View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13201_low_15 (Length: 312)

Name: NF13201_low_15
Description: NF13201
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13201_low_15
NF13201_low_15
[»] chr7 (91 HSPs)
chr7 (132-304)||(41405324-41405494)
chr7 (1-132)||(25893916-25894047)
chr7 (1-131)||(33839715-33839845)
chr7 (1-130)||(33423276-33423405)
chr7 (1-131)||(35328069-35328199)
chr7 (1-131)||(36389409-36389539)
chr7 (1-131)||(40670616-40670746)
chr7 (1-131)||(45690097-45690227)
chr7 (1-132)||(23393050-23393181)
chr7 (1-132)||(33695820-33695951)
chr7 (1-131)||(17855481-17855611)
chr7 (1-131)||(35355941-35356071)
chr7 (1-131)||(47066977-47067107)
chr7 (1-131)||(46913162-46913294)
chr7 (1-132)||(22979646-22979777)
chr7 (1-132)||(27018169-27018300)
chr7 (1-132)||(47740330-47740461)
chr7 (1-131)||(30076527-30076657)
chr7 (1-131)||(35767527-35767657)
chr7 (1-131)||(49171362-49171492)
chr7 (1-131)||(2341661-2341792)
chr7 (1-132)||(20165813-20165944)
chr7 (1-132)||(33411313-33411444)
chr7 (1-131)||(5183825-5183955)
chr7 (1-119)||(15877603-15877721)
chr7 (1-131)||(31586901-31587031)
chr7 (1-134)||(28233933-28234066)
chr7 (1-132)||(5712221-5712352)
chr7 (1-132)||(48609676-48609807)
chr7 (1-131)||(26579717-26579847)
chr7 (2-131)||(35757020-35757149)
chr7 (1-131)||(37846016-37846146)
chr7 (1-134)||(10028541-10028676)
chr7 (1-120)||(41990869-41990988)
chr7 (1-131)||(29446891-29447020)
chr7 (1-131)||(31625757-31625886)
chr7 (1-131)||(45482711-45482841)
chr7 (1-134)||(19563500-19563633)
chr7 (1-132)||(31429474-31429605)
chr7 (1-132)||(43499538-43499669)
chr7 (1-131)||(33332842-33332971)
chr7 (4-130)||(33870301-33870424)
chr7 (12-131)||(44405412-44405531)
chr7 (1-133)||(45063355-45063485)
chr7 (15-131)||(41904272-41904388)
chr7 (3-97)||(33720070-33720164)
chr7 (1-131)||(10618351-10618474)
chr7 (3-96)||(44564393-44564486)
chr7 (1-131)||(35752034-35752153)
chr7 (1-134)||(43489271-43489393)
chr7 (56-131)||(46898016-46898091)
chr7 (1-131)||(37127990-37128109)
chr7 (1-132)||(36816844-36816964)
chr7 (1-131)||(7876328-7876447)
chr7 (1-131)||(24923024-24923143)
chr7 (42-130)||(45502817-45502905)
chr7 (1-131)||(46817421-46817540)
chr7 (5-130)||(33393385-33393499)
chr7 (56-131)||(45237533-45237608)
chr7 (1-117)||(26941546-26941651)
chr7 (1-117)||(48085911-48086016)
chr7 (1-132)||(26371102-26371222)
chr7 (1-131)||(21718170-21718288)
chr7 (1-131)||(24228594-24228713)
chr7 (5-131)||(44003370-44003485)
chr7 (1-132)||(2332072-2332192)
chr7 (56-129)||(39453484-39453557)
chr7 (3-117)||(25037522-25037625)
chr7 (1-131)||(29610688-29610807)
chr7 (5-134)||(7257438-7257556)
chr7 (1-133)||(498186-498307)
chr7 (56-130)||(46103217-46103291)
chr7 (5-132)||(47460771-47460887)
chr7 (5-131)||(37443602-37443717)
chr7 (63-131)||(39323712-39323779)
chr7 (59-114)||(41855159-41855214)
chr7 (66-140)||(42272180-42272253)
chr7 (59-132)||(29098847-29098920)
chr7 (56-97)||(32556640-32556681)
chr7 (1-57)||(26456162-26456218)
chr7 (59-131)||(44659943-44660015)
chr7 (5-56)||(15644010-15644061)
chr7 (5-56)||(16482847-16482898)
chr7 (5-60)||(38448508-38448563)
chr7 (1-117)||(35484690-35484795)
chr7 (1-131)||(47906758-47906878)
chr7 (1-41)||(39866718-39866758)
chr7 (1-40)||(29098804-29098843)
chr7 (1-37)||(39453558-39453594)
chr7 (73-117)||(39866762-39866806)
chr7 (1-41)||(44659896-44659936)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-131)||(22341788-22341918)
chr6 (1-131)||(5882558-5882688)
chr6 (1-131)||(26377204-26377334)
chr6 (3-131)||(24168145-24168273)
chr6 (1-132)||(18101494-18101625)
chr6 (1-131)||(11988974-11989104)
chr6 (1-127)||(14891383-14891509)
chr6 (1-134)||(8615292-8615425)
chr6 (1-132)||(22551060-22551191)
chr6 (1-131)||(7393586-7393716)
chr6 (1-131)||(19415533-19415663)
chr6 (1-131)||(34527862-34527992)
chr6 (1-129)||(2892240-2892368)
chr6 (1-129)||(7345114-7345242)
chr6 (1-131)||(2593852-2593982)
chr6 (4-132)||(959903-960031)
chr6 (1-117)||(16703418-16703534)
chr6 (1-132)||(28947139-28947270)
chr6 (1-131)||(1970763-1970893)
chr6 (5-131)||(10507908-10508034)
chr6 (1-132)||(24224069-24224200)
chr6 (1-132)||(33452571-33452702)
chr6 (1-132)||(599944-600075)
chr6 (3-130)||(19281056-19281183)
chr6 (1-131)||(5294801-5294931)
chr6 (1-131)||(5299353-5299483)
chr6 (1-119)||(30743460-30743578)
chr6 (1-131)||(23261929-23262059)
chr6 (1-78)||(30467656-30467733)
chr6 (1-134)||(28948842-28948964)
chr6 (56-131)||(15965529-15965604)
chr6 (51-117)||(13329472-13329538)
chr6 (1-131)||(4487579-4487698)
chr6 (56-131)||(24913096-24913171)
chr6 (56-133)||(3786845-3786922)
chr6 (56-133)||(18661830-18661907)
chr6 (5-131)||(7167638-7167753)
chr6 (56-131)||(1398649-1398724)
chr6 (51-131)||(3291099-3291179)
chr6 (72-129)||(375729-375786)
chr6 (1-45)||(1939579-1939623)
chr6 (72-131)||(34262342-34262401)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (1-131)||(43262183-43262313)
chr5 (1-132)||(24253434-24253565)
chr5 (1-132)||(27501054-27501185)
chr5 (1-131)||(7722101-7722231)
chr5 (1-131)||(35626090-35626220)
chr5 (1-131)||(39932631-39932761)
chr5 (1-131)||(43326379-43326509)
chr5 (1-130)||(15398483-15398612)
chr5 (1-129)||(6901851-6901979)
chr5 (1-131)||(27938949-27939080)
chr5 (1-131)||(739704-739834)
chr5 (1-131)||(3466681-3466811)
chr5 (1-131)||(12648849-12648979)
chr5 (1-131)||(29789295-29789425)
chr5 (1-134)||(31938949-31939082)
chr5 (1-132)||(18479667-18479798)
chr5 (1-132)||(34451302-34451433)
chr5 (1-132)||(40886027-40886157)
chr5 (1-131)||(5185024-5185154)
chr5 (1-131)||(15683843-15683973)
chr5 (1-132)||(2484291-2484422)
chr5 (1-131)||(25831573-25831702)
chr5 (10-131)||(28424795-28424916)
chr5 (1-132)||(40278857-40278988)
chr5 (1-131)||(890958-891087)
chr5 (1-130)||(27278474-27278607)
chr5 (1-132)||(13504741-13504872)
chr5 (1-131)||(38756487-38756618)
chr5 (1-131)||(5137767-5137897)
chr5 (3-131)||(763777-763905)
chr5 (1-113)||(40110286-40110397)
chr5 (1-134)||(19295782-19295904)
chr5 (1-133)||(27503431-27503552)
chr5 (39-112)||(4149774-4149847)
chr5 (1-131)||(33617637-33617756)
chr5 (1-131)||(38015514-38015633)
chr5 (1-131)||(23195248-23195367)
chr5 (56-131)||(5497369-5497444)
chr5 (1-117)||(42658676-42658781)
chr5 (1-132)||(3656567-3656687)
chr5 (1-131)||(13957722-13957841)
chr5 (1-93)||(40632551-40632634)
chr5 (1-130)||(9424593-9424711)
chr5 (1-132)||(31293988-31294119)
chr5 (1-114)||(38492665-38492767)
chr5 (56-108)||(6206980-6207032)
chr5 (1-131)||(6973115-6973234)
chr5 (1-131)||(9374502-9374621)
chr5 (1-134)||(14972030-14972152)
chr5 (5-132)||(18327172-18327288)
chr5 (5-131)||(27390653-27390768)
chr5 (11-132)||(24167783-24167893)
chr5 (1-114)||(36365462-36365564)
chr5 (59-131)||(612757-612830)
chr5 (1-60)||(12558090-12558148)
chr5 (5-56)||(36472348-36472399)
chr5 (56-130)||(33623940-33624014)
chr5 (1-129)||(36948492-36948607)
chr5 (5-131)||(2585518-2585633)
chr5 (1-57)||(5120077-5120132)
chr5 (5-131)||(38637910-38638025)
chr5 (68-131)||(3940336-3940399)
chr5 (57-131)||(9171035-9171108)
chr5 (94-132)||(21785995-21786033)
chr5 (5-131)||(1402505-1402620)
chr5 (72-131)||(40687010-40687069)
chr5 (73-131)||(42247791-42247849)
chr5 (1-45)||(612831-612875)
chr5 (1-37)||(42247865-42247901)
[»] chr4 (121 HSPs)
chr4 (1-132)||(31532134-31532265)
chr4 (1-131)||(34276599-34276729)
chr4 (1-134)||(9798517-9798650)
chr4 (1-134)||(21366606-21366739)
chr4 (1-133)||(44984813-44984945)
chr4 (1-131)||(42085259-42085389)
chr4 (1-131)||(53461816-53461946)
chr4 (1-130)||(32366661-32366790)
chr4 (1-141)||(54574930-54575070)
chr4 (1-132)||(23437644-23437775)
chr4 (1-132)||(26091257-26091388)
chr4 (1-131)||(237529-237659)
chr4 (1-131)||(31914250-31914379)
chr4 (1-131)||(39077597-39077727)
chr4 (1-131)||(42765842-42765971)
chr4 (1-131)||(45797531-45797661)
chr4 (1-131)||(48657870-48658000)
chr4 (1-130)||(6019980-6020109)
chr4 (3-127)||(50534685-50534809)
chr4 (1-132)||(53854429-53854559)
chr4 (1-131)||(2826682-2826811)
chr4 (1-131)||(19387688-19387818)
chr4 (1-135)||(31972332-31972466)
chr4 (3-133)||(41560382-41560512)
chr4 (1-135)||(54608014-54608148)
chr4 (1-134)||(29478412-29478545)
chr4 (1-129)||(397454-397582)
chr4 (2-134)||(23609140-23609272)
chr4 (1-129)||(41702461-41702589)
chr4 (1-132)||(18462012-18462143)
chr4 (1-132)||(51363059-51363189)
chr4 (1-140)||(54086461-54086599)
chr4 (1-132)||(55519879-55520010)
chr4 (5-131)||(36532830-36532956)
chr4 (3-134)||(41949436-41949569)
chr4 (1-131)||(55056259-55056389)
chr4 (3-128)||(6285361-6285486)
chr4 (1-114)||(27373128-27373241)
chr4 (1-133)||(35446557-35446689)
chr4 (1-132)||(56022997-56023128)
chr4 (1-131)||(146429-146559)
chr4 (1-131)||(43471695-43471825)
chr4 (1-131)||(47344708-47344838)
chr4 (1-131)||(55776097-55776226)
chr4 (1-131)||(55840275-55840404)
chr4 (3-131)||(3170680-3170808)
chr4 (1-129)||(50457812-50457940)
chr4 (1-132)||(407806-407935)
chr4 (3-134)||(42033229-42033360)
chr4 (2-131)||(14017376-14017503)
chr4 (1-131)||(22618514-22618642)
chr4 (1-131)||(50234052-50234182)
chr4 (1-131)||(52728307-52728436)
chr4 (1-131)||(38591720-38591846)
chr4 (1-134)||(42222343-42222476)
chr4 (1-131)||(2243510-2243640)
chr4 (1-131)||(3692210-3692340)
chr4 (1-131)||(29777257-29777387)
chr4 (1-131)||(31070074-31070203)
chr4 (1-131)||(47662102-47662232)
chr4 (1-132)||(49881058-49881193)
chr4 (1-131)||(54425034-54425163)
chr4 (1-130)||(53834055-53834184)
chr4 (1-132)||(41632006-41632136)
chr4 (1-131)||(1932815-1932945)
chr4 (1-127)||(50536628-50536754)
chr4 (34-132)||(35595772-35595870)
chr4 (1-114)||(39587796-39587909)
chr4 (1-131)||(48654866-48655002)
chr4 (1-113)||(22468788-22468900)
chr4 (1-132)||(48313609-48313738)
chr4 (4-134)||(42509351-42509481)
chr4 (1-119)||(33897507-33897625)
chr4 (1-131)||(54805614-54805748)
chr4 (3-114)||(48259528-48259638)
chr4 (1-87)||(52396778-52396865)
chr4 (1-129)||(51951734-51951861)
chr4 (56-132)||(9997930-9998006)
chr4 (1-131)||(45633779-45633898)
chr4 (29-130)||(35344868-35344968)
chr4 (58-130)||(33048990-33049062)
chr4 (1-134)||(15060286-15060408)
chr4 (56-131)||(43891024-43891099)
chr4 (1-131)||(37239090-37239209)
chr4 (1-134)||(22620645-22620767)
chr4 (56-134)||(34552415-34552493)
chr4 (3-131)||(52461417-52461534)
chr4 (1-108)||(5117461-5117557)
chr4 (59-131)||(52688448-52688520)
chr4 (1-131)||(54715087-54715206)
chr4 (56-131)||(20351842-20351917)
chr4 (58-117)||(33289801-33289860)
chr4 (56-131)||(47812002-47812077)
chr4 (1-134)||(54216365-54216487)
chr4 (1-108)||(4486604-4486700)
chr4 (54-131)||(48259704-48259780)
chr4 (56-108)||(27873571-27873623)
chr4 (1-131)||(31881314-31881433)
chr4 (5-131)||(38547601-38547716)
chr4 (26-131)||(42558270-42558367)
chr4 (1-131)||(46708741-46708860)
chr4 (5-134)||(27872635-27872753)
chr4 (1-132)||(49014150-49014270)
chr4 (56-117)||(51981493-51981554)
chr4 (5-131)||(27580175-27580290)
chr4 (5-131)||(34835233-34835348)
chr4 (5-59)||(27398664-27398718)
chr4 (1-132)||(54216735-54216855)
chr4 (63-131)||(3291805-3291873)
chr4 (5-127)||(46720081-46720195)
chr4 (5-56)||(1662323-1662374)
chr4 (1-56)||(14335165-14335220)
chr4 (62-113)||(33557960-33558011)
chr4 (5-132)||(573859-573975)
chr4 (3-48)||(43231556-43231601)
chr4 (79-131)||(1662261-1662313)
chr4 (90-133)||(18206510-18206553)
chr4 (1-41)||(3293102-3293142)
chr4 (5-131)||(6371249-6371364)
chr4 (1-55)||(18206583-18206641)
chr4 (1-41)||(11972208-11972248)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (1-132)||(3611188-3611319)
chr1 (1-132)||(25678258-25678389)
chr1 (1-132)||(45538205-45538336)
chr1 (1-131)||(31308053-31308183)
chr1 (1-133)||(47671638-47671770)
chr1 (1-132)||(21139411-21139542)
chr1 (1-132)||(36566382-36566513)
chr1 (1-131)||(44662022-44662152)
chr1 (1-125)||(4068689-4068813)
chr1 (1-129)||(43251763-43251891)
chr1 (1-132)||(26085397-26085528)
chr1 (1-132)||(47317367-47317498)
chr1 (1-131)||(17994951-17995081)
chr1 (3-131)||(5981224-5981352)
chr1 (3-131)||(23984809-23984937)
chr1 (1-133)||(25058740-25058872)
chr1 (1-132)||(35273648-35273779)
chr1 (1-131)||(31040761-31040891)
chr1 (1-131)||(37620192-37620322)
chr1 (1-131)||(38790197-38790327)
chr1 (1-134)||(24245022-24245155)
chr1 (1-134)||(46967038-46967171)
chr1 (1-133)||(2450546-2450678)
chr1 (1-132)||(26277229-26277360)
chr1 (1-131)||(6327548-6327677)
chr1 (1-131)||(23932509-23932639)
chr1 (1-127)||(26794356-26794482)
chr1 (1-131)||(33112818-33112947)
chr1 (1-131)||(39646620-39646750)
chr1 (1-131)||(41999867-41999997)
chr1 (1-131)||(33884140-33884270)
chr1 (1-131)||(33959982-33960112)
chr1 (1-131)||(47187157-47187287)
chr1 (3-133)||(47383730-47383860)
chr1 (1-131)||(50774269-50774399)
chr1 (1-134)||(46784475-46784608)
chr1 (1-133)||(51057123-51057255)
chr1 (1-131)||(35692663-35692793)
chr1 (1-131)||(38331859-38331989)
chr1 (1-119)||(49253987-49254105)
chr1 (1-130)||(3285454-3285582)
chr1 (1-98)||(31844428-31844525)
chr1 (1-118)||(42863917-42864034)
chr1 (3-131)||(4808699-4808827)
chr1 (1-133)||(49398986-49399118)
chr1 (1-131)||(5980120-5980250)
chr1 (1-131)||(24885553-24885683)
chr1 (1-131)||(26524889-26525019)
chr1 (1-131)||(42313361-42313491)
chr1 (1-131)||(46616601-46616731)
chr1 (1-132)||(23220934-23221059)
chr1 (1-131)||(36003182-36003315)
chr1 (1-132)||(51045595-51045726)
chr1 (1-128)||(28888633-28888760)
chr1 (1-87)||(25518866-25518952)
chr1 (1-131)||(4156439-4156576)
chr1 (1-108)||(45475866-45475972)
chr1 (1-131)||(48373556-48373677)
chr1 (41-134)||(27983600-27983693)
chr1 (38-133)||(13312529-13312624)
chr1 (1-131)||(47772172-47772302)
chr1 (1-132)||(41467631-41467751)
chr1 (1-131)||(2657355-2657474)
chr1 (1-131)||(33073263-33073382)
chr1 (1-130)||(6626025-6626143)
chr1 (56-134)||(41895161-41895239)
chr1 (1-131)||(10928119-10928238)
chr1 (1-131)||(29770722-29770841)
chr1 (1-65)||(51403074-51403137)
chr1 (1-68)||(2556909-2556976)
chr1 (1-132)||(30289909-30290029)
chr1 (5-131)||(2954911-2955026)
chr1 (1-68)||(31979998-31980065)
chr1 (1-117)||(26472193-26472298)
chr1 (56-117)||(34752328-34752389)
chr1 (1-131)||(4953104-4953223)
chr1 (5-131)||(5961267-5961382)
chr1 (68-132)||(7561527-7561591)
chr1 (1-131)||(42234892-42235010)
chr1 (56-131)||(4243490-4243565)
chr1 (11-132)||(10920262-10920372)
chr1 (1-114)||(35991616-35991718)
chr1 (6-132)||(1388530-1388645)
chr1 (5-131)||(26685912-26686027)
chr1 (76-132)||(33187450-33187506)
chr1 (5-131)||(38716247-38716362)
chr1 (75-134)||(32448754-32448813)
chr1 (5-134)||(39475780-39475897)
chr1 (56-131)||(51155590-51155664)
chr1 (62-108)||(24215865-24215911)
chr1 (3-48)||(39637950-39637996)
chr1 (56-105)||(13281588-13281637)
chr1 (12-131)||(31286504-31286612)
chr1 (56-132)||(38718166-38718242)
chr1 (1-45)||(13313249-13313293)
chr1 (1-57)||(33187392-33187448)
chr1 (5-131)||(48683330-48683445)
chr1 (5-56)||(27924722-27924773)
chr1 (5-56)||(52367939-52367990)
chr1 (1-41)||(32448700-32448740)
chr1 (1-131)||(44293455-44293574)
chr1 (1-41)||(44544125-44544165)
chr1 (79-134)||(52324058-52324113)
chr1 (70-98)||(39359502-39359530)
chr1 (1-41)||(46428332-46428372)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-131)||(39556-39686)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (1-131)||(32984077-32984207)
chr8 (1-133)||(24079899-24080031)
chr8 (1-132)||(10646175-10646306)
chr8 (1-131)||(9303574-9303704)
chr8 (5-131)||(12032986-12033112)
chr8 (1-131)||(13356120-13356250)
chr8 (1-127)||(31830959-31831085)
chr8 (1-131)||(33981663-33981793)
chr8 (1-131)||(40435153-40435283)
chr8 (6-131)||(33730641-33730766)
chr8 (1-131)||(37956473-37956603)
chr8 (1-131)||(43328759-43328889)
chr8 (1-133)||(2714601-2714732)
chr8 (1-131)||(5946099-5946229)
chr8 (1-131)||(9734307-9734435)
chr8 (1-131)||(41862272-41862402)
chr8 (15-132)||(41981534-41981651)
chr8 (1-133)||(3904129-3904260)
chr8 (3-131)||(25248087-25248215)
chr8 (1-132)||(41653947-41654078)
chr8 (1-131)||(6366038-6366168)
chr8 (1-131)||(17718722-17718852)
chr8 (1-119)||(25185951-25186069)
chr8 (1-131)||(45236565-45236695)
chr8 (1-130)||(37301326-37301455)
chr8 (3-131)||(9013738-9013865)
chr8 (1-129)||(32114301-32114429)
chr8 (1-108)||(29048426-29048533)
chr8 (1-132)||(37419992-37420123)
chr8 (3-114)||(44088460-44088571)
chr8 (1-131)||(2275965-2276094)
chr8 (1-131)||(35628829-35628959)
chr8 (1-131)||(41231998-41232128)
chr8 (1-119)||(45066604-45066722)
chr8 (1-131)||(13760646-13760778)
chr8 (1-130)||(22878443-22878572)
chr8 (18-131)||(31336163-31336276)
chr8 (4-114)||(45258565-45258675)
chr8 (1-130)||(41639966-41640095)
chr8 (3-121)||(42701299-42701418)
chr8 (1-132)||(41843305-41843425)
chr8 (1-131)||(4447295-4447414)
chr8 (1-132)||(9713738-9713858)
chr8 (1-131)||(3211257-3211376)
chr8 (1-134)||(117326-117448)
chr8 (1-132)||(31940367-31940486)
chr8 (56-132)||(2379236-2379312)
chr8 (1-131)||(10378361-10378480)
chr8 (1-51)||(41981485-41981535)
chr8 (3-56)||(39915887-39915940)
chr8 (56-117)||(40649845-40649906)
chr8 (3-126)||(4975412-4975524)
chr8 (1-132)||(40458771-40458891)
chr8 (1-114)||(32373744-32373845)
chr8 (56-131)||(9509400-9509475)
chr8 (66-132)||(39901674-39901740)
chr8 (56-133)||(33622465-33622541)
chr8 (56-133)||(41425427-41425503)
chr8 (5-131)||(33896843-33896958)
chr8 (1-58)||(31148953-31149009)
chr8 (5-131)||(3490399-3490514)
chr8 (11-131)||(26196317-26196426)
chr8 (1-41)||(27243218-27243258)
chr8 (1-41)||(27254793-27254833)
chr8 (1-41)||(38631704-38631744)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (1-131)||(17600887-17601017)
chr2 (1-134)||(746517-746650)
chr2 (1-134)||(23901830-23901963)
chr2 (1-132)||(45371041-45371172)
chr2 (1-131)||(27651034-27651164)
chr2 (1-131)||(40635269-40635399)
chr2 (1-128)||(25294886-25295013)
chr2 (1-136)||(26710396-26710531)
chr2 (1-131)||(4034643-4034773)
chr2 (1-131)||(6594458-6594588)
chr2 (1-131)||(11185023-11185153)
chr2 (1-131)||(14660497-14660627)
chr2 (1-131)||(34518418-34518548)
chr2 (1-131)||(38997152-38997282)
chr2 (1-125)||(6430524-6430648)
chr2 (1-132)||(13815217-13815348)
chr2 (1-132)||(27400454-27400585)
chr2 (1-132)||(32327412-32327543)
chr2 (1-131)||(1091951-1092081)
chr2 (1-131)||(2324889-2325019)
chr2 (1-131)||(10244582-10244712)
chr2 (1-133)||(4609677-4609809)
chr2 (1-128)||(10424646-10424773)
chr2 (1-131)||(27024466-27024596)
chr2 (1-131)||(33427647-33427777)
chr2 (1-131)||(37255337-37255467)
chr2 (1-132)||(5726180-5726311)
chr2 (1-131)||(9444741-9444874)
chr2 (1-132)||(14697536-14697667)
chr2 (1-132)||(32948497-32948627)
chr2 (1-131)||(11159672-11159802)
chr2 (1-132)||(2914137-2914268)
chr2 (1-132)||(40735515-40735646)
chr2 (1-131)||(7892688-7892818)
chr2 (1-131)||(32856436-32856566)
chr2 (1-131)||(40037194-40037323)
chr2 (1-133)||(37620865-37621000)
chr2 (1-97)||(32608431-32608527)
chr2 (24-132)||(447632-447740)
chr2 (1-116)||(1229678-1229793)
chr2 (1-98)||(8432949-8433046)
chr2 (1-125)||(15925131-15925255)
chr2 (1-97)||(12842154-12842250)
chr2 (21-93)||(28014856-28014928)
chr2 (1-97)||(41172509-41172605)
chr2 (1-74)||(42899966-42900039)
chr2 (24-131)||(12827137-12827243)
chr2 (1-133)||(35158048-35158169)
chr2 (56-130)||(39103142-39103216)
chr2 (1-134)||(19428423-19428545)
chr2 (1-134)||(29687092-29687214)
chr2 (1-129)||(145333-145450)
chr2 (1-131)||(3711684-3711803)
chr2 (1-131)||(13543624-13543743)
chr2 (1-134)||(28641289-28641411)
chr2 (56-132)||(4258584-4258660)
chr2 (1-131)||(21734900-21735019)
chr2 (56-131)||(2688729-2688804)
chr2 (1-132)||(43898970-43899089)
chr2 (1-131)||(27331349-27331472)
chr2 (1-131)||(34249316-34249435)
chr2 (1-134)||(12333494-12333614)
chr2 (1-132)||(43356147-43356267)
chr2 (1-131)||(12730112-12730231)
chr2 (1-131)||(27764863-27764981)
chr2 (1-131)||(39301197-39301316)
chr2 (5-131)||(44481883-44481998)
chr2 (1-126)||(28566703-28566817)
chr2 (5-56)||(35126835-35126886)
chr2 (73-129)||(3266399-3266455)
chr2 (60-114)||(8056725-8056779)
chr2 (73-133)||(40544083-40544143)
chr2 (1-41)||(40544155-40544195)
chr2 (3-46)||(30545874-30545917)
chr2 (32-81)||(17799296-17799345)
chr2 (51-131)||(2000339-2000417)
chr2 (1-41)||(3266347-3266387)
chr2 (1-29)||(12814665-12814693)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-134)||(11130-11263)
[»] chr3 (105 HSPs)
chr3 (3-131)||(49330091-49330219)
chr3 (1-131)||(38416724-38416854)
chr3 (1-131)||(47257845-47257975)
chr3 (1-130)||(51170034-51170163)
chr3 (1-131)||(35748311-35748441)
chr3 (1-131)||(43612047-43612177)
chr3 (1-134)||(41464404-41464537)
chr3 (1-129)||(48609775-48609903)
chr3 (1-132)||(28048391-28048522)
chr3 (1-132)||(40643852-40643983)
chr3 (1-131)||(47809596-47809727)
chr3 (1-131)||(7855114-7855244)
chr3 (1-131)||(27066978-27067108)
chr3 (1-131)||(40130959-40131089)
chr3 (1-131)||(40419887-40420017)
chr3 (1-131)||(46126039-46126168)
chr3 (1-131)||(48739233-48739363)
chr3 (1-134)||(44222881-44223014)
chr3 (1-130)||(55453245-55453374)
chr3 (1-132)||(22399149-22399279)
chr3 (1-132)||(24100335-24100465)
chr3 (1-131)||(39634572-39634701)
chr3 (1-134)||(52629006-52629138)
chr3 (1-133)||(41732580-41732712)
chr3 (1-119)||(29625839-29625957)
chr3 (1-131)||(32234398-32234527)
chr3 (1-131)||(37324593-37324723)
chr3 (1-131)||(42291894-42292024)
chr3 (1-134)||(37313451-37313584)
chr3 (1-142)||(46134408-46134549)
chr3 (1-131)||(2666052-2666182)
chr3 (1-131)||(7755307-7755436)
chr3 (1-131)||(40804510-40804640)
chr3 (1-131)||(43125883-43126012)
chr3 (1-131)||(51102378-51102508)
chr3 (1-131)||(51452751-51452880)
chr3 (1-131)||(52215128-52215258)
chr3 (3-127)||(35594175-35594299)
chr3 (1-129)||(43183964-43184092)
chr3 (1-132)||(51146214-51146345)
chr3 (1-131)||(39053446-39053576)
chr3 (1-131)||(52638894-52639024)
chr3 (1-131)||(53943588-53943717)
chr3 (3-116)||(36368993-36369105)
chr3 (1-129)||(47894822-47894950)
chr3 (1-131)||(18946955-18947085)
chr3 (1-131)||(20754393-20754523)
chr3 (1-130)||(43021766-43021896)
chr3 (1-131)||(44806736-44806866)
chr3 (1-98)||(24376625-24376722)
chr3 (16-131)||(33550467-33550582)
chr3 (4-131)||(5560025-5560154)
chr3 (1-131)||(41216507-41216637)
chr3 (1-131)||(41293319-41293448)
chr3 (9-131)||(52864550-52864671)
chr3 (1-129)||(53832486-53832614)
chr3 (1-99)||(53637893-53637991)
chr3 (1-114)||(46949426-46949538)
chr3 (1-95)||(37758981-37759075)
chr3 (1-80)||(47182052-47182131)
chr3 (1-131)||(25641698-25641817)
chr3 (1-131)||(42589882-42590001)
chr3 (1-131)||(51416021-51416140)
chr3 (1-129)||(54159000-54159118)
chr3 (1-131)||(55000178-55000297)
chr3 (56-131)||(38156632-38156707)
chr3 (1-117)||(54401239-54401344)
chr3 (1-132)||(34279720-34279840)
chr3 (1-129)||(48546842-48546959)
chr3 (56-128)||(49130674-49130746)
chr3 (1-131)||(54707220-54707339)
chr3 (1-134)||(37028775-37028897)
chr3 (1-114)||(39141141-39141245)
chr3 (1-132)||(47510939-47511059)
chr3 (5-132)||(55380041-55380157)
chr3 (5-131)||(48534007-48534122)
chr3 (3-131)||(31286793-31286910)
chr3 (3-126)||(40022128-40022240)
chr3 (9-131)||(25353614-25353725)
chr3 (1-131)||(41635800-41635919)
chr3 (5-131)||(53115503-53115618)
chr3 (1-129)||(45058935-45059052)
chr3 (1-131)||(24688166-24688285)
chr3 (5-131)||(30251501-30251616)
chr3 (1-132)||(52756066-52756190)
chr3 (1-106)||(17665549-17665643)
chr3 (56-131)||(44945935-44946010)
chr3 (3-131)||(51224038-51224155)
chr3 (44-131)||(30429227-30429314)
chr3 (5-130)||(42998790-42998904)
chr3 (5-130)||(51143873-51143987)
chr3 (73-131)||(43176738-43176796)
chr3 (5-132)||(40165707-40165823)
chr3 (1-131)||(41609119-41609238)
chr3 (1-60)||(2227995-2228054)
chr3 (1-48)||(28576184-28576231)
chr3 (5-48)||(41882063-41882106)
chr3 (1-60)||(47402810-47402868)
chr3 (5-48)||(50731986-50732029)
chr3 (5-48)||(50780827-50780870)
chr3 (3-60)||(8847718-8847775)
chr3 (80-133)||(50731912-50731965)
chr3 (80-133)||(50780891-50780944)
chr3 (5-131)||(21597148-21597263)
chr3 (79-131)||(40688431-40688483)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (1-136)||(1921-2056)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-131)||(13762-13892)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-134)||(2429-2562)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-131)||(176706-176836)
scaffold0007 (1-131)||(278058-278190)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (3-131)||(3133-3261)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (3-134)||(4593-4724)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-131)||(75244-75374)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-131)||(18854-18984)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-98)||(32613-32710)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (3-134)||(7145-7265)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (5-133)||(14800-14917)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-131)||(20477-20592)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (58-97)||(18004-18043)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (3-56)||(4618-4671)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (3-56)||(3447-3500)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (5-56)||(158-209)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (1-55)||(19269-19327)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 91)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 304
Target Start/End: Original strand, 41405324 - 41405494
Alignment:
Q  132 aaagttaaatagttgatccatcaccaaattatctcaccatcactatttttctcgnnnnnnnnnnctctctctttaaataaaacctttcatttgcttaatt 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41405324 aaagttaaatagttgattcatcaccaaattatctcaccatcactatttttctcgtttttttt--ctctctctttaaataaaacctttcatttgcttaatt 41405421  T
Q  232 tgaaaaataaaaagatcctcacctgttattgttagaggttacaaaatggttgttttgtgcttggattcttctc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41405422 tgaaaaataaaaagatcctcacctgttattgttagaggttacaaaatggttgttttgtgcttggattcttctc 41405494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25894047 - 25893916
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894047 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25893948  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25893947 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 25893916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33839845 - 33839715
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33839845 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 33839746  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839745 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33423405 - 33423276
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33423405 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33423306  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33423305 ccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35328199 - 35328069
