View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320F-Insertion-26 (Length: 715)

Name: NF1320F-Insertion-26
Description: NF1320F
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320F-Insertion-26
NF1320F-Insertion-26
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (8-473)||(32066130-32066605)
chr7 (9-473)||(32065360-32065830)
chr7 (48-466)||(32073659-32074087)
chr7 (48-498)||(32066426-32066880)
chr7 (48-473)||(32065655-32066092)
chr7 (48-473)||(32065140-32065571)
chr7 (48-473)||(32065914-32066342)
chr7 (8-220)||(32066643-32066855)
chr7 (48-353)||(32073919-32074232)
chr7 (498-693)||(32066931-32067129)
chr7 (48-279)||(32072830-32073063)
chr7 (241-473)||(32065077-32065321)
chr7 (300-473)||(32072830-32073004)
chr7 (427-498)||(32074843-32074914)
chr7 (123-219)||(32052340-32052437)
chr7 (48-104)||(32074177-32074233)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (427-487)||(46170398-46170458)
chr1 (174-219)||(46170413-46170458)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (520-569)||(8196443-8196492)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 473
Target Start/End: Original strand, 32066130 - 32066605
Alignment:
Q  8 aatcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaacccatgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32066130 aatcgtacattaataaatttgtttggaaggagggaactcatgtgtcaccattgactcattggcacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 32066229  T
Q  108 gacaactaaagtttgtctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaa 207  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  32066230 gacaaataaagtttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcatatgggtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcaa 32066329  T
Q  208 atacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagaga--tcactt--tgtg 303  Q
    ||| ||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || ||||||  ||||||  ||||    
T  32066330 ataaatttgactaactccttaagaaagtggacatatgtttgattccttacaatcgtgcatgaatgatatttgattgaaaggagagaattcactttgtgtg 32066429  T
Q  304 tcaccattgactcatcgacattgaataa--tggtaatccggtcaataaaa--aat-atccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcg 397  Q
    ||| |||| |||||  ||||  ||||||  ||||||||| || |||||||  ||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32066430 tcagcatttactcactgacaccgaataatgtggtaatccagtgaataaaaataataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatacggcg 32066529  T
Q  398 taatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32066530 taaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgcatttcgtccgaattcagaacatatacatttgacta 32066605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065360 - 32065830
Alignment:
Q  9 atcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaacccatgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaacag 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32065360 atcgtgcatgaataaatttggttggaaggagggaactcatgtgtcaccattgactcaacgacaccgaataatatggtaatccagtcaatataaaaaacag 32065459  T
Q  109 acaactaaagtttgtctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaa 208  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | ||||    
T  32065460 acaaataaagtttatctctcattatttaatacgacgtaaaggtcaaacgtcagatgagttacactaaagtaaaatttatttggtccgaattcaaaacaaa 32065559  T
Q  209 tacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagaga--tcactt--tgtgt 304  Q
    || ||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |  ||| ||  |||||    
T  32065560 taaatttgactaactccttaagaaagtgggcatatgtttgattccttacaatcgtgcatgaatgatatttggttggaaggagataactcattttgtgtgt 32065659  T
Q  305 caccattgactcatcgacattgaata--atggtaatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcgtaat 401  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||  ||||||||||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||     
T  32065660 caccatttactcaccgaaatcgaataatatggtaatccaatcaataaaaaa-atacagataaataaagtacttatctctcattatttaatatggtgtaaa 32065758  T
Q  402 ggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  32065759 ggtaaaacgtcatgtgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtatgaattcagatcaaataaatttgacta 32065830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 32073659 - 32074087
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaacagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacggcgt 145  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  32073659 tgtgtcaccattaactcaccgacaccgaataatctggtaatccattcaataaaaaatacagacaaatgaagtacttatctctcattatttaatacggcgt 32073758  T
Q  146 aaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacattt-gactaactcattgtgagagtggacctatg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  | | || | ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  32073759 aaaggtcaaacgtcatatgagtaacacttatgtaaaatgtatgttgtttgaacttagatcaaatacattttgactaactccttatgaaagtggacatatg 32073858  T
