View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13194_high_7 (Length: 501)

Name: NF13194_high_7
Description: NF13194
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13194_high_7
NF13194_high_7
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-497)||(16743991-16744489)
chr3 (86-374)||(17912483-17912771)
chr3 (80-447)||(2049777-2050147)
chr3 (80-447)||(14842487-14842856)
chr3 (70-447)||(13838852-13839232)
chr3 (80-447)||(12030073-12030443)
chr3 (69-400)||(15858996-15859331)
chr3 (69-384)||(51158008-51158325)
chr3 (209-374)||(2449238-2449404)
chr3 (80-367)||(15936634-15936922)
chr3 (312-495)||(19231982-19232169)
chr3 (80-367)||(15938476-15938764)
chr3 (87-362)||(15614808-15615085)
chr3 (328-447)||(19260749-19260869)
chr3 (242-374)||(13975722-13975853)
chr3 (242-374)||(45860937-45861068)
chr3 (24-154)||(15468555-15468686)
chr3 (80-374)||(13954890-13955185)
chr3 (24-154)||(22275119-22275250)
chr3 (87-222)||(47984624-47984759)
chr3 (87-222)||(48003198-48003333)
chr3 (87-222)||(47993911-47994046)
chr3 (87-222)||(48012484-48012619)
chr3 (72-340)||(16821099-16821369)
chr3 (80-362)||(55316187-55316471)
chr3 (416-495)||(3992873-3992953)
chr3 (416-495)||(55513193-55513273)
chr3 (413-490)||(15857120-15857198)
chr3 (80-362)||(41270043-41270327)
chr3 (416-495)||(2844514-2844594)
chr3 (9-54)||(2449391-2449436)
chr3 (80-132)||(19231945-19231997)
chr3 (416-495)||(54037976-54038056)
chr3 (416-470)||(17955861-17955916)
chr3 (416-495)||(7854305-7854385)
chr3 (416-476)||(45581954-45582016)
chr3 (80-154)||(13975944-13976017)
chr3 (80-142)||(45860773-45860834)
chr3 (317-358)||(14080715-14080756)
chr3 (69-101)||(22144532-22144564)
chr3 (112-230)||(12264932-12265050)
chr3 (436-488)||(17191884-17191936)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-374)||(22907214-22907588)
chr8 (87-447)||(16193643-16194005)
chr8 (80-495)||(16404852-16405268)
chr8 (80-447)||(43373392-43373761)
chr8 (70-447)||(24928716-24929096)
chr8 (209-374)||(5238184-5238350)
chr8 (209-374)||(24661248-24661414)
chr8 (209-374)||(43685643-43685809)
chr8 (83-374)||(17345540-17345832)
chr8 (87-362)||(24548956-24549233)
chr8 (87-362)||(6774258-6774535)
chr8 (80-340)||(21844594-21844856)
chr8 (80-340)||(21851987-21852249)
chr8 (80-362)||(30120690-30120974)
chr8 (1-54)||(5238144-5238197)
chr8 (1-54)||(24661401-24661454)
chr8 (1-54)||(43685603-43685656)
chr8 (416-495)||(274766-274846)
chr8 (416-495)||(641003-641083)
chr8 (416-495)||(826809-826889)
chr8 (416-495)||(24716714-24716794)
chr8 (80-299)||(222754-222975)
chr8 (80-299)||(736377-736598)
chr8 (80-299)||(860272-860493)
chr8 (70-224)||(23837154-23837308)
chr8 (242-362)||(16674392-16674512)
chr8 (72-153)||(13662481-13662561)
chr8 (84-133)||(16674624-16674672)
chr8 (317-358)||(23226076-23226117)
chr8 (69-106)||(41246613-41246650)
chr8 (416-495)||(39115598-39115678)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-374)||(26680089-26680463)
chr4 (69-495)||(54118120-54118551)
chr4 (69-447)||(13246386-13246769)
chr4 (84-447)||(15675009-15675381)
chr4 (242-447)||(122020-122226)
chr4 (87-347)||(31115603-31115865)
chr4 (209-374)||(10488659-10488825)
chr4 (209-374)||(16327926-16328092)
chr4 (84-447)||(10104170-10104523)
chr4 (80-340)||(10644187-10644449)
chr4 (242-374)||(13048221-13048353)
chr4 (80-211)||(111362-111493)
chr4 (312-447)||(33240901-33241043)
chr4 (80-362)||(47357622-47357906)
chr4 (416-495)||(25119059-25119139)
chr4 (9-54)||(10488627-10488672)
chr4 (9-54)||(16328079-16328124)
chr4 (83-158)||(7849970-7850044)
chr4 (416-495)||(5682380-5682460)
chr4 (177-358)||(40885570-40885753)
chr4 (130-224)||(41166083-41166177)
chr4 (80-224)||(15044794-15044938)
chr4 (69-101)||(44055870-44055902)
chr4 (109-224)||(8374504-8374619)
chr4 (80-224)||(15109486-15109630)
chr4 (109-230)||(17145796-17145917)
chr4 (160-224)||(13809647-13809711)
chr4 (113-224)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-374)||(7292905-7293279)
chr7 (68-447)||(13036938-13037322)
chr7 (80-447)||(16211733-16212103)
chr7 (80-488)||(3059933-3060344)
chr7 (80-447)||(36052634-36053003)
chr7 (80-447)||(11580661-11581035)
chr7 (87-374)||(47481031-47481320)
chr7 (209-374)||(11516324-11516490)
chr7 (209-374)||(15441564-15441730)
chr7 (209-374)||(30262129-30262295)
chr7 (80-367)||(18253842-18254130)
chr7 (87-373)||(13320988-13321278)
chr7 (83-339)||(16478985-16479244)
chr7 (242-374)||(25292338-25292470)
chr7 (80-340)||(13572644-13572906)
chr7 (80-340)||(2437425-2437687)
chr7 (80-362)||(10989378-10989661)
chr7 (83-439)||(295900-296257)
chr7 (98-340)||(13911046-13911292)
chr7 (1-54)||(15441717-15441770)
chr7 (1-54)||(30262282-30262335)
chr7 (416-495)||(126738-126818)
chr7 (416-495)||(32493898-32493978)
chr7 (1-54)||(11516284-11516337)
chr7 (416-495)||(1936869-1936949)
chr7 (332-374)||(14113989-14114031)
chr7 (332-374)||(14423639-14423681)
chr7 (416-495)||(111121-111201)
chr7 (69-101)||(15822691-15822723)
chr7 (80-154)||(25292560-25292633)
chr7 (69-224)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-374)||(37066-37440)
scaffold0078 (416-495)||(41632-41712)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (83-497)||(41394191-41394609)
chr1 (80-447)||(20445646-20446019)
chr1 (80-435)||(20531411-20531770)
chr1 (80-447)||(20931312-20931682)
chr1 (69-447)||(20893551-20893933)
chr1 (80-447)||(20913004-20913367)
chr1 (80-447)||(37844374-37844746)
chr1 (209-374)||(51452589-51452755)
chr1 (80-324)||(22227777-22228022)
chr1 (80-324)||(22232474-22232719)
chr1 (87-340)||(2116228-2116484)
chr1 (242-340)||(45051554-45051652)
chr1 (416-495)||(21860334-21860414)
chr1 (416-489)||(44034829-44034903)
chr1 (9-54)||(51452557-51452602)
chr1 (80-340)||(18601140-18601402)
chr1 (87-167)||(45051416-45051496)
chr1 (80-362)||(5072388-5072672)
chr1 (436-495)||(41218749-41218808)
chr1 (70-101)||(49967607-49967638)
chr1 (109-190)||(20254308-20254389)
chr1 (436-488)||(13376711-13376763)
chr1 (112-191)||(22143531-22143611)
chr1 (436-488)||(27675139-27675191)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (69-495)||(19794581-19795011)
chr2 (80-495)||(43642833-43643250)
chr2 (80-447)||(36982364-36982737)
chr2 (80-495)||(20627190-20627609)
chr2 (80-447)||(462706-463075)
chr2 (80-441)||(8891209-8891574)
chr2 (84-447)||(24341309-24341681)
chr2 (209-374)||(19689401-19689567)
chr2 (209-374)||(23820168-23820334)
chr2 (209-374)||(14906440-14906606)
chr2 (87-374)||(25265390-25265679)
chr2 (209-374)||(20015108-20015274)
chr2 (83-324)||(7507894-7508138)
chr2 (242-374)||(17396653-17396784)
chr2 (80-362)||(19886661-19886945)
chr2 (416-495)||(22284278-22284358)
chr2 (354-447)||(22863171-22863267)
chr2 (416-495)||(22275045-22275125)
chr2 (417-495)||(15633538-15633617)
chr2 (9-54)||(19689554-19689599)
chr2 (9-54)||(14906593-14906638)
chr2 (9-54)||(20015076-20015121)
chr2 (9-54)||(23820136-23820181)
chr2 (80-142)||(17396887-17396948)
chr2 (109-191)||(19669279-19669362)
chr2 (130-190)||(9636761-9636821)
chr2 (432-488)||(19660217-19660273)
chr2 (112-191)||(19666525-19666605)
chr2 (146-190)||(24884718-24884762)
chr2 (69-101)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (80-447)||(1091-1462)
scaffold0266 (80-447)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (80-447)||(48565-48935)
scaffold0023 (84-340)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (80-448)||(36836-37209)
scaffold0077 (436-495)||(15319-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (80-439)||(19173-19537)
scaffold0195 (80-374)||(21257-21553)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (69-447)||(23153403-23153786)
chr6 (87-403)||(14626089-14626407)
chr6 (80-374)||(35009439-35009735)
chr6 (83-374)||(1657748-1658040)
chr6 (83-374)||(15862443-15862734)
chr6 (87-362)||(1650105-1650382)
chr6 (83-216)||(27740808-27740941)
chr6 (80-334)||(25175531-25175787)
chr6 (80-362)||(27653983-27654267)
chr6 (379-447)||(23148266-23148335)
chr6 (416-495)||(19983144-19983224)
chr6 (416-495)||(35015009-35015089)
chr6 (69-223)||(18381821-18381975)
chr6 (80-133)||(16825986-16826038)
chr6 (291-374)||(27751605-27751688)
chr6 (416-495)||(18583640-18583720)
chr6 (94-200)||(22361926-22362032)
chr6 (177-374)||(29665937-29666137)
chr6 (69-98)||(32898745-32898774)
chr6 (69-224)||(21623123-21623278)
chr6 (160-224)||(25367374-25367438)
chr6 (112-191)||(33324690-33324770)
chr6 (112-191)||(35136182-35136262)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (80-447)||(23506932-23507302)
chr5 (69-447)||(27182471-27182854)
chr5 (88-447)||(18530988-18531355)
chr5 (84-447)||(22053753-22054125)
chr5 (209-374)||(20623066-20623232)
chr5 (209-374)||(21233528-21233694)
chr5 (212-374)||(37052844-37053007)
chr5 (209-374)||(16536294-16536460)