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35328199 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35328100  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35328099 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 36389409 - 36389539
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36389409 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 36389508  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36389509 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 40670616 - 40670746
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40670616 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40670715  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670716 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45690227 - 45690097
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  45690227 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 45690128  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45690127 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23393181 - 23393050
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23393181 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 23393082  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23393081 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23393050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33695951 - 33695820
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33695951 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33695852  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33695851 ccattcttccatggataccctagttgtcacca 33695820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17855481 - 17855611
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17855481 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 17855580  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17855581 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35355941 - 35356071
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35355941 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35356040  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35356041 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47067107 - 47066977
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47067107 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47067008  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47067007 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 46913162 - 46913294
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg--cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913162 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 46913261  T
Q  99 tatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46913262 caccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22979777 - 22979646
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22979777 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 22979678  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22979677 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 22979646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 27018169 - 27018300
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27018169 tgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 27018268  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27018269 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 27018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47740461 - 47740330
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47740461 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47740362  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47740361 ccattcttccatggataccctagttgtcacca 47740330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30076657 - 30076527
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  30076657 tgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccca 30076558  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30076557 tcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35767527 - 35767657
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35767527 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35767626  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35767627 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49171492 - 49171362
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  49171492 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 49171393  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  49171392 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2341792 - 2341661
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2341792 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 2341693  T
Q  101 tcattcttccat-gggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2341692 ccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20165944 - 20165813
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  20165944 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactca 20165845  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20165844 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 20165813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 33411313 - 33411444
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33411313 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 33411412  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  33411413 ccattcttccataagtaccctagttgtcacca 33411444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5183955 - 5183825
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5183955 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 5183856  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5183855 ccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 15877603 - 15877721
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  15877603 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattaccca 15877702  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15877703 ccattcttccatgggtacc 15877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31586901 - 31587031
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31586901 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31587000  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  31587001 ccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28234066 - 28233933
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28234066 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaactaccca 28233967  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     | ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28233966 cctttctttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 28233933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 5712221 - 5712352
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5712221 tgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5712320  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  5712321 tcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 5712352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48609807 - 48609676
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  48609807 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattataca 48609708  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48609707 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 48609676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26579847 - 26579717
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26579847 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 26579748  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26579747 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35757149 - 35757020
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  35757149 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactca 35757051  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35757050 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37846146 - 37846016
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37846146 tgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 37846047  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37846046 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 10028541 - 10028676
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10028541 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 10028640  T
Q  101 tcattcttccatggg--taccttagttgtcaccaaa 134  Q
      |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  10028641 ctattcttccatgggtataccctagttgtcaccaaa 10028676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41990988 - 41990869
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |    
T  41990988 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactca 41990889  T
Q  101 tcattcttccatgggtacct 120  Q
     |||||||||||||||||||    
T  41990888 ccattcttccatgggtacct 41990869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29446891 - 29447020
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  29446891 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgactaatgtgtattggttggagt-aattaccca 29446989  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29446990 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31625757 - 31625886
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  31625757 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattacc-a 31625855  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31625856 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 45482711 - 45482841
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45482711 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattaccca 45482810  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45482811 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 19563500 - 19563633
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  19563500 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattaccca 19563599  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19563600 ccattcttccatgggtactctaattgtcaccaaa 19563633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31429605 - 31429474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  31429605 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactca 31429506  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31429505 tcattctttcatgggtaccctagttgtcacca 31429474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 43499538 - 43499669
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  43499538 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattaccca 43499637  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  43499638 ccattcttccatggataccctagttctcacca 43499669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33332842 - 33332971
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33332842 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 33332940  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33332941 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 130
Target Start/End: Original strand, 33870301 - 33870424
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33870301 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 33870400  T
Q  104 ttcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||   ||||||||  ||||||||||    
T  33870401 ttct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405531
Alignment:
Q  12 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcca 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  112 tgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||   |||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45063485 - 45063355
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |    
T  45063485 tgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatcca 45063388  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     ||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  45063387 ccattctttcattggtactctagttgtcaccaa 45063355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904388
Alignment:
Q  15 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  115 gtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||| | |||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 33720164 - 33720070
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720164 aaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 10618351 - 10618474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10618351 tgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 10618443  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10618444 ccattcttccatgggtaccctagttatcacc 10618474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 44564393 - 44564486
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 96  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44564393 aaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatta 44564486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35752153 - 35752034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35752153 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35752065  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  35752064 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 43489271 - 43489393
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43489271 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43489359  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  43489360 tcattctttcatgggtagtctagttgtcaccaaa 43489393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46898091 - 46898016
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46898091 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37127990 - 37128109
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  37127990 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 37128078  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  37128079 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36816964 - 36816844
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  36816964 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatcca 36816876  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  36816875 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 36816844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7876447 - 7876328
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7876447 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 7876359  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  7876358 tcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24923143 - 24923024
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24923143 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 24923055  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    || ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24923054 tccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45502905 - 45502817
Alignment:
Q  42 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45502905 gataccatttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46817540 - 46817421
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  46817540 tgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 46817452  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  46817451 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 46817421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 33393385 - 33393499
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||           || ||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
T  33393385 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccat 33393473  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33393474 tcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45237608 - 45237533
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  45237608 atgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26941651 - 26941546
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  26941651 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactca 26941563  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  26941562 tcattctttcatgggta 26941546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 48085911 - 48086016
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48085911 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 48085999  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  48086000 tcattctttcatgggta 48086016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26371102 - 26371222
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26371102 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactca 26371190  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  26371191 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 26371222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 21718170 - 21718288
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21718170 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 21718258  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  21718259 ttatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24228594 - 24228713
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  24228594 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatcca 24228682  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  24228683 tcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44003485 - 44003370
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  44003485 aatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 44003397  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  44003396 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 2332072 - 2332192
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |    
T  2332072 tgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatcca 2332160  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  2332161 ccatttttccatgggtacccaagttgtcacca 2332192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453484
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25037625 - 25037522
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  25037625 aaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatc 25037537  T
Q  103 attcttccatgggta 117  Q
    |||||| ||||||||    
T  25037536 attctttcatgggta 25037522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29610688 - 29610807
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  29610688 tgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactca 29610776  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610777 tcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 7257438 - 7257556
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||           ||||  ||||||||||||||||||||| | |||    
T  7257438 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccat 7257526  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7257527 ttttctatgggtaccctagttgtcaccaaa 7257556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 498307 - 498186
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  498307 tgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatcca 498219  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| ||||||    
T  498218 tcattctttcatggctagcctagttgccaccaa 498186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Original strand, 46103217 - 46103291
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  46103217 atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47460887 - 47460771
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  47460887 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccat 47460799  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||    
T  47460798 tttttcatgggtaccctagttgtcacca 47460771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37443717 - 37443602
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  37443717 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 37443629  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||  ||||||||| |||||||||||    
T  37443628 ttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323779
Alignment:
Q  63 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 41855159 - 41855214
Alignment:
Q  59 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  41855159 tgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatgg 41855214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272253
Alignment:
Q  66 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaa 140  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcaccaaaattaaa 42272253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Original strand, 29098847 - 29098920
Alignment:
Q  59 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||| || | ||||||| ||||    
T  29098847 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgttacca 29098920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32556681 - 32556640
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556681 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 26456162 - 26456218
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 57  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456162 tgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Original strand, 44659943 - 44660015
Alignment:
Q  59 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  44659943 tgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15644061 - 15644010
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  15644061 aatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaa 15644010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16482898 - 16482847
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16482898 aatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38448563 - 38448508
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 60  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  38448563 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgtg 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 35484690 - 35484795
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||  |    
T  35484690 tgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactca 35484778  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  35484779 tcattctttcatgggta 35484795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47906878 - 47906758
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aaattacct 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  47906878 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattaccc 47906790  T
Q  100 atcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||| || ||||| || | |||||| ||||    
T  47906789 atcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 39866718 - 39866758
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39866718 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 29098804 - 29098843
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat 40  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29098804 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 39453594 - 39453558
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 37  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39453594 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 117
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  73 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 44659896 - 44659936
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  44659896 tgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22341918 - 22341788
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22341918 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 22341819  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341818 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5882558 - 5882688
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5882558 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5882657  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5882658 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26377334 - 26377204
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26377334 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 26377235  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26377234 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 24168145 - 24168273
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24168145 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 24168244  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24168245 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18101625 - 18101494
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18101625 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 18101526  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18101525 tcattcttccatgggtatcctagttgtcacca 18101494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11989104 - 11988974
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11989104 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 11989005  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11989004 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14891509 - 14891383
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14891509 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 14891410  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
     |||||||||||||||||| |||||||    
T  14891409 ccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 8615292 - 8615425
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8615292 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 8615391  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8615392 ctattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 8615425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22551191 - 22551060
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22551191 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 22551092  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22551091 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 22551060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7393716 - 7393586
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7393716 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 7393617  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7393616 ccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19415663 - 19415533
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19415663 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 19415564  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19415563 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 34527992 - 34527862
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34527992 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34527893  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34527892 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 2892240 - 2892368
