24792414  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  24792415 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagc 24792514  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  24792515 caatccaaacggggcct 24792531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Original strand, 43067956 - 43068176
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43067956 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 43068055  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  43068056 gaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagt 43068155  T
Q  271 ccatccaaacggggccttact 291  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  43068156 caatccaaacggggccttact 43068176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42204368 - 42204149
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204368 gtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 42204269  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204268 gcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataag 42204169  T
Q  271 cc-atccaaacggggcctta 289  Q
    || |||||||||||||||||    
T  42204168 ccaatccaaacggggcctta 42204149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 42964979 - 42965197
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964979 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 42965078  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965079 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 42965178  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  42965179 caatccaaaaggggcctta 42965197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Original strand, 12101161 - 12101378
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101161 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 12101260  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12101261 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 12101360  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  12101361 caatccaaatggggcctt 12101378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 33359073 - 33359288
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359073 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 33359172  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359173 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagc 33359272  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  33359273 caatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 84 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7164385 - 7164184
Alignment:
Q  84 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164385 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 7164286  T
Q  184 actacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7164285 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 7164186  T
Q  283 gg 284  Q
    ||    
T  7164185 gg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20346693 - 20346487
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346693 agagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctta 20346594  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20346593 tgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20346494  T
Q  279 acggggc 285  Q
    |||||||    
T  20346493 acggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 36890813 - 36891030
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36890813 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataa 36890912  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  36890913 gcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagt 36891011  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  36891012 caatccaaacggggcctta 36891030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511318
Alignment:
Q  81 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  181 gaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaa 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaa 3511328  T
Q  280 cggggcctta 289  Q
    |||| |||||    
T  3511327 cgggacctta 3511318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 22649677 - 22649892
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649677 gtggatccagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 22649776  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649777 gcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 22649876  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | || |||||||||||    
T  22649877 caattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5281073 - 5280855
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5281073 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 5280974  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5280973 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagc 5280874  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  5280873 caatccaaacgggacctta 5280855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15656125 - 15655907
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656125 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 15656026  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656025 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagc 15655926  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15655925 caatccaaacggggcctta 15655907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 933498 - 933280
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933498 gtggatccagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 933399  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  933398 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagc 933299  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | || ||||| ||||||||    
T  933298 caattcaaacagggcctta 933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1803239 - 1803041
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  1803239 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataa 1803140  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803139 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 1803041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 4477312 - 4477515
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4477312 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 4477411  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4477412 tgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 4477511  T
Q  279 acgg 282  Q
    ||||    
T  4477512 acgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25748700 - 25748485
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748700 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 25748601  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | ||||||||||  |||||    
T  25748600 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagc 25748501  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  25748500 caatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4347485 - 4347268
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4347485 gtggatccagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataa 4347387  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4347386 gcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagt 4347287  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  4347286 caatccaaacggggcctta 4347268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6394956 - 6394746
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6394956 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 6394857  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6394856 tgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaa 6394757  T
Q  279 acggggcctta 289  Q
    |||||||||||    
T  6394756 acggggcctta 6394746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42673674 - 42673467
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673674 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 42673575  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42673574 gcagcttatgaaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagt 42673479  T
Q  271 ccatccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  42673478 caatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 33846520 - 33846723
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33846520 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttta 33846614  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33846615 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 33846714  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  33846715 acggggcct 33846723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 12097573 - 12097788
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12097573 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 12097672  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  12097673 gtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagc 12097772  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||| ||||||    
T  12097773 caatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38866757 - 38866559
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38866757 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataa 38866658  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38866657 acagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataag 38866559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43156926 - 43156725
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  43156926 gtggatccggagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataa 43156827  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156826 acagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagc 43156727  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  43156726 ca 43156725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9452803 - 9452591
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9452803 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatag 9452704  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||     
T  9452703 acagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagt 9452604  T
Q  271 ccatccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  9452603 caatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32041747 - 32041539
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32041747 agagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagctta 32041648  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32041647 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaa 32041548  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    |||||||||    
T  32041547 acggggcct 32041539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8630876 - 8630665
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630876 gatccagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 8630777  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc-ca 273  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  |    
T  8630776 gcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaa 8630677  T
Q  274 tccaaacggggc 285  Q
    ||||||||||||    
T  8630676 tccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17753813 - 17753600