chr5 (83-374)||(34939248-34939540)
chr5 (209-372)||(25900408-25900571)
chr5 (80-362)||(22366481-22366765)
chr5 (80-362)||(25426596-25426880)
chr5 (80-340)||(18778014-18778276)
chr5 (80-362)||(12342-12626)
chr5 (80-362)||(19499867-19500151)
chr5 (80-362)||(21073595-21073879)
chr5 (99-340)||(4200007-4200251)
chr5 (70-154)||(17471803-17471887)
chr5 (80-340)||(27009809-27010071)
chr5 (242-362)||(29188284-29188404)
chr5 (80-340)||(43443417-43443679)
chr5 (1-54)||(20623026-20623079)
chr5 (1-54)||(21233681-21233734)
chr5 (87-160)||(29190479-29190552)
chr5 (9-54)||(25900558-25900603)
chr5 (1-54)||(37052801-37052854)
chr5 (9-54)||(16536262-16536307)
chr5 (112-224)||(23493916-23494029)
chr5 (436-490)||(11584394-11584448)
chr5 (160-224)||(7728466-7728530)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (69-447)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (80-447)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (80-447)||(128095-128464)
scaffold0008 (99-340)||(31697-31942)
scaffold0008 (73-101)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (80-447)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (80-447)||(247366-247738)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (80-447)||(123087-123460)
scaffold0011 (69-101)||(255074-255106)
scaffold0011 (69-101)||(261680-261712)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (70-447)||(171863-172242)
scaffold0001 (70-447)||(177566-177945)
scaffold0001 (69-101)||(70882-70914)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (80-447)||(12083-12450)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (80-438)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (84-436)||(8820-9180)
scaffold0025 (80-406)||(148688-149018)
scaffold0025 (354-447)||(146844-146938)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (80-447)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (80-447)||(26340-26710)
scaffold0162 (87-374)||(8180-8466)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (70-447)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (242-435)||(51121-51314)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (209-374)||(26892-27058)
scaffold0141 (209-367)||(22637-22796)
scaffold0141 (9-54)||(22605-22650)
scaffold0141 (9-54)||(26860-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (209-374)||(1582-1748)
scaffold0124 (9-54)||(1735-1780)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (80-367)||(48155-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (80-367)||(107715-108003)
scaffold0026 (80-305)||(64585-64812)
scaffold0026 (317-359)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (87-374)||(13480-13769)
scaffold0132 (416-495)||(42677-42754)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (87-374)||(41622-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (82-374)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (83-374)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (242-447)||(89378-89586)
scaffold0028 (323-447)||(107708-107835)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (87-340)||(9371-9626)
scaffold0215 (87-340)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (87-363)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (69-211)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (80-324)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (242-367)||(5660-5785)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (80-324)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (80-339)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (80-340)||(14083-14344)
scaffold0139 (80-340)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (80-340)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (242-340)||(13347-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (80-202)||(48482-48603)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (80-202)||(26-147)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (416-495)||(80187-80267)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (112-324)||(54415-54630)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (415-495)||(166116-166197)
scaffold0016 (415-489)||(162036-162111)
scaffold0016 (68-187)||(116687-116806)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (242-362)||(1304-1424)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (416-495)||(31132-31212)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (88-167)||(3183-3262)
scaffold0361 (291-374)||(3370-3453)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (416-489)||(5735-5809)
scaffold0686 (416-489)||(5941-6015)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (80-133)||(1815-1867)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (415-495)||(304-385)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (69-224)||(76984-77139)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (69-106)||(132505-132542)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (89-224)||(197390-197525)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (436-495)||(1721-1780)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (436-495)||(19802-19861)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (112-190)||(104793-104872)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (94-191)||(10642-10739)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (130-191)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (317-358)||(1546-1587)
scaffold0456 (317-358)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (69-98)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (317-358)||(8216-8257)
scaffold0123 (112-191)||(8007-8087)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (249-367)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (317-358)||(70307-70348)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (69-98)||(38253-38282)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (137-201)||(2548-2612)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16744489 - 16743991
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744489 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 16744390  T
101 aattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744389 aattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 16744290  T
201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
16744289 catagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaat 16744190  T
300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744189 catacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaa 16744090  T
400 aattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttctcc 497  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
16744089 aatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattctcc 16743991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 86 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
86 caaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacat 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||    
17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
186 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 447
Target Start/End: Original strand, 13838852 - 13839232
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
13838852 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaa 13838950  T
170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
13838951 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 13839050  T
268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
13839051 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 13839150  T
368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
13839151 tattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858996
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 400  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacacc-aacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 365  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
366 atcatccataatcaaaatt 384  Q
    || |||||||| |||||||    
51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 312 - 495
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232169
Alignment:
312 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatt-cacaa 408  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
409 aatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 19232169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||    
15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615085
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||||| |||||    
15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca 15615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
328 aaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 427  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