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2892240 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 2892339  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2892340 ccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7345242 - 7345114
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7345242 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 7345143  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7345142 ccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2593982 - 2593852
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  2593982 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatcca 2593883  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2593882 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 960031 - 959903
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  960031 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 959932  T
Q  104 ttcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  959931 ttctttcatgggtaccctagttgtcacca 959903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 16703418 - 16703534
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16703418 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgca 16703517  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  16703518 tcattcttccatgggta 16703534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 28947139 - 28947270
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28947139 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 28947238  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28947239 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 28947270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1970763 - 1970893
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1970763 tgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 1970862  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1970863 ccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10508034 - 10507908
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  10508034 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccat 10507935  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  10507934 tcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24224200 - 24224069
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24224200 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccta 24224101  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
      |||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  24224100 ctattctttcatgagtatcctagttgtcacca 24224069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33452702 - 33452571
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33452702 tgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 33452603  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33452602 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 33452571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 599944 - 600075
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | |    
T  599944 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatcca 600043  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  600044 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 600075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19281183 - 19281056
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19281183 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 19281084  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    |||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  19281083 attctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5294931 - 5294801
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||  |    
T  5294931 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactca 5294832  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5294831 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5299483 - 5299353
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||  |    
T  5299483 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactca 5299384  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5299383 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30743578 - 30743460
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30743578 tgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattaccta 30743479  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     ||||||| ||||| ||||    
T  30743478 ccattctttcatggatacc 30743460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23262059 - 23261929
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  23262059 tgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtattggttggggtaaattatcca 23261960  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     | ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23261959 ccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30467733 - 30467656
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30467733 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28948964 - 28948842
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||           || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28948964 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg-----------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 28948876  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28948875 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 28948842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 15965529 - 15965604
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  15965529 atgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 117
Target Start/End: Original strand, 13329472 - 13329538
Alignment:
Q  51 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13329472 taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 13329538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4487579 - 4487698
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4487579 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4487667  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  4487668 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913096
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Original strand, 3786845 - 3786922
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  3786845 atgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaa 3786922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661907
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 18661907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 7167638 - 7167753
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  7167638 aatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 7167726  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  7167727 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 1398649 - 1398724
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  1398649 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 131
Target Start/End: Original strand, 3291099 - 3291179
Alignment:
Q  51 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  3291099 taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  72 aatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 1939623 - 1939579
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1939623 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  72 aatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43262313 - 43262183
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43262313 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43262214  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43262213 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24253434 - 24253565
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24253434 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 24253533  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24253534 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 24253565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27501185 - 27501054
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27501185 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattaccca 27501086  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27501085 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 27501054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 7722101 - 7722231
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7722101 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattaccca 7722200  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7722201 ccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35626090 - 35626220
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35626090 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35626189  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35626190 ccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39932631 - 39932761
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39932631 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaa 39932730  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39932731 ccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43326509 - 43326379
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43326509 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43326410  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43326409 ccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15398612 - 15398483
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15398612 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 15398513  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15398512 ccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6901851 - 6901979
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6901851 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 6901950  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6901951 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27938949 - 27939080
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27938949 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27939048  T
Q  101 tcattcttccatggg-taccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27939049 ccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 739834 - 739704
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  739834 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattaccca 739735  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  739734 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 739704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3466811 - 3466681
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3466811 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 3466712  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3466711 ccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 12648849 - 12648979
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12648849 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 12648948  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12648949 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29789425 - 29789295
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  29789425 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattaccca 29789326  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29789325 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 31938949 - 31939082
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31938949 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31939048  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31939049 ccattcttccatgggtaccctaattgtcaccaaa 31939082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18479798 - 18479667
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18479798 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 18479699  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  18479698 ccattcttctatggataccctagtagtcacca 18479667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 34451302 - 34451433
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34451302 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 34451401  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34451402 ccattcttccatggataccctagttgtcacca 34451433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40886157 - 40886027
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40886157 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 40886059  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40886058 ccattcttccatgggtaccctagttttcacca 40886027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5185024 - 5185154
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  5185024 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactca 5185123  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5185124 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15683843 - 15683973
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15683843 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 15683942  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  15683943 ccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2484422 - 2484291
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2484422 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 2484323  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2484322 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 2484291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 25831573 - 25831702
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25831573 tgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25831671  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25831672 ccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28424916 - 28424795
Alignment:
Q  10 gcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28424916 gcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 28424817  T
Q  110 catgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| |||  |||||||||||    
T  28424816 catggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40278988 - 40278857
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |    
T  40278988 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattaccca 40278889  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  40278888 tcattcttccatgaataccctagttgtcacca 40278857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 890958 - 891087
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  890958 tgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccta 891056  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  891057 ccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27278607 - 27278474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatag----ttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27278607 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaatta 27278508  T
Q  97 cctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    || | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27278507 cccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13504872 - 13504741
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| | |    
T  13504872 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatcca 13504773  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13504772 ccattcttccatggataccctagttgtcacca 13504741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38756618 - 38756487
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |    
T  38756618 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattaccca 38756519  T
Q  101 tcattctt-ccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  38756518 caattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5137767 - 5137897
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | |    
T  5137767 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatcca 5137866  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||   |||| |||||||||||    
T  5137867 ccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 763777 - 763905
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  763777 aaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatc 763876  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||  |||| |||  |||||||||||    
T  763877 attctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 40110286 - 40110397
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||    
T  40110286 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatcta 40110384  T
Q  101 tcattcttccatg 113  Q
     ||||||||||||    
T  40110385 ccattcttccatg 40110397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 19295782 - 19295904
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19295782 tgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 19295870  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  19295871 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 19295904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 27503431 - 27503552
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27503431 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 27503519  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  27503520 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 27503552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Original strand, 4149774 - 4149847
Alignment:
Q  39 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  4149774 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33617637 - 33617756
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33617637 tgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 33617725  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33617726 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38015633 - 38015514
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38015633 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 38015545  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  38015544 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23195367 - 23195248
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  23195367 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccg 23195279  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23195278 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 5497369 - 5497444
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  5497369 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 42658781 - 42658676
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42658781 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42658693  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  42658692 tcattctttcatgggta 42658676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 3656687 - 3656567
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3656687 tgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 3656599  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  3656598 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 3656567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 13957722 - 13957841
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13957722 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 13957810  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13957811 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 40632551 - 40632634
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632551 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc---------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9424711 - 9424593
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||           || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9424711 tgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 9424623  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  9424622 tcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31294119 - 31293988
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||  | |||  |||||||||| |||||||||| |    
T  31294119 tgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattaccca 31294020  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31294019 ccattcttacatgggtaccctagttgtcacca 31293988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 38492665 - 38492767
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38492665 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 38492753  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
    |||||||| |||||    
T  38492754 tcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Original strand, 6206980 - 6207032
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6206980 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 6973115 - 6973234
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6973115 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattaccca 6973203  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  6973204 tcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9374621 - 9374502
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||           |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9374621 tgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 9374533  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  9374532 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14972030 - 14972152
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||           |||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| |    
T  14972030 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattaccca 14972118  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  14972119 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 14972152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18327288 - 18327172
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  18327288 aatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 18327200  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18327199 ttttccatgggtaccttagttatcacca 18327172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 27390653 - 27390768
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||  |||||||||||||||||| | | |||    
T  27390653 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccat 27390741  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27390742 tcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24167893 - 24167783
Alignment:
Q  11 caatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||  | |||| ||||    
T  24167893 caatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttcc 24167805  T
Q  111 atgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  24167804 atgggtaccctagttgtcacca 24167783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36365564 - 36365462
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  36365564 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagcca 36365476  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
    |||||||| |||||    
T  36365475 tcattctttcatgg 36365462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 612830 - 612757
Alignment:
Q  59 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-gtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  612830 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12558148 - 12558090
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 60  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12558148 tgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 36472399 - 36472348
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36472399 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33624014 - 33623940
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  33624014 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 36948607 - 36948492
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  36948607 tgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgg-tagggtaaattaccca 36948521  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  36948520 ccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 2585518 - 2585633
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  2585518 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 2585606  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | |||||||| |||| || ||||||||    
T  2585607 ttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 5120077 - 5120132
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 57  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120077 tgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38638025 - 38637910
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||           ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||    
T  38638025 aatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaat 38637937  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  38637936 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940336
Alignment:
Q  68 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcacc 3940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9171108 - 9171035
Alignment:
Q  57 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  9171108 tgtgcttatgtggttaatgtgtattgatt-gggtaaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 9171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 132
Target Start/End: Original strand, 21785995 - 21786033
Alignment:
Q  94 ttacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21785995 ttacctatcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 21786033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1402620 - 1402505
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||           ||||| |||| |||||||||||||||| | |||    
T  1402620 aatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccat 1402532  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  1402531 ttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 131
Target Start/End: Original strand, 40687010 - 40687069
Alignment:
Q  72 aatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  40687010 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42247849 - 42247791
Alignment:
Q  73 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  42247849 atgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacc 42247791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 612875 - 612831
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  612875 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata 612831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 42247901 - 42247865
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtt 37  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42247901 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 121)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31532265 - 31532134
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31532265 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 31532166  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31532165 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacca 31532134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34276599 - 34276729