Q  245 tttgattccttacactcgtgcatgaata---aaatttggttggaaagagagatcactttgtgt--caccattgactcatcgacattgaataat--ggtaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||||  ||||     
T  32073859 tttgattccttacactcgtgcatgattattaaaatttggttggaaggagagatcactttgtgtgtcactattgactcaccgacactaaataatatggtat 32073958  T
Q  338 tccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctcat-attaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaat 436  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32073959 tccagtcaataaaaaa-atacagacaaatggagtacttatctctcattatttaatacggcataatggtcaaacgtcatatgagtaacactaaagtaaaat 32074057  T
Q  437 gtatttggtccgaattcagatcatatacat 466  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32074058 gtatgtggtccgaattcagatcaaatacat 32074087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 48 - 498
Target Start/End: Original strand, 32066426 - 32066880
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca-----gacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatac 140  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| || |     ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  32066426 tgtgtcagcatttactcactgacaccgaataatgtggtaatccagtgaataaaaataataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatac 32066525  T
Q  141 ggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacc 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||  || |||||||     
T  32066526 ggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgcatttcgtccgaattcagaacatatacatttgactaactccttaagaaagtggaca 32066625  T
Q  241 tatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagagatcactttgtgtcaccattgactcatcgacattgaataat--ggtaat 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | | | || ||||||||||||||  ||||  |||||||  |||| |    
T  32066626 tatgtttgattccttacaatcgtgcatgaataaa-tttggttggaaggagggaactcat-gtctcaccattgactcagtgacaccgaataatatggtact 32066723  T
Q  339 ccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctcat-attaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatg 437  Q
    || ||||||| |||| |  || |||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32066724 ccagtcaatataaaaaa--caaacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatg 32066819  T
Q  438 tatttggtccgaattcagatcatatacatttgactatttatttatatttaatttaagaccc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32066820 tatttggtccgaattcagatcatatacatttgactatttatttatatttaatttaagaccc 32066880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065655 - 32066092
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaa-acagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacggcg 144  Q
    |||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||  || ||||||||||||||||| || |    
T  32065655 tgtgtcaccatttactcaccgaaatcgaataatatggtaatccaatcaataaaaaaatacagataaataaagtacttatctctcattatttaatatggtg 32065754  T
Q  145 taaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacctatg 244  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||| || |    
T  32065755 taaaggtaaaacgtcatgtgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtatgaattcagatcaaataaatttgactaactccataagaaagtggacataag 32065854  T
Q  245 tttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagaga--tcactttgtgt--caccattgactcatcgacattgaataat--ggtaat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||  | ||||    
T  32065855 tttgattccttacaatcgtgcatgaataaaatttggttggaatgaaagaactcactttgtgtgtcaccatttactcaccgacatcgaataatatgataat 32065954  T
Q  339 ccggtcaataaaaaat--atccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaa 435  Q
    || ||||||||||||   ||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32065955 ccagtcaataaaaaaataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatatggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaa 32066054  T
Q  436 tgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32066055 tgtatttcgtccgaattcagaaaaaatacatttgacta 32066092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065140 - 32065571
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaa--cagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacggc 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  32065140 tgtgtcaccattgactcactgacaccgaattatatggtaatccagtcaataaaaaaaatacagacaaataacgtacttatctctcattatttaatacggc 32065239  T
Q  144 gtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaa-----gtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtgga 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  32065240 gtaaaggtcaaacgtcagatcagtaacactaaattaaagtaaaatgtatttcgtctgaattcagaacaaatacatttgactaactccttaagaaagtgga 32065339  T
