View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320A-Insertion-16 (Length: 473)

Name: NF1320A-Insertion-16
Description: NF1320A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320A-Insertion-16
NF1320A-Insertion-16
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (8-473)||(32066130-32066605)
chr7 (9-384)||(32065360-32065740)
chr7 (8-220)||(32066643-32066855)
chr7 (48-466)||(32073659-32074087)
chr7 (8-473)||(32065609-32066092)
chr7 (48-353)||(32073919-32074232)
chr7 (48-279)||(32072830-32073063)
chr7 (48-473)||(32065140-32065571)
chr7 (48-473)||(32066426-32066855)
chr7 (48-473)||(32065914-32066342)
chr7 (241-428)||(32065077-32065272)
chr7 (331-473)||(32072863-32073004)
chr7 (123-219)||(32052340-32052437)
chr7 (269-425)||(32073624-32073786)
chr7 (48-104)||(32074177-32074233)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (174-219)||(46170413-46170458)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 473
Target Start/End: Original strand, 32066130 - 32066605
Alignment:
Q  8 aatcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaactcatgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32066130 aatcgtacattaataaatttgtttggaaggagggaactcatgtgtcaccattgactcattggcacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 32066229  T
Q  108 gacaactaaagtttgtctctcgttatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaa 207  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  32066230 gacaaataaagtttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcatatgggtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcaa 32066329  T
Q  208 atacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagataga--tcactt--tgtg 303  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || || |||  ||||||  ||||    
T  32066330 ataaatttgactaactccttaagaaagtggacatatgtttgattccttacaatcgtgcatgaatgatatttgattgaaaggagagaattcactttgtgtg 32066429  T
Q  304 tcagcattgactcatcgacattgaataa--tggtaatccggtcaataaaa--aat-atccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcg 397  Q
    |||||||| |||||  ||||  ||||||  ||||||||| || |||||||  ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  32066430 tcagcatttactcactgacaccgaataatgtggtaatccagtgaataaaaataataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatacggcg 32066529  T
Q  398 tactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagttatgtatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||  | || |||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32066530 taaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagta-aaatgcatttcgtccgaattcagaacatatacatttgacta 32066605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 384
Target Start/End: Original strand, 32065360 - 32065740
Alignment:
Q  9 atcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaactcatgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaacag 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32065360 atcgtgcatgaataaatttggttggaaggagggaactcatgtgtcaccattgactcaacgacaccgaataatatggtaatccagtcaatataaaaaacag 32065459  T
Q  109 acaactaaagtttgtctctcgttatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaa 208  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | ||||    
T  32065460 acaaataaagtttatctctcattatttaatacgacgtaaaggtcaaacgtcagatgagttacactaaagtaaaatttatttggtccgaattcaaaacaaa 32065559  T
Q  209 tacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaa--agatagatcactt--tgtgt 304  Q
    || ||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||  ||| ||  |||||    
T  32065560 taaatttgactaactccttaagaaagtgggcatatgtttgattccttacaatcgtgcatgaatgatatttggttggaaggagataactcattttgtgtgt 32065659  T
Q  305 cagcattgactcatcgacattgaata--atggtaatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctcat 384  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||  ||||||||||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  32065660 caccatttactcaccgaaatcgaataatatggtaatccaatcaataaaaaa-atacagataaataaagtacttatctctcat 32065740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 32066643 - 32066855
Alignment:
Q  8 aatcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaactcatgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32066643 aatcgtgcatgaataaatttggttggaaggagggaactcatgtctcaccattgactcagtgacaccgaataatatggtactccagtcaatataaaaaaca 32066742  T
Q  108 gacaactaaagtttgtctctcgttatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaa 207  Q
     |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  32066743 aacaaataaagtttatctctcattatttaatacggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcat 32066842  T
Q  208 atacatttgacta 220  Q
    |||||||||||||    
T  32066843 atacatttgacta 32066855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 32073659 - 32074087
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaacagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacggcgt 145  Q
    |||||||||||| |||||  |||||  |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  32073659 tgtgtcaccattaactcaccgacaccgaataatctggtaatccattcaataaaaaatacagacaaatgaagtacttatctctcattatttaatacggcgt 32073758  T
Q  146 aaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaataca-tttgactaactcattgtgagagtggacctatg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  | | || | |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  32073759 aaaggtcaaacgtcatatgagtaacacttatgtaaaatgtatgttgtttgaacttagatcaaatacattttgactaactccttatgaaagtggacatatg 32073858  T
Q  245 tttgattccttacactcgtgcatg---aataaaatttggttggaaagatagatcactt--tgtgtcagcattgactcatcgacattgaata--atggtaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| | ||||  ||||||     
T  32073859 tttgattccttacactcgtgcatgattattaaaatttggttggaaggagagatcactttgtgtgtcactattgactcaccgacactaaataatatggtat 32073958  T
Q  338 tccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagtta 435  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||   |    