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753813 gtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 17753714  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  17753713 gcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagc 17753614  T
Q  272 -catccaaacgggg 284  Q
      ||||||||||||    
T  17753613 taatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Original strand, 16894490 - 16894668
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894490 gtggatccagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 16894589  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894590 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 16894668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 46891322 - 46891535
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  46891322 gtggatccagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataa 46891421  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaa-gcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46891422 gcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataag 46891521  T
Q  271 cc-atccaaacggg 283  Q
    || |||||||||||    
T  46891522 ccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48865837 - 48865665
Alignment:
Q  81 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865837 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 48865738  T
Q  181 gaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaa---gcttatgggagtagataagc 250  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  48865737 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 46134295 - 46134500
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  46134295 agagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagctta 46134394  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  46134395 tgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaa 46134494  T
Q  279 acgggg 284  Q
    ||||||    
T  46134495 acgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 43021563 - 43021777
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |    |||||| |||||    
T  43021563 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataa 43021658  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  43021659 gcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagc 43021758  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  43021759 caatccaaatggggcctta 43021777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828265
Alignment:
Q  140 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggg 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  240 agtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcctta 19828265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 37005864 - 37006022
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  37005864 aaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaag 37005963  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggccttactgctaaact 299  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37005964 tagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagccttaatgcaaaact 37006022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704975
Alignment:
Q  190 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcctt 37704976  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  37704975 a 37704975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43405155 - 43405015
Alignment:
Q  150 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 249  Q
    ||||||||||||||| | | || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43405155 ggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataag 43405056  T
Q  250 cccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcctta 289  Q
    || ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  43405055 ccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcctta 43405015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 286
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |  ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 286  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691506
Alignment:
Q  196 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataa 27691506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Original strand, 15655465 - 15655613
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |  | ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  ||||||  ||    
T  15655465 aaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagacttatgttag 15655564  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    |||| |||| |||||||| | | |||||||| ||||||||| |||||||    
T  15655565 tagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcctta 15655613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Original strand, 30075292 - 30075426
Alignment:
Q  150 ggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||   | | |||  |||||||  |||||||||     
T  30075292 ggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-ta-tataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggcttatgttagtagataaa 30075388  T
Q  250 cccacataagctcaaaataag-ccatccaaacggggcc 286  Q
    | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  30075389 ctcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  151 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaac 218  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 54189757 - 54189540
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189757 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 54189658  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189657 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagc 54189558  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | ||||||||||||||||    
T  54189557 caatccaaacggggcctt 54189540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 19913611 - 19913826
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19913611 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 19913710  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913711 gcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 19913810  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  19913811 caatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Original strand, 1756753 - 1756958
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756753 agagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 1756852  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1756853 tgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1756952  T
Q  279 acgggg 284  Q
    ||||||    
T  1756953 acgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 53717445 - 53717661
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53717445 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataa 53717544  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  53717545 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagc 53717644  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  53717645 caatccaaacggggcct 53717661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 23776440 - 23776655
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776440 gtggatcctgagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 23776539  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776540 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 23776639  T
Q  272 c-atccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  23776640 caatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20877259 - 20877041
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20877259 gtggatctagagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 20877160  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877159 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 20877060  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  20877059 caatccaaacgggacctta 20877041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 45424515 - 45424733
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424515 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 45424614  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  45424615 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagt 45424714  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  45424715 caatccaaacggggcctta 45424733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50354005 - 50353795
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50354005 agagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctta 50353906  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50353905 tgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaa 50353806  T
Q  279 acggggcctta 289  Q
    |||||||||||    
T  50353805 acggggcctta 50353795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 269
Target Start/End: Original strand, 37968738 - 37968935
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37968738 gtggatctagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataa 37968837  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968838 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 37968935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 27488629 - 27488845
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27488629 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataa 27488728  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  27488729 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagc 27488828  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  27488829 caatccaaacggggcct 27488845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38055369 - 38055154
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055369 gtggatccagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 38055270  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38055269 gcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagt 38055170  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  38055169 caatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 28032693 - 28032891
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28032693 gtggatccagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataa 28032792  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032793 gcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 28032891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 288
Target Start/End: Original strand, 44784898 - 44785115
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44784898 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataa 44784997  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44784998 gcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 44785097  T
Q  272 c-atccaaacggggcctt 288  Q
    | ||||||||||||||||    
T  44785098 caatccaaacggggcctt 44785115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 2481389 - 2481605
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2481389 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataa 2481488  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481489 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagc 2481588  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  2481589 caatccaaacggggcct 2481605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 6611341 - 6611557