428 aagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||| ||||||||||||    
19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13975853 - 13975722
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
13975853 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 13975755  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
13975754 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Original strand, 45860937 - 45861068
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
45860937 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 45861035  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
45861036 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15468686 - 15468555
Alignment:
24 atcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
15468686 atcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaat 15468587  T
123 ccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 154  Q
     |||||||||| |||||||| | |||||||||    
15468586 tcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 22275119 - 22275250
Alignment:
24 atcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaatt-cacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaat 122  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
22275119 atcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaat 22275218  T
123 ccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 154  Q
     |||||||||| ||||| || | |||||||||    
22275219 tcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| ||||||    
48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 222  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 340
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
72 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctatt 171  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |  || ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | |    
16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
172 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 268  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
269 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992953
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 3992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513273
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 55513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 413 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
413 atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 490  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844594
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 2844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2449436 - 2449391
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
2449436 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 132
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231997
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaatat 19231997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037976
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 54037976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctcta 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta 17955861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854385
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 7854385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 476
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctaacttca 476  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975944
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 13975944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45860834
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 45860834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12265050 - 12264932
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
12265050 tcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 12264951  T
212 tcaactacaacatgtcaaa 230  Q
    ||||| ||||||| |||||    
12264950 tcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 17191884 - 17191936
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 488  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
17191884 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22907588 - 22907214
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22907588 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 22907489  T
101 aattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22907488 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 22907389  T
201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
22907388 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 22907289  T
300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
22907288 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | | ||||||    
16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 384  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
385 catacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta 447  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta 16193643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404852
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 474  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
475 cactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
16404872 cacttttgctcctatgattct 16404852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||    
43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24929096 - 24928716
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||| || |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |    
24929096 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaa 24928998  T
170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||     
24928997 ttaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttg 24928898  T
268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
24928897 ttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaat 24928798  T
368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttacctta 447  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
24928797 tatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
     ||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||    
6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844594
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21844594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851987
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 21851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 5238144 - 5238197
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5238144 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24661454 - 24661401
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24661454 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 43685603 - 43685656
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43685603 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274846
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 274846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641003
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 641003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826809
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 826809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716714
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 24716714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
277 aaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||     
23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16674512 - 16674392
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| |||||     
16674512 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcac 16674413  T
342 agttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||   |||||| |||||||||    
16674412 agaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662481
Alignment:
72 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattca 153  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattca 13662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674624
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 133  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16674624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246650
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 41246650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115678
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 39115678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 26680089 - 26680463
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
26680089 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatttcaccaaaacaccaacaac 26680188  T