T  32073959 tccagtcaataaaaaa-atacagacaaatggagtacttatctctcattatttaatacggcataatggtcaaacgtcatatgagtaacactaaagta-aaa 32074056  T
Q  436 tgtatttggtcctaattcagatcatatacat 466  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  32074057 tgtatgtggtccgaattcagatcaaatacat 32074087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065609 - 32066092
Alignment:
Q  8 aatcgtgcatgaataa-atttgtttggaaggaggaaactcat-----gtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataa 101  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||     ||||||||||| |||||  || |   ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32065609 aatcgtgcatgaatgatatttggttggaaggagataactcattttgtgtgtcaccatttactcaccgaaatcgaataatatggtaatccaatcaataaaa 32065708  T
Q  102 aaa-acagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaat 198  Q
    ||| ||||| || ||||||  || |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  32065709 aaatacagataaataaagtacttatctctcattatttaatatggtgtaaaggtaaaacgtcatgtgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtatgaat 32065808  T
Q  199 tcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagataga--tca 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||    
T  32065809 tcagatcaaataaatttgactaactccataagaaagtggacataagtttgattccttacaatcgtgcatgaataaaatttggttggaatgaaagaactca 32065908  T
Q  297 ctttgtgt--cagcattgactcatcgacattgaataat--ggtaatccggtcaataaaaaat--atccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaa 389  Q
    ||||||||  || |||| ||||| |||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  32065909 ctttgtgtgtcaccatttactcaccgacatcgaataatatgataatccagtcaataaaaaaataatatagacaaataaagtacttatctctcattattta 32066008  T
Q  390 atacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagttatgtatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    |||  |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  32066009 atatggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagta-aaatgtatttcgtccgaattcagaaaaaatacatttgacta 32066092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 353
Target Start/End: Original strand, 32073919 - 32074232
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaa-acagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacggcg 144  Q
    |||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||  || |||||| ||||||||||||||     
T  32073919 tgtgtcactattgactcaccgacactaaataatatggtattccagtcaataaaaaaatacagacaaatggagtacttatctctcattatttaatacggca 32074018  T
Q  145 taaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacat-ttgactaactcattgtgagagtggacctat 243  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  32074019 taatggtcaaacgtcatatgagtaacactaaagtaaaatgtatgtggtccgaattcagatcaaatacatattgactaactccttgtgaaagtgaacatat 32074118  T
Q  244 gtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagatagatcactt--tgtgtcagcattgactcatcgacattgaata--atggtaatc 339  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  32074119 gtttgactccttacattcgtgcatgaataaaatttggttggaaggagagatcactttgtgtgtcactattgactcaccgacactgaataatatggtaatc 32074218  T
Q  340 cggtcaataaaaaa 353  Q
      ||||||||||||    
T  32074219 tagtcaataaaaaa 32074232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Original strand, 32072830 - 32073063
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaacagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacggcgt 145  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||  || |||||  ||||||||||||||||    
T  32072830 tgtgtcacaattgactcactgacaccgaataatatggtaatctagtcaataaaaaatacagacaaataaagtacttatctcttattatttaatacggcgt 32072929  T
Q  146 aaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgt 245  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||    
T  32072930 aaaggtcaaactgcagatgagtaacactacagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcaaatacatttgactaactccttaagaaagtggacatatgt 32073029  T
Q  246 ttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttg 279  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32073030 ttgattctttacactagtgcatgaataaaatttg 32073063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065140 - 32065571
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaa--cagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacggc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||  || |||||| ||||||||||||||    
T  32065140 tgtgtcaccattgactcactgacaccgaattatatggtaatccagtcaataaaaaaaatacagacaaataacgtacttatctctcattatttaatacggc 32065239  T
Q  144 gtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaa-----gtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  32065240 gtaaaggtcaaacgtcagatcagtaacactaaattaaagtaaaatgtatttcgtctgaattcagaacaaatacatttgactaactccttaagaaagtgga 32065339  T
Q  239 cctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagatagatcactttgtgtcagcattgactcatcgacattgaata--atggta 336  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||  || | |  ||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||||||    
T  32065340 caaatgtttgattccttactatcgtgcatgaat-aaatttggttggaaggagggaactc-atgtgtcaccattgactcaacgacaccgaataatatggta 32065437  T
Q  337 atccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagtt 434  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||  ||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||       
T  32065438 atccagtcaatataaaaaa--cagacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacgacgtaaaggtcaaacgtcagatgagttacactaaagta-aa 32065532  T
Q  435 atgtatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    || |||||||||| |||||| | || ||| |||||||||    
T  32065533 atttatttggtccgaattcaaaacaaataaatttgacta 32065571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32066426 - 32066855
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca-----gacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatac 140  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||| || |     ||||| ||||||  || |||||| |||||||||||    
