View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320_low_21 (Length: 448)

Name: NF1320_low_21
Description: NF1320
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320_low_21
NF1320_low_21
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (32-441)||(49206822-49207229)
chr3 (30-441)||(49201865-49202274)
chr3 (30-441)||(49211406-49211803)
chr3 (30-441)||(49186885-49187294)
chr3 (32-441)||(49190590-49190985)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (30-440)||(51823582-51823990)
chr1 (30-441)||(32593300-32593697)
chr1 (30-441)||(31526701-31527101)
chr1 (148-441)||(37030147-37030440)
chr1 (32-108)||(37030057-37030133)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (33-441)||(26755869-26756272)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (30-65)||(52267390-52267425)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 441
Target Start/End: Original strand, 49206822 - 49207229
Alignment:
Q  32 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49206822 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 49206921  T
Q  132 cagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 231  Q
    || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49206922 cattattatca--ccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 49207019  T
Q  232 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49207020 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 49207119  T
Q  332 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49207120 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 49207219  T
Q  432 cttcatctca 441  Q
    |||| |||||    
T  49207220 cttcttctca 49207229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Original strand, 49201865 - 49202274
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  49201865 gcaacatgcccgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttttttc 49201964  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
     |||  | ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49201965 accaccactatca--ctaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtactgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 49202062  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49202063 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattcagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcacaat 49202162  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  49202163 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcggcttcttgcttgcaagcataaaatgttgcatctgctgacgctttctgtgcttctgcctct 49202262  T
Q  430 gccttcatctca 441  Q
    |||||| |||||    
T  49202263 gccttcttctca 49202274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Original strand, 49211406 - 49211803
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||      ||    
T  49211406 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtacacaccagcaacttctttcatc------gcaccttca------cc 49211493  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49211494 cccactattatca--ccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcagcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 49211591  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49211592 catttatcatcaagtaatcccttactgctgtatagttgtttccaagtgcattcagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcacaat 49211691  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49211692 cccctctgcctcttttttctttgcgtacagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgtgcttctgcctct 49211791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Original strand, 49186885 - 49187294
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49186885 gcaacatgcccgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccatcagttattcc 49186984  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
    |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49186985 cccactattatca--ccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtattgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgtcac 49187082  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  49187083 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcttgtccaagtgtcacaat 49187182  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  49187183 tccctctgcctcctttttctttgcataaagctctgcttcagctgcttgtttgctagcataaaatgttgcatctgccgacgctttctgtgcttctgcctct 49187282  T
Q  430 gccttcatctca 441  Q
    |||||| |||||    
T  49187283 gccttcttctca 49187294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 441
Target Start/End: Original strand, 49190590 - 49190985
Alignment:
Q  32 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcccc 131  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||      ||||    
T  49190590 aacattcccgtttgctcatgaacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatc------gcaccttca------cccc 49190677  T
Q  132 cagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccacca 231  Q
    || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49190678 cactattatca--ccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtactgcctcagcattaatcttagcgatctcttgaaacatgccacca 49190775  T
Q  232 tttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcc 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  49190776 tttatcatcaagaaatcccttacagcagtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgcacttagatacaccccttgagcattcccaagtgtcacaattc 49190875  T
Q  332 cctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgc 431  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  49190876 cctctgcctcctttttctttgcatatagctctgcttcagctgcttgcgtgcgagcataaaatgttgcgtctgctaatgctttctgtgcttctgcctctgc 49190975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 440
Target Start/End: Original strand, 51823582 - 51823990
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  51823582 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttgaacagaggtggcagcatcttgtagacaccagcaacctctttcatacccatagaaccttcggctattcc 51823681  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