101 aattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26680189 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 26680288  T
201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
26680289 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 26680388  T
300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
26680389 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 69 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118120
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactact 463  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
464 agctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
54118151 agctctagcttcacttttgctcttatgattct 54118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 69 - 447
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 84 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
380 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 242 - 447
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
441 tacctta 447  Q
    |||||||    
122220 tacctta 122226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 347
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 347  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 84 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||                   ||||||    
10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||   |    
10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
380 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644449
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 10644449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13048353 - 13048221
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |    
13048353 gcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattga 13048254  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
13048253 agttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 447
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
312 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
410 ----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
        ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119059
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 25119059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 10488627 - 10488672
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10488627 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 16328124 - 16328079
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16328124 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaac 158  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682380
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaaccc-cttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||| ||||    
5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct 5682380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
177 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 273  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
274 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41166177 - 41166083
Alignment:
130 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
41166177 tatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 178  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||    
15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
179 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 8374504 - 8374619
Alignment:
109 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 208  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
8374504 ttttcatcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 8374603  T
209 aattcaactacaacat 224  Q
    | |||||| |||||||    
8374604 atttcaacaacaacat 8374619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15109630 - 15109486
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatca 178  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||| | |||| |||||| | |||||||   |||||| ||    
15109630 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaaca 15109532  T
179 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15109531 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15109486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17145917 - 17145796
Alignment:
109 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 208  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
17145917 ttttcatcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 17145818  T
209 aattcaactacaacatgtcaaa 230  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
17145817 atttcaacaacaacatatcaaa 17145796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13809711 - 13809647
Alignment:
160 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||| || | ||||||||| |||||||    
13809711 acaacatcaattagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 13809647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52265757 - 52265645
Alignment:
113 catcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
    |||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||    
52265757 catcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaat 52265658  T
212 tcaactacaacat 224  Q
    ||||| |||||||    
52265657 tcaacaacaacat 52265645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 7292905 - 7293279
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
7292905 atcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 7293004  T
101 aattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7293005 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 7293104  T
201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
7293105 catagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaat 7293204  T
300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
7293205 catacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
68 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 365  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
366 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||     
16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 80 - 488
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
377 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 475  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
476 actttggctccta 488  Q
    ||||| |||||||    
3060332 acttttgctccta 3060344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
378 ---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
        ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 373
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||    
13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaaca 281  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| | |  ||||||| | |||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  || |||||    
13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 373  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478985
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 339  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatc 16478985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25292470 - 25292338
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||    
25292470 gcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaa 25292371  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
25292370 agttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572906
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13572906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437687
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 275  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
276 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 2437687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295900
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 278  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
279 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat- 377  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || ||| |||||||||||||| || ||| ||     
296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
378 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 439  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc 295900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911046
Alignment:
98 aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
198 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 293  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
294 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 13911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 15441770 - 15441717
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15441770 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 30262335 - 30262282
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30262335 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126818