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6611341 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataa 6611440  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6611441 acagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaac 6611540  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  6611541 caatccaaacggggcct 6611557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 15241009 - 15241225
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15241009 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 15241108  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15241109 gcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 15241208  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | ||||||||| |||||    
T  15241209 caatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 35490754 - 35490966
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490754 gtggatccagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 35490853  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35490854 gcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagc 35490953  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  35490954 caatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055298
Alignment:
Q  88 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  188 cgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 286  Q
     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T
Q  287 t 287  Q
    |    
T  50055298 t 50055298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14988004 - 14987786
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14988004 gtggatccagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 14987905  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14987904 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagc 14987805  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14987804 caatccaaacggggcctta 14987786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Original strand, 40428701 - 40428915
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40428701 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataa 40428800  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40428801 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 40428900  T
Q  272 c-atccaaacggggc 285  Q
    | || ||||||||||    
T  40428901 caattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48910058 - 48909842
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48910058 gtggatctggagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataa 48909959  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48909958 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagc 48909859  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||| ||||||    
T  48909858 caatccaaacagggcct 48909842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16700993 - 16700782
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16700993 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 16700894  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700893 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 16700794  T
Q  272 c-atccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  16700793 caatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Original strand, 8932167 - 8932377
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8932167 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctta 8932266  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8932267 tgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaa 8932366  T
Q  279 acggggcctta 289  Q
    |||||||||||    
T  8932367 acggggcctta 8932377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Original strand, 11639559 - 11639773
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639559 gtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 11639658  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  11639659 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaac 11639758  T
Q  272 c-atccaaacggggc 285  Q
    | |||||||||||||    
T  11639759 caatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31969893 - 31969696
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31969893 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataa 31969794  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataa 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31969793 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54412832 - 54412627
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54412832 agagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagctta 54412733  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54412732 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 54412633  T
Q  279 acgggg 284  Q
    ||||||    
T  54412632 acgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1617296 - 1617084
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1617296 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaa 1617197  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1617196 gcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagc 1617097  T
Q  272 c-atccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  1617096 caatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 286
Target Start/End: Original strand, 6688608 - 6688817
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688608 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 6688707  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6688708 gca------gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagt 6688801  T
Q  271 ccatccaaacggggcc 286  Q
    | ||||||||||||||    
T  6688802 caatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37464933 - 37464717
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464933 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 37464834  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464833 gcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagc 37464734  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | || ||||||||||||    
T  37464733 caattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 30423546 - 30423763
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30423546 gtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataa 30423644  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30423645 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagc 30423744  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  30423745 caatccaaacgggacctta 30423763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Original strand, 8591073 - 8591274
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8591073 gtggatccagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataa 8591172  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8591173 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagc 8591272  T
Q  272 ca 273  Q
    ||    
T  8591273 ca 8591274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Original strand, 19164954 - 19165164
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19164954 gtggatccagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataa 19165051  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaag-cttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165052 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 19165151  T
Q  271 cc-atccaaacgg 282  Q
    || ||||||||||    
T  19165152 ccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 43289941 - 43290157
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289941 gtggatccaaagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 43290040  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  43290041 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagc 43290140  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||| ||||    
T  43290141 caatccaaacggagcct 43290157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47632247 - 47632032
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47632247 gtggatccagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataa 47632148  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47632147 gcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataag 47632048  T
Q  271 cc-atccaaacggggc 285  Q
    || |||||||||||||    
T  47632047 ccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53875869 - 53875658
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53875869 gtggatccagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataa 53875770  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53875769 gcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagc 53875670  T
Q  272 c-atccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  53875669 caatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Original strand, 23704190 - 23704408
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23704190 gtggatccaaagagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataa 23704289  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23704290 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagc 23704389  T
Q  272 c-atccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  23704390 caatccaaacagggcctta 23704408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15669395 - 15669179
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15669395 gtggatccagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataa 15669296  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15669295 gcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagc 15669196  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  15669195 caatccaaacggggcct 15669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53353275 - 53353049
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttat----taaaatatggc 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  53353275 gtggatttagagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggc 53353176  T
Q  168 ataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccaca----taagctca 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    ||||||||    
T  53353175 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctca 53353076  T
Q  264 aaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  53353075 aaataagccaatccaaacggggcctta 53353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 27536085 - 27536297
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536085 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 27536184  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||    
T  27536185 gcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagc 27536280  T
Q  272 c-atccaaacggggcct 287  Q
    | |||||||||||||||    
T  27536281 caatccaaacggggcct 27536297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33704053 - 33703855
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33704053 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 33703954  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703953 gcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataag 33703855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52139405 - 52139203
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139405 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 52139306  T
