View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320R-Insertion-17 (Length: 410)

Name: NF1320R-Insertion-17
Description: NF1320R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320R-Insertion-17
NF1320R-Insertion-17
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (11-410)||(49206822-49207221)
chr3 (9-410)||(49201865-49202266)
chr3 (9-410)||(49211406-49211795)
chr3 (9-410)||(49186885-49187286)
chr3 (11-410)||(49190590-49190977)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (9-410)||(51823582-51823983)
chr1 (9-410)||(31526701-31527093)
chr1 (9-410)||(32593308-32593697)
chr1 (119-410)||(37030141-37030432)
chr1 (11-87)||(37030057-37030133)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (12-407)||(26755869-26756261)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (9-44)||(52267390-52267425)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 410
Target Start/End: Original strand, 49206822 - 49207221
Alignment:
Q  11 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49206822 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 49206921  T
Q  111 cattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49206922 cattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatt 49207021  T
Q  211 tatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49207022 tatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccc 49207121  T
Q  311 tctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgcct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49207122 tctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgcct 49207221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 49201865 - 49202266
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  49201865 gcaacatgcccgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttttttc 49201964  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
     |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49201965 accaccactatcactaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtactgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 49202064  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49202065 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattcagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcacaatcc 49202164  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||| || ||||||||||||||    
T  49202165 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcggcttcttgcttgcaagcataaaatgttgcatctgctgacgctttctgtgcttctgcctctgc 49202264  T
Q  409 ct 410  Q
    ||    
T  49202265 ct 49202266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 49211406 - 49211795
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||      ||    
T  49211406 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtacacaccagcaacttctttcatc------gcaccttca------cc 49211493  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49211494 cccactattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcagcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 49211593  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49211594 tttatcatcaagtaatcccttactgctgtatagttgtttccaagtgcattcagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcacaatcc 49211693  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49211694 cctctgcctcttttttctttgcgtacagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgtgcttctgcctctgc 49211793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 49186885 - 49187286
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49186885 gcaacatgcccgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccatcagttattcc 49186984  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49186985 cccactattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtattgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgtcacca 49187084  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |    
T  49187085 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcttgtccaagtgtcacaattc 49187184  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  49187185 cctctgcctcctttttctttgcataaagctctgcttcagctgcttgtttgctagcataaaatgttgcatctgccgacgctttctgtgcttctgcctctgc 49187284  T
Q  409 ct 410  Q
    ||    
T  49187285 ct 49187286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 410
Target Start/End: Original strand, 49190590 - 49190977
Alignment:
Q  11 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 110  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||      ||||    
T  49190590 aacattcccgtttgctcatgaacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatc------gcaccttca------cccc 49190677  T
Q  111 cattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatt 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49190678 cactattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtactgcctcagcattaatcttagcgatctcttgaaacatgccaccatt 49190777  T
Q  211 tatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccc 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  49190778 tatcatcaagaaatcccttacagcagtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgcacttagatacaccccttgagcattcccaagtgtcacaattccc 49190877  T
Q  311 tctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgcct 410  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  49190878 tctgcctcctttttctttgcatatagctctgcttcagctgcttgcgtgcgagcataaaatgttgcgtctgctaatgctttctgtgcttctgcctctgcct 49190977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 51823582 - 51823983
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  51823582 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttgaacagaggtggcagcatcttgtagacaccagcaacctctttcatacccatagaaccttcggctattcc 51823681  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
     ||   ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51823682 gcctccattgtcccctccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccacgtactgcctcagcattaatcttagccatctcttgaaacatgccacca 51823781  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  51823782 tttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcatttccaagtgtcacaatcc 51823881  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51823882 cctctgcctcttttttctttgcgtatagatctgcttcagctgcttgcttgcacgcataaaatgttgcatctgccaatgctttctgtgcttctgcctctgc 51823981  T
Q  409 ct 410  Q
    ||    
T  51823982 ct 51823983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 31526701 - 31527093
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||       ||    
T  31526701 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtaaacaccagcaacctctttcatacccatagaaccttcg------cc 31526794  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
     ||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31526795 tccattgt---cacctccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccacgtaccgcctcagcattaatcttagccatctcttgaaacatgccacca 31526891  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31526892 tttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacactccttgagcattcccaagtgtcacaatcc 31526991  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  31526992 cctctgcctcttttttctttgcatatagctccgcttcggctgcttgcttgcgcgcataaaatgttgcatctgacaatgctttctgtgcttctgcctctgc 31527091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32593697 - 32593308
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  32593697 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcagcatcttgtaaacaccagcaacctctttcatgcccatagaaccttccgttattcc 32593598  T
Q  109 cccattattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 208  Q
     ||             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32593597 gcct------------ccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccatgtactgcctcagcattgatcttagccatctcttgaaacatgccacca 32593510  T
Q  209 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32593509 tttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacactccttgagcattcccaagtgtcacaatcc 32593410  T
Q  309 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32593409 cttctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagctgcttgcttgcgcgcataaaatgttgcatctgccaatgctttctgtgcttctgcctctgc 32593310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 410
Target Start/End: Original strand, 37030141 - 37030432
Alignment:
Q  119 tcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatttatcatca 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37030141 tcacccccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtcctcgtattgcctcggcgttaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatttatcatca 37030240  T
Q  219 agtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccctctgcctc 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  37030241 agtaatccctcacagctgtgtagtcgtttccaagtgcattaagaagtttacttacatacaccccttgagcttgtccaactgtcacaattccctctgcctc 37030340  T
Q  319 ttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgcct 410  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  37030341 ctttttctttgcataaagctctgcttcagctgcttgtttgctagcataaaatgttgcatctgccgatgctttctgtgcttctgcctctgcct 37030432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 37030057 - 37030133
Alignment:
Q  11 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacc 87  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37030057 aacattcccgtttgctcatggacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacc 37030133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 26755869 - 26756261
Alignment:
Q  12 acatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattccccc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || | ||    
T  26755869 acatgcctgtttgctcatggactgtcttaaacagaggtggcaacatcttgtacacaccagcaacttctttcatacctatgccaccgtcagttttttcgcc 26755968  T
Q  112 attattatcaccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgccccggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccattt 211  Q
    |   ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26755969 accgttat---caccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccgcgtatagcctcagcattaatcttcgcaatatctcgaaacatgccaccattt 26756065  T
Q  212 atcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccct 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |    ||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  26756066 atcatcaagtagtcccttacagctgtataatcacctccaagtgcgttgagaagggtacttacacacaccccttgaccattcccaagtgtcacgatcccct 26756165  T
Q  312 ctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctg 407  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| | || |||||||||| | || |||||||||||||    
T  26756166 ccgcctccttcttctttgcatatagctctgcttcggctgcttgtttacgagcataaaatgttgcatttgccaatgctatctgtgcttctgcctctg 26756261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 52267425 - 52267390
Alignment:
Q  9 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaaca 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52267425 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaaca 52267390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University