T  32066426 tgtgtcagcatttactcactgacaccgaataatgtggtaatccagtgaataaaaataataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatac 32066525  T
Q  141 ggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacc 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||  || |||||||     
T  32066526 ggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgcatttcgtccgaattcagaacatatacatttgactaactccttaagaaagtggaca 32066625  T
Q  241 tatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagatagatcactttgtgtcagcattgactcatcgacattgaata--atggtaat 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  || | |  ||| ||| ||||||||||  ||||  |||||  |||||| |    
T  32066626 tatgtttgattccttacaatcgtgcatgaat-aaatttggttggaaggagggaactc-atgtctcaccattgactcagtgacaccgaataatatggtact 32066723  T
Q  339 ccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagttat 436  Q
    || ||||||| |||| |  || |||||| ||||  |||||||||| |||| ||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||||||||   ||    
T  32066724 ccagtcaatataaaaaa--caaacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagta-aaat 32066818  T
Q  437 gtatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32066819 gtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 32066855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065914 - 32066342
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaa----acagacaactaaagt--ttgtctctcgttatttaatacg 141  Q
    |||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||    | |||||| ||||||  || |||||| |||||||||| |    
T  32065914 tgtgtcaccatttactcaccgacatcgaataatatgataatccagtcaataaaaaaataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatatg 32066013  T
Q  142 gcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacct 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |    
T  32066014 gcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttcgtccgaattcagaaaaaatacatttgactaactccttaagaaagtggacat 32066113  T
Q  242 atgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagatagatcactttgtgtcagcattgactcatcgacattgaata--atggtaatc 339  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||| ||  || | |  ||||||| ||||||||||| | ||  |||||  |||||||||    
T  32066114 atgtttgagtacttacaatcgtacattaat-aaatttgtttggaaggagggaactc-atgtgtcaccattgactcattggcacagaataatatggtaatc 32066211  T
Q  340 cggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaagtagttatg 437  Q
    | ||||||| |||| |  ||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||| |||  |||||||||||||   |||    
T  32066212 cagtcaatataaaaaa--cagacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcatatgggtaacactaaagta-aaatg 32066306  T
Q  438 tatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  32066307 tatttggtccgaattcagatcaaataaatttgacta 32066342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 241 - 428
Target Start/End: Original strand, 32065077 - 32065272
Alignment:
Q  241 tatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttgga--aagatagatcactt--tgtgtcagcattgactcatcgacattgaat--aatgg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  ||||   ||||    
T  32065077 tatgtttgattctttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaagaagagaactcacttcgtgtgtcaccattgactcactgacaccgaattatatgg 32065176  T
Q  335 taatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacactaaa 428  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32065177 taatccagtcaataaaaaaaatacagacaaataacgtacttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatcagtaacactaaa 32065272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 473
Target Start/End: Original strand, 32072863 - 32073004
Alignment:
Q  331 atggtaatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctcat-attaaatacagcgtactggtcaacgt-cagatgattaacactaaa 428  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||||  | ||||||| |||||||| |    
T  32072863 atggtaatctagtcaataaaaaata--cagacaaataaagtacttatctcttattatttaatacggcgtaaaggtcaaactgcagatgagtaacactaca 32072960  T
Q  429 gtagttatgtatttggtcctaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32072961 gtaaa-atgtatttggtccgaattcagatcaaatacatttgacta 32073004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 32052340 - 32052437
Alignment:
Q  123 tctctcgttatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaa-gtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgact 219  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32052340 tctctcattatttgatagggtgtaaagaccaaacgttaggcgagtaacacaaaatgtaaaatgtatttggtctaaatttagatcaaatacatttgact 32052437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 425
Target Start/End: Original strand, 32073624 - 32073786
Alignment:
Q  269 aataaaatttggttggaaagataga--tcactt--tgtgtcagcattgactcatcgacattgaataa--tggtaatccggtcaataaaaaatatccagac 362  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||  ||||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  32073624 aataaaatttggttggaaggattgaactgactttgtgtgtcaccattaactcaccgacaccgaataatctggtaatccattcaataaaaaata--cagac 32073721  T
Q  363 aaatgaagtacttatctctca-tattaaatacagcgtactggtc-aacgtcagatgattaacact 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||| ||||||| |||| |||||||    
T  32073722 aaatgaagtacttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcatatgagtaacact 32073786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 32074177 - 32074233
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacataataatatggtaatccagtcaatataaaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32074177 tgtgtcactattgactcaccgacactgaataatatggtaatctagtcaataaaaaaa 32074233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46170458 - 46170413
Alignment:
Q  174 aaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgact 219  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  46170458 aaagtaaaatgtatttggtccaaatttagattaaatacatttgact 46170413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University