Q  182 aaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaac 280  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  52139305 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaac 52139206  T
Q  281 ggg 283  Q
    |||    
T  52139205 ggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30171792 - 30171581
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30171792 gtggatccagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataa 30171693  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30171692 gcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagc 30171593  T
Q  272 c-atccaaacgg 282  Q
    | ||||||||||    
T  30171592 caatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 27583613 - 27583811
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583613 gtggatccagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataa 27583712  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27583713 gcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataag 27583811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Original strand, 44379176 - 44379384
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44379176 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactta 44379275  T
Q  180 tgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag-ccatccaa 278  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||    
T  44379276 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaa 44379375  T
Q  279 acggggcct 287  Q
    || ||||||    
T  44379376 acagggcct 44379384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 40680019 - 40680217
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40680019 gtggatccagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataa 40680118  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  40680119 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataag 40680217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 287
Target Start/End: Original strand, 55344806 - 55345022
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55344806 gtggatccagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataa 55344905  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
     || || ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55344906 acaactcatgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagt 55345005  T
Q  271 ccatccaaacggggcct 287  Q
    | || ||||||||||||    
T  55345006 caattcaaacggggcct 55345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375844
Alignment:
Q  88 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  188 cgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgggg 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 270
Target Start/End: Original strand, 38071307 - 38071499
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |     |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38071307 gtggatccagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataa 38071400  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071401 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataag 38071499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16704023 - 16703843
Alignment:
Q  82 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704023 agagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16703924  T
Q  182 aaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctc 262  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  16703923 aaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360444
Alignment:
Q  113 agctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttattta 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  212 cccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataag 28360444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50053587 - 50053439
Alignment:
Q  140 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggg 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50053587 tgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatggg 50053488  T
Q  240 agtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50053487 agtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Original strand, 23269027 - 23269162
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23269027 gtggatccagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataa 23269126  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttattta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23269127 gcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53408232 - 53408137
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgg-agggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 166  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408232 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265956
Alignment:
Q  199 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctta 23265956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 289
Target Start/End: Original strand, 44548192 - 44548341
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| |  |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  44548192 aaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttag 44548291  T
Q  242 tagataagcccacataagctcaaaataag--ccatccaaacggggcctta 289  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||||||    
T  44548292 tagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcctta 44548341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 142
Target Start/End: Original strand, 23261867 - 23261937
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctga 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23261867 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Original strand, 9595883 - 9595982
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           | |||||||||||||||||||| |||||    
T  9595883 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataa 9595971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Original strand, 51780769 - 51780845
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaac 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780769 aaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 50055349 - 50055303
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055349 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaag 50055303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17493475 - 17493370
Alignment:
Q  142 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggag 241  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  17493475 aaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgcttataggag 17493376  T
Q  242 tagata 247  Q
    ||||||    
T  17493375 tagata 17493370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 48748262 - 48748197
Alignment:
Q  80 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaa 145  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748262 agagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 55344675 - 55344715
Alignment:
Q  73 tggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344675 tggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Original strand, 9595974 - 9596031
Alignment:
Q  230 agcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9595974 agcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggggcct 9596031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  140 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgataagcta 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 34615970 - 34615934
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatt 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34615970 gtggatcaagagaaaatcgaaggaggttacataaatt 34615934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 84 - 286
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23159
Alignment:
Q  84 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  184 actacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacgg 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 23155  T
Q  283 ggcc 286  Q
    ||||    
T  23156 ggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 283
Target Start/End: Original strand, 145238 - 145450
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  145238 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataa 145337  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  145338 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagt 145437  T
Q  271 ccatccaaacggg 283  Q
    | |||||||||||    
T  145438 caatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3922 - 3708
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gtggatccagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 3823  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3822 gcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaac 3723  T
Q  272 c-atccaaacggggc 285  Q
    | |||||||||||||    
T  3722 caatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10450 - 10232
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10450 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataa 10351  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag- 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  10350 gcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagt 10251  T
Q  271 ccatccaaacggggcctta 289  Q
    | |||||||||||||||||    
T  10250 caatccaaacggggcctta 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 287
Target Start/End: Original strand, 2 - 215
Alignment:
Q  75 gatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2 gatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagca 101  T
Q  175 gcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-a 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |    
T  102 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaa 201  T
Q  274 tccaaacggggcct 287  Q
    | ||||||||||||    
T  202 tacaaacggggcct 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 72 - 284
Target Start/End: Original strand, 288 - 501
Alignment:
Q  72 gtggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataa 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  288 gtggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataa 387  T
Q  172 gcagcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 271  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  388 gcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagc 487  T
Q  272 c-atccaaacgggg 284  Q
    | ||||||||||||    
T  488 caatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 283
Target Start/End: Original strand, 1 - 212
Alignment:
Q  74 ggatctagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaggctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagc 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1 ggatccagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagc 99  T
Q  174 agcttatgaaactacgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagta---gataagcccacataagctcaaaataag 270  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  100 agcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataag 198  T
Q  271 -ccatccaaacggg 283  Q
     | |||||||||||    
T  199 tcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University