View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320_high_23 (Length: 432)

Name: NF1320_high_23
Description: NF1320
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320_high_23
NF1320_high_23
[»] chr5 (203 HSPs)
chr5 (29-355)||(10848131-10848457)
chr5 (29-355)||(30116289-30116614)
chr5 (29-355)||(28464790-28465115)
chr5 (29-355)||(35932459-35932785)
chr5 (29-355)||(3245894-3246219)
chr5 (29-355)||(33932627-33932952)
chr5 (29-355)||(35986684-35987011)
chr5 (29-355)||(15516330-15516654)
chr5 (29-318)||(14086992-14087281)
chr5 (29-355)||(28138963-28139291)
chr5 (29-355)||(30742341-30742666)
chr5 (29-355)||(9088329-9088653)
chr5 (29-355)||(29138858-29139182)
chr5 (29-337)||(21659589-21659896)
chr5 (29-352)||(26764866-26765188)
chr5 (29-355)||(42243041-42243366)
chr5 (29-352)||(11993251-11993574)
chr5 (29-337)||(7746146-7746455)
chr5 (29-334)||(23392056-23392362)
chr5 (29-337)||(17814340-17814650)
chr5 (29-337)||(31117255-31117563)
chr5 (29-337)||(31487614-31487920)
chr5 (29-337)||(89873-90184)
chr5 (29-352)||(33022025-33022350)
chr5 (29-337)||(26783730-26784039)
chr5 (29-337)||(12353248-12353556)
chr5 (29-337)||(19536749-19537058)
chr5 (29-337)||(6512882-6513192)
chr5 (29-337)||(23413426-23413735)
chr5 (29-337)||(13545977-13546282)
chr5 (29-345)||(643153-643469)
chr5 (29-337)||(21199453-21199761)
chr5 (29-345)||(9399068-9399385)
chr5 (137-355)||(4886322-4886540)
chr5 (33-337)||(21100159-21100464)
chr5 (37-337)||(23880442-23880742)
chr5 (29-301)||(21072689-21072962)
chr5 (29-225)||(4886512-4886707)
chr5 (29-337)||(25097279-25097587)
chr5 (29-337)||(25155249-25155557)
chr5 (29-206)||(31146087-31146264)
chr5 (29-218)||(20550391-20550578)
chr5 (29-237)||(2156727-2156932)
chr5 (61-337)||(32160124-32160404)
chr5 (197-345)||(13736694-13736842)
chr5 (60-355)||(11208490-11208788)
chr5 (29-237)||(16606991-16607197)
chr5 (60-355)||(25112358-25112656)
chr5 (60-355)||(25171449-25171747)
chr5 (29-133)||(25930608-25930712)
chr5 (29-240)||(34637929-34638140)
chr5 (29-177)||(13736587-13736735)
chr5 (29-169)||(22000508-22000647)
chr5 (60-266)||(23477827-23478031)
chr5 (29-133)||(6498818-6498922)
chr5 (60-266)||(20215597-20215802)
chr5 (29-162)||(23589269-23589399)
chr5 (201-333)||(22000650-22000784)
chr5 (63-266)||(40228110-40228312)
chr5 (228-355)||(31146255-31146382)
chr5 (60-177)||(23488062-23488177)
chr5 (44-237)||(26120294-26120484)
chr5 (60-175)||(13522737-13522850)
chr5 (31-130)||(31589429-31589528)
chr5 (60-177)||(1914958-1915073)
chr5 (185-337)||(26766443-26766596)
chr5 (143-223)||(25740631-25740711)
chr5 (29-163)||(20968765-20968897)
chr5 (29-163)||(24019174-24019305)
chr5 (29-116)||(25740708-25740795)
chr5 (60-237)||(20567286-20567460)
chr5 (60-177)||(40033248-40033363)
chr5 (60-148)||(20168559-20168645)
chr5 (60-148)||(36096144-36096230)
chr5 (60-148)||(36097601-36097687)
chr5 (41-184)||(22586448-22586587)
chr5 (60-175)||(35543621-35543733)
chr5 (29-148)||(34637143-34637256)
chr5 (60-337)||(20625259-20625535)
chr5 (29-184)||(39799328-39799480)
chr5 (60-223)||(20417397-20417557)
chr5 (60-145)||(13533494-13533577)
chr5 (102-309)||(25156558-25156766)
chr5 (29-91)||(26758772-26758834)
chr5 (60-177)||(27204285-27204399)
chr5 (60-177)||(32753598-32753712)
chr5 (60-266)||(40390850-40391054)
chr5 (60-266)||(40401512-40401716)
chr5 (65-226)||(12078354-12078514)
chr5 (60-177)||(6131284-6131398)
chr5 (167-237)||(6498746-6498816)
chr5 (60-177)||(9377115-9377229)
chr5 (60-177)||(14041090-14041204)
chr5 (60-177)||(14446654-14446768)
chr5 (60-177)||(14457266-14457380)
chr5 (60-177)||(14557670-14557784)
chr5 (60-177)||(14568307-14568421)
chr5 (60-177)||(15693685-15693799)
chr5 (60-177)||(15740461-15740575)
chr5 (60-177)||(15769621-15769735)
chr5 (60-177)||(15992982-15993096)
chr5 (60-177)||(16003544-16003658)
chr5 (60-177)||(17607552-17607666)
chr5 (60-177)||(17618167-17618281)
chr5 (60-177)||(22147016-22147130)
chr5 (60-177)||(22157599-22157713)
chr5 (60-177)||(22559930-22560044)
chr5 (60-177)||(22676609-22676724)
chr5 (60-177)||(22686500-22686615)
chr5 (60-177)||(24567582-24567696)
chr5 (60-177)||(24816539-24816653)
chr5 (60-177)||(24827127-24827241)
chr5 (60-177)||(27041865-27041979)
chr5 (60-177)||(27052489-27052603)
chr5 (60-177)||(27460654-27460768)
chr5 (60-177)||(27471053-27471167)
chr5 (60-177)||(31349026-31349140)
chr5 (60-177)||(31359640-31359754)
chr5 (60-177)||(31833976-31834090)
chr5 (60-177)||(31844454-31844568)
chr5 (60-177)||(35215999-35216113)
chr5 (60-177)||(35226583-35226697)
chr5 (60-177)||(36688187-36688301)
chr5 (60-177)||(36698753-36698867)
chr5 (60-177)||(37728905-37729019)
chr5 (60-177)||(37740221-37740335)
chr5 (60-177)||(39352981-39353095)
chr5 (60-177)||(39364974-39365088)
chr5 (74-177)||(13403773-13403874)
chr5 (60-131)||(106613-106683)
chr5 (60-107)||(6976301-6976348)
chr5 (60-107)||(6986791-6986838)
chr5 (60-177)||(9347035-9347149)
chr5 (60-177)||(14030537-14030651)
chr5 (60-177)||(17719410-17719524)
chr5 (60-177)||(17730062-17730176)
chr5 (60-177)||(20798189-20798303)
chr5 (60-177)||(23296770-23296884)
chr5 (60-177)||(23307338-23307452)
chr5 (60-177)||(23362604-23362718)
chr5 (60-177)||(23697277-23697391)
chr5 (60-177)||(23707935-23708049)
chr5 (64-177)||(24808409-24808519)
chr5 (60-177)||(30227149-30227263)
chr5 (60-177)||(30237676-30237790)
chr5 (60-177)||(33951453-33951567)
chr5 (60-177)||(39490603-39490717)
chr5 (60-177)||(39501793-39501907)
chr5 (60-177)||(40513642-40513756)
chr5 (60-101)||(7031852-7031893)
chr5 (59-99)||(26056008-26056048)
chr5 (60-99)||(1108872-1108911)
chr5 (60-99)||(1121630-1121669)
chr5 (60-99)||(5290304-5290343)
chr5 (60-99)||(5300875-5300914)
chr5 (60-99)||(8522334-8522373)
chr5 (60-99)||(9336448-9336487)
chr5 (60-99)||(17457040-17457079)
chr5 (60-99)||(19464464-19464503)
chr5 (60-99)||(19478494-19478533)
chr5 (60-99)||(20562818-20562857)
chr5 (165-337)||(20968624-20968793)
chr5 (60-99)||(21702852-21702891)
chr5 (60-99)||(21705699-21705738)
chr5 (163-266)||(23488003-23488106)
chr5 (60-99)||(24925867-24925906)
chr5 (60-99)||(24983148-24983187)
chr5 (60-99)||(27603146-27603185)
chr5 (60-99)||(34063114-34063153)
chr5 (60-99)||(34772403-34772442)
chr5 (60-99)||(34783348-34783387)
chr5 (60-99)||(36084954-36084993)
chr5 (60-99)||(36229232-36229271)
chr5 (60-99)||(36582286-36582325)
chr5 (60-99)||(36592841-36592880)
chr5 (60-99)||(42395477-42395516)
chr5 (60-99)||(43621622-43621661)
chr5 (291-337)||(6498689-6498735)
chr5 (60-177)||(31419156-31419270)
chr5 (60-177)||(42043277-42043391)
chr5 (60-177)||(42053852-42053966)
chr5 (290-351)||(37395528-37395588)
chr5 (65-177)||(37407146-37407255)
chr5 (163-337)||(40033319-40033499)
chr5 (63-99)||(20552311-20552347)
chr5 (60-99)||(17446424-17446463)
chr5 (60-99)||(23406939-23406978)
chr5 (136-223)||(24494992-24495079)
chr5 (60-99)||(27622495-27622534)
chr5 (60-99)||(30069632-30069671)
chr5 (60-99)||(34052453-34052492)
chr5 (60-99)||(43043399-43043438)
chr5 (60-177)||(10754985-10755099)
chr5 (290-337)||(20168762-20168808)
chr5 (277-340)||(24019030-24019092)
chr5 (60-99)||(31449047-31449086)
chr5 (189-266)||(13403713-13403791)
chr5 (254-337)||(31589618-31589702)
chr5 (59-123)||(26119095-26119157)
chr5 (163-266)||(1914898-1915002)
chr5 (197-237)||(20550433-20550472)
chr5 (134-177)||(22747897-22747941)
chr5 (197-237)||(22747898-22747938)
[»] chr7 (190 HSPs)
chr7 (29-355)||(27871075-27871401)
chr7 (32-355)||(32265196-32265519)
chr7 (29-355)||(24795187-24795514)
chr7 (43-355)||(48063299-48063611)
chr7 (29-355)||(12174813-12175138)
chr7 (29-355)||(48806352-48806679)
chr7 (29-355)||(19339722-19340048)
chr7 (29-355)||(33421109-33421432)
chr7 (29-352)||(16557063-16557385)
chr7 (29-352)||(16608277-16608599)
chr7 (43-355)||(331008-331321)
chr7 (29-352)||(9710278-9710600)
chr7 (29-355)||(15704962-15705286)
chr7 (29-355)||(21381902-21382228)
chr7 (29-337)||(15087926-15088233)
chr7 (29-336)||(33692175-33692481)
chr7 (30-337)||(30945834-30946140)
chr7 (36-355)||(2265996-2266313)
chr7 (29-337)||(14187064-14187374)
chr7 (29-337)||(2914083-2914393)
chr7 (29-352)||(28622832-28623156)
chr7 (29-337)||(13138370-13138678)
chr7 (29-333)||(13731147-13731453)
chr7 (29-336)||(19328487-19328792)
chr7 (29-337)||(11318780-11319090)
chr7 (29-337)||(13302236-13302545)
chr7 (29-345)||(15467285-15467600)
chr7 (29-337)||(19711486-19711793)
chr7 (43-337)||(4820862-4821154)
chr7 (29-337)||(11792285-11792593)
chr7 (36-337)||(13034318-13034620)
chr7 (29-337)||(10883645-10883953)
chr7 (29-334)||(14425926-14426231)
chr7 (29-337)||(21283847-21284156)
chr7 (29-337)||(23280434-23280734)
chr7 (29-337)||(4493950-4494260)
chr7 (29-337)||(16315012-16315320)
chr7 (29-337)||(16317029-16317336)
chr7 (29-337)||(13027375-13027681)
chr7 (93-337)||(48237378-48237622)
chr7 (29-260)||(16112358-16112588)
chr7 (29-337)||(16310379-16310689)
chr7 (29-337)||(29935818-29936127)
chr7 (29-337)||(5001297-5001608)
chr7 (64-337)||(13879545-13879820)
chr7 (29-305)||(13683004-13683281)
chr7 (29-337)||(13261087-13261397)
chr7 (29-345)||(41842898-41843214)
chr7 (76-337)||(33604282-33604543)
chr7 (29-206)||(8182437-8182614)
chr7 (32-337)||(12367213-12367519)
chr7 (148-349)||(35954498-35954698)
chr7 (29-223)||(2499529-2499721)
chr7 (29-337)||(7488377-7488685)
chr7 (197-354)||(14424875-14425032)
chr7 (43-277)||(13472985-13473217)
chr7 (52-337)||(19237532-19237817)
chr7 (197-355)||(1292448-1292606)
chr7 (29-165)||(1292578-1292714)
chr7 (166-337)||(44466469-44466642)
chr7 (29-177)||(22579688-22579835)
chr7 (60-337)||(4433040-4433321)
chr7 (167-337)||(9069135-9069304)
chr7 (43-337)||(16411384-16411673)
chr7 (29-177)||(13645927-13646075)
chr7 (168-355)||(15574193-15574379)
chr7 (43-165)||(14425004-14425126)
chr7 (60-351)||(602126-602420)
chr7 (79-333)||(13902136-13902390)
chr7 (60-337)||(4412467-4412749)
chr7 (29-337)||(9099513-9099818)
chr7 (227-355)||(8182317-8182447)
chr7 (29-237)||(25687314-25687519)
chr7 (29-337)||(9098707-9099012)
chr7 (29-177)||(30025442-30025589)
chr7 (175-337)||(16545956-16546117)
chr7 (175-337)||(16619545-16619706)
chr7 (165-309)||(21691763-21691910)
chr7 (197-337)||(22579825-22579964)
chr7 (29-153)||(35953159-35953282)
chr7 (29-152)||(39285037-39285158)
chr7 (29-143)||(21691902-21692015)
chr7 (64-266)||(11087507-11087708)
chr7 (29-129)||(44466647-44466747)
chr7 (29-161)||(13172828-13172956)
chr7 (197-337)||(30025310-30025452)
chr7 (60-266)||(8999393-8999598)
chr7 (29-337)||(16308187-16308491)
chr7 (52-237)||(5034864-5035047)
chr7 (208-337)||(13259053-13259184)
chr7 (208-337)||(13266393-13266524)
chr7 (60-146)||(13175064-13175148)
chr7 (60-177)||(24882875-24882989)
chr7 (197-337)||(39285143-39285285)
chr7 (60-145)||(3476795-3476877)
chr7 (29-99)||(16105439-16105509)
chr7 (60-145)||(29589755-29589838)
chr7 (29-130)||(18362041-18362140)
chr7 (252-347)||(2499428-2499526)
chr7 (231-337)||(24787736-24787845)
chr7 (60-145)||(8933327-8933409)
chr7 (63-226)||(9802668-9802829)
chr7 (60-177)||(17950572-17950686)
chr7 (60-177)||(48381919-48382033)
chr7 (60-133)||(26210003-26210075)
chr7 (54-177)||(2706060-2706180)
chr7 (54-177)||(2716664-2716784)
chr7 (60-227)||(24931057-24931220)
chr7 (60-337)||(18418685-18418960)
chr7 (60-337)||(18440766-18441041)
chr7 (60-177)||(166627-166741)
chr7 (60-177)||(177219-177333)
chr7 (60-177)||(468035-468149)
chr7 (60-177)||(1987272-1987386)
chr7 (60-177)||(1997893-1998007)
chr7 (58-147)||(2501515-2501600)
chr7 (60-177)||(4222340-4222454)
chr7 (60-177)||(6867679-6867793)
chr7 (60-177)||(6878311-6878425)
chr7 (60-177)||(8627681-8627795)
chr7 (60-177)||(11004917-11005031)
chr7 (196-337)||(13645826-13645968)
chr7 (60-145)||(15216080-15216162)
chr7 (256-318)||(16155463-16155525)
chr7 (60-177)||(17961178-17961292)
chr7 (60-177)||(22088855-22088969)
chr7 (60-177)||(22099470-22099584)
chr7 (60-177)||(24734485-24734599)
chr7 (60-177)||(24744432-24744546)
chr7 (60-177)||(26294483-26294597)
chr7 (60-177)||(26390550-26390664)
chr7 (60-177)||(26401192-26401306)
chr7 (60-177)||(37343932-37344046)
chr7 (60-177)||(42865559-42865673)
chr7 (60-177)||(42876185-42876299)
chr7 (60-177)||(48710945-48711059)
chr7 (60-133)||(12734619-12734691)
chr7 (29-223)||(23125439-23125627)
chr7 (60-337)||(588785-589059)
chr7 (56-99)||(16472303-16472346)
chr7 (29-84)||(33605314-33605369)
chr7 (60-177)||(455253-455367)
chr7 (60-177)||(8002519-8002633)
chr7 (60-177)||(8013164-8013278)
chr7 (64-177)||(9085016-9085126)
chr7 (64-177)||(9094730-9094840)
chr7 (60-177)||(26653779-26653893)
chr7 (60-177)||(26700108-26700222)
chr7 (60-177)||(30049252-30049366)
chr7 (60-177)||(38594165-38594280)
chr7 (60-177)||(40042562-40042676)
chr7 (60-177)||(40053111-40053225)
chr7 (60-148)||(4211770-4211855)
chr7 (59-100)||(11015574-11015615)
chr7 (259-345)||(21211245-21211334)
chr7 (60-113)||(38403665-38403718)
chr7 (63-208)||(9762194-9762337)
chr7 (60-99)||(540892-540931)
chr7 (60-99)||(1367437-1367476)
chr7 (60-99)||(3165542-3165581)
chr7 (60-99)||(5685326-5685365)
chr7 (60-99)||(11095861-11095900)
chr7 (60-99)||(15888782-15888821)
chr7 (60-99)||(21770396-21770435)
chr7 (60-99)||(44280302-44280341)
chr7 (60-177)||(8617118-8617232)
chr7 (29-99)||(25807007-25807076)
chr7 (29-83)||(41842745-41842799)
chr7 (59-100)||(1878762-1878803)
chr7 (59-100)||(12222937-12222978)
chr7 (163-223)||(13172928-13172988)
chr7 (65-148)||(40055212-40055292)
chr7 (60-99)||(9433071-9433110)
chr7 (60-99)||(9443667-9443706)
chr7 (60-131)||(13682095-13682165)
chr7 (60-99)||(14746123-14746162)
chr7 (60-99)||(20989460-20989499)
chr7 (60-99)||(21003462-21003501)
chr7 (60-99)||(31116964-31117003)
chr7 (59-100)||(15871582-15871623)
chr7 (77-122)||(19416856-19416900)
chr7 (60-97)||(20490816-20490853)
chr7 (63-99)||(9159538-9159574)
chr7 (63-99)||(9169993-9170029)
chr7 (68-122)||(9065097-9065151)
chr7 (29-68)||(48237341-48237380)
chr7 (65-177)||(13263320-13263426)
chr7 (135-177)||(22579823-22579865)
chr7 (136-184)||(4447066-4447114)
chr7 (197-225)||(8182478-8182506)
[»] chr1 (165 HSPs)
chr1 (29-352)||(23024157-23024480)
chr1 (29-355)||(21121457-21121783)
chr1 (29-355)||(21215069-21215395)
chr1 (29-355)||(46088350-46088676)
chr1 (29-352)||(21205265-21205588)
chr1 (29-348)||(21983964-21984283)
chr1 (29-355)||(44824154-44824478)
chr1 (29-354)||(21702177-21702501)
chr1 (56-349)||(42284008-42284301)
chr1 (31-355)||(21135555-21135878)
chr1 (29-349)||(37640376-37640697)
chr1 (29-355)||(10250350-10250673)
chr1 (43-352)||(25448963-25449274)
chr1 (29-355)||(48570623-48570947)
chr1 (29-349)||(29215163-29215482)
chr1 (29-355)||(14263823-14264153)
chr1 (29-337)||(23036899-23037206)
chr1 (29-355)||(30571561-30571884)
chr1 (29-337)||(1577246-1577553)
chr1 (29-337)||(16235701-16236007)
chr1 (29-334)||(2834068-2834374)
chr1 (29-352)||(19214976-19215300)
chr1 (29-337)||(7309197-7309506)
chr1 (29-345)||(33256742-33257060)
chr1 (29-345)||(33276914-33277232)
chr1 (29-337)||(10756803-10757112)
chr1 (29-337)||(22153234-22153544)
chr1 (29-337)||(32786332-32786639)
chr1 (29-337)||(36133583-36133889)
chr1 (29-352)||(2327829-2328151)
chr1 (52-337)||(22427753-22428039)
chr1 (29-337)||(12283801-12284112)
chr1 (29-337)||(22600584-22600887)
chr1 (29-295)||(35039588-35039853)
chr1 (44-336)||(22202141-22202434)
chr1 (29-336)||(1899727-1900031)
chr1 (43-352)||(2266464-2266770)
chr1 (29-337)||(12624946-12625254)
chr1 (29-337)||(38281945-38282251)
chr1 (29-337)||(21192257-21192566)
chr1 (29-336)||(30892474-30892782)
chr1 (29-337)||(26702521-26702831)
chr1 (38-333)||(22465211-22465507)
chr1 (29-271)||(2267977-2268217)
chr1 (44-309)||(17025370-17025638)
chr1 (29-208)||(19717031-19717210)
chr1 (29-272)||(18614364-18614604)
chr1 (29-233)||(18896986-18897187)
chr1 (60-337)||(34255939-34256219)
chr1 (29-337)||(20908790-20909097)
chr1 (34-337)||(17017970-17018263)
chr1 (29-177)||(21028336-21028482)
chr1 (60-337)||(19170748-19171028)
chr1 (29-177)||(48703743-48703890)
chr1 (60-337)||(17370420-17370700)
chr1 (30-237)||(20110342-20110546)
chr1 (29-161)||(14293076-14293206)
chr1 (60-337)||(23926441-23926722)
chr1 (29-163)||(27858296-27858428)
chr1 (60-337)||(26548679-26548959)
chr1 (60-208)||(22642407-22642553)
chr1 (60-337)||(28379372-28379653)
chr1 (29-163)||(23053928-23054057)
chr1 (47-306)||(26280461-26280716)
chr1 (60-177)||(20251319-20251434)
chr1 (63-266)||(22018785-22018987)
chr1 (208-337)||(38281764-38281892)
chr1 (197-339)||(48703640-48703783)
chr1 (29-337)||(16233523-16233824)
chr1 (63-208)||(19037519-19037662)
chr1 (60-184)||(21543575-21543697)
chr1 (60-177)||(28473774-28473889)
chr1 (60-177)||(46181297-46181411)
chr1 (60-208)||(5929221-5929367)
chr1 (29-161)||(18517552-18517682)
chr1 (60-208)||(22654989-22655135)
chr1 (29-118)||(28492793-28492882)
chr1 (60-148)||(52351103-52351189)
chr1 (29-163)||(18130403-18130536)
chr1 (60-131)||(7745504-7745575)
chr1 (197-337)||(14293182-14293325)
chr1 (60-148)||(45071046-45071132)
chr1 (60-175)||(20867271-20867383)
chr1 (60-174)||(22610392-22610503)
chr1 (29-237)||(9346255-9346462)
chr1 (60-177)||(44200560-44200675)
chr1 (60-148)||(20884300-20884385)
chr1 (60-133)||(24029106-24029179)
chr1 (60-133)||(18311390-18311462)
chr1 (29-148)||(31358900-31359012)
chr1 (52-163)||(26703133-26703241)
chr1 (60-131)||(14388544-14388614)
chr1 (60-123)||(41133034-41133097)
chr1 (59-184)||(2819732-2819853)
chr1 (60-177)||(3171298-3171412)
chr1 (60-177)||(3181900-3182014)
chr1 (60-177)||(5640127-5640241)
chr1 (60-177)||(5650684-5650798)
chr1 (60-177)||(5832894-5833008)
chr1 (60-177)||(5843496-5843610)
chr1 (60-177)||(7689876-7689990)
chr1 (60-177)||(10998201-10998315)
chr1 (60-177)||(12614733-12614847)
chr1 (60-177)||(12624198-12624312)
chr1 (60-177)||(12730223-12730337)
chr1 (60-177)||(12740816-12740930)
chr1 (60-177)||(12898398-12898512)
chr1 (60-177)||(12944885-12944999)
chr1 (60-177)||(21863337-21863451)
chr1 (60-177)||(35649108-35649222)
chr1 (60-177)||(38094752-38094866)
chr1 (60-177)||(38105377-38105491)
chr1 (60-177)||(47608348-47608462)
chr1 (60-177)||(47618956-47619070)
chr1 (60-177)||(51629604-51629718)
chr1 (60-177)||(51656865-51656979)
chr1 (61-177)||(35404810-35404923)
chr1 (60-131)||(675165-675235)
chr1 (60-177)||(2538212-2538326)
chr1 (60-177)||(4166935-4167049)
chr1 (60-177)||(4177591-4177705)
chr1 (60-177)||(7506978-7507092)
chr1 (60-177)||(7517575-7517689)
chr1 (59-125)||(18515586-18515652)
chr1 (60-177)||(19178635-19178749)
chr1 (60-177)||(19187514-19187628)
chr1 (60-177)||(33084238-33084352)
chr1 (60-177)||(36236846-36236960)
chr1 (60-177)||(36247393-36247507)
chr1 (60-177)||(21877442-21877557)
chr1 (60-108)||(20196109-20196156)
chr1 (52-163)||(21684469-21684577)
chr1 (60-99)||(148630-148669)
chr1 (60-99)||(154705-154744)
chr1 (60-99)||(5973509-5973548)
chr1 (60-99)||(7677595-7677634)
chr1 (60-99)||(18382320-18382359)
chr1 (60-99)||(20798689-20798728)
chr1 (60-99)||(23580743-23580782)
chr1 (60-99)||(35012679-35012718)
chr1 (60-99)||(35638456-35638495)
chr1 (60-99)||(39194510-39194549)
chr1 (60-99)||(47195013-47195052)
chr1 (60-177)||(11195485-11195599)
chr1 (65-177)||(17956915-17957024)
chr1 (59-96)||(22639898-22639935)
chr1 (63-99)||(8698474-8698510)
chr1 (163-255)||(21543534-21543626)
chr1 (60-99)||(4250981-4251020)
chr1 (290-353)||(7745705-7745767)
chr1 (60-99)||(20441733-20441772)
chr1 (60-99)||(39586721-39586760)
chr1 (65-99)||(9050909-9050943)
chr1 (137-337)||(22642242-22642448)
chr1 (65-184)||(23917364-23917481)
chr1 (252-337)||(28492896-28492982)
chr1 (59-101)||(10153650-10153692)
chr1 (60-90)||(21894963-21894993)
chr1 (312-345)||(2834028-2834061)
chr1 (59-100)||(25398987-25399028)
chr1 (196-224)||(9757092-9757120)
chr1 (197-237)||(12439844-12439884)
chr1 (163-266)||(20251259-20251363)
chr1 (65-120)||(23549809-23549862)
chr1 (279-355)||(26702975-26703049)
[»] chr4 (172 HSPs)
chr4 (29-355)||(17399103-17399429)
chr4 (29-355)||(3105848-3106173)
chr4 (29-355)||(22190202-22190528)
chr4 (29-355)||(27189069-27189398)
chr4 (43-355)||(40860027-40860339)
chr4 (29-355)||(6516844-6517168)
chr4 (29-355)||(9751968-9752294)
chr4 (43-355)||(17701198-17701510)
chr4 (29-352)||(13576545-13576867)
chr4 (29-355)||(3500082-3500405)
chr4 (29-355)||(55731204-55731528)
chr4 (29-355)||(56533489-56533816)
chr4 (29-350)||(20976819-20977141)
chr4 (29-352)||(29120725-29121047)
chr4 (29-352)||(16852863-16853186)
chr4 (29-337)||(22675951-22676259)
chr4 (29-336)||(56033948-56034253)
chr4 (29-355)||(14154423-14154750)
chr4 (29-337)||(45832761-45833067)
chr4 (29-345)||(14605333-14605650)
chr4 (29-337)||(16631814-16632124)
chr4 (29-337)||(54679302-54679610)
chr4 (29-337)||(10072308-10072615)
chr4 (29-352)||(37435969-37436284)
chr4 (29-345)||(6641051-6641367)
chr4 (29-337)||(19665739-19666049)
chr4 (29-306)||(15475572-15475849)
chr4 (52-337)||(55379684-55379969)
chr4 (29-336)||(23749899-23750206)
chr4 (30-286)||(25651525-25651779)
chr4 (29-345)||(12600126-12600441)
chr4 (29-337)||(11915075-11915384)
chr4 (29-337)||(15014814-15015123)
chr4 (29-348)||(16847911-16848230)
chr4 (29-337)||(37986039-37986349)
chr4 (29-337)||(19912307-19912616)
chr4 (135-355)||(16939357-16939576)
chr4 (29-337)||(11900565-11900873)
chr4 (29-237)||(23122996-23123203)
chr4 (29-208)||(29680974-29681153)
chr4 (93-337)||(19610827-19611070)
chr4 (29-208)||(39420163-39420343)
chr4 (55-337)||(41115211-41115494)
chr4 (29-345)||(8685870-8686188)
chr4 (29-337)||(17788466-17788777)
chr4 (166-337)||(19884107-19884278)
chr4 (29-177)||(16939564-16939712)
chr4 (67-337)||(15135103-15135374)
chr4 (165-349)||(38513270-38513454)
chr4 (29-337)||(10661594-10661903)
chr4 (29-337)||(10875739-10876048)
chr4 (29-195)||(8105155-8105320)
chr4 (29-207)||(12811604-12811782)
chr4 (29-273)||(17539840-17540082)
chr4 (29-177)||(3395125-3395272)
chr4 (29-215)||(19621488-19621674)
chr4 (190-352)||(8103644-8103808)
chr4 (29-179)||(14904785-14904934)
chr4 (29-237)||(17057543-17057747)
chr4 (29-147)||(38513442-38513561)
chr4 (136-337)||(16475912-16476115)
chr4 (62-268)||(33377858-33378062)
chr4 (60-266)||(19241700-19241903)
chr4 (44-337)||(19889427-19889716)
chr4 (60-241)||(18007464-18007644)
chr4 (29-147)||(19884267-19884384)
chr4 (228-348)||(39420332-39420452)
chr4 (29-237)||(13890307-13890514)
chr4 (29-337)||(20571427-20571731)
chr4 (60-175)||(16819754-16819867)
chr4 (197-323)||(14904892-14905018)
chr4 (43-122)||(36470418-36470497)
chr4 (60-177)||(1671924-1672039)
chr4 (60-177)||(36210514-36210629)
chr4 (197-337)||(3395024-3395165)
chr4 (29-177)||(14902875-14903021)
chr4 (60-148)||(17994196-17994282)
chr4 (60-175)||(23508884-23508996)
chr4 (29-146)||(2651382-2651496)
chr4 (60-177)||(14711182-14711297)
chr4 (60-177)||(14778846-14778961)
chr4 (60-177)||(18775058-18775173)
chr4 (60-177)||(55651089-55651203)
chr4 (60-147)||(8997659-8997743)
chr4 (29-226)||(18773545-18773741)
chr4 (258-337)||(36470343-36470425)
chr4 (137-336)||(10249309-10249509)
chr4 (29-99)||(13027393-13027463)
chr4 (29-99)||(16324943-16325013)
chr4 (60-223)||(49002360-49002520)
chr4 (60-177)||(4948104-4948218)
chr4 (259-337)||(23120911-23120989)
chr4 (60-177)||(55756242-55756356)
chr4 (39-131)||(21350638-21350731)
chr4 (43-99)||(13693420-13693476)
chr4 (60-177)||(450343-450457)
chr4 (60-177)||(3390221-3390336)
chr4 (60-177)||(5873137-5873251)
chr4 (60-177)||(10740973-10741087)
chr4 (60-177)||(10954742-10954856)
chr4 (277-355)||(14190088-14190166)
chr4 (60-177)||(14844032-14844146)
chr4 (60-177)||(15561458-15561572)
chr4 (29-99)||(18473643-18473713)
chr4 (60-177)||(21996180-21996294)
chr4 (60-177)||(22006778-22006892)
chr4 (60-177)||(24028464-24028578)
chr4 (60-177)||(29042035-29042149)
chr4 (60-177)||(30926873-30926987)
chr4 (60-177)||(36018103-36018217)
chr4 (60-177)||(36028656-36028770)
chr4 (60-177)||(49517902-49518016)
chr4 (60-177)||(55745631-55745745)
chr4 (60-133)||(11535653-11535725)
chr4 (60-133)||(31267171-31267243)
chr4 (60-227)||(17917770-17917933)
chr4 (60-227)||(17928418-17928581)
chr4 (60-177)||(16255632-16255747)
chr4 (60-177)||(16266225-16266340)
chr4 (60-177)||(460924-461038)
chr4 (60-177)||(3370481-3370596)
chr4 (61-131)||(4986790-4986859)
chr4 (61-131)||(4987084-4987153)
chr4 (60-177)||(10751547-10751661)
chr4 (60-177)||(10965316-10965430)
chr4 (60-177)||(19955341-19955455)
chr4 (29-99)||(20576902-20576972)
chr4 (60-177)||(24640015-24640129)
chr4 (60-177)||(27656367-27656481)
chr4 (60-177)||(27666940-27667054)
chr4 (60-177)||(30937451-30937565)
chr4 (60-133)||(11514843-11514915)
chr4 (63-132)||(24713240-24713308)
chr4 (60-133)||(39532175-39532247)
chr4 (59-99)||(18394154-18394194)
chr4 (252-337)||(18473441-18473527)
chr4 (78-145)||(18775816-18775881)
chr4 (60-99)||(10695482-10695521)
chr4 (60-99)||(10909249-10909288)
chr4 (60-99)||(14836481-14836520)
chr4 (60-99)||(15207766-15207805)
chr4 (60-99)||(18130618-18130657)
chr4 (60-99)||(19581082-19581121)
chr4 (60-99)||(27815324-27815363)
chr4 (60-99)||(48370973-48371012)
chr4 (60-98)||(1674476-1674514)
chr4 (29-99)||(17526812-17526880)
chr4 (60-177)||(18752868-18752982)
chr4 (60-177)||(18763478-18763592)
chr4 (60-177)||(19944706-19944820)
chr4 (68-133)||(10300343-10300407)
chr4 (60-101)||(52703628-52703669)
chr4 (63-99)||(16304948-16304984)
chr4 (63-99)||(16317172-16317208)
chr4 (63-337)||(40454731-40455002)
chr4 (60-99)||(5022578-5022617)
chr4 (60-99)||(18078285-18078324)
chr4 (259-337)||(29681173-29681253)
chr4 (60-99)||(47152457-47152496)
chr4 (29-99)||(7222121-7222190)
chr4 (252-337)||(18773469-18773553)
chr4 (63-99)||(40470969-40471005)
chr4 (63-177)||(25656902-25657013)
chr4 (277-355)||(13693204-13693280)
chr4 (135-177)||(19555904-19555946)
chr4 (279-337)||(22089660-22089717)
chr4 (63-93)||(24619269-24619299)
chr4 (120-335)||(16325019-16325230)
chr4 (312-345)||(17246996-17247029)
chr4 (135-235)||(17538814-17538914)
chr4 (276-337)||(19580847-19580907)
chr4 (197-225)||(8105185-8105213)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (29-351)||(210767-211088)
scaffold0004 (56-352)||(377995-378293)
scaffold0004 (29-333)||(219624-219928)
scaffold0004 (29-337)||(244703-245011)
scaffold0004 (29-235)||(87890-88093)
[»] chr6 (171 HSPs)
chr6 (29-349)||(19066479-19066799)
chr6 (29-355)||(33352689-33353014)
chr6 (29-355)||(12422626-12422950)
chr6 (29-355)||(19482114-19482441)
chr6 (29-355)||(26588960-26589287)
chr6 (29-337)||(9717223-9717530)
chr6 (32-336)||(19085539-19085845)
chr6 (29-337)||(12715882-12716192)
chr6 (29-355)||(21617608-21617932)
chr6 (29-352)||(20731166-20731487)
chr6 (29-352)||(16876269-16876592)
chr6 (29-345)||(21624463-21624777)
chr6 (29-337)||(32543645-32543952)
chr6 (29-352)||(22801505-22801827)
chr6 (50-352)||(21234524-21234825)
chr6 (29-337)||(13601546-13601856)
chr6 (29-352)||(15954063-15954384)
chr6 (34-337)||(15301595-15301899)
chr6 (29-352)||(17380942-17381264)
chr6 (29-337)||(19952033-19952339)
chr6 (44-337)||(19623359-19623654)
chr6 (29-337)||(15532087-15532394)
chr6 (29-345)||(19688155-19688467)
chr6 (29-345)||(29917399-29917704)
chr6 (29-337)||(14100899-14101207)
chr6 (29-345)||(19470039-19470355)
chr6 (29-337)||(24116207-24116518)
chr6 (29-337)||(7763032-7763342)
chr6 (29-345)||(18434910-18435228)
chr6 (29-337)||(25593448-25593758)
chr6 (29-333)||(26941819-26942125)
chr6 (96-337)||(18377822-18378062)
chr6 (123-352)||(19833533-19833761)
chr6 (90-336)||(15986734-15986980)
chr6 (29-333)||(16914808-16915113)
chr6 (29-237)||(29597556-29597762)
chr6 (29-345)||(19625182-19625499)
chr6 (29-337)||(17927172-17927479)
chr6 (29-337)||(25592002-25592307)
chr6 (29-337)||(25929858-25930165)
chr6 (135-337)||(13435265-13435465)
chr6 (29-337)||(12347472-12347778)
chr6 (60-355)||(14070562-14070860)
chr6 (165-355)||(17317091-17317281)
chr6 (30-177)||(22076868-22077014)
chr6 (166-337)||(10631514-10631684)
chr6 (60-349)||(14051881-14052163)
chr6 (102-333)||(17303807-17304037)
chr6 (29-147)||(10631673-10631791)
chr6 (29-147)||(17316985-17317103)
chr6 (197-355)||(22077004-22077161)
chr6 (29-161)||(20113158-20113288)
chr6 (29-237)||(17446115-17446320)
chr6 (29-145)||(16265612-16265727)
chr6 (60-337)||(20635101-20635381)
chr6 (29-163)||(21034546-21034677)
chr6 (60-333)||(22386188-22386464)
chr6 (29-178)||(7811555-7811701)
chr6 (29-161)||(23296283-23296414)
chr6 (165-337)||(14732712-14732887)
chr6 (194-337)||(16528690-16528836)
chr6 (60-241)||(11235129-11235309)
chr6 (60-337)||(21127611-21127890)
chr6 (29-237)||(32335320-32335524)
chr6 (29-237)||(16463113-16463320)
chr6 (32-345)||(24728986-24729296)
chr6 (60-234)||(17608796-17608968)
chr6 (34-148)||(15395152-15395264)
chr6 (60-337)||(7586646-7586925)
chr6 (60-177)||(31931119-31931233)
chr6 (37-345)||(18226803-18227104)
chr6 (197-333)||(20113264-20113402)
chr6 (38-345)||(18172698-18172998)
chr6 (60-175)||(18554968-18555080)
chr6 (60-177)||(11205641-11205756)
chr6 (60-177)||(17063896-17064010)
chr6 (32-337)||(24719204-24719502)
chr6 (60-145)||(25518416-25518499)
chr6 (60-266)||(19453011-19453216)
chr6 (60-146)||(19289766-19289850)
chr6 (60-177)||(17047255-17047370)
chr6 (29-134)||(19875419-19875523)
chr6 (60-175)||(12953516-12953628)
chr6 (64-266)||(22308396-22308596)
chr6 (63-266)||(25687137-25687337)
chr6 (29-113)||(23230793-23230877)
chr6 (29-163)||(25595734-25595864)
chr6 (29-148)||(26185291-26185407)
chr6 (60-131)||(9934057-9934127)
chr6 (29-99)||(15551607-15551677)
chr6 (30-100)||(31127771-31127840)
chr6 (60-145)||(17742088-17742171)
chr6 (60-148)||(25735942-25736027)
chr6 (60-133)||(29765276-29765347)
chr6 (60-223)||(3661036-3661195)
chr6 (60-223)||(3671700-3671859)
chr6 (29-97)||(24398393-24398461)
chr6 (60-177)||(4630569-4630683)
chr6 (52-106)||(10705017-10705071)
chr6 (60-177)||(12717220-12717334)
chr6 (60-177)||(12727869-12727983)
chr6 (60-177)||(12854719-12854833)
chr6 (60-177)||(12865245-12865359)
chr6 (60-177)||(25985780-25985894)
chr6 (60-177)||(26025157-26025271)
chr6 (60-177)||(26035731-26035845)
chr6 (60-177)||(26864484-26864598)
chr6 (60-177)||(26875108-26875222)
chr6 (60-177)||(27341392-27341506)
chr6 (60-177)||(27402132-27402246)
chr6 (60-177)||(27412791-27412905)
chr6 (60-177)||(31983010-31983124)
chr6 (60-177)||(32301427-32301541)
chr6 (60-177)||(32312116-32312230)
chr6 (60-177)||(32962318-32962432)
chr6 (60-177)||(32972937-32973051)
chr6 (60-177)||(34807544-34807658)
chr6 (60-177)||(34818176-34818290)
chr6 (60-223)||(7751619-7751778)
chr6 (60-337)||(18835018-18835292)
chr6 (64-177)||(16930149-16930259)
chr6 (64-177)||(16959320-16959430)
chr6 (60-177)||(17982885-17982999)
chr6 (60-177)||(17985094-17985208)
chr6 (60-177)||(29384450-29384564)
chr6 (60-177)||(33199026-33199140)
chr6 (31-163)||(15478246-15478373)
chr6 (65-177)||(16123924-16124034)
chr6 (60-133)||(17746168-17746240)
chr6 (60-133)||(27166827-27166898)
chr6 (60-101)||(31543280-31543321)
chr6 (60-133)||(31572155-31572226)
chr6 (60-132)||(5844827-5844898)
chr6 (60-132)||(18826623-18826693)
chr6 (60-99)||(4292498-4292537)
chr6 (60-99)||(7376142-7376181)
chr6 (60-99)||(9112879-9112918)
chr6 (60-99)||(9123516-9123555)
chr6 (60-99)||(11147634-11147673)
chr6 (290-337)||(12041231-12041278)
chr6 (60-99)||(12353328-12353367)
chr6 (60-99)||(12827465-12827504)
chr6 (56-148)||(14923699-14923788)
chr6 (60-99)||(18926148-18926187)
chr6 (60-99)||(20030288-20030327)
chr6 (60-99)||(20063039-20063078)
chr6 (60-99)||(25787474-25787513)
chr6 (189-239)||(7811524-7811574)
chr6 (60-177)||(26043910-26044024)
chr6 (277-337)||(3680493-3680552)
chr6 (55-122)||(31720106-31720174)
chr6 (197-337)||(23296166-23296307)
chr6 (60-99)||(27372605-27372644)
chr6 (60-99)||(27462955-27462994)
chr6 (60-99)||(27504118-27504157)
chr6 (60-99)||(27505715-27505754)
chr6 (60-99)||(28251947-28251986)
chr6 (60-99)||(28357094-28357133)
chr6 (65-132)||(32757139-32757205)
chr6 (252-337)||(29537992-29538079)
chr6 (147-208)||(3680593-3680654)
chr6 (60-184)||(18027211-18027331)
chr6 (60-223)||(27384087-27384245)
chr6 (278-345)||(15395333-15395399)
chr6 (60-99)||(27474619-27474658)
chr6 (321-355)||(16333103-16333137)
chr6 (135-237)||(19490410-19490512)
chr6 (135-176)||(22077002-22077043)
chr6 (137-177)||(10631613-10631653)
chr6 (197-237)||(21689401-21689441)
chr6 (60-123)||(24480948-24481008)
[»] chr2 (166 HSPs)
chr2 (29-337)||(22786072-22786380)
chr2 (29-355)||(22782032-22782358)
chr2 (29-355)||(44839790-44840116)
chr2 (32-355)||(40331467-40331789)
chr2 (29-355)||(28551336-28551662)
chr2 (43-355)||(45087413-45087725)
chr2 (29-355)||(34322353-34322675)
chr2 (29-345)||(22316959-22317274)
chr2 (29-349)||(30557738-30558060)
chr2 (29-333)||(22188520-22188824)
chr2 (37-355)||(1587458-1587775)
chr2 (29-337)||(13964396-13964699)
chr2 (85-355)||(16494704-16494974)
chr2 (29-319)||(33073621-33073909)
chr2 (29-352)||(20152418-20152742)
chr2 (29-337)||(24575409-24575719)
chr2 (43-355)||(22801828-22802139)
chr2 (29-349)||(28701630-28701949)
chr2 (29-337)||(28712116-28712423)
chr2 (29-337)||(23234384-23234690)
chr2 (29-337)||(24376481-24376789)
chr2 (29-337)||(38780772-38781079)
chr2 (29-337)||(19539791-19540100)
chr2 (29-337)||(20569166-20569476)
chr2 (29-352)||(31328380-31328703)
chr2 (29-352)||(31335101-31335424)
chr2 (29-337)||(22257576-22257885)
chr2 (29-333)||(31801305-31801610)
chr2 (29-319)||(14580958-14581241)
chr2 (112-355)||(40331144-40331387)
chr2 (29-337)||(25188773-25189082)
chr2 (29-337)||(39038058-39038367)
chr2 (29-337)||(10010167-10010477)
chr2 (44-337)||(40781851-40782145)
chr2 (29-332)||(24778752-24779058)
chr2 (29-337)||(28141018-28141327)
chr2 (32-334)||(35744399-35744698)
chr2 (29-333)||(23184719-23185023)
chr2 (29-333)||(23595982-23596286)
chr2 (29-337)||(18702115-18702424)
chr2 (29-337)||(24851082-24851388)
chr2 (37-337)||(25037686-25037987)
chr2 (29-325)||(17963684-17963980)
chr2 (29-337)||(18431354-18431663)
chr2 (29-337)||(22271505-22271815)
chr2 (29-337)||(24843580-24843888)
chr2 (29-208)||(6392139-6392317)
chr2 (29-177)||(22776654-22776802)
chr2 (29-221)||(26619517-26619707)
chr2 (29-199)||(21537668-21537835)
chr2 (166-352)||(6574651-6574837)
chr2 (60-355)||(1083370-1083668)
chr2 (60-337)||(23393114-23393393)
chr2 (163-337)||(22455507-22455685)
chr2 (163-336)||(41122235-41122411)
chr2 (29-237)||(10898940-10899138)
chr2 (29-147)||(22455405-22455521)
chr2 (29-147)||(6574545-6574662)
chr2 (60-268)||(24814961-24815167)
chr2 (163-345)||(26366957-26367141)
chr2 (29-205)||(19114593-19114767)
chr2 (60-268)||(24801994-24802200)
chr2 (167-337)||(25828537-25828707)
chr2 (29-152)||(44880730-44880851)
chr2 (60-241)||(20647003-20647183)
chr2 (29-133)||(26366855-26366959)
chr2 (87-237)||(20567636-20567783)
chr2 (37-147)||(41122141-41122249)
chr2 (60-208)||(19356010-19356155)
chr2 (44-147)||(25828697-25828800)
chr2 (60-177)||(19300404-19300519)
chr2 (52-184)||(21911303-21911433)
chr2 (60-177)||(19498384-19498499)
chr2 (60-148)||(19313411-19313497)
chr2 (29-237)||(22382958-22383165)
chr2 (60-265)||(22763288-22763490)
chr2 (60-177)||(22755010-22755125)
chr2 (228-340)||(6392035-6392150)
chr2 (46-163)||(21845709-21845824)
chr2 (29-163)||(25918266-25918397)
chr2 (60-133)||(1088946-1089019)
chr2 (60-266)||(22773991-22774194)
chr2 (29-108)||(24441133-24441212)
chr2 (63-173)||(38033228-38033336)
chr2 (60-177)||(39170487-39170601)
chr2 (60-266)||(967896-968099)
chr2 (60-337)||(17970662-17970936)
chr2 (60-227)||(24338796-24338959)
chr2 (29-96)||(24157432-24157499)
chr2 (201-309)||(27296842-27296954)
chr2 (60-177)||(1099587-1099701)
chr2 (60-177)||(4220203-4220317)
chr2 (60-177)||(7006199-7006313)
chr2 (60-177)||(9763160-9763274)
chr2 (60-177)||(9773696-9773810)
chr2 (60-177)||(10266716-10266830)
chr2 (60-177)||(10277293-10277407)
chr2 (60-177)||(11389201-11389315)
chr2 (60-177)||(11395564-11395678)
chr2 (60-177)||(11405880-11405994)
chr2 (60-177)||(18393029-18393143)
chr2 (60-177)||(22915256-22915370)
chr2 (60-177)||(22960724-22960838)
chr2 (60-145)||(24274779-24274861)
chr2 (60-177)||(24328126-24328240)
chr2 (60-177)||(32217596-32217710)
chr2 (60-177)||(34790609-34790723)
chr2 (60-177)||(34804752-34804866)
chr2 (60-177)||(35263313-35263427)
chr2 (60-177)||(35273938-35274052)
chr2 (60-132)||(27978774-27978845)
chr2 (60-132)||(28065303-28065374)
chr2 (60-177)||(35252704-35252818)
chr2 (263-337)||(21537835-21537911)
chr2 (60-177)||(4099536-4099650)
chr2 (60-177)||(4209611-4209725)
chr2 (60-177)||(9897966-9898080)
chr2 (60-177)||(17857829-17857943)
chr2 (194-337)||(24838480-24838624)
chr2 (60-177)||(27221103-27221217)
chr2 (60-177)||(29254523-29254637)
chr2 (60-177)||(30489216-30489330)
chr2 (60-177)||(34477651-34477765)
chr2 (60-177)||(43345130-43345244)
chr2 (60-177)||(43354745-43354859)
chr2 (59-100)||(22525274-22525315)
chr2 (60-101)||(29244017-29244058)
chr2 (290-355)||(31968460-31968525)
chr2 (59-99)||(15671057-15671097)
chr2 (60-108)||(17969602-17969650)
chr2 (60-99)||(1041946-1041985)
chr2 (60-99)||(2561285-2561324)
chr2 (56-99)||(14794303-14794346)
chr2 (60-99)||(16768740-16768779)
chr2 (60-99)||(18769297-18769336)
chr2 (60-99)||(21650923-21650962)
chr2 (60-99)||(24415413-24415452)
chr2 (60-99)||(24427978-24428017)
chr2 (65-132)||(38586484-38586550)
chr2 (60-177)||(40222054-40222169)
chr2 (60-99)||(43082451-43082490)
chr2 (60-99)||(43093060-43093099)
chr2 (60-177)||(9908554-9908668)
chr2 (65-148)||(14866833-14866913)
chr2 (60-177)||(36252236-36252350)
chr2 (60-177)||(36785191-36785305)
chr2 (259-333)||(44880654-44880731)
chr2 (29-85)||(9015786-9015842)
chr2 (63-99)||(28732297-28732333)
chr2 (60-99)||(21172858-21172897)
chr2 (225-337)||(26623064-26623179)
chr2 (60-99)||(26866869-26866908)
chr2 (60-99)||(26879458-26879497)
chr2 (59-98)||(27939600-27939639)
chr2 (60-177)||(40250915-40251030)
chr2 (63-100)||(33240295-33240332)
chr2 (63-100)||(33248216-33248253)
chr2 (59-100)||(40202837-40202878)
chr2 (63-99)||(28721711-28721747)
chr2 (56-99)||(19320844-19320887)
chr2 (65-122)||(27746267-27746322)
chr2 (59-96)||(22683010-22683047)
chr2 (312-345)||(38631120-38631153)
chr2 (197-225)||(6392182-6392210)
chr2 (197-225)||(22776762-22776790)
chr2 (197-237)||(26619623-26619662)
[»] chr3 (269 HSPs)
chr3 (29-355)||(40850338-40850664)
chr3 (29-355)||(9700508-9700835)
chr3 (29-355)||(21640228-21640554)
chr3 (42-355)||(2025450-2025762)
chr3 (29-351)||(30054652-30054973)
chr3 (29-349)||(1728487-1728807)
chr3 (29-352)||(50299599-50299921)
chr3 (29-352)||(40799262-40799584)
chr3 (29-355)||(33582593-33582918)
chr3 (29-309)||(2784472-2784753)
chr3 (29-352)||(29854770-29855096)
chr3 (29-349)||(20627905-20628224)
chr3 (29-337)||(28581485-28581792)
chr3 (29-337)||(31302728-31303034)
chr3 (29-355)||(5212940-5213265)
chr3 (29-352)||(47207069-47207391)
chr3 (29-355)||(14954791-14955116)
chr3 (29-337)||(38178116-38178422)
chr3 (71-355)||(49669003-49669286)
chr3 (29-352)||(53057201-53057523)
chr3 (99-355)||(2782840-2783096)
chr3 (31-337)||(3238071-3238378)
chr3 (29-337)||(13823446-13823753)
chr3 (29-352)||(47405894-47406216)
chr3 (29-337)||(17239393-17239702)
chr3 (29-349)||(11222930-11223251)
chr3 (29-337)||(13781056-13781366)
chr3 (29-337)||(46350317-46350626)
chr3 (29-336)||(49643232-49643541)
chr3 (29-337)||(2560565-2560874)
chr3 (29-333)||(20645537-20645842)
chr3 (29-337)||(17667785-17668092)
chr3 (29-337)||(6090106-6090417)
chr3 (29-337)||(12963555-12963865)
chr3 (29-337)||(49553972-49554276)
chr3 (29-336)||(22804492-22804801)
chr3 (29-337)||(12726702-12727015)
chr3 (29-337)||(18122085-18122392)
chr3 (29-332)||(14968748-14969044)
chr3 (29-337)||(41494378-41494685)
chr3 (29-337)||(29951908-29952216)
chr3 (29-307)||(8874590-8874871)
chr3 (29-337)||(30001062-30001370)
chr3 (29-337)||(16031975-16032283)
chr3 (29-237)||(46796839-46797045)
chr3 (29-337)||(15902575-15902884)
chr3 (37-277)||(14393482-14393722)
chr3 (29-233)||(24776004-24776206)
chr3 (29-209)||(52919944-52920122)
chr3 (135-355)||(21638851-21639070)
chr3 (29-207)||(13947847-13948025)
chr3 (29-337)||(26418146-26418456)
chr3 (29-345)||(12967679-12967996)
chr3 (29-335)||(12396450-12396755)
chr3 (29-337)||(23538634-23538943)
chr3 (123-349)||(11222182-11222409)
chr3 (141-332)||(1241670-1241860)
chr3 (29-195)||(22140286-22140451)
chr3 (29-337)||(20724467-20724776)
chr3 (29-177)||(21606126-21606274)
chr3 (29-337)||(6252800-6253108)
chr3 (29-333)||(6174719-6175024)
chr3 (60-337)||(12753122-12753403)
chr3 (60-337)||(13953642-13953922)
chr3 (197-355)||(46797036-46797193)
chr3 (197-350)||(22463672-22463825)
chr3 (197-350)||(22465130-22465283)
chr3 (30-165)||(22463565-22463700)
chr3 (30-165)||(22465023-22465158)
chr3 (60-237)||(15961132-15961307)
chr3 (32-177)||(21638718-21638863)
chr3 (60-337)||(11909541-11909822)
chr3 (169-345)||(25398867-25399042)
chr3 (29-177)||(52283271-52283418)
chr3 (29-206)||(12389342-12389518)
chr3 (29-220)||(11867772-11867955)
chr3 (29-237)||(14077791-14077996)
chr3 (60-337)||(15832787-15833067)
chr3 (165-337)||(22128457-22128627)
chr3 (60-337)||(49989640-49989920)
chr3 (29-234)||(10851295-10851497)
chr3 (29-147)||(22128615-22128732)
chr3 (29-219)||(14007065-14007251)
chr3 (56-177)||(17697159-17697278)
chr3 (157-337)||(19889512-19889692)
chr3 (60-266)||(17006648-17006853)
chr3 (29-133)||(19249883-19249986)
chr3 (197-352)||(52283154-52283311)
chr3 (60-177)||(10528889-10529004)
chr3 (29-119)||(16659089-16659179)
chr3 (60-337)||(31114363-31114642)
chr3 (29-177)||(8729458-8729604)
chr3 (29-177)||(9081345-9081491)
chr3 (60-266)||(51989522-51989725)
chr3 (60-223)||(15848700-15848861)
chr3 (60-266)||(22150700-22150905)
chr3 (201-345)||(13939267-13939412)
chr3 (29-237)||(19198351-19198555)
chr3 (60-184)||(37412143-37412265)
chr3 (60-224)||(51340508-51340670)
chr3 (29-184)||(13698904-13699056)
chr3 (148-337)||(14063577-14063769)
chr3 (29-117)||(25398728-25398816)
chr3 (189-355)||(37411997-37412168)
chr3 (43-159)||(7833113-7833226)
chr3 (60-148)||(13147838-13147924)
chr3 (209-337)||(11189392-11189519)
chr3 (29-129)||(18143217-18143316)
chr3 (60-177)||(14580887-14581003)
chr3 (163-337)||(45862160-45862340)
chr3 (148-309)||(16659181-16659346)
chr3 (29-177)||(14072240-14072384)
chr3 (60-184)||(45862089-45862211)
chr3 (60-266)||(41045197-41045402)
chr3 (34-163)||(13410523-13410650)
chr3 (60-145)||(2246144-2246227)
chr3 (60-145)||(13199619-13199702)
chr3 (29-131)||(19889413-19889515)
chr3 (60-177)||(27172583-27172697)
chr3 (29-113)||(16811743-16811828)
chr3 (44-237)||(16879498-16879689)
chr3 (60-145)||(15651445-15651527)
chr3 (60-145)||(15663080-15663162)
chr3 (60-177)||(17017544-17017659)
chr3 (60-148)||(21735885-21735970)
chr3 (57-163)||(21317075-21317179)
chr3 (29-337)||(4243591-4243895)
chr3 (60-177)||(16076676-16076790)
chr3 (60-177)||(24659648-24659762)
chr3 (193-309)||(19249985-19250104)
chr3 (60-335)||(29933934-29934207)
chr3 (60-355)||(29947720-29948013)
chr3 (60-335)||(29983088-29983361)
chr3 (60-355)||(29996874-29997167)
chr3 (29-163)||(13931516-13931645)
chr3 (60-131)||(29906555-29906625)
chr3 (43-177)||(37759417-37759548)
chr3 (137-355)||(51340342-51340565)
chr3 (60-177)||(504541-504655)
chr3 (60-177)||(526907-527021)
chr3 (60-177)||(4743486-4743600)
chr3 (60-177)||(4754073-4754187)
chr3 (60-177)||(5866069-5866183)
chr3 (60-177)||(5876668-5876782)
chr3 (60-177)||(6180901-6181015)
chr3 (60-177)||(6221075-6221189)
chr3 (60-177)||(8774405-8774519)
chr3 (60-177)||(10098816-10098930)
chr3 (60-177)||(12287352-12287467)
chr3 (60-177)||(12297174-12297289)
chr3 (60-177)||(13121410-13121524)
chr3 (60-177)||(13131652-13131766)
chr3 (60-177)||(13373039-13373153)
chr3 (60-177)||(13383633-13383747)
chr3 (60-177)||(13394227-13394341)
chr3 (60-177)||(14465339-14465453)
chr3 (60-177)||(14475969-14476083)
chr3 (60-177)||(16385823-16385937)
chr3 (29-91)||(16811827-16811889)
chr3 (60-177)||(18483792-18483906)
chr3 (60-177)||(20684152-20684266)
chr3 (60-177)||(20720861-20720975)
chr3 (60-177)||(23647497-23647611)
chr3 (60-177)||(24383892-24384006)
chr3 (60-177)||(24670228-24670342)
chr3 (60-177)||(35187125-35187239)
chr3 (60-177)||(38194472-38194586)
chr3 (60-177)||(38205008-38205122)
chr3 (60-177)||(39371801-39371915)
chr3 (60-177)||(39382438-39382552)
chr3 (60-177)||(41683426-41683540)
chr3 (60-177)||(41693995-41694109)
chr3 (60-133)||(8740499-8740571)
chr3 (56-147)||(16881860-16881949)
chr3 (60-148)||(17961122-17961207)
chr3 (60-176)||(20673567-20673680)
chr3 (29-78)||(49666877-49666926)
chr3 (60-223)||(16671536-16671695)
chr3 (60-266)||(17281808-17282011)
chr3 (60-132)||(27883173-27883244)
chr3 (228-333)||(52919848-52919956)
chr3 (60-337)||(9381031-9381305)
chr3 (60-177)||(4175130-4175244)
chr3 (60-177)||(5510444-5510558)
chr3 (60-177)||(5520622-5520736)
chr3 (60-177)||(5537394-5537508)
chr3 (60-177)||(5547978-5548092)
chr3 (60-177)||(5580007-5580121)
chr3 (60-177)||(5628391-5628505)
chr3 (60-177)||(11272757-11272871)
chr3 (60-177)||(13557322-13557436)
chr3 (60-177)||(18006039-18006152)
chr3 (60-177)||(19778133-19778247)
chr3 (60-177)||(19788770-19788884)
chr3 (60-177)||(23757046-23757160)
chr3 (60-177)||(23767642-23767756)
chr3 (60-177)||(37866193-37866307)
chr3 (60-177)||(37885326-37885440)
chr3 (60-148)||(8785019-8785104)
chr3 (60-133)||(9006882-9006954)
chr3 (65-177)||(28168829-28168938)
chr3 (60-108)||(1053522-1053570)
chr3 (60-177)||(28325221-28325334)
chr3 (60-266)||(39673256-39673460)
chr3 (60-99)||(7794980-7795019)
chr3 (60-99)||(7804891-7804930)
chr3 (60-99)||(9391577-9391616)
chr3 (60-99)||(9535432-9535471)
chr3 (56-99)||(11078307-11078350)
chr3 (60-99)||(11206447-11206486)
chr3 (60-99)||(11217098-11217137)
chr3 (60-99)||(14258437-14258476)
chr3 (65-132)||(14322070-14322136)
chr3 (60-99)||(28314605-28314644)
chr3 (60-99)||(29461586-29461625)
chr3 (60-99)||(29472438-29472477)
chr3 (60-99)||(38314516-38314555)
chr3 (60-99)||(48337064-48337103)
chr3 (61-99)||(933450-933488)
chr3 (60-177)||(6501376-6501490)
chr3 (60-177)||(9982258-9982372)
chr3 (60-177)||(9994266-9994380)
chr3 (60-177)||(12237986-12238100)
chr3 (165-223)||(22770435-22770493)
chr3 (63-100)||(1463905-1463942)
chr3 (60-133)||(8996330-8996402)
chr3 (65-177)||(13262051-13262160)
chr3 (213-337)||(15848521-15848650)
chr3 (60-108)||(1063951-1063999)
chr3 (60-96)||(1784444-1784480)
chr3 (63-99)||(11163652-11163688)
chr3 (63-99)||(24706931-24706967)
chr3 (312-355)||(2783230-2783273)
chr3 (60-99)||(4404095-4404134)
chr3 (60-99)||(4433582-4433621)
chr3 (60-99)||(10627314-10627353)
chr3 (60-99)||(10655636-10655675)
chr3 (60-99)||(12249812-12249851)
chr3 (60-99)||(19887727-19887766)
chr3 (60-99)||(23635532-23635571)
chr3 (52-99)||(50721727-50721774)
chr3 (52-99)||(50791075-50791122)
chr3 (68-184)||(932382-932493)
chr3 (60-177)||(6490722-6490836)
chr3 (59-148)||(12410297-12410382)
chr3 (29-95)||(22766988-22767052)
chr3 (29-95)||(27849808-27849873)
chr3 (59-100)||(17769492-17769533)
chr3 (59-100)||(19070793-19070834)
chr3 (60-96)||(1794857-1794893)
chr3 (277-337)||(11078135-11078194)
chr3 (277-337)||(21316933-21316992)
chr3 (90-177)||(22770393-22770477)
chr3 (290-337)||(15651707-15651753)
chr3 (60-99)||(17910375-17910414)
chr3 (29-148)||(16305619-16305732)
chr3 (276-338)||(29472652-29472713)
chr3 (189-218)||(17697148-17697177)
chr3 (290-355)||(17960971-17961035)
chr3 (307-352)||(24776207-24776252)
chr3 (276-337)||(27849604-27849664)
chr3 (163-266)||(10528829-10528933)
chr3 (277-337)||(13410758-13410817)
chr3 (277-337)||(13698784-13698843)
chr3 (163-266)||(17017484-17017588)
chr3 (65-112)||(19643907-19643952)
chr3 (137-177)||(22128555-22128595)
chr3 (197-237)||(22140305-22140344)
chr3 (197-237)||(52919977-52920016)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (29-355)||(11559-11886)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (29-355)||(16139-16464)
scaffold0247 (29-220)||(25799-25990)
scaffold0247 (197-225)||(25907-25935)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (29-355)||(65828-66153)
scaffold0011 (31-355)||(144875-145198)
scaffold0011 (102-345)||(165125-165372)
scaffold0011 (29-234)||(59046-59248)
scaffold0011 (59-96)||(251224-251261)
[»] chr8 (157 HSPs)
chr8 (29-355)||(40845857-40846185)
chr8 (29-354)||(43639138-43639462)
chr8 (43-355)||(13431104-13431416)
chr8 (29-325)||(45292221-45292515)
chr8 (32-352)||(33560688-33561008)
chr8 (29-337)||(39692908-39693215)
chr8 (29-352)||(15336558-15336882)
chr8 (29-352)||(15425623-15425947)
chr8 (29-352)||(15516927-15517251)
chr8 (29-337)||(25163443-25163752)
chr8 (29-352)||(45538907-45539229)
chr8 (31-337)||(29692684-29692992)
chr8 (29-349)||(43773480-43773801)
chr8 (29-337)||(17442290-17442596)
chr8 (37-329)||(21932263-21932554)
chr8 (29-337)||(23264095-23264402)
chr8 (29-337)||(19942608-19942915)
chr8 (29-345)||(20255980-20256299)
chr8 (29-333)||(17796798-17797101)
chr8 (29-349)||(9319929-9320250)
chr8 (29-337)||(18321628-18321935)
chr8 (29-345)||(18121578-18121895)
chr8 (29-337)||(18679186-18679495)
chr8 (29-337)||(18718375-18718684)
chr8 (135-355)||(14990057-14990276)
chr8 (135-355)||(18152253-18152472)
chr8 (29-337)||(17526202-17526515)
chr8 (135-351)||(14990668-14990883)
chr8 (135-355)||(22673154-22673373)
chr8 (29-219)||(20382863-20383053)
chr8 (29-228)||(1744635-1744833)
chr8 (29-337)||(43644269-43644577)
chr8 (135-355)||(22662441-22662661)
chr8 (29-337)||(19956807-19957116)
chr8 (29-206)||(6407230-6407406)
chr8 (93-337)||(12758270-12758515)
chr8 (37-237)||(16206772-16206970)
chr8 (110-345)||(16681803-16682040)
chr8 (29-263)||(24645779-24646012)
chr8 (56-337)||(26832448-26832729)
chr8 (29-208)||(30421903-30422081)
chr8 (29-337)||(19706888-19707189)
chr8 (29-177)||(14989921-14990069)
chr8 (29-177)||(18152117-18152265)
chr8 (44-337)||(18772064-18772358)
chr8 (29-177)||(14990532-14990680)
chr8 (29-177)||(22662649-22662797)
chr8 (60-337)||(21287774-21288055)
chr8 (95-309)||(19153432-19153653)
chr8 (29-177)||(22673361-22673509)
chr8 (60-337)||(45568416-45568697)
chr8 (136-337)||(15934236-15934440)
chr8 (67-265)||(22707777-22707973)
chr8 (29-277)||(22462107-22462353)
chr8 (44-207)||(15934116-15934277)
chr8 (60-345)||(21540326-21540605)
chr8 (228-355)||(6407112-6407239)
chr8 (60-266)||(28902915-28903119)
chr8 (60-268)||(40002672-40002879)
chr8 (60-224)||(21298503-21298665)
chr8 (29-134)||(36104774-36104877)
chr8 (197-337)||(16206643-16206781)
chr8 (29-147)||(17928618-17928734)
chr8 (29-130)||(16188563-16188664)
chr8 (44-163)||(2810357-2810474)
chr8 (228-352)||(30422070-30422194)
chr8 (60-266)||(17519558-17519762)
chr8 (29-125)||(17701326-17701422)
chr8 (60-175)||(22211798-22211911)
chr8 (257-355)||(1744541-1744639)
chr8 (43-337)||(25850477-25850767)
chr8 (60-177)||(29379115-29379230)
chr8 (137-337)||(21298354-21298560)
chr8 (43-237)||(18557507-18557698)
chr8 (29-108)||(12193515-12193594)
chr8 (29-108)||(12437943-12438022)
chr8 (60-177)||(22136266-22136380)
chr8 (60-177)||(22167431-22167545)
chr8 (60-148)||(8031593-8031679)
chr8 (60-148)||(19460754-19460840)
chr8 (60-148)||(19558432-19558518)
chr8 (60-145)||(7018789-7018872)
chr8 (29-146)||(19505907-19506021)
chr8 (60-177)||(23271616-23271731)
chr8 (29-223)||(1210212-1210405)
chr8 (290-355)||(36104694-36104759)
chr8 (60-133)||(3843322-3843394)
chr8 (65-122)||(17879222-17879278)
chr8 (60-227)||(26120619-26120782)
chr8 (29-184)||(33052406-33052556)
chr8 (60-131)||(20260026-20260096)
chr8 (60-131)||(21046656-21046726)
chr8 (60-177)||(3349034-3349148)
chr8 (60-177)||(3359631-3359745)
chr8 (60-177)||(6160782-6160896)
chr8 (60-177)||(9340903-9341017)
chr8 (60-177)||(9368047-9368161)
chr8 (60-177)||(9856884-9856998)
chr8 (60-177)||(15781117-15781231)
chr8 (60-177)||(15791706-15791820)
chr8 (60-177)||(18449129-18449243)
chr8 (29-99)||(19155854-19155924)
chr8 (56-337)||(24678894-24679166)
chr8 (60-177)||(36077696-36077810)
chr8 (60-177)||(36088282-36088396)
chr8 (60-177)||(44480850-44480964)
chr8 (60-177)||(44491466-44491580)
chr8 (60-177)||(241583-241697)
chr8 (60-177)||(252168-252282)
chr8 (60-177)||(794938-795052)
chr8 (60-177)||(849374-849488)
chr8 (201-275)||(2810305-2810379)
chr8 (60-177)||(6150827-6150941)
chr8 (60-177)||(13688975-13689089)
chr8 (60-177)||(19128507-19128621)
chr8 (60-177)||(19139039-19139153)
chr8 (60-177)||(26110990-26111104)
chr8 (60-177)||(29076490-29076604)
chr8 (60-177)||(29086741-29086855)
chr8 (60-177)||(32078103-32078217)
chr8 (60-177)||(32088676-32088790)
chr8 (60-177)||(36292680-36292794)
chr8 (60-177)||(36303283-36303397)
chr8 (59-148)||(27739450-27739533)
chr8 (60-99)||(3220466-3220505)
chr8 (56-99)||(12541254-12541297)
chr8 (60-99)||(16746834-16746873)
chr8 (60-99)||(18153571-18153610)
chr8 (60-99)||(18158090-18158129)
chr8 (60-99)||(18769544-18769583)
chr8 (60-99)||(19224768-19224807)
chr8 (60-99)||(19418186-19418225)
chr8 (60-99)||(20161638-20161677)
chr8 (60-99)||(20195790-20195829)
chr8 (60-99)||(23370386-23370425)
chr8 (60-99)||(23469868-23469907)
chr8 (60-99)||(30315103-30315142)
chr8 (60-99)||(43248159-43248198)
chr8 (60-177)||(210560-210674)
chr8 (60-177)||(724183-724297)
chr8 (59-100)||(24498609-24498650)
chr8 (59-100)||(24634928-24634969)
chr8 (60-99)||(6318923-6318962)
chr8 (60-99)||(19428761-19428800)
chr8 (63-125)||(15598347-15598409)
chr8 (59-93)||(17687598-17687632)
chr8 (29-99)||(17917288-17917358)
chr8 (65-133)||(40213580-40213648)
chr8 (60-96)||(31214849-31214885)
chr8 (29-68)||(12758233-12758272)
chr8 (290-337)||(20383070-20383116)
chr8 (189-223)||(15934229-15934263)
chr8 (276-337)||(23470082-23470142)
chr8 (197-225)||(6407271-6407299)
chr8 (290-338)||(23271819-23271866)
chr8 (290-338)||(23363725-23363772)
chr8 (163-266)||(29379055-29379159)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (29-355)||(18188-18514)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (29-355)||(1243-1568)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (29-355)||(88023-88349)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (29-348)||(22553-22870)
scaffold0217 (29-337)||(18412-18718)
[»] scaffold0084 (6 HSPs)
scaffold0084 (29-337)||(48712-49022)
scaffold0084 (60-337)||(839-1120)
scaffold0084 (33-177)||(32068-32207)
scaffold0084 (196-337)||(31966-32109)
scaffold0084 (60-129)||(57196-57264)
scaffold0084 (290-337)||(57426-57472)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (29-348)||(7163-7483)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (29-337)||(6113-6420)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (29-352)||(362-685)
scaffold0205 (29-130)||(248-349)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (29-349)||(2350-2670)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (29-337)||(76-382)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (29-332)||(78778-79083)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (29-334)||(106-412)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (29-265)||(5635-5871)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (29-265)||(5645-5881)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (29-355)||(2396-2722)
scaffold0116 (29-207)||(21398-21574)
scaffold0116 (167-277)||(21564-21674)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (29-337)||(14498-14806)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (29-352)||(19045-19368)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (29-337)||(7204-7511)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (29-355)||(26090-26400)
scaffold0056 (197-355)||(35335-35494)
scaffold0056 (29-165)||(35227-35363)
scaffold0056 (29-84)||(36604-36659)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (29-334)||(83776-84081)
scaffold0009 (29-337)||(268163-268470)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (29-345)||(211728-212045)
scaffold0005 (60-177)||(60769-60884)
scaffold0005 (290-337)||(60633-60679)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (29-337)||(9286-9596)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (29-337)||(1039-1348)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (29-309)||(90479-90758)
scaffold0003 (43-337)||(96-385)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (29-334)||(1078-1383)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (29-305)||(7336-7614)
scaffold0026 (37-177)||(59558-59698)
scaffold0026 (197-337)||(59460-59598)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (29-273)||(8602-8844)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (29-337)||(9337-9646)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (29-337)||(73962-74271)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (29-337)||(9344-9657)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (29-337)||(27853-28158)
[»] scaffold0035 (5 HSPs)
scaffold0035 (29-337)||(19890-20200)
scaffold0035 (29-225)||(99629-99825)
scaffold0035 (29-345)||(29168-29483)
scaffold0035 (135-310)||(99795-99969)
scaffold0035 (307-351)||(110298-110342)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (29-337)||(10530-10838)
scaffold0161 (29-337)||(15194-15502)
[»] scaffold0007 (8 HSPs)
scaffold0007 (29-303)||(142511-142784)
scaffold0007 (135-352)||(46030-46249)
scaffold0007 (135-352)||(63704-63923)
scaffold0007 (29-177)||(63911-64058)
scaffold0007 (29-177)||(46237-46384)
scaffold0007 (60-146)||(59705-59788)
scaffold0007 (197-225)||(46249-46277)
scaffold0007 (197-225)||(63923-63951)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (29-339)||(102948-103260)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (29-236)||(7308-7515)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (29-337)||(2611-2914)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (29-337)||(32208-32516)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (148-351)||(24319-24521)
scaffold0028 (29-337)||(80776-81086)
scaffold0028 (29-170)||(6024-6164)
scaffold0028 (60-99)||(14387-14426)
scaffold0028 (60-99)||(54536-54575)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (29-277)||(158553-158799)
scaffold0022 (29-208)||(36910-37089)
scaffold0022 (29-208)||(134970-135149)
scaffold0022 (252-337)||(36810-36897)
scaffold0022 (252-337)||(134870-134957)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (29-337)||(144286-144596)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (58-337)||(8009-8294)
scaffold0047 (60-177)||(40866-40980)
scaffold0047 (60-99)||(33315-33354)
[»] scaffold0771 (3 HSPs)
scaffold0771 (29-193)||(1-165)
scaffold0771 (60-165)||(5899-6002)
scaffold0771 (197-337)||(5782-5927)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (52-345)||(1215-1506)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (44-337)||(16566-16859)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (29-273)||(2106-2349)
scaffold0622 (29-163)||(3819-3950)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (197-355)||(3259-3416)
scaffold0280 (29-176)||(3152-3298)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (52-207)||(2432-2586)
scaffold0530 (167-337)||(2576-2746)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (29-265)||(2214-2449)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (29-337)||(13424-13732)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (32-236)||(698-900)
scaffold0498 (44-87)||(914-957)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (197-355)||(5855-6017)
scaffold0069 (29-152)||(5747-5870)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (52-176)||(13114-13238)
scaffold0426 (197-268)||(13083-13153)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (29-196)||(37156-37320)
scaffold0120 (29-196)||(41685-41849)
scaffold0120 (223-337)||(37360-37476)
scaffold0120 (223-309)||(41556-41645)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (29-237)||(802-1007)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (163-337)||(25840-26016)
scaffold0163 (60-145)||(29233-29315)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (29-237)||(404-609)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (60-337)||(9347-9630)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (60-268)||(4350-4556)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (60-337)||(38536-38817)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (60-337)||(1580-1860)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (29-134)||(2890-2994)
scaffold0471 (290-355)||(2810-2875)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (29-161)||(5189-5319)
scaffold0273 (29-237)||(22496-22700)
scaffold0273 (197-309)||(5097-5213)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (149-337)||(111192-111381)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (60-337)||(4496-4777)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (60-337)||(1387-1667)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (60-264)||(32448-32651)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (166-337)||(8039-8213)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (29-148)||(4433-4549)
scaffold0040 (43-160)||(1945-2060)
scaffold0040 (167-345)||(2618-2798)
[»] scaffold0607 (2 HSPs)
scaffold0607 (29-146)||(5579-5695)
scaffold0607 (228-307)||(5509-5588)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (29-117)||(7580-7668)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (60-337)||(20825-21105)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (60-268)||(2125-2331)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (29-237)||(18679-18884)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (166-352)||(44418-44607)
scaffold0064 (60-133)||(44343-44416)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (163-337)||(2336-2516)
scaffold0220 (60-177)||(2265-2380)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (60-265)||(475703-475907)
scaffold0002 (60-265)||(482223-482427)
scaffold0002 (60-131)||(157078-157149)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (184-333)||(1960-2111)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (45-186)||(76748-76887)
scaffold0037 (189-337)||(76626-76775)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (60-337)||(61110-61392)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (60-224)||(35144-35306)
scaffold0050 (213-266)||(35072-35125)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (60-224)||(6905-7067)
scaffold0018 (213-268)||(7086-7141)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (60-337)||(40763-41044)
scaffold0017 (60-266)||(59309-59512)
scaffold0017 (70-131)||(10113-10174)
scaffold0017 (60-133)||(175092-175167)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (259-355)||(23993-24089)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (29-237)||(1300-1505)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (60-177)||(1454-1569)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (60-148)||(474-560)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (60-148)||(8068-8154)
scaffold0012 (60-337)||(127210-127489)
scaffold0012 (60-145)||(16365-16448)
scaffold0012 (60-99)||(140608-140647)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (60-175)||(10205-10317)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (60-175)||(29212-29324)
scaffold0001 (288-337)||(29412-29460)
[»] scaffold0207 (3 HSPs)
scaffold0207 (60-177)||(10266-10381)
scaffold0207 (60-208)||(20136-20282)
scaffold0207 (195-268)||(20016-20089)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (60-148)||(961-1047)
scaffold0752 (60-148)||(1576-1662)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (60-224)||(11258-11420)
scaffold0422 (189-266)||(11186-11263)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (60-148)||(402-488)
scaffold0090 (60-148)||(4782-4868)
scaffold0090 (163-223)||(357-417)
scaffold0090 (163-223)||(4737-4797)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (60-175)||(885-997)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (225-345)||(5587-5711)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (135-337)||(1-209)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (60-177)||(1722-1836)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (60-177)||(6826-6941)
scaffold0269 (212-337)||(16346-16476)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (37-237)||(19556-19756)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (60-148)||(936-1022)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (29-106)||(31349-31426)
[»] scaffold0758 (2 HSPs)
scaffold0758 (29-163)||(3830-3962)
scaffold0758 (252-337)||(3689-3775)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (60-148)||(38412-38497)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (29-163)||(7651-7780)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (60-145)||(35298-35380)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (30-196)||(2607-2772)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (75-175)||(58065-58162)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (29-99)||(9-79)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (60-177)||(12086-12200)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (60-177)||(40230-40344)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (60-177)||(30861-30975)
scaffold0133 (60-99)||(42933-42972)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (60-177)||(7690-7804)
scaffold0105 (60-177)||(37371-37485)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (60-133)||(5066-5138)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (63-131)||(15500-15567)
scaffold0410 (290-355)||(15278-15341)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (60-133)||(10701-10773)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (60-99)||(2494-2533)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (60-99)||(2631-2670)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (60-99)||(37147-37186)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (60-99)||(8172-8211)
scaffold0068 (60-99)||(11019-11058)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (60-177)||(12530-12644)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (225-337)||(1213-1331)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (29-78)||(22302-22351)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (60-101)||(7255-7296)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (59-99)||(2752-2792)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (65-99)||(17374-17408)
scaffold0099 (60-99)||(19027-19067)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (62-99)||(5011-5048)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (59-266)||(7296-7501)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (65-100)||(5112-5147)
[»] scaffold1107 (1 HSPs)
scaffold1107 (59-93)||(2766-2800)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (297-335)||(14348-14386)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (59-93)||(16826-16860)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (297-335)||(1390-1428)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (224-303)||(13801-13883)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (197-237)||(1156-1196)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 203)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10848457 - 10848131
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10848457 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtt 10848358  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10848357 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 10848258  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10848257 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 10848158  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  10848157 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 10848131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 30116289 - 30116614
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30116289 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 30116388  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30116389 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 30116487  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30116488 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaagactgacttccggtttgt 30116587  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  30116588 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 30116614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 28464790 - 28465115
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28464790 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 28464889  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28464890 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-atttg 28464988  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  28464989 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgt 28465088  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28465089 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 28465115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 35932459 - 35932785
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35932459 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtt 35932558  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  35932559 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcctgcagttgtgcttgagcaatttt 35932658  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35932659 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 35932758  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  35932759 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 35932785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 3245894 - 3246219
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245894 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 3245993  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  3245994 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaaatctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttaaac-atttg 3246092  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||    
T  3246093 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacaggaccgacttccgttttgt 3246192  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  3246193 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 3246219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33932952 - 33932627
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  33932952 aattctagagtctttggagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtt 33932854  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33932853 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 33932754  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33932753 aagtctcttagtaaatttagtagtgagcatttgtaatcagatattgcatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagattgacttccggtttgt 33932654  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33932653 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 33932627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 35986684 - 35987011
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35986684 aattctagagtctttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgt 35986783  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35986784 ttgaatttagaagtctcttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 35986883  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  35986884 gaagtctcatactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggtagtgcaagggggacaggactgacttctggtttg 35986983  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  35986984 tggaaggaacctgtataaactgcttgtg 35987011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15516654 - 15516330
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15516654 aattctagagcctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 15516556  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15516555 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgtttgaccaatataagtctcttcattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 15516457  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15516456 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 15516357  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  15516356 ggtaggaacctgtataaattgcttgtg 15516330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 318
Target Start/End: Original strand, 14086992 - 14087281
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14086992 aattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtattcaacctcaaataattttctttgtaattctgtt 14087091  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087092 tgaattcagaagtgtcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 14087191  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgact 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14087192 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgact 14087281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28139291 - 28138963
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28139291 aattctagagtctttagagtctgcatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 28139193  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28139192 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagtaatagaagtctcttgattatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 28139094  T
Q  229 aagtctcttactaagttta----gtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||||||||||||    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  28139093 aagtctcttactaagtttagcacgtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccttt 28138994  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28138993 ttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 28138963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30742666 - 30742341
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30742666 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtt 30742568  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30742567 tgaattcaaatgtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgaacaatttg 30742468  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  30742467 aagtctcttactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaaccctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttcctggttgt 30742368  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  30742367 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 30742341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9088653 - 9088329
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9088653 aattctagagtctttagagtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 9088555  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9088554 tgaattaagaagtctcttgcagatgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgcagttgcacttgagca-tttg 9088456  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9088455 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagactgatttccgatttgt 9088356  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  9088355 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 9088329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 29138858 - 29139182
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  29138858 aattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctt-gtaattctatt 29138956  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29138957 tgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 29139055  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  29139056 aagtctcttactaagtttagtagggagcaattgtaataagatattacataatgaactctccttggaagtgcaaggggggcaggactgactttcggtttgt 29139155  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  29139156 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 29139182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21659896 - 21659589
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21659896 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtt 21659797  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21659796 tggatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatggaagtctcttgatcgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttg 21659697  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21659696 aagtctcttgctagtcttagcaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgt 21659598  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  21659597 ggaaggaac 21659589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26765188 - 26764866
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26765188 aattctagagtttttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 26765090  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26765089 tgatttgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagc-atttg 26764991  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagc-atttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26764990 aagtctcttactaactttagtagtgagcaatttgtaatcagatattatatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttg 26764891  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||| | || |||||||||||    
T  26764890 tggaaggagcctgtataaattgctt 26764866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42243366 - 42243041
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa-gtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  42243366 aattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcagtgtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgt 42243268  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42243267 ttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-ttt 42243169  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  42243168 gaagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattatatagtgaactctccttggaagtgcaagggagacatgaccgacttccggtttg 42243069  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42243068 tggaaggaacttgtataaattgcttgtg 42243041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11993574 - 11993251
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  11993574 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatataaagtgttcaacctcaaacatttttatt-gtaattctgtt 11993476  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11993475 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttg 11993377  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac--atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11993376 aattctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaattagataatacttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttt 11993277  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  11993276 gtggaaggaacctgtataaattgctt 11993251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 7746146 - 7746455
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7746146 aattctagagtcttaagagtccatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 7746245  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7746246 tgaatt-ataagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagcaatttg 7746344  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7746345 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattctagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 7746443  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  7746444 tgtggaaggaac 7746455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 23392056 - 23392362
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  23392056 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgt 23392155  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23392156 ttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaggaagtt 23392255  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| | |||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23392256 gaagtctcctgctagttttagccgtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactccctttggaagtgcaggggggacaggactgacttccggtttg 23392355  T
Q  328 tggaagg 334  Q
    |||||||    
T  23392356 tggaagg 23392362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17814650 - 17814340
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17814650 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctggt 17814551  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17814550 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtttcttgactatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 17814452  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17814451 aagtctcttgctaagtttagcagtgatcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagagcaagggggacaggactgacttccggtt 17814352  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  17814351 tgtggaaggaac 17814340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31117563 - 31117255
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31117563 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 31117465  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31117464 tgaattcagaagtctcttgcagttgttcttcagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-tatttg 31117366  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  31117365 aagtctcttgctaagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtaaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtt 31117267  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  31117266 tgtggaaggaac 31117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31487920 - 31487614
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  31487920 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttctattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctatt 31487822  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31487821 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagctgtgcttgagc-atttg 31487723  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||  ||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||    
T  31487722 aagtctctttgtagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtctgt 31487623  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  31487622 ggaaggaac 31487614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 89873 - 90184
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  89873 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaccttaaacaattttctttgtaattctgtt 89972  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  89973 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgctttagtaatttg 90072  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  90073 aagtctctagctaagtttagcagtgaacagttgtaatcagatattacatttttagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 90171  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  90172 ttgtggaaggaac 90184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33022350 - 33022025
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33022350 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaataccaccaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 33022251  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | |||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  33022250 tgaattaaaaagtctctcgcggttgtgcttgatcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagatgtgcttgagaaacttg 33022151  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatga--gcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33022150 aagtctcttgctagttttagcagtgagcgcaattgtaattagatattacatagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggttt 33022051  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  33022050 gtggaaggaacttgtataaattgctt 33022025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26784039 - 26783730
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26784039 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaactattttctttgtaattctgtt 26783940  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26783939 tcaattcagaagtctcttgcagttgtacttaagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 26783841  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||| ||||| |||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26783840 aagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaaacagatgttacattttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaatact-acttccggtt 26783742  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||||||    
T  26783741 tgttgaaggaac 26783730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 12353248 - 12353556
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12353248 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaaca-ttttctttgtaattctgtt 12353346  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||    
T  12353347 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcaattatgcttgagtagtttg 12353444  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  12353445 aagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggct 12353544  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  12353545 tgtggaaggaac 12353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19536749 - 19537058
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19536749 aattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatataaa-tgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgt 19536847  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19536848 ttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attt 19536946  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |    
T  19536947 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacatgact-acttccgat 19537045  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  19537046 ttgtggaaggaac 19537058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 6512882 - 6513192
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6512882 aattctagagttttaagagtctgcatcttatttttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatt 6512981  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6512982 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attta 6513080  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  6513081 aagtctcttgctatgtttagcagtgagcagttgtaatcagatactacattatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatt 6513180  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  6513181 tgtggaaggaac 6513192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 23413426 - 23413735
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  23413426 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccagtgattgtatatcaagtgttcatcctcaaacaattttttgtgtaattctgtt 23413525  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23413526 tgaattt-gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgcagttgtgctcgagtaatttg 23413624  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23413625 aagtttcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttaatgaactctccttggaagtgaaagggggacaagact-acttccggtt 23413723  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  23413724 tgtgtaaggaac 23413735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13545977 - 13546282
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  13545977 aattcttgagtcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctctaacatttttctt-gtaattctgtt 13546075  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13546076 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagtgcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13546174  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  13546175 aagtctcttgctagttttagcattgagctattgtaatcagatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtttgt 13546273  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  13546274 ggaaggaac 13546282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 643153 - 643469
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  643153 aattctatagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaagctcaaacaattttctttgtaattctgtt 643252  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  643253 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatgagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaaatctcttgcagttatgcttgagtaatttg 643350  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||| ||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  643351 aagcctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 643449  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  643450 tgtagaaggaacttgtataa 643469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 21199453 - 21199761
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21199453 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 21199552  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21199553 tgaa--tagaagtctcttgcaattgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 21199650  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||| | || ||||||||||||| |   |||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21199651 aagtctcttgctagttttagcagtgagtagttataatcagatattaaattttagtgaactctcctcgaaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 21199749  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  21199750 tgtggaaggaac 21199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 9399068 - 9399385
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9399068 aattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 9399167  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  9399168 tgaa--tagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcctgcagttgtgcttgagtagtttg 9399265  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  | |||   |||| | ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  9399266 aagtctcttgctagttgtagctctgagtagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 9399364  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  9399365 ttgtggaaggaacttgtataa 9399385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 137 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4886540 - 4886322
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4886540 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaccataggaagtctcttgcaattgtgtttgagcaatttgaagtctct 4886441  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaa 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4886440 tactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactttccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaa 4886341  T
Q  337 cttgaataaattgcttgtg 355  Q
    | || ||||||||||||||    
T  4886340 cctgtataaattgcttgtg 4886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 337
Target Start/End: Original strand, 21100159 - 21100464
Alignment:
Q  33 ctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100159 ctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcttaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 21100258  T
Q  133 tttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagt 232  Q
      || |||||||||| |||| || |||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21100259 --tataagtctcttgtagttgtgtttgagcataagaagtttattgattatgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagt 21100356  T
Q  233 ctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtg 329  Q
    ||||| |||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21100357 ctcttgctagttttagcagtgagccgttgtaatcagatattacattttagtgaactctcattggaaatgcaagggggacagtaatgacttccggtttgtg 21100456  T
Q  330 gaaggaac 337  Q
    ||||||||    
T  21100457 gaaggaac 21100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23880742 - 23880442
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  23880742 agtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaat--a 23880645  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23880644 gaagtctcttgcagttgtgcttgagtatcagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgggcttgagtaatttgaagtctct 23880545  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    | |||  | ||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||    
T  23880544 tgctagttgtagcagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acatccggtttgtgaaag 23880446  T
Q  334 gaac 337  Q
    ||||    
T  23880445 gaac 23880442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Original strand, 21072689 - 21072962
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21072689 aattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattttgtt 21072788  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21072789 tgaatata--agtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgttctgtagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtaatttg 21072886  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaa 301  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  21072887 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctcattggaagtgcaa 21072962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4886707 - 4886512
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4886707 aattctagagtctttagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 4886609  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886608 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 4886512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 25097279 - 25097587
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25097279 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 25097378  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||    
T  25097379 cgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggacgtgtcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgcaattgtgcttaagtagtttg 25097476  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  25097477 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgctagggggacatgact-acttccggtt 25097575  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  25097576 tgtggaaggaac 25097587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 25155249 - 25155557
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25155249 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 25155348  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     |||  |||||||||||||||||| ||||||||||   || || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||    
T  25155349 cgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggacgtgtcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgcaattgtgcttaagtagtttg 25155446  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  25155447 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgctagggggacatgact-acttccggtt 25155545  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  25155546 tgtggaaggaac 25155557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 31146087 - 31146264
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31146087 aattttagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatt 31146186  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 206  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146187 tgaattaagaaatctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtatcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 31146264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20550578 - 20550391
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20550578 aattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 20550479  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 218  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20550478 tga--ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttacagttgtgctt 20550391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 2156727 - 2156932
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2156727 aattctagagtcttaagagtct-tatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtt 2156825  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2156826 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattttgttcatgagcatatgaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 2156923  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  2156924 aagtctctt 2156932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32160404 - 32160124
Alignment:
Q  61 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||    
T  32160404 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttga 32160307  T
Q  161 gcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcattt 260  Q
    |||   ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  32160306 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaaatctcttgcctgtgtgcttgagtaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 32160207  T
Q  261 gtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32160206 gtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggaacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 32160124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 197 - 345
Target Start/End: Original strand, 13736694 - 13736842
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  13736694 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcaattgtaatcaaatattacatagtgaactctccttggaag 13736793  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13736794 tgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 13736842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 11208490 - 11208788
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  11208490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtacaattctatttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 11208587  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |||||| |    
T  11208588 agcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagtaaaggaagtatcttgctg-tgtgcttgagcattttgaagtctcatactagttgtagtattgagcagt 11208686  T
Q  260 tgtaatca-----gatattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    ||||||||     |||  ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  11208687 tgtaatcagttgtgattatacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggggcatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcatg 11208786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16607197 - 16606991
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||    
T  16607197 aattctagagtcttaagagtctgtatctcatttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtagttctgtt 16607098  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||| ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||| || | ||||    
T  16607097 tgaa--tagaagtatcttgcaattgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcatttatgcttcagtagtttg 16607000  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  16606999 aagtctctt 16606991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 25112358 - 25112656
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  25112358 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 25112455  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  25112456 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 25112555  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  25112556 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtat-aattgcttg 25112654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 25171449 - 25171747
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  25171449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 25171546  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  25171547 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 25171646  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  25171647 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtat-aattgcttg 25171745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 25930608 - 25930712
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25930608 aattctagagtctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaactgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 25930707  T
Q  129 tgaat 133  Q
    |||||    
T  25930708 tgaat 25930712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34638140 - 34637929
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34638140 aattgtagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgtaattctgtt 34638041  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagca-taggaagtctcttgcagttgtgcttgag-caatt 226  Q
    ||||  ||||||||||||||| || || || ||||   |||||||||||    ||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  | ||    
T  34638040 tgaa--tagaagtctcttgcatttgtggttaagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaggaaacctcttgcagttgtgcttgagttagtt 34637943  T
Q  227 tgaagtctcttact 240  Q
    ||||||||||||||    
T  34637942 tgaagtctcttact 34637929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 13736587 - 13736735
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  13736587 aattttagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttc-ttgtaattctatt 13736685  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa-tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  13736686 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttg 13736735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 169
Target Start/End: Original strand, 22000508 - 22000647
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22000508 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtaaatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtttaattctgtt 22000607  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaa 169  Q
    | ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  22000608 taaattt-gaagtctctggcagttgtgcttgagcattagaa 22000647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23478031 - 23477827