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct 126818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493898
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 32493898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 11516284 - 11516337
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11516284 atcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936869
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||    
1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct 1936869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
332 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
332 atatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111121
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 111121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292560
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||    
25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcat 25292560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||   ||||||||    
17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37440 - 37066
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcttcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
37440 atcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaac 37341  T
101 aattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37340 aattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaat 37241  T
201 catagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaat 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
37240 catagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaat 37141  T
300 catacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37140 catacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41712
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 41712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 83 - 497
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394609
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatca 379  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
380 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcact 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
479 ttggctcctatgcttctcc 497  Q
    || ||||||||| ||||||    
41394591 ttagctcctatgattctcc 41394609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta 447  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 435
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531770
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | |    
20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 435  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 69 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||| || | |    
37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |    
37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
377 t--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228022
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232719
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116484
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
187 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 2116484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 340
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051652
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||    
45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatca 45051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860414
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 21860414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 489  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 51452557 - 51452602
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51452557 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601140
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18601140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | ||||||    
45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | |  ||| | || |||  |    
5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 495
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218808
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
41218749 ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 41218808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 101
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Original strand, 20254308 - 20254389
Alignment:
109 ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 190  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||   || ||||| | || ||||||| | | |||| ||||||||||||||    
20254308 ttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaatt 20254389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 13376763 - 13376711
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 488  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
13376763 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22143611 - 22143531
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
22143611 tcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattg 22143531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 488
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675191
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
27675139 ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 69 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794581
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 265  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
266 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaaca 365  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||    
19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
366 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactac 462  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
463 tagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatgattct 19794581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642833
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||    
43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 474  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
475 cactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
43642853 cacttttgctcctatgattct 43642833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 80 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627190
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||| || | |    
20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 475  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
476 actttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
20627209 acttttgctcctatgattct 20627190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  || ||||| |||| || | |    
462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataa 376  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
377 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 441
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891574
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccctt 441  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctt 8891574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   |    
24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
380 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
182 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17396784 - 17396653
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||||||    
17396784 gcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaa 17396686  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
17396685 agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284358
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct 22284358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 447
Target Start/End: Original strand, 22863171 - 22863267
Alignment:
354 aatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
22863171 aatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275125
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 22275125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 495
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633617
Alignment:
417 tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct 15633617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19689599 - 19689554
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19689599 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 14906638 - 14906593
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14906638 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 20015076 - 20015121
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20015076 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 23820136 - 23820181