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34276599 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34276698  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34276699 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 9798517 - 9798650
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9798517 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 9798616  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798617 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 9798650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21366739 - 21366606
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21366739 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 21366640  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366639 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 21366606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 44984813 - 44984945
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44984813 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 44984912  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44984913 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 44984945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42085259 - 42085389
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  42085259 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 42085358  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42085359 ccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 42085389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53461946 - 53461816
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53461946 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 53461847  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53461846 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32366790 - 32366661
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32366790 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 32366691  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32366690 ccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54575070 - 54574930
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54575070 tgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 54574971  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaat 141  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  54574970 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatagataaat 54574930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 23437644 - 23437775
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23437644 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 23437743  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23437744 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 23437775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26091388 - 26091257
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26091388 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 26091289  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26091288 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26091257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 237529 - 237659
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  237529 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 237628  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  237629 ccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31914250 - 31914379
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31914250 tgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31914348  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31914349 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39077597 - 39077727
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39077597 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39077696  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39077697 acattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42765971 - 42765842
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42765971 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42765873  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765872 ccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 45797531 - 45797661
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45797531 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccta 45797630  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45797631 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 45797661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48657870 - 48658000
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48657870 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatcca 48657969  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48657970 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 6019980 - 6020109
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6019980 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 6020079  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6020080 ccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 50534685 - 50534809
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  50534685 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 50534784  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50534785 attcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53854559 - 53854429
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  53854559 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 53854460  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  53854459 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 53854429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2826811 - 2826682
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2826811 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 2826712  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2826711 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19387818 - 19387688
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19387818 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 19387719  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19387718 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31972466 - 31972332
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  31972466 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 31972367  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaag 135  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  31972366 ccattctttcatgggtaccctaattgtcaccaaag 31972332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 41560382 - 41560512
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  41560382 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccacc 41560481  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41560482 attcttccatgggtaccctagctgtcaccaa 41560512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 54608014 - 54608148
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  54608014 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 54608113  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaag 135  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  54608114 tcattcttccatggataccctagtagtcaccaaag 54608148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 29478412 - 29478545
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  29478412 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattaccca 29478511  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29478512 ccattcttccataggtaccctagttgtcaccaaa 29478545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 397454 - 397582
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  397454 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 397553  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  397554 ccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 23609140 - 23609272
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  23609140 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcac 23609239  T
Q  102 cattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23609240 cattcttccatgggtaccctatttgtcaccaaa 23609272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41702589 - 41702461
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41702589 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41702490  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41702489 ccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18462143 - 18462012
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  18462143 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcaccca 18462044  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18462043 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 18462012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 51363059 - 51363189
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  51363059 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 51363158  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51363159 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcacca 51363189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 54086461 - 54086599
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  54086461 tgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattaccca 54086559  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaa 140  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54086560 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaatttaaa 54086599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 55519879 - 55520010
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  55519879 tgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 55519978  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  55519979 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacca 55520010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532830
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 41949436 - 41949569
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41949436 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41949535  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  41949536 ccattctttcataggtaccctagttgtcaccaaa 41949569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55056389 - 55056259
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55056389 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55056290  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  55056289 ccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Original strand, 6285361 - 6285486
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6285361 aaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 6285460  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6285461 attcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 27373128 - 27373241
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27373128 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27373227  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
     |||||||||||||    
T  27373228 ccattcttccatgg 27373241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 35446557 - 35446689
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  35446557 tgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 35446656  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35446657 ccattcttccatgggtaccctagttgttaccaa 35446689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 56023128 - 56022997
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  56023128 tgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatcca 56023029  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  56023028 tcattttttcatgggtaccctagttgtcacca 56022997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 146559 - 146429
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  146559 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattaccca 146460  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  146459 ccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43471825 - 43471695
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43471825 tgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43471726  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43471725 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 47344708 - 47344838
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  47344708 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattca 47344807  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47344808 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 55776097 - 55776226
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55776097 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55776195  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  55776196 ccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 55840275 - 55840404
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55840275 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55840373  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  55840374 ccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 3170680 - 3170808
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3170680 aaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 3170779  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3170780 attcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 50457940 - 50457812
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  50457940 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattataca 50457841  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50457840 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 407806 - 407935
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  407806 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatcca 407903  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  407904 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 407935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 42033229 - 42033360
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| | |    
T  42033229 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccacc 42033328  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033329 attcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 42033360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14017503 - 14017376
Alignment:
Q  2 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  14017503 gaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaag--tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgc 14017406  T
Q  102 cattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14017405 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22618642 - 22618514
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
T  22618642 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattaccca 22618545  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22618544 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 50234052 - 50234182
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50234052 tgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 50234151  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  50234152 ccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 52728436 - 52728307
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  52728436 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgaggtaaattaccca 52728337  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52728336 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 38591720 - 38591846
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38591720 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 38591815  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38591816 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 42222343 - 42222476
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  42222343 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacaca 42222442  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  42222443 ccattcttttatgggtaccctagttgtcaccaaa 42222476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2243510 - 2243640
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  2243510 tgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattaccca 2243609  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2243610 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3692340 - 3692210
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3692340 tgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 3692241  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3692240 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 29777387 - 29777257
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29777387 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 29777288  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29777287 ccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31070203 - 31070074
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31070203 tgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 31070105  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31070104 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47662232 - 47662102
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47662232 tgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47662133  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47662132 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 49881193 - 49881058
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg----taaatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  49881193 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaatta 49881094  T
Q  97 cctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    || | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49881093 cccaccattcttccatgggtactctagttgtcacca 49881058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 54425034 - 54425163
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  54425034 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattaccca 54425133  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  54425134 cgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 53834184 - 53834055
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||| |    
T  53834184 tgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattaccca 53834085  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  53834084 ccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41632136 - 41632006
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41632136 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 41632038  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41632037 tcattctttcatgggtatcctagttgtcacca 41632006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1932815 - 1932945
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |    
T  1932815 tgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatcca 1932914  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  1932915 tcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 50536754 - 50536628
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  50536754 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattaccca 50536655  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||    
T  50536654 ccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595870
Alignment:
Q  34 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacca 35595870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39587909 - 39587796
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  39587909 tgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattaccca 39587810  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
     |||||||||||||    
T  39587809 ccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48654866 - 48655002
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtgtattggttggggtaaat 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  48654866 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaat 48654965  T
Q  95 tacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  48654966 tacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22468900 - 22468788
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22468900 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 22468801  T
Q  101 tcattcttccatg 113  Q
     |||| |||||||    
T  22468800 ccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 48313609 - 48313738
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |    
T  48313609 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaa-tatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattaccca 48313706  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48313707 ccatttttccatgggtaccctagttgtcacca 48313738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509481
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatca 103  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | | ||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  104 ttcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcaccaaa 42509481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33897625 - 33897507
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||| |    
T  33897625 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattaccca 33897526  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     |||||||| || ||||||    
T  33897525 ccattcttctataggtacc 33897507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54805748 - 54805614
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54805748 tgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaatta 54805649  T
Q  97 cctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |  |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  54805648 ctcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 48259638 - 48259528
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |    
T  48259638 aaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccacc 48259540  T
Q  103 attcttccatgg 114  Q
    ||||||||||||    
T  48259539 attcttccatgg 48259528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 52396778 - 52396865
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396778 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 51951734 - 51951861
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  51951734 tgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattaccca 51951832  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  51951833 ccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9998006 - 9997930
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9998006 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 9997930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45633898 - 45633779
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45633898 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 45633810  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  45633809 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  29 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  129 ac 130  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  58 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15060408 - 15060286
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15060408 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattaccca 15060320  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  15060319 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 15060286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 43891024 - 43891099
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43891024 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37239209 - 37239090
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  37239209 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 37239121  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  37239120 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22620645 - 22620767
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22620645 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 22620733  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||| |||||||    
T  22620734 tcattcttttatgggtagcctagttgccaccaaa 22620767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Original strand, 34552415 - 34552493
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  34552415 atgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 34552493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 52461417 - 52461534
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52461417 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 52461505  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  52461506 attctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5117557 - 5117461
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5117557 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5117469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 131
Target Start/End: Original strand, 52688448 - 52688520
Alignment:
Q  59 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  52688448 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 54715087 - 54715206
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  54715087 tgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattaccca 54715175  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  54715176 ccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20351917 - 20351842
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  20351917 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 117
Target Start/End: Original strand, 33289801 - 33289860
Alignment:
Q  58 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33289801 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 33289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Original strand, 47812002 - 47812077
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  47812002 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 54216365 - 54216487
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  54216365 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcga 54216453  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||    
T  54216454 tcattctttcatgggtaacctagttgtcatcaaa 54216487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4486700 - 4486604
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4486700 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4486612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  54 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27873623 - 27873571