     ||   ||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51823682 gcctccattgtc--ccctccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccacgtactgcctcagcattaatcttagccatctcttgaaacatgccac 51823779  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51823780 catttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcatttccaagtgtcacaat 51823879  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51823880 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagatctgcttcagctgcttgcttgcacgcataaaatgttgcatctgccaatgctttctgtgcttctgcctct 51823979  T
Q  430 gccttcatctc 440  Q
    |||||| ||||    
T  51823980 gccttcttctc 51823990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32593697 - 32593300
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  32593697 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggtggcagcatcttgtaaacaccagcaacctctttcatgcccatagaaccttccgttattcc 32593598  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
     ||               |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32593597 gcct--------------ccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccatgtactgcctcagcattgatcttagccatctcttgaaacatgccac 32593512  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32593511 catttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacactccttgagcattcccaagtgtcacaat 32593412  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32593411 cccttctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagctgcttgcttgcgcgcataaaatgttgcatctgccaatgctttctgtgcttctgcctct 32593312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 441
Target Start/End: Original strand, 31526701 - 31527101
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattcc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||       ||    
T  31526701 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtaaacaccagcaacctctttcatacccatagaaccttcg------cc 31526794  T
Q  130 cccagtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccac 229  Q
     ||| | | | ||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31526795 tccattgtcacct-----ccattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccacgtaccgcctcagcattaatcttagccatctcttgaaacatgccac 31526889  T
Q  230 catttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31526890 catttatcatcaagtaatcccttagagctgtgtagtcgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacactccttgagcattcccaagtgtcacaat 31526989  T
Q  330 cccctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  31526990 cccctctgcctcttttttctttgcatatagctccgcttcggctgcttgcttgcgcgcataaaatgttgcatctgacaatgctttctgtgcttctgcctct 31527089  T
Q  430 gccttcatctca 441  Q
    |||||| |||||    
T  31527090 gccttcttctca 31527101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 148 - 441
Target Start/End: Original strand, 37030147 - 37030440
Alignment:
Q  148 ccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatttatcatcaagtaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37030147 ccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtcctcgtattgcctcggcgttaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccatttatcatcaagtaat 37030246  T
Q  248 cccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatcccctctgcctctttttt 347  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |  |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  37030247 ccctcacagctgtgtagtcgtttccaagtgcattaagaagtttacttacatacaccccttgagcttgtccaactgtcacaattccctctgcctccttttt 37030346  T
Q  348 ctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgccttcatctca 441  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  37030347 ctttgcataaagctctgcttcagctgcttgtttgctagcataaaatgttgcatctgccgatgctttctgtgcttctgcctctgccttcttctca 37030440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 37030057 - 37030133
Alignment:
Q  32 aacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacc 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37030057 aacattcccgtttgctcatggacagtcttaaacaaaggtggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacc 37030133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 33 - 441
Target Start/End: Original strand, 26755869 - 26756272
Alignment:
Q  33 acatgcctgtttgctcatggacagtcttaaacagaggcggcaacatcttgtagacaccagcaacttctttcatacccatggcaccttcagttattccccc 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || | ||    
T  26755869 acatgcctgtttgctcatggactgtcttaaacagaggtggcaacatcttgtacacaccagcaacttctttcatacctatgccaccgtcagttttttcgcc 26755968  T
Q  133 agtattatctacccaccattagtccaaatactaatcttaggctcaagtccgcgtaccgcctcggcattaatcttagcaatctcttgaaacatgccaccat 232  Q
    |   |||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  26755969 accgttatc-----accattagtccaaatactaatcttaggttcaagtccgcgtatagcctcagcattaatcttcgcaatatctcgaaacatgccaccat 26756063  T
Q  233 ttatcatcaagtaatcccttacagctgtgtagttgtttccaagtgcattgagaagtgtacttacatacgctccttgagcattcccaagtgtcataatccc 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |    ||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  |||||    
T  26756064 ttatcatcaagtagtcccttacagctgtataatcacctccaagtgcgttgagaagggtacttacacacaccccttgaccattcccaagtgtcacgatccc 26756163  T
Q  333 ctctgcctcttttttctttgcgtatagctctgcttcagcttcttgcttgcgagcataaaatgtggaatctgccaatgctttttgcgcttctgcctctgcc 432  Q
    ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| | || |||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  26756164 ctccgcctccttcttctttgcatatagctctgcttcggctgcttgtttacgagcataaaatgttgcatttgccaatgctatctgtgcttctgcctctgtc 26756263  T
Q  433 ttcatctca 441  Q
    ||| |||||    
T  26756264 ttcttctca 26756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 52267425 - 52267390
Alignment:
Q  30 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaaca 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52267425 gcaacatgcctgtttgctcatggacagtcttaaaca 52267390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University