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  23478031 ttgtattctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttcagtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 23477934  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  23477933 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 23477834  T
Q  260 tgtaatc 266  Q
    |||||||    
T  23477833 tgtaatc 23477827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6498922 - 6498818
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6498922 aattctagagtcttaaaagtttgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtt 6498823  T
Q  129 tgaat 133  Q
    |||||    
T  6498822 tgaat 6498818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 20215597 - 20215802
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||  |  ||||||    
T  20215597 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtataattctgtttgaa--taaaagtctcttgctttagtgcttg 20215694  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  20215695 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 20215794  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  20215795 ttgtaatc 20215802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23589399 - 23589269
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23589399 aattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttatgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtt 23589301  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||  |||||||||||||||  || |||||||||    
T  23589300 tga--ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 23589269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Original strand, 22000650 - 22000784
Alignment:
Q  201 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagt 297  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||    
T  22000650 tctcttgcaattgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagt 22000749  T
Q  298 gcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22000750 gcaagggggacaagact-acttctggtttgtggaag 22000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40228312 - 40228110
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  40228312 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttgagc 40228215  T
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    |   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||| ||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  40228214 ataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40228115  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  40228114 taatc 40228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 355
Target Start/End: Original strand, 31146255 - 31146382
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  31146255 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgcatttagatattacatagtaaactccccttggaagtgcaagggggatatcattgacttccggtttg 31146354  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||    
T  31146355 tggaaggaaccagtataaattgcctgtg 31146382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23488177 - 23488062
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  23488177 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 23488080  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  23488079 agcaaaggaagtctcttg 23488062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 26120294 - 26120484
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  26120294 agagtctgtatctgacttgtattgtgaacaccaatgattgaatatcaattgttcaacctcaaac-attttctttgtaattgtgtttg--tttagaagtct 26120390  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||   || ||||| ||||   ||||||||||| |||||| |  |||||||||||  ||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  26120391 cttgattttatgcttaagcataggaagtctcttgtttgtgtgcttgagcataggaaacctcttacttttgtgcttgagtagtttgaagtctctt 26120484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13522850 - 13522737
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  13522850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 13522753  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  13522752 agcattggaagtctct 13522737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 31589429 - 31589528
Alignment:
Q  31 ttctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  31589429 ttctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacatttttctgtgtaattgtgtttg 31589528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1915073 - 1914958
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  1915073 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 1914976  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  1914975 agcaaaggaagtctcttg 1914958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 337
Target Start/End: Original strand, 26766443 - 26766596
Alignment:
Q  185 tcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtg 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | |||  | ||||||||||||||||||   |||||    
T  26766443 tcaggagcataggaagtctcttgcatttgtacttgagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgattagttgtaatcagatattacatcttagtg 26766541  T
Q  282 aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26766542 aactcttcttggaaatgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 26766596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25740711 - 25740631
Alignment:
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25740711 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgctgttgtgcttgagca 25740631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20968897 - 20968765
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||| | ||    
T  20968897 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtgttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttatgtgtaattttttt 20968798  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  | ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  20968797 tg--tctagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 20968765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24019305 - 24019174
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||| ||||    
T  24019305 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaaatgttcaac-ccaaacatttttttgtgtaattgtgtt 24019207  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  24019206 tg--tttagaaatctcttgcttttgtgcttgagca 24019174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 25740795 - 25740708
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctt 116  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25740795 aattccagagtcttaggagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacagttttctt 25740708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20567460 - 20567286
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||   || ||||||    
T  20567460 ttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttattattctgtttga--ttagaagtctcttggttttgtgcttg 20567364  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||   |||||||||||  | ||| |  ||||| |||||  |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  20567363 agcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcaaaggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctctt 20567286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 40033248 - 40033363
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  40033248 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 40033345  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  40033346 agcataggaagtctcttg 40033363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 20168559 - 20168645
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20168559 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 20168645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 36096144 - 36096230
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36096144 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgc 36096230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 36097601 - 36097687
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36097601 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgc 36097687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Original strand, 22586448 - 22586587
Alignment:
Q  41 tttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaag 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  22586448 tttagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-ccaaacatttttatgtgtaattgtgtttg--tttagaag 22586543  T
Q  141 tctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    |||||||   || ||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  22586544 tctcttggttttgtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgt 22586587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 35543621 - 35543733
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||  |  ||||||    
T  35543621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--tcagaagtctcttgctttagtgcttg 35543717  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  35543718 agcattggaagtctct 35543733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34637256 - 34637143
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34637256 aattctagagtcttaagagtctg-atttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac--caaacatatttctttgtaatt-tgtt 34637161  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||  || |||||||||||||    
T  34637160 tg--ttcagaagtctcttgc 34637143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 20625259 - 20625535
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| |||    ||||||    
T  20625259 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaa--tagaagcctctcgcatgcatgcttg 20625355  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt--gaagtctcttactaagtttagtaatgagca 257  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||    ||||||||||| |||  |||||||| |||| ||   |||| ||||||    
T  20625356 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttag-agagtattgagca 20625454  T
Q  258 tttgtaatc--agatattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||   || ||||  ||||| || || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20625455 tttgtaatctttgagatta-ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 20625535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Original strand, 39799328 - 39799480
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||| ||||    
T  39799328 aattatagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttttgtgtaattttgtt 39799427  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
       || || |||||||||||  || ||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  39799428 ---atctaaaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaaatctcttgtttgtgt 39799480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 20417397 - 20417557
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||     ||||||    
T  20417397 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctctcgcctgcgtgcttg 20417493  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| |||   |||||||||||    
T  20417494 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagca 20417557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13533577 - 13533494
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  13533577 ttgtattgtgaacactattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgttattctgtttga--ttagaagtctct 13533494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Original strand, 25156558 - 25156766
Alignment:
Q  102 tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaa-gtctcttgattgtgttcaggagcataggaag 200  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||| |||||||||||     
T  25156558 tcaaacaatattctttgaaaatctgtttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgaaca-tagaacgtgtcatgattgtgttcaagagcataggaaa 25156654  T
Q  201 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagt 297  Q
    |||||  || |||||||| ||   ||||||||||||| | |  ||||| | |||||| | |||||||||||| |||   || ||||||| | ||| ||||    
T  25156655 tctctcacaattgtgcttaagttgtttgaagtctcttgcgagttttagcagtgagcaatggtaatcagatataacattttaatgaactctccttgtaagt 25156754  T
Q  298 gcaagggggaca 309  Q
    || |||||||||    
T  25156755 gctagggggaca 25156766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26758834 - 26758772
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 91  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26758834 aattctagagtttttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 26758772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 27204285 - 27204399
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||||||    
T  27204285 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcatgcgtgcttg 27204381  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27204382 agcattagaagtctcttg 27204399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32753712 - 32753598
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||     ||||||    
T  32753712 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctcttgcctacgtgcttg 32753616  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  32753615 agcattagaagactcttg 32753598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 40390850 - 40391054
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  40390850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 40390946  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  40390947 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttag-atagtattgagc 40391044  T
Q  257 atttgtaatc 266  Q
    ||||||||||    
T  40391045 atttgtaatc 40391054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 40401512 - 40401716
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  40401512 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 40401608  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  40401609 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttag-atagtattgagc 40401706  T
Q  257 atttgtaatc 266  Q
    ||||||||||    
T  40401707 atttgtaatc 40401716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12078514 - 12078354
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat-tctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg--ag 161  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||||  || ||||||  ||    
T  12078514 ttgtgaactcctctgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaacaatattctttataatctttgtttg---ttaaaagtctcttgcttttgtgcttgcaag 12078419  T
Q  162 caatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    ||   ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12078418 cataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt 12078354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6131284 - 6131398
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6131284 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6131380  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6131381 agcattagaagtctcttg 6131398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6498816 - 6498746
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  6498816 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgttgttgtgcttgagtagtttggagtctctt 6498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9377229 - 9377115
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9377229 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9377133  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9377132 agcattagaagtctcttg 9377115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 14041090 - 14041204
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14041090 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14041186  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14041187 agcattagaagtctcttg 14041204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14446768 - 14446654
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14446768 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14446672  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14446671 agcattagaagtctcttg 14446654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14457380 - 14457266
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14457380 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14457284  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14457283 agcattagaagtctcttg 14457266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14557784 - 14557670
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14557784 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14557688  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14557687 agcattagaagtctcttg 14557670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14568421 - 14568307
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14568421 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14568325  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14568324 agcattagaagtctcttg 14568307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15693799 - 15693685
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15693799 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15693703  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15693702 agcattagaagtctcttg 15693685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 15740461 - 15740575
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15740461 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15740557  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15740558 agcattagaagtctcttg 15740575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 15769621 - 15769735
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15769621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15769717  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15769718 agcattagaagtctcttg 15769735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15993096 - 15992982
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15993096 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15993000  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15992999 agcattagaagtctcttg 15992982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16003658 - 16003544
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  16003658 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 16003562  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16003561 agcattagaagtctcttg 16003544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17607552 - 17607666
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17607552 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17607648  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17607649 agcattagaagtctcttg 17607666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17618167 - 17618281
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17618167 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17618263  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17618264 agcattagaagtctcttg 17618281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22147016 - 22147130
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22147016 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22147112  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22147113 agcattagaagtctcttg 22147130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22157599 - 22157713
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22157599 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22157695  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22157696 agcattagaagtctcttg 22157713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22559930 - 22560044
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| || |||||||  | |||||||||||||   | ||||||    
T  22559930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctttgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgtgtgcttg 22560026  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22560027 agcattagaagtctcttg 22560044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22676609 - 22676724
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  22676609 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 22676706  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22676707 agcattagaagtctcttg 22676724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22686500 - 22686615
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  22686500 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 22686597  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22686598 agcattagaagtctcttg 22686615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24567582 - 24567696
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24567582 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24567678  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24567679 agcattagaagtctcttg 24567696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24816653 - 24816539
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24816653 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24816557  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24816556 agcattagaagtctcttg 24816539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24827241 - 24827127
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24827241 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24827145  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24827144 agcattagaagtctcttg 24827127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27041979 - 27041865
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27041979 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27041883  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27041882 agcattagaagtctcttg 27041865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27052603 - 27052489
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27052603 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27052507  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27052506 agcattagaagtctcttg 27052489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 27460654 - 27460768
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27460654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27460750  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27460751 agcattagaagtctcttg 27460768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 27471053 - 27471167
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27471053 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27471149  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27471150 agcattagaagtctcttg 27471167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31349026 - 31349140
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  31349026 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 31349122  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31349123 agcattagaagtctcttg 31349140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31359640 - 31359754
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  31359640 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 31359736  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31359737 agcattagaagtctcttg 31359754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31833976 - 31834090
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  31833976 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 31834072  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31834073 agcattagaagtctcttg 31834090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31844454 - 31844568
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  31844454 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 31844550  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31844551 agcattagaagtctcttg 31844568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 35215999 - 35216113
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35215999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35216095  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35216096 agcattagaagtctcttg 35216113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 35226583 - 35226697
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35226583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35226679  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35226680 agcattagaagtctcttg 35226697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36688187 - 36688301
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36688187 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36688283  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36688284 agcattagaagtctcttg 36688301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36698753 - 36698867
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36698753 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36698849  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36698850 agcattagaagtctcttg 36698867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37729019 - 37728905
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  37729019 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 37728923  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  37728922 agcattagaagtctcttg 37728905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37740335 - 37740221
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  37740335 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 37740239  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  37740238 agcattagaagtctcttg 37740221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 39352981 - 39353095
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  39352981 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39353077  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39353078 agcattagaagtctcttg 39353095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 39364974 - 39365088
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  39364974 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39365070  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39365071 agcattagaagtctcttg 39365088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13403874 - 13403773
Alignment:
Q  74 ccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtct 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||   |||||||    
T  13403874 ccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtct 13403777  T
Q  174 cttg 177  Q
    ||||    
T  13403776 cttg 13403773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 106613 - 106683
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  106613 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttga 106683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Original strand, 6976301 - 6976348
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6976301 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaac 6976348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 107
Target Start/End: Original strand, 6986791 - 6986838
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6986791 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaac 6986838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9347035 - 9347149
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9347035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9347131  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9347132 agcattagaagtctcttg 9347149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 14030537 - 14030651
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||     ||||||    
T  14030537 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttaaaagtctcttgcctgcgtgcttg 14030633  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14030634 agcattagaagtctcttg 14030651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17719410 - 17719524
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17719410 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17719506  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17719507 agcattagaagtctcttg 17719524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17730062 - 17730176
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17730062 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17730158  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17730159 agcattagaagtctcttg 17730176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 20798189 - 20798303
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| || |||||||  | ||||| |||||||   | ||||||    
T  20798189 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttaattctttgtatttttgtttga--tcagaagcctcttgcctgtgtgcttg 20798285  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20798286 agcagtagaagtctcttg 20798303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23296770 - 23296884
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  23296770 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 23296866  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23296867 agcattagaagtctcttg 23296884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23307338 - 23307452
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  23307338 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 23307434  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23307435 agcattagaagtctcttg 23307452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23362604 - 23362718
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| | || || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  23362604 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctatatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 23362700  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23362701 agcattagaagtctcttg 23362718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23697277 - 23697391
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  23697277 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctagcctgcgtgcttg 23697373  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23697374 agcattagaagtctcttg 23697391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23707935 - 23708049
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  23707935 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 23708031  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23708032 agcattagaagtctcttg 23708049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Original strand, 24808409 - 24808519
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||||||    
T  24808409 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 24808505  T
Q  164 atagaagtctcttg 177  Q
     |||||||||||||    
T  24808506 ttagaagtctcttg 24808519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30227263 - 30227149
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  30227263 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 30227167  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30227166 agcattagaagtctcttg 30227149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30237790 - 30237676
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  30237790 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 30237694  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30237693 agcattagaagtctcttg 30237676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33951567 - 33951453
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  33951567 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 33951471  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33951470 agcattagaagtctcttg 33951453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39490717 - 39490603
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  39490717 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 39490621  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39490620 agcattagaagtctcttg 39490603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39501907 - 39501793
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  39501907 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 39501811  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39501810 agcattagaagtctcttg 39501793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40513756 - 40513642
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  40513756 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 40513660  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40513659 agcattagaagtctcttg 40513642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 7031893 - 7031852
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031893 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 7031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Original strand, 26056008 - 26056048
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056008 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 26056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1108911 - 1108872
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108911 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1108872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1121669 - 1121630
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121669 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1121630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5290343 - 5290304
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5290304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5300914 - 5300875
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300914 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5300875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 8522334 - 8522373
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522334 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8522373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 9336448 - 9336487
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336448 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9336487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17457079 - 17457040
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457079 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17457040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 19464464 - 19464503
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19464503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 19478494 - 19478533
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478494 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19478533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 20562818 - 20562857
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562818 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20562857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20968793 - 20968624
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    ||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || |||||||||| ||   ||||    |||||||||||||    
T  20968793 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgct---tttatgcttgagcatttgtaa 20968697  T
Q  265 tcagatatt-acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    | ||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  20968696 taagatattgatttagtgaactctgcttggaagtgcaaggaggacatgact-acttccggattgtggaaggaac 20968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21702891 - 21702852
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702891 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21702852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21705738 - 21705699
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705738 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21705699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23488106 - 23488003
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  23488106 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgt 23488007  T
Q  263 aatc 266  Q
    ||||    
T  23488006 aatc 23488003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24925906 - 24925867
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24925906 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24925867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24983187 - 24983148
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983187 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24983148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27603185 - 27603146
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603185 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27603146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 34063114 - 34063153
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063114 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 34063153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 34772403 - 34772442
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772403 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 34772442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 34783348 - 34783387
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783348 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 34783387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 36084954 - 36084993
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084954 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36084993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 36229232 - 36229271
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229232 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36229271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36582325 - 36582286
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582325 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36582286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36592880 - 36592841
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592880 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36592841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 42395477 - 42395516
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395477 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 42395516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43621661 - 43621622
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621661 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43621622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6498735 - 6498689
Alignment:
Q  291 tggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6498735 tggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 6498689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31419156 - 31419270
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  31419156 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttaattctttgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcttgcgtgcttg 31419252  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31419253 agcattagaagtctcttg 31419270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 42043277 - 42043391
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  42043277 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcga-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 42043373  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42043374 agcattagaagtctcttg 42043391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 42053852 - 42053966
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  42053852 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcga-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 42053948  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42053949 agcattagaagtctcttg 42053966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37395588 - 37395528
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgct 351  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37395588 ttggaagtgcaaggggg-catgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgct 37395528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 37407146 - 37407255
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||||||     
T  37407146 ttgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcat 37407242  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||    
T  37407243 tagaagactcttg 37407255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Original strand, 40033319 - 40033499
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  40033319 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40033418  T
Q  262 taatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| |      |||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40033419 taatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 40033499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 20552311 - 20552347
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552311 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20552347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17446463 - 17446424
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17446463 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaa 17446424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 23406939 - 23406978
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406939 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23406978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Original strand, 24494992 - 24495079
Alignment:
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||   ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24494992 agaagtctctttcaattgtgattgagcaataaaagtctcttgaagttgtccttgagcattggaagtctcttgcagttgtgcatgagca 24495079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27622534 - 27622495
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27622534 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaa 27622495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30069671 - 30069632
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069671 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30069632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 34052453 - 34052492
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34052453 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 34052492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43043438 - 43043399
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043438 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43043399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10754985 - 10755099
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  10754985 ttgtattaagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10755081  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10755082 agcattagaagtctcttg 10755099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 20168762 - 20168808
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20168762 ttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 20168808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24019092 - 24019030
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttg 340  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  24019092 tagtgaactctcattggaagtgtaagggggacaaaact-acttccggaatgtggaaagaacttg 24019030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 31449047 - 31449086
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31449047 ttgtattgagaacaccactgattatatatcaagtgttcaa 31449086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13403791 - 13403713
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  13403791 gagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 13403713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 337
Target Start/End: Original strand, 31589618 - 31589702
Alignment:
Q  254 agcatttgtaatcagatattacat--agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||   |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31589618 agcatttgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggattgtggaatgaac 31589702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Original strand, 26119095 - 26119157
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaatt 123  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  26119095 tttgtattgcgaacaccac--attgtatatcaagtgttcaac--caaacaattatttctttgtaatt 26119157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1915002 - 1914898
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  1915002 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 1914903  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  1914902 taatc 1914898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20550472 - 20550433
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20550472 gaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attagaagtctctt 20550433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22747941 - 22747897
Alignment:
Q  134 ttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaat-agaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  22747941 ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattgagaagtctcttg 22747897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22747938 - 22747898
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22747938 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattgagaagtctctt 22747898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 190)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27871401 - 27871075
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27871401 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 27871302  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27871301 tgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 27871202  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27871201 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgt 27871102  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  27871101 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 27871075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 32 - 355
Target Start/End: Original strand, 32265196 - 32265519
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32265196 tctagagtcctttgagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttga 32265295  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32265296 atttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 32265395  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32265396 tctcttactaagtttagtagtgagcatttttaatcagatattacatagtgaactccccttagaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtgga 32265495  T
Q  332 aggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    || ||| || ||||||||||||||    
T  32265496 agaaacctgtataaattgcttgtg 32265519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 24795187 - 24795514
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24795187 aattctagagtctttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctttgtaattctgt 24795286  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24795287 ttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaattt 24795386  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  24795387 gaagtctcttactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttg 24795486  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  24795487 tggaaggaacctgtataaattgcttgtg 24795514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 48063299 - 48063611
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48063299 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 48063398  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48063399 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgattgagcaatttgaagtctcatactaa 48063498  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| || |    
T  48063499 gtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttgtggaagaaacctgta 48063598  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    ||| |||||||||    
T  48063599 taatttgcttgtg 48063611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 12174813 - 12175138
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12174813 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattatgtt 12174912  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12174913 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgcgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 12175011  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12175012 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcaagactgacttccggtttgt 12175111  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||    
T  12175112 ggaagaaacctgtataaattgtttgtg 12175138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 48806352 - 48806679
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48806352 aattctagagtctttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttcattgtaattctgt 48806451  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48806452 ttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgataatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaattt 48806551  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48806552 gaagtctcatactaagtttagtattgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttg 48806651  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  48806652 tggaaggaacctgtataaattgcctgtg 48806679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 19339722 - 19340048
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19339722 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattatgtt 19339821  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19339822 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgatcttgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgttcttgagcaatttg 19339921  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  19339922 aagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgt 19340021  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19340022 ggaaggaacctgtataaattgcctgtg 19340048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33421432 - 33421109
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33421432 aattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat-aagtgttcaacctcaaacatttttctta-taattctgtt 33421335  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33421334 tgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 33421236  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  33421235 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggtttgt 33421136  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  33421135 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 33421109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 16557063 - 16557385
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16557063 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 16557162  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16557163 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattcgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagc-atttg 16557261  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  16557262 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgt 16557361  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    | ||||||| || |||||||||||    
T  16557362 gcaaggaacctgtataaattgctt 16557385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16608599 - 16608277
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16608599 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 16608500  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16608499 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattcgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagc-atttg 16608401  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  16608400 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgt 16608301  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    | ||||||| || |||||||||||    
T  16608300 gcaaggaacctgtataaattgctt 16608277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 331321 - 331008
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  331321 tagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 331222  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  331221 tcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctag 331123  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac--atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttg 340  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  331122 gtttagcagtgagcatttgtaatcagatattacttatagtgaactctccttggaagtgccagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctg 331023  T
Q  341 aataaattgcttgtg 355  Q
     ||||||||||||||    
T  331022 tataaattgcttgtg 331008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 9710278 - 9710600
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9710278 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgatcgtatctcaagtgttcaacttcaaacatttttctt-gtaattctgtt 9710376  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9710377 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgtttaggagcgtaggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 9710476  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9710477 aagtctcttgctagttttagcaatgagaaattgtaatcagatattacatagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 9710576  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  9710577 ggaaggaacctgtataaattgctt 9710600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 15704962 - 15705286
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15704962 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctatt 15705060  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15705061 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagc-atttg 15705159  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15705160 aagtctcttactaaatttagtagagagcaattgtaataagatattacataatgaactatccttggaagtgcaagggggacaggactgacttacggtttgt 15705259  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  15705260 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 15705286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 21381902 - 21382228
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21381902 aattctagtgtcattagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtt 21382001  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382002 tgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21382101  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21382102 aagtctcatactaaatatagaaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactcaactaggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgt 21382201  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  21382202 ggaaggaacctgtataaattgattgtg 21382228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15088233 - 15087926
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15088233 aattctagagtcttaagagtctgtatccgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 15088134  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15088133 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 15088035  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  15088034 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcaggactgacttccgatttgt 15087935  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  15087934 ggaaggaac 15087926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 33692175 - 33692481
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33692175 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 33692273  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33692274 tgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcgttagaagtcccttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 33692373  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33692374 aagtctcttgctagttttagcagtgatcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaaaactgacttccggtttgt 33692473  T
Q  329 ggaaggaa 336  Q
    ||||||||    
T  33692474 ggaaggaa 33692481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 30945834 - 30946140
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  | ||||||    
T  30945834 attctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtgttactgttt 30945932  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttga 229  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945933 gaatcgagaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttga 30946032  T
Q  230 agtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtg 329  Q
    |||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  30946033 agtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtg 30946132  T
Q  330 gaaggaac 337  Q
    ||||||||    
T  30946133 gaaggaac 30946140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 36 - 355
Target Start/End: Original strand, 2265996 - 2266313
Alignment:
Q  36 gagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattt 135  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| || | ||||| ||||||||||||||     
T  2265996 gagtctttagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaatcacaaacatttat-tttgttattctgtttgaattg 2266094  T
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctc 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2266095 agaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtttcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttccagttgtgcttgagca-tttgaagtctc 2266193  T
Q  236 ttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2266194 ttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcaaatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaaggctgacttccggtttgtggaagga 2266293  T
Q  336 acttgaataaattgcttgtg 355  Q
    || || |||||||| |||||    
T  2266294 acctgtataaattgattgtg 2266313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14187374 - 14187064
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  14187374 aattctatagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctatgcaattctgtt 14187275  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14187274 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtatcttgattgtgttcaggagtataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 14187176  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14187175 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccgat 14187077  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  14187076 ttgtggaaggaac 14187064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 2914083 - 2914393
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2914083 aattctagagtcttacgagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 2914182  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2914183 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcagaagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 2914281  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2914282 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 2914381  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  2914382 tgtggaaggaac 2914393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 28622832 - 28623156
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28622832 aattctagagtcttaaaagtctgtaactgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 28622931  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  28622932 tgaattaagaagtgtcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgcaattgtacttgagtaatttg 28623031  T
Q  229 aagtctcttacta-agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28623032 aagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttg 28623131  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||| |  |||||||||||    
T  28623132 tggaaggaacctatataaattgctt 28623156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13138370 - 13138678
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  13138370 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacctcaaacatttttcattgtgattttgtt 13138469  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13138470 tgaatttggaagcctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13138568  T
Q  229 aagtctcttactaag-tttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13138569 aagtctcttgctaagttttagcagtgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctcgttggaagtgcaagggggacatgactgacttccgatttg 13138668  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  13138669 tggaaggaac 13138678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 13731147 - 13731453
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13731147 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13731246  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13731247 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13731345  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |    
T  13731346 aagtctcttgctaagtttagcattgaacatttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccagct 13731445  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  13731446 tgtggaag 13731453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 19328487 - 19328792
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19328487 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttaaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 19328585  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19328586 tgaatttagaagtcacttgcagttgtgcttgagcactagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctagcagttgtgcttgagc-atttg 19328684  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||  ||  ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  19328685 aagtctcttgatagttttagcagtgagcaattataatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgt 19328784  T
Q  329 ggaaggaa 336  Q
    ||||||||    
T  19328785 ggaaggaa 19328792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11319090 - 11318780
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11319090 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaaatctgtt 11318991  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11318990 tgaatttgaaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 11318892  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  11318891 aagtctcttgttaagtttagcagtgaacatttgtaatcagatattacattttattgaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatt 11318792  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  11318791 tgtggaaggaac 11318780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13302545 - 13302236
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13302545 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13302446  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13302445 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcaaaggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13302347  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||| ||||| |||  ||||| | | |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  13302346 aagcctcttgctagttttagcagtcagcagttgtaataagatattacattttagtgaactatccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 13302248  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  13302247 tgtggaaggaac 13302236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15467600 - 15467285
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15467600 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctt-gtaattttgtt 15467502  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15467501 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagatgtctcgtgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagaaatttg 15467402  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  15467401 aagtctcttgctagttttagaaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaattctccttggaagtgcaagggggacaggactgatttctggtttgt 15467302  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  15467301 ggaaggaacttgtataa 15467285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19711486 - 19711793
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19711486 aattctagaatctttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtt 19711585  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19711586 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgaataatagaagtctcttgaccgtgttcaggagtataggaagtctcttggagttgtgcttgagcaagttg 19711685  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| |    
T  19711686 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttctggtttat 19711784  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  19711785 ggaaggaac 19711793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 43 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4821154 - 4820862
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-cttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagt 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4821154 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactacaaaca-tattccttgtaattctgtttgaattcagaagt 4821056  T
Q  142 ctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttacta 241  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4821055 ctcttgcagatgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttacta 4820957  T
Q  242 agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4820956 agtatagtagtgagcaattgtaatcaaatactacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaaggaac 4820862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11792593 - 11792285
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  11792593 aattctaaagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctatt 11792494  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  11792493 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgttcttaagtaatttg 11792396  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11792395 aagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 11792297  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  11792296 tgtggaaggaac 11792285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 337
Target Start/End: Original strand, 13034318 - 13034620
Alignment:
Q  36 gagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattt 135  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13034318 gagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa--t 13034415  T
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctc 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13034416 agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataataagtctcttgattctgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctc 13034515  T
Q  236 ttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaa 332  Q
    || |||  ||||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13034516 ttgctagttttagcagtgagaagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaa 13034615  T
Q  333 ggaac 337  Q
    |||||    
T  13034616 ggaac 13034620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 10883645 - 10883953
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10883645 aattctagagtcttaagagttt-tatccgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtt 10883743  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10883744 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgttcttgagc-atttg 10883842  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  10883843 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 10883941  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  10883942 tgtgaaaggaac 10883953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14426231 - 14425926
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  14426231 aattctagagtctttagagtctgaatctgacttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattttgtt 14426133  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14426132 tgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttt 14426034  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  14426033 aagtctcgtgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattactttttagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 14425935  T
Q  326 tgtggaagg 334  Q
    |||||||||    
T  14425934 tgtggaagg 14425926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 21283847 - 21284156
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21283847 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatctatattaggaacaccactaattgtatatcaagtgttcaactgcaaacatttttctatgtaattctgtt 21283946  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21283947 tgaatt-agaagtctcttgcagttgtgctctagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 21284044  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21284045 aagtctcttgctaagtttagcagtgaacagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactcccggtt 21284144  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  21284145 tgtggaaggaac 21284156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 23280434 - 23280734
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||    
T  23280434 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaatcatttttctt-gtaattctgtt 23280532  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||       |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280533 tgaattaagaagtctcttgcagtt-------agcattagaagtatcttcattgcgttaaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 23280625  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| |||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23280626 aagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgt 23280725  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  23280726 ggaaggaac 23280734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4494260 - 4493950
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4494260 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 4494161  T
Q  129 tgaatttagaagtctctt-gcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4494160 tga--ttagaagtctctttgcaattgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgctcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaattt 4494063  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | || |||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  4494062 gaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctcctttgaagtgcaagggggacaggaat-acttccgg 4493964  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| |||||||    
T  4493963 tttgtgaaaggaac 4493950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16315012 - 16315320
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  16315012 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattttgtt 16315111  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16315112 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtttattgattgtgttcaggagcataggaagtctcttacagttgtacttgagc-atttg 16315210  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    ||||||| || | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  16315211 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaattagatattactttttagtgaattctccttggaagtgcaaggggg-catgact-acttccggtt 16315308  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  16315309 tgtgaaaggaac 16315320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16317029 - 16317336
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16317029 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttctattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctatgtaattatgtt 16317128  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     ||||  || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16317129 cgaat--agtagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 16317226  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| | |||||||||||||||||||   ||| |||||| |||    
T  16317227 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattaaattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggac-ggact-acttcctgtt 16317324  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  16317325 tgtggaaggaac 16317336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13027375 - 13027681
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13027375 aattctggagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 13027474  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  13027475 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttg 13027572  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||||||   |||||||||||||| |   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13027573 aagtctcttgctagttttagaagtgagca---gtaatcagatattaaaatttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacagaactgacttccggtt 13027669  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  13027670 tgtgaaaggaac 13027681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 93 - 337
Target Start/End: Original strand, 48237378 - 48237622
Alignment:
Q  93 tgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagc 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48237378 tgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagc 48237477  T
Q  193 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  48237478 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaactgtaatcagatattacatagtgaattctccttg 48237577  T
Q  293 gaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48237578 gaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 48237622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Original strand, 16112358 - 16112588
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16112358 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 16112457  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  16112458 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcagtagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-atttg 16112556  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcattt 260  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||||||    
T  16112557 aagtctcttgctagttttagcagtgagcattt 16112588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16310379 - 16310689
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt--tcaacttcaaacaattttctttgtaattctg 126  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16310379 aattctagaatcttaagagtctatatctgatttgtattgtaaacacatttgattgtatatcaagtgtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctg 16310478  T
Q  127 tttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16310479 tttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtattcaggagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatt 16310576  T
Q  227 tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  16310577 tgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccatggaattgcaagggggacatgact-acttccgg 16310675  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  16310676 tttgtggaaggaac 16310689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 29935818 - 29936127
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29935818 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctg-gtaattctgtt 29935916  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29935917 tgaatt-agaagtctcttgcagttatgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgctcaggagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 29936015  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||| || || |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  29936016 aagacttttgctaagtttagcagtgagcaattgtaattagatattacattttttagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggact-acttccgg 29936113  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  29936114 tttgtggaaggaac 29936127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 5001297 - 5001608
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5001297 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtaaataccacaaattgtatattaactgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgt 5001396  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  5001397 ttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcaggagtatgggaaatctcttgcagttgtgcttgtgtaattt 5001496  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |    
T  5001497 gaagtctcttgataagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-actttcgat 5001595  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  5001596 ttgtggaaggaac 5001608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13879820 - 13879545
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13879820 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttataattctgtttgattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaa 13879721  T
Q  164 atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat---tt 260  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | |||||||   ||    
T  13879720 ttagaagtatcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgttgttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcattaatt 13879622  T
Q  261 gtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13879621 gtaatcagatattacatagtgaactctccttagaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 13879545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13683281 - 13683004
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13683281 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgtt-aacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13683183  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  13683182 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcatgtagttgtgcttgag-tatttg 13683084  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggg 305  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13683083 aagtctcttcctagttttagcaatgagcagttgcaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggg 13683004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13261087 - 13261397
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactt-caaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||    
T  13261087 aattctagagtcttaagagtctgtattcgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacccgcaaacaattttctgtgtaattttgt 13261186  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13261187 ttgaatt-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaagagtcttttgattctgtccaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt 13261285  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
T  13261286 gaagtctcttgctaagtttaacagtaagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccagt 13261384  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  13261385 ttgtggaaggaac 13261397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 41842898 - 41843214
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41842898 aattcaagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 41842997  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  41842998 tgaat--agaagtctcttgcagctgtgcttgaggataagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttg 41843095  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    || |||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  41843096 aaatctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 41843194  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  41843195 tatggaaggaacttgtataa 41843214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 33604543 - 33604282
Alignment:
Q  76 actgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33604543 actgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttctt-gtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctct 33604445  T
Q  176 tgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||    
T  33604444 tgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtatcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatatgac 33604346  T
Q  276 ---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
        ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33604345 tttttagcgaactctccttggaagtggaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 33604282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8182614 - 8182437
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182614 aattctagagcctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 8182515  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8182514 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctctt 8182437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 337
Target Start/End: Original strand, 12367213 - 12367519
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  12367213 tctagagtcctaagagtctgtatgtgatttatgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaat-aattttctgtgtaattctgtttga 12367311  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctctt-gattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaa 230  Q
    ||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  12367312 att-agaagtctcttagagttgtgcttgagcattagaagtctctttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttttgcttgattaatttgaa 12367410  T
Q  231 gtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    || |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  12367411 gtttcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactttccttggaagtgcaagggggacataact-acttccagtttg 12367509  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  12367510 tggaaggaac 12367519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 148 - 349
Target Start/End: Original strand, 35954498 - 35954698
Alignment:
Q  148 cagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttta 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35954498 cagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagttta 35954596  T
Q  248 gtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaat 347  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  35954597 gtagtgaggaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaat 35954696  T
Q  348 tg 349  Q
    ||    
T  35954697 tg 35954698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2499721 - 2499529
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2499721 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 2499622  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499621 tgaa-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcataagaaatctcttgattgtg-tcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 2499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 7488377 - 7488685
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7488377 aattctagagtcttaagagtctatagcttatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgt 7488476  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  7488477 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctcttgaaattgtgcttgagtaattt 7488574  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| || |||  || |||| ||| |||||||||| |||||||     |||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  7488575 gaagtcttttgctattttgagtagtgaacatttgtaattagatattgattttagtgaactctccttggaagtgtaagggggactggact-acttccggtt 7488673  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  7488674 tgtggaaggaac 7488685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 197 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14425032 - 14424875
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14425032 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctctttggaag 14424933  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14424932 tgcaagggggacaagactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgt 14424875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 277
Target Start/End: Original strand, 13472985 - 13473217
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13472985 tagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaggctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat--agaagtc 13473082  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || |||     
T  13473083 tcttgcagttgtgcttgagcataaaatgtctcttgattgtgttcagcagcatagaaaatctcttgcacttgtgcttgagtagtttgaagtcttttgctag 13473182  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat 277  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  13473183 ttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacat 13473217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Original strand, 19237532 - 19237817
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||       
T  19237532 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttataatttagtttgaa--tagaagtctcttgctta 19237629  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaa 251  Q
    | ||||||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| | |||||||| | || |||  ||||| |     
T  19237630 tgtgcttgagcataagaaggttattgaatgtgttcaggagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtagtttgaagttttttgctagttttagcag 19237729  T
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19237730 tgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 19237817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1292606 - 1292448
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1292606 gaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagttagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaag 1292507  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1292506 tgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 1292448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1292714 - 1292578
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292714 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 1292615  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaat 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1292614 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgtttgagcaat 1292578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44466642 - 44466469
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||    
T  44466642 agaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagc-atttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaat 44466544  T
Q  266 cagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44466543 cagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 44466469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 22579688 - 22579835
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  22579688 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattcttct 22579787  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22579788 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atagaagtctcttg 22579835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 4433040 - 4433321
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  4433040 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 4433137  T
Q  160 agcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||| |||| || ||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  4433138 agc-atagaaattctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcat 4433236  T
Q  259 ttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| |   |||  || ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4433237 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactttccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 4433321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9069304 - 9069135
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| || |||||  |||||||    
T  9069304 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcaaagagcagctgtaatc 9069206  T
Q  267 agatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9069205 agatactacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaagaac 9069135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16411673 - 16411384
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16411673 tagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttttaattctgtttgaa--tagaagt 16411578  T
Q  142 ctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttact 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||    
T  16411577 ctcttgcagttgtgcttgagc-atagtaagtctcttgagtgtgttcttgagcataagaattctcttgcagttttgcttgagtagtttgaagtctcttgct 16411479  T
Q  241 aagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |   ||     |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16411478 a---ttgtgcttgagcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagtgggacaggact-acttccggattgtggaaggaac 16411384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13646075 - 13645927
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13646075 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaaaaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13645976  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  13645975 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagtattaaaagtctcttg 13645927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 168 - 355
Target Start/End: Original strand, 15574193 - 15574379
Alignment:
Q  168 aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatca 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  15574193 aagtctcttaattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcatgagcg-tttgaagtctattactaattttagtagtgagcaattgttatca 15574291  T
Q  268 gatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15574292 gatattacatagtgaactctccttagaagtgcaagggggacaggtttgacttccgatttgtggaaggaaactgtataaattgcttgtg 15574379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14425126 - 14425004
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14425126 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtc 14425027  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaat 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  14425026 tcttgcagttgtgcttgagcaat 14425004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 602420 - 602126
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||    
T  602420 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa-ttagaagtctcttgctttagtgcttg 602322  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||  ||||||    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||   || |||| |||||| |    
T  602321 agcatctgaagtctcttacttgtgtgtttgagcata-gaagtctcttgctg-tgtgcttgagcaatctgaagtctcatacttgtttaagtattgagcagt 602224  T
Q  260 tgtaatc-----agatattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgct 351  Q
    |||||||      |||  ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  602223 tgtaatcttgtgtgattatacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcgatttgtggaaggaacctgtataaattgct 602126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Original strand, 13902136 - 13902390
Alignment:
Q  79 gattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttga 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  13902136 gattgtatatcaagagttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttga 13902233  T
Q  179 ttgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-- 276  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||  || || |||||||| ||||||| ||| |||| |      
T  13902234 ttgtgttcaggagcataggaaatcacttacagttgtgcttgagtagtttgaagtcttttgctagcttcagcaatgagcaattgtaattagaaattatatt 13902333  T
Q  277 -tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
     ||| ||||||   |||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  13902334 ttagcgaactcttcttggaagtacaagggggacaggact-acttctggtttgtggaag 13902390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 4412467 - 4412749
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  4412467 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 4412564  T
Q  160 agcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||| |||| |||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  4412565 agc-atagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 4412663  T
Q  259 ttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactg-acttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4412664 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgaacttccggtttgtggaaggaac 4412749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 9099513 - 9099818
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| ||    
T  9099513 aattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatt 9099612  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  ||||||||||||||  || ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||    |||||| | |||    
T  9099613 tgaa--tagaagtctcttgcttttgtgcttgag-tatagaaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagt----cttgagtagttt 9099705  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||||  ||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||| | ||||||||||||| || | |  ||| ||||||||    
T  9099706 gaagtctcttggtagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattacatttttagtggactctccttggaagtgcaagaggaatatgact-acttccgg 9099804  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  9099805 tttgtggaaggaac 9099818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8182447 - 8182317
Alignment:
Q  227 tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt--aatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8182447 tgaagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggt 8182348  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8182347 ttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 8182317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 25687314 - 25687519
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25687314 aattttagagtcttaagagtttgtatatgatttgtattgggaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattatgtt 25687412  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    ||| |  |||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  25687413 tgaa--taaaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcatttgtgcttgagtagtttg 25687510  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  25687511 aagtctctt 25687519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 9098707 - 9099012
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||| ||    
T  9098707 aattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaataccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatt 9098806  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  ||||||||||||||  || ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||||    |||||| | |||    
T  9098807 tgaa--tagaagtctcttgcttttgtgcttgag-tatagaaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctctttcagt----cttgagtagttt 9098899  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||||  ||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    ||||| |||| | ||||||||||||| || | |  ||| ||||||||    
T  9098900 gaagtctcttggtagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattacatttttagtggactctccttggaagtgcaagaggaatatgact-acttccgg 9098998  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  9098999 tttgtggaaggaac 9099012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30025589 - 30025442
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  30025589 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattctgaacaccactaattgtatatcaactgttcaacatcaaac-attttctttgtaattttttt 30025491  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  30025490 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgtttgagcattagaagtttcttg 30025442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 337
Target Start/End: Original strand, 16545956 - 16546117
Alignment:
Q  175 ttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatta 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  16545956 ttgattgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagta-tttgaagtctcttgctagttttaatagtgagcaattgtaatgagatatta 16546054  T
Q  275 catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  16546055 cgtagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaac 16546117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16619706 - 16619545
Alignment:
Q  175 ttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatta 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  16619706 ttgattgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagta-tttgaagtctcttgctagttttaatagtgagcaattgtaatgagatatta 16619608  T
Q  275 catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  16619607 cgtagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaac 16619545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21691910 - 21691763
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  21691910 tagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtattttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaa 21691811  T
Q  265 tcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    |||||||| |||   |||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21691810 tcagatataacattttagtgaactctccttggaagttcaagggggaca 21691763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 22579825 - 22579964
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  22579825 gaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactttccttggaag 22579923  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22579924 tgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggaac 22579964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 35953159 - 35953282
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  35953159 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgaatatcaagtgttcaacctcaaatatttttc-ttgtaattctgtt 35953257  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttt 153  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  35953258 tgaattcagaagtctcttgcagttt 35953282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 39285037 - 39285158
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39285037 aattctagagtcttaagagtttgtatctaatttgtattgtggacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 39285136  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagtt 152  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  39285137 tgaa--tagaagtctcttgcagtt 39285158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21692015 - 21691902
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21692015 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 21691916  T
Q  129 tgaatttagaagtct 143  Q
    |||| ||||||||||    
T  21691915 tgaa-ttagaagtct 21691902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 11087507 - 11087708
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  11087507 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgggtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttgagca 11087604  T
Q  164 atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    |  ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  11087605 aaggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgt 11087704  T
Q  263 aatc 266  Q
    ||||    
T  11087705 aatc 11087708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 44466747 - 44466647
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44466747 aattctagagtcttaacagtctctatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 44466648  T
Q  129 t 129  Q
    |    
T  44466647 t 44466647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 13172828 - 13172956
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13172828 aattctagagtattaagagtc-ctatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccacaaac-attttctttgtaattctgtt 13172925  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||  ||||||||||||||  || ||||||||    
T  13172926 tgaa--tagaagtctcttgcttttgtgcttgag 13172956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30025452 - 30025310
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |  |||    
T  30025452 gaagtttcttgcagttgtgcatgagcaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctctctgg 30025353  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30025352 aagtggaagggggacaagact-acttccggtttgttgaaggaac 30025310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 8999393 - 8999598
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  8999393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 8999490  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||  ||||| ||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  8999491 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatttgaagtttcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 8999590  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  8999591 ttgtaatc 8999598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16308187 - 16308491
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  16308187 aattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatatagtgttcaaacctcaaac-attttatgtgtaattctgt 16308285  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  ||||||||||||| |  || ||||||||||   |||| |||||   ||||| |  |||||||| ||  |||||||  ||||||||||  | |||    
T  16308286 ttga--ttagaagtctcttacttttgtgcttgagcataggaagactcttacgtgtgtgcttgagcatagaaaacctcttgcttttgtgcttgactagttt 16308383  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||| ||   |||  |  |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |    
T  16308384 gaagtctcttgct---tttgttcttgagcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggat 16308479  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  16308480 tgtggaaggaac 16308491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5035047 - 5034864
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||  | ||||||| ||||||  |    
T  5035047 tatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattttgtttg--tctagaagtatcttgcttt 5034950  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    | ||||||||||   |||||||||||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | || ||||||||||    
T  5034949 tgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctctt 5034864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 337
Target Start/End: Original strand, 13259053 - 13259184
Alignment:
Q  208 cagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaaggg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13259053 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggg 13259152  T
Q  305 ggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13259153 ggacaggact-acttccgatttgtggaaggaac 13259184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 337
Target Start/End: Original strand, 13266393 - 13266524
Alignment:
Q  208 cagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaaggg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13266393 cagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggg 13266492  T
Q  305 ggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13266493 ggacaggact-acttccgatttgtggaaggaac 13266524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 13175064 - 13175148
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13175064 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctctt 13175148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24882875 - 24882989
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  24882875 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 24882971  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| | |||||||||||    
T  24882972 agcattggaagtctcttg 24882989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 39285143 - 39285285
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||||||||||||||| || || | |||||||| |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||    
T  39285143 gaagtctcttgcagttgtgtttaagtagtttgaagtttcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctctttgg 39285242  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39285243 aagtggaagggagacaggact-acttccggtttgtggaaggaac 39285285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 3476795 - 3476877
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3476795 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 3476877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Original strand, 16105439 - 16105509
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16105439 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 16105509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29589838 - 29589755
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29589838 ttgtaatgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 29589755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Original strand, 18362041 - 18362140
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  18362041 aattctagagtcttaagtgttt-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaacatctttctgtgtaattttgtt 18362138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2499526 - 2499428
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaat 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2499526 tgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggtcaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaat 2499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24787845 - 24787736
Alignment:
Q  231 gtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24787845 gtctcttgataagtttagcagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttg 24787746  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  24787745 tggaaggaac 24787736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8933409 - 8933327
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8933409 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctct 8933327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9802829 - 9802668
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaattct-gtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||| |||||   ||| |||| ||||||   | ||||||    
T  9802829 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaact--aaacaattatttccttgtaattctagtttg---ttataagtgtcttgcttgtgtgcttg 9802735  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9802734 agcatgtgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttatgtgcttgagcaatt 9802668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17950572 - 17950686
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||||||    
T  17950572 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcatgcgtgcttg 17950668  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17950669 agcattagaagtctcttg 17950686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48382033 - 48381919
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||     ||||||    
T  48382033 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttga--ttagaagcctcttgcctgcgtgcttg 48381937  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  48381936 agcattagaagactcttg 48381919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 26210003 - 26210075
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26210003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaat 26210075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 2706060 - 2706180
Alignment:
Q  54 tctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttt 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||         
T  2706060 tctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcg 2706156  T
Q  154 tgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  2706157 tgcttgagcattagaagtctcttg 2706180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 2716664 - 2716784
Alignment:
Q  54 tctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttt 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||         
T  2716664 tctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgca 2716760  T
Q  154 tgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  2716761 tgcttgagcattagaagtctcttg 2716784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 24931057 - 24931220
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24931057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24931153  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  24931154 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcaattt 24931220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18418960 - 18418685
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| ||     ||||||    
T  18418960 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttga--ttagaagcctctcgcctgcgtgcttg 18418864  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  18418863 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaag-agagtattgagcat 18418765  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||   || ||||  ||||| || || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18418764 ttgtaatctttgagatta-ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 18418685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18441041 - 18440766
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| ||     ||||||    
T  18441041 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-actttctgtgtatttctgtttga--ttagaagcctctcgcctgcgtgcttg 18440945  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  18440944 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaag-agagtattgagcat 18440846  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||   || ||||  ||||| || || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18440845 ttgtaatctttgagatta-ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 18440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 166741 - 166627
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  166741 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 166645  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  166644 agcattagaagtctcttg 166627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 177333 - 177219
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  177333 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 177237  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  177236 agcattagaagtctcttg 177219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 468035 - 468149
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  468035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 468131  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  468132 agcattagaagtctcttg 468149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1987386 - 1987272
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  1987386 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 1987290  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1987289 agcattagaagtctcttg 1987272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1998007 - 1997893
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  1998007 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 1997911  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1997910 agcattagaagtctcttg 1997893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 147
Target Start/End: Original strand, 2501515 - 2501600
Alignment:
Q  58 atttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  2501515 atttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaac-ttattctttgtaatttcgtttg--tttagaagtctcttg 2501600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4222454 - 4222340
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4222454 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4222358  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4222357 agcattagaagtctcttg 4222340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6867679 - 6867793
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6867679 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6867775  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6867776 agcattagaagtctcttg 6867793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6878311 - 6878425
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6878311 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6878407  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6878408 agcattagaagtctcttg 6878425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8627795 - 8627681
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  8627795 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 8627699  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8627698 agcattagaagtctcttg 8627681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11005031 - 11004917
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  11005031 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 11004935  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11004934 agcattagaagtctcttg 11004917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13645968 - 13645826
Alignment:
Q  196 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||  | || || |||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||   |||    
T  13645968 ggaagtctcttgcagttgtgcttgag-tattaaaagtctcttgctagttatattagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtgaactctgcttg 13645870  T
Q  293 gaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  13645869 gaagtgcaagggggacaggact-acttacggtttgtggaaggaac 13645826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15216162 - 15216080
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  15216162 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtataattttgtttgaa--tagaagtctct 15216080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 16155463 - 16155525
Alignment:
Q  256 catttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgact 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16155463 catttgtaatcagatattacatagtgaattctccttggaagtgcaagggggacaagactgact 16155525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17961178 - 17961292
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17961178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17961274  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17961275 agcattagaagtctcttg 17961292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22088969 - 22088855
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22088969 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22088873  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22088872 agcattagaagtctcttg 22088855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22099584 - 22099470
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22099584 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22099488  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22099487 agcattagaagtctcttg 22099470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24734599 - 24734485
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24734599 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24734503  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24734502 agcattagaagtctcttg 24734485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24744546 - 24744432
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24744546 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24744450  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24744449 agcattagaagtctcttg 24744432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26294483 - 26294597
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26294483 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26294579  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26294580 agcattagaagtctcttg 26294597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26390550 - 26390664
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26390550 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26390646  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26390647 agcattagaagtctcttg 26390664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26401192 - 26401306
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26401192 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26401288  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26401289 agcattagaagtctcttg 26401306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37344046 - 37343932
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  37344046 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 37343950  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  37343949 agcattagaagtctcttg 37343932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42865673 - 42865559
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  42865673 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 42865577  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42865576 agcattagaagtctcttg 42865559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42876299 - 42876185
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  42876299 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 42876203  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42876202 agcattagaagtctcttg 42876185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 48710945 - 48711059
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  48710945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 48711041  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48711042 agcattagaagtctcttg 48711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 12734619 - 12734691
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  12734619 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaactttgtttgaat 12734691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23125627 - 23125439
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  23125627 aattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattgtgaacacggccgataatatatcaagtgttcaac--caaacatatttctttgtaatt-tgtt 23125532  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||  |||||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |  ||| ||  ||||||||||||   ||||||||||||    
T  23125531 tg--tttagaagtctcttacttttgggcttgagcattagaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 23125439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 589059 - 588785
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| ||||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  589059 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacataattcattgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 588963  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  || ||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  588962 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgaacattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttag-atagtattgagc 588865  T
Q  257 atttgtaatc--agatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||   |  |||  |||||||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  588864 atttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgatttgtggaaggaac 588785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16472346 - 16472303
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16472346 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16472303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 33605369 - 33605314
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgt 84  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33605369 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgt 33605314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 455253 - 455367
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||| ||||     ||||||    
T  455253 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtcttttgcctgcgtgcttg 455349  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  455350 agcattagaagtctcttg 455367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 8002519 - 8002633
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  8002519 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 8002615  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8002616 agcattagaagtctcttg 8002633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 8013164 - 8013278
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  8013164 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 8013260  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8013261 agcattagaagtctcttg 8013278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9085126 - 9085016
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||||||    
T  9085126 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 9085030  T
Q  164 atagaagtctcttg 177  Q
     |||||||||||||    
T  9085029 ttagaagtctcttg 9085016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9094840 - 9094730
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||||||    
T  9094840 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 9094744  T
Q  164 atagaagtctcttg 177  Q
     |||||||||||||    
T  9094743 ttagaagtctcttg 9094730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26653779 - 26653893
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  26653779 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 26653875  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26653876 agcattagaagtctcttg 26653893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 26700108 - 26700222
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  26700108 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 26700204  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26700205 agcattagaagtctcttg 26700222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30049366 - 30049252
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| || |||||||  | ||||| ||||||||    ||||||    
T  30049366 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttatttctttgtatttttgtttga--tcagaagactcttgcatgcgtgcttg 30049270  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  30049269 agcattagaagactcttg 30049252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 38594165 - 38594280
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  38594165 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcattatcaaacttttttctttgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 38594262  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  38594263 agcattagaagactcttg 38594280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 40042562 - 40042676
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  40042562 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 40042658  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40042659 agcattagaagtctcttg 40042676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 40053111 - 40053225
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  40053111 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 40053207  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40053208 agcattagaagtctcttg 40053225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4211855 - 4211770
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  4211855 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgc 4211770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11015615 - 11015574
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015615 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 11015574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Original strand, 21211245 - 21211334
Alignment:
Q  259 ttgtaatcagatattacat----agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21211245 ttgtaatcaaatattacatttttagtgaactctccttgcaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaacttgtataa 21211334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 113
Target Start/End: Original strand, 38403665 - 38403718
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  38403665 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacattttt 38403718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9762337 - 9762194
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaattc-tgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||| ||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||    
T  9762337 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaact--aaacaattatttccttgtaattcttgtttg---ttataagtttcttgcttgtgtgcttg 9762243  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  9762242 agcatgtgaagtctcttgcttgtgtacttgagcatatgaagtctcttgc 9762194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 540931 - 540892
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  540931 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 540892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1367476 - 1367437
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367476 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1367437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3165581 - 3165542
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165581 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3165542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5685365 - 5685326
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685365 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5685326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11095900 - 11095861
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095900 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11095861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 15888782 - 15888821
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888782 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15888821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 21770396 - 21770435
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770396 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21770435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44280341 - 44280302
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280341 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 44280302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8617232 - 8617118
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     || |||    
T  8617232 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgattg 8617136  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8617135 agcattagaagtctcttg 8617118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25807076 - 25807007
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25807076 aattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 25807007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 41842745 - 41842799
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattg 83  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41842745 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattttgatcaccactgattg 41842799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 1878762 - 1878803
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1878762 tttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 1878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 12222937 - 12222978
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12222937 tttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 12222978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Original strand, 13172928 - 13172988
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||||||||||| || ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13172928 aatagaagtctcttgcttttgtgcttgagtataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 13172988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Original strand, 40055212 - 40055292
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||    
T  40055212 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-tttttctgtgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgc 40055292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9433110 - 9433071
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9433110 ttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaa 9433071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9443706 - 9443667
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9443706 ttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaa 9443667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13682165 - 13682095
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  13682165 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgtttaaagtcaaac-attttcggtgtaattttgtttga 13682095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 14746123 - 14746162
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746123 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14746162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20989499 - 20989460
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20989499 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 20989460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 21003462 - 21003501
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21003462 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 21003501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 31116964 - 31117003
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116964 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31117003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 15871582 - 15871623
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15871582 tttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaac 15871623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19416900 - 19416856
Alignment:
Q  77 ctgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19416900 ctgattgtatatcaagtgttcaactt-acacaattttctttgtaat 19416856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 20490853 - 20490816
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20490853 ttgtattgtgaaccccactgattgtatatcaagtgttc 20490816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9159574 - 9159538
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9159574 tattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaa 9159538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9170029 - 9169993
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9170029 tattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaa 9169993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9065151 - 9065097
Alignment:
Q  68 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat-tttctttgtaat 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  9065151 tgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaacaatatttttttgtaat 9065097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 48237341 - 48237380
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgt 68  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  48237341 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgt 48237380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13263426 - 13263320
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||  || ||||||||||     
T  13263426 ttgtaaacacctctgattgtatatcaagtgttcatc-tcaaac-ttattctttgtaa-tctgtttga---tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 13263333  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
      |||||||||||    
T  13263332 aggaagtctcttg 13263320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Original strand, 22579823 - 22579865
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  22579823 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttg 22579865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4447114 - 4447066
Alignment:
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4447114 agaagtctctttcaattgtgattgagcaatagaagtctcttgcttgtgt 4447066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8182506 - 8182478
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182506 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 8182478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 165)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23024480 - 23024157
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23024480 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 23024381  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23024380 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 23024281  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  23024280 aattctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgt 23024181  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  23024180 ggaaggaacctgtataaattgctt 23024157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 21121457 - 21121783
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21121457 aattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattccgtt 21121556  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21121557 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21121656  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21121657 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 21121756  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  21121757 ggaaggaacctgtataaattgtttgtg 21121783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 21215069 - 21215395
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21215069 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtatttttgtt 21215168  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21215169 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttccggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21215268  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21215269 aagtctcttactaaggttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaattccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 21215368  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  21215369 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 21215395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46088676 - 46088350
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46088676 aattctagagtctttaaagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 46088577  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46088576 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaatttg 46088477  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46088476 aagtctcttactaagtttagaagtgagcatgtgtaatcagatattacatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgt 46088377  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  46088376 ggaaggaacttgtataaattgcttgtg 46088350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 21205265 - 21205588
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21205265 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 21205364  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205365 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttccggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21205464  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21205465 aagtctcttactaaggttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgt 21205564  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  21205565 ggaaggaacctgtataaattgctt 21205588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21984283 - 21983964
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21984283 aattctagagtctttagagtctgtatctaatttatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtt 21984184  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21984183 tgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtatcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21984084  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21984083 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 21983984  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaatt 348  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  21983983 ggaaggaacctgtataaatt 21983964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 44824154 - 44824478
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44824154 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 44824252  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44824253 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 44824351  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44824352 aagtttcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 44824451  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  44824452 ggaaggaacctgtataaattgtttgtg 44824478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21702501 - 21702177
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702501 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 21702402  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21702401 tgaattcagaagtttcttgcagttgttcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 21702303  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  21702302 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagagggataggactgacttccggtttgt 21702203  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgt 354  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21702202 ggaaggaacctgtttaaattgcttgt 21702177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42284301 - 42284008
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42284301 tgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtg 42284202  T
Q  156 cttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42284201 cttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgag 42284102  T
Q  256 catttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  42284101 catttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattg 42284008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 21135555 - 21135878
Alignment:
Q  31 ttctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 130  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135555 ttctaaagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgatcgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttg 21135654  T
Q  131 aatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaa 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21135655 aattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatttgaa 21135754  T
Q  231 gtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgg 330  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  21135755 gtctcatactaagattagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttgaaagtgcaa-ggggacatgactgacttccggtttgtgg 21135853  T
Q  331 aaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||    
T  21135854 aaggaacctgtataaattacttgtg 21135878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37640697 - 37640376
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37640697 aattctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtt 37640598  T
Q  129 tgaatttag-aagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37640597 tgaatttaggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 37640498  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  37640497 gaagtctcatactaagtatagtattgagcagttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttg 37640398  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  37640397 tggaaggaacctgtataaattg 37640376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10250673 - 10250350
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10250673 aattctaaagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 10250575  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10250574 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 10250476  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10250475 aagtctcttactaa-tttagttgtgagcaattgtaataagatattagatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 10250377  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  10250376 ggaaggaacctgtataaattgtttgtg 10250350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 43 - 352
Target Start/End: Original strand, 25448963 - 25449274
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25448963 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaaatc 25449062  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25449063 tcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctattgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttactaa 25449161  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaactt 339  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25449162 gtttagtagtgagcaattgtaatcagatattactttatagtgaacgctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacct 25449261  T
Q  340 gaataaattgctt 352  Q
    | |||||||||||    
T  25449262 gtataaattgctt 25449274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 48570623 - 48570947
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  48570623 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattatgtt 48570721  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48570722 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtggtcgagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 48570820  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  48570821 aagtatcttactaagtttagtagttagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgattgacttccggtttgt 48570920  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  48570921 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 48570947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29215482 - 29215163
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29215482 aattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaatatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 29215384  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29215383 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 29215284  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29215283 aagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaattagatattatattgtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 29215184  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  29215183 ggaaggaacttgtataaattg 29215163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 14263823 - 14264153
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263823 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagtctcaaacaattttctttgtaattctgtt 14263922  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14263923 tgaattgagaagtctcttgcttttgtgcttgagcaatagaagtctcttgacttagttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagca-tttg 14264021  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggac-----aatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||     |  |||||||| |||    
T  14264022 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacgggacaggactgactttcgg 14264121  T
Q  324 tttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14264122 tttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 14264153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 23036899 - 23037206
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  23036899 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctgtt 23036998  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23036999 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaggtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgctgttgtgcttgagc-atttg 23037097  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23037098 aagtctcttgctagttttagctgtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 23037197  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  23037198 ggaaggaac 23037206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30571884 - 30571561
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30571884 aattctaaagcctttagaatttgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatcttctttgtaattctgtt 30571785  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30571784 tgaattgagaagtctcttgcagttgtg-ttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagc-atttg 30571687  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30571686 aagtctcttactaaatttagtagtgaacatttgtaatcagatattacatagtg-actctccttgaaagtacaagggggacaggactgacttccggtttgt 30571588  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||    
T  30571587 ggaaggaatctgtataaattacttgtg 30571561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1577553 - 1577246
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1577553 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtt 1577454  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1577453 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcgtgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggatgactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 1577355  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1577354 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 1577255  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  1577254 ggaaggaac 1577246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16235701 - 16236007
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16235701 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 16235799  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16235800 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atgtg 16235898  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16235899 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtccaagggggacaaaactgacttccggtttgt 16235998  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  16235999 ggaaggaac 16236007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2834374 - 2834068
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2834374 aattctaaagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattgtgtt 2834275  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2834274 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 2834175  T
Q  229 aagtctcttacta-agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  2834174 aagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattacatagtgaactctccttggaaatgcaagggggacatgaccgacttccggtttg 2834075  T
Q  328 tggaagg 334  Q
    |||||||    
T  2834074 tggaagg 2834068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19215300 - 19214976
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  19215300 aattctagagtctttagagtatatatctgatctgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtt 19215202  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19215201 tgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcattttg 19215102  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac--atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||||    
T  19215101 aagtctcatactaagtttagtattgagcaattgtaatcagatattacttttagtgaactctccttggaagtacaaaggggacaggattgatttccggttt 19215002  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  19215001 gtggaaggaacctgtataaattgctt 19214976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7309506 - 7309197
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7309506 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacaattttctgtgtaattctgtt 7309407  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7309406 tgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 7309308  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  7309307 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcatttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttagaagtgcaagggggacagtact-acttccgatt 7309209  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  7309208 tgtggaaggaac 7309197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 33256742 - 33257060
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33256742 aattctagagtcataagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 33256841  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33256842 tgaatttagaagtctcttgcagctggacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 33256940  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  33256941 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtt 33257040  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33257041 tgtggaaggaacttgtataa 33257060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 33276914 - 33277232
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33276914 aattctagagtcataagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 33277013  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33277014 tgaatttagaagtctcttgcagctggacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 33277112  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  33277113 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtt 33277212  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  33277213 tgtggaaggaacttgtataa 33277232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10757112 - 10756803
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10757112 aattctagagttttaagattttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 10757013  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10757012 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 10756915  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10756914 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 10756816  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  10756815 ttgtggaaggaac 10756803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22153544 - 22153234
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22153544 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaatacaactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtt 22153445  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22153444 tgaat--aaaagtctcttgcagttgtgcttaagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 22153347  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||    
T  22153346 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttctagtgaactctccttggaagtgcaagagggacaggaccgacttccagt 22153247  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  22153246 ttgtggaaggaac 22153234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 32786332 - 32786639
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32786332 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgcgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 32786430  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32786431 agaattaagaagtctcttgcagttgtgctcgagcattagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 32786530  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||  ||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||    
T  32786531 aagtctcttgatagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggagacaggattgacttccagtttgt 32786630  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  32786631 ggaaggaac 32786639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36133889 - 36133583
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36133889 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtt 36133790  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36133789 tgaa-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 36133692  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||    
T  36133691 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggccagggctaacttccggtttgt 36133592  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  36133591 ggaaggaac 36133583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 2327829 - 2328151
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2327829 aattctagagtcttaagagtctg-atctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca-tattctttgtaattctgtt 2327926  T
Q  129 tgaattt--agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2327927 tgaatttttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagtcgtgcttgagca-tt 2328025  T
Q  227 tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  2328026 tgaagtctcttgctatgtttggtagtgagcaattgtaatcagatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccaattt 2328125  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  2328126 gtggaaggaacctgtataaattgctt 2328151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Original strand, 22427753 - 22428039
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22427753 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 22427851  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaa 251  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |     
T  22427852 tgtgattgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctcacagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctaagtttagcag 22427950  T
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22427951 tgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtttgtggaaggaac 22428039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12284112 - 12283801
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12284112 aattctagagttttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaaatctgtt 12284013  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12284012 tgaatttggaagtctcatgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgtgtaatttg 12283913  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  12283912 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 12283814  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  12283813 ttgtggaaggaac 12283801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 22600584 - 22600887
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22600584 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattggga---ccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcta-gtaattctgtt 22600679  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22600680 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 22600778  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22600779 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 22600878  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  22600879 ggaaggaac 22600887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35039853 - 35039588
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35039853 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 35039754  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35039753 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgaacattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-ttttg 35039655  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaa 295  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35039654 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaa 35039588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 336
Target Start/End: Original strand, 22202141 - 22202434
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||    
T  22202141 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttaaatatagttgtct 22202240  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||      
T  22202241 cttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgattgagc-atttgaagtctcttgctagt 22202339  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaa 336  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  22202340 tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaaggaa 22202434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1900031 - 1899727
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||| || ||||    
T  1900031 aattctagagtcttaagagtctgtatctgattggtat-gtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttcta-gtagttatgtt 1899934  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1899933 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 1899835  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1899834 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattttaatcagatattacataatgaactctccttagaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgt 1899735  T
Q  329 ggaaggaa 336  Q
    ||||||||    
T  1899734 ggaaggaa 1899727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2266770 - 2266464
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2266770 tagagtctgtatataatttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaagctcaaacatttttctt-gtaattctgtttgaattaagaagtc 2266673  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    ||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2266672 tctcgcagttgtgcttgaacatcagaagtctcttgattgtgtttaggagcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctag 2266573  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  2266572 ttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacatgactgacttccggtttgtggaagaaacctgta 2266474  T
Q  343 taaattgctt 352  Q
    ||||||||||    
T  2266473 taaattgctt 2266464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 12624946 - 12625254
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  12624946 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctact 12625045  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  12625046 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcagaagcgtaggaaatctcttgcagttatgcttgagtagtttg 12625143  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12625144 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 12625242  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  12625243 tgtggaaggaac 12625254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38282251 - 38281945
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  38282251 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacatttttcta-gtaattctgtt 38282153  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||| |||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38282152 tgaattaagaaatctcttacaattgtacttgagcattagaagtctcttgattgcgttcaggaacataggaagtctcttacagttgtgcttgagc-atttg 38282054  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||    
T  38282053 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgattgactttcgatttgt 38281954  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  38281953 ggaaggaac 38281945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 21192257 - 21192566
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21192257 aattctagagtcttgagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatgattgtgtatcatgtgttcaacctcaaacaatttattttgtaattctgtt 21192356  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21192357 tgaat--agaagtctcttgcagttatgcttgggcataagaagtctcttgatggagttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 21192454  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    | ||||||| |||  ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21192455 atgtctcttgctagttttagcagtgagcagttgcaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtt 21192554  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||||||    
T  21192555 tgttgaaggaac 21192566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30892782 - 30892474
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |    
T  30892782 aattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatcttctgtgtaattctat 30892683  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  30892682 ttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgttctttagc-attt 30892584  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  30892583 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacatgact-acttctggt 30892486  T
Q  325 ttgtggaaggaa 336  Q
    ||||||||||||    
T  30892485 ttgtggaaggaa 30892474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 26702521 - 26702831
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26702521 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 26702620  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg-cagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||  |||||||||| || | |||    
T  26702621 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgctaaggagcatagaaaatctcttgtaagttgtgcttaagtagttt 26702718  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||| |||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26702719 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtgatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggt 26702818  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  26702819 ttgtggaaggaac 26702831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 38 - 333
Target Start/End: Original strand, 22465211 - 22465507
Alignment:
Q  38 gtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttag 137  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||    
T  22465211 gtcttaagagtctgtatctgatttgtatcatgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtgtgaactcag 22465309  T
Q  138 aagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22465310 aagtcttttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctcgcaattatgcttgagc-atttgaagtctctt 22465408  T
Q  238 actaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
     |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22465409 gctaagtttagcagtgagcagttgtaatcaaatattatatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaag 22465507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2268217 - 2267977
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2268217 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttatgtgtaattctgtt 2268118  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2268117 tgaa-ttagaagtctcttgaagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagc-atttg 2268020  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagata 271  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  2268019 aagtctcttgctaagtttagcagtgagtagttgtaatcagata 2267977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 309
Target Start/End: Original strand, 17025370 - 17025638
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  17025370 agagtctatatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaa--tagaagtct 17025467  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    |||||   | ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  17025468 cttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctaag 17025567  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||     |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17025568 tttagaagtgagcagttgtaatcaaatattacattttttagtaaactctccttggaagtgcaagggggaca 17025638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19717210 - 19717031
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19717210 aattctagagtcttaagagcatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 19717111  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19717110 tgaatttggaagtctcttacagttttgtttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaagagcatatgaagtctcttgc 19717031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18614604 - 18614364
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18614604 aattctagagtcttaggagtctatatctgatttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaaca-ttttctttgtaattctgct 18614506  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||    
T  18614505 tgaat--agaagtctcctgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcatgagcataggaaatctcttgcagttatacttgagtagtttg 18614408  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatat 272  Q
    ||||||||| |||  || || | |||||| ||||||||||||||    
T  18614407 aagtctcttgctattttgagcagtgagcagttgtaatcagatat 18614364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 18896986 - 18897187
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |    
T  18896986 aattctagagtcttaagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttg-t 18897084  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18897085 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataaaaagtctcttgattaagttcaagaacatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 18897182  T
Q  229 aagtc 233  Q
    |||||    
T  18897183 aagtc 18897187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 34255939 - 34256219
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||  |  ||||||    
T  34255939 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--taagaagtctcttgctttagtgcttg 34256036  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  34256037 agcataagaagtctcttg-ctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 34256135  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34256136 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctacttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 34256219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20909097 - 20908790
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  20909097 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacatcattgattgtatataaagtgttcaacctcaaac-gttttctttgtaattctgtt 20908999  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| | |||   |||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||     
T  20908998 tgaa--tataagtctcttgcagttgtgcttgagcagaggaagtctcttgatttttttcttaagcataggaaatctcttgcggttgtgtttgagtagtttc 20908901  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgc-aagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| | |||  || || | ||||||||||||||||||||||     ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  20908900 aagtctcgtgctattttgagaagtgagcatttgtaatcagatattgattttagggaactctccttggaagtgcaaagggggacaagact-acttcagatt 20908802  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  20908801 tgtggaaggaac 20908790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17018263 - 17017970
Alignment:
Q  34 tagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17018263 tagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctatttgaa- 17018165  T
Q  134 ttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtc 233  Q
     ||||||||||        ||||||| |||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  17018164 -tagaagtctc--------ttgcttgtgcataggaagtctcttgatt-tgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagttgtttgaaatc 17018075  T
Q  234 tcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    |||| |||  || ||   |||||| ||||||||| |||||     ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||    
T  17018074 tcttgctattttgagcgttgagcaattgtaatcaaatattgattttagcgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttctgatttatgga 17017976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21028482 - 21028336
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  21028482 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaactatattctttgtaattctgtt 21028383  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  21028382 tgaa--tagaagtatcttgcagttatgcttgagcataaaaagtctcttg 21028336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 19170748 - 19171028
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  19170748 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 19170845  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    |||||  |||||||||||  || || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  19170846 agcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 19170945  T
Q  260 tgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||| |      |||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19170946 tgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 19171028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48703890 - 48703743
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48703890 aattctagagtactaagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 48703791  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  48703790 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttg 48703743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17370700 - 17370420
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  17370700 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 17370603  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  17370602 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 17370503  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17370502 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaatggggactcgact-acttccggtttgtggaaggaac 17370420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 20110342 - 20110546
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20110342 attctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtt 20110439  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||| |||    ||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||    
T  20110440 tgaa--tagaagtctcttgcagagttgcttgagcataggaagtctattgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagtagtgcttgagtagtttg 20110537  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  20110538 aagtctctt 20110546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 14293076 - 14293206
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14293076 aattctagaaccttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtt 14293175  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| || |||||    
T  14293176 tgaa--tagaagtcttttgcagttgtgtttgag 14293206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23926722 - 23926441
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  23926722 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 23926625  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| | |||||||||||  || || |  ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  23926624 agcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtccttgagcaattgagaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 23926525  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |      |||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23926524 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 23926441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27858428 - 27858296
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  27858428 aattctagagtcttaagaatctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattttgtt 27858329  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27858328 tg--tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 27858296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 26548679 - 26548959
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |  ||||||    
T  26548679 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttggtttagtgcttg 26548776  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  26548777 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgactgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 26548876  T
Q  259 ttgtaatcaga--tatt--acatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||| |||   |||  || |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26548877 ttgtaataagagtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 26548959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22642553 - 22642407
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  22642553 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 22642456  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    
T  22642455 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgc 22642407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28379653 - 28379372
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  28379653 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 28379556  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||| ||     
T  28379555 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtttgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgaacag 28379456  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |      |||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28379455 ttgtaatctgtgtgattattacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggaatggact-acttccggtttgtggaaggaac 28379372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23054057 - 23053928
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  23054057 aattctagagtcttaagagtcg-tatctgatctgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaacctcaaaca--tttctttttaattctgtt 23053961  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23053960 tgaa--tagaagtctcttgcaattgtgcttgagca 23053928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 306
Target Start/End: Original strand, 26280461 - 26280716
Alignment:
Q  47 gtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctctt 146  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  26280461 gtctgtatcagatttgtatcgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg--tctagaagtctctt 26280558  T
Q  147 gcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttt 246  Q
    ||  || ||||||||||   |||||||||||  | ||| |  ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | || |||||||||| ||   |||    
T  26280559 gcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgct---ttt 26280655  T
Q  247 agtaatgagcatttgtaatcagatatt-acatagtgaactcccattggaagtgcaaggggg 306  Q
         ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26280656 gtgcttgaacatttgtaatcagatattgatttagtgaactctccttggaagtgcaaggggg 26280716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20251434 - 20251319
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  20251434 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 20251337  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  20251336 agcaaaggaagtctcttg 20251319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22018987 - 22018785
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  22018987 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttgagc 22018890  T
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    |   ||||||||||  ||  || |  ||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  22018889 ataggaagtctctttctttagtgcttgagcaaaggaagtgtcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 22018790  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  22018789 taatc 22018785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38281892 - 38281764
Alignment:
Q  208 cagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaaggggga 307  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  38281892 cagttgtacttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagaggga 38281794  T
Q  308 caatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38281793 catgactgacttccgatttgtggaaggaac 38281764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48703783 - 48703640
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||    
T  48703783 gaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgg 48703685  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaactt 339  Q
    |||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48703684 aagtgcaatgggggcatgact-acttccggtttgtggaaggaactt 48703640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 16233523 - 16233824
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  16233523 aattctagagtcttaagagtat--atctgatttgtattgtgaacaccactgatagtatgtcaagtgttcaacctcaaacatatttctatgtaattgtgtt 16233620  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||  ||||||||| ||||||  || ||||||||||   |||| ||||||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||| || || | ||||    
T  16233621 tg--tttagaagtttcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgatttagtagtttg 16233718  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagt-aatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||     |||| ||   ||||||  ||||||||||||||     |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  16233719 aagtctctt-----gttttgtggttgagcaactgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagcgcaagggggacaagact-acttccggat 16233812  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  16233813 tgtggaaggaac 16233824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19037662 - 19037519
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||    
T  19037662 tattgtgaacaccacttatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttgagc 19037565  T
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||  ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    
T  19037564 aaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgc 19037519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21543697 - 21543575
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  21543697 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 21543600  T
Q  160 agcaatag-aagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21543599 agc-atagaaagtctcttgcttgtgt 21543575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28473889 - 28473774
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  28473889 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 28473792  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  28473791 agcataggaagtctcttg 28473774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 46181297 - 46181411
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  46181297 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 46181393  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| | |||||||||||    
T  46181394 agcattggaagtctcttg 46181411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5929367 - 5929221
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  5929367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 5929270  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||    
T  5929269 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgc 5929221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 18517552 - 18517682
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  18517552 aattttagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccctaaacatttttctatgtaattttgtt 18517651  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||  | ||||||||||||||  || ||||||||    
T  18517652 tg--tctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 18517682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22655135 - 22654989
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |  ||||||    
T  22655135 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttggtttagtgcttg 22655038  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    
T  22655037 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgc 22654989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Original strand, 28492793 - 28492882
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttg 118  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28492793 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttg 28492882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 52351103 - 52351189
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52351103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 52351189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Original strand, 18130403 - 18130536
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||||||| || || || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  18130403 aattctagagtattaagggtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacatttttctgtgtaattctgt 18130502  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||  |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  18130503 ttga--ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 18130536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 7745504 - 7745575
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7745504 ttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttga 7745575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Original strand, 14293182 - 14293325
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||| | ||||||||||   ||||||||| | ||||    
T  14293182 gaagtcttttgcagttgtgtttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaaccggatattacattttagtgaactctccttgg 14293281  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  14293282 aagtgcaagggggacaagacttatttccggtttgtggaaggaac 14293325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 45071046 - 45071132
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45071046 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 45071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 20867271 - 20867383
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  20867271 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 20867367  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  20867368 agcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 174
Target Start/End: Original strand, 22610392 - 22610503
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  22610392 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 22610488  T
Q  160 agcaatagaagtctc 174  Q
    |||| ||||||||||    
T  22610489 agcattagaagtctc 22610503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9346462 - 9346255
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||| ||| |||    
T  9346462 aattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacaccacttattgtatatcaagcgttcaacctcaaacatttttttatgtgattgtgt 9346363  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||  |||||||||||||||   || ||||||||||   |||| ||||||  ||| | |  ||||||| ||||  ||||||  ||||||||||| | |||    
T  9346362 ttg--tttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtgtatgcttgagcatatgaagcttcttgcttttgtgcttgagtagttt 9346265  T
Q  228 gaagtctctt 237  Q
     |||||||||    
T  9346264 aaagtctctt 9346255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44200675 - 44200560
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||  |  ||||||    
T  44200675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttga--ttagaaatctcttgctttagtgcttg 44200578  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  44200577 agcatatgaagtctcttg 44200560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 20884300 - 20884385
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20884300 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 20884385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 24029106 - 24029179
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24029106 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaccattttctgtgtaattctgtttgaat 24029179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 18311390 - 18311462
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18311390 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattatgtttgaat 18311462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31359012 - 31358900
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||| ||||    
T  31359012 aattttagagtctt-agagtctcaat-tgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac--caaacttatttctttgtaatt-tgtt 31358918  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  31358917 tg--tttagaagtctcttgc 31358900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26703241 - 26703133
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||| | ||||||| ||||||  |||| |||||||||||  |    
T  26703241 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-accaaacatctttatatgtaattttgtttg--tttataagtctcttgcttt 26703145  T
Q  152 tttgcttgagca 163  Q
    | ||||||||||    
T  26703144 tgtgcttgagca 26703133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 14388544 - 14388614
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14388544 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttttgtgtaattctgtttga 14388614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 41133034 - 41133097
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaatt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  41133034 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagagttcaaagtcaaacaattttctgtgtaatt 41133097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 184
Target Start/End: Original strand, 2819732 - 2819853
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||    
T  2819732 tttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-accaaacatatttctttgtaatt-tgtttg--tttagaagtctcttgcttttgtgctt 2819827  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||||| | ||| ||| ||| ||||||    
T  2819828 gagcattggaaatcttttgcttgtgt 2819853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3171412 - 3171298
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3171412 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3171316  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3171315 agcattagaagtctcttg 3171298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3182014 - 3181900
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3182014 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3181918  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3181917 agcattagaagtctcttg 3181900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5640127 - 5640241
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5640127 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5640223  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5640224 agcattagaagtctcttg 5640241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5650684 - 5650798
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5650684 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5650780  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5650781 agcattagaagtctcttg 5650798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5833008 - 5832894
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5833008 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5832912  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5832911 agcattagaagtctcttg 5832894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5843610 - 5843496
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5843610 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5843514  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5843513 agcattagaagtctcttg 5843496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 7689876 - 7689990
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  7689876 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 7689972  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  7689973 agcattagaagtctcttg 7689990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10998201 - 10998315
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  10998201 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10998297  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10998298 agcattagaagtctcttg 10998315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12614733 - 12614847
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12614733 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12614829  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12614830 agcagtagaagtctcttg 12614847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12624198 - 12624312
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12624198 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12624294  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12624295 agcagtagaagtctcttg 12624312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12730337 - 12730223
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12730337 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12730241  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12730240 agcattagaagtctcttg 12730223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12740930 - 12740816
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12740930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12740834  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12740833 agcattagaagtctcttg 12740816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12898398 - 12898512
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12898398 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12898494  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12898495 agcattagaagtctcttg 12898512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12944999 - 12944885
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  12944999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 12944903  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  12944902 agcattagaagactcttg 12944885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21863451 - 21863337
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  21863451 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 21863355  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21863354 agcattagaagtctcttg 21863337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 35649108 - 35649222
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35649108 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35649204  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35649205 agcattagaagtctcttg 35649222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38094866 - 38094752
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  38094866 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 38094770  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38094769 agcattagaagtctcttg 38094752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38105491 - 38105377
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  38105491 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 38105395  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38105394 agcattagaagtctcttg 38105377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 47608348 - 47608462
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  47608348 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 47608444  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  47608445 agcattagaagtctcttg 47608462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 47618956 - 47619070
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  47618956 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 47619052  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  47619053 agcattagaagtctcttg 47619070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 51629604 - 51629718
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  51629604 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 51629700  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  51629701 agcattagaagtctcttg 51629718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 51656865 - 51656979
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  51656865 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 51656961  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  51656962 agcattagaagtctcttg 51656979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 35404810 - 35404923
Alignment:
Q  61 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||||    
T  35404810 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 35404906  T
Q  161 gcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||| |||||||||||||    
T  35404907 gcattagaagtctcttg 35404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 675235 - 675165
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  675235 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttatgtgtaattttgtttga 675165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2538326 - 2538212
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  2538326 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 2538230  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2538229 agcattagaagtctcttg 2538212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4167049 - 4166935
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4167049 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4166953  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4166952 agcattagaagtctcttg 4166935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4177705 - 4177591
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4177705 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4177609  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4177608 agcattagaagtctcttg 4177591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7507092 - 7506978
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  7507092 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 7506996  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  7506995 agcattagaagtctcttg 7506978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7517689 - 7517575
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  7517689 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 7517593  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  7517592 agcattagaagtctcttg 7517575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18515652 - 18515586
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaattct 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  18515652 tttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac--caaacaattatttctttgtaattct 18515586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19178749 - 19178635
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  19178749 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19178653  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19178652 agcattagaagtctcttg 19178635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19187628 - 19187514
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  19187628 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19187532  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19187531 agcattagaagtctcttg 19187514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33084352 - 33084238
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  33084352 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 33084256  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33084255 agcattagaagtctcttg 33084238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36236846 - 36236960
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  36236846 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 36236942  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36236943 agcattagaagtctcttg 36236960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36247393 - 36247507
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  36247393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 36247489  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36247490 agcattagaagtctcttg 36247507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21877557 - 21877442
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||  | |||||||||||||||     ||||||    
T  21877557 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgttttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 21877460  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21877459 agcattagaagtctcttg 21877442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 20196109 - 20196156
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20196109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaaca 20196156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 163
Target Start/End: Original strand, 21684469 - 21684577
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||| |  |    
T  21684469 tatctgatttgtattgtgaacatcagtgattgtatatcaagtgttcaa-agcaaacatctttctgtgtaattttgttt--atttagaaatctctttcttt 21684565  T
Q  152 tttgcttgagca 163  Q
    | ||||||||||    
T  21684566 tgtgcttgagca 21684577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 148630 - 148669
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148630 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 148669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 154705 - 154744
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154705 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 154744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5973548 - 5973509
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973548 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5973509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7677634 - 7677595
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7677634 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7677595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18382320 - 18382359
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382320 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18382359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20798728 - 20798689
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798728 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20798689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 23580743 - 23580782
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580743 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23580782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35012718 - 35012679
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012718 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35012679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 35638456 - 35638495
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35638456 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35638495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 39194510 - 39194549
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194510 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 39194549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 47195052 - 47195013
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195052 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47195013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 11195485 - 11195599
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||    |||||||    
T  11195485 ttgtattgataacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcttgcttg 11195581  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  11195582 agcattagaagactcttg 11195599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17957024 - 17956915
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||     ||||||||||     
T  17957024 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaagatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgcctacgtgcttgagcat 17956928  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||    
T  17956927 tagaagactcttg 17956915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22639935 - 22639898
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22639935 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 22639898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8698510 - 8698474
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8698510 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8698474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21543626 - 21543534
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21543626 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgag 21543534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 4250981 - 4251020
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250981 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4251020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 353
Target Start/End: Original strand, 7745705 - 7745767
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7745705 ttggaagtgcaagggggacatggct-acttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 7745767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 20441733 - 20441772
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441733 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20441772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39586760 - 39586721
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39586760 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 39586721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 99
Target Start/End: Original strand, 9050909 - 9050943
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050909 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9050943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22642448 - 22642242
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctc 235  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||   ||||||||||| ||| || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||    
T  22642448 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctc 22642349  T
Q  236 ttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtg 329  Q
     ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| |||||   |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  22642348 atactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactcttcttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtg 22642250  T
Q  330 gaaggaac 337  Q
    ||||||||    
T  22642249 gaaggaac 22642242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23917481 - 23917364
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaa--ttttctttgtaat-tctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| | ||||||   |||||||||| ||||   | ||||||||    
T  23917481 ttgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaac--caaacaactatttctttgtaatctttgtttg---ttagaagtcttttgcttgtctgcttgag 23917387  T
Q  162 caatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||  |||||||||||| ||||||    
T  23917386 cataagaagtctcttgcttgtgt 23917364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Original strand, 28492896 - 28492982
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28492896 tgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggg-ataggact-acttccggtttgtggaaggaac 28492982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10153692 - 10153650
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10153692 tttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagcgttcaact 10153650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 21894993 - 21894963
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatca 21894963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2834061 - 2834028
Alignment:
Q  312 actgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2834061 actgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 2834028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25399028 - 25398987
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25399028 tttgtattgtaaacaccattaattgtatatcaagtgttcaac 25398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 224
Target Start/End: Original strand, 9757092 - 9757120
Alignment:
Q  196 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9757092 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 9757120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Original strand, 12439844 - 12439884
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12439844 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattgagaagtctctt 12439884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20251363 - 20251259
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt-gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  20251363 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 20251264  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  20251263 taatc 20251259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23549862 - 23549809
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgta 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  23549862 ttgtgaacacctctgattgtatgtcaagtgttca--tcaaaacaattttctttgta 23549809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26703049 - 26702975
Alignment:
Q  279 gtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26703049 gtgaactctctttggaagtgcaagagggacagaact-acttccagattgtggaaggaacttgtat-aattgcttgtg 26702975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 172)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 17399103 - 17399429
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17399103 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 17399202  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17399203 tgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 17399302  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17399303 aagactcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgt 17399402  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17399403 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 17399429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 3105848 - 3106173