Q  239 cctatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagagatcactttgtgtcaccattgactcatcgacattgaata--atggta 336  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |  |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||    
T  32065340 caaatgtttgattccttactatcgtgcatgaat-aaatttggttggaaggagggaactc-atgtgtcaccattgactcaacgacaccgaataatatggta 32065437  T
Q  337 atccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaa 435  Q
    |||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32065438 atccagtcaatataaaaaa--cagacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacgacgtaaaggtcaaacgtcagatgagttacactaaagtaaaa 32065533  T
Q  436 tgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    | ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  32065534 tttatttggtccgaattcaaaacaaataaatttgacta 32065571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065914 - 32066342
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaa----acagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacg 141  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    | |||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  32065914 tgtgtcaccatttactcaccgacatcgaataatatgataatccagtcaataaaaaaataatatagacaaataaagtacttatctctcattatttaatatg 32066013  T
Q  142 gcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacct 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |    
T  32066014 gcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttcgtccgaattcagaaaaaatacatttgactaactccttaagaaagtggacat 32066113  T
Q  242 atgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagagatcactttgtgtcaccattgactcatcgacattgaata--atggtaatc 339  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||| ||| || | |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||    
T  32066114 atgtttgagtacttacaatcgtacattaat-aaatttgtttggaaggagggaactc-atgtgtcaccattgactcattggcacagaataatatggtaatc 32066211  T
Q  340 cggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgt 438  Q
    | ||||||| |||| |  ||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32066212 cagtcaatataaaaaa--cagacaaataaagt--ttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcatatgggtaacactaaagtaaaatgt 32066307  T
Q  439 atttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32066308 atttggtccgaattcagatcaaataaatttgacta 32066342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 32066643 - 32066855
Alignment:
Q  8 aatcgtgcatgaataaatttgtttggaaggaggaaacccatgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaaca 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32066643 aatcgtgcatgaataaatttggttggaaggagggaactcatgtctcaccattgactcagtgacaccgaataatatggtactccagtcaatataaaaaaca 32066742  T
Q  108 gacaactaaagtttgtctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaa 207  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  32066743 aacaaataaagtttatctctcattatttaatacggcgtaaagttcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcat 32066842  T
Q  208 atacatttgacta 220  Q
    |||||||||||||    
T  32066843 atacatttgacta 32066855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 353
Target Start/End: Original strand, 32073919 - 32074232
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaa-acagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacggcg 144  Q
    |||||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||  || |||||||||||||||||||||     
T  32073919 tgtgtcactattgactcaccgacactaaataatatggtattccagtcaataaaaaaatacagacaaatggagtacttatctctcattatttaatacggca 32074018  T
Q  145 taaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacat-ttgactaactcattgtgagagtggacctat 243  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||    
T  32074019 taatggtcaaacgtcatatgagtaacactaaagtaaaatgtatgtggtccgaattcagatcaaatacatattgactaactccttgtgaaagtgaacatat 32074118  T
Q  244 gtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaaagagagatcactt--tgtgtcaccattgactcatcgacattgaata--atggtaatc 339  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  32074119 gtttgactccttacattcgtgcatgaataaaatttggttggaaggagagatcactttgtgtgtcactattgactcaccgacactgaataatatggtaatc 32074218  T
Q  340 cggtcaataaaaaa 353  Q
      ||||||||||||    
T  32074219 tagtcaataaaaaa 32074232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 498 - 693
Target Start/End: Original strand, 32066931 - 32067129
Alignment:
Q  498 cttcgttattttcatgaatatcatgttactataggttacatatgttgcaactgctttggtggattctaaactctgtagaatagcgtaatgatctatttga 597  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32066931 cttcgttattttcctgaacatgatgttactataggttacatatgttgcaactgctttggtggattctaaactctgtagaatagcgtaatgatctatttga 32067030  T
