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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13203_low_22 (Length: 285)
Name: NF13203_low_22
Description: NF13203
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13203_low_22 |
 | |
|
| [»] scaffold0027 (1 HSPs) |
| |
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| [»] chr7 (4 HSPs) |
| |
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| [»] chr1 (2 HSPs) |
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| [»] chr6 (2 HSPs) |
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| [»] chr5 (10 HSPs) |
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|
| [»] chr3 (6 HSPs) |
| |
|
| [»] chr8 (2 HSPs) |
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|
Alignment Details
Target: scaffold0027 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 56496 - 56220
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56496 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
56397 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
56396 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
56297 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
56296 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
56220 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26404950 - 26404674
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26404950 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggttcatccaaatcgtcaatattttgcat |
26404851 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26404850 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccaggattgtcgcg |
26404751 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
26404750 |
tgactatcttgcagtgccagaaacttatatggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
26404674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28347631 - 28347406
Alignment:
| Q |
60 |
ggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattat |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28347631 |
ggcgttcggtataaccatcaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattggaaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattat |
28347532 |
T |
|
| Q |
160 |
tgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtg |
259 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28347531 |
tgccaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcgtgactatcctgcagtcccacaaaattatacggtgccagatgaaaatatgtg |
28347432 |
T |
|
| Q |
260 |
gtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28347431 |
gtcaaatacacctccaccctataacc |
28347406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27252459 - 27252272
Alignment:
| Q |
95 |
tcaatattttgcatggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatatttta |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
27252459 |
tcaatattttgcatggtattgagaatttttcggagatcatctga---tttctagagaagtattattgtcaaacccaagacaagcatttgcaagaatttta |
27252363 |
T |
|
| Q |
195 |
ccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27252362 |
ctaggattgtcgcgtgactagcctgtagtgccagaaacttatacggtgccagatgaaaatatatggttaaatacacctccaccctataacc |
27252272 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27252506 - 27252457
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttca |
58 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27252506 |
catcatcgtcaagttcaaaactgaaatcaacgtcatcaattagcacttca |
27252457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48345443 - 48345167
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48345443 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
48345344 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48345343 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
48345244 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48345243 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
48345167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49912829 - 49912553
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49912829 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgtttggtacaaccacgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
49912730 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49912729 |
ggtattggaaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaatccaaggcaagcatgtgtaagaattttaccaggattgtcgcg |
49912630 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49912629 |
tgactatcatgcagtgccagaaacttatacggtgccagataaaaatatgtggtcaaatactcctccaccctataacc |
49912553 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 283
Target Start/End: Original strand, 44803537 - 44803811
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44803537 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
44803636 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44803637 |
ggtattgggaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccaggattgtcgcg |
44803736 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataa |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44803737 |
tgactatcctgcaatgccagaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtgatcaaatacacctccaccctataa |
44803811 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 21063045 - 21063314
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaact-ggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
107 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21063045 |
catcatcgtcaagtccaaaaattggaaccaacatcatcaattagtacttcacgacgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
21063144 |
T |
|
| Q |
108 |
tggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgc |
207 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21063145 |
tggtattgataatttttccgaaatcatttgtggctttctagagaagtattattgacaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccacgattgtcgc |
21063244 |
T |
|
| Q |
208 |
gtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccacc |
277 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21063245 |
gtgactatcctgcagcgccagaaacctatacggtgccagatgaaaatgtgtggtcaaatacacctccacc |
21063314 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 285
Target Start/End: Original strand, 43632055 - 43632262
Alignment:
| Q |
78 |
gaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaag |
177 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43632055 |
gaggtttattcaaatcgtcaatattttgcatggtattggaaatttttcagagatcatttgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaag |
43632154 |
T |
|
| Q |
178 |
catgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccacc |
277 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43632155 |
catgtgcaagaattttaccaggattgtcgcgcgactatcctgcagtgccagaaatttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccacc |
43632254 |
T |
|
| Q |
278 |
ttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
43632255 |
ctataacc |
43632262 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42606663 - 42606514
Alignment:
| Q |
136 |
tgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaactta |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
42606663 |
tgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaatcatgtgcaaaaattttaccagaattgacgcgtgactatcctgcaacgccagaaactta |
42606564 |
T |
|
| Q |
236 |
tacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42606563 |
tacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
42606514 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7685606 - 7685330
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7685606 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
7685507 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7685506 |
ggtattgggaatttttcggagatcatctatggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaaacatgtgcaagaattttaccaggattgtcgcg |
7685407 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