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23820136 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396887
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaa 17396887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19669362 - 19669279
Alignment:
109 ttttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||    
19669362 ttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 9636761 - 9636821
Alignment:
130 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 190  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||    
9636761 tatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 9636821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 488
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660273
Alignment:
432 ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
19660217 ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 19666525 - 19666605
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
19666525 tcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatcaattg 19666605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Original strand, 24884718 - 24884762
Alignment:
146 atgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 190  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
24884718 atgaatcatcaacaacaatatctattagcaacaacaacatcaatt 24884762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| |||| || | |    
1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| | || |||| ||||  |||||||| |||| |||| |    
3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | | |    
48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 340
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |  ||| | || |||  | |||    
36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 80 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa 448  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15319
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| ||||    
15378 ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatgattct 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 80 - 439
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19537
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 439  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccc 19537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 69 - 447
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||     
23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626089
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 383  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
384 tcatacaacatttgaaaatt 403  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
14626108 tcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || |||    
35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || | ||| | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650105
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||| |||||    
1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||   ||  | |||| |    
27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175787
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacata 334  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacata 25175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 379 - 447
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
379 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983144
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 19983144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015009
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 35015009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 223  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825986
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 16825986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
291 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583720
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 18583720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
94 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgc 192  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||     
22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
193 acaagaat 200  Q
    ||| ||||    
22361933 acatgaat 22361926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
177 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 274  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
275 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 372  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | |||||| |||||| ||||||| ||||    
29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
373 at 374  Q
    ||    
29666136 at 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Original strand, 21623123 - 21623278
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  ||||||||  |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||| |||  |||||||    
21623123 caattcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcat-ttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatc 21623221  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||| || || || | ||||||||| |||||||    
21623222 acttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaacaacaacat 21623278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25367438 - 25367374
Alignment:
160 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
25367438 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 25367374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 33324690 - 33324770
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
33324690 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 33324770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35136262 - 35136182
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
35136262 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 35136182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 69 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||     
27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
367 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 88 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
88 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||    
18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
188 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 382  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |    
18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
383 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 84 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||    
22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
380 aaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
212 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
311 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||    
34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
183 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 280  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||| || |  || | |  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattc-acaatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
281 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18778014
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | ||  ||  |    
18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 18778014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| |||||  | || ||| | || |||  |    
19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagca 362  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||    
21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4200007
Alignment:
99 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
199 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 295  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
296 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 4200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17471887 - 17471803
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcat 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
17471887 aattcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010071
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 27010071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
342 agttggagcacaaatttagca 362  Q
    |||  |||||| ||| |||||    
29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443417
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca--aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |   |  |||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatca 43443417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20623026 - 20623079
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20623026 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21233734 - 21233681