Q  598 tttgttatctaagaaac-tttttgagtt-agtagatgttatgaaggtgcacaattggtgatgccagcctctttggcaatgacag-acgttcaggttact 693  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32067031 tttgttatctaggaaacttttttgagttaagtagtttttatgaaggtgcacaattgttgatgccagcctcttttgcaatgacagtacgttcaggttact 32067129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Original strand, 32072830 - 32073063
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaaacagacaactaaagt--ttgtctctcattatttaatacggcgt 145  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  32072830 tgtgtcacaattgactcactgacaccgaataatatggtaatctagtcaataaaaaatacagacaaataaagtacttatctcttattatttaatacggcgt 32072929  T
Q  146 aaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgactaactcattgtgagagtggacctatgt 245  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||    
T  32072930 aaaggtcaaactgcagatgagtaacactacagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcaaatacatttgactaactccttaagaaagtggacatatgt 32073029  T
Q  246 ttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttg 279  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32073030 ttgattctttacactagtgcatgaataaaatttg 32073063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 241 - 473
Target Start/End: Original strand, 32065077 - 32065321
Alignment:
Q  241 tatgtttgattccttacactcgtgcatgaataaaatttggttgga--aagagagatcactt--tgtgtcaccattgactcatcgacattgaat--aatgg 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||  ||||   ||||    
T  32065077 tatgtttgattctttacactcgtgcatgaataaaatttggttggaagaagagaactcacttcgtgtgtcaccattgactcactgacaccgaattatatgg 32065176  T
Q  335 taatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctca-tattaaatacggcgtaatggtcaaacgtcagatgagtaacac-----taa 428  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     |||    
T  32065177 taatccagtcaataaaaaaaatacagacaaataacgtacttatctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatcagtaacactaaattaa 32065276  T
Q  429 agtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  32065277 agtaaaatgtatttcgtctgaattcagaacaaatacatttgacta 32065321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 300 - 473
Target Start/End: Original strand, 32072830 - 32073004
Alignment:
Q  300 tgtgtcaccattgactcatcgacattgaataat--ggtaatccggtcaataaaaaatatccagacaaatgaagtacttatctctcat-attaaatacggc 396  Q
    |||||||| |||||||||  ||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  32072830 tgtgtcacaattgactcactgacaccgaataatatggtaatctagtcaataaaaaata--cagacaaataaagtacttatctcttattatttaatacggc 32072927  T
Q  397 gtaatggtcaaacgtcagatgagtaacactaaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgacta 473  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32072928 gtaaaggtcaaactgcagatgagtaacactacagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcaaatacatttgacta 32073004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 427 - 498
Target Start/End: Original strand, 32074843 - 32074914
Alignment:
Q  427 aaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgactatttatttatatttaatttaagaccc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32074843 aaagtaaaatgtatttggtccaaacttagatcaaatacgtttgactatttattgatatttaatttaagaccc 32074914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 32052340 - 32052437
Alignment:
Q  123 tctctcattatttaatacggcgtaaaggtcaaacgtcagatgagtaacactaaa-gtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgact 219  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32052340 tctctcattatttgatagggtgtaaagaccaaacgttaggcgagtaacacaaaatgtaaaatgtatttggtctaaatttagatcaaatacatttgact 32052437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 32074177 - 32074233
Alignment:
Q  48 tgtgtcaccattgactcattgacacagaataatatggtaatccagtcaatataaaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32074177 tgtgtcactattgactcaccgacactgaataatatggtaatctagtcaataaaaaaa 32074233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 46170458 - 46170398
Alignment:
Q  427 aaagtaaaatgtatttggtccgaattcagatcatatacatttgactatttatttatattta 487  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  46170458 aaagtaaaatgtatttggtccaaatttagattaaatacatttgactttttacttatattta 46170398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46170458 - 46170413
Alignment:
Q  174 aaagtaaaatgtatttgctctaaattcagatcaaatacatttgact 219  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  46170458 aaagtaaaatgtatttggtccaaatttagattaaatacatttgact 46170413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 8196492 - 8196443
Alignment:
Q  520 atgttactataggttacatatgttgcaactgctttggtggattctaaact 569  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8196492 atgtaactgtaggtgacatatgttgcaattgctttggtggattccaaact 8196443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University