7685406 |
tgactatcctgcagtgccagaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccatcctataacc |
7685330 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32632084 - 32631955
Alignment:
| Q |
24 |
caaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgggattttt |
123 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |||||||| | || || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
32632084 |
caaaagtgaaaccaacgtcatcagttagcactagatggagtctgatataaccatgaggtttatcagaatcgtcgatattttgaatggtattggaactttt |
32631985 |
T |
|
| Q |
124 |
tcagagattatatgtggctttctagagaag |
153 |
Q |
| |
|
| ||||| || | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
32631984 |
ttggagatcatttttggatttctagagaag |
32631955 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5626573 - 5626297
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5626573 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
5626474 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5626473 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagacaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
5626374 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
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|
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| T |
5626373 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
5626297 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 25083626 - 25083902
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
25083626 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
25083725 |
T |
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| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
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| T |
25083726 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggatttccgcg |
25083825 |
T |
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| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
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| T |
25083826 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtcgtcaaatacacctccaccctataacc |
25083902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 25141596 - 25141872
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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| T |
25141596 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
25141695 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
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| T |
25141696 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggatttccgcg |
25141795 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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| T |
25141796 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtcgtcaaatacacctccaccctataacc |
25141872 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 20880373 - 20880649
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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| T |
20880373 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggctttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
20880472 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
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| T |
20880473 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
20880572 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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|
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| T |
20880573 |
tgactatcctgcagtcccacaagcttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
20880649 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 42829985 - 42830261
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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| T |
42829985 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
42830084 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
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| T |
42830085 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacacaaggcaagcatatgcatcaattttaccaggattgccgcg |
42830184 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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|
| T |
42830185 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
42830261 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 25061213 - 25061489
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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| T |
25061213 |
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25061312 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
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| T |
25061313 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaaacatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
25061412 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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| T |
25061413 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
25061489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27820846 - 27820570
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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|
| T |
27820846 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
27820747 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
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| T |
27820746 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagaacagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgtatcaattttaccaggattgccgcg |
27820647 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27820646 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccatcctataacc |
27820570 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 2496058 - 2496326
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2496058 |
catcatcgtcaggtccaacactggaaccaacgtcatcaatttgcatttcactgcgttcggtataaccatgaggtttatcccaatcgtcaatattttgcat |
2496157 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2496158 |
ggtattgggaatttttcggagatcatctatggctttctagagaagtattattgacaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccaggattgtcgcg |
2496257 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccacc |
277 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2496258 |
tgactatcctacagcgcccgaaacctatacggtgccagatgaaaatatatggtcaaatacacctccacc |
2496326 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 28471912 - 28472180
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28471912 |
catcatcgtcaagtccaatggtggaaccaacgtcatcagttagcattagacaatgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
28472011 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28472012 |
ggtattgggaatttttcggagatcatttgtggctttctagagaagaattattgaaaaccccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccaagattgtcgcg |
28472111 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccacc |
277 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28472112 |
tgactatcatgcagcgccataaacctatatggtgtcaattgaaaatatttggtcaaatgcacctccacc |
28472180 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5897026 - 5896877
Alignment:
| Q |
136 |
tgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaactta |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5897026 |
tgtggctttatagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttaccaggattgtcacgtgactatcctgcagtgccagaaactta |
5896927 |
T |
|
| Q |
236 |
tacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
5896926 |
tacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaaaacacttccaccatataacc |
5896877 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 47095885 - 47096161
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47095885 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
