View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13200_low_13 (Length: 471)

Name: NF13200_low_13
Description: NF13200
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13200_low_13
NF13200_low_13
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (18-405)||(4889458-4889845)
chr8 (231-460)||(4681923-4682152)
chr8 (231-445)||(4737274-4737488)
chr8 (231-445)||(4996924-4997138)
chr8 (232-459)||(4704011-4704238)
chr8 (231-433)||(4716046-4716251)
chr8 (231-445)||(4775939-4776157)
chr8 (231-438)||(4900482-4900689)
chr8 (231-445)||(4912881-4913093)
chr8 (231-460)||(4689501-4689729)
chr8 (231-445)||(10447863-10448071)
chr8 (231-445)||(21438821-21439038)
chr8 (231-460)||(4746053-4746281)
chr8 (239-408)||(4923567-4923736)
chr8 (238-445)||(4726725-4726931)
chr8 (237-447)||(4874658-4874870)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (80-120)||(2131532-2131572)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4889845 - 4889458
Alignment:
Q  18 aaaaccatactatcttcatccctaaatataaaaatcttttggtatattttcaactgcattctataataatcactacgatgaaaacataaactaattctct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4889845 aaaaccatactatcttcatccctaaatataacaatcttttggtatattttcaactgcattctataacaacgactacgatgaaaacataaactaattctct 4889746  T
Q  118 ctcatggatggttgtaaaacatttaatacta-tgaacaaatttaaaacatttagggacgaaggttgtatatgaatttatagaatcattt-tgttgtaatc 215  Q
     ||||  |||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||      
T  4889745 ttcatatatggttgtaaaacatt-acgaatagtcaacaaatttaaaatatttagggacgaaggttgtatatgaatttatagagtaatttatggtataaag 4889647  T
Q  216 cnnnnnnnnnnnnnnaatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccc 315  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4889646 -taatccttttttttaatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatgggctgactagaaattgggaaggagatccatgtgcccc 4889548  T
Q  316 tgtgaattatatgtgggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaa 405  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4889547 tgtgaattacgtgtgggaaggcctaaactgcagtattgatggcaataacatcccaagaatcatatctttgtaagtatacaattccttaaa 4889458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 231 - 460
Target Start/End: Original strand, 4681923 - 4682152
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  4681923 aatacgaaatactagttgatactatgagaaacatcaagaaggcctatggggtggctagaaattggcagggagatccatgtggtccagtaaactatatgtg 4682022  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4682023 ggaaggcctaaactgcagtcttgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 4682122  T
Q  431 cttcaattatcctctaatgttatatatatt 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4682123 cttcaagtatcctctaatgttatatatatt 4682152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Original strand, 4737274 - 4737488
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4737274 aatactaaataccagttgatactatgacaaacatcaagaatgcttatggtgtggcaagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattacatgtg 4737373  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4737374 ggaaggcctaaactgtagtagtgatggcaataacattccaagaatcacatctttgtaagtttataattccttaaataaaccatatgcataaattcaaaaa 4737473  T
Q  431 cttcaattatcctct 445  Q
    |||||||||||||||    
T  4737474 cttcaattatcctct 4737488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Original strand, 4996924 - 4997138
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4996924 aatactaaatactagttgatactatcataaacatcaagaacacttatggggtggctagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattatatgtg 4997023  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4997024 ggaaggcctaaactgcagtcttgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaggtttataattccttaaataaaccatatgcataaattcaaaaa 4997123  T
Q  431 cttcaattatcctct 445  Q
    ||| |||||||||||    
T  4997124 cttgaattatcctct 4997138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 232 - 459
Target Start/End: Original strand, 4704011 - 4704238
Alignment:
Q  232 atacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4704011 atacgaaatactagttgatactatcatgaatatcaagaacacttatggggtgtctagaaattggcaaggagatccatgtgtccctgtgaattacatgtgg 4704110  T
Q  332 gaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaac 431  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4704111 gaaggcgtaaactgtactattgatgccaatagcatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatccataaattcaagaac 4704210  T
Q  432 ttcaattatcctctaatgttatatatat 459  Q
    |||||||||| | | |||||| ||||||    
T  4704211 ttcaattatcatttgatgttaaatatat 4704238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 231 - 433
Target Start/End: Original strand, 4716046 - 4716251
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4716046 aatacaaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatacttatggggtgactagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4716145  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatccct---taaataaatcatatgcataaattcaa 427  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||    
T  4716146 ggaaggcctaaattgtagtattgatggctatagcatcccaagaatcacatctctgtaagtttacaatcccttaataaataaaccatatgcataacttcaa 4716245  T
Q  428 aaactt 433  Q
    ||||||    
T  4716246 aaactt 4716251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4776157 - 4775939
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4776157 aatacaaaatactagttgataatatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtgcccctgtgaattatatgtg 4776058  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtag---tattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaa-ttca 426  Q
    |||||| |||| ||||||   |  ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  4776057 ggaaggcctaaactgtagcactgatgatgacaataatcccccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaattaaccatatgcataaatttca 4775958  T
Q  427 aaaacttcaattatcctct 445  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4775957 aaaactttaattatcctct 4775939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 231 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4900689 - 4900482
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4900689 aataccaaatgctagttgatactatcacaaacatcaaggatgcttatggggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaaatatatgtg 4900590  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  4900589 ggaagtcctaaactgtagtattgatggctatagcattccaagaatcacatctttgtaagtttacaattccttaaataaactgtatgcataacttcaaaaa 4900490  T