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3105848 aattatagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcat-ttcaaacaattttctttgtaattctgtt 3105946  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3105947 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 3106046  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3106047 aagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacataactgacttccggtttgt 3106146  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  3106147 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 3106173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22190528 - 22190202
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22190528 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 22190429  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22190428 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttg 22190329  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||    
T  22190328 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaacgggaacatgactgacttccggtttgt 22190229  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22190228 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 22190202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 27189069 - 27189398
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaa--ttct 125  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |    
T  27189069 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgttaattttt 27189168  T
Q  126 gtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189169 gtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 27189268  T
Q  226 ttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  27189269 ttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagagggacaggactgacttccggct 27189368  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27189369 tgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 27189398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40860339 - 40860027
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40860339 tagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgattgaattaagaagtc 40860240  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40860239 tcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttagtagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 40860140  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |    
T  40860139 gtttagtagtgagcatttttaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggagcctgta 40860040  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||    
T  40860039 taaattgcttgtg 40860027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6517168 - 6516844
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6517168 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 6517070  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6517069 tgaattaagaagtcttttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 6516971  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  6516970 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattttaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgt 6516871  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  6516870 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 6516844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 9751968 - 9752294
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9751968 aattctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtt 9752067  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752068 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcttgagcataggatgtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 9752167  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9752168 aagtctcatactaagtttagtattgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacaggaccgacttccggtttgt 9752267  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  9752268 ggaaggaacctgtataaattgcatgtg 9752294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 17701198 - 17701510
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17701198 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtc 17701297  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17701298 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatattgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttgctag 17701397  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
     ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  17701398 ttttagtagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgttgaaggaacctgta 17701497  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    |||||||| ||||    
T  17701498 taaattgcctgtg 17701510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 13576545 - 13576867
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13576545 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgatcgtatctcaagtgttcaacttcaaacatttttctt-gtaattctgtt 13576643  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13576644 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctcttgattgtgttaaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 13576743  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13576744 aagtctcttgctagttttagcaatgagaaattgtaatcagatattacatagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 13576843  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  13576844 ggaaggaacctgtataaattgctt 13576867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 3500082 - 3500405
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3500082 aattctagagtctttagagtctgtatctgatt-gtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtt 3500180  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3500181 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 3500279  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  3500280 aagtctcttactaaatttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtacaa-ggggacaggactgacttccggtttgt 3500378  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3500379 ggaaggaacctgtataaattgcctgtg 3500405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 55731528 - 55731204
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  55731528 aattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattatgtt 55731430  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  55731429 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgagca-tttg 55731331  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  55731330 aagtctcttactaagtttagtagtgaacatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgt 55731231  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  55731230 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 55731204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 56533489 - 56533816
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  56533489 aattctaaagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca-tattctttgtaattctgtt 56533587  T
Q  129 tgaattt--agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56533588 tgaatttttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcagaagtttcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatt 56533687  T
Q  227 tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  56533688 tgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggaagacatgactgacttccggttt 56533787  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||    
T  56533788 gtggaaggaacctgtacaaattgcttgtg 56533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20977141 - 20976819
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20977141 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgt 20977042  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20977041 ttgaattaagaattctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagtt 20976942  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20976941 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 20976842  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgc 350  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  20976841 tggaaggaacctgtataaattgc 20976819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29121047 - 29120725
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29121047 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 29120949  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29120948 tgaatttagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 29120849  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| || |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || | ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  29120848 aagtcttttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacttagagaattctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccagtttgt 29120749  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
     |||||||| || |||||||||||    
T  29120748 agaaggaacctgtataaattgctt 29120725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16853186 - 16852863
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16853186 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca-tattctttgtacttctgtt 16853088  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16853087 tgaagtgagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagc-atttg 16852989  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac--atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16852988 aagtctcttactaaatttagtagtgagcaattgtaatcagatattacttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttt 16852889  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  16852888 gtggaaggaacctgtataaattgctt 16852863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 22675951 - 22676259
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22675951 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacattttttcttgtaattctgtt 22676050  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22676051 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgattgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttacagttgtgcttgagcaatttg 22676150  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22676151 aagtctcttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgt 22676250  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  22676251 ggaaggaac 22676259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 56034253 - 56033948
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  56034253 aattctagagtcttaagagt-tgtatctgatttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 56034155  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56034154 tgaatt-agaagtctcttgcaattgtgcttgagcatttgaagtctcttgatcgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttg 56034056  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  56034055 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattttaatcagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 56033956  T
Q  329 ggaaggaa 336  Q
    ||||||||    
T  56033955 ggaaggaa 56033948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 14154423 - 14154750
Alignment:
Q  29 aattctagagtctt-tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14154423 aattctagagtctgatagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca-ttttccttgtaattctgt 14154521  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14154522 ttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-attt 14154620  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca--tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14154621 gaagtctcttgctaagtttagcagtgaacatttgtaatcagttattacacctagtgaattctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 14154720  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14154721 tgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 14154750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45833067 - 45832761
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  45833067 aattctagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttcta-gtaattctgtt 45832969  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45832968 tgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 45832870  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  45832869 aagtctcttgctaggtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgattttt 45832770  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  45832769 ggaaggaac 45832761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 14605333 - 14605650
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14605333 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtt 14605432  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14605433 tgaa-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgcgcttgagc-atttg 14605530  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14605531 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtt 14605630  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  14605631 tgtggaaggaacttgtataa 14605650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16632124 - 16631814
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16632124 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttcgttgtaattctgtt 16632025  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16632024 tgaatttggaagtctcttgaagttgtgcttgggcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtttcttgcagttgtgcttgagc-atttg 16631926  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16631925 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcatttgtaataagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 16631826  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  16631825 tgtggaaggaac 16631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54679610 - 54679302
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  54679610 aattccagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaccatttttctttgtaattctgtt 54679511  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54679510 tgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtttcttgattgtgttcaggagtataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 54679412  T
Q  229 aagtctcttacta-agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54679411 aagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattctaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 54679312  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  54679311 tggaaggaac 54679302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10072615 - 10072308
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10072615 aattctagagtcttaagagtttatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 10072517  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072516 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 10072417  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| ||  ||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10072416 aagtcttttgatagttttagcaatgagcaattgtaatcatatattacataatgaactctccttcgaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 10072317  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  10072316 ggaaggaac 10072308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 37435969 - 37436284
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37435969 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 37436068  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37436069 tg-agttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 37436165  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | | |||| ||||||||||||||||     ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37436166 aagtctcttgctagttttagcagtaagcaattgtaatcagatatta-----tgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgt 37436260  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  37436261 ggaaggaacctgtataaattgctt 37436284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6641367 - 6641051
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  6641367 aattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtt 6641268  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6641267 tgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 6641169  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  6641168 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-actt-cggtt 6641071  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6641070 tgtggaaggaacttgtataa 6641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19666049 - 19665739
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  19666049 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtaaataccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctttgtaaatttgtt 19665950  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19665949 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 19665851  T
Q  229 aagtctcttactaag-tttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaa--ctcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19665850 aagtctcttgctaagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatagtaaactctctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 19665751  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  19665750 tgtggaaggaac 19665739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 15475572 - 15475849
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15475572 aattctagagtctttagagttagtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaatctcaaacatttttcattgtaattttgtt 15475671  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15475672 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttg 15475771  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaaggggg 306  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15475772 aagtctcttgctagttttagcattgagcaattgtaatcaaatattacatagtgaactctccttggaagtgcagggggg 15475849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 55379969 - 55379684
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  55379969 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttccgtgtaattctgtttgaat--agaagtctcttgcagt 55379872  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaa 251  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |     
T  55379871 tgtgcttgagca-tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcag 55379773  T
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55379772 tgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccgttttgtggaaggaac 55379684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23750206 - 23749899
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23750206 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 23750107  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||||    
T  23750106 tgaa--tagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatatcctgcagttgtgcttgagtagtttg 23750009  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||  | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23750008 aagtctcttgctagttttaacagtgaacagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 23749910  T
Q  326 tgtggaaggaa 336  Q
    |||||||||||    
T  23749909 tgtggaaggaa 23749899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 286
Target Start/End: Original strand, 25651525 - 25651779
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25651525 attctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcttgg-aattctgttt 25651623  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttga 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25651624 gaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagc-atttga 25651722  T
Q  230 agtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactc 286  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25651723 agtctcttactaaatttagtagtgagcaattgtaataagatattacataatgaactc 25651779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12600441 - 12600126
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12600441 aattctagagacttaggagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactaattgtatataaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 12600342  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12600341 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtggttgagc-atttg 12600243  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| || ||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12600242 aagtctctt-ct-agtgtagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagttcaagggggacaggact-acttccggtt 12600146  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  12600145 tgtggaaggaacttgtataa 12600126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11915384 - 11915075
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11915384 aattctagagtcttaagagcctgtatctgatttgtattgtgaccaccactggttgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtt 11915285  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11915284 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataacaagtctattgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 11915187  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  11915186 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaataagatattacatttttagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaagact-acttctggt 11915088  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  11915087 ttgtggaaggaac 11915075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 15014814 - 15015123
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15014814 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 15014913  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  15014914 tcaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcaattgtgcttgagtagtttg 15015011  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |    
T  15015012 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaaaggggacaggact-acttccgat 15015110  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  15015111 ttgtggaaggaac 15015123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16848230 - 16847911
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||  ||||    
T  16848230 aattctagagtttttagagtctgtatctgatttgttttgtgaacatcattgattgtatatcaagtgctcaaccttaaaca-tattctttgtaatcttgtt 16848132  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16848131 tgaattgagaagtcttttgccgttgtgcttgaacaatagaagtctcttgattgagttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgtgc-atttg 16848033  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac--atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16848032 aagtctcttactaaatatagtagtgagcaattgtaatcagatattacttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttt 16847933  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaatt 348  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  16847932 gtggaaggaacctgtataaatt 16847911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 37986039 - 37986349
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37986039 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattttgtt 37986138  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37986139 tgaatttagaagtctcttgcagttgtacttgagcattagaagtctctttattgtgttcaggagcatacgaaatctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 37986237  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactc-ccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || |||||||| |||||||||   |||||||||| || |   ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  37986238 aagtctcttgctagttttagcagtgatcaattgtaatcggatattacattttagtgaactctccttataaagtgcaagggggacaggact-acttccggt 37986336  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  37986337 ttgtggaaggaac 37986349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19912307 - 19912616
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19912307 aattctagagtcttaagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccattgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacaattttcgttgtagttctgtt 19912406  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19912407 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgaggagcataggaagtctcttgcagtagtgcttgagc-atttg 19912505  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||   || ||||||| | ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  19912506 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacattttactgaactctccttgaaaatgcaagggggacatgact-acttccggtt 19912604  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||||||    
T  19912605 tgtagaaggaac 19912616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16939576 - 16939357
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16939576 tagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtct 16939478  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16939477 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagg 16939378  T
Q  335 aacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  16939377 aacctgtataaattgcttgtg 16939357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11900873 - 11900565
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||    
T  11900873 aattctagagtctaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgcaattctatt 11900774  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11900773 taaat--agaagtctcttacagttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgattatgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 11900676  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||| | ||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  11900675 aagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaattagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 11900577  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  11900576 tgtggaaggaac 11900565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23123203 - 23122996
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23123203 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattctgtt 23123104  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  23123103 tgaatttagaagtctcttgccattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcaattgtacttgagc-atttg 23123005  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  23123004 aagtctctt 23122996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 29680974 - 29681153
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  29680974 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctttgtaattctgtt 29681073  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29681074 tgaatttggaagtctcttacagatgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 29681153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 337
Target Start/End: Original strand, 19610827 - 19611070
Alignment:
Q  93 tgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagc 192  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19610827 tgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttcgaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaggagc 19610926  T
Q  193 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattg 292  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  19610927 ataaaaagacttttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacatagtgaactctccttg 19611025  T
Q  293 gaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  19611026 gaagtgcaagggggataggactgacttccagtttgtggaaagaac 19611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 39420163 - 39420343
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39420163 aattctagagtctttaagagtctatatctgatttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgt 39420262  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39420263 ttgaattaagaagtctcttacagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgc 39420343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 55 - 337
Target Start/End: Original strand, 41115211 - 41115494
Alignment:
Q  55 ctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagtttt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  41115211 ctgatttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaat--agaagtctcttgcagttgt 41115308  T
Q  155 gcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatga 254  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||  ||||| | |||    
T  41115309 gcttgagcataagaagtctcttgatttagttcttaagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttaaagtctcttgctagttttagcagtga 41115408  T
Q  255 gcatttgtaatcagatattacat----agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||||||| |||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||    
T  41115409 gcagttgtaatcaaatattacattttcagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggct-acttccggtttgaggaaggaac 41115494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 8685870 - 8686188
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||   || ||||| ||||||||    
T  8685870 aattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatacagtgttcaacctcaaacatagttatttgtcattctgtt 8685969  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||     
T  8685970 tgaat--agaagtcacttgcagttgtgcttgagtataggaagtctcttgattgtgttcttgagcatgggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttt 8686067  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||     |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  8686068 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttttagtgaactctccttgaaagtgcaaggggggcaggact-acttccgg 8686166  T
Q  324 tttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  8686167 tttgtggaaggaacttgtataa 8686188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 17788466 - 17788777
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  17788466 aattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatatttctttgtaattctgt 17788565  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagca-taggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||   |||  |||||   |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  17788566 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaattctcttgatttatttcttgagcacggggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtt 17788663  T
Q  227 tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccg 322  Q
    ||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  17788664 tgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacatttttagtgaactctccttggaaatgcaagggggacatgact-acttccg 17788762  T
Q  323 gtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||    
T  17788763 gtttgtggaaggaac 17788777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19884278 - 19884107
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19884278 agaagtctcttgattgtgttcaggagcagatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtttcttgctaattttagtagtgagcaattgtaat 19884179  T
Q  266 cagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19884178 cagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 19884107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16939712 - 16939564
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16939712 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 16939613  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16939612 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 16939564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15135374 - 15135103
Alignment:
Q  67 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  |||  |    
T  15135374 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattctgtttgaa--tagaagtctcttgtagttgtgcttatgcataa 15135277  T
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||   ||||||||  ||||||     
T  15135276 gaagtctcttgattgtgttctggagcataggaaatctcttgttgttgtgcttgagttgtttgaagtctcttgctagttttcacaatgagcagctgtaatt 15135177  T
Q  267 agatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||| | |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15135176 agatattacattttagtgaactctccttggatgcgcaagggggactggactaacttccggtttgtggaaggaac 15135103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 165 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38513454 - 38513270
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | |||| | ||||||    
T  38513454 tagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaa 38513355  T
Q  265 tcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38513354 tcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgtaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattg 38513270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 10661594 - 10661903
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10661594 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgtatctcaagtgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctgtt 10661693  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |  |  |||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  10661694 t--aagtagaagtcacttgcagttgtgcttaagcatatgaagtctcttgatttggttcttgagtataagaaatctcttgcacttgtggttgagtagcttg 10661791  T
Q  229 aagtctcttactaagttt-agtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||| || | |||||| |||||||||||||||  |   |||||||||| | | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10661792 aagtctcttgctagttttgagcagtgagcaattgtaatcagatatttgattttagtgaactctcctgggaggtgcaagtgggacaagact-acttccggt 10661890  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  10661891 ttgtggaaggaac 10661903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 10875739 - 10876048
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10875739 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgtatctcaagtgttcaacatcaaacaattttctttgtaattctgtt 10875838  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |  |  |||||||| ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  10875839 t--aagtagaagtcacttgcagttgtgcttaagcatatgaagtctcttgatttggttcttgagtataagaaatctcttgcacttgtggttgagtagcttg 10875936  T
Q  229 aagtctcttactaagttt-agtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||| || | |||||| |||||||||||||||  |   |||||||||| | | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  10875937 aagtctcttgctagttttgagcagtgagcaattgtaatcagatatttgattttagtgaactctcctgggaggtgcaagtgggacaagact-acttccggt 10876035  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  10876036 ttgtggaaggaac 10876048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8105320 - 8105155
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8105320 aattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgtt 8105222  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcata 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  8105221 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctattgattttgttcttgagcata 8105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 12811604 - 12811782
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  12811604 aattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcgttgtaattctatt 12811703  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagca-taggaagtctcttg 207  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12811704 tgaa-ttagaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcattagaaagtctcttg 12811782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17540082 - 17539840
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  17540082 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtt 17539983  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  17539982 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttga-tgatagaaagtttcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgtagttgcgcttgagtagttt 17539886  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt 273  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17539885 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatatt 17539840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3395272 - 3395125
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  3395272 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttttaattctatt 3395174  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  3395173 tgaatttagaagtctcttgcagttatgcttgagcatttgaagtctcttg 3395125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 19621488 - 19621674
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | ||    
T  19621488 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtaaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttatgtgtaattatatt 19621587  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtg 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||    
T  19621588 tgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagtattagaagtctcttgattgtgttcagtagcatagtaaatcttttgaagttgtg 19621674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8103808 - 8103644
Alignment:
Q  190 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||| |   |||||||||    
T  8103808 agcataggaagtctcttgcagttgtccttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttaacagtgagcaattgtaatcaaatattactttttagtgaactc 8103710  T
Q  287 ccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
     | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8103709 tccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataaattgctt 8103644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 179
Target Start/End: Original strand, 14904785 - 14904934
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  14904785 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattctgtt 14904884  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgat 179  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  14904885 tgaa-ttagaagtatcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgat 14904934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 17057543 - 17057747
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17057543 aattctaaagtcttaagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtt 17057640  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || |||||||||||  || ||||||||||   ||||||| |||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||    
T  17057641 tgaa--taaaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtcttttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttg 17057738  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  17057739 aagtctctt 17057747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38513561 - 38513442
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  38513561 aattctaaagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgt 38513462  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38513461 ttgaatttagaagtctcttg 38513442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Original strand, 16475912 - 16476115
Alignment:
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctc 235  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||| | |||||||||||    
T  16475912 agaagtctcttgcagttgcgcatgagcataagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgttg-tgtgcttgagtagtttgaagtctc 16476010  T
Q  236 ttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    || |||  ||||||| | | || || ||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16476011 ttgctagttttagtagtaaacagttataatccgatattacatttttagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtttgtgga 16476109  T
Q  332 aggaac 337  Q
    ||||||    
T  16476110 aggaac 16476115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33378062 - 33377858
Alignment:
Q  62 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  33378062 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgcgtaattctatttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttgag 33377965  T
Q  162 caatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| | |||    
T  33377964 cataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagaagttg 33377865  T
Q  262 taatcag 268  Q
    |||||||    
T  33377864 taatcag 33377858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19241903 - 19241700
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  19241903 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 19241806  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||     
T  19241805 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactagg--tagtattgagcag 19241708  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  19241707 ttgtaatc 19241700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Original strand, 19889427 - 19889716
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19889427 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaacctcaaac-attttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtc 19889523  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    ||||||  || ||||||||||   |||| ||||||  | ||| |  |||||||||||  ||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| ||      
T  19889524 tcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgct-- 19889621  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     |||     ||| || |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19889622 -tttgtgcttgatcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggattgtggaaggaac 19889716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Original strand, 18007464 - 18007644
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||    
T  18007464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttactttagtgcttg 18007561  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt-gaagtctcttacta 241  Q
    ||||   ||||||||||||||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18007562 agcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttggaagtctcatacta 18007644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19884384 - 19884267
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19884384 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccgcaaacatttttc-ttgtaattttgtt 19884286  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  19884285 tgacttaagaagtctcttg 19884267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Original strand, 39420332 - 39420452
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39420332 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 39420431  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaatt 348  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  39420432 tggaaggaacttgtataaatt 39420452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13890514 - 13890307
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| |||    
T  13890514 aattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttccacctcaaacatatttctgtgtaattgtgt 13890415  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||  |||||||| |||||||  || ||||||||||   |||| || |||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |||    
T  13890414 ttg--tttagaagactcttgcttttgtgcttgagcataggaagactattgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 13890317  T
Q  228 gaagtctctt 237  Q
    ||||||||||    
T  13890316 gaagtctctt 13890307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 20571427 - 20571731
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  20571427 aattatagagtcttaagagtttgtatctgatttgtactgtgaacaccactggttgtatatcaagtgttcaacctctaacatttttctgtgtaattgtgtt 20571526  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||  ||||||||||||||||  || || |||| ||   |||||||||||  | ||| |  ||||||| |||  |||||||  ||||||||||| | ||||    
T  20571527 tg--tttagaagtctcttgcttttgtgtttgaacataggaagtctcttgtgtatgtgcttgagcatatgaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttg 20571624  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| ||   |||     |||||||||||||||| |||||     |||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||    
T  20571625 aagtctcttgct---tttgtgcttgagcatttgtaatcatatattgattttagtgaactatccttggaagtgcaagagggacaggact-acttccggatt 20571720  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||    
T  20571721 gtggaaggaac 20571731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 16819754 - 16819867
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  16819754 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 16819851  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  16819852 agcattggaagtctct 16819867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 323
Target Start/End: Original strand, 14904892 - 14905018
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttt-agtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaa 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14904892 gaagtatcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgataggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaa 14904990  T
Q  296 gtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14904991 gtacaagggggacaagactgacttccgg 14905018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36470497 - 36470418
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36470497 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaat 36470418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1672039 - 1671924
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  1672039 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 1671942  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  1671941 agcataggaagtctcttg 1671924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36210514 - 36210629
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  36210514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 36210611  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  36210612 agcaaaggaagtctcttg 36210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3395165 - 3395024
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||    
T  3395165 gaagtctcttgcagttatgcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattacattttagtaaactctccttgg 3395067  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  3395066 aagtgcaagagggacatgact-actttcggtttgtggaaggaac 3395024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 14902875 - 14903021
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  14902875 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaccgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattgtgtt 14902974  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||  | ||||||||||||||  || ||||| ||||  |||| |||||||    
T  14902975 tg--tctagaagtctcttgcttttgtgcttaagcataagaaatctcttg 14903021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 17994196 - 17994282
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17994196 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 17994282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23508996 - 23508884
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  23508996 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 23508900  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  23508899 agcattggaagtctct 23508884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2651496 - 2651382
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2651496 aattctagagtcttaagagtct-tatcttatttgtattgtgaacaccaatgatagtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtt 2651398  T
Q  129 tgaatttagaagtctctt 146  Q
    ||  | ||||||||||||    
T  2651397 tg--tctagaagtctctt 2651382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 14711182 - 14711297
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  14711182 ttgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 14711279  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  14711280 agcaaaggaagtctcttg 14711297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 14778846 - 14778961
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  14778846 ttgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 14778943  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  14778944 agcaaaggaagtctcttg 14778961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 18775058 - 18775173
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  18775058 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 18775155  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  18775156 agcataggaagtctcttg 18775173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 55651203 - 55651089
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  55651203 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctcttgccttcgtgcttg 55651107  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  55651106 agcattagaagactcttg 55651089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 8997659 - 8997743
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8997659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gacaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttg 8997743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18773741 - 18773545
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaag-tgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  18773741 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattcgtgaacaccactaattgtatttcaagtttttaaacctcaaacaattttctatgtaattatg 18773642  T
Q  127 tttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||  | |||||||||| ||| | || ||||||||||   |||||||||||  ||||| |  ||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  18773641 ttt--aattagaagtctattg-atttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtgtgtgcttgagcatatgaaacctcttgcttttgtgcttgagcaatt 18773545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36470425 - 36470343
Alignment:
Q  258 tttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36470425 tttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 36470343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10249509 - 10249309
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  10249509 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctcttgtagttgttcttgagtagtttgaagtctct 10249410  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    | |||  || ||   |||||| ||||||||  |||||     ||||||||||   ||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  10249409 tgctattttgagccctgagcaattgtaatcgaatattgattttagtgaactcttcttggaggtgcaagggggacatgact-agttccggtttgtggaagg 10249311  T
Q  335 aa 336  Q
    ||    
T  10249310 aa 10249309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13027463 - 13027393
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13027463 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtgtatcaagtgttcaa 13027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Original strand, 16324943 - 16325013
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16324943 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 16325013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 49002360 - 49002520
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||     ||||||    
T  49002360 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctctcgcctgcgtgcttg 49002456  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| |||   |||||||||||    
T  49002457 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagca 49002520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4948218 - 4948104
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||   | ||||||    
T  4948218 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgtgtgcttg 4948122  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4948121 agcattagaagtctcttg 4948104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23120989 - 23120911
Alignment:
Q  259 ttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  23120989 ttgtaattagatattacatagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaagacaaacttccggtttgtggaaggaac 23120911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 55756242 - 55756356
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  55756242 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctttgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 55756338  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  55756339 agcattagaagtctcttg 55756356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Original strand, 21350638 - 21350731
Alignment:
Q  39 tctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||||||| |||||||    
T  21350638 tcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacatctttttgtgtaattttgtttga 21350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13693476 - 13693420
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13693476 tagagtctgtatctgatttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13693420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 450457 - 450343
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  450457 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 450361  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  450360 agcattagaagtctcttg 450343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3390336 - 3390221
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||     ||||||    
T  3390336 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3390239  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3390238 agcattagaagactcttg 3390221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5873251 - 5873137
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  5873251 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatatttctttgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 5873155  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  5873154 agcattagaagactcttg 5873137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10740973 - 10741087
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||     ||||||    
T  10740973 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgttt--aattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10741069  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10741070 agcattagaagtctcttg 10741087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10954742 - 10954856
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||     ||||||    
T  10954742 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgttt--aattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10954838  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10954839 agcattagaagtctcttg 10954856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Original strand, 14190088 - 14190166
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14190088 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataaattgtttgtg 14190166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 14844032 - 14844146
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14844032 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14844128  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14844129 agcattagaagtctcttg 14844146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 15561458 - 15561572
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15561458 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15561554  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15561555 agcattagaagtctcttg 15561572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18473713 - 18473643
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18473713 aattctagagtcttaagagtctcattattatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18473643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21996294 - 21996180
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  21996294 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 21996198  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21996197 agcattagaagtctcttg 21996180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22006892 - 22006778
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22006892 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22006796  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22006795 agcattagaagtctcttg 22006778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24028464 - 24028578
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24028464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24028560  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24028561 agcattagaagtctcttg 24028578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 29042035 - 29042149
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  29042035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 29042131  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29042132 agcattagaagtctcttg 29042149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 30926873 - 30926987
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  30926873 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 30926969  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30926970 agcattagaagtctcttg 30926987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36018217 - 36018103
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36018217 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36018121  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36018120 agcattagaagtctcttg 36018103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36028770 - 36028656
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36028770 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36028674  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36028673 agcattagaagtctcttg 36028656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 49518016 - 49517902
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  49518016 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 49517920  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  49517919 agcattagaagtctcttg 49517902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 55745631 - 55745745
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  55745631 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 55745727  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  55745728 agcattagaagtctcttg 55745745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11535725 - 11535653
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  11535725 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 11535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 31267171 - 31267243
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  31267171 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 31267243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17917933 - 17917770
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||     
T  17917933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctta 17917837  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  17917836 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattt 17917770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17928581 - 17928418
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||     ||||||    
T  17928581 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttggaagtctcttgcctgcgtgcttg 17928485  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  17928484 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattt 17928418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16255747 - 16255632
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaa-ttctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||    
T  16255747 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtaatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 16255651  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  16255650 gagcattagaagtctcttg 16255632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16266340 - 16266225
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaa-ttctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||    
T  16266340 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtaatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 16266244  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  16266243 gagcattagaagtctcttg 16266225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 461038 - 460924
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||| ||||||||     ||||||    
T  461038 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaattctcttgcctgcgtgcttg 460942  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  460941 agcattagaagtctcttg 460924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3370596 - 3370481
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||     ||||||    
T  3370596 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcataatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3370499  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3370498 agcattagaagactcttg 3370481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Original strand, 4986790 - 4986859
Alignment:
Q  61 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  4986790 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaacatatttcattgtatttttgtttga 4986859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4987153 - 4987084
Alignment:
Q  61 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  4987153 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaacatatttcattgtatttttgtttga 4987084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10751547 - 10751661
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||     ||||||    
T  10751547 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgttt--aattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10751643  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| || ||||||||||    
T  10751644 agcattaaaagtctcttg 10751661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 10965316 - 10965430
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||     ||||||    
T  10965316 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgttt--aattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10965412  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| || ||||||||||    
T  10965413 agcattaaaagtctcttg 10965430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 19955341 - 19955455
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  19955341 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19955437  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19955438 agcattagaagtctcttg 19955455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20576972 - 20576902
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20576972 aattttagagtcttaagagtctgtatttgatttgtatttggaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24640129 - 24640015
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  24640129 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 24640033  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24640032 agcattagaagtctcttg 24640015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27656481 - 27656367
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  27656481 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 27656385  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27656384 agcattagaagtctcttg 27656367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27667054 - 27666940
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  27667054 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 27666958  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27666957 agcattagaagtctcttg 27666940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 30937451 - 30937565
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||  ||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  30937451 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctccgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 30937547  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30937548 agcattagaagtctcttg 30937565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11514915 - 11514843
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  11514915 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctatgtatttttgtttgaat 11514843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24713308 - 24713240
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  24713308 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 24713240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 39532175 - 39532247
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||  | |||||||||    
T  39532175 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatctttgtttgaat 39532247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18394194 - 18394154
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18394194 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18394154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18473527 - 18473441
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacat--agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  18473527 tgagcatttgtaatcagatattgattttagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgact-acttccggattgtggaaggaac 18473441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Original strand, 18775816 - 18775881
Alignment:
Q  78 tgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18775816 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaatcttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 18775881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10695521 - 10695482
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695521 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10695482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10909288 - 10909249
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909288 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10909249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 14836481 - 14836520
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836481 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14836520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 15207766 - 15207805
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207766 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15207805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18130618 - 18130657
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130618 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18130657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19581121 - 19581082
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581121 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19581082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 27815324 - 27815363
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815324 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27815363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 48371012 - 48370973
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48371012 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 48370973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1674514 - 1674476
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 1674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Original strand, 17526812 - 17526880
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526812 aattctagagtctt-agagtctgaat-tgttttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17526880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 18752868 - 18752982
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  18752868 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 18752964  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18752965 agcattagaagtctcttg 18752982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 18763478 - 18763592
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  18763478 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcatgcttg 18763574  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18763575 agcattagaagtctcttg 18763592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 19944706 - 19944820
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  19944706 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19944802  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    | || |||||||||||||    
T  19944803 aacattagaagtctcttg 19944820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10300407 - 10300343
Alignment:
Q  68 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  10300407 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaat 10300343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 52703669 - 52703628
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52703669 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaact 52703628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16304984 - 16304948
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16304984 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16304948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16317208 - 16317172
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16317208 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16317172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 337
Target Start/End: Original strand, 40454731 - 40455002
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||||    |||||||||    
T  40454731 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcatgcgtgcttgagc 40454827  T
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    | ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||| ||   |||| ||||||||    
T  40454828 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttag-agagtattgagcatt 40454925  T
Q  260 tgtaatc--agatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||   |  |||  |||||||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40454926 tgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgatttgtggaaggaac 40455002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5022617 - 5022578
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022617 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5022578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18078285 - 18078324
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18078285 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaa 18078324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Original strand, 29681173 - 29681253
Alignment:
Q  259 ttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29681173 ttgtaatcatatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttctggtttgtggaaggaac 29681253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 47152457 - 47152496
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47152457 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaa 47152496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7222190 - 7222121
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| |||||| | || || |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7222190 aattctagagtcttaagagtc-caatttgttttgtattatgaacaccagtgattgcatatcaagtgttcaa 7222121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18773553 - 18773469
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  18773553 tgagcaattgtaatcagatattgattagtgaactctccttgaaagggcaagggggacatgact-acttccggattgtggaaggaac 18773469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 40470969 - 40471005
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470969 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 40471005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25657013 - 25656902
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||    
T  25657013 tattgagaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgtgtgcttgagc 25656917  T
Q  163 aatagaagtctcttg 177  Q
    | |||||||||||||    
T  25656916 attagaagtctcttg 25656902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13693280 - 13693204
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||| || || |||||||||||    
T  13693280 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggattatggaaggaacctgtat-aattgcttgtg 13693204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 177
Target Start/End: Original strand, 19555904 - 19555946
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19555904 tagaagtctcttggagttgtacttgagcaatagaagtctcttg 19555946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22089717 - 22089660
Alignment:
Q  279 gtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  22089717 gtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-aattccggtttgtggaaggaac 22089660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24619299 - 24619269
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24619299 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 24619269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 335
Target Start/End: Original strand, 16325019 - 16325230
Alignment:
Q  120 aattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttg 219  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||  || ||||||||||  |||||  |||||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  16325019 aattctgtttga--ttagaagtctattgcttttgtgcttgagcataagaagaatcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttg 16325116  T
Q  220 agcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat--agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgac 317  Q
    || | ||||||||||||| ||   |||     |||||| ||||||||| |||||   |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16325117 agtagtttgaagtctcttgct---tttgtgcttgagcaattgtaatcaaatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-ac 16325212  T
Q  318 ttccggtttgtggaagga 335  Q
    |||||| || ||||||||    
T  16325213 ttccggattatggaagga 16325230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17247029 - 17246996
Alignment:
Q  312 actgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17247029 actgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 17246996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17538914 - 17538814
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtc 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||  ||||  |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||    
T  17538914 tagaagtctcttgcagttgtgcttgag-gatagaaagtttcttgatttagttcttgagcatagaaaatctcttgtagttgcgcttgagtagtttgaaatc 17538816  T
Q  234 tc 235  Q
    ||    
T  17538815 tc 17538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19580907 - 19580847
Alignment:
Q  276 atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19580907 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactagact-acttccgttttgtggaaggaac 19580847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8105213 - 8105185
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8105213 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 8105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 211088 - 210767
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211088 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 210989  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  210988 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 210890  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  210889 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaggggggacataactgacttccggtttgt 210790  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgct 351  Q
    | ||||||| || ||||||||||    
T  210789 gaaaggaacctgtataaattgct 210767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 56 - 352
Target Start/End: Original strand, 377995 - 378293
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  377995 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtg 378094  T
Q  156 cttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | ||||    
T  378095 cttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagactcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgag 378193  T
Q  256 catttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaata-aattgct 351  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  378194 cagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcatgact-acttccagtttgtggaaggaacttgtatataattgct 378292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 219928 - 219624
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  219928 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcacacaaatttctttgtaattctgtt 219829  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  219828 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgaacataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 219731  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||  | ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  219730 aagtctcttgctagttttatcagtgagcttttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgact-acttccgatt 219632  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  219631 tgtggaag 219624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 244703 - 245011
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  244703 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt-ttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 244801  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||| ||||||||   | ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||| | ||||    
T  244802 tgaa--tagaactctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatttcttgcagctgtgcttgagtagtttg 244899  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||| | | ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  244900 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaaccctccttgaaagtgcaagggggacacgact-acttccggt 244998  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  244999 ttgtggaaggaac 245011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 88093 - 87890
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||||||| ||    
T  88093 aattctagagtcttaagagtct-tatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacattgttatctgtaattctatt 87995  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  87994 tgaat--agaagtctcttgcagttgcgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 87897  T
Q  229 aagtctc 235  Q
    |||||||    
T  87896 aagtctc 87890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 171)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 19066479 - 19066799
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19066479 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 19066578  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19066579 tgaattaagaggtctattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 19066678  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19066679 aagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 19066778  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  19066779 ggaaggaacatgtataaattg 19066799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 33352689 - 33353014
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352689 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 33352788  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33352789 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 33352887  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  33352888 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagattttacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggatatgactgacttccggtttgt 33352987  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33352988 ggaaggaacctatataaattgcttgtg 33353014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12422950 - 12422626
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12422950 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 12422852  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12422851 tgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttgagcaatagaagactcttgattgtgttcaggagcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 12422753  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  12422752 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggagtgacttccggtttgt 12422653  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12422652 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 12422626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19482441 - 19482114
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19482441 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgt 19482342  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19482341 ttgaattaagaagtctcttgcagttgttcttgagcaatagaagtctccttatcttgttcaagagcataggaagtctcttacagttgcgcttcagcaattt 19482242  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19482241 gaagtctcatactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttg 19482142  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||    
T  19482141 tggaaggaacctgtataaattgtttgtg 19482114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 26589287 - 26588960
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26589287 aattctagagtctttagagtctgtaaatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtt 26589188  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26589187 tgaatttagaattctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttg 26589088  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagc-atttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26589087 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaatttgtaattagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 26588988  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  26588987 tggaaggaacctgtataaattgcctgtg 26588960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9717530 - 9717223
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9717530 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 9717432  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717431 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 9717332  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||    
T  9717331 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggtcaggactgactttcgatttgt 9717232  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  9717231 ggaaggaac 9717223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 32 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19085845 - 19085539
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19085845 tctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttga 19085746  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19085745 attaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaag 19085646  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   | |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19085645 tctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttggtgaactctccttggaagtgtaagggcgacaatact-acttccggtttgt 19085547  T
Q  329 ggaaggaa 336  Q
    ||||||||    
T  19085546 ggaaggaa 19085539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 12715882 - 12716192
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12715882 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtt 12715981  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  12715982 tgaatttagaagtctcttgcaggtgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaattctcttgcagttgtgcttgagc-attta 12716080  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12716081 tagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 12716180  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  12716181 tgtggaaggaac 12716192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21617932 - 21617608
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||    
T  21617932 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttt-tttgtttttctgtt 21617834  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  21617833 tgaattgagaagtcttttgcagttgttctttagcaatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgttcttgagca-tttg 21617735  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21617734 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctcctttgaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 21617635  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||| ||||  | |||||||| |||||    
T  21617634 ggaatgaaccagtataaattgtttgtg 21617608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 20731166 - 20731487
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20731166 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 20731264  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20731265 tgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 20731364  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  20731365 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattaaagagtgaactctcgttggaagtgcaa-ggggacaggactgatttccggtttgt 20731463  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| |  |||||||||||    
T  20731464 ggaaggaacctatataaattgctt 20731487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16876592 - 16876269
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||  ||| ||||||||||||||    
T  16876592 aattctagagtctttagagtctgtatctgatatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactaaaacatattt-tttgtaattctgtt 16876494  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16876493 tgaattgagaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 16876395  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16876394 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttcgaagtgcaa-ggggacaagactgacttccggtt 16876296  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  16876295 tgtggaaggaacctgtataaattgctt 16876269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21624777 - 21624463
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21624777 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgagcaccactaattgtatatcaagtgttcgacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 21624679  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21624678 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgattgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 21624580  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| |||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21624579 aagtatcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattacttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 21624480  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  21624479 ggaaggaacttgtataa 21624463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32543952 - 32543645
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||    
T  32543952 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctt-gtaattctgtt 32543854  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543853 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtcttttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 32543754  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32543753 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaactgtaatcagatattatatagtgaactctccttgaaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 32543654  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  32543653 ggaaggaac 32543645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22801827 - 22801505
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22801827 aattctagagtcttaatagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaatggttcaactgcaaacattttgctt-gtaattctgtt 22801729  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22801728 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatttg 22801629  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||   |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22801628 aagtctcttactagtcttagaagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaaatctccttggaaatgcaagggggacatgactgacttccagtttgt 22801529  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||  || |||||||||||    
T  22801528 ggaaggaatctgtataaattgctt 22801505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21234825 - 21234524
Alignment:
Q  50 tctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgca 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  21234825 tctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctatttgaattaagaagtctctcgca 21234727  T
Q  150 gttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagt 249  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||     
T  21234726 gttgtgcttgagcattagaagtttcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgccgttgtgcttgagcattttgaaatctcttgctagttttagc 21234627  T
Q  250 aatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21234626 agtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattg 21234527  T
Q  350 ctt 352  Q
    |||    
T  21234526 ctt 21234524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13601856 - 13601546
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13601856 aattttagagtcttaagagtcggtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtt 13601757  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13601756 tgaatttagaagtctcttggagttgtacttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13601658  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| | |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13601657 aagtctcgtgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtt 13601558  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  13601557 tgtggaaggaac 13601546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15954384 - 15954063
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||    
T  15954384 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctta-taattatgtt 15954286  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15954285 tgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgaggagcatatgaagtctcttgcaattgtgcttgagca-tttg 15954187  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    || |||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15954186 aattctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattaaatagtgatctctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 15954087  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  15954086 ggaaggaacctgtataaattgctt 15954063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15301899 - 15301595
Alignment:
Q  34 tagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15301899 tagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 15301800  T
Q  134 ttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtc 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  15301799 ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaattctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-ttttgaaatc 15301701  T
Q  234 tcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgg 330  Q
    |||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||    
T  15301700 tcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggtct-acttctggtttgtgg 15301602  T
Q  331 aaggaac 337  Q
    |||||||    
T  15301601 aaggaac 15301595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17381264 - 17380942
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||    
T  17381264 aattctggagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatagtgtgttcaaccttaaatatttttatttgtaattctgtt 17381165  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17381164 tggattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcatgattgtttttatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 17381066  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17381065 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 17380966  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  17380965 ggaaggaacctgtataaattgctt 17380942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19952033 - 19952339
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  19952033 aattctagagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcta-gtaattctgtt 19952131  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  19952132 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaggtctcttgattgtgttcaagagcatagaaagtttcttgcagttgtgtttgagc-atttg 19952230  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| || |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19952231 aagtcttttgctaattttagcagtgagcaattgtaatcagatattacataatgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 19952330  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  19952331 ggaaggaac 19952339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19623654 - 19623359
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19623654 agagtctgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagact 19623555  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  19623554 cttgcagttgtgcttgagcattagaagtctctagattgtgttcaggagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgaataatttgaagtctcttgctaag 19623455  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19623454 tttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtaaacactccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 19623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 15532087 - 15532394
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||    
T  15532087 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatctttctt-gtagttctgtt 15532185  T
Q  129 tgaattta-gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15532186 tgaattaaagaagtctattgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagc-attt 15532284  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15532285 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacataatgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttg 15532384  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  15532385 tggaaggaac 15532394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19688467 - 19688155
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19688467 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtt 19688368  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19688367 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttaagc-ataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 19688271  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    || ||| || || ||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |    
T  19688270 aaatcttttgct-agtttagcattgagcgattgcaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttcctgcttat 19688172  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19688171 ggaaggaacttgtataa 19688155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29917704 - 29917399
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29917704 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattg------ccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttt-tttgtaattctgtt 29917612  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29917611 tgaattaagaagtcttttgcagttttgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttc 29917512  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||| ||   ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  29917511 aagtctcttgctaattt---taacgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaacggggactagact-acttccggtttgt 29917416  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29917415 ggaaggaacttgtataa 29917399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 14100899 - 14101207
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14100899 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaataccactgattgtatttcaagtgtccaacctcaaacatttttctttataattctgtt 14100998  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14100999 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 14101096  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  14101097 aagtctcttgctagttttagcagagagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 14101195  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  14101196 tgtggaaggaac 14101207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19470355 - 19470039
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19470355 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 19470256  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  19470255 tgaat--agaagtctcttgcagttttgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttg 19470158  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| | || ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  19470157 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatcacattatagtgaactctccttagaagtgctagggggacatgact-acttccggtt 19470059  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19470058 tgtggaaggaacttgtataa 19470039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24116518 - 24116207
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||    
T  24116518 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattttgt 24116419  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24116418 ttgaatttagaagtctcttgcagctgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt 24116319  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
     ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  24116318 aaagtctctcgctaagtttagaagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttctggt 24116220  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  24116219 ttgtggaaggaac 24116207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7763342 - 7763032
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7763342 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 7763243  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7763242 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgtttaggagcatatgaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 7763145  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | | | || ||||||||||||||||||    ||||||||||   ||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7763144 aagtctcttgctaagtttagcactcaacaattgtaatcagatattacatttttagtgaactcttcttgaaagtgcaagggggacgggactgacttccggt 7763045  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  7763044 ttgtggaaggaac 7763032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18435228 - 18434910
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18435228 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctt-gtaattctgtt 18435130  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18435129 tgaattgagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgatc-atttg 18435031  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||| | ||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  | | |||||||     
T  18435030 aagtctcttgctaaatttagcagtgagcagttgtaattacatattacattttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggagt-acttccga 18434932  T
Q  324 tttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||| ||| ||||    
T  18434931 tttgtggaaggaagttgtataa 18434910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25593758 - 25593448
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  25593758 aattctagagtcttaagagtttgtatttgatttgtattgtgaatatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctatt 25593659  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25593658 taaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagc-atttg 25593560  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||| | |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  25593559 aagtcttttgctaagtttagcagtgagcatttgtaatcaaatattatattttggtgaactctccttggaaatgcaaggggggcaggactgatttccggtt 25593460  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  25593459 tgtggaaggaac 25593448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26942125 - 26941819
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26942125 aattatagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtt 26942026  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  26942025 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctctcgatttagttcttgagcataggtaatctcttgcagttgtgattgagtagtttg 26941928  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||    
T  26941927 aagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtaaactctccttggaagtgcaagggggacatgattgacttctggt 26941828  T
Q  325 ttgtggaag 333  Q
    |||||||||    
T  26941827 ttgtggaag 26941819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18378062 - 18377822
Alignment:
Q  96 tcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcata 195  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||      
T  18378062 tcaacctcaaacatttttctttgtaattcggtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcagg 18377963  T
Q  196 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaa 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18377962 ggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaattagatattacatagtgaactctccttggaa 18377864  T
Q  296 gtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18377863 gtgcaagggggaccggactgacttccggtttgtggaaggaac 18377822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 123 - 352
Target Start/End: Original strand, 19833533 - 19833761
Alignment:
Q  123 tctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19833533 tctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcagtagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgagc 19833632  T
Q  223 aatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccg 322  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19833633 -atttgaaatctgttactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattacatattgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgactttcg 19833731  T
Q  323 gtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  19833732 gtttgtgtaaggaacctttataaattgctt 19833761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 90 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15986980 - 15986734
Alignment:
Q  90 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagg 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  15986980 aagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgagt--agaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tagaagtctattgattgtgtttagg 15986884  T
Q  190 agcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactc 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  15986883 agcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactc 15986784  T
Q  287 ccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaa 336  Q
     | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15986783 tcctttgaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaa 15986734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16915113 - 16914808
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16915113 aattctatagtcttaagagactgtatgtgatttatattgtgaacacgactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgaaattatgtt 16915014  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16915013 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 16914916  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||| | | ||||||||||||||||   |||| ||||| | || ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  16914915 aagtctcttgctagttttagcagtgagtagtcgtaatcagatattacattttagtaaactctccttagaaatgcaagggggacatgactgacttccgatt 16914816  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  16914815 tgtggaag 16914808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29597762 - 29597556
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29597762 aattctaaagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 29597663  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29597662 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttgaacattaaaagtctcttgatcgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttcagc-atttg 29597565  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  29597564 aagtctctt 29597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19625499 - 19625182
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19625499 aattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtt 19625400  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||  || |   |||||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||    
T  19625399 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atagaaagtatcttgttttagtactttagcataggaaatctcttgcagttgtgttcgagtagttt 19625303  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    || ||||||| |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  19625302 gatgtctcttgctagttttagtagtaagcagttgtaatcagatataacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccag 19625204  T
Q  324 tttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  19625203 tttgtgaaaggaacttgtataa 19625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17927479 - 17927172
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  17927479 aattctagagttttaagattctgtatctgatttttattgtgaacaccactgattgtttatcaagtattcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 17927380  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  17927379 taaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatgggaagtctcttgattttgctcttgagcataggaaatctcttgcaattgtgtttgagtagtttg 17927282  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  17927281 aagtctcttgctaattttagcattgagcagttgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccagttt 17927183  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||    
T  17927182 gtggaaggaac 17927172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25592307 - 25592002
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  25592307 aattatagagccttaagagtct-tatctgatttgtatagtgaacatcactgattgcatatcaagtgttcaaccttaaaca-ttttctttgtaattctgtt 25592210  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25592209 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgaatttgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 25592112  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatca--gatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||  ||| |    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||    
T  25592111 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagtgatttattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-actttcggatt 25592013  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||    
T  25592012 gtggaaggaac 25592002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25930165 - 25929858
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25930165 aattttagagccttaaaagtctgtatctgatttttattgtgaactccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 25930066  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||||    
T  25930065 tgaa--tagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatattgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtacttgcgtagtttg 25929968  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  || || | ||||||||||| ||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  25929967 aagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtgatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggttt 25929869  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    || ||||||||    
T  25929868 gttgaaggaac 25929858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13435465 - 13435265
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13435465 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaagtct 13435367  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    ||| |||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  13435366 cttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggaaaggact-acttccggtttgtggaagg 13435268  T
Q  335 aac 337  Q
    |||    
T  13435267 aac 13435265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12347778 - 12347472
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12347778 aattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacacg-ctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgt 12347681  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| || |||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||    
T  12347680 ttgaat--agaagtctcttgtagttgtgattgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagttt 12347583  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||| |||  || || | ||| || |||||||||||||||     |||||||||  | |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  12347582 gaagtctcttgctattttgagcagtgaacaattgtaatcagatattgattttagtgaactttccttggaagtgcaatggggacaggact-acttccggtt 12347484  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  12347483 tgtggaaggaac 12347472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 14070562 - 14070860
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  14070562 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 14070659  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||   |  |||| |||||| |    
T  14070660 agcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgttg-tgtgcttgagcattttgaagtctcgtacttgttgaagtattgagcagt 14070758  T
Q  260 tgtaatca-----gatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    ||||||||     |||  ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  14070759 tgtaatcagttgtgattatacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcctg 14070858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 17317091 - 17317281
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | |||| | ||||||    
T  17317091 tagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttgaagtctcttgctagttttagcagtgagtaattgtaa 17317190  T
Q  265 tcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||    
T  17317191 tcagatattacatagtgaactccccttggaagtgctagggggacaggactgacttccggtttatggaaggaacctgtataaattgcctgtg 17317281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 22076868 - 22077014
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22076868 attctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgttt 22076966  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22076967 gaattaaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 22077014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10631684 - 10631514
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||    
T  10631684 agaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaat 10631586  T
Q  266 cagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10631585 caaacattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 10631514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 349
Target Start/End: Original strand, 14051881 - 14052163
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  14051881 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 14051978  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||  | |||||||||| | ||||||||||| ||||   |  |||| |||||| |    
T  14051979 agcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggatgtctcttgttg-tgtgcttgagaattttgaagtctcgtacttgttgaagtattgagcagt 14052077  T
Q  260 tgtaatcagatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||     |||  ||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14052078 tgt-----gattatacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattg 14052163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Original strand, 17303807 - 17304037
Alignment:
Q  102 tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |    
T  17303807 tcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcttgagcatatgaaat 17303904  T
Q  202 ctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgc 299  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||  || || | |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||    
T  17303905 ctcttgcagttgtgctttagtagtttgaagtctcttgctattttgagcagtgagcaattgtaatcagatattgattgtagtgaactctccttggaagtgc 17304004  T
Q  300 aagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  17304005 aagggagacatgact-acttccggtttgtggaag 17304037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10631791 - 10631673
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10631791 aattctagagtctcaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtt 10631692  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  10631691 tgaattaagaagtctcttg 10631673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 17316985 - 17317103
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17316985 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaccatttttcattgtaattatgtt 17317084  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17317085 tgaatttagaagtctcttg 17317103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 22077004 - 22077161
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22077004 gaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttaatagagagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctacttggaag 22077102  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22077103 tgcaagggggacataactgacttctgatttatggaaggaacctgtataaattgcttgtg 22077161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 20113158 - 20113288
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20113158 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtt 20113257  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20113258 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 20113288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 17446115 - 17446320
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17446115 aattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgt 17446212  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  || |||||||||||  || ||||||||||   |||||||||||  | ||| |  |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  17446213 ttgaa--tataagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgctgttgtgcttgagtagttt 17446310  T
Q  228 gaagtctctt 237  Q
    ||||||||||    
T  17446311 gaagtctctt 17446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 16265612 - 16265727
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16265612 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgtt 16265710  T
Q  129 tgaatttagaagtctct 145  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16265711 tgaattaagaagtctct 16265727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20635381 - 20635101
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  20635381 ttgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 20635284  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| | ||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  20635283 agcataggaagtctcttgctttagtacttgagcaaatgaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 20635184  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20635183 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 20635101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21034677 - 21034546
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21034677 aattctagagtcttaagagtcac-atctaatttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 21034579  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21034578 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 21034546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22386464 - 22386188
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  22386464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 22386367  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||| |||    || |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||| |    
T  22386366 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcatgcctgcgtacttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtaatattgagcagt 22386267  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  22386266 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 22386188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7811701 - 7811555
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7811701 aattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaa-tctgtt 7811603  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttga 178  Q
    ||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  7811602 tgaa--tagaattttcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttga 7811555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23296414 - 23296283
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23296414 aattcgagagtcttaagagtctgtatttgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaactgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgt 23296315  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23296314 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 23296283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 337
Target Start/End: Original strand, 14732712 - 14732887
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||  ||||| | |||||| ||||||    
T  14732712 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgtgc-atttgaagtctcgtgctagttttagcagtgagcagttgtaa 14732810  T
Q  265 tcagatattaca---tagtgaactc-ccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||   ||||||||||    ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  14732811 tcagatattacattttagtgaactcttgtttgaaagtgcaagggggacaggactaacttccagtttgtggaaggaac 14732887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16528836 - 16528690
Alignment:
Q  194 taggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccat 290  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |    
T  16528836 taggaaatctcttgcagtcgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctcct 16528737  T
Q  291 tggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16528736 tggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 16528690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11235309 - 11235129
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  11235309 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 11235212  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttacta 241  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  11235211 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacta 11235129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21127890 - 21127611
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  21127890 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 21127793  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  |||| |||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||     
T  21127792 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactagg--tagtattgagcag 21127695  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |      |||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21127694 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 21127611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32335524 - 32335320
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32335524 aattctaaagtcttaagagttt-tatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtt 32335427  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||  ||| |||||||||||  || ||||||||||   ||||||| |||  | ||| |  ||||||| ||   |||||||  ||||||||||| | ||||    
T  32335426 tga--ttataagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctattgcgtttgtgcttgagcatatgagacctcttgcttttgtgcttgagtagtttg 32335329  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  32335328 aagtctctt 32335320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 16463113 - 16463320
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacacca-ctgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttcttt-gtaattctg 126  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  16463113 aattctagagtcttaagagtcgc-atctgatttgtattgtgaacaccaactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctg 16463211  T
Q  127 tttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgt-gttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||| |   ||||||||||| | || || |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |    
T  16463212 tttgaat--agaagtctcttgcaattgtgcttgagtataggaagtctcttg-tagtagtgcttgagcataggaaacctcttgcgtttgtgcttgagtagt 16463308  T
Q  226 ttgaagtctctt 237  Q
    ||||||||||||    
T  16463309 ttgaagtctctt 16463320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 345
Target Start/End: Original strand, 24728986 - 24729296
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||     
T  24728986 tctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacatcattgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttg- 24729084  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||   |||| ||||||  ||||  |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  24729085 -tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatacgaagactcttgcgtgtgggcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaag 24729183  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattgg-aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||| || ||   |||     |||||| ||||||| |||||||     |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  24729184 tcttttgct---tttgtgcttgagcaattgtaataagatattgattttagtgaactctccttggaaagtgcaagggggacaagact-acttccggattgt 24729279  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  24729280 ggaaggaacttgtataa 24729296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 17608796 - 17608968
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  17608796 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 17608893  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  17608894 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtct 17608968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 15395152 - 15395264
Alignment:
Q  34 tagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||  |    
T  15395152 tagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtatg--t 15395249  T
Q  134 ttagaagtctcttgc 148  Q
     ||||||||||||||    
T  15395250 ctagaagtctcttgc 15395264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 7586646 - 7586925
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  7586646 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagcgttcaaactcaaacaattttctgtgtaaatctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 7586743  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  |||| |||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||     
T  7586744 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactagg--tagtattgagcag 7586841  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||      |||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7586842 ttgtaatcagtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 7586925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31931233 - 31931119
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  31931233 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 31931137  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| | |||||||||||    
T  31931136 agcattggaagtctcttg 31931119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18227104 - 18226803
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  |||    
T  18227104 agtcttaagagtttgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttga--tta 18227007  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||| |  | |||    |||||||| ||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18227006 gaagtctcttgc--ttttg-ttgagcataggaagtctctcgcctttgtggttgagcatagcaaacctcttgcctttgtgtttgagtagtttgaagtctct 18226910  T
Q  237 tactaagtttagt-aatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    | |    ||| ||   |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  18226909 tgc----tttggtgcttgagcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacatgact-acttccggattgtggaag 18226815  T
Q  334 gaacttgaataa 345  Q
    ||||||| ||||    
T  18226814 gaacttgtataa 18226803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 333
Target Start/End: Original strand, 20113264 - 20113402
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||    
T  20113264 gaagtctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacattttagtgaactctccttgg 20113363  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  20113364 aagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaag 20113402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 345
Target Start/End: Original strand, 18172698 - 18172998
Alignment:
Q  38 gtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttag 137  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||    
T  18172698 gtcttaagagtttgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttga--ttag 18172795  T
Q  138 aagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||| |  | |||    |||||||| ||  |||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  18172796 aagtctcttgc--ttttg-ttgagcataggaagtctctcgcctttgtggttgagcatagcaaacctcttgcctttgtgtttgagtagtttgaagtctctt 18172892  T
Q  238 actaagtttagt-aatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
     |    ||| ||   |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||    
T  18172893 gc----tttggtgcttgagcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacatgact-acttccggattgtggaagg 18172987  T
Q  335 aacttgaataa 345  Q
    |||||| ||||    
T  18172988 aacttgtataa 18172998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18555080 - 18554968
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  18555080 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 18554984  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  18554983 agcattggaagtctct 18554968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11205756 - 11205641
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  11205756 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 11205659  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  11205658 agcataggaagtctcttg 11205641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17064010 - 17063896
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||  |  ||||||    
T  17064010 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttc-ttgtaattctgtttgaa--tataagtctcttgctttagtgcttg 17063914  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| | |||||||||||    
T  17063913 agcattggaagtctcttg 17063896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 337
Target Start/End: Original strand, 24719204 - 24719502
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||        
T  24719204 tctaaagtcttaagagtatgtatatgatttgtattatgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgt---- 24719299  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||   |||| ||||||  ||||  |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  24719300 -tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtgtgtgggcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaag 24719398  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtg 329  Q
    |||||| ||   |||     ||||| ||||||||| ||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||    
T  24719399 tctcttgct---tttgtgcttgagcttttgtaatctgatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttctggattgtg 24719494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25518499 - 25518416
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25518499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 25518416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 19453011 - 19453216
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |  ||||||    
T  19453011 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgatttagtgcttg 19453108  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| | ||||| ||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  19453109 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtatcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 19453208  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  19453209 ttgtaatc 19453216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 19289766 - 19289850
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19289766 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctctt 19289850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17047370 - 17047255
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  17047370 ttgtattgagaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 17047273  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| | |||||||||||    
T  17047272 agcattggaagtctcttg 17047255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19875523 - 19875419
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19875523 aattctagagtcttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactaattgtatatcaattgtttaacctcaaac-attttctttgtaattcttt 19875426  T
Q  128 ttgaatt 134  Q
    |||||||    
T  19875425 ttgaatt 19875419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 12953516 - 12953628
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |  ||||||    
T  12953516 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaacaaatttttgtgtaattctgtttga--ttagaagcctcttgctttagtgcttg 12953612  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  12953613 agcattggaagtctct 12953628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22308596 - 22308396
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||    |||||||||||    
T  22308596 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttctgtttga--ttagaagcctcttgcctgcttgcttgagca 22308500  T
Q  164 atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt--gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
     |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||   |||| ||||||||||    
T  22308499 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatactaag-agagtattgagcatttg 22308401  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  22308400 taatc 22308396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Original strand, 25687137 - 25687337
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||  ||||||| |||||||  |  |||||||||    
T  25687137 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttatgtgtaattttgtttga--ttagaagactcttgctttagtgcttgagc 25687233  T
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    | |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||    
T  25687234 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgagtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgagcatttg 25687332  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  25687333 taatc 25687337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23230877 - 23230793
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatttt 113  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23230877 aattatagagtcttaagaatctgtatctgatttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttt 23230793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25595864 - 25595734
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  25595864 aattctagagttttaagagtttgtatctaatttgtattgtgaacatcactgcttgtatatcaagtgttcaa-atcaaacatttttctgtgtaattttgtt 25595766  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
        ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25595765 ---gtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 25595734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26185407 - 26185291
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||| | |||| | ||||||| ||||    
T  26185407 aattctagtgtcttaagagtct-tatgtgatttgtattgtgaaaaccattgattgtatatcaagtgttcaacgccaaatatttttatgtgtaattatgtt 26185309  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  26185308 tg--tttagaagtctcttgc 26185291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 9934057 - 9934127
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9934057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttga 9934127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15551677 - 15551607
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15551677 aattctagagtcttaagagtctttatttgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaattgttcaa 15551607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 100
Target Start/End: Original strand, 31127771 - 31127840
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127771 attctagagtcttaagagtct-tatctgatctgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 31127840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 17742088 - 17742171
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17742088 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctatgtaattctgtttg-attaagaagtctct 17742171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 25735942 - 25736027
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  25735942 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttagaagactcttgc 25736027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29765347 - 29765276
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  29765347 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaac-attttctttgtatttttgtttgaat 29765276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3661195 - 3661036
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3661195 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3661099  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  3661098 agcattagaagtctcttgctt-tgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 3661036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3671859 - 3671700
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3671859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3671763  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  3671762 agcattagaagtctcttgctt-tgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 3671700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24398461 - 24398393
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 97  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24398461 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacatcattgattgtatatcaagtgttc 24398393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4630683 - 4630569
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4630683 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4630587  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4630586 agcattagaagtctcttg 4630569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 10705017 - 10705071
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10705017 tatcttatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa 10705071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12717220 - 12717334
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12717220 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12717316  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12717317 agcattagaagtctcttg 12717334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12727869 - 12727983
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12727869 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12727965  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12727966 agcattagaagtctcttg 12727983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12854833 - 12854719
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12854833 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12854737  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12854736 agcattagaagtctcttg 12854719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12865359 - 12865245
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12865359 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12865263  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12865262 agcattagaagtctcttg 12865245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25985894 - 25985780
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  25985894 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 25985798  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25985797 agcattagaagtctcttg 25985780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26025271 - 26025157
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26025271 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26025175  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26025174 agcattagaagtctcttg 26025157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26035845 - 26035731
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26035845 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26035749  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26035748 agcattagaagtctcttg 26035731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26864598 - 26864484
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26864598 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26864502  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26864501 agcattagaagtctcttg 26864484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26875222 - 26875108
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26875222 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26875126  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26875125 agcattagaagtctcttg 26875108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27341506 - 27341392
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27341506 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27341410  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27341409 agcattagaagtctcttg 27341392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27402246 - 27402132
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27402246 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27402150  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27402149 agcattagaagtctcttg 27402132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27412905 - 27412791
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27412905 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27412809  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27412808 agcattagaagtctcttg 27412791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 31983010 - 31983124
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  31983010 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 31983106  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  31983107 agcattagaagtctcttg 31983124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32301427 - 32301541
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32301427 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32301523  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32301524 agcattagaagtctcttg 32301541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32312116 - 32312230
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32312116 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32312212  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32312213 agcattagaagtctcttg 32312230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32962318 - 32962432
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32962318 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32962414  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32962415 agcattagaagtctcttg 32962432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32972937 - 32973051
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32972937 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32973033  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32973034 agcattagaagtctcttg 32973051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 34807544 - 34807658
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  34807544 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 34807640  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34807641 agcattagaagtctcttg 34807658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 34818176 - 34818290
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  34818176 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 34818272  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34818273 agcattagaagtctcttg 34818290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 7751619 - 7751778
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    || | |||| || |||||||  |||||||||||||||  || ||||||    
T  7751619 ttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattgtctgtacttttgtttga--ttagaagtctcttgcttttgtgcttg 7751715  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  7751716 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagca 7751778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 18835018 - 18835292
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||   ||||| |||| ||   | ||||||    
T  18835018 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--aagaagcctctcgcttctgtgcttg 18835113  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt--gaagtctcttactaagtttagtaatgagca 257  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||| |||  |||||||| |||| ||   |||| ||||||    
T  18835114 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttag-agagtattgagca 18835212  T
Q  258 tttgtaatc--agatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||   |  ||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18835213 tttgtaatctttgtgatta-ttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccgatttgtggaaggaac 18835292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16930259 - 16930149
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||||||    
T  16930259 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 16930163  T
Q  164 atagaagtctcttg 177  Q
     |||||||||||||    
T  16930162 ttagaagtctcttg 16930149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16959430 - 16959320
Alignment:
Q  64 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||||||    
T  16959430 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 16959334  T
Q  164 atagaagtctcttg 177  Q
     |||||||||||||    
T  16959333 ttagaagtctcttg 16959320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17982885 - 17982999
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  17982885 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 17982981  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17982982 agcattagaagtctcttg 17982999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17985094 - 17985208
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  17985094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 17985190  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17985191 agcattagaagtctcttg 17985208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29384564 - 29384450
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  29384564 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 29384468  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29384467 agcattagaagtctcttg 29384450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33199140 - 33199026
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  33199140 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcatgcttg 33199044  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33199043 agcattagaagtctcttg 33199026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Original strand, 15478246 - 15478373
Alignment:
Q  31 ttctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 130  Q
    |||||||||||| |||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||    
T  15478246 ttctagagtcttaagagtctgaat-tgttttgtattgtgaacaccattgattgtatagcaagtgttcaa-accaaacttatttctttgtaatt-tgtttg 15478342  T
Q  131 aatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
      ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15478343 --tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 15478373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 16123924 - 16124034
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||     
T  16123924 ttgtgaacatcactgattgtacatcaagtgttcaaggtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaa--tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 16124021  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||    
T  16124022 tagaagactcttg 16124034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 17746168 - 17746240
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  17746168 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 17746240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 27166827 - 27166898
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  27166827 ttgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaa-ttcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 27166898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Original strand, 31543280 - 31543321
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543280 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 31543321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31572226 - 31572155
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  31572226 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 31572155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5844898 - 5844827
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  5844898 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 5844827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Original strand, 18826623 - 18826693
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  18826623 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 18826693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4292537 - 4292498
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4292537 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4292498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 7376142 - 7376181
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7376142 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7376181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 9112879 - 9112918
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112879 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9112918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 9123516 - 9123555
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123516 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9123555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 11147634 - 11147673
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147634 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11147673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12041278 - 12041231
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12041278 ttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 12041231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12353367 - 12353328
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12353328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12827504 - 12827465
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827504 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12827465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 148
Target Start/End: Original strand, 14923699 - 14923788
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  ||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14923699 tgatttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcgaac--caaacatctttatgtgtaattttgtttg--tttagaagtctcttgc 14923788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18926148 - 18926187
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926148 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18926187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 20030288 - 20030327
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030288 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20030327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 20063039 - 20063078
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20063039 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20063078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25787513 - 25787474
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787513 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25787474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7811574 - 7811524
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttac 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7811574 gagcataggaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatatgaaatctcttac 7811524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26044024 - 26043910
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26044024 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26043928  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26043927 agcattagaagtctcttg 26043910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3680552 - 3680493
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3680552 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaaggaac 3680493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 122
Target Start/End: Original strand, 31720106 - 31720174
Alignment:
Q  55 ctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaat 122  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  31720106 ctgatttgtatttgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaac--caaacaattatttctttgtaat 31720174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23296307 - 23296166
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattgga 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  || || | ||| ||||| ||||||||||||     || ||||||| | |||||    
T  23296307 gaagtctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttggtattttgagcagtgaacatttataatcagatattgattttattgaactctccttgga 23296208  T
Q  295 agtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| | ||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  23296207 agtgctaagggaacaagaat-acttccggtttgtggaaggaac 23296166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27372644 - 27372605
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372644 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27372605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27462994 - 27462955
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27462994 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27462955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27504157 - 27504118
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27504157 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27504118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27505754 - 27505715
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505754 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27505715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 28251947 - 28251986
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251947 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28251986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 28357094 - 28357133
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357094 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28357133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32757205 - 32757139
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  32757205 ttgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 32757139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29538079 - 29537992
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29538079 tgagcagttgtaatcagatattacattttagtaaactctacttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtttatggaaggaac 29537992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3680654 - 3680593
Alignment:
Q  147 gcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  3680654 gcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgtttaggagaataggaaatctcttgc 3680593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Original strand, 18027211 - 18027331
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||   ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || ||||||    
T  18027211 ttgtattatgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa-accaaacttatttctgtgtaatt-tgtttg--tttagaagtctcttgcttttgtgcttg 18027306  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||||   ||| ||||||| ||||||    
T  18027307 agcatatgaaatctcttgcttgtgt 18027331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27384245 - 27384087
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  27384245 ttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaactcaattgtctgtacttttgtttga--ttagaagtctcttgc-ttagtgcttg 27384150  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  27384149 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagca 27384087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 15395333 - 15395399
Alignment:
Q  278 agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15395333 agtgaactctccttggaagtgcaagagggacaggact-acttccggattgtggaaggaacttgtataa 15395399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27474658 - 27474619
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27474658 ttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 27474619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16333137 - 16333103
Alignment:
Q  321 cggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16333137 cggtttgtggaaggaacttgtataaattgcttgtg 16333103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19490512 - 19490410
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||| ||| | ||| ||  ||||||  |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||    
T  19490512 tagaagtctcttggagttgtccttgagcagtggaagtctattgttagtgatcttgagcatgagaagtctcttgcaagagtgcttgagcatttggaagtct 19490413  T
Q  235 ctt 237  Q
    |||    
T  19490412 ctt 19490410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 176
Target Start/End: Original strand, 22077002 - 22077043
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctctt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  22077002 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctt 22077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10631653 - 10631613
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  10631653 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttg 10631613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Original strand, 21689401 - 21689441
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21689401 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaaataaaagtctctt 21689441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 24480948 - 24481008
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaatt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  24480948 ttgtattgtgaacaccaatgattgtagatctagtgttcaa--tcaaac-tttttctttgtaatt 24481008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 166)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 22786072 - 22786380
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22786072 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 22786171  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22786172 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttacagttgtgcttgagcaatttg 22786271  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22786272 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtaaactctccttggaagtacaagggggacaggactgacttccggtttgt 22786371  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  22786372 ggaaggaac 22786380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 22782032 - 22782358
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782032 aattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 22782131  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22782132 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctgttgcagttatgcttgagcaatttg 22782231  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22782232 aagtctcttactaagttttgtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 22782331  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  22782332 ggatggaacctgtataaattgcatgtg 22782358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44840116 - 44839790
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44840116 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 44840017  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44840016 tgaattaagaagtttcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgaacaatttg 44839917  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44839916 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaattctccttggaagtgtaagggggacaggactgacttccggtttgt 44839817  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  44839816 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 44839790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 32 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40331789 - 40331467
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40331789 tctagagtctttagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttga 40331690  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331689 attaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 40331590  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||     
T  40331589 tctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtggg 40331491  T
Q  332 aggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||| || ||||||||||||||    
T  40331490 aggaacctgtataaattgcttgtg 40331467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 28551336 - 28551662
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28551336 aattctagagtctttagagtttgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaaaattatctttgtaattctgtt 28551435  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28551436 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 28551535  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  28551536 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgcaatcagatattacatagcgaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttgcggtttgt 28551635  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28551636 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 28551662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 45087413 - 45087725
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45087413 tagagtctatatctgatttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtc 45087512  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45087513 tattgcatttgtgcttaagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgctgttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 45087612  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  45087613 gtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacgtagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgtcttccggtttgtggaagaaacctgta 45087712  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||    
T  45087713 taaattgcttgtg 45087725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 34322353 - 34322675
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  34322353 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacagcaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttgtt-gtaattctgtt 34322451  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  34322452 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatag--gtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaaca-tttg 34322548  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34322549 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgt 34322648  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  34322649 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 34322675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22317274 - 22316959
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22317274 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 22317176  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22317175 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatctg 22317076  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||| ||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22317075 aagtcacttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagattttacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgt 22316976  T
Q  329 ggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||| ||||    
T  22316975 ggaaggaacttgtataa 22316959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 30557738 - 30558060
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30557738 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtggacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 30557836  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557837 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 30557936  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30557937 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaactgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtt 30558036  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  30558037 tgtggaaggaacctgtataaattg 30558060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 22188520 - 22188824
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22188520 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttgctttataattatgtt 22188619  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188620 tgaatttgtaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagcagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 22188719  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| |||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22188720 aagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaaaactgatttccggtttgt 22188819  T
Q  329 ggaag 333  Q
    |||||    
T  22188820 ggaag 22188824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 37 - 355
Target Start/End: Original strand, 1587458 - 1587775
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  1587458 agtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacacccttgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctatttaaattaa 1587556  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1587557 gaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-gatttgaagtctct 1587655  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaa-gggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1587656 tactaagtttagtagtgaacaattgtaatcagatattacatagtgaactctcctttgaagtgcaaggggggacaggactgacttccggtttgtggaagga 1587755  T
Q  336 acttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  1587756 acttgtataaattgcttgtg 1587775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13964396 - 13964699
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13964396 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13964495  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13964496 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttaagc-atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgcgcttgagc-atttg 13964593  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||| |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13964594 aagtctcttagt---tttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatggtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 13964690  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  13964691 ggaaggaac 13964699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16494974 - 16494704
Alignment:
Q  85 atatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16494974 atatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctgttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 16494875  T
Q  185 tcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaac 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16494874 tcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttactaagtttagtagtgagcatttgcaatcagatattacacagtgaac 16494775  T
Q  285 tcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  16494774 tccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgaaaggaacctgtataaattgcttgtg 16494704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33073909 - 33073621
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33073909 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttaaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 33073811  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  33073810 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagc-attta 33073712  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgactt 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33073711 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctaattggaagtgcaagggggacaagactgactt 33073621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 20152418 - 20152742
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20152418 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttctt-gtaattctgtt 20152516  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20152517 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttaattgtgttcaggagcatagtaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttg 20152616  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaat--gagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    |||||||||||||  ||||| | |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  20152617 aagtctcttactagttttagcagtgagagtaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggagacatgactaacttccggttt 20152716  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| | || |||||||||||    
T  20152717 gtggaaggagcctgtataaattgctt 20152742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24575719 - 24575409
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24575719 aattctagattcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 24575620  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24575619 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 24575521  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||    
T  24575520 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaaggggagaggactggcttccggtt 24575421  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  24575420 tgtggaaggaac 24575409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22802139 - 22801828
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| || ||||||||||||| |  |||     
T  22802139 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttatagttctgtttgaattcattagta 22802041  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    ||||||| ||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802040 tcttgcatttgcacttgaggaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 22801941  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  22801940 gtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaacactccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttgtggaaggaacctgta 22801841  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    ||||||| |||||    
T  22801840 taaattgattgtg 22801828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 28701630 - 28701949
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |    
T  28701630 aattctaaggtctttagagtctgtatctaatttatattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctttctaattctgat 28701729  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28701730 tgaattaagaattctcttgtaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgttcttgag-aatttg 28701828  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28701829 aagtttcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 28701928  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  28701929 ggaaggaacctgtataaattg 28701949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 28712116 - 28712423
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28712116 aattctagtgtctttaatgtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 28712215  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28712216 tgaattaaaaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-atttg 28712314  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  28712315 aagtctcgtactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgaatgacttccggtttat 28712414  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  28712415 ggaaggaac 28712423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23234690 - 23234384
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23234690 aattctagagacttaagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacttttttctttgtaattctgtt 23234591  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23234590 tgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgcagttgtgcttaagc-atttg 23234493  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23234492 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgt 23234393  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
     ||||||||    
T  23234392 agaaggaac 23234384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24376789 - 24376481
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24376789 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 24376690  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24376689 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 24376593  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | || |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  24376592 aagtctcttgctaagtttagaagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttagaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 24376494  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  24376493 ttgtggaaggaac 24376481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38781079 - 38780772
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38781079 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacctttttctttgtaattctgtt 38780980  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38780979 tgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 38780881  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| || |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  38780880 aagtctgttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttcgaaatgcaaggggaatatgactgacttccggtttgt 38780781  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  38780780 ggaaggaac 38780772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19540100 - 19539791
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  19540100 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtt 19540001  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19540000 tgaattt-gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 19539902  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||| | ||||||||    
T  19539901 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagttcaagcgggacaggact-atttccggtt 19539803  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  19539802 tgtggaaggaac 19539791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 20569166 - 20569476
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20569166 aattctagagtcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttctttgtaattttgtt 20569265  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20569266 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcctgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 20569364  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20569365 aagtctcttgctagttttagcagtgaccagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgctagggggacaagactgacttccggtt 20569464  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  20569465 tgtggaaggaac 20569476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 31328380 - 31328703
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31328380 aattctagactctttagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-taatctttgtaattctgtt 31328478  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31328479 ttaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgattgagc-atttg 31328577  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatta--catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    ||||||||| |  |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  31328578 aagtctcgtactaagtttagtattgaacaattgtaatcagatattatttttagtgaacttctcttggaagtgcaagggggataggactgacttcccgttt 31328677  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  31328678 gtggaaggaacctgtataaattgctt 31328703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 31335101 - 31335424
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31335101 aattctagactctttagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-taatctttgtaattctgtt 31335199  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31335200 ttaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgattgagc-atttg 31335298  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatta--catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    ||||||||| |  |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  31335299 aagtctcgtactaagtttagtattgaacaattgtaatcagatattatttttagtgaacttctcttggaagtgcaagggggataggactgacttcccgttt 31335398  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  31335399 gtggaaggaacctgtataaattgctt 31335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22257885 - 22257576
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22257885 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaacaattttctttgacattctgtt 22257786  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22257785 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagatgtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgggcttgagc-atttg 22257687  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  22257686 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccgatt 22257588  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  22257587 tgtggaaggaac 22257576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 31801305 - 31801610
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31801305 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 31801403  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31801404 tgaattcataagtctcttcaaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgactgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 31801502  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  31801503 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgaatgacttccggtt 31801602  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  31801603 tgtggaag 31801610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14581241 - 14580958
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581241 aattctagagtctttagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 14581142  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  14581141 tgaattcagaagtcttttgcatttgtacatgagcaatagaagtctcttgattgtattcaggagcataggaagtatcttgcagttgtggttgaacaatttg 14581042  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgactt 319  Q
    ||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  14581041 aagtct-------agtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttataagtgcaagggggacagaactgactt 14580958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 112 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40331387 - 40331144
Alignment:
Q  112 ttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagt 211  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40331387 ttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcatgagcataggaagtctcttgcagt 40331288  T
Q  212 tgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||      
T  40331287 tgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggggcatg 40331188  T
Q  312 actgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  40331187 actgacttccggtttgtggaaggaatctgtataaattgcttgtg 40331144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25189082 - 25188773
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25189082 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 25188983  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  25188982 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttaattgtgttcaggagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttg 25188885  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25188884 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtaaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 25188785  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  25188784 tgtggaaggaac 25188773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 39038058 - 39038367
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39038058 aattctagagtcttatgagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattatgtt 39038157  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39038158 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataacaagtctattgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 39038255  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  || || |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  39038256 aagtctcttgctagtttaagcaatgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagcgggacaggactgacttccggtt 39038355  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  39038356 tgtggaaggaac 39038367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 10010167 - 10010477
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  10010167 aattctagagtcgtaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctgtgtaattctgtt 10010266  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  10010267 tgaatttagaaatctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-atttg 10010365  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | || ||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  10010366 aagtctcttgctagttttagcagtgggcagttgtaatcaaatattacatttttagtgaactctccttgaaagtgtaagggggacaggact-acttccggt 10010464  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  10010465 ttgtggaaggaac 10010477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40782145 - 40781851
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  40782145 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacactagtgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattctgtttgaattcataagtct 40782046  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||      
T  40782045 cttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attggaagtctcttgctagt 40781947  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40781946 tttaggagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactcttattggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 40781851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24779058 - 24778752
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24779058 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacctcaaacaattttctatgtaattctgtt 24778959  T
Q  129 tgaattt-agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||    
T  24778958 tgaattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcatgattgtgttcaggagcataggaaatctattgcagctgtgcttgagtaattt 24778859  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||| || | ||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  24778858 gaagtctcttgctaaatttagcagtgaacagtcgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaagact-atttccagt 24778760  T
Q  325 ttgtggaa 332  Q
    ||||||||    
T  24778759 ttgtggaa 24778752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 28141018 - 28141327
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28141018 aattctagagtattaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 28141117  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  28141118 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttggttgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag-tatttg 28141215  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  28141216 aagtctcttgctagttttagcagtgagtagttgtgatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 28141314  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  28141315 ttgtggaaggaac 28141327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Original strand, 35744399 - 35744698
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  35744399 tctagagt-tttagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcgacctcaaacatttttctt-gtaattctctttga 35744496  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  35744497 attgagaagtctctttcagttgtgcttaaacaatagaagtctcttgattgtgtttatgagcatagaaagtctttggcagttgtgtttgagca-tttgaag 35744595  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  35744596 tctcttactaagtttagtatcgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacatgactgatttccggtttgtgga 35744695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 23184719 - 23185023
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  23184719 aattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttcttttgaattctttt 23184818  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23184819 tgaat--agaagtctcttgcagttgtccttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 23184916  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  || || | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23184917 aagtctcttgctagtttgagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 23185015  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  23185016 tgtggaag 23185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Original strand, 23595982 - 23596286
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||    
T  23595982 aattctagagtcttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttcttttgaattctttt 23596081  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23596082 tgaat--agaagtctcttgcagttgtccttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 23596179  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  || || | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23596180 aagtctcttgctagtttgagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 23596278  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  23596279 tgtggaag 23596286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18702424 - 18702115
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18702424 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtt 18702325  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18702324 tgaa--tagaagtctcttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 18702227  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  18702226 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-actttcggt 18702128  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  18702127 ttgtggaaggaac 18702115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 24851082 - 24851388
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24851082 aattctagagtcttaag--tctgtatcttatttgtattgtgaacaccattgagtatatatcaagtgttcaacctcaaacaattttccttgtaattctgtt 24851179  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  24851180 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttatgcttgagtagtttg 24851277  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||    
T  24851278 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccgatt 24851376  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  24851377 tgtggaaggaac 24851388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 337
Target Start/End: Original strand, 25037686 - 25037987
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25037686 agtcttaagagtatgtatctgatttgaattgtgaacaccactgattgtatatca-gtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttg 25037784  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25037785 gaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtcacttgattatgttcaagagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagc-acttgaagtctct 25037883  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    | ||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  25037884 tgcttgttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggtgacatgactgatttccggtttgtggaag 25037983  T
Q  334 gaac 337  Q
    ||||    
T  25037984 gaac 25037987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 17963684 - 17963980
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17963684 aattttagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat-aagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtt 17963782  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17963783 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtcttttgattgtgttcaagagcacaggaaatctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 17963881  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17963882 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcaaatattacattttagtgaactttccttaaaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 17963980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 18431354 - 18431663
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18431354 aattctagagtcttaaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgt 18431453  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||| | |||    
T  18431454 ttgaa--tagaagtctgttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttaagcatagaaaatctcttgcagttgtacttgagtagttt 18431551  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||  ||||  | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  18431552 gaagtctcttgctagttttaacagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctcattggaagtgcaacggggacaagact-acttccggt 18431650  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  18431651 ttgtggaaggaac 18431663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22271815 - 22271505
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||    
T  22271815 aattctagagtgttaagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatatgtaattctgtt 22271716  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22271715 tgaa--tataagtctcttgcagttatgcttgggcataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 22271618  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22271617 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaataagatattacactttttagtgaactctcctttgaagtccaagggggacaggact-acttccgg 22271519  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  22271518 tttgtggaaggaac 22271505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24843888 - 24843580
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24843888 aattctagactcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgt 24843789  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  24843788 ttgaa--tagaagtctcttgccgttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgattagttt 24843691  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||| |||  || || | |||||||||||||||| |||||     |||||||||| | |||||||||||||| |||    ||| ||||||||||    
T  24843690 gaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtaatcaaatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggtggagtggact-acttccggtt 24843592  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  24843591 tgtggaaggaac 24843580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6392317 - 6392139
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6392317 aattctagagtctaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatttagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 6392219  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6392218 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtttcttgc 6392139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 22776654 - 22776802
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22776654 aattctagagtctttagagtttgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 22776753  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22776754 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 22776802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Original strand, 26619517 - 26619707
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  26619517 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 26619616  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgag 221  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26619617 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgag 26619707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Original strand, 21537668 - 21537835
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21537668 aattatagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 21537767  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaa 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21537768 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-ataaaagtctcttgattgtgttcaggagaataggaa 21537835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 352
Target Start/End: Original strand, 6574651 - 6574837
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||    
T  6574651 agaagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtcttttgcagttgtgctttagcaatttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaat 6574750  T
Q  266 cagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  6574751 cagatattaaatagtaaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaatggctt 6574837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1083668 - 1083370
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  1083668 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 1083571  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   |||||||||||  || || |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  1083570 agcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 1083471  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttg 353  Q
    |||||| || |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  1083470 tgtaataagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacatgtat-aattgcttg 1083372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 23393114 - 23393393
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||    
T  23393114 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttactttagtgcttg 23393211  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  23393212 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 23393311  T
Q  260 tgtaatcagat---att-acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   ||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23393312 tgtaatcagttgtgattaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 23393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Original strand, 22455507 - 22455685
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc-agttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||    
T  22455507 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcaagttgtgcttgggtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttg 22455606  T
Q  262 taatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22455607 taatcagatattacattttagtgaactctccttggaattgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaac 22455685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Original strand, 41122235 - 41122411
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||  | |||||| ||||    
T  41122235 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcaattgt 41122334  T
Q  263 aatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaa 336  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  41122335 aatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtgaaaggaa 41122411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 10898940 - 10899138
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||    
T  10898940 aattttagagttttaagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttataattttgt 10899037  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  10899038 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttg-------gaagtctcttgattttgttcttgaacataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 10899128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 22455405 - 22455521
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22455405 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaagaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 22455504  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  22455505 tgaa--tagaagtctcttg 22455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Original strand, 6574545 - 6574662
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6574545 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacacttttc-ttgtaattctgtt 6574643  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  6574644 tgaattaagaagtctcttg 6574662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 24814961 - 24815167
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  24814961 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 24815058  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  24815059 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 24815158  T
Q  260 tgtaatcag 268  Q
    |||||||||    
T  24815159 tgtaatcag 24815167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 345
Target Start/End: Original strand, 26366957 - 26367141
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | ||| || ||||    
T  26366957 aatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgaacagttgt 26367056  T
Q  263 aatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  26367057 aataagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-actttcgatttgtggaaggaacttgtataa 26367141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19114767 - 19114593
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  19114767 aattctagagtcttaagagtctgtatcttatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagcgttcaacctcaaccatatttctttataattctgtt 19114668  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctct 205  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||    
T  19114667 tgaa--tagaagtctctttcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttgaggataggaagtctct 19114593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 24801994 - 24802200
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  24801994 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 24802091  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  24802092 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcatgagcattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 24802191  T
Q  260 tgtaatcag 268  Q
    |||||||||    
T  24802192 tgtaatcag 24802200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25828707 - 25828537
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||| | |||||| ||||||||    
T  25828707 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaagtctattgctagttttagcagtgagcagttgtaatc 25828609  T
Q  267 agatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25828608 agatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggg-caggact-acttccggtttgtggaaggaac 25828537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44880851 - 44880730
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  44880851 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtt 44880752  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagtt 152  Q
    ||||  ||||||||||||||||||    
T  44880751 tgaa--tagaagtctcttgcagtt 44880730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Original strand, 20647003 - 20647183
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||    
T  20647003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttactttagtgcttg 20647100  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt-gaagtctcttacta 241  Q
    ||||   ||||||||||||||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20647101 agcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttggaagtctcatacta 20647183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 26366855 - 26366959
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26366855 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctttataattctgtt 26366954  T
Q  129 tgaat 133  Q
    |||||    
T  26366955 tgaat 26366959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20567783 - 20567636
Alignment:
Q  87 atcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttc 186  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |    
T  20567783 atcaagtgttcaacctcaaaca-ttttctttgtaattttgtttgaat--agaagtctcttgtagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattttgtcc 20567687  T
Q  187 aggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
      |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20567686 ttgagcatgggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgatgtctctt 20567636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 147
Target Start/End: Original strand, 41122141 - 41122249
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41122141 agtcttaagagtatgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaa--ta 41122238  T
Q  137 gaagtctcttg 147  Q
    |||||||||||    
T  41122239 gaagtctcttg 41122249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19356155 - 19356010
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  19356155 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 19356059  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    |||| | ||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||    
T  19356058 agcattggaagtctcttgctttagtgcctgagcattggaagtctcttgc 19356010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25828800 - 25828697
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25828800 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatagcaaatgttcaacctccaacatctttctgtgtaattctgtttgaatttggaagtct 25828701  T
Q  144 cttg 147  Q
    ||||    
T  25828700 cttg 25828697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 19300404 - 19300519
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  19300404 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 19300501  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  19300502 agcataggaagtctcttg 19300519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 21911303 - 21911433
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||  |    
T  21911303 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgggtatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgcttt 21911400  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    | ||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  21911401 tgtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgt 21911433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 19498384 - 19498499
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  19498384 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 19498481  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  19498482 agcataggaagtctcttg 19498499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 19313411 - 19313497
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  19313411 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgc 19313497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22383165 - 22382958
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-cttcaaacaattttctttgtaattctg 126  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||    
T  22383165 aattatagagtcttaagagtctattt-tgatttgtatttgtgaacaacactgatagtatatcaagtgttcaaccctcaaacaaatttttgtgtaattctg 22383067  T
Q  127 tttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt 226  Q
    |||||  |||||||||||||||  || ||||||||||   |||||||||||  | ||| |  |||||||||||   ||||||  ||||||||||| | ||    
T  22383066 tttga--ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacgtcttgcttttgtgcttgagtagtt 22382969  T
Q  227 tgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||    
T  22382968 tgaagtctctt 22382958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22763490 - 22763288
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||     ||||||    
T  22763490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttggaagtctcttgcttgcgtgcttg 22763394  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| |||||||    
T  22763393 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgagcat 22763295  T
Q  259 ttgtaat 265  Q
    |||||||    
T  22763294 ttgtaat 22763288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22755125 - 22755010
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  22755125 ttgtattgtgaacaccgctgattttatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 22755028  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  22755027 agcaaaggaagtctcttg 22755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6392150 - 6392035
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  6392150 gaagtttcttgctaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggt 6392051  T
Q  325 ttgtggaaggaacttg 340  Q
    ||||||||||||||||    
T  6392050 ttgtggaaggaacttg 6392035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21845824 - 21845709
Alignment:
Q  46 agtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctc 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||     
T  21845824 agtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg--tttagaagtctt 21845728  T
Q  145 ttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||  || ||||||||||    
T  21845727 ttgcttttgtgcttgagca 21845709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25918397 - 25918266
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   |||| ||||||| ||||    
T  25918397 aattctagagtcttaagagtgtgtatttgatttttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-accaaacatccttctatgtaattttgtt 25918299  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |  |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25918298 t--atttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 25918266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1089019 - 1088946
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1089019 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaat 1088946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22774194 - 22773991
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||  | || ||||||||||||     ||||||    
T  22774194 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgttt--aattggaagtctcttgcctgcgtgcttg 22774098  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| ||||||||||| |   |||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| |||||||    
T  22774097 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctttcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgagcat 22773999  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  22773998 ttgtaatc 22773991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 24441133 - 24441212
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24441133 aattctagagtcttaagagtctacatctgatttgtgttatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaaca 24441212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 38033228 - 38033336
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagc 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||  |  |||||||||    
T  38033228 tattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctatttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttgagc 38033325  T
Q  163 aatagaagtct 173  Q
    ||  |||||||    
T  38033326 aaaggaagtct 38033336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 39170487 - 39170601
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  39170487 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39170583  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39170584 agcattagaagtctcttg 39170601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 967896 - 968099
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| ||     ||||||    