47095984 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47095985 |
ggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
47096084 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47096085 |
tgactatcctgcagtcccacaagcttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
47096161 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 30892728 - 30892452
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30892728 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
30892629 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
30892628 |
ggtattgggaatttttcggagattatttgtggctttctagacaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgtg |
30892529 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30892528 |
tgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
30892452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 39505900 - 39506176
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39505900 |
catcatcgtcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcgattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
39505999 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
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||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39506000 |
ggtattgagaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaatccaaggtaagcatgtgcaagaattttcccaggattgtcgcg |
39506099 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39506100 |
tgactatcctgtagtgccaaaaacttatacggtgtcagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
39506176 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53137584 - 53137308
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53137584 |
catcatcgtcaagtccaaaattggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
53137485 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53137484 |
ggtattgggaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgcg |
53137385 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
53137384 |
tgactatcctgcagtccaacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
53137308 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 51798463 - 51798740
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
107 |
Q |
| |
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|
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| T |
51798463 |
acatcatcgtcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggtgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
51798562 |
T |
|
| Q |
108 |
tggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgc |
207 |
Q |
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| T |
51798563 |
tgatattgggaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattatcaaacccaaggcagccatgtgcaagaattttactaggattgtcgc |
51798662 |
T |
|
| Q |
208 |
gtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
| |
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|
|
| T |
51798663 |
gtgactatcctgcagtgcctgaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacaccttcaccctataacc |
51798740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21180295 - 21180020
Alignment:
| Q |
9 |
catcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
108 |
Q |
| |
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| T |
21180295 |
catcatcgtcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcat |
21180196 |
T |
|
| Q |
109 |
ggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcg |
208 |
Q |
| |
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| T |
21180195 |
ggtattggaattttt-cggagatcatttgtggctttctagagaagtattattgtcaaatccaaggcaagcatgtgcaagaattttatcaggattgtcacg |
21180097 |
T |
|
| Q |
209 |
tgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
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|
| T |
21180096 |
tgactatcctgcagtgccagtatcttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
21180020 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 7828980 - 7829257
Alignment:
| Q |
8 |
acatcatcatcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
107 |
Q |
| |
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| T |
7828980 |
acatcatcgtcaagtccaaaactagaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgca |
7829079 |
T |
|
| Q |
108 |
tggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgc |
207 |
Q |
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| T |
7829080 |
tggtattgggaatttttcggagattatctgtggctttctagacaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcatcaattttaccaggattgccgc |
7829179 |
T |
|
| Q |
208 |
gtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
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| T |
7829180 |
gtgactatcctgcagtcccacaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccctataacc |
7829257 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40846584 - 40846373
Alignment:
| Q |
74 |
ccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgggattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaagg |
173 |
Q |
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| T |
40846584 |
ccatgaggcttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattaggaatttttcggagatcatctgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaagg |
40846485 |
T |
|
| Q |
174 |
caagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctc |
273 |
Q |
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| T |
40846484 |
caggcatgtgcaagaattttaccatgattgtcgcgtgactatcctgcagcgccagaaacttatacgatgccagatgaaaatatgtggtcaaatacacctc |
40846385 |
T |
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| Q |
274 |
caccttataacc |
285 |
Q |
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| T |
40846384 |
caccctataacc |
40846373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31668853 - 31668586
Alignment:
| Q |
17 |
tcaagttcaaaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgg |
116 |
Q |
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| T |
31668853 |
tcaagtccaaaactggaaccaacgtcatcaattagcatttcacggtgttcggtacaaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgg |
31668754 |
T |
|
| Q |
117 |
gattttttcagagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatc |
216 |
Q |
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| T |
31668753 |
gaatttttcggagatcatctatggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttagtaggattgtcgcgtgactatc |
31668654 |
T |
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| Q |
217 |
ctgcagtgccaaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataac |
284 |
Q |
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| T |
31668653 |
ctgcagtgccagaaacttatacggtgccagatgaaaatatatgatcaaatacacctccaccctataac |
31668586 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8289878 - 8289619
Alignment:
| Q |
26 |
aaactggaaccaacgtcatcaattagcacttcacggcgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattgggattttttc |
125 |
Q |
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| T |
8289878 |
aaactgaaaccaacgtcatcaattagcacttcacgacgttcggtataaccatgaggtttatccaaatcgtcaatattttgcatggtattggaaatttttc |
8289779 |
T |
|
| Q |
126 |
agagattatatgtggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgctaatattttaccaggattgtcgcgtgactatcctgcagtgc |
225 |
Q |
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| T |
8289778 |
ggagatcatctatggctttctagagaagtattattgtcaaacccaaggcaagcatgtgcaagaattttattaggattgtctcgtgactatcctgcagtgc |
8289679 |
T |
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| Q |
226 |
caaaaacttatacggtgctagatgaaaatatgtggtcaaatacacctccaccttataacc |
285 |
Q |
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| T |
8289678 |
cagaaacttatacggtgccagatgaaaatatgtggtcaaatttacctccaccctataacc |
8289619 |
T |
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