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27873623 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31881433 - 31881314
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  31881433 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattca 31881345  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  31881344 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38547716 - 38547601
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  38547716 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 38547628  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  38547627 ttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  26 gtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagtt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46708860 - 46708741
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  46708860 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcaccca 46708772  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||| | || | |||||||||||    
T  46708771 tcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 27872635 - 27872753
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  27872635 aatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 27872723  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27872724 ttttccatgggtaccgtagttgtcaccaaa 27872753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 49014150 - 49014270
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |    
T  49014150 tgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactca 49014238  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  49014239 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 49014270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981493
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcattggta 51981493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 27580175 - 27580290
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  27580175 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccatcat 27580263  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  27580264 ttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 34835233 - 34835348
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  34835233 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 34835321  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  34835322 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27398718 - 27398664
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 59  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27398718 aatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 54216855 - 54216735
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||      
T  54216855 tgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccct 54216767  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  54216766 ccattcttccatggataccctagttatcacca 54216735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  63 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 46720081 - 46720195
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||       |||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  46720081 aatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccat 46720172  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  46720173 ttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 1662374 - 1662323
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1662374 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 14335220 - 14335165
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14335220 tgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33558011 - 33557960
Alignment:
Q  62 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33558011 ttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 573859 - 573975
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  573859 aatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactat 573947  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  573948 ttttccatgagtacactagttgtcacca 573975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 43231556 - 43231601
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43231556 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662261
Alignment:
Q  79 attggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18206553 - 18206510
Alignment:
Q  90 taaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18206553 taaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtcaccaa 18206510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3293142 - 3293102
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3293142 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6371364 - 6371249
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  6371364 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 6371276  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | || ||| |||||| |||||||||||    
T  6371275 tttttcataggtaccctagttgtcacc 6371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 18206641 - 18206583
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 55  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206641 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 11972248 - 11972208
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11972248 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 3611188 - 3611319
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3611188 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 3611287  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3611288 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 3611319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25678389 - 25678258
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25678389 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25678290  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25678289 ccattcttccatgggtaccatagttgtcacca 25678258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 45538205 - 45538336
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45538205 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 45538304  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45538305 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 45538336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31308053 - 31308183
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31308053 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31308152  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31308153 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 47671638 - 47671770
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47671638 tgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47671737  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47671738 tcattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 47671770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21139542 - 21139411
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21139542 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 21139443  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21139442 ccattcttccataggtaccctagttgtcacca 21139411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 36566382 - 36566513
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36566382 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattaccca 36566481  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36566482 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 36566513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44662022 - 44662152
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44662022 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 44662121  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44662122 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4068813 - 4068689
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4068813 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4068714  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagtt 125  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  4068713 ccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 43251763 - 43251891
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43251763 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43251862  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43251863 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26085528 - 26085397
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26085528 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 26085429  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26085428 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26085397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 47317367 - 47317498
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47317367 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 47317466  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47317467 tcattcttctatgggtaccctagttgtcacca 47317498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17995081 - 17994951
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17995081 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17994982  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17994981 ccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 5981224 - 5981352
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |    
T  5981224 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccacc 5981323  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5981324 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 23984809 - 23984937
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  23984809 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccacc 23984908  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23984909 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 23984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 25058740 - 25058872
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25058740 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 25058839  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25058840 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 25058872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 35273648 - 35273779
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |    
T  35273648 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacaca 35273747  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35273748 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 35273779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 31040761 - 31040891
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31040761 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 31040860  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31040861 ccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37620322 - 37620192
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37620322 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37620223  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37620222 ccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38790327 - 38790197
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38790327 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 38790228  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38790227 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24245155 - 24245022
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  24245155 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatcca 24245056  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24245055 ccattcttccatgggtaccctagttatcaccaaa 24245022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46967171 - 46967038
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |    
T  46967171 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattaccca 46967072  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46967071 tcattctttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 46967038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 2450546 - 2450678
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450546 tgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 2450645  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2450646 tcattcttccatgggtatcctagttgtcaccaa 2450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 26277229 - 26277360
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26277229 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 26277328  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26277329 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 26277360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6327677 - 6327548
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6327677 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 6327579  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6327578 ctattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23932639 - 23932509
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |    
T  23932639 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattaccca 23932540  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23932539 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 26794356 - 26794482
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  26794356 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 26794455  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
     |||||||||||||||||| |||||||    
T  26794456 ccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33112947 - 33112818
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33112947 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33112848  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  33112847 ccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39646620 - 39646750
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  39646620 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatcca 39646719  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39646720 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41999867 - 41999997
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41999867 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41999966  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41999967 ccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33884140 - 33884270
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33884140 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33884239  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  33884240 ccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33960112 - 33959982
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33960112 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33960013  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  33960012 ccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 47187157 - 47187287
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  47187157 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatcca 47187256  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47187257 ccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 47383860 - 47383730
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  47383860 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccacc 47383761  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  47383760 attctttcattggtaccctagttgtcaccaa 47383730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 50774269 - 50774399
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50774269 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattaccca 50774368  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50774369 cctttcttccatgggtaccctagttgtcacc 50774399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 46784475 - 46784608
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  46784475 tgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattaccca 46784574  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46784575 tcattcttccatgggtaccctaattgtcaccaaa 46784608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 51057123 - 51057255
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  51057123 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatcca 51057222  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51057223 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 51057255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35692793 - 35692663
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35692793 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 35692694  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     | ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  35692693 ccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38331989 - 38331859
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38331989 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 38331890  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38331889 ccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 49254105 - 49253987
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  49254105 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 49254006  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  49254005 ccattcttccatggatacc 49253987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 3285454 - 3285582
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  3285454 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 3285552  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||    
T  3285553 ccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 31844428 - 31844525
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844428 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 31844525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 42863917 - 42864034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  42863917 tgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 42864016  T
Q  101 tcattcttccatgggtac 118  Q
     |||||||||||| ||||    
T  42864017 ccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 49399118 - 49398986
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49399118 tgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattaccca 49399019  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49399018 ctattcttccatgggtatcctagttgtcaccaa 49398986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5980120 - 5980250
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5980120 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 5980219  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  5980220 ccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24885553 - 24885683
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24885553 tgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattaccca 24885652  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24885653 ccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26525019 - 26524889
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26525019 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 26524920  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26524919 ctattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42313491 - 42313361
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42313491 tgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42313392  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42313391 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 46616601 - 46616731
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  46616601 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 46616700  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  46616701 ccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23221059 - 23220934
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || | |    
T  23221059 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatcca 23220966  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23220965 ccattcttccatgggtaccctagttgtgacca 23220934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 36003182 - 36003315
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  36003182 tgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattaccca 36003281  T
Q  101 tcattcttc---catgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||   ||| |||||| |||||||||||    
T  36003282 ccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51045726 - 51045595
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  51045726 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 51045627  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  51045626 ccattcttctacgggtatcctagttgtcacca 51045595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28888633 - 28888760
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | |    
T  28888633 tgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatcca 28888732  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28888733 ccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 25518866 - 25518952
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518866 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4156439 - 4156576
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156439 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 4156538  T
Q  94 ttacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  4156539 ttacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 45475972 - 45475866
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45475972 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattaccca 45475874  T
Q  101 tcattctt 108  Q
     |||||||    
T  45475873 ccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 48373556 - 48373677
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48373556 tgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattaccca 48373646  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48373647 ccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27983693 - 27983600
Alignment:
Q  41 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27983693 ggataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 27983600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312529
Alignment:
Q  38 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccaa 13312529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47772302 - 47772172
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  47772302 tgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattacaca 47772203  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47772202 ccattcttccatgggtaccttaattgtcacc 47772172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41467751 - 41467631
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41467751 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41467663  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  41467662 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 41467631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2657355 - 2657474
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2657355 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 2657443  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  2657444 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33073263 - 33073382
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33073263 tgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 33073351  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33073352 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6626143 - 6626025
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6626143 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 6626055  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  6626054 tcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41895239 - 41895161
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  41895239 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 41895161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 10928119 - 10928238
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10928119 tgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 10928207  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  10928208 ccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 29770722 - 29770841
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29770722 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 29770810  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| || |||||||| | |||||| ||||    
T  29770811 tcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 51403137 - 51403074
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51403137 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttat 51403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2556976 - 2556909
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2556976 tgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 30290029 - 30289909
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||           ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  30290029 tgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatcca 30289941  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30289940 ccattcttccatgagtaccttagttgtcacca 30289909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 2954911 - 2955026
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||           | ||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  2954911 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccat 2954999  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  2955000 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 31980065 - 31979998
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 68  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31980065 tgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26472298 - 26472193
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  26472298 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactca 26472210  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  26472209 tcattctttcatgggta 26472193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34752389 - 34752328
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34752389 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggta 34752328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4953104 - 4953223
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4953104 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4953192  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||||| || | || ||||||||    
T  4953193 tcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5961382 - 5961267