T  967896 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttagaagcctctcgcctgcgtgcttg 967992  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  967993 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaag-agagtattgagcat 968091  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  968092 ttgtaatc 968099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 17970662 - 17970936
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||| ||     ||||||    
T  17970662 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttagaagcctctcgcctgcgtgcttg 17970758  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  ||||| || |||||   |||||| |||||||    
T  17970759 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtttcatacta--gttagtattgagcat 17970856  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||   |  ||||  |||| ||| || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17970857 ttgtaatctgtgtgatta-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 17970936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 24338796 - 24338959
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24338796 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24338892  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  24338893 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattt 24338959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24157499 - 24157432
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24157499 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgtt 24157432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27296954 - 27296842
Alignment:
Q  201 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||    |||||||||| | |||||||    
T  27296954 tctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatgagatattgcatttttagtgaactctccttggaag 27296855  T
Q  297 tgcaagggggaca 309  Q
    |||||||||||||    
T  27296854 tgcaagggggaca 27296842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 1099587 - 1099701
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  1099587 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 1099683  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  1099684 agcattagaagtctcttg 1099701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4220317 - 4220203
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4220317 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4220221  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4220220 agcattagaagtctcttg 4220203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 7006199 - 7006313
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  7006199 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 7006295  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  7006296 agcattagaagtctcttg 7006313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9763160 - 9763274
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9763160 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9763256  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9763257 agcattagaagtctcttg 9763274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9773696 - 9773810
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9773696 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9773792  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9773793 agcattagaagtctcttg 9773810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10266830 - 10266716
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  10266830 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10266734  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10266733 agcattagaagtctcttg 10266716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10277407 - 10277293
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  10277407 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10277311  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10277310 agcattagaagtctcttg 10277293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 11389201 - 11389315
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  11389201 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 11389297  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11389298 agcattagaagtctcttg 11389315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 11395564 - 11395678
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  11395564 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 11395660  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11395661 agcattagaagtctcttg 11395678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 11405880 - 11405994
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  11405880 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 11405976  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11405977 agcattagaagtctcttg 11405994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 18393029 - 18393143
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  18393029 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 18393125  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18393126 agcattagaagtctcttg 18393143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22915256 - 22915370
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22915256 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22915352  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22915353 agcattagaagtctcttg 22915370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22960724 - 22960838
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  22960724 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 22960820  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22960821 agcattagaagtctcttg 22960838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24274861 - 24274779
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  24274861 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-atattctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctct 24274779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24328126 - 24328240
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24328126 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24328222  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24328223 agcattagaagtctcttg 24328240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32217710 - 32217596
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32217710 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32217614  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32217613 agcattagaagtctcttg 32217596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 34790609 - 34790723
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  34790609 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 34790705  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34790706 agcattagaagtctcttg 34790723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 34804752 - 34804866
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  34804752 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 34804848  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34804849 agcattagaagtctcttg 34804866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35263427 - 35263313
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35263427 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35263331  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35263330 agcattagaagtctcttg 35263313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35274052 - 35273938
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35274052 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35273956  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35273955 agcattagaagtctcttg 35273938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Original strand, 27978774 - 27978845
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  27978774 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 27978845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Original strand, 28065303 - 28065374
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  28065303 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 28065374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35252818 - 35252704
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaa-acaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||    
T  35252818 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaactcaa--ttctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 35252723  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  35252722 gagcattagaagtctcttg 35252704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 337
Target Start/End: Original strand, 21537835 - 21537911
Alignment:
Q  263 aatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21537835 aatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtttgtggaaggaac 21537911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4099650 - 4099536
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4099650 ttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4099554  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4099553 agcattagaagtctcttg 4099536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4209725 - 4209611
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4209725 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4209629  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4209628 agcattagaagtctcttg 4209611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9897966 - 9898080
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9897966 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaactt-aaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9898062  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9898063 agcattagaagtctcttg 9898080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 17857829 - 17857943
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  17857829 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 17857925  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17857926 agcattagaagtctcttg 17857943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24838624 - 24838480
Alignment:
Q  194 taggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccatt 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  || || | ||| |  |||||||||||||||     |||||||||| | ||    
T  24838624 taggaaatctcttgcagttgtgcttgagtattttgaagtctcttcctattttgagcagtgaactgttgtaatcagatattgattttagtgaactctcctt 24838525  T
Q  292 ggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  24838524 ggaagtgcaagggggac-ataacaacttccgatttgtggaaggaac 24838480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27221217 - 27221103
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| | || || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  27221217 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctatatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 27221121  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27221120 agcattagaagtctcttg 27221103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29254637 - 29254523
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  29254637 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 29254541  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29254540 agcattagaagtctcttg 29254523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 30489216 - 30489330
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||  ||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  30489216 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctcagtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 30489312  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30489313 agcattagaagtctcttg 30489330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34477765 - 34477651
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  34477765 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 34477669  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  34477668 agcattagaagtctcttg 34477651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43345244 - 43345130
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  43345244 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctagcctgcgtgcttg 43345148  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  43345147 agcattagaagtctcttg 43345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43354859 - 43354745
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  43354859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctagcctgcgtgcttg 43354763  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  43354762 agcattagaagtctcttg 43354745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 22525274 - 22525315
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525274 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 22525315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29244058 - 29244017
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244058 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 29244017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Original strand, 31968460 - 31968525
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31968460 ttggaagtgcaatggggacaggaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 31968525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Original strand, 15671057 - 15671097
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15671057 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15671097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 17969602 - 17969650
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17969602 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaaca 17969650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1041985 - 1041946
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1041985 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1041946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2561324 - 2561285
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561324 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2561285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 14794303 - 14794346
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14794303 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 14794346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16768779 - 16768740
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768779 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16768740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18769297 - 18769336
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769297 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18769336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 21650923 - 21650962
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650923 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21650962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 24415413 - 24415452
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415413 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24415452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 24427978 - 24428017
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24427978 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24428017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 38586484 - 38586550
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  38586484 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 38586550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40222169 - 40222054
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtat-atcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     |||||    
T  40222169 ttgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 40222073  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  40222072 gagcattagaagtctcttg 40222054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43082490 - 43082451
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43082451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43093099 - 43093060
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093099 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43093060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9908554 - 9908668
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||      ||||||    
T  9908554 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgtctgcgtgcttg 9908650  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9908651 agcattagaagtctcttg 9908668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14866913 - 14866833
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat-tctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||    
T  14866913 ttgtgaacacctctaattgtatatcaagtgttcaa-tccaaacaattttctttgtaatctttgtttg---ttagaagtctcttgc 14866833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36252236 - 36252350
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||| |||||||     ||||||    
T  36252236 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagcctcttgcctgcgtgcttg 36252332  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36252333 agcattagaagtctcttg 36252350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 36785191 - 36785305
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  36785191 ttgtattgtgaacaccactgttagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 36785287  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  36785288 agcattagaagactcttg 36785305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44880731 - 44880654
Alignment:
Q  259 ttgtaatcagatattacat----agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||    
T  44880731 ttgtaatcagatattacatttttagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgact-acttctggtttgtggaag 44880654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 9015786 - 9015842
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgta 85  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9015786 aattctagaatcttaagagtctgtatttgatttctattgtgaacaccactgattgta 9015842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 28732297 - 28732333
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732297 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28732333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 21172858 - 21172897
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172858 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21172897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 337
Target Start/End: Original strand, 26623064 - 26623179
Alignment:
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttc 320  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  26623064 tttggagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattgcatttttaatgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttc 26623162  T
Q  321 cggtttgtggaaggaac 337  Q
    | |||||||||| ||||    
T  26623163 cagtttgtggaaagaac 26623179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26866908 - 26866869
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866908 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 26866869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26879497 - 26879458
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879497 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 26879458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27939639 - 27939600
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27939639 tttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttca 27939600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40251030 - 40250915
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtat-atcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||| |||||     |||||    
T  40251030 ttgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtcgcttgcctgcgtgctt 40250934  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  40250933 gagcattagaagtctcttg 40250915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33240332 - 33240295
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33240332 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaac 33240295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33248253 - 33248216
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33248253 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaac 33248216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 40202837 - 40202878
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40202837 tttgtattatgaacactactgattgtatatcaagtgttcaac 40202878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 28721711 - 28721747
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28721711 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 28721747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Original strand, 19320844 - 19320887
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19320844 tgatttgtattatgaacatcattgattgtatatcaagtgttcaa 19320887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Original strand, 27746267 - 27746322
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat 122  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27746267 ttgtgatcacctctgattgtatatcaaatgttcaac--caaacaatattctttgtaat 27746322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22683047 - 22683010
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22683047 tttgtattctgaacaccacttattgtatatcaagtgtt 22683010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38631153 - 38631120
Alignment:
Q  312 actgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38631153 actgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 38631120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6392210 - 6392182
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6392210 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 6392182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Original strand, 22776762 - 22776790
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22776762 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 22776790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Original strand, 26619623 - 26619662
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26619623 gaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atatgaagtctctt 26619662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 269)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40850664 - 40850338
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40850664 aattctaaagtctttagagtttttatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 40850565  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40850564 tgaattaagaagtctcttgcagttgtacttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 40850465  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40850464 aactctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 40850365  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  40850364 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 40850338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 9700508 - 9700835
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9700508 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgt 9700607  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700608 ttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 9700707  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||    
T  9700708 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagagggacaggactgacttccggcttg 9700807  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  9700808 tggaaggaacctgtataaattgcttgtg 9700835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21640554 - 21640228
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21640554 aattctagagtctatagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatattctttgtaattctgtt 21640455  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21640454 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 21640355  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  |||||    
T  21640354 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacataatgaactctccttggacgtgcaagcgggacaggactgacttccaatttgt 21640255  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  21640254 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 21640228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 42 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2025762 - 2025450
Alignment:
Q  42 ttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagt 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2025762 ttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagt 2025663  T
Q  142 ctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttacta 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2025662 ctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagc-atttgaagtctcttacta 2025564  T
Q  242 agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttga 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  2025563 agtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgaaaggaacctgt 2025464  T
Q  342 ataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||| |||||    
T  2025463 ataaattgtttgtg 2025450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Original strand, 30054652 - 30054973
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30054652 aattctagagtctttagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtt 30054751  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30054752 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttaattgtgttcaggagcatagaaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttg 30054851  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30054852 aagtctcttactaagtttagt-gtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 30054950  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgct 351  Q
    ||||||||| ||  |||||||||    
T  30054951 ggaaggaacctgtgtaaattgct 30054973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 1728487 - 1728807
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1728487 aattctatagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtt 1728586  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1728587 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaagttg 1728686  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1728687 aagtctcttgctagttttagcagtgaacaattgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 1728786  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  1728787 ggaaggaacctgtataaattg 1728807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50299921 - 50299599
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50299921 aattctaaagtctttagagtctatatttgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 50299822  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50299821 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcctaggaagtctctcgcagttgtgcttgagcaatttg 50299722  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  50299721 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatatt-tatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 50299623  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| |  |||||||||||    
T  50299622 ggaaggaacctatataaattgctt 50299599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40799584 - 40799262
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40799584 aattctagagtcttaagagtctgtttctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 40799486  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40799485 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 40799386  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40799385 aagtctcttgctagttttagaagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 40799286  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
     |||||||| || |||||||||||    
T  40799285 agaaggaacctgtataaattgctt 40799262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33582918 - 33582593
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33582918 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 33582820  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33582819 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 33582720  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||| |||||| |    
T  33582719 aagtctcttactatgtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggagacgggactgactttcggttttt 33582620  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  33582619 ggaaggaacctgtataaattgtttgtg 33582593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2784753 - 2784472
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-cttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2784753 aattctagtgtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 2784654  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2784653 ttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgctgttgtgtttgagcaattt 2784554  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2784553 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaattagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggaca 2784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29855096 - 29854770
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  29855096 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctgaaacgtttttctttgtaattctgtt 29854997  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagc----ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29854996 ttaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaataggagtctcttgattgtgttcaggagcatatataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-a 29854898  T
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29854897 tttgaagtctcttactaagtttagtagttagcaattgtaatcagatattacaaagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggt 29854798  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29854797 ttgtggaaggaacctgtataaattgctt 29854770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 20627905 - 20628224
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20627905 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 20628003  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20628004 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaattctcttgattgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 20628103  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20628104 aagtctcttgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattacaaagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgt 20628203  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||||| || ||||||||    
T  20628204 ggaaggaacctgtataaattg 20628224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28581792 - 28581485
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  28581792 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattatgtt 28581694  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28581693 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagcagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 28581594  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| |||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28581593 aagtttcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 28581494  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  28581493 ggaaggaac 28581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31303034 - 31302728
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31303034 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 31302935  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31302934 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 31302837  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31302836 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcaggtattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgt 31302737  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  31302736 ggaaggaac 31302728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5213265 - 5212940
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5213265 aattctagagtctttagattctgtatctgatttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 5213167  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5213166 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagaagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttg 5213068  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaat-actgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   |  ||| |||| |||||||    
T  5213067 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggggggaggactaactttcggtttg 5212968  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||    
T  5212967 tggaaggaatctgtataaattgcttgtg 5212940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47207391 - 47207069
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47207391 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctt-gtaattctgtt 47207293  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47207292 tgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgttcagaagcatatgaagtatcttgcagttgtgcttgagcaatttg 47207193  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47207192 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 47207093  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  47207092 ggaaggaacctgtataaattgctt 47207069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14955116 - 14954791
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14955116 aattctagagtctttagagtatgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtt 14955018  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  14955017 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaggtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcaattgtgtttgatcaatttg 14954918  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |    
T  14954917 aagtctcttactaagtttggtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacatgactgacttccgctttat 14954818  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||    
T  14954817 gaaaggaacctgtataaattgcttgtg 14954791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 38178116 - 38178422
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38178116 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 38178214  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38178215 tgaagtaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 38178313  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38178314 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 38178413  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||| ||||    
T  38178414 ggaatgaac 38178422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 71 - 355
Target Start/End: Original strand, 49669003 - 49669286
Alignment:
Q  71 acaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaag 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  49669003 acaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaag 49669102  T
Q  171 tctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  49669103 tctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttaac-atttgaagtctcttactaagtttagtagttagcatttgtaatgagat 49669201  T
Q  271 attacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  49669202 attacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaatctgtataaattgtttgtg 49669286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 53057201 - 53057523
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  53057201 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtt 53057300  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53057301 tgaattaagaagtctcttgcaattgtgcctgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagtatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 53057399  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  53057400 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattatatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttcgt 53057499  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  53057500 ggaaggaacctgtataaattgctt 53057523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 99 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2783096 - 2782840
Alignment:
Q  99 acttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2783096 acttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatga 2782997  T
Q  199 agtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtg 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  2782996 agtctcttgctgttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcttcttggaagtg 2782897  T
Q  299 caagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2782896 caagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 2782840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3238378 - 3238071
Alignment:
Q  31 ttctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3238378 ttctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgtttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgttt 3238280  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttga 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  3238279 gaattgagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtcgcttgcagttgcgcttgag-aatttga 3238181  T
Q  230 agtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  3238180 agtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggttt 3238082  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||    
T  3238081 gtggaaggaac 3238071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13823753 - 13823446
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13823753 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacatattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 13823654  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  13823653 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgaac-atttg 13823555  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||  |   ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13823554 aagtctcttgatggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 13823455  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  13823454 ggaaggaac 13823446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 47405894 - 47406216
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  47405894 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaatatttttctttgtaattctgtt 47405993  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47405994 tgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtattcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 47406093  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |    
T  47406094 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaattctcctttgaagtgcaa-ggggacatgactgacttccggtttat 47406192  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  47406193 ggaaggaacctgtataaattgctt 47406216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 17239393 - 17239702
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17239393 aattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 17239492  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17239493 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 17239592  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||   |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17239593 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagat-ttacattttagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 17239690  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  17239691 tgtggaaggaac 17239702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11223251 - 11222930
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11223251 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 11223152  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11223151 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 11223053  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtg--aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11223052 aagtctcttgctagttttagcggtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttt 11222953  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    | |||| |||| || ||||||||    
T  11222952 gaggaaagaacctgtataaattg 11222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 13781056 - 13781366
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13781056 aattcgagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatt 13781155  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13781156 tgaatttggaagtctcttgtagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 13781254  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13781255 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatatttcattttagtgaactctccttggatgtgcaagggggacagaactgacttccggtt 13781354  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  13781355 tgtggaaggaac 13781366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 46350317 - 46350626
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46350317 aattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtattcaacatcaaacatttttctttgtaattttgtt 46350416  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46350417 tgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 46350516  T
Q  229 aagtctcttacta-agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||   ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46350517 aagtctcttgctagtttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtataagggggacaagactgacttctggtttg 46350616  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  46350617 tggaaggaac 46350626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 49643232 - 49643541
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49643232 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 49643331  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49643332 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 49643430  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49643431 aagtctcttgctagttttagcagtgaccagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtt 49643530  T
Q  326 tgtggaaggaa 336  Q
    | |||||||||    
T  49643531 tatggaaggaa 49643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2560874 - 2560565
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2560874 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 2560776  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  2560775 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctattacagttgtgtttgagc-atttg 2560677  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||| ||  ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  2560676 aagtctgttgataagtttagcagtaagcaattgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 2560578  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  2560577 ttgtggaaggaac 2560565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20645842 - 20645537
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20645842 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttctttgtaattctgtt 20645743  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20645742 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 20645644  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| |   | |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20645643 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattaaattttggtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtt 20645545  T
Q  326 tgtggaag 333  Q
    ||||||||    
T  20645544 tgtggaag 20645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17668092 - 17667785
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17668092 aattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactttttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtt 17667993  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17667992 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgatagtgttcaggagcatagaaagactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 17667894  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  17667893 aagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgtaatcagatatttcatagtgaactctccttggaagtgcaaggaggacatgactgacttacggtttgt 17667794  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  17667793 ggaaggaac 17667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6090417 - 6090106
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6090417 aattctagagttttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatgaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 6090318  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6090317 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcgtaggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttg 6090218  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||| ||||    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6090217 aagtctcttgctaagtttagcagtgagaagttgtaatcagatactacatttttagtgagctctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 6090119  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  6090118 ttgtggaaggaac 6090106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 12963555 - 12963865
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12963555 aattctagagtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 12963654  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  12963655 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttc 12963754  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||  ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||    
T  12963755 aaagctcttgctaagtttatcattgagcagttgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgtaagggggac-atgattacttccgatt 12963853  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  12963854 tgtggaaggaac 12963865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 49553972 - 49554276
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49553972 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtaaatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtt 49554071  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49554072 tgaatt-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 49554169  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||| || |||  ||||| | ||| || |||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49554170 aagtcttttgctagttttagcagtgaacaattg--atcagatattacgtagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 49554267  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  49554268 ggaaggaac 49554276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 336
Target Start/End: Original strand, 22804492 - 22804801
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  22804492 aattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaaatttcttagtaattctgtt 22804591  T
Q  129 tgaattt-agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22804592 tgaattttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtaattt 22804691  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca--tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||| ||||  ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22804692 gaagtttcttgttaaatttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttatgaaatctcattggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtt 22804790  T
Q  326 tgtggaaggaa 336  Q
    |||||||||||    
T  22804791 tgtggaaggaa 22804801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 12726702 - 12727015
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaac----accactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattc 124  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  12726702 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaattaaaaccactggttgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattc 12726801  T
Q  125 tgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12726802 tgtttgaatt-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttagc-a 12726899  T
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttcc 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12726900 tttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttcc 12726999  T
Q  322 ggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12727000 ggtttgtagaaggaac 12727015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 18122085 - 18122392
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| | |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18122085 aattctaaagtcttaatagtctgcatctgatttttattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 18122183  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18122184 tgaatttagaagtttcttgcagttatgcttgaggaatagaagtctcttgattgagttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatttg 18122283  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    | |||||||  ||  ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  18122284 aggtctcttgatagttttagcagtgagcaattgtaatcagatatcacatagtgaactcttcttggaagtgcaacggggacaaaactgactttcgatttgt 18122383  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  18122384 ggaaggaac 18122392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14969044 - 14968748
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14969044 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgaa-----atcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 14968951  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14968950 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 14968852  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14968851 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtcaactctccttggaagttcaagggggacaggactgacttccggtttgt 14968752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41494685 - 41494378
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  41494685 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtt 41494586  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41494585 taaa--tagaagtctcttgcatttgtgcttgagcataagaagtctattgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 41494489  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  41494488 aagtctcttgttaagtttagcaatgagcagttgtaatcagatattacattatagtgaactctccttgaaagtgc-agggggacatgattgacttccggtt 41494390  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    | ||||||||||    
T  41494389 tatggaaggaac 41494378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 29951908 - 29952216
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29951908 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtt 29952007  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29952008 tgaat--agaagtcttttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 29952105  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  29952106 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactccccttgaaagtgcaaaggggacaggact-acttccggtt 29952204  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  29952205 tgtggaaggaac 29952216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 307
Target Start/End: Original strand, 8874590 - 8874871
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8874590 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 8874689  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8874690 tgaatt-agaagtctcttgcagttgtgcttaagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 8874788  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaaggggga 307  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  8874789 aagtctcttgctaagtttggcagtgagcagttgtaatcaaatattacatttttagtaaactctccttggaagtgcaaggggga 8874871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 30001062 - 30001370
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30001062 aattctagagtcttaagagtttgtatctgagttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtt 30001161  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30001162 tgaat--agaagtcttttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcacaagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 30001259  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  30001260 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactccccttgaaagtgcaaaggggacaggact-acttccggtt 30001358  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  30001359 tgtggaaggaac 30001370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16032283 - 16031975
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16032283 aattttagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 16032184  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16032183 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcacttgtgcttgagtaatttg 16032086  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    ||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  16032085 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaattagatattacatttttagtgaactcttcttagaagtgcaa-ggggacaagact-actttcggt 16031988  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  16031987 ttgtggaaggaac 16031975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 46796839 - 46797045
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46796839 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 46796937  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46796938 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 46797036  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  46797037 aagtctctt 46797045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15902884 - 15902575
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15902884 aattctagagtcttaagagtctgtatctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 15902785  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  15902784 tgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagaagcatacgaagtctcttgtaattgtgcttgagc-atttg 15902686  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||| ||||| | |||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||    
T  15902685 aagcctcttgcaaagtttagcagtgagtagttgtaatcagaaattacattttagtg-actctccttggaagtgcaagggggacataactgacttttgatt 15902587  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  15902586 tgtggaaggaac 15902575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 14393482 - 14393722
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |    
T  14393482 agtcttaagagtttgtatctgatttgtattatgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacgattttatgtgtaattatgtttgaattaa 14393581  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14393582 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttgaagtctct 14393681  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat 277  Q
    | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  14393682 tgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacat 14393722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 24776004 - 24776206
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24776004 aattctagagtccttagagtcagtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 24776102  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24776103 tgaattaagaagtcttttgcagttatgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 24776201  T
Q  229 aagtc 233  Q
    |||||    
T  24776202 aagtc 24776206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52920122 - 52919944
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52920122 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 52920023  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgca 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52920022 tga--ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgca 52919944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Original strand, 21638851 - 21639070
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21638851 tagaaggctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaagtct 21638949  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    ||||||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  21638950 cttactaagtttagtagcaaacaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgaggaagg 21639049  T
Q  335 aacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  21639050 aacctgtataaattgcttgtg 21639070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13948025 - 13947847
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13948025 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 13947926  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947925 tgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg 13947847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 26418146 - 26418456
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  26418146 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatattaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgt 26418245  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  26418246 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttatttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagatt 26418343  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  26418344 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctacttggaagtgcaaggggcacaggact-acttccgg 26418442  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  26418443 tttgtggaaggaac 26418456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12967996 - 12967679
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12967996 aattctagagtctcaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtt 12967897  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||  |||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  12967896 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagaattggaagtcttttgatttagttattgagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttg 12967799  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||  | ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||  ||| |||| |||     
T  12967798 aagtctcttgctagttttagcagtgactagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttgaaagtgcaatggggacatgact-actttcggg 12967700  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  12967699 ttgtggaaggaacttgtataa 12967679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12396755 - 12396450
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12396755 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatttcaagtgctcaacctcaaataattttctttgtaattctgtt 12396656  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12396655 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgattttgttcttgagcatagaaaatctcttgtagttgtgcttgagtaatttg 12396558  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||| |     ||| |||||| | ||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||    
T  12396557 aagtctcttgctatttttagcagtgagcaattgtaatcagatagtgattttagcgaactctccttggaagtgcaagggagataggact-acttccggttt 12396459  T
Q  327 gtggaagga 335  Q
    |||||||||    
T  12396458 gtggaagga 12396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 23538634 - 23538943
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  23538634 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatatgtattgtgaacaccgcttattgtatatcaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctatt 23538733  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23538734 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 23538831  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||| |||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| |    |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  23538832 aagtttcttgctagttttagcattgagcagttgtaatcagatattatatttttagtgaactctccttggaagtgcaatggggacaggact-acttccggt 23538930  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  23538931 ttgtggaaggaac 23538943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11222409 - 11222182
Alignment:
Q  123 tctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11222409 tctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaagtctcttgcagttgtgcttgagc 11222310  T
Q  223 aatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtg--aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttc 320  Q
     |||||||||||||| |||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  11222309 -atttgaagtctcttgctagttttagcggtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaaaactctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttc 11222211  T
Q  321 cggtttgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  11222210 cggtttgaggaaggaacctgtataaattg 11222182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 141 - 332
Target Start/End: Original strand, 1241670 - 1241860
Alignment:
Q  141 tctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttact 240  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1241670 tctcttgcatttgtgtttgagtaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagtaatttgaagtctcttact 1241769  T
Q  241 aagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaa 332  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1241770 aagtttagtcgtgagcatttgtaatcagatattaaatagtgaactctctttggaagtgcaa-ggggacatgactgacttccgatttgtggaa 1241860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22140451 - 22140286
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  22140451 aattcttgagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattctgtt 22140353  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcata 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22140352 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcata 22140286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20724776 - 20724467
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  20724776 aattctagagtattaagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattatatatcaggcgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 20724677  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||| ||||||   | ||||||||||   ||||||||||||||  |||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  20724676 tgaa--tagaagtatcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttatttagcataggaaatctcttgcaattgtgcttgagtagtttg 20724579  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20724578 aagtctcttgctaattttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtaaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggt 20724480  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  20724479 ttgtggaaggaac 20724467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 21606126 - 21606274
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21606126 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 21606225  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21606226 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 21606274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 6253108 - 6252800
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  6253108 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatctttctttgtaattctatt 6253009  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || |||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||     
T  6253008 tgaa--tataagtctcttgtagttgtgcttgagcatacgaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgattgagtagtttc 6252911  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca-atactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||  ||||||||| |||||     ||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  6252910 aagtctcttgctagttttagcagtgagctgttgtaatcaaatattgattttagtgaaatctccttggaagtgcaagggggacagaaact-acttccggtt 6252812  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  6252811 tgtggaaggaac 6252800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6175024 - 6174719
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||| ||    
T  6175024 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtcttcaaccttaaacatctttctttgtaattctatt 6174925  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||| |||||  |||||||||||   ||||| ||||||| ||||| | |||     
T  6174924 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtgtcttgattttgttcttgagcataggaaacatcttgtagttgtgattgagtagtttc 6174827  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatat-taca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||  ||||||||| |||| |  |   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6174826 aagtctcttgctagttttagcagtgagctgttgtaatcaaatatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagaact-acttccggt 6174728  T
Q  325 ttgtggaag 333  Q
    || ||||||    
T  6174727 ttatggaag 6174719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 12753122 - 12753403
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  12753122 ttgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 12753219  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||   ||||| |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  12753220 agcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 12753319  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12753320 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 12753403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13953922 - 13953642
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  13953922 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 13953825  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  13953824 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 13953725  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13953724 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 13953642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 46797036 - 46797193
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  46797036 gaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttagtagtgatcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttgaaag 46797134  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  46797135 tgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgtttgtg 46797193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Original strand, 22463672 - 22463825
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22463672 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattcggagtctcatactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaag 22463771  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgc 350  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22463772 tgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaaactgtataaattgc 22463825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 350
Target Start/End: Original strand, 22465130 - 22465283
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22465130 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattcggagtctcatactaagtttaatagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaag 22465229  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgc 350  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22465230 tgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaaactgtataaattgc 22465283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 22463565 - 22463700
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22463565 attctagagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgttt 22463664  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22463665 gaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 22463700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 22465023 - 22465158
Alignment:
Q  30 attctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22465023 attctagagtctttatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgttt 22465122  T
Q  130 gaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22465123 gaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 22465158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 15961132 - 15961307
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  15961132 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctccaacatttttctttgtaattctgtttgaa--taaaagtttcttgcagttttgcttg 15961229  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15961230 agcataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctctt 15961307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 21638718 - 21638863
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21638718 tctagagtctgtagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgcaattctgtttga 21638817  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  21638818 attcagaagtctcttgcatttgtgtttgagcaatagaaggctcttg 21638863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 11909541 - 11909822
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  11909541 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 11909638  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| |||||  |  ||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  11909639 agcataggaagtctcttgcttgtgggcttgagcaaaggaagtttcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 11909738  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11909739 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaagggagacaggactgactttcggtttgtggaaggaac 11909822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 345
Target Start/End: Original strand, 25398867 - 25399042
Alignment:
Q  169 agtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  25398867 agtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaaca-tttgaagtctcttgctagttttagcagcgagcaattgtaatcag 25398965  T
Q  269 atattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  25398966 atattacatagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactaacttccagtttgtggaaggaatttgtataa 25399042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52283418 - 52283271
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52283418 aattctagaatcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 52283320  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  52283319 tgaatttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttg 52283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 12389342 - 12389518
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttc-aaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  12389342 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgttttgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacatcaaaaaaaaattctttgtaattctgt 12389441  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 206  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12389442 ttgaa--tagaagtctcttgtagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcatagaaaatctctt 12389518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11867955 - 11867772
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11867955 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattctgaacaccactaattatatatcaactgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgtt 11867857  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttga 220  Q
    |       ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11867856 t-------gaagtattttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgctaaggaggataggaagtctcttgcagttgtgcttga 11867772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 14077791 - 14077996
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14077791 aattctagagtcataagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattttgtt 14077889  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||   ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||    ||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||    
T  14077890 tga--gtagaagtcttttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 14077987  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||| ||||    
T  14077988 aagtgtctt 14077996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15833067 - 15832787
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  | ||||    
T  15833067 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagttcttg 15832970  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  15832969 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 15832870  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15832869 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 15832787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22128627 - 22128457
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaa 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||  | |||||| ||||||    
T  22128627 tagaagtcccttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcaattgtaa 22128529  T
Q  265 tcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22128528 tcagatgttacatactg-actctccttggaagtgcaaaggggacaagactgacttccggtttgtagaaggaac 22128457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 49989920 - 49989640
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  49989920 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 49989823  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |    
T  49989822 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgcagtattgagcaat 49989723  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49989722 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 49989640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10851497 - 10851295
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  10851497 aattctagagtcttaaaagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctgaaac-attttctttgtaattctgt 10851400  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||||    ||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||    
T  10851399 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgaggataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtatttt 10851302  T
Q  228 gaagtct 234  Q
    |||||||    
T  10851301 gaagtct 10851295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22128732 - 22128615
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22128732 aattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttc-ttgtaattatgtt 22128634  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  22128633 tgaatttagaagtcccttg 22128615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14007251 - 14007065
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14007251 aattctagagtcttaagagtcac-atctaatttgtattgtgaacagccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtt 14007154  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttg 219  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    ||| |  | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14007153 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgtgcataggaaacctcttgcagttgtgcttg 14007065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17697278 - 17697159
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  17697278 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgcagttgtg 17697181  T
Q  156 cttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||   |||||||||||    
T  17697180 cttgagcataggaagtctcttg 17697159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 337
Target Start/End: Original strand, 19889512 - 19889692
Alignment:
Q  157 ttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||| | | |||    
T  19889512 ttgagcattagaggtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgctttagc-atttgaagtctcttgctagttttagcagttagc 19889610  T
Q  257 atttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    | || |||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19889611 agttttaatcagatattacattttagtgaactctcattcgaagtgcaa-ggggacatgact-acttccggtttgtggaaggaac 19889692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17006853 - 17006648
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |  ||||||    
T  17006853 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tataagtctcttgctttagtgcttg 17006756  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||  |||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  17006755 agcataagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 17006656  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  17006655 ttgtaatc 17006648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 19249883 - 19249986
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19249883 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacaa-tttctttgtaattctgtt 19249981  T
Q  129 tgaat 133  Q
    |||||    
T  19249982 tgaat 19249986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 52283311 - 52283154
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||    
T  52283311 gaagtcttttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagaaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttgg 52283213  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52283212 aagtgcaagggggacatgactgactttcagtttgtggaaggaacctgtataaattgctt 52283154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10529004 - 10528889
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  10529004 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 10528907  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  10528906 agcaaaggaagtctcttg 10528889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Original strand, 16659089 - 16659179
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16659089 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgt 16659179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 31114363 - 31114642
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  31114363 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 31114460  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat-ttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||     
T  31114461 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattattgaagtctcatactagg--tagtattgagcag 31114558  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |      |||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31114559 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 31114642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 8729458 - 8729604
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  8729458 aattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtt 8729557  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||  |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||||||||||    
T  8729558 tg--tttagaagtctcttacttttgtgcttgaacataagaagtctcttg 8729604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 9081345 - 9081491
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  9081345 aattctagagtcttaagagtgtgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtt 9081444  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||  |||||||||||||| |  || ||||||| ||  ||||||||||||    
T  9081445 tg--tttagaagtctcttacttttgtgcttgaacataagaagtctcttg 9081491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 51989522 - 51989725
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||   |  ||||||    
T  51989522 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaatttactgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgttttagtgcttg 51989619  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||||  ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| ||||||     
T  51989620 agcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactagg--tagtattgagcag 51989717  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  51989718 ttgtaatc 51989725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15848861 - 15848700
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |  ||||||    
T  15848861 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgttttagtgcttg 15848764  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15848763 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 15848700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22150905 - 22150700
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  22150905 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 22150808  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||||| |    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  22150807 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctctttcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 22150708  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  22150707 ttgtaatc 22150700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13939412 - 13939267
Alignment:
Q  201 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||    
T  13939412 tctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcactgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagt 13939314  T
Q  298 gcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13939313 gcaagggggacatgac-aacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 13939267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 19198351 - 19198555
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  19198351 aattctagagtcttaagaatc-ctatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcatac-attttctttgtaattctgtt 19198448  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || |||||| ||||  || ||||||||||   ||| |||||||    ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||    
T  19198449 tgaa--tataagtctattgcttttgtgcttgagcataggaattctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttg 19198546  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  19198547 aagtctctt 19198555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37412265 - 37412143
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||    
T  37412265 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttg--tttagaagtctcttgctttagtgcttg 37412168  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||    
T  37412167 agcaaaggaagtctcttgcttgtgt 37412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51340670 - 51340508
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  51340670 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttaatgcttg 51340573  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    ||||   ||||||||||| ||   | |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  51340572 agcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaa 51340508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13699056 - 13698904
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||    
T  13699056 aattctagagtctgaagagtct-tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccccaatcatttttctgtgtaattgtgtt 13698958  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||  |||||||||||||||   || ||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  13698957 tg--tttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcatatgaaatctcttgcttgtgt 13698904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 337
Target Start/End: Original strand, 14063577 - 14063769
Alignment:
Q  148 cagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttta 247  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||  ||  ||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||    
T  14063577 cagttgtgcttgagcatacgaagtctctttgtttagttcttgagcatatgaaatctcttgcacttgtgcttgagtagtttgaagtctctttctagtttta 14063676  T
Q  248 gtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  14063677 gcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccagtttgtggaaggaac 14063769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Original strand, 25398728 - 25398816
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttcttt 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25398728 aattctatagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcttt 25398816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37412168 - 37411997
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---attaca--tagtgaa 283  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||| |  |||||||    
T  37412168 gagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaa 37412069  T
Q  284 -ctcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  37412068 actctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtat-aattgcttgtg 37411997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 7833113 - 7833226
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||     
T  7833113 tagagtct-tatctgatttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg--tttagaagta 7833209  T
Q  143 tcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| || ||||||    
T  7833210 tcttgcatttgtgcttg 7833226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13147924 - 13147838
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13147924 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgc 13147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11189519 - 11189392
Alignment:
Q  209 agttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggac 308  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11189519 agttgtggttgagca-tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacgtagtgaactctcgttggaagtgcaagggggac 11189421  T
Q  309 aatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11189420 aggactaacttccggtttatggaaggaac 11189392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Original strand, 18143217 - 18143316
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18143217 aattctaaagacttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgtt 18143315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14581003 - 14580887
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca-attttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||||    
T  14581003 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgctt 14580906  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  14580905 gagcattggaagtctcttg 14580887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Original strand, 45862160 - 45862340
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||    
T  45862160 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgcagtattgagcagttgt 45862259  T
Q  263 aatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45862260 aatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 45862340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 309
Target Start/End: Original strand, 16659181 - 16659346
Alignment:
Q  148 cagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttta 247  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||    
T  16659181 cagttgtgcttgagcattagaagtctcttaactgttttcaggagcatagaaagtctcttgaaattgtgcttgagc-atttgaagtctcttgttagtttta 16659279  T
Q  248 gtaatgagcatttgtaatcagatattaca-----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||     ||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  16659280 gcagtgagcagttgtaatcagatattacattttttagagaagtctccttggaagtgcaagggggaca 16659346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14072384 - 14072240
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||| || ||||    
T  14072384 aattctagagtcttaagagtcac-atctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaac-attttttatgtatttttgtt 14072287  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||  || |||||||||||  || ||||||||||   |||||||||||    
T  14072286 tgaa--tataagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttg 14072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Original strand, 45862089 - 45862211
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  45862089 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtataattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 45862186  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||    
T  45862187 agcataggaagtctcttgcttgtgt 45862211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41045402 - 41045197
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  41045402 ttgtattgtgaacaccaccaatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttaatgcttg 41045305  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    |||||||| || || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  41045304 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgaacatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 41045205  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  41045204 ttgtaatc 41045197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Original strand, 13410523 - 13410650
Alignment:
Q  34 tagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||      
T  13410523 tagagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg-- 13410619  T
Q  133 tttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    || |||||| ||||||  || ||||||||||    
T  13410620 ttcagaagtttcttgctcttgtgcttgagca 13410650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2246227 - 2246144
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2246227 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 2246144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 13199619 - 13199702
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  13199619 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctct 13199702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Original strand, 19889413 - 19889515
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  19889413 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttttattgtgaaaatcactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttcagtataattctgtt 19889512  T
Q  129 tga 131  Q
    |||    
T  19889513 tga 19889515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27172697 - 27172583
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||  |  ||||||    
T  27172697 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttc-ttgtaattctgtttgaa--tataagtctcttgctttagtgcttg 27172601  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  27172600 agcataggaagtctcttg 27172583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 16811743 - 16811828
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtat-tgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatttt 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16811743 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatctgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacactttt 16811828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16879689 - 16879498
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16879689 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaaacctcaaac-attttttgtgtaattgtgtttg--tttagaagtc 16879593  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||||  || ||||| ||||   ||| |||||||  | ||| |  ||| |||||||  |||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  16879592 tcttgcttttgtgcttaagcataggaactctcttgtgtttgtgcttgagtataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtatctt 16879498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 15651445 - 15651527
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15651445 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 15651527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 15663080 - 15663162
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15663080 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 15663162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17017659 - 17017544
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  17017659 ttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaacttaaataattttctgtgtatttctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 17017562  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  17017561 agcaaaggaagtctcttg 17017544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21735970 - 21735885
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21735970 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttttgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 21735885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21317179 - 21317075
Alignment:
Q  57 gatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgc 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||    
T  21317179 gatttgtattgtgaacaccactgattatatatcatatgttgaacctcaaacatttttctatgtaattgtgtttg--tttagaagtctcttgcatttgtgc 21317082  T
Q  157 ttgagca 163  Q
    || ||||    
T  21317081 ttaagca 21317075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 4243591 - 4243895
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||    
T  4243591 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttttattgtaaacatcgttgtttgtatatcaagtgttcaacctcaaagatatttctgtgtaattgtgtt 4243690  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||  ||||||||||||||||  || || |||| ||   |||| ||||||  ||||| |   ||||||||||  ||||||   ||||||||||| | ||||    
T  4243691 tg--tttagaagtctcttgcttttgtggttgaacataggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagtttg 4243788  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||   | | |||     |||||| ||||||| |||||||     ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  4243789 aagtctct---tgattttgtgtttgagcaattgtaattagatattgattttagtgaagtctctttggaagtgcaagggggacaata-ttacttccggatt 4243884  T
Q  327 gtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||    
T  4243885 gtggaaggaac 4243895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16076790 - 16076676
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  16076790 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 16076694  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  16076693 agcattagaagactcttg 16076676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24659762 - 24659648
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24659762 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24659666  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24659665 agcattagaagtctcttg 24659648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Original strand, 19249985 - 19250104
Alignment:
Q  193 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactccca 289  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||||||||  ||    
T  19249985 ataggaaatctcttgttgttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattatattttagtgaactttca 19250084  T
Q  290 ttggaagtgcaagggggaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19250085 ttggaagtgcaagggggaca 19250104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 335
Target Start/End: Original strand, 29933934 - 29934207
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||     ||||||    
T  29933934 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttggaagtctcttgcctacgtgcttg 29934030  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| |||||||    
T  29934031 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgagcat 29934129  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    ||||||||   || ||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  29934130 ttgtaatctgtgagatta-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagga 29934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 29947720 - 29948013
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  || |||||| |||||     ||||||    
T  29947720 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttggaagtcgcttgcctgcgtgcttg 29947816  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  |  |  |||||| |||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| ||| |||    
T  29947817 agcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgaacat 29947915  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||   || ||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  29947916 ttgtaatctgtgagatta-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaaccaggataatttgcttgtg 29948013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 335
Target Start/End: Original strand, 29983088 - 29983361
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||     ||||||    
T  29983088 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttggaagtctcttgcctacgtgcttg 29983184  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| |||||||    
T  29983185 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgagcat 29983283  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    ||||||||   || ||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  29983284 ttgtaatctgtgagatta-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagga 29983361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 355
Target Start/End: Original strand, 29996874 - 29997167
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||  || |||||| |||||     ||||||    
T  29996874 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga--ttggaagtcgcttgcctgcgtgcttg 29996970  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  |  |  |||||| |||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||   |||| ||| |||    
T  29996971 agcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttag-agagtattgaacat 29997069  T
Q  259 ttgtaatc--agatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||   || ||||  |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  29997070 ttgtaatctgtgagatta-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaaccaggataatttgcttgtg 29997167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13931645 - 13931516
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||   ||||||||||||| ||||    
T  13931645 aattctagagtcttaagagtcta-atttgttttgtattgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaa-accaaacttatttctttgtaatt-tgtt 13931549  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  13931548 tg--tttagaagtctcttacttttttgcttgagca 13931516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 29906555 - 29906625
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  29906555 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 29906625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37759548 - 37759417
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||    
T  37759548 tagagtctttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtc 37759452  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  37759451 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 37759417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51340565 - 51340342
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||   |||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||     
T  51340565 gaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaaatctca 51340466  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgg 330  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||     
T  51340465 tactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggagaggactgacttccgttttgtga 51340366  T
Q  331 aaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||| || || |||||||||||    
T  51340365 aaggaacctgtat-aattgcttgtg 51340342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 504541 - 504655
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  504541 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 504637  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  504638 agcattagaagtctcttg 504655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 526907 - 527021
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  526907 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 527003  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  527004 agcattagaagtctcttg 527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4743600 - 4743486
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4743600 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4743504  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4743503 agcattagaagtctcttg 4743486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4754187 - 4754073
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  4754187 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4754091  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4754090 agcattagaagtctcttg 4754073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5866069 - 5866183
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5866069 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5866165  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5866166 agcattagaagtctcttg 5866183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5876668 - 5876782
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5876668 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5876764  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5876765 agcattagaagtctcttg 5876782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6180901 - 6181015
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6180901 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6180997  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6180998 agcattagaagtctcttg 6181015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6221075 - 6221189
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6221075 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6221171  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6221172 agcattagaagtctcttg 6221189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8774519 - 8774405
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  8774519 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 8774423  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8774422 agcattagaagtctcttg 8774405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10098930 - 10098816
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  10098930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 10098834  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  10098833 agcattagaagtctcttg 10098816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12287352 - 12287467