Q  431 cttcaatt 438  Q
    ||||||||    
T  4900489 cttcaatt 4900482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4913093 - 4912881
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4913093 aataccaaataatagttaatgctatcacaaacatcaaggatgcttatgtggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4912994  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  4912993 ggaaggcctaaactgtagtattgatggctatagcattccaagaatcacatctttgtaagtttaccattccttaaataaaccata--cataaattcaagaa 4912896  T
Q  431 cttcaattatcctct 445  Q
    |||||||||||||||    
T  4912895 cttcaattatcctct 4912881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 460
Target Start/End: Original strand, 4689501 - 4689729
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4689501 aataccaaatactagttgatactattacaaacattaagaaggcctatggagtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgaattatatgtg 4689600  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtat---tgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaa 427  Q
    |||||| ||||  ||||||||   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||   ||||||||||    
T  4689601 ggaaggcctaaattgtagtattgatgatgccaataaccccccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcacttcaataaaccata---ataaattcaa 4689697  T
Q  428 aaacttcaattatcctctaatgttatatatatt 460  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4689698 aaacttcaa-taacctctaatgttatatatatt 4689729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Original strand, 10447863 - 10448071
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10447863 aataccaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatgggatggctagaaattggaatggagatccatgtggtccagtgaagtatatgtg 10447962  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaa 430  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||      |||| ||||||||||||||    
T  10447963 ggaaggcctaaactgtagtattgatggcaataacattcaaagaatcacatctttgtaagtttagaatcacttaaa------atatacataaattcaaaaa 10448056  T
Q  431 cttcaattatcctct 445  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10448057 ctttaattgtcctct 10448071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 21439038 - 21438821
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21439038 aataccaaatactagttgatgctatcacaaacgtcaaggatgcttataaggtggctagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgggaattatatgtg 21438939  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcata---aattcaa 427  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |   |||||||    
T  21438938 ggaaggcctaaattgtagcattgatggatatagcatcccaagaatcacatctttgtaagtttactattccttaaataaaccatatgcaaatataattcaa 21438839  T
Q  428 aaacttcaattatcctct 445  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21438838 aaacttcaattatcctct 21438821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 460
Target Start/End: Original strand, 4746053 - 4746281
Alignment:
Q  231 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  4746053 aatacgaaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggggttgcgagaaattggcaaggagatccatgtggtcctgtgcagtatatgta 4746152  T
Q  331 ggaaggtctaacctgtagtattga---tggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattc-a 426  Q
    |||| | |||| ||| ||||||||   ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    | || ||||||||||||||| |    
T  4746153 ggaatgcctaaactgcagtattgatggtggaaataaccccccaagaatcacatatttgtaagtttataattcct----tcaaccatatgcataaattcaa 4746248  T
Q  427 aaaacttcaattatcctctaatgttatatatatt 460  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4746249 aaaacttcaa-taacctctaatgttatatatatt 4746281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4923736 - 4923567
Alignment:
Q  239 atactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaaggtc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  4923736 atactagttgatactatcacaaacatcaagaagacttatggggtggctaaaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaagtatatatgggaaggcc 4923637  T
Q  339 taacctgtagtattgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataa 408  Q
    ||| ||| ||  |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4923636 taaactgcagcgttgatggatataaccccccaagaatcacatctttgtaagtctactatcccttgaataa 4923567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 238 - 445
Target Start/End: Original strand, 4726725 - 4726931
Alignment:
Q  238 aatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaaggt 337  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4726725 aatacaagttgatactatgacaaacatcaagaatgcttatggggtgactaggaattggcagggagatccatgtggtcccgtgaaatatatgtgggaaggc 4726824  T
Q  338 ctaacctgtagtattga---tggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaacttc 434  Q
     ||| ||| ||||||||   ||| ||||||  |  |||||||| || |||||||||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  4726825 ttaaactgcagtattgatggtggaaataaccccaaaagaatcatatatttgtaagtttataaaacc----ataaaccatatgcataaattccaaaacttt 4726920  T
Q  435 aattatcctct 445  Q
    |||||||||||    
T  4726921 aattatcctct 4726931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4874870 - 4874658
Alignment:
Q  237 aaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggagtgactagaaattggcaaggagatccatgtggccctgtgaattatatgtgggaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||     || |||||||||||    
T  4874870 aaatactagttgatactatcacaaacatcaagaatgcttatggggtggaaagaaattggcaaggagatccatgttaccctgaagcatacatgtgggaagg 4874771  T
Q  337 tctaacctgtagtat---tgatggcaataacatcccaagaatcacatctttgtaagtttacaatcccttaaataaatcatatgcataaattcaaaaactt 433  Q
     |||| |||||||||   | ||   | |  |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |    
T  4874770 cctaaactgtagtatgcattatctgattggcggcccaagaatcctatctttgtaagtttacaatccctgaaataaaccat-ttcataaattcaacaacct 4874672  T
Q  434 caattatcctctaa 447  Q
    ||||||||||||||    
T  4874671 caattatcctctaa 4874658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2131572 - 2131532
Alignment:
Q  80 ataataatcactacgatgaaaacataaactaattctctctc 120  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131572 ataataaatactatgatgaaaacataaactaattctctctc 2131532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University