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21233734 atcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190479
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaacta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacta 29190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 25900603 - 25900558
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25900603 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 37052801 - 37052854
Alignment:
1 atcaaccccaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
37052801 atcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 16536262 - 16536307
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
16536262 caatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 23493916 - 23494029
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaa 210  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| | |||||| | |||| |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | |||    
23493916 tcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaa 23494015  T
211 ttcaactacaacat 224  Q
    |||||| |||||||    
23494016 ttcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584448
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
11584394 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 7728466 - 7728530
Alignment:
160 acaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
7728466 acaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 7728530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 69 - 447
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| |     
41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 266  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
267 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaa 366  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
367 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | |||||  |||| |||| |    
1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    || |||||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
99 acaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 198  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
199 atcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 294  Q
    |||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
295 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 101
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
73 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||  | ||||   |||| |||| |    
6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| ||   |    
247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || | |    
123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 447
Target Start/End: Original strand, 171863 - 172242
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
171863 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 171961  T
170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
171962 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 172061  T
268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
172062 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 172161  T
368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
172162 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 447
Target Start/End: Original strand, 177566 - 177945
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | || | || |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
177566 aattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttcttaa-caacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 177664  T
170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
177665 ttaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 177764  T
268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
177765 ttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagt 177864  T
368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
177865 tatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
378 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
12380 caaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||    
5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
378 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc 438  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 436
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9180
Alignment:
84 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaac 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||  | ||| |||    
8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
184 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 281  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
282 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatca 379  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||   |    
9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
380 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaac 436  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac 9180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 406
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149018
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| || | |    
148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
378 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac 406  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||    
148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 354 - 447
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146938
Alignment:
354 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 146938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
378 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| || | |    
26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat 377  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||    
26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
378 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||    
8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 70 - 447
Target Start/End: Original strand, 271983 - 272362
Alignment:
70 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatcta 169  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||  | |  || | |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |    
271983 aattcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctctataa-caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaa 272081  T
170 ttagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttc 267  Q
    ||| || | | |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||     
272082 ttaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttg 272181  T
268 tacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    | | ||||| |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||| | |    
272182 ttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatt 272281  T
368 catccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
272282 tatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 242 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51121
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 51121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 209 - 367
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 22605 - 22650
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22605 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 26860 - 26905
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26860 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
209 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
308 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1780 - 1735
Alignment:
9 caatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 54  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1780 caatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||    
107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64585
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcataca 305  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcataca 64585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattta 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42754
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 42754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 374
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||    
41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
82 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |    
828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
182 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
280 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
83 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||| | || || ||| |    
34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