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5961382 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcat 5961294  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5961293 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7561591 - 7561527
Alignment:
Q  68 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7561591 ggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacca 7561527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42234892 - 42235010
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  42234892 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatcca 42234979  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  42234980 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4243565 - 4243490
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||   |||||||||||    
T  4243565 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Original strand, 10920262 - 10920372
Alignment:
Q  11 caatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  10920262 caatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttcc 10920350  T
Q  111 atgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10920351 atggataccttagttgtcacca 10920372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35991718 - 35991616
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35991718 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagcta 35991630  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
    |||||||| |||||    
T  35991629 tcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 1388530 - 1388645
Alignment:
Q  6 atgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcatt 105  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  1388530 atgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatt 1388618  T
Q  106 cttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1388619 tttccatgggtaccctagttgtcacca 1388645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 26685912 - 26686027
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||    
T  26685912 aatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccat 26686000  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  26686001 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 132
Target Start/End: Original strand, 33187450 - 33187506
Alignment:
Q  76 tgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33187450 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 33187506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38716362 - 38716247
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  38716362 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 38716274  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  38716273 ttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 32448754 - 32448813
Alignment:
Q  75 gtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  32448754 gtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcgccaaa 32448813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39475897 - 39475780
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||           || || ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  39475897 aatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggataccacctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcat 39475810  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  39475809 tttttcatgggtaccctagttgtcaccaaa 39475780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51155664 - 51155590
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51155664 atgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcacc 51155590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 24215865 - 24215911
Alignment:
Q  62 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24215865 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 39637950 - 39637996
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttc-atggatacca 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39637950 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacca 39637996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13281637 - 13281588
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  13281637 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  12 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  112 tgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718166
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-gtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacca 38718166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 13313293 - 13313249
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13313293 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 33187392 - 33187448
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 57  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33187392 tgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaat 33187448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48683445 - 48683330
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||           ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  48683445 aatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccat 48683357  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  48683356 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27924773 - 27924722
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27924773 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 52367939 - 52367990
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52367939 aatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 32448700 - 32448740
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32448700 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44293574 - 44293455
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |    
T  44293574 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtacttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactca 44293486  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  44293485 tcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 44544165 - 44544125
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44544165 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Original strand, 52324058 - 52324113
Alignment:
Q  79 attggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52324058 attgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 52324113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 98
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359530
Alignment:
Q  70 ctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacc 39359530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 46428372 - 46428332
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46428372 tgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39686 - 39556
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39686 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39587  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39586 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32984207 - 32984077
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32984207 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 32984108  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32984107 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24080031 - 24079899
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24080031 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 24079932  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24079931 ccattctttcatgggtaccctagttgtcaccaa 24079899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 10646175 - 10646306
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10646175 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 10646274  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10646275 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 10646306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9303704 - 9303574
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9303704 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattaccca 9303605  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9303604 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033112
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13356250 - 13356120
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13356250 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 13356151  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13356150 tcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31831085 - 31830959
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31831085 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattaccta 31830986  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
     |||||||||||||||||| |||||||    
T  31830985 ccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33981793 - 33981663
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33981793 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 33981694  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33981693 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40435283 - 40435153
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40435283 tgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40435184  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40435183 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33730766 - 33730641
Alignment:
Q  6 atgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33730766 atgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 33730667  T
Q  106 cttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||    
T  33730666 cttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37956473 - 37956603
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37956473 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37956572  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  37956573 ccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 43328759 - 43328889
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  43328759 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 43328858  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43328859 ccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 2714601 - 2714732
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2714601 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 2714700  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2714701 ccattcttccat-ggtactttagttgtcaccaa 2714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 5946099 - 5946229
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  5946099 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 5946198  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  5946199 ccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 9734307 - 9734435
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9734307 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattaccca 9734404  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9734405 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41862272 - 41862402
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  41862272 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 41862371  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  41862372 ccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981651
Alignment:
Q  15 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  115 gtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||| ||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacca 41981651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 3904129 - 3904260
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  3904129 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattaccca 3904227  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3904228 ccattcttccatgggtaccctagttatcaccaa 3904260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 25248087 - 25248215
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25248087 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatc 25248186  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25248187 attcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41653947 - 41654078
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41653947 tgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 41654046  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41654047 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 41654078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 6366038 - 6366168
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6366038 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 6366137  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  6366138 ccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17718852 - 17718722
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17718852 tgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 17718753  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17718752 ccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 25185951 - 25186069
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25185951 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25186050  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  25186051 ccattcttccataggtacc 25186069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45236695 - 45236565
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  45236695 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 45236596  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  45236595 ccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37301455 - 37301326
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37301455 tgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 37301356  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37301355 ccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 9013738 - 9013865
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  9013738 aaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccacc 9013836  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9013837 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 32114301 - 32114429
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32114301 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 32114400  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||    
T  32114401 ccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29048533 - 29048426
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29048533 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 29048434  T
Q  101 tcattctt 108  Q
     |||||||    
T  29048433 ccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37419992 - 37420123
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  37419992 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattaccca 37420091  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37420092 ccattcttccataggtaccctagttgtcacca 37420123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 44088571 - 44088460
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44088571 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 44088472  T
Q  103 attcttccatgg 114  Q
    ||||||||||||    
T  44088471 attcttccatgg 44088460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2275965 - 2276094
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  2275965 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattaccca 2276063  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  2276064 tcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 35628829 - 35628959
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35628829 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattaccca 35628928  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  35628929 ccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41231998 - 41232128
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41231998 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41232097  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  41232098 ctattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45066722 - 45066604
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| |    
T  45066722 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattaccca 45066623  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45066622 tcattcttccatgggtacc 45066604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13760778 - 13760646
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13760778 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 13760679  T
Q  101 tcattcttccatgg--gtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13760678 ccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22878443 - 22878572
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22878443 tgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 22878542  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
      ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22878543 caattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  18 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  118 ccttagttgtcacc 131  Q
    || |||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 45258565 - 45258675
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatca 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45258565 aaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 45258664  T
Q  104 ttcttccatgg 114  Q
    |||||||||||    
T  45258665 ttcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 41639966 - 41640095
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  41639966 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattaccca 41640065  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41640066 ccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42701418 - 42701299
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacct 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  42701418 aaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatcc 42701321  T
Q  100 atcattcttccatgggtacctt 121  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  42701320 accatccttccatgggtacctt 42701299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 41843305 - 41843425
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41843305 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 41843393  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  41843394 tcattctttcatgggtagcttagttatcacca 41843425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4447414 - 4447295
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4447414 tgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 4447326  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4447325 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 9713738 - 9713858
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9713738 tgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 9713826  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  9713827 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 9713858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3211257 - 3211376
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  3211257 tgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattaccca 3211345  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3211346 ccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 117448 - 117326
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  117448 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattca 117360  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  117359 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 117326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 31940367 - 31940486
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31940367 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattaccca 31940454  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  31940455 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 31940486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Original strand, 2379236 - 2379312
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  2379236 atgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacca 2379312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 10378361 - 10378480
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  10378361 tgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattaccca 10378449  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10378450 ccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 41981485 - 41981535
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981485 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39915940 - 39915887
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39915940 aaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40649906 - 40649845
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  40649906 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggta 40649845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4975524 - 4975412
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  4975524 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatc 4975436  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttg 126  Q
    |||||| |||||||| | ||||||    
T  4975435 attctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 40458891 - 40458771
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  40458891 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattaccca 40458803  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  40458802 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 40458771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 32373845 - 32373744
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32373845 tgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaattacc-a 32373758  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
     |||||||||||||    
T  32373757 ccattcttccatgg 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 9509475 - 9509400
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  9509475 atgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 132
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901740
Alignment:
Q  66 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacca 39901740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33622541 - 33622465
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||||||||    
T  33622541 atgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcaccaa 33622465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425427
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||| ||||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccaccaa 41425427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33896958 - 33896843
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||           ||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  33896958 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccat 33896870  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | || |||||||||| |||||||||||    
T  33896869 tttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 31149009 - 31148953
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatg 58  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31149009 tgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccacttaaaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3490514 - 3490399
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||           ||||| |||||||||||||||| |||| | |||    
T  3490514 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccat 3490426  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | || ||| |||||| |||||||||||    
T  3490425 tttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26196426 - 26196317
Alignment:
Q  11 caatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttcc 110  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  26196426 caatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttcc 26196338  T
Q  111 atgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||  || | |||||||||||    
T  26196337 atgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 27243258 - 27243218
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27243258 tgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 27254833 - 27254793
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  27254833 tgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 38631704 - 38631744
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38631704 tgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg 38631744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 17600887 - 17601017
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17600887 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17600986  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17600987 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 746517 - 746650
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  746517 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 746616  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  746617 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 746650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23901830 - 23901963
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23901830 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 23901929  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901930 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 23901963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 45371041 - 45371172
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45371041 tgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 45371140  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45371141 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 45371172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27651164 - 27651034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27651164 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 27651065  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27651064 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 40635269 - 40635399
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40635269 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40635368  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40635369 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 26710396 - 26710531
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26710396 tgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattaccca 26710495  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagt 136  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26710496 ccattctttcatgggtaccctagttgtcaccaaagt 26710531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4034643 - 4034773