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  12287352 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 12287449  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12287450 agcattagaagtctcttg 12287467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12297174 - 12297289
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  12297174 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 12297271  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12297272 agcattagaagtctcttg 12297289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13121524 - 13121410
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13121524 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13121428  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13121427 agcattagaagtctcttg 13121410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13131766 - 13131652
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13131766 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13131670  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13131669 agcattagaagtctcttg 13131652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 13373039 - 13373153
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13373039 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13373135  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13373136 agcattagaagtctcttg 13373153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 13383633 - 13383747
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13383633 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13383729  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13383730 agcattagaagtctcttg 13383747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 13394227 - 13394341
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13394227 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13394323  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13394324 agcattagaagtctcttg 13394341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14465453 - 14465339
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14465453 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14465357  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14465356 agcattagaagtctcttg 14465339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14476083 - 14475969
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  14476083 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 14475987  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  14475986 agcattagaagtctcttg 14475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16385937 - 16385823
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  16385937 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 16385841  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16385840 agcattagaagtctcttg 16385823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16811889 - 16811827
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaa 91  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16811889 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtattatgaacaccactgactgtatatcaa 16811827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18483906 - 18483792
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  18483906 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 18483810  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18483809 agcattagaagtctcttg 18483792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 20684152 - 20684266
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  20684152 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 20684248  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20684249 agcattagaagtctcttg 20684266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20720975 - 20720861
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  20720975 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 20720879  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20720878 agcattagaagtctcttg 20720861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23647611 - 23647497
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  23647611 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 23647515  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23647514 agcattagaagtctcttg 23647497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24383892 - 24384006
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24383892 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24383988  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24383989 agcattagaagtctcttg 24384006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24670342 - 24670228
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  24670342 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttctgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 24670246  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24670245 agcattagaagtctcttg 24670228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35187239 - 35187125
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  35187239 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 35187143  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35187142 agcattagaagtctcttg 35187125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38194586 - 38194472
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  38194586 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 38194490  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38194489 agcattagaagtctcttg 38194472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38205122 - 38205008
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  38205122 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 38205026  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  38205025 agcattagaagtctcttg 38205008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39371915 - 39371801
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  39371915 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39371819  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39371818 agcattagaagtctcttg 39371801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39382552 - 39382438
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  39382552 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39382456  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39382455 agcattagaagtctcttg 39382438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41683540 - 41683426
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  41683540 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 41683444  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  41683443 agcattagaagtctcttg 41683426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41694109 - 41693995
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  41694109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 41694013  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  41694012 agcattagaagtctcttg 41693995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 8740499 - 8740571
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  8740499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaat 8740571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16881949 - 16881860
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact-tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||| |   |||||||||||||||    
T  16881949 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatctcaaac-attttctgtgtaattgtgtct--ctttagaagtctcttg 16881860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17961207 - 17961122
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  17961207 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtccaaccaa-tttctttatatttttgtttgaa--tagaagtctcttgc 17961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 20673567 - 20673680
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  20673567 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 20673663  T
Q  160 agcaatagaagtctctt 176  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20673664 agcattagaagtctctt 20673680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 49666877 - 49666926
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccact 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49666877 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccact 49666926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Original strand, 16671536 - 16671695
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||   ||||| |||| |||  | ||||||    
T  16671536 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-atcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--aagaagcctctcgcatgtgtgcttg 16671631  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||    
T  16671632 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca 16671695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 17281808 - 17282011
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  17281808 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 17281904  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  17281905 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaag-agagtattgagcat 17282003  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  17282004 ttgtaatc 17282011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 27883244 - 27883173
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  27883244 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 27883173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52919956 - 52919848
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  52919956 gaagtctcttgcaaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagcgaactctccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccga 52919858  T
Q  324 tttgtggaag 333  Q
    ||||||||||    
T  52919857 tttgtggaag 52919848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 9381031 - 9381305
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||| ||||| || |||||||  | ||||| |||||||     ||||||    
T  9381031 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttatttcattgtatttttgtttga--tcagaagactcttgcctgcgtgcttg 9381127  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt---gaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  9381128 agcattagaagactcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcacttttaagaagtctcatacttag-atagtactgagc 9381225  T
Q  257 atttgtaatc--agatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||   |  |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9381226 atttgtaatctttgtgatt--atagtgaaatctcattggaagtgcaagggggactggact-acttccgatttgtggaaggaac 9381305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 4175130 - 4175244
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  4175130 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 4175226  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4175227 agcattagaagtctcttg 4175244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5510558 - 5510444
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  5510558 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 5510462  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5510461 agcattagaagtctcttg 5510444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5520736 - 5520622
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  5520736 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 5520640  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5520639 agcattagaagtctcttg 5520622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5537394 - 5537508
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5537394 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5537490  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5537491 agcattagaagtctcttg 5537508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5547978 - 5548092
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  5547978 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 5548074  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5548075 agcattagaagtctcttg 5548092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5580007 - 5580121
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  5580007 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 5580103  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5580104 agcattagaagtctcttg 5580121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 5628391 - 5628505
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  5628391 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 5628487  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  5628488 agcattagaagtctcttg 5628505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 11272757 - 11272871
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  11272757 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgagtgcttg 11272853  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11272854 agcattagaagtctcttg 11272871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13557436 - 13557322
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  13557436 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 13557340  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13557339 agcattagaagtctcttg 13557322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18006152 - 18006039
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  18006152 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaaccaatttc-ttgtatttgtgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 18006057  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  18006056 agcataggaagtctcttg 18006039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19778247 - 19778133
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  19778247 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19778151  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19778150 agcattagaagtctcttg 19778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19788884 - 19788770
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  19788884 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19788788  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19788787 agcattagaagtctcttg 19788770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23757160 - 23757046
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  23757160 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 23757064  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23757063 agcattagaagtctcttg 23757046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23767756 - 23767642
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  23767756 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 23767660  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23767659 agcattagaagtctcttg 23767642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37866307 - 37866193
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  37866307 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 37866211  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  37866210 agcattagaagtctcttg 37866193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37885440 - 37885326
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  37885440 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 37885344  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  37885343 agcattagaagtctcttg 37885326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8785104 - 8785019
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  8785104 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgc 8785019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 9006882 - 9006954
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  9006882 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 9006954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28168938 - 28168829
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||   | ||||||||||     
T  28168938 ttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcat 28168842  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||    
T  28168841 tagaagactcttg 28168829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1053570 - 1053522
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1053570 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaaca 1053522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 28325221 - 28325334
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgta-attctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||  || |||||||  |||||||||||||||   | |||||    
T  28325221 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattttttgtttga--ttagaagtctcttgc--ctgtgctt 28325315  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  28325316 gagcattagaagtctcttg 28325334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 39673256 - 39673460
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  39673256 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 39673352  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtaatgagc 256  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||| |||| ||  ||||| |||||    
T  39673353 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttag-atagtattgagc 39673450  T
Q  257 atttgtaatc 266  Q
    ||||||||||    
T  39673451 atttgtaatc 39673460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 7794980 - 7795019
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794980 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7795019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 7804891 - 7804930
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804891 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7804930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 9391577 - 9391616
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391577 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9391616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9535471 - 9535432
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535471 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9535432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11078350 - 11078307
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11078350 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 11078307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 11206447 - 11206486
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206447 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11206486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 11217098 - 11217137
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11217098 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11217137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 14258437 - 14258476
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258437 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14258476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 14322070 - 14322136
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  14322070 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa 14322136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 28314605 - 28314644
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28314605 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28314644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 29461586 - 29461625
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461586 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29461625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 29472438 - 29472477
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472438 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29472477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38314555 - 38314516
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38314555 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38314516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 48337103 - 48337064
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 48337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 933488 - 933450
Alignment:
Q  61 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933488 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 933450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6501376 - 6501490
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6501376 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6501472  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6501473 agcattagaagtctcttg 6501490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9982258 - 9982372
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9982258 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9982354  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9982355 agcattagaagtctcttg 9982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9994266 - 9994380
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9994266 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9994362  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9994363 agcattagaagtctcttg 9994380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12237986 - 12238100
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12237986 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12238082  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12238083 agcattagaagtctcttg 12238100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 22770435 - 22770493
Alignment:
Q  165 tagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22770435 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 22770493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1463942 - 1463905
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1463942 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 1463905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 8996330 - 8996402
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  8996330 ttgtattgagaaaaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaac-attttctctgtatttttgtttgaat 8996402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 177
Target Start/End: Original strand, 13262051 - 13262160
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||     ||||||||||     
T  13262051 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaggtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 13262147  T
Q  165 tagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||    
T  13262148 tagaagactcttg 13262160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15848650 - 15848521
Alignment:
Q  213 gtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaaggggg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  15848650 gtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctctttggaagtgcaaggggg 15848551  T
Q  307 acaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15848550 actggact-acttccgatttgtggaaggaac 15848521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1063999 - 1063951
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1063999 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaaca 1063951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Original strand, 1784444 - 1784480
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1784444 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 1784480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11163688 - 11163652
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163688 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11163652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Original strand, 24706931 - 24706967
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706931 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24706967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2783273 - 2783230
Alignment:
Q  312 actgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2783273 actgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 2783230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4404134 - 4404095
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4404134 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaa 4404095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4433621 - 4433582
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4433621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaa 4433582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 10627314 - 10627353
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10627314 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10627353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 10655636 - 10655675
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655636 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10655675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 12249812 - 12249851
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249812 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12249851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 19887727 - 19887766
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887727 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19887766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23635571 - 23635532
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635571 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23635532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 50721774 - 50721727
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50721774 tatctgatttgaattgtgaacaccactgattatatatcaaatgttcaa 50721727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Original strand, 50791075 - 50791122
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50791075 tatctgatttgaattgtgaacaccactgattatatatcaaatgttcaa 50791122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 932493 - 932382
Alignment:
Q  68 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||  |||||| | ||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||    
T  932493 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac--caaacttatttctaagtaatt-tctttg--tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataag 932399  T
Q  168 aagtctcttgattgtgt 184  Q
    || ||||||| ||||||    
T  932398 aaatctcttgcttgtgt 932382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 6490722 - 6490836
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6490722 ttgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6490818  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6490819 agcattagaagtctcttg 6490836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 12410297 - 12410382
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  12410297 tttgtattgtgaacaccactgattgtatataaattgttcaa-accaaacttatttctttgtaatt-tgtttg--tttagaagtctcttgc 12410382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 22766988 - 22767052
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 95  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22766988 aattttagagtcttaagagtct-ta-ctgatttgtattgtgaacaccactcattttatatcaagtgt 22767052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27849873 - 27849808
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 95  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27849873 aattctagagtcttaagagtctg-atttattttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgt 27849808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 17769492 - 17769533
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17769492 tttgtattatgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaac 17769533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 19070793 - 19070834
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19070793 tttgtattatgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaac 19070834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Original strand, 1794857 - 1794893
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1794857 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgtt 1794893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11078194 - 11078135
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  11078194 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggattgtggaaggaac 11078135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21316992 - 21316933
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  21316992 tagtgaactctccttggaagtgcaagggagacaagact-acttccggattgtggaaggaac 21316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Original strand, 22770393 - 22770477
Alignment:
Q  90 aagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||||||||   |||||||||||    
T  22770393 aagtgttcaatctcaaaca-ttttctttgtaattctgttcga--ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttg 22770477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 15651707 - 15651753
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15651707 ttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 15651753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 17910375 - 17910414
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17910375 ttgtagtgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaa 17910414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 16305619 - 16305732
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||   ||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   ||||||  ||||| |||| || ||||    
T  16305619 aattctagagtcttaagagtctgtatct---ttaaattgtgaacaccattgattgtatattaattgttcaa-accaaacatctttctctgtagttttgtt 16305714  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  16305715 tg--tttagaagtctcttgc 16305732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 29472652 - 29472713
Alignment:
Q  276 atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaact 338  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29472652 atagtgaaatctcattggaagtgcaagggggactggact-acttccgatttgtggaaggaact 29472713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17697177 - 17697148
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697177 gagcataggaagtctcttgcagttgtgctt 17697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17961035 - 17960971
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  17961035 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggattgtggaaggaaccagtataaattgcttgtg 17960971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 352
Target Start/End: Original strand, 24776207 - 24776252
Alignment:
Q  307 acaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24776207 acaagactgatttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgctt 24776252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27849664 - 27849604
Alignment:
Q  276 atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27849664 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactgtact-acttccggattgtggaaggaac 27849604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10528933 - 10528829
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  10528933 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttatgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 10528834  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  10528833 taatc 10528829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Original strand, 13410758 - 13410817
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||    
T  13410758 tagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccgaattgtggaaggaac 13410817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13698843 - 13698784
Alignment:
Q  277 tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  13698843 tagtgaactctccttggaagtgcaagagggacaagact-actaccggattgtggaaggaac 13698784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17017588 - 17017484
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  17017588 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 17017489  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  17017488 taatc 17017484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 112
Target Start/End: Original strand, 19643907 - 19643952
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattt 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19643907 ttgtgaacacctctgattgaatatcaagtgttcaac--caaacaattt 19643952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22128595 - 22128555
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  22128595 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttg 22128555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22140344 - 22140305
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22140344 gaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attagaagtctctt 22140305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52920016 - 52919977
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52920016 gaagtctcttgcagttgtgcttgagc-attagaagtctctt 52919977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11886 - 11559
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11886 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 11787  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11786 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttg 11687  T
Q  229 aagtctcttactaa-gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11686 aagtctcttactaatttttagtagtgagcatttgtaatcagatattacttagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 11587  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11586 tggaaggaacctgtataaattgcttgtg 11559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 16139 - 16464
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16139 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 16238  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16239 tgaattaagaagtctcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 16337  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16338 aaatctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 16437  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  16438 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 16464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Original strand, 25799 - 25990
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25799 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 25898  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttga 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25899 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttga 25990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Original strand, 25907 - 25935
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25907 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 25935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 65828 - 66153
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65828 aattctagagtccttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 65927  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65928 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 66026  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  66027 aagtctcttgctaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtggaagggggacaggactgacttctggtttgt 66126  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  66127 ggaaggaacctgcataaatttcttgtg 66153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 31 - 355
Target Start/End: Original strand, 144875 - 145198
Alignment:
Q  31 ttctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 130  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144875 ttctagagtccttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 144974  T
Q  131 aatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaa 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  144975 aattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcgtaggaagtctcttgcaattgtgcttgagc-atttgaa 145073  T
Q  231 gtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgg 330  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  145074 gtctcttagtaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactatacttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgg 145173  T
Q  331 aaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  145174 aaggaacctgtataaattgcttgtg 145198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 345
Target Start/End: Original strand, 165125 - 165372
Alignment:
Q  102 tcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||  |  ||||||||||   ||||||||||   ||||| |  ||||| |||||||    
T  165125 tcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaat--agaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagt 165222  T
Q  202 ctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatca-----gatattacatagtg-aactcccattggaa 295  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||     |||   || ||||| ||||| | ||||||    
T  165223 ctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcatttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaa 165322  T
Q  296 gtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  165323 gtgcaagggagacaggagtgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 165372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 59248 - 59046
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  59248 aattctagagtcttaggagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatgtcaaatgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgt 59151  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  |||||||||||||||  || || |||||||   ||||| |||||  | ||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||  | |||    
T  59150 ttga--ttagaagtctcttgcttttgtggttgagcataggaagtatcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgactagttt 59053  T
Q  228 gaagtct 234  Q
    |||||||    
T  59052 gaagtct 59046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 251261 - 251224
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  251261 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtt 251224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 157)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 40845857 - 40846185
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40845857 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 40845956  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40845957 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 40846055  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg---taatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40846056 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaataatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtt 40846155  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  40846156 tgtggaagaaacttgtataaattgattgtg 40846185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 29 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43639462 - 43639138
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43639462 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 43639363  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43639362 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcaatttg 43639263  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  43639262 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccag-ttgt 43639164  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgt 354  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||    
T  43639163 ggaaggaacatgtataaattgattgt 43639138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 43 - 355
Target Start/End: Original strand, 13431104 - 13431416
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13431104 tagagtctgtatcagatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtc 13431203  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13431204 tattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtcttttactaa 13431303  T
Q  243 gtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaa 342  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| || |    
T  13431304 gtttagtagtgagcatttgcaatcagatattacatagtgaactccccttgaaagtgcaagggggacatgaccgacttccgatttgtggaaggaacctgta 13431403  T
Q  343 taaattgcttgtg 355  Q
    ||||||| |||||    
T  13431404 taaattgtttgtg 13431416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45292515 - 45292221
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45292515 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 45292416  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  45292415 tgaattaagaggtctattgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgt--ctgagcaatttg 45292318  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45292317 aagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 45292221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 32 - 352
Target Start/End: Original strand, 33560688 - 33561008
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33560688 tctagaatctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttga 33560787  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33560788 atttagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtatcttgcagttgtgcttgagcaagttgaag 33560887  T
Q  232 tctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    |||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |    
T  33560888 tctcttgctagttttagcagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgtgca 33560987  T
Q  332 aggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  33560988 aggaacctgtataaattgctt 33561008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39693215 - 39692908
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39693215 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 39693116  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39693115 tgaatttggaagtctcttacagttgcgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 39693017  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39693016 aagtctcttgctagttttaggagtgagcagttgtaatcagatattacatagtgaactctacttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 39692917  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  39692916 ggaaggaac 39692908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 15336558 - 15336882
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15336558 aattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 15336656  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15336657 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 15336755  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15336756 aagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 15336855  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  15336856 tgtggaaggaacatgtataaattgctt 15336882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 15425623 - 15425947
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15425623 aattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 15425721  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15425722 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 15425820  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15425821 aagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 15425920  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  15425921 tgtggaaggaacatgtataaattgctt 15425947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 15516927 - 15517251
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15516927 aattctatagtctttagagtcagtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 15517025  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15517026 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatagaagtctcttgattatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 15517124  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15517125 aagtctcttactaagtttagtagtgagaaattgcaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 15517224  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  15517225 tgtggaaggaacatgtataaattgctt 15517251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25163752 - 25163443
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25163752 aattctagagttttaagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 25163653  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25163652 tgaattt-gaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaggagtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 25163554  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25163553 aagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagtct-acttccggtt 25163455  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    | ||||||||||    
T  25163454 tatggaaggaac 25163443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 45538907 - 45539229
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45538907 aattctagagtcttaagagcctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 45539006  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcag-ttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45539007 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagtttgtgcttgagc-attt 45539105  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  45539106 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaataagatattacgtagtgaaatctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttg 45539204  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  45539205 tggaaggaacctgtataaattgctt 45539229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29692992 - 29692684
Alignment:
Q  31 ttctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttg 130  Q
    ||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29692992 ttctatagttttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttg 29692893  T
Q  131 aatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaa 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29692892 aatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttaaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaa 29692794  T
Q  231 gtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29692793 gtctcttgctaagtttagtagtgagtagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 29692694  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    ||||||||||    
T  29692693 tggaaggaac 29692684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43773801 - 43773480
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  43773801 aattttagagtctttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgt 43773702  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  43773701 ttgaattgagaagtctattgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtatcttgcagttgtgcttaagcaagtt 43773602  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||| |||||| |||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43773601 gaaatctcttgctagttttagcagagagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttg 43773502  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  43773501 tggaaggaacctgtataaattg 43773480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 17442290 - 17442596
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17442290 aattctagagtcttaagaggttgtatctgatt-gtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaacatcaaacatttttctttgtaattctgtt 17442388  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17442389 tgaatttagaagtttcttgcagttgtgctggagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 17442487  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  17442488 aagtctctttctatttttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctcctcggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttat 17442587  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  17442588 ggaaggaac 17442596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21932554 - 21932263
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  21932554 agtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtttcaattaa 21932456  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21932455 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtatgt 21932356  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtg 329  Q
    | |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21932355 tgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtg 21932263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 23264095 - 23264402
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactt-caaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  23264095 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgctcaacccacaaacatttttctttgtaattctgt 23264194  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23264195 ttgaattaagaagtctattgtagttgtgcttgagcattagaagtctcttcattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca--tt 23264292  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  23264293 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctcgttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttg 23264392  T
Q  328 tggaaggaac 337  Q
    |||| |||||    
T  23264393 tggatggaac 23264402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19942915 - 19942608
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19942915 aattctagagtcttaatagtccgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacct-caaacatttttctttgtaattctgtt 19942817  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||  ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942816 tga--ttataagtctcttgcagttgtgcttgaccattagaagtctcttgattgtattcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 19942719  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  19942718 aagtctctttctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-actttcggtt 19942620  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  19942619 tgtggaaggaac 19942608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 20255980 - 20256299
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20255980 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtt 20256079  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc-agttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||    
T  20256080 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcaagttgtgcttgggtagttt 20256179  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||    
T  20256180 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggagacatgact-atttccggt 20256278  T
Q  325 ttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20256279 ttgtggaaggaacttgtataa 20256299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17797101 - 17796798
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  17797101 aattatagagtcttaagagactgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctt-gtaattttgtt 17797003  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17797002 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtctcttgcagttgtgcttga-ccatttg 17796904  T
Q  229 aagtctcttacta-agtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17796903 aagtctcttgctagtttttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatggtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttg 17796804  T
Q  328 tggaag 333  Q
    ||||||    
T  17796803 tggaag 17796798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9320250 - 9319929
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9320250 aattctagagtcttaagaatctgtatttgatttgtattgtgagcatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 9320152  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9320151 tgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 9320053  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | |||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  9320052 aagtctcttgcaaagtttagcagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggataggtctgacttccggtt 9319953  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    | ||| | |||| || ||||||||    
T  9319952 tatggtatgaacctgtataaattg 9319929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 18321628 - 18321935
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18321628 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattatgtt 18321727  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18321728 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttaattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcag-tgtgcttgagtaatttg 18321824  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    |||| ||||  | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  18321825 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtattcagatattactttttagtaaactttccttggaagtgcaagggggacataact-acttccggtt 18321923  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  18321924 tgtgaaaggaac 18321935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 18121578 - 18121895
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  18121578 aattctagagtcttaagagtttgtatctaatttctattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcta-gtaattttgtt 18121676  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  18121677 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgaac-atttg 18121775  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||  |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18121776 aagtctcttgatggttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 18121875  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18121876 tgtggaaggaacttgtataa 18121895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18679495 - 18679186
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  18679495 aattctagagtcttaagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtt 18679396  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  18679395 tgaa-ttagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcaggagcataggaagtctcttgaagttgtgtttgag-aatttg 18679298  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18679297 aagtctcttgctagttttagcaatgagcatttgtaatcagatattacatttttagtgaactgtccttggatgtgcaagggggacatgact-acttccggt 18679199  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    || ||||||||||    
T  18679198 ttatggaaggaac 18679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18718684 - 18718375
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  18718684 aattctagagtcttaagagtctgtatctgaattgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtt 18718585  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  18718584 tgaa-ttagaagtctcttacagttgtgcttgagcattagaagtctcttgactgtgttcaggagcataggaagtctcttgaagttgtgtttgag-aatttg 18718487  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||  | ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18718486 aagtctcttgctagttttagcaatgagcatttgtaatcagatattacatttttagtgaactgtccttggatgtgcaagggggacatgact-acttccggt 18718388  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    || ||||||||||    
T  18718387 ttatggaaggaac 18718375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Original strand, 14990057 - 14990276
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14990057 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtct 14990155  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14990156 cttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattatatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtggaagg 14990255  T
Q  335 aacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||  || ||||||||||||||    
T  14990256 aatctgtataaattgcttgtg 14990276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Original strand, 18152253 - 18152472
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18152253 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcagcaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtct 18152351  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18152352 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttctggtttgtggaagg 18152451  T
Q  335 aacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  18152452 aacctgtataaattgcttgtg 18152472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 17526202 - 17526515
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaac---aattttctttgtaattct 125  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||| |    
T  17526202 aattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacgttttttttttttgtaatttt 17526301  T
Q  126 gtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17526302 gtttgaatttaaaagtctcttgcagctgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttcagc-at 17526400  T
Q  226 ttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccg 322  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  17526401 ttgaactctcttgctatgtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacataattgacttccg 17526500  T
Q  323 gtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||  |||||||    
T  17526501 gtttgtaaaaggaac 17526515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 14990668 - 14990883
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14990668 tagaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtct 14990766  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  14990767 cttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaggggggacataactgacttccggtttgtgaaagg 14990866  T
Q  335 aacttgaataaattgct 351  Q
    ||| || ||||||||||    
T  14990867 aacctgtataaattgct 14990883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22673373 - 22673154
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22673373 tagacgtctcttgtagttgtgcttgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtct 22673275  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagg 334  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22673274 cttaataagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagg 22673175  T
Q  335 aacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  22673174 aacctgtataaattgcttgtg 22673154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Original strand, 20382863 - 20383053
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20382863 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtt 20382962  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20382963 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttg 20383053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1744833 - 1744635
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  1744833 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaaca-tattctttgtaattttgtt 1744735  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1744734 tgaattgagaagtctcttgcagttttgattgagcaatagaagtctcttgattatgttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 1744635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 43644577 - 43644269
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  43644577 aattctagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgct 43644478  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     |||  ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43644477 cgaa--tagaagtctcttgcagttacgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggatcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 43644380  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||  |   ||||| | |||||| |||||||||||||||| |   |||||||||| | |||||| |||||||||| ||  ||| |||||||| |    
T  43644379 aagtctcttgttggttttagcagtgagcagttgtaatcagatattatattttagtgaactctccttggaattgcaaggggggcaggact-acttccggat 43644281  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  43644280 tgtggaaggaac 43644269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 135 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22662661 - 22662441
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgctt-gagcaatttgaagtc 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22662661 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttttggagcataggaagtctcttgcagttgtgctttgagca-tttgaagtc 22662563  T
Q  234 tcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  22662562 tcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttacggtttgtggaag 22662463  T
Q  334 gaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  22662462 gaacctgtataaactgcttgtg 22662441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19956807 - 19957116
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19956807 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaaatttctttgtaattatgtt 19956906  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa-ttt 227  Q
    ||||  ||||||||||||||     ||||||||||   ||||||| |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||    
T  19956907 tgaa--tagaagtctcttgcttgcgtgcttgagcataggaagtctattgattttgttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgattgagtaagttt 19957004  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
     ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||| |   || |||||||||    
T  19957005 taagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggatagggct-acttccggt 19957103  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  19957104 ttgtggaaggaac 19957116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6407406 - 6407230
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6407406 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 6407308  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407307 tgaatcaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctctt 6407230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 337
Target Start/End: Original strand, 12758270 - 12758515
Alignment:
Q  93 tgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagc 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12758270 tgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtcttttgcagttgtgcttgagcattagaagtcttttgattgtgtttaggagc 12758369  T
Q  193 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactccca 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |     
T  12758370 ataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttaaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctcc 12758468  T
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||   |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12758469 ttaacagtgcaagggggacatgact-acttccggtttgtggaaggaac 12758515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16206970 - 16206772
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |    
T  16206970 agtcttaagagtctgtatctaatttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcta-gtaattctgtttgaattaa 16206872  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16206871 gaagtctcttgcatttttgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttgaagtctct 16206773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 345
Target Start/End: Original strand, 16681803 - 16682040
Alignment:
Q  110 ttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgca 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681803 ttttctttgtgattctgtttgaatttagaagtctcttggagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgca 16681902  T
Q  210 gttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaaggggg 306  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  16681903 gctgtgtttgagc-atttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttagaagtgcaaggtgg 16682001  T
Q  307 acaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16682002 acaggagtgacttctggtttgtggaaagaacttgtataa 16682040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24646012 - 24645779
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttc-tttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24646012 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcttttctaattctgt 24645913  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24645912 tagaa-ttataagtctcttgcagttgttcttgagcattagaagtctcttgattgtgttgaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-attt 24645815  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgta 263  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||    
T  24645814 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgta 24645779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26832729 - 26832448
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26832729 tgatttatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaat--agaagtctcttgcagttttg 26832632  T
Q  156 cttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    ||||||||   |||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | ||||    
T  26832631 cttgagcataggaagtctcttgacttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgag 26832532  T
Q  256 catttgtaatcagatatt---acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    || |||||||||||||||      |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  26832531 cagttgtaatcagatattttcttttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggact-acttcctgtttgtggaaggaac 26832448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Original strand, 30421903 - 30422081
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30421903 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaaca-ttttctttgtaattttgtt 30422001  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30422002 tgaatttagaagtctctcgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattctgttcaggagcataggaagtctcttgc 30422081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19707189 - 19706888
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707189 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 19707090  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || ||||||| ||||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||       || |||    
T  19707089 tgaa--taaaagtctcctgcagctatgcttgagcataggaagtctattgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagtt-tg-------aaattg 19707000  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||| | ||||||| ||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| || |    
T  19706999 aagtctcttgctagttttaggagtgagaagttgtaattagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-actttcgat 19706901  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  19706900 ttgtggaaggaac 19706888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 14989921 - 14990069
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14989921 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 14990020  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14990021 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgatcaatagaagtctcttg 14990069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 18152117 - 18152265
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18152117 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaccattttctttgtaattctgtt 18152216  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18152217 tgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 18152265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18772358 - 18772064
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  18772358 agagtctgtatctaatttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctgaaacaaatttctttgtaattctgtttgaa--taaaagtct 18772261  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||      
T  18772260 cttgcagttatgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtacttgagtagtttgaagtctcttgctagt 18772161  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattac----atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     |||| | |||||| |||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  18772160 gttagcagtgagcagttgtaatcagatattacttttttagtgaactctccttggaagtgcgagggggacaggact-acttctggtttgtgaaaggaac 18772064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Original strand, 14990532 - 14990680
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14990532 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtt 14990631  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14990632 tgaattcataagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 14990680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22662797 - 22662649
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22662797 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 22662698  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  22662697 tgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagtaatagaagtctcttg 22662649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21288055 - 21287774
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  21288055 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 21287958  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  21287957 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtacttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 21287858  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21287857 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcgttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 21287774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19153653 - 19153432
Alignment:
Q  95 ttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcat 194  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19153653 ttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtttcctgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcagtagcat 19153554  T
Q  195 ag-----gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactc 286  Q
    ||     |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  19153553 aggaagggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaggtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactc 19153455  T
Q  287 ccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  19153454 tccttggaagtgcaagggggaca 19153432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22673509 - 22673361
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22673509 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtatagtgaacaccggtgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 22673410  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  22673409 tgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagacgtctcttg 22673361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 45568416 - 45568697
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  45568416 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 45568513  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  45568514 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 45568613  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45568614 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgtaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 45568697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Original strand, 15934236 - 15934440
Alignment:
Q  136 agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctc 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15934236 agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatatcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctc 15934335  T
Q  236 ttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    || |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  15934336 ttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtgga 15934434  T
Q  332 aggaac 337  Q
    ||||||    
T  15934435 aggaac 15934440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22707973 - 22707777
Alignment:
Q  67 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  22707973 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatat 22707876  T
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||    
T  22707875 gaagtctcttgattttgttcttgagcatagggaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagtttgagcagtgagcatttgtaat 22707777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Original strand, 22462107 - 22462353
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22462107 aattctagagtcttaaaagtctgtatctgatttgtatggtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 22462206  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | ||  ||||||||||||| || | ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||| | |||     
T  22462207 taaa--tagaagtctcttgtaggtgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctgttgcacttgtatttgagtagttta 22462304  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat 277  Q
    ||||||||| | |  ||||| | |||| | || ||||||||||||||||    
T  22462305 aagtctcttgcaagttttagcagtgagtagttttaatcagatattacat 22462353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 15934116 - 15934277
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15934116 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattttgtttgaa--tagaagtct 15934213  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg 207  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    ||| |  |||||||||||||||||||    
T  15934214 cttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttg 15934277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21540605 - 21540326
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||    
T  21540605 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctctttctttagtgcttg 21540508  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   |||||||||||  ||||| |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||| |    
T  21540507 agcataggaagtctcttgcatgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtcgtattgagcagt 21540408  T
Q  260 tgtaatcagatattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||     |||   || |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21540407 tgt-----gattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggtgacatgactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataa 21540326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6407239 - 6407112
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  6407239 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtatg 6407140  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  6407139 tggaaggaacctgtataaattgcttgtg 6407112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28903119 - 28902915
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  28903119 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 28903022  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||||| |    
T  28903021 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagtaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttaaagtctcatgctaggtgtagtattgagcagt 28902922  T
Q  260 tgtaatc 266  Q
    |||||||    
T  28902921 tgtaatc 28902915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40002879 - 40002672
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  40002879 ttgtactgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 40002782  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa-tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  40002781 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 40002682  T
Q  259 ttgtaatcag 268  Q
    ||||||||||    
T  40002681 ttgtaatcag 40002672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21298665 - 21298503
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||| |    
T  21298665 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgctcg 21298568  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  21298567 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaa 21298503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36104877 - 36104774
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36104877 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtg-tcaacctcaaacatttttc-ttgtaattctgtt 36104780  T
Q  129 tgaatt 134  Q
    ||||||    
T  36104779 tgaatt 36104774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16206781 - 16206643
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16206781 gaagtctcttgctgttgtgcttgagca-tttgaagtctattgctagttttagcattgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaag 16206683  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16206682 tgcaaggggg-caggactgacttccggtttgtggaaggaac 16206643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17928734 - 17928618
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  17928734 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacatttttttttgtaattgtgtt 17928635  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttg 147  Q
    ||  | |||||||||||||    
T  17928634 tg--tctagaagtctcttg 17928618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16188664 - 16188563
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16188664 aattccagagtcttaagagtatgtatctgatttgtattgtgaacactagtgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtt 16188565  T
Q  129 tg 130  Q
    ||    
T  16188564 tg 16188563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2810474 - 2810357
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  2810474 agagtctgtatcggatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttga--ttataactct 2810377  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  2810376 cttgcagttgtgcttgagca 2810357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 352
Target Start/End: Original strand, 30422070 - 30422194
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30422070 gaagtctcttgctagttttagttgtgagcaattgtaatcagatattatatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttg 30422169  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  30422170 tggaaggaacctgtataaattgctt 30422194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 17519558 - 17519762
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  17519558 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 17519655  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||| |||||||||| ||| ||  || |   |||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||| ||     
T  17519656 agc-atagaagtcttttgctttagtgctttagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgatcag 17519754  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  17519755 ttgtaatc 17519762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 17701422 - 17701326
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattct 125  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17701422 aattatagagtcgtaagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataatattctttgtaattct 17701326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 22211798 - 22211911
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  22211798 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 22211895  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  22211896 agcattggaagtctct 22211911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1744639 - 1744541
Alignment:
Q  257 atttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1744639 atttgtaatcagatattacatagtgaactcctcttggaagtgcaagagggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 1744541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 337
Target Start/End: Original strand, 25850477 - 25850767
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||| ||||||  |||||||| |    
T  25850477 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttttgtgtaattgtgtttg--tttagaagac 25850574  T
Q  143 tcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaa 242  Q
    ||||||  || |||||||| |   |||| ||||||  | | | |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |       
T  25850575 tcttgcttttgtgcttgagtataggaagactcttgtgtttatgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgc--- 25850671  T
Q  243 gtttagta-atgagcatttgtaatcagatatta--catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     ||| |||  |||| | |||||||| |||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||    
T  25850672 -ttttgtacttgagtaattgtaatcggatattaattttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacatgac-aacttccggattgtggaaggaac 25850767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29379230 - 29379115
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  29379230 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 29379133  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  29379132 agcaaaggaagtctcttg 29379115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21298560 - 21298354
Alignment:
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctct 236  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||     
T  21298560 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctttgtgctgtagcaatttgaagtctca 21298461  T
Q  237 tactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgg 330  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  21298460 tactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtgg 21298361  T
Q  331 aaggaac 337  Q
    |||||||    
T  21298360 aaggaac 21298354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18557698 - 18557507
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18557698 tagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccacttattgtatatcaactgttaaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaa--tagaagt 18557603  T
Q  142 ctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    |||||||  || ||||||||||   |||||||||||  | ||| |  || ||||||||  |||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18557602 ctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgaacataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtgtctt 18557507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12193594 - 12193515
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12193594 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca 12193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12438022 - 12437943
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca 108  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12438022 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaca 12437943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22136266 - 22136380
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  22136266 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctctcgcctgcctgcttg 22136362  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22136363 agcattagaagtctcttg 22136380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 22167431 - 22167545
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  22167431 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 22167527  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22167528 agcattagaagtctcttg 22167545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8031679 - 8031593
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8031679 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 8031593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19460840 - 19460754
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19460840 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgc 19460754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19558518 - 19558432
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19558518 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgc 19558432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Original strand, 7018789 - 7018872
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  7018789 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttga--ttagaagtctct 7018872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 19505907 - 19506021
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  19505907 aattctagagtcttaagaatctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtttaa-accaaacatctttctatgtaattttgtt 19506005  T
Q  129 tgaatttagaagtctctt 146  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  19506006 tg--tttagaagtctctt 19506021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 23271616 - 23271731
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  23271616 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaatcctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 23271713  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  23271714 agcataggaagtctcttg 23271731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 1210212 - 1210405
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  1210212 aattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtccaa-accaaacatctttctgtgtaattttgtt 1210310  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca-ata-gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||  ||||||||||| ||||   | |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |  ||| ||  ||||||||||||   ||||||||||||    
T  1210311 tg--tttagaagtcttttgcttctgtgcttgagcatataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 1210405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36104759 - 36104694
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36104759 ttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 36104694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3843394 - 3843322
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  3843394 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttgaat 3843322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17879278 - 17879222
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17879278 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaacaattttctttgtaat 17879222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26120782 - 26120619
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26120782 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26120686  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  26120685 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattt 26120619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33052556 - 33052406
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||   ||||| | ||||| ||||    
T  33052556 aattctagagtcttaagagtctg-atttgttttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaaatgttcaa-tccaaactgatttctgtataatt-tgtt 33052460  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgt 184  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  33052459 tg--tttagaagtctcttgcatttttgcttgagcatatgaaatctcttgcttgtgt 33052406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 20260026 - 20260096
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  20260026 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 20260096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 21046656 - 21046726
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  21046656 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 21046726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 3349034 - 3349148
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3349034 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3349130  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3349131 agcattagaagtctcttg 3349148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 3359631 - 3359745
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  3359631 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 3359727  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  3359728 agcattagaagtctcttg 3359745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6160896 - 6160782
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6160896 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6160800  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6160799 agcattagaagtctcttg 6160782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9341017 - 9340903
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9341017 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9340921  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9340920 agcattagaagtctcttg 9340903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9368161 - 9368047
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9368161 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9368065  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9368064 agcattagaagtctcttg 9368047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 9856884 - 9856998
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  9856884 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 9856980  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9856981 agcattagaagtctcttg 9856998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 15781117 - 15781231
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15781117 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15781213  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15781214 agcattagaagtctcttg 15781231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 15791706 - 15791820
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  15791706 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 15791802  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15791803 agcattagaagtctcttg 15791820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18449243 - 18449129
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  18449243 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 18449147  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  18449146 agcattagaagtctcttg 18449129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19155924 - 19155854
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19155924 aattctagaatcttaaaagtttgtatctgatttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19155854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 337
Target Start/End: Original strand, 24678894 - 24679166
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttg 155  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |  |||||| |||||   ||||||||||||||||  |||||    
T  24678894 tgatttgtattgtgatcaccattgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatatttatgggtaattgtgttt--ttttagaagtctcttgcttttttg 24678991  T
Q  156 cttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    ||||||||   |||| ||||||  ||||| |   ||||||||||  |||||    ||||||||||| | ||||||||||||| ||   |||     ||||    
T  24678992 cttgagcataggaagactcttgcgtgtgtgc-ttagcataggaaacctctt----ttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgct---tttgtgcttgag 24679083  T
Q  256 catttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    || |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  24679084 caattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccagattgtggaaggaac 24679166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36077810 - 36077696
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36077810 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36077714  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36077713 agcattagaagtctcttg 36077696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36088396 - 36088282
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36088396 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36088300  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36088299 agcattagaagtctcttg 36088282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44480964 - 44480850
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  44480964 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 44480868  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  44480867 agcattagaagtctcttg 44480850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44491580 - 44491466
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  44491580 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 44491484  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  44491483 agcattagaagtctcttg 44491466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 241697 - 241583
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  241697 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 241601  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  241600 agcattagaagtctcttg 241583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 252282 - 252168
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  252282 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 252186  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  252185 agcattagaagtctcttg 252168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 795052 - 794938
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  795052 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 794956  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  794955 agcattagaagtctcttg 794938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 849374 - 849488
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  849374 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 849470  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  849471 agcattagaagtctcttg 849488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2810379 - 2810305
Alignment:
Q  201 tctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||    
T  2810379 tctcttgcagttgtgcttgagcagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcaaatattac 2810305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6150941 - 6150827
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  6150941 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 6150845  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  6150844 agcattagaagtctcttg 6150827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 13688975 - 13689089
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  13688975 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 13689071  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13689072 agcattagaagtctcttg 13689089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19128621 - 19128507
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  19128621 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19128525  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19128524 agcattagaagtctcttg 19128507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19139153 - 19139039
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     ||||||    
T  19139153 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgcttg 19139057  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19139056 agcattagaagtctcttg 19139039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26111104 - 26110990
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  26111104 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 26111008  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26111007 agcattagaagtctcttg 26110990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29076604 - 29076490
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  29076604 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 29076508  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29076507 agcattagaagtctcttg 29076490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29086855 - 29086741
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  29086855 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 29086759  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  29086758 agcattagaagtctcttg 29086741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32078103 - 32078217
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32078103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32078199  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32078200 agcattagaagtctcttg 32078217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 32088676 - 32088790
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  32088676 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtattgttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 32088772  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32088773 agcattagaagtctcttg 32088790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36292794 - 36292680
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36292794 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaactctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36292698  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36292697 agcattagaagtctcttg 36292680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36303397 - 36303283
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  36303397 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaactctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 36303301  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  36303300 agcattagaagtctcttg 36303283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27739533 - 27739450
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  27739533 tttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaact---aaccttattctttgtaatt-tgtttg--tttagaagtctcttgc 27739450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3220505 - 3220466
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220505 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3220466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12541297 - 12541254
Alignment:
Q  56 tgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541297 tgatttgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12541254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16746873 - 16746834
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746873 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16746834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18153610 - 18153571
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153610 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18153571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18158129 - 18158090
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158129 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18158090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 18769544 - 18769583
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769544 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18769583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19224807 - 19224768
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224807 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19224768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19418225 - 19418186
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418225 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19418186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 20161638 - 20161677
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161638 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20161677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20195829 - 20195790
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195829 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20195790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23370425 - 23370386
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23370425 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23370386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 23469868 - 23469907
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469868 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23469907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 30315103 - 30315142
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30315103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30315142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43248198 - 43248159
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248198 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43248159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 210560 - 210674
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  210560 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaatctcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 210656  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  210657 agcattagaagtctcttg 210674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 724183 - 724297
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  724183 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ttcaatctcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 724279  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  724280 agcattagaagtctcttg 724297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 24498609 - 24498650
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24498609 tttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaac 24498650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24634969 - 24634928
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24634969 tttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaac 24634928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 6318923 - 6318962
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318923 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6318962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19428800 - 19428761
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428800 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19428761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15598409 - 15598347
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaat--tttctttgtaattct 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  15598409 tattgtgaacacctctgattgtatatcaagtgtttaac--caaacaattatttctttgtaattct 15598347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17687632 - 17687598
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17687632 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 17687598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Original strand, 17917288 - 17917358
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  17917288 aattctagagttttaagagtttgtatctaatttttattgtgaatatcactaattgtatatcaagtgttcaa 17917358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 40213580 - 40213648
