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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1320_low_43 (Length: 362)

Name: NF1320_low_43
Description: NF1320
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1320_low_43
NF1320_low_43
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (35-331)||(36464484-36464780)
chr4 (45-331)||(51357349-51357629)
chr4 (46-331)||(8818985-8819261)
chr4 (48-331)||(17119979-17120258)
chr4 (46-239)||(19841973-19842166)
chr4 (93-331)||(33340755-33340988)
chr4 (87-214)||(29117274-29117401)
chr4 (46-156)||(40568631-40568741)
chr4 (48-307)||(40714518-40714771)
chr4 (46-222)||(38951882-38952058)
chr4 (46-213)||(41041707-41041874)
chr4 (58-230)||(42555589-42555761)
chr4 (93-222)||(43624606-43624732)
chr4 (46-208)||(22279277-22279438)
chr4 (64-329)||(23627022-23627282)
chr4 (181-230)||(40568750-40568799)
chr4 (70-115)||(48747921-48747966)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (46-323)||(1052754-1053030)
chr7 (46-331)||(36298955-36299238)
chr7 (47-222)||(7767254-7767429)
chr7 (47-224)||(11038881-11039058)
chr7 (46-230)||(33189570-33189754)
chr7 (35-330)||(2943735-2944024)
chr7 (46-249)||(47925068-47925270)
chr7 (74-239)||(38440133-38440298)
chr7 (61-284)||(30541196-30541413)
chr7 (85-222)||(23809408-23809545)
chr7 (66-331)||(22518891-22519149)
chr7 (65-222)||(5973248-5973405)
chr7 (53-162)||(27337317-27337426)
chr7 (172-222)||(15953895-15953945)
chr7 (324-358)||(32066352-32066386)
chr7 (324-358)||(32066615-32066649)
chr7 (181-230)||(27337265-27337314)
chr7 (324-357)||(32066102-32066135)
chr7 (68-116)||(43427079-43427127)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (53-331)||(2191491-2191764)
chr1 (46-230)||(25293744-25293928)
chr1 (47-215)||(31584933-31585101)
chr1 (38-230)||(15378987-15379185)
chr1 (46-230)||(47141038-47141222)
chr1 (46-222)||(48378778-48378954)
chr1 (100-283)||(38264075-38264254)
chr1 (46-239)||(29677304-29677492)
chr1 (46-222)||(11894519-11894695)
chr1 (48-109)||(42507314-42507375)
chr1 (40-162)||(25987667-25987789)
chr1 (46-106)||(17562526-17562586)
chr1 (46-110)||(36728558-36728622)
chr1 (172-215)||(17562611-17562654)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (35-230)||(28211598-28211793)
chr8 (46-257)||(7986897-7987108)
chr8 (44-331)||(31006187-31006470)
chr8 (46-222)||(8226935-8227111)
chr8 (46-222)||(9762621-9762797)
chr8 (60-222)||(7968170-7968332)
chr8 (46-222)||(36582626-36582802)
chr8 (42-222)||(11481677-11481858)
chr8 (45-245)||(6870294-6870501)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (46-230)||(22226-22410)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (46-230)||(39800139-39800323)
chr5 (46-162)||(35188318-35188434)
chr5 (63-239)||(42878662-42878838)
chr5 (46-162)||(39206827-39206943)
chr5 (46-162)||(40057171-40057287)
chr5 (47-222)||(3926454-3926629)
chr5 (42-217)||(23429506-23429675)
chr5 (46-214)||(42837777-42837944)
chr5 (35-307)||(26621543-26621811)
chr5 (44-223)||(39886925-39887104)
chr5 (42-155)||(33742406-33742518)
chr5 (118-317)||(2209724-2209916)
chr5 (45-101)||(2209916-2209972)
chr5 (181-222)||(33742528-33742569)
chr5 (181-222)||(35188437-35188478)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (46-239)||(5110451-5110644)
chr2 (35-222)||(45150925-45151109)
chr2 (46-222)||(13626007-13626183)
chr2 (46-222)||(5704857-5705033)
chr2 (42-222)||(5938937-5939117)
chr2 (48-235)||(31575637-31575824)
chr2 (46-162)||(42622363-42622479)
chr2 (108-222)||(13807805-13807919)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (46-239)||(7622545-7622738)
chr6 (46-230)||(641724-641907)
chr6 (59-331)||(28582320-28582587)
chr6 (46-217)||(35166981-35167151)
chr6 (47-230)||(10408637-10408820)
chr6 (46-222)||(10788736-10788911)
chr6 (93-222)||(8576998-8577127)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (46-230)||(8965-9149)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (46-230)||(12149236-12149420)
chr3 (38-222)||(13826311-13826495)
chr3 (46-331)||(48251182-48251462)
chr3 (46-222)||(25874396-25874574)
chr3 (46-230)||(27926328-27926512)
chr3 (46-222)||(3778672-3778847)
chr3 (46-214)||(5295481-5295649)
chr3 (46-215)||(21288357-21288527)
chr3 (109-206)||(36585000-36585097)
chr3 (164-331)||(26188022-26188184)
chr3 (263-331)||(36584553-36584621)
chr3 (75-215)||(27519860-27520000)
chr3 (44-89)||(36585102-36585147)
chr3 (52-112)||(24435316-24435376)
chr3 (73-137)||(26749153-26749217)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (42-309)||(66717-66978)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (46-222)||(6640-6816)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 35 - 331
Target Start/End: Original strand, 36464484 - 36464780
Alignment:
Q  35 tccgcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaat 134  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36464484 tccgcacccgcggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaacggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaat 36464583  T
Q  135 ggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattt 234  Q
     || |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36464584 agatacggatgcggatttaatgatatccgcacccgcaaatatccttactcgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattt 36464683  T
Q  235 ttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36464684 ttaagctaaaaacctcgatattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 36464780  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 51357629 - 51357349
Alignment:
Q  45 tggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggat 144  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||      |    
T  51357629 tggataaaatccgccactgacatgaagcagataccttaatggatatttatggataaaataaacggatattttaattatctgctaattaattga------t 51357536  T
Q  145 acggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaa 244  Q
     ||||||||||| |||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51357535 gcggatttaatggtatccacacccacggatatccatacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaa 51357