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4034643 tgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 4034742  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4034743 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6594588 - 6594458
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6594588 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 6594489  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6594488 ccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11185023 - 11185153
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11185023 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 11185122  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11185123 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 14660497 - 14660627
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14660497 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattaccca 14660596  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14660597 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34518418 - 34518548
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34518418 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34518517  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34518518 ctattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 38997152 - 38997282
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38997152 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattaccca 38997251  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38997252 ccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 6430524 - 6430648
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6430524 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 6430623  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagtt 125  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  6430624 ccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13815348 - 13815217
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13815348 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 13815249  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13815248 cctttctttcatgggtaccctagttgtcacca 13815217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 27400454 - 27400585
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27400454 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27400553  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27400554 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacca 27400585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 32327412 - 32327543
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  32327412 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatcca 32327511  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32327512 tcattcttccataggtaccctagttgtcacca 32327543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1092081 - 1091951
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1092081 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattaccca 1091982  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1091981 ccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2325019 - 2324889
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2325019 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 2324920  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  2324919 ccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10244712 - 10244582
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10244712 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattaccca 10244613  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10244612 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 4609677 - 4609809
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  4609677 tgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 4609776  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4609777 acattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 4609809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 10424646 - 10424773
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  10424646 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattaccca 10424745  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10424746 ccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27024466 - 27024596
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27024466 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27024565  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27024566 ttattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33427777 - 33427647
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33427777 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacaca 33427678  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  33427677 ccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37255467 - 37255337
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37255467 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattaccca 37255368  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37255367 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 5726180 - 5726311
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5726180 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 5726279  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5726280 ccattcttccatggataccctagttgtcacca 5726311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 9444741 - 9444874
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac--- 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  9444741 tgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 9444840  T
Q  98 ctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9444841 ccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14697667 - 14697536
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14697667 tgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattaccca 14697568  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14697567 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacca 14697536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 32948497 - 32948627
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32948497 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 32948595  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32948596 tcattcttctatgggtactctagttgtcacca 32948627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 11159672 - 11159802
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  11159672 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattaccca 11159771  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11159772 ccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2914268 - 2914137
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  2914268 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattaccca 2914169  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  2914168 ccattcttccatggatatcctagttgtcacca 2914137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 40735515 - 40735646
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  40735515 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 40735614  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  40735615 tcattcttccatgagtaccctaattgtcacca 40735646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7892818 - 7892688
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7892818 tgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattaccca 7892719  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7892718 ccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32856566 - 32856436
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  32856566 tgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattaccca 32856467  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32856466 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 40037194 - 40037323
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40037194 tgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 40037293  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  40037294 tcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37621000 - 37620865
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggt---caagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||     
T  37621000 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattat 37620901  T
Q  98 ctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37620900 ccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccaa 37620865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 32608431 - 32608527
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608431 tgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 32608527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447632
Alignment:
Q  24 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttag 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  124 ttgtcacca 132  Q
    |||||||||    
T  447640 ttgtcacca 447632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 1229678 - 1229793
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| |    
T  1229678 tgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattaccca 1229777  T
Q  101 tcattcttccatgggt 116  Q
     |||||||||||||||    
T  1229778 ccattcttccatgggt 1229793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8433046 - 8432949
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8433046 tgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 8432949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 15925131 - 15925255
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  15925131 tgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatcca 15925230  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagtt 125  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||    
T  15925231 tcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 12842154 - 12842250
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842154 tgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 12842250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  21 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 41172509 - 41172605
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172509 tgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 42899966 - 42900039
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42899966 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827243
Alignment:
Q  24 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttag 123  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||| |  |||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctctag 12827235  T
Q  124 ttgtcacc 131  Q
    ||||||||    
T  12827236 ttgtcacc 12827243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35158169 - 35158048
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35158169 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 35158081  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  35158080 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaa 35158048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 130
Target Start/End: Original strand, 39103142 - 39103216
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39103142 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19428545 - 19428423
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19428545 tgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 19428457  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  19428456 tcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaa 19428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 29687092 - 29687214
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  29687092 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattaccca 29687180  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  29687181 tcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 29687214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 145333 - 145450
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  145333 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 145421  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  145422 tcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 3711684 - 3711803
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3711684 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 3711772  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  3711773 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13543743 - 13543624
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13543743 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 13543655  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  13543654 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28641411 - 28641289
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28641411 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 28641323  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    | |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  28641322 ttattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 28641289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 132
Target Start/End: Original strand, 4258584 - 4258660
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  4258584 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacca 4258660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21735019 - 21734900
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21735019 tgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattaccca 21734931  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21734930 ccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2688804 - 2688729
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  2688804 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 43899089 - 43898970
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43899089 tgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattaccca 43899002  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  43899001 tcattctttcatgggtagcctagttgccacca 43898970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 27331349 - 27331472
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||        | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |    
T  27331349 tgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat-------atatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatcca 27331441  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  27331442 tcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 34249316 - 34249435
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||           |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  34249316 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 34249404  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  34249405 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12333614 - 12333494
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12333614 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattaccca 12333527  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  12333526 tcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccaaa 12333494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 43356147 - 43356267
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |    
T  43356147 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattaccca 43356235  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  43356236 tgattctttcatggttagcctagttgtcacca 43356267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 12730112 - 12730231
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  12730112 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattaccca 12730200  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  12730201 tcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27764981 - 27764863
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  27764981 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaacca 27764893  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||| ||||    
T  27764892 tca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39301316 - 39301197
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  39301316 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatcca 39301228  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||    
T  39301227 tcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 44481883 - 44481998
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           || || ||||||||||||||||||||| | |||    
T  44481883 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccat 44481971  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  44481972 ttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28566817 - 28566703
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  28566817 tgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactca 28566729  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttg 126  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||    
T  28566728 tcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 35126835 - 35126886
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35126835 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 35126886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 3266399 - 3266455
Alignment:
Q  73 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  3266399 atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 114
Target Start/End: Original strand, 8056725 - 8056779
Alignment:
Q  60 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||    
T  8056725 gcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40544143 - 40544083
Alignment:
Q  73 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  40544143 atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccaa 40544083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 40544195 - 40544155
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40544195 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Original strand, 30545874 - 30545917
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 46  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30545874 aaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatac 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  32 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 81  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2000417 - 2000339
Alignment:
Q  51 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  2000417 taaatatgtgcttacgtggctcatatgtattg-ttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 3266347 - 3266387
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg 41  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  3266347 tgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 12814665 - 12814693
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814665 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11263 - 11130
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11263 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 11164  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11163 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 11130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 105)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 49330091 - 49330219
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49330091 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatc 49330190  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49330191 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38416854 - 38416724
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38416854 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 38416755  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38416754 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 47257845 - 47257975
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47257845 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 47257944  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47257945 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 51170163 - 51170034
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  51170163 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 51170064  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170063 ccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35748441 - 35748311
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35748441 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 35748342  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35748341 tcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43612177 - 43612047
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43612177 tgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43612078  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43612077 tcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 41464404 - 41464537
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41464404 tgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 41464503  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41464504 gcattcttccatgggtactctagttgtcaccaaa 41464537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 48609775 - 48609903
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48609775 tgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 48609874  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48609875 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28048522 - 28048391
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |    
T  28048522 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattaccca 28048423  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28048422 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 28048391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 40643852 - 40643983
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40643852 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40643951  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40643952 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 40643983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47809727 - 47809596
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattacct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  47809727 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattaccc 47809628  T
Q  100 atcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809627 accattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47809596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7855244 - 7855114
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  7855244 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattaccca 7855145  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7855144 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27067108 - 27066978
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27067108 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 27067009  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27067008 tcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40131089 - 40130959
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40131089 tgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 40130990  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40130989 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 40419887 - 40420017
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  40419887 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactca 40419986  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40419987 ccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 46126039 - 46126168
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46126039 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 46126138  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46126139 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48739363 - 48739233
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48739363 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 48739264  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48739263 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44222881 - 44223014
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44222881 tgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 44222980  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44222981 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 44223014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 55453374 - 55453245
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  55453374 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 55453275  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  55453274 ccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22399149 - 22399279
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22399149 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccacttaaaa-tgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 22399247  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22399248 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 22399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 24100335 - 24100465
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24100335 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 24100433  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24100434 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacca 24100465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39634701 - 39634572
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39634701 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39634603  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39634602 caattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 52629006 - 52629138
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52629006 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatcca 52629105  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  52629106 ccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccaaa 52629138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 41732580 - 41732712
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41732580 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 41732679  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
     ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  41732680 ccatccttccatggataccccagttgtcaccaa 41732712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 29625957 - 29625839
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29625957 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 29625858  T
Q  101 tcattcttccatgggtacc 119  Q
     |||||||| |||||||||    
T  29625857 ccattcttctatgggtacc 29625839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 32234527 - 32234398