182 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 278  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
279 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
439 cttacctta 447  Q
    |||||||||    
89386 cttacctta 89378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
323 catacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 420  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
421 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 447  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||    
107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||    
16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
187 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 284  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
285 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 363
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
87 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||| |||||||| | || || ||| ||||||    
2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
187 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 283  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
284 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaa 363  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||    
3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatct 168  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||     
9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
169 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 367
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
342 agttggagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 324
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 276  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 324  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 339
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | || ||| | || |||  |    
42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 339  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| |  | |||  |    
14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21138
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| | || |||||||||  | |||||| | || |||  |    
21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 277  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
278 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatca 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 340
Target Start/End: Original strand, 3 - 265
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||| | || |||||| ||  | || ||| | || |||  |    
3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
180 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 276  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
277 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13347
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 340  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 13347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
180 caacatcaattgcacaagaatca 202  Q
     |||||||| || ||||||||||    
48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaa 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||  | |||||| |||| |||  |    
147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
180 caacatcaattgcacaagaatca 202  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80267
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 80267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 324
Target Start/End: Original strand, 54415 - 54630
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||| |    
54415 tcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatt 54514  T
212 tcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 307  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |    
54515 tcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaat 54613  T
308 tattatcaattcatgca 324  Q
    ||| |||||||||||||    
54614 tatcatcaattcatgca 54630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166116
Alignment:
415 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
415 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 489  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 116806 - 116687
Alignment:
68 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaa-tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacat 166  Q
    ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||| |||  |||||| |||| | |||||| | |||| |||||||| |||| ||    
116806 tcaattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaa-tccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatat 116708  T
167 ctattagcatcaacaacatca 187  Q
    |  |||||| |||||||||||    
116707 cacttagcaacaacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
242 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 341  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
342 agttggagcacaaatttagca 362  Q
    ||   |||||| |||||||||    
1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31132
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct 31132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 167
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3262
Alignment:
88 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatc 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
291 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 374  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 489  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
416 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 489  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1867
Alignment:
80 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatg 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatg 1867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 304
Alignment:
415 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||  |||| |||    
77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
168 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132505
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttca 132505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 197525 - 197390
Alignment:
89 aacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatca 187  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||    
197525 aacaacaacaacaactcaa-ttctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatca 197427  T
188 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 224  Q
    |||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
197426 attgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 495
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1780
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
1721 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 1780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 19861 - 19802
Alignment:
436 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatgcttct 495  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
19861 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct 19802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 104872 - 104793
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaatt 190  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||    
104872 tcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 191
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10739
Alignment:
94 caacaacaattcaaattttcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| | |||| | |||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
10642 caacaacaattcat-ttttcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattg 10739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2532
Alignment:
130 tatgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 8007 - 8087
Alignment:
112 tcatcatcaatccatgaat-atgtatacccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattg 191  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||    
8007 tcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattg 8087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
249 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 346  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
347 gagcacaaatttagcaacaat 367  Q
    |||||| |||||| |||||||    
56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
317 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaattt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 98
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
69 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Original strand, 2548 - 2612
Alignment:
137 acccaaacgatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatc 201  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
2548 acccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University