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaca-attttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  40213580 ttgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaa-gtcaaacatattttctctgtatttttgtttgaat 40213648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31214885 - 31214849
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214885 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 31214849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 12758233 - 12758272
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgt 68  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12758233 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgt 12758272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 20383070 - 20383116
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20383070 ttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggtttgtggaaggaac 20383116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 223
Target Start/End: Original strand, 15934229 - 15934263
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15934229 gagcataagaagtctcttgcagttgtgcttgagca 15934263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 337
Target Start/End: Original strand, 23470082 - 23470142
Alignment:
Q  276 atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23470082 atagtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 23470142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6407299 - 6407271
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6407299 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 6407271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Original strand, 23271819 - 23271866
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaact 338  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23271819 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaact 23271866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23363772 - 23363725
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaact 338  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23363772 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaact 23363725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29379159 - 29379055
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttg 261  Q
    ||||||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||    
T  29379159 aatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 29379060  T
Q  262 taatc 266  Q
    |||||    
T  29379059 taatc 29379055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 18188 - 18514
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18188 aattctaaagtctttagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 18287  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18288 tgaattgagaagtctgttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagctgtgcttgagcaacttg 18387  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||    
T  18388 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgagagacttccgatttgt 18487  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18488 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 18514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 1243 - 1568
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1243 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtt 1342  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1343 tgaattaaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgaagttgtgcttgagcaatttg 1442  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1443 aagtctcatactaagtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaagtgcaa-ggggacaagactgacttccggtttgt 1541  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1542 ggaaggaacctaaataaattgcttgtg 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 88023 - 88349
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  88023 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgtt 88122  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  88123 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatttg 88222  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  88223 aagtctcatactacgtttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatattgaactccccttggaagtgcaaaggggacatgtctgacttccggtttgt 88322  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  88323 ggaaggaacctgtataaattgcttgtg 88349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Original strand, 22553 - 22870
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22553 aattctagagtctttagagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 22651  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22652 tgaactaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttg 22750  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  22751 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggtagtgcaagggggacaggactgactttgggtttgt 22850  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaatt 348  Q
    | ||||||| || |||||||    
T  22851 gcaaggaacctgtataaatt 22870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18718 - 18412
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   || ||||||||||    
T  18718 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaatttc--ttataattctgtt 18621  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620 tgaattaagaagtctcttgcagttctgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 18521  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18520 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactcttcttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 18421  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  18420 ggaaggaac 18412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 6)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 49022 - 48712
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49022 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 48923  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  48922 tgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtggttgagc-atttg 48824  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48823 aagtctcttgttaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtt 48724  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  48723 tgtggaaggaac 48712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 839 - 1120
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    |  ||||||    
T  839 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttaatttagtgcttg 936  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  937 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagtaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 1036  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1037 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32207 - 32068
Alignment:
Q  33 ctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaa 132  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32207 ctagattcttcatagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatat-----gttcaacctcaagcatttttctttgtaattctgtttgaa 32113  T
Q  133 tttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  32112 tttggaagtctcttgcagttgttcttgagcatttgaagtctcttg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32109 - 31966
Alignment:
Q  196 ggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattg 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||   ||||||||| | |||    
T  32109 ggaagtctcttgcagttgttcttgagca-tttgaagtctcttgctaagtttagtatcgagtagtcttaatcagatattacattttagtgaactctccttg 32011  T
Q  293 gaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32010 gaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 31966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Original strand, 57196 - 57264
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  57196 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgttt 57264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Original strand, 57426 - 57472
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  57426 ttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 57472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 348
Target Start/End: Original strand, 7163 - 7483
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  7163 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaaaactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaacatttttctt-gtaattctgtt 7261  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7262 tgaattgagaagtatcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 7360  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7361 aaatctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtt 7460  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataaatt 348  Q
    |||||||||||| || |||||||    
T  7461 tgtggaaggaacctgtataaatt 7483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 6113 - 6420
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6113 aattctagagtcttaagagtctggatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtt 6212  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6213 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattaaaagtctcttgattgtgttcaggagcataagaagtcttttgcagttgtgcttgagc-atttg 6311  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  6312 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccattttgt 6411  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  6412 ggaaggaac 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 362 - 685
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  362 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtt 461  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  462 tgaatttagaattctcttgcagttgtgcttgagcattacaagtctcttgagtgtgttcaggagcataggaagtctattgtagttatgcttgaacaatttg 561  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  562 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacaaagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgt 661  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  662 ggaaggaacctgtataaattgctt 685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 349 - 248
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  349 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtt 250  T
Q  129 tg 130  Q
    ||    
T  249 tg 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2670 - 2350
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgattt-gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  2670 aattctaaagtcttaagagtatgtatctgattttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtttttctgt 2572  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2571 ttgaatttagaagtcttttgcagttgtgcttgagcattataagtctctttattgtgttcaggagcataggaagtcttttgcagttgtgcttgagcaattt 2472  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2471 gaagtctctttctatttttagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagtactaacttccggtttg 2372  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattg 349  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  2371 tggaaggaacctgtataaattg 2350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 76 - 382
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  76 aattctagagtcttaagagtctgtatatgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacttcaaacatttttctgtgtaattctgtt 175  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  176 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 273  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| || | |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  274 aagtttcatgctagttttagcaatgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactatccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgt 373  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  374 ggaaggaac 382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 332
Target Start/End: Original strand, 78778 - 79083
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  78778 aattctagggtctttagagtatgtatctcatttgtattgtaaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttctt-gtaattctgtt 78876  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78877 tgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttgagtaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 78976  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  78977 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttccggtt 79076  T
Q  326 tgtggaa 332  Q
    |||||||    
T  79077 tgtggaa 79083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 412 - 106
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  412 aattctagagtctttaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgt 313  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  312 ttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaggaagtt 213  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    |||||||| | |||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  212 gaagtctcctgctagttttagccgtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactccctttggaagtgcaggggggacaggactgacttccggtttg 113  T
Q  328 tggaagg 334  Q
    |||||||    
T  112 tggaagg 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5635
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5871 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 5772  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5771 tgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtcgcttgcagttgtgcttgatcaatttg 5672  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5671 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaat 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5881 - 5645
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 5782  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5781 tgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtcttttgattgtgttcaggagcataggaagtcgcttgcagttgtgcttgatcaatttg 5682  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5681 aagtctcttactaagtttagtagtgagcatttgtaat 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 2396 - 2722
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2396 aattctagagtctttaaagtatgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttcacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 2495  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   | | |  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2496 tgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgaaattctccttgagcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 2595  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  2596 aagtgtcttaataagtttcgtagtgggcatttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaagtctgacttccgatttgt 2695  T
Q  329 ggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||    
T  2696 gcaaggaacctgtataaattgcttgtg 2722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Original strand, 21398 - 21574
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21398 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtt 21497  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg 207  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21498 tgaa--tagaagtctcttgcagttgggcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttg 21574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 277
Target Start/End: Original strand, 21564 - 21674
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  21564 gaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtggttgagcagtttgaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatc 21663  T
Q  267 agatattacat 277  Q
    |||||||||||    
T  21664 agatattacat 21674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14806 - 14498
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14806 aattctaaagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 14707  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14706 tgaattt-gaagtttcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 14608  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||   |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14607 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagat-ttacattttagtgaactttccttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 14510  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  14509 tgtggaaggaac 14498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 352
Target Start/End: Original strand, 19045 - 19368
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  19045 aattctagagtcttaagagtctatatctgattggtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttgcattgtaattctgtt 19144  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19145 tgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaacactcttgcagttgtgcttgagc-atttg 19243  T
Q  229 aagtctcttactaag-tttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  19244 aagtctcttgctaagttttagcactaagcaattctaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggatgacaggactgacttccggtttg 19343  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  19344 tggaaggaacctgtataaattgctt 19368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7511 - 7204
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7511 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 7413  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 7313  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||  | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||| |    
T  7312 aagtctcttgctagttttagcagtgattaattgtaatcaaatattacatagtgaactctccttggaagtgtaagggggataggactgacttccagttttt 7213  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  7212 ggaaggaac 7204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 355
Target Start/End: Original strand, 26090 - 26400
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  26090 aattctagagtctttagagtctgtatctaatttgtactgtgaacaccactgattgtctatcaagtgttcaacctcaaacatttgtctttgtaattctgtt 26189  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26190 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgattgagcaatataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtacttgagcaatttg 26289  T
Q  229 aagtctcttactaagttta-gtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||  ||||||||||||||||    
T  26290 aagtctcttactaagtttaagtagtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaa-----------------agggggacaggactgacttccggtttg 26372  T
Q  328 tggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  26373 tggaaggaacctgtataaattgcttgtg 26400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 35335 - 35494
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttta-gtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaa 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35335 gaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttaagttgtgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactccccttggaa 35434  T
Q  296 gtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35435 gtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 35494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Original strand, 35227 - 35363
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  35227 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaaattctttgtaattatgtt 35326  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaat 165  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35327 tgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaat 35363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 84
Target Start/End: Original strand, 36604 - 36659
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgt 84  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36604 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactggttgt 36659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 84081 - 83776
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||    
T  84081 aattctagagtcttaagagtctatataagatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcttt-tagttctgtt 83983  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  83982 cgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagaaatttg 83883  T
Q  229 aagtctcttactaagttt-agtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttg 327  Q
    ||||||||| |||  ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  83882 aagtctcttgctagttttaagcagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttta 83783  T
Q  328 tggaagg 334  Q
    |||||||    
T  83782 tggaagg 83776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 268470 - 268163
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  268470 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 268371  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||  |||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||| || ||||||||||| | |||    
T  268370 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgtttaagc-atagaaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatatcttacaattgtgcttgagtagttt 268274  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||| |||| |||  || || | |||| | ||||||||| |||||     |||||||||| | |||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||    
T  268273 gaagtgtcttgctattttgagcagtgagaagttgtaatcaaatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggaataggact-acttccggtt 268175  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  268174 tgtggaaggaac 268163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 212045 - 211728
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  212045 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtt 211946  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  211945 tgaa-ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcatatgaagtctcttgcagttgagcttgagc-atttg 211848  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  211847 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggaatgacttccggtt 211748  T
Q  326 tgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  211747 tgtggaaggaacttgtataa 211728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 60884 - 60769
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  60884 ttgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 60787  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||  |||||||||||    
T  60786 agcaaaggaagtctcttg 60769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 60679 - 60633
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  60679 ttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaaggaac 60633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9286
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  9596 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgcattgtgaacactagtgattgtatatcaagtgttcaacctaaaacaattttctttgtaattatgtt 9497  T
Q  129 tgaattt-agaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  9496 tgaatttaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgagc-gttt 9398  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  9397 gaagtctcttgctaagtttagcagtgagaagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgact-acttccggt 9299  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  9298 ttgtggaaggaac 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1348 - 1039
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1348 aattctagaatcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtt 1249  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1248 tgaa-ttagaagtctcttgcagtcgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtccttgagc-atttg 1151  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  1150 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctcattgaaagtgcaagggggacatgactgacttccagtt 1051  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |  |||||||||    
T  1050 taaggaaggaac 1039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 309
Target Start/End: Original strand, 90479 - 90758
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  90479 aattctagagtcataagagtctgtatatgatttctattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattttgtt 90577  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90578 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttgaccaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 90677  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    ||||||||| |||  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  90678 aagtctcttgctagttttagcagttagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggaca 90758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 96
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagt 141  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  385 tagagtct-tatctgatttgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttttaattctgtttgaa--tagaagt 290  T
Q  142 ctcttgcagttttgcttgagcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttact 240  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||    
T  289 ctcttgcagttgtgcttgagc-atagtaagtctcttgagtgtgttcttgagcataagaattctcttgcagttttgcttgagtagtttgaagtctcttgct 191  T
Q  241 aagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt--acatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |   ||     |||||| |||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  190 a---ttgtgcttgagcaattgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtgcaagtgggacaggact-acttccggattgtggaaggaac 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1383
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1078 aattctagagtctttagagtctgaatctgacttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctt-gtaattatgtt 1176  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1177 tgaattcaaaagtctcttgcagttgtgcttgagcaataaaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttt 1275  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1276 aagtctcgtgctaagtttagcagtgagcagttgtaatcagatattactttttagtgaactctacttggaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 1374  T
Q  326 tgtggaagg 334  Q
    |||||||||    
T  1375 tgtggaagg 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7614 - 7336
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7614 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 7515  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7514 tgaatttagaagtctcttgtagttgtgcttcagcattagaactctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttg 7416  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggg 305  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7415 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggg 7336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 59698 - 59558
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59698 agtcttaagagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 59599  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  59598 gaagtctcttgcagttgtgcttgagaattagaagtctcttg 59558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 59598 - 59460
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattgg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||   ||||||||||   |||||||||| | ||||    
T  59598 gaagtctcttgcagttgtgcttgag-aattagaagtctcttgctagttttagtagtgagcagttgta---agatattacattttagtgaactctccttgg 59503  T
Q  294 aagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  59502 aagtgcaaggggtacatgact-acttccggtttgtggaaggaac 59460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8844 - 8602
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8844 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaagctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 8746  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8745 tgaattatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagc-atttg 8647  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt 273  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8646 aagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatatt 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9646 - 9337
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 9547  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||    
T  9546 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttaattgtgttcaggagcatagaaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttg 9449  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  9448 aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaaggggaacaggactgacttctggtt 9349  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  9348 tgtgaaaggaac 9337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 74271 - 73962
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  74271 aattctacagtcttaagagtctatatctgatttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 74172  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  74171 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttaattgtgttcaggagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 74074  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  74073 aagtctcttgctaagtttaacagtgagcaattgtaatcaaatattaaattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtt 73974  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  73973 tgtggaaggaac 73962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9657 - 9344
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaac----accactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattc 124  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  9657 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaattaaaaccactggttgtatatcaaatgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattc 9558  T
Q  125 tgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9557 tgtttgaatt-agaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgattgtgttcaggagcatagtaagtctcttgcagttgtgctttagc-a 9460  T
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttcc 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459 tttgaagtctcttgctaagtttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacaggactgacttcc 9360  T
Q  322 ggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  9359 ggtttgtggaaggaac 9344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 27853 - 28158
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact-tcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27853 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttatattgtgaaaatcactgattgtatatcaagtgttcaaccctcaaacatttttctgtgtaattctgt 27952  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||      ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27953 tt------agaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-attt 28045  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28046 gaagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtaattagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggt 28145  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  28146 ttgtggaaggaac 28158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 19890 - 20200
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  19890 aattctagagtcttaagagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctgtt 19989  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19990 tgaa-ttagaagtcatttgcagttgtgcttgagcattagaaatctcttgattgtgttcaaaagcgtaggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 20088  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    ||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20089 aagtctcttgctatgtttagcgttgagcagttgtaataagatattacatttttagtgaactctctttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggt 20187  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  20188 ttgtggaaggaac 20200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 99629 - 99825
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99629 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 99728  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    ||| |  |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  99729 tgaattcagaagtctattgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagcaat 99825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29483 - 29168
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||| |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29483 aattctaaagtcttaatagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtt 29384  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  29383 tgaa--tataagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttttttcttgagcataggaaacctcttgcaattgtgcttgagtagtttg 29286  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatat--tacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggttt 326  Q
    ||||||||| |||  || || | ||||||  | |||||||||||      |||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29285 aagtctcttgctattttgagcagtgagcaactataatcagatatggattttagtgaacactccatggaagtgcaagggcgacaagact-acttccggttt 29187  T
Q  327 gtggaaggaacttgaataa 345  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  29186 atggaaggaacttgtataa 29168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 310
Target Start/End: Original strand, 99795 - 99969
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  99795 tagaagtctcttgccgttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagc-atttaaagtct 99893  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaa 310  Q
    ||||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  99894 cttaccaagtttagtagtcagcaattataataagatattacatagtgaactctccgtggaagtgcaagggggacaa 99969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 351
Target Start/End: Original strand, 110298 - 110342
Alignment:
Q  307 acaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgct 351  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  110298 acaacactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgct 110342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 10530 - 10838
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||    
T  10530 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctt 10629  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630 tga--ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 10727  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    |||||||||    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||    
T  10728 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtagtcagatattactttttagtgaacttttcttggaagtgcaagggggacaggact-acttttggtt 10826  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  10827 tgtggaaggaac 10838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15502
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||    
T  15194 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctt 15293  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294 tga--ttagaagtctcttgtagttgtgcttgagcatcagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 15391  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    |||||||||    ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||    
T  15392 aagtctcttgctaagtttagcagtgagcagttgtagtcagatattactttttagtgaacttttcttggaagtgcaagggggacaggact-acttttggtt 15490  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  15491 tgtggaaggaac 15502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 8)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 142784 - 142511
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  142784 aattctagagtcttaagagtccgtacctgatttgtattgtgaactccactgattatatatcaagtattcaacctcaaacatttttctt-gtaattctgtt 142686  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  142685 tgaattaagaattctcttgtagttatgtttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgcgcttgagcaatttg 142586  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagg 303  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  142585 aagtctcttgctagttttagtagtgagcaattgtaattagatattacatagtgaactctccttagaagtgcaagg 142511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 135 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46249 - 46030
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46249 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtct 46151  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||    
T  46150 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaaccagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtaga 46051  T
Q  332 aggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  46050 aggaacctgtataaattgctt 46030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 135 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 63923 - 63704
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  63923 tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagc-atttgaagtct 63825  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatta---catagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtgga 331  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     |||||||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  63824 cttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattattttttagtgaactctccttcaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgga 63725  T
Q  332 aggaacttgaataaattgctt 352  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  63724 aggaacctgtataaattgctt 63704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 64058 - 63911
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  64058 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-ataatctttgtaattctgtt 63960  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  63959 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 63911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46384 - 46237
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||||    
T  46384 aattttagagtctttagagtctgtatctgatttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaa-gataatctttgtaattctgtt 46286  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46285 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 46237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 146
Target Start/End: Original strand, 59705 - 59788
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  59705 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttttgtgtcattctgtttga--ttagaagtctctt 59788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46277 - 46249
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46277 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 46249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 63951 - 63923
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  63951 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaat 63923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 103260 - 102948
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  103260 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtatacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtt 103161  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  103160 tgaa-ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcataagtctcttgattgtgttcaggagcatagcaagtctcctgtagttgtgcttgagc-atttg 103063  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattac----atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggt 324  Q
    |||||| || ||  |||| | | ||| || |||||||||||||||||     |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  103062 aagtcttttgcttggtttggcagtgaacagttgtaatcagatattacttttttagtgaactatccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggt 102963  T
Q  325 ttgtggaaggaactt 339  Q
    |||||||||||||||    
T  102962 ttgtggaaggaactt 102948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7515 - 7308
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7515 aattctagagtcttaagagtctatatctgatttgtactgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 7416  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7415 tgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaaaactcttgcagttgtgcttgagtaatttg 7316  T
Q  229 aagtctct 236  Q
    ||||||||    
T  7315 aagtctct 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2914 - 2611
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2914 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatt------gcgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatttcctttgtaattctgtt 2821  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  2820 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgtttgagtagtttg 2723  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg-t 324  Q
    ||||||||| | |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  2722 aagtctcttgccagttttagtagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgtaagtgcaagggggacaagact-acttccggtt 2624  T
Q  325 ttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||    
T  2623 ttgtggaaggaac 2611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Original strand, 32208 - 32516
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  32208 aattctagagtattaagagtctgtatcagatttgtattatgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttcattgtaattctgtt 32307  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32308 tga--ttagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaagtctcttgatttagttcttgagtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttg 32405  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32406 aagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacattttagtgaactctccttggaaatgcaagggggacaagact-acttccggtt 32504  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||    
T  32505 tgtggaaggaac 32516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 148 - 351
Target Start/End: Original strand, 24319 - 24521
Alignment:
Q  148 cagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagttta 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24319 cagttatgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagca-tttgaagtctcttactaagttta 24417  T
Q  248 gtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaat 347  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  24418 gtagtgagcaattgtaataagatattacatagtgaactctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaatctgtataaat 24517  T
Q  348 tgct 351  Q
    ||||    
T  24518 tgct 24521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 81086 - 80776
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  81086 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttctttgtgattctgt 80987  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||||||| |||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||    
T  80986 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatcaagtatcttgattttgttcttgagcataggaaatgtcttgtagttgtgcttgagtagttt 80889  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||| | |  ||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    |||||||||| | |||||||| ||| | |||||  ||| ||||||||    
T  80888 gaagtctcttgccagttttaggagtgagcagttgtaagtagatattacatttttagtgaactctccttggaagtacaatgaggacaggact-acttccgg 80790  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    
T  80789 tttgtggaaggaac 80776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 170
Target Start/End: Original strand, 6024 - 6164
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  6024 aattctagagtctttagagttagcatctgatgtgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaacctcaaccatttttc-ttgtaattttgtt 6122  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaag 170  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6123 tgaattcagaagtctcttgtagttgtgcttgagcaatagaag 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14426 - 14387
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 54536 - 54575
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54536 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 54575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 158799 - 158553
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  158799 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttacattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtt 158700  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  |||||||||||| |   | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  158699 tgaa--tagaagtctctttcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcatgagcagtttg 158602  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat 277  Q
    ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  158601 aagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaatcagatattacat 158553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36910
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttcttt-gtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  37089 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgt 36990  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989 ttgaatt-agaagtcccttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 36910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 135149 - 134970
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttcttt-gtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  135149 aattctagagtcttaagagtttgtatctgatttgtattttgaacaccactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgt 135050  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  135049 ttgaatt-agaagtcccttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36897 - 36810
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36897 tgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgtaagtgcaaaggggataggact-acttctggtttgtggaaggaac 36810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 134957 - 134870
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  134957 tgagcaattgtaatcagatattacattttagtgaactctccttgtaagtgcaaaggggataggact-acttctggtttgtggaaggaac 134870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 144596 - 144286
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  144596 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtattgtggacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgt 144497  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  144496 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgatttagttcttcagcataggaaatctcttgcatttgtgcttgagtaattt 144399  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccgg 323  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||| ||||||||  |    |||||||||| | || |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  144398 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcaattgtaaacagatatttgatttttagtgaactctccttagaagtgcaagggggacatgact-acttccgg 144300  T
Q  324 tttgtggaaggaac 337  Q
     |||||||||||||    
T  144299 attgtggaaggaac 144286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8009
Alignment:
Q  58 atttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgct 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  8294 atttgtattgggaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcatacaattttttttgtaattctgtttgaat--agaagtatcttgcagttgtgct 8197  T
Q  158 tgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagca 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  8196 tgagcataagaagtctcttgattgcgttcaggagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcaatgagca 8097  T
Q  258 tttgtaatcagatattaca----tagtgaa----ctcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     ||||||||||||||||||    ||||| |    ||| | ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8096 attgtaatcagatattacatttttagtgtactctctctccttggaagtgcaaggggggcagaactcacttccgatttgtggaaggaac 8009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 40866 - 40980
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  40866 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 40962  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40963 agcattagaagtctcttg 40980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 33315 - 33354
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33315 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 33354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 1
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  165 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtt 66  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagca 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 tgaatttataagtctcttgcagttgtgcttgaacattagaagtctcttgattgtgttcaggagca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6002 - 5899
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||    
T  6002 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgcttgtgtgcttg 5905  T
Q  160 agcaat 165  Q
    ||||||    
T  5904 agcaat 5899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5782
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccat 290  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |    
T  5927 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcct 5828  T
Q  291 tggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5827 tggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 5782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1506 - 1215
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||       
T  1506 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtagatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttga--ttagaattttcttgctta 1409  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaa 251  Q
    | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||  |||||||     
T  1408 tgtggttgagca-tagaggtctcttgattgtgttcaggagcataggaaatctcttgcagttatgcttgagtattttaaagtctcttgctagttttagtag 1310  T
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | |||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1309 tgagcaattgtaatcagatattactttttagtgaactctccttggaagtgcaagggg-atatgact-acttccggtttgtggaaggaacttgtataa 1215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 337
Target Start/End: Original strand, 16566 - 16859
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtct 143  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16566 agagtctgtatctgatttgtcttgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctcaaaaaaaaatatttgtaattctgtttgaat--agaagtct 16663  T
Q  144 cttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaag 243  Q
    |||||||||  |||||||||   |||| |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||      
T  16664 cttgcagttgagcttgagcataggaagcctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagt 16763  T
Q  244 tttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||| | |||||| || |||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16764 tttagaagtgagcagttataatcagatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggggacgtgact-acttccggtttgtggaaggaac 16859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2349 - 2106
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2349 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtatttgtgaacgtcgctaattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgt 2250  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||   |||    
T  2249 ttgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttttttcttgagcataggaaatctcttgcagtttttcttgagttgttt 2152  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatatt 273  Q
    |||||||||| |||  || || | ||||||||||||||||||||||    
T  2151 gaagtctcttgctattttgagcagtgagcatttgtaatcagatatt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Original strand, 3819 - 3950
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  3819 aattctagagtcttaagagtcta-atttgttttgtattgtgaacaccgctgattgtatattaagtgttcaatctcaaacattattctgtgtaattgtgtt 3917  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  |||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  3918 tg--tttataagtctcttgcttttgtgcttgagca 3950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 3259 - 3416
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaag 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3259 gaagtctcttgcagttgtgcttgagca-tttgaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaag 3357  T
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3358 tgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 3416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 3152 - 3298
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  3152 aattctagagtctttagagtctatatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattttgtt 3250  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctctt 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  3251 tgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctctt 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Original strand, 2432 - 2586
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2432 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaa-ttagaagtctctttcagt 2530  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttg 207  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2531 tgtacttgaacattagaagtctcttgattgtgttcaggaacataggaagtctcttg 2586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 167 - 337
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2746
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  | |||||| ||||||||    
T  2576 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagca-tttgaagtctcttgctagttttaacagtgagcagttgtaatc 2674  T
Q  267 agatattacat---agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2675 agatattacattttagtgaactctccttggaagtgcaagggc-acaggact-acttccggtttgtggaaggaac 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Original strand, 2214 - 2449
Alignment:
Q  29 aattctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  2214 aattctagagtcttaaagagtctgtatctgatttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccttaaaaaaatttctttgtaattctgt 2313  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||   ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||    
T  2314 ttgaa--tagaagtctattgcagttgtacttgagcataggaagtctcttgatttagttctcgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttaagtagttt 2411  T
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||    
T  2412 gaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaat 2449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13732 - 13424
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || || ||||    
T  13732 aattctagactcttaagagtctgcatctgatttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttatatttttgtt 13633  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | ||  ||||||||||||||   | | ||||||||  |||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13632 ttaa--tagaagtctcttgcttgtgtacttgagcataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtaatttg 13535  T
Q  229 aagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtt 325  Q
     |||||||| |||  ||||| | |||||| | | ||||||||||||||   |||||||||| | |||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||    
T  13534 tagtctcttgctagttttagcagtgagcagtcgcaatcagatattacattttagtgaactctccttggtagtgtaagggggacaggac-aacttccggtt 13436  T
Q  326 tgtggaaggaac 337  Q
    |||| |||||||    
T  13435 tgtgaaaggaac 13424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 698 - 900
Alignment:
Q  32 tctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  698 tctagagtcttaagagtctgtatctgatttttattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctatttga 797  T
Q  132 atttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaag 231  Q
    |  ||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||    
T  798 a--tagaagtatcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgatttagttcttaagcataggaaatctcttgcagttgtgctttagtagtttgaag 895  T
Q  232 tctct 236  Q
    |||||    
T  896 tctct 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Original strand, 914 - 957
Alignment:
Q  44 agagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtata 87  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  914 agagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtata 957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 5855 - 6017
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtg----cttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattg 292  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5855 gaagtctcttgcagttgtgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaagtttagtagtgagcgtttgtaatcagatattacttagtgaactccccttg 5954  T
Q  293 gaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5955 gaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 6017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 5747 - 5870
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  5747 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttcattataattctgtt 5846  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5847 tgaatttagaagtctcttgcagtt 5870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13238 - 13114
Alignment:
Q  52 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13238 tatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagt 13139  T
Q  152 tttgcttgagcaatagaagtctctt 176  Q
    | ||||||| || ||||||||||||    
T  13138 tgtgcttgaacattagaagtctctt 13114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13153 - 13083
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcag 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  13153 gaagtctcttgcagttgtgcttgaac-attagaagtctctttctagttttagcagtgagcagttgtaatcag 13083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 37156 - 37320
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  37156 aattctagagtcttaagagtcattatctgatttgtattgtgaacacctctgattgtatat-aagtgttcaaccttaaacgattttctttgtaattctgtt 37254  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatag 196  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcatag 37320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41849 - 41685
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  41849 aattctagagtcttaagagtcattatctgatttgtattgtgaacacctctgattgtatat-aagtgttcaaccttaaacgattttctttgtaattctgtt 41751  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatag 196  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41750 tgaat--agaagtctcttgcagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattgtgttcaggagcatag 41685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 337
Target Start/End: Original strand, 37360 - 37476
Alignment:
Q  223 aatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgactt 319  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |   |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  37360 aatttcaagtctcttgctaagtttagcagtcagcaattgtaatcagatattagattttagtaaactctccttggaagagcaagggggacaggact-actt 37458  T
Q  320 ccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  37459 ccgatttgtggaaggaac 37476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41645 - 41556
Alignment:
Q  223 aatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggaca 309  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |   |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  41645 aatttcaagtctcttgctaagtttagcagtcagcaattgtaatcagatattagattttagtaaactctccttggaagagcaagggggaca 41556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1007 - 802
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1007 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 908  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |   ||||||||||||||   | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||    
T  907 taa---tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcaggagcatagggaaactcttgcttgtgtgcttgagtagtttg 811  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  810 aagtctctt 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26016 - 25840
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  26016 aatagaagtctcgtgattgtgttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaac-atttgaagtctcttgctaagtttagcaatgagcagttgt 25918  T
Q  263 aatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||    |||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25917 aatcagatattacatttttagtgaactctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaac 25840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29315 - 29233
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29315 ttgtattgtgaacacacttgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 29233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 404 - 609
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  404 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacacaacaaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 503  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    | |   ||||||||||||||   | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||    
T  504 taa---tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctcttgattgtgttcaggagcatagggaaactcttgcttgtgtgcttgagtagtttg 600  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  601 aagtctctt 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9630 - 9347
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttt--tgct 157  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||    
T  9630 ttgtactgtgaacaccactgatggtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaatactgtttgaa--tagaagtctcttgctttttagtgct 9533  T
Q  158 tgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagca 257  Q
    ||||||   |||||||||||  ||||| |  ||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  9532 tgagcataggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 9433  T
Q  258 tttgtaatcagat---atta--catagtga-actcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     |||||||||| |   ||||  | |||| | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9432 gttgtaatcagttgtgattaagcttagttatactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaac 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 4350 - 4556
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  4350 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 4447  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||| ||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  4448 agcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 4547  T
Q  260 tgtaatcag 268  Q
    |||||||||    
T  4548 tgtaatcag 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38817
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  38536 ttgtatagtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 38633  T
Q  160 agcaatag-aagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  38634 agc-atagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcctgagaaatttgaagtgtcatactaggtgtagtattgagcag 38732  T
Q  259 ttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  38733 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggatgtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaac 38817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 1580 - 1860
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  1580 ttgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 1677  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  1678 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcgtactaggtgtagtattgagcagt 1777  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1778 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2890
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2994 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtg-tcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtt 2896  T
Q  129 tgaatt 134  Q
    ||||||    
T  2895 tgaatt 2890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2875 - 2810
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2875 ttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtg 2810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5189
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5319 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgcacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtt 5220  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgag 161  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5219 tgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgag 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22700 - 22496
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||    
T  22700 aattctagagtcttaagagtttcaa-ctgatttgtattgtaaataccactgatggtatatcaagtgttcaaccttaaac-attttctttgtaattctttt 22603  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttg 228  Q
    ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||   |||||||||||  | ||| |   ||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||    
T  22602 tgaa--tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcgtttgtgctaaagcataggaaacctcttgctattgtgcttgagtagtttg 22505  T
Q  229 aagtctctt 237  Q
    |||||||||    
T  22504 aagtctctt 22496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5213 - 5097
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||  ||| | | | |||| ||||||||||||||||||    |||| |||||   |||    
T  5213 gaagtctcttgcagttgtgcttgagtagttttaagtctcttgctagttttcgcagtaagcagttgtaatcagatattacatttttagttaactctggttg 5114  T
Q  293 gaagtgcaagggggaca 309  Q
    |||||||||||||||||    
T  5113 gaagtgcaagggggaca 5097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 149 - 337
Target Start/End: Original strand, 111192 - 111381
Alignment:
Q  149 agttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttag 248  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  111192 agttgtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgtttgagc-atttgaagtctcttgttaagtttag 111290  T
Q  249 taatgagcatttgtaatcagatattac---atagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     | |||| | |||||||||||||||||    ||||||| || | ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  111291 cagtgaggaattgtaatcagatattaccttttagtgaaatctccttggaagtgcaagagggacaaga-tgactaccggtttgtggaaggaac 111381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4777 - 4496
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  4777 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 4680  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa-tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||   | |  ||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  4679 agcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 4580  T
Q  259 ttgtaatcagat---att--acatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||| |   |||  || |||| |||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4579 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 4496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 1387 - 1667
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  ||||||    
T  1387 ttgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttactttagtgcttg 1484  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  1485 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcgtactaggtgtagtattgagcagt 1584  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1585 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 1667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32651 - 32448
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  32651 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 32554  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  32553 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 32454  T
Q  259 ttgtaa 264  Q
    ||||||    
T  32453 ttgtaa 32448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8213 - 8039
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||    
T  8213 agaagtctcttgattgtattcaggggcgtaggaaatctcttgcagttgtgcttgaatagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaat 8114  T
Q  266 cagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||   || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8113 cagatattacattttactgaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttattggaaggaac 8039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 4433 - 4549
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4433 aattctagagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttgtaattgtgtt 4531  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  4532 tg--tttagaagtctcttgc 4549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Original strand, 1945 - 2060
Alignment:
Q  43 tagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtc 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1945 tagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccgctgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaaaattttttgtaattctgtttgaa--tagaagtc 2042  T
Q  143 tcttgcagttttgcttga 160  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2043 tcttgcagttgtgcttga 2060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 345
Target Start/End: Original strand, 2618 - 2798
Alignment:
Q  167 gaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||     
T  2618 gaagtatcttgattttgttcttgagcatatgaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt-aagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaata 2716  T
Q  267 agatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    ||||||||||    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2717 agatattacatttttagtgaactctccttggaagtgaaagggggacatgact-acttccggattgtggaaggaacttgtataa 2798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5695 - 5579
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  5695 aattctagagtctttaaagtttgcatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttc-ttataattctgtt 5597  T
Q  129 tgaatttagaagtctctt 146  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5596 tgaattaagaagtctctt 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5588 - 5509
Alignment:
Q  228 gaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaaggggga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5588 gaagtctcttactaagtttagtagtgagcaattgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaaggggga 5509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 117
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7668
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttcttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7580 aattctagagtctttagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcttt 7668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 20825 - 21105
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  20825 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattatttgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 20922  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatt 259  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| | |    
T  20923 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagtagt 21022  T
Q  260 tgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||| |   |||  || ||||| ||| | | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21023 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaacactccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 21105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 2125 - 2331
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  2125 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctatttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 2222  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||| ||||||| |||||| ||  || |  ||||| |||||||||||||||    |||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  2223 agc-atagaagcctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcatgcatgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 2321  T
Q  259 ttgtaatcag 268  Q
    ||||||||||    
T  2322 ttgtaatcag 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18884 - 18679
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtatt-gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  18884 aattctagagttttaagagtcg-tatctgatttgtatttgtaaacaccactgattttatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctat 18787  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    | | |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||   | |||    
T  18786 ttgaa--tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttctgcttgagcataggaaatctcttgtagttgtgcttgcatagttt 18689  T
Q  228 gaagtctctt 237  Q
    ||||||||||    
T  18688 gaagtctctt 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 352
Target Start/End: Original strand, 44418 - 44607
Alignment:
Q  166 agaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaat 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | ||| || |||||||    
T  44418 agaagtttcttgattgtgttcaagagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttcctagttttagcagtgaccaattgtaat 44517  T
Q  266 cagatattacata----gtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgctt 352  Q
    || |||||||||     |||||||| | ||| |||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44518 caaatattacattttttgtgaactctccttgaaagtgcaaaggcgacatgact-acttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgctt 44607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 44343 - 44416
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44343 ttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaataaatttctttgtaattctgtttgaat 44416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Original strand, 2336 - 2516
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  2336 aatagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgt 2435  T
Q  263 aatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||| |   |||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  2436 aatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaagggagacaggactgactttcggtttgtggaaggaac 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 2265 - 2380
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||   | ||||||    
T  2265 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgcttgtgtgcttg 2362  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  2363 agcataggaagtctcttg 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Original strand, 475703 - 475907
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  475703 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 475800  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  475801 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 475900  T
Q  259 ttgtaat 265  Q
    |||||||    
T  475901 ttgtaat 475907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 265
Target Start/End: Original strand, 482223 - 482427
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  482223 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 482320  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| |||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  482321 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 482420  T
Q  259 ttgtaat 265  Q
    |||||||    
T  482421 ttgtaat 482427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 131
Target Start/End: Original strand, 157078 - 157149
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  157078 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga 157149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 333
Target Start/End: Original strand, 1960 - 2111
Alignment:
Q  184 ttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagt 280  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | || ||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  1960 ttcaagagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgcgcagttgtaatcagatattacattttagt 2059  T
Q  281 gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaag 333  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  2060 gaactctccttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaag 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 76887 - 76748
Alignment:
Q  45 gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctc 144  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  76887 gagtgtctatttgatttgtactatgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacccgaaacatatttctttgtaattctgtttgaa--tagaagtctc 76790  T
Q  145 ttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttc 186  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  76789 ttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttgattttgttc 76748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 76775 - 76626
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattacat--agtgaactc 286  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||| | ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| |||||||||||||||   |  |||||||||    
T  76775 gagcataggaagtctcttgattttgttcttgagtagtttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattgattttagtgaactc 76676  T
Q  287 ccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  76675 tctttggaagtgcaagggggacaggact-acttccggtttgtggaaggaac 76626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 61392 - 61110
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  61392 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 61295  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg-attgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagca 257  Q
    ||||   |||||||||||  || ||| |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  61294 agcataggaagtctcttgctttttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgcgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 61195  T
Q  258 tttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
     || ||||| |      |||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  61194 gttataatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 61110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35306 - 35144
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  35306 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 35209  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  35208 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaa 35144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35125 - 35072
Alignment:
Q  213 gtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  35125 gtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 35072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Original strand, 6905 - 7067
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  6905 ttgtaatgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 7002  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7003 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaa 7067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 268
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7141
Alignment:
Q  213 gtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  7086 gtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcag 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Original strand, 40763 - 41044
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  40763 ttgtattgtgaaaaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 40860  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||   | |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| || || || ||||||     
T  40861 agcataggaagtctcttgctttattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctacgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtaatattgagcag 40960  T
Q  259 ttgtaatcag-----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |      |||| | |||| ||| || | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40961 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 41044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 266
Target Start/End: Original strand, 59309 - 59512
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  59309 ttgtattgtaaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 59406  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||    
T  59407 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactagg--tagtattgagcat 59504  T
Q  259 ttgtaatc 266  Q
    ||||||||    
T  59505 ttgtaatc 59512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10174 - 10113
Alignment:
Q  70 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10174 aacaccattgattgtatatcaagtattcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttga 10113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 175167 - 175092
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgatt---gtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  175167 ttgtattgtgaacatcactgattattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaat 175092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24089 - 23993
Alignment:
Q  259 ttgtaatcagatattacatagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24089 ttgtaatcagatattacatagtgaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattggttgtg 23993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1505
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||| |||    
T  1300 aattcttgagtcttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaagc-attttctgtgtaattttgt 1398  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaattt 227  Q
    |||  ||||||||||||||||  || ||| | ||||   ||||  |||||  | || ||  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||    
T  1399 ttg--tttagaagtctcttgcttttgtgcataagcataggaagagtcttgtgtttg-tcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtaattt 1495  T
Q  228 gaagtctctt 237  Q
    ||||||||||    
T  1496 gaagtctctt 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1569
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  1454 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 1551  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  1552 agcataggaagtctcttg 1569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 474
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  560 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 8068 - 8154
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8068 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgc 8154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 127489 - 127210
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||||||  || ||||||||||||     ||||||    
T  127489 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-attttatgtgtaattttgtttga--ttggaagtctcttgcctgcgtgcttg 127393  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaagtttagtaatgagcat 258  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  127392 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 127293  T
Q  259 ttgtaatcag----atattacatagt-gaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||| |     |||| | |||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  127292 ttgtaatctgtggattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaac 127210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16448 - 16365
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16448 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttg-attaagaagtctct 16365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 140647 - 140608
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140647 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 140608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 10205 - 10317
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  10205 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 10301  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  10302 agcattggaagtctct 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 29212 - 29324
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  29212 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 29308  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  29309 agcattggaagtctct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 337
Target Start/End: Original strand, 29412 - 29460
Alignment:
Q  288 cattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29412 cattggaagtgcaagggggactagact-acttccggtttgtggaaggaac 29460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10381 - 10266
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  10381 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 10284  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  10283 agcataggaagtctcttg 10266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20282 - 20136
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  20282 ttgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattcagtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 20185  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgc 208  Q
    ||||   ||||||||||| |||  | |  ||||| ||||||||||||||    
T  20184 agcataggaagtctcttgcttgattgcttgagcaaaggaagtctcttgc 20136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20089 - 20016
Alignment:
Q  195 aggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcag 268  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  20089 aggaagtctcttgcttgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcag 20016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1047 - 961
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1047 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1662 - 1576
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  1662 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttga--ttagaagtctcttgc 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11420 - 11258
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |  ||||||    
T  11420 ttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctattgctttagtgcttg 11323  T
Q  160 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaa 224  Q
    ||||   ||||||||||| ||  || |  ||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  11322 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagcaa 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11263 - 11186
Alignment:
Q  189 gagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatc 266  Q
    ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||||    
T  11263 gagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtggtattgagcagttgtaatc 11186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 402
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  488 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaa--tagaagtctcttgc 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4868 - 4782
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  4868 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaa--tagaagtctcttgc 4782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 417 - 357
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  417 aatagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4797 - 4737
Alignment:
Q  163 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 223  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  4797 aatagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 4737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 175
Target Start/End: Original strand, 885 - 997
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  ||||||    
T  885 ttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttg 981  T
Q  160 agcaatagaagtctct 175  Q
    |||| | |||||||||    
T  982 agcattggaagtctct 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5711 - 5587
Alignment:
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca----tagtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttc 320  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  5711 tttgaagtctcttgctagttttagcagtgagcagttgtaatcagatattacagttttagtgaactctcgttggaagtgcaagggggataggactgacttc 5612  T
Q  321 cggtttgtggaaggaacttgaataa 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  5611 cggtttgtggaaggaacttgtataa 5587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 337
Target Start/End: Original strand, 1 - 209
Alignment:
Q  135 tagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |    
T  1 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaatttgaagtgt 100  T
Q  235 cttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgt 328  Q
    |  |||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  101 caaactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgt 200  T
Q  329 ggaaggaac 337  Q
    |||||||||    
T  201 ggaaggaac 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1836 - 1722
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  1836 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 1740  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  1739 agcattagaagactcttg 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6941 - 6826
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||    
T  6941 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattatgtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgctttagtgcttg 6844  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||   |||||||||||    
T  6843 agcataggaagtctcttg 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16476 - 16346
Alignment:
Q  212 tgtgcttgagcaatttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---att--acatagtg-aactcccattggaagtgcaagggg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16476 tgtgcttgagcaatttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 16377  T
Q  306 gacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16376 gattggact-acttccggtttgtggaaggaac 16346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19756 - 19556
Alignment:
Q  37 agtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattta 136  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||   ||||    
T  19756 agtcttaagagtttgtatctgatttgtattatgaacatcactgattgtatatcaaatgttcaatctcaaatatttttctgtgtaattgtgttt--cttta 19659  T
Q  137 gaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctctt--gattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtct 234  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||   |||||||| |  |  ||||| |  |||||||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  19658 gaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcatgcgtgtgtgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttgaagtct 19559  T
Q  235 ctt 237  Q
    |||    
T  19558 ctt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1022 - 936
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1022 ttgtattgtgaacaccacatattgtatatcaagttttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaa--tagaagtctcttgc 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31426 - 31349
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaa 106  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31426 aattctagagtcttacgagtttgtatctgatttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa 31349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3962 - 3830
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatttt-ctttgtaattctgt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||| || ||||||| |||    
T  3962 aattctagagtcttaagagtctgattatgatttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaa-tccaaatatttttcctgtgtaattgtgt 3864  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    |||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  3863 ttg--tttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca 3830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3775 - 3689
Alignment:
Q  252 tgagcatttgtaatcagatattacat--agtgaactcccattggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3775 tgagcatttgtaatcagatattgattttagtgaactctccttggaagtacaagggggagaagact-acttccggattgtggaaggaac 3689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 148
Target Start/End: Original strand, 38412 - 38497
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgc 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38412 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacaattttctatgcaattctgtttg-attta-aagtctcttgc 38497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7780 - 7651
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtt 128  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||| ||| ||||    
T  7780 aattttagagtcttaggagtctgtatttgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa--tcaaacttatttctgtgtgatt-tgtt 7684  T
Q  129 tgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagca 163  Q
    ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  7683 tg--tttagaagtctcttgcttttatgcttgagca 7651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35380 - 35298
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctct 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35380 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtctaactattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctct 35298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2607
Alignment:
Q  30 attctagagtcttta-gagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aacttcaaacaattttctttgtaattctgt 127  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||| |    
T  2772 attctagagtcttaaagagtctgtatctaattggtattgtgaacagcactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaac-atttgatttgtaattctat 2674  T
Q  128 ttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcatag 196  Q
    ||||   ||||||||||||||  || | ||||||||   |||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  2673 ttga--gtagaagtctcttgcttttgttcttgagcacaggaagtctcttgcgtgtgttcttgagcatag 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 58162 - 58065
Alignment:
Q  75 cactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttgagcaatagaagtctc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||| | ||||||||    
T  58162 cactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaacaattttctgtgtaattctgtttga--ttagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctc 58066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 79 - 9
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  79 aattctagagtcttaagagtctgtattttattcgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12200 - 12086
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  12200 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 12104  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12103 agcattagaagtctcttg 12086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40344 - 40230
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||   | ||||||    
T  40344 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgtgtgcttg 40248  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  40247 agcattagaagactcttg 40230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30975 - 30861
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||     ||||||    
T  30975 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 30879  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30878 agcattagaagtctcttg 30861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 42933 - 42972
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 42972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7804 - 7690
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  7804 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 7708  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7707 agcaatagaagtctcttg 7690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 37371 - 37485
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||| ||     ||||||    
T  37371 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ttcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctctcgcctgcgtgcttg 37467  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37468 agcaatagaagtctcttg 37485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5138 - 5066
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  5138 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaat 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15567 - 15500
Alignment:
Q  63 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttga 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  15567 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattttgtttga 15500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15341 - 15278
Alignment:
Q  290 ttggaagtgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaaggaacttgaataaattgcttgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  15341 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaaggaaccagaat-aattgcttgtg 15278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 10701 - 10773
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || | |||||||    
T  10701 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtgtatttttatttgaat 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2533 - 2494
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2533 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 2631 - 2670
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 37147 - 37186
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37147 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 37186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 8172 - 8211
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8172 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 11019 - 11058
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11019 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 12530 - 12644
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgcttg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||||||     ||||||    
T  12530 ttgtattgtgaacaccactgatagaatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatttttgtttgaa--tagaagcctcttgcctgcgtgcttg 12626  T
Q  160 agcaatagaagtctcttg 177  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  12627 agcattagaagactcttg 12644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1331 - 1213
Alignment:
Q  225 tttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagat---attaca--tagtgaa-ctcccattggaagtgcaagggggacaatactgact 318  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |   |||| |  ||||||| ||| | |||||||||||||||||| |  |||||||    
T  1331 tttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgact 1232  T
Q  319 tccggtttgtggaaggaac 337  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1231 tccggtttgtggaaggaac 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22351 - 22302
Alignment:
Q  29 aattctagagtctttagagtctctatctgatttgtattgtgaacaccact 78  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22351 aattctagagttttaagagtctgtatctgatttgtattgtgaacaccact 22302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Original strand, 7255 - 7296
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaact 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7255 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaact 7296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Original strand, 2752 - 2792
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2752 tttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 99
Target Start/End: Original strand, 17374 - 17408
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17374 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19067 - 19027
Alignment:
Q  60 ttgtattgtgaacaccactgattgta-tatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19067 ttgtattgtgaacaccactgattgtattatcaagtgttcaa 19027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5048 - 5011
Alignment:
Q  62 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5048 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 5011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 266
Target Start/End: Original strand, 7296 - 7501
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttttgctt 158  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||     |||||    
T  7296 tttgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaacttaattctctgtatttttgtttga--tcagaagtctcttgcctgcgtgctt 7392  T
Q  159 gagcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcttactaagtttagtaatgag 255  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  7393 gagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcttacttag-aaagtattgag 7490  T
Q  256 catttgtaatc 266  Q
    |||||||||||    
T  7491 catttgtaatc 7501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 5147 - 5112
Alignment:
Q  65 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5147 ttgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaac 5112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1107
Description:

Target: scaffold1107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 93
Target Start/End: Original strand, 2766 - 2800
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2766 tttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagt 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14386 - 14348
Alignment:
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14386 tgcaagggggacaagactgacttctggtttgtggaagga 14348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 93
Target Start/End: Original strand, 16826 - 16860
Alignment:
Q  59 tttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt 93  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16826 tttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1428 - 1390
Alignment:
Q  297 tgcaagggggacaatactgacttccggtttgtggaagga 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1428 tgcaagggggacaagactgacttctggtttgtggaagga 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 13801 - 13883
Alignment:
Q  224 atttgaagtctcttactaagtttagtaatgagcatttgtaatcagatattaca---tagtgaactcccattggaagtgcaagg 303  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| | || ||| ||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  13801 atttgaagtctcttgctagttttagcagtgggcagttgtaatcagatattacattgtagtgtactctccttggaagtgcaagg 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1196 - 1156
Alignment:
Q  197 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatttgaagtctctt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1196 gaagtctcttgcagttgtgcttgagcattgcgaagtctctt 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University