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32234527 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa-tatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 32234429  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32234428 ctattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 37324593 - 37324723
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37324593 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 37324692  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37324693 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42291894 - 42292024
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42291894 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42291993  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42291994 ccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 37313451 - 37313584
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37313451 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37313550  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
     |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37313551 ccattcttccatgggtactctaggtgtcaccaaa 37313584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 46134408 - 46134549
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  46134408 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattca 46134507  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagttaaata 142  Q
     ||||||| ||||| |||| || ||||||||| | |||||||    
T  46134508 ccattctttcatggataccctaattgtcaccatatttaaata 46134549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 2666052 - 2666182
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  2666052 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattaccca 2666151  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2666152 ctattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7755436 - 7755307
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  7755436 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataaccca 7755338  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7755337 tcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40804640 - 40804510
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  40804640 tgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattaccca 40804541  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40804540 ccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 43125883 - 43126012
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43125883 tgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 43125982  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||  || |||||| |||||||||||    
T  43125983 ccattcttttataggtacc-tagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51102508 - 51102378
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51102508 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 51102409  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  51102408 ccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51452880 - 51452751
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51452880 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 51452781  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  51452780 tcattcttccat-ggtaccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 52215128 - 52215258
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  52215128 tgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 52215227  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  52215228 ccattcttctatgggtgccttaattatcacc 52215258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 35594175 - 35594299
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |    
T  35594175 aaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccacc 35594274  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgt 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  35594275 attcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 43183964 - 43184092
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  43183964 tgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactca 43184063  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43184064 ccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 51146345 - 51146214
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  51146345 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 51146246  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  51146245 ccattctttcatgggtaccctagttgccacca 51146214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 39053446 - 39053576
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  39053446 tgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattaccca 39053545  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||| ||  |||| |||  |||||||||||    
T  39053546 tcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 52638894 - 52639024
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  52638894 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 52638993  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  52638994 ccattattctatgggtaccctagttgtcacc 52639024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 53943717 - 53943588
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53943717 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 53943618  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53943617 ccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Original strand, 36368993 - 36369105
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |    
T  36368993 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacc 36369092  T
Q  103 attcttccatgggt 116  Q
    | ||||||||||||    
T  36369093 a-tcttccatgggt 36369105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 47894950 - 47894822
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | | |    
T  47894950 tgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatcca 47894851  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47894850 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18946955 - 18947085
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  18946955 tgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattaccca 18947054  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18947055 ccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20754523 - 20754393
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20754523 tgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattaccca 20754424  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  20754423 ccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 43021766 - 43021896
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtgggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacct 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43021766 tgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattaccc 43021865  T
Q  100 atcattcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  43021866 accattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 44806736 - 44806866
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |    
T  44806736 tgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatcca 44806835  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44806836 caattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24376625 - 24376722
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24376625 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacc 24376722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  16 tgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatggg 115  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  116 taccttagttgtcacc 131  Q
    |||| |||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5560154 - 5560025
Alignment:
Q  4 aaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttggggtaaattacctat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| | |     
T  5560154 aaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccac 5560055  T
Q  102 cattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5560054 cattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41216507 - 41216637
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  41216507 tgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattaccca 41216606  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41216607 ctattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41293448 - 41293319
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41293448 tgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattaccca 41293350  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41293349 ccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864671
Alignment:
Q  9 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  109 ccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 53832614 - 53832486
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  53832614 tgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatcca 53832515  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||| || || |||||||||    
T  53832514 ccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 53637893 - 53637991
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacct 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53637893 tgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacct 53637991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 46949426 - 46949538
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  46949426 tgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattaccca 46949524  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
     |||||||||||||    
T  46949525 ccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 37758981 - 37759075
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758981 tgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 47182052 - 47182131
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182052 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 25641698 - 25641817
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25641698 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25641786  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  25641787 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42589882 - 42590001
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42589882 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 42589970  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  42589971 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 51416021 - 51416140
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  51416021 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 51416109  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  51416110 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 54159118 - 54159000
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  54159118 tgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactca 54159029  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54159028 ccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55000297 - 55000178
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55000297 tgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 55000209  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  55000208 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 55000178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38156707 - 38156632
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  38156707 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 54401239 - 54401344
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54401239 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 54401327  T
Q  101 tcattcttccatgggta 117  Q
    |||||||| ||||||||    
T  54401328 tcattctttcatgggta 54401344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34279840 - 34279720
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34279840 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34279752  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| |||||    
T  34279751 tcattctttcatggatagcctagttgccacca 34279720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 48546959 - 48546842
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  48546959 tgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgctta---------tgtgtattgattggggtaaattatcca 48546871  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48546870 ccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 128
Target Start/End: Original strand, 49130674 - 49130746
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49130674 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54707339 - 54707220
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54707339 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 54707251  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  54707250 tcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 37028775 - 37028897
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37028775 tgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 37028863  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  37028864 tcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaa 37028897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39141245 - 39141141
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  39141245 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat---------atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattaccca 39141155  T
Q  101 tcattcttccatgg 114  Q
    |||||||| |||||    
T  39141154 tcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 47511059 - 47510939
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  47511059 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactca 47510971  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  47510970 tcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 47510939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 55380041 - 55380157
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  55380041 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 55380129  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  55380130 ttttccatgggtaccctagttgtcacca 55380157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534007
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcat 48534034  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||    
T  48534033 tctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31286910 - 31286793
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  31286910 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatc 31286822  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  31286821 attctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 40022128 - 40022240
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  40022128 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatc 40022216  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttg 126  Q
    |||||| |||||||| | ||||||    
T  40022217 attctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 25353614 - 25353725
Alignment:
Q  9 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattctt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25353614 agcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattctt 25353702  T
Q  109 ccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  25353703 ccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 41635919 - 41635800
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  41635919 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattaccca 41635831  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  41635830 tcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 53115503 - 53115618
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  53115503 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccat 53115591  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||    
T  53115592 ttttccataggtaccctagttgtcacc 53115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 45058935 - 45059052
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  45058935 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattaccca 45059023  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtca 129  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  45059024 tcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 24688166 - 24688285
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||           |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  24688166 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatcca 24688254  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  24688255 tcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30251616 - 30251501
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||| | |||    
T  30251616 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccat 30251528  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    
T  30251527 tcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52756190 - 52756066
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat----gtgtattggttggggtaaatta 96  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||           ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  52756190 tgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaattaatgtgtattggtttgggtaaatta 52756102  T
Q  97 cctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  52756101 cccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacca 52756066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17665643 - 17665549
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17665643 tgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17665555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945935
Alignment:
Q  56 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51224155 - 51224038
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  51224155 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatc 51224067  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  51224066 attcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429227
Alignment:
Q  44 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| | | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42998904 - 42998790
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||  ||||||||||| ||||||||| | |||    
T  42998904 aatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccat 42998816  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||    
T  42998815 ttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 51143873 - 51143987
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  51143873 aatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccat 51143961  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcac 130  Q
    | || |||||||||| ||||||||||    
T  51143962 tttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43176796 - 43176738
Alignment:
Q  73 atgtgtattggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43176796 atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 40165707 - 40165823
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  40165707 aatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccat 40165795  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacca 132  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||    
T  40165796 ttttccatgggtaccctggttgtcacca 40165823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 41609119 - 41609238
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||           |||||  |||||||| ||||||||| |      
T  41609119 tgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg-----------aatgttcattggttgaggtaaattatccg 41609207  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41609208 tcattcttccatgggtacattagttgtcacc 41609238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 2228054 - 2227995
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 60  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  2228054 tgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 28576231 - 28576184
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28576231 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 41882106 - 41882063
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41882106 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 47402868 - 47402810
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 60  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47402868 tgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaatgtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 50732029 - 50731986
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50732029 aatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Original strand, 50780827 - 50780870
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50780827 aatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8847775 - 8847718
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 60  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8847775 aaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731912
Alignment:
Q  80 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 50731912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780944
Alignment:
Q  80 ttggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaa 50780944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21597263 - 21597148
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||           ||||| |||||||| |||||||||| | |  ||    
T  21597263 aatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaactaaaaaggtg-----------aatgtttattggtttgggtaaattatccactat 21597175  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  21597174 ttttccatgggtactttagttgtcacc 21597148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 131
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  79 attggttggggtaaattacctatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 1921 - 2056
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1921 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 2020  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaagt 136  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2021 ccattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaagt 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13892 - 13762
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13892 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 13793  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13792 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2562 - 2429
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2562 tgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactca 2463  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2462 tcattcttccatgggtaccctagttatcaccaaa 2429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 176706 - 176836
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  176706 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 176805  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  176806 ccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 278058 - 278190
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc--acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  278058 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacc 278157  T
Q  99 tatcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  278158 caccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Original strand, 3133 - 3261
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  3133 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 3232  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3233 attcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4593
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  4724 aaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 4625  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4624 attcttccatgggtaccctagttgtcaccaaa 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 75374 - 75244
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  75374 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattca 75275  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  75274 ccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18984 - 18854
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | |    
T  18984 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatcca 18885  T
Q  101 tcattcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18884 caattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 32613 - 32710
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32613 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacc 32710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 7145 - 7265
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatc 102  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7145 aaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatc 7233  T
Q  103 attcttccatgggtaccttagttgtcaccaaa 134  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  7234 attctttcatgggtagcctagttgtcaccaaa 7265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 14800 - 14917
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14800 aatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccat 14888  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcaccaa 133  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14889 ttttccatgggtaccctagttgtcaccaa 14917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20592 - 20477
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacctatcat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  20592 aatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccat 20504  T
Q  105 tcttccatgggtaccttagttgtcacc 131  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  20503 ttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 97
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18043
Alignment:
Q  58 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4618
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4671 aaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Original strand, 3447 - 3500
Alignment:
Q  3 aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3447 aaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 158 - 209
Alignment:
Q  5 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 56  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  158 aatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 19269 - 19327
Alignment:
Q  1 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaag----atagttcatggataccacttaaaa 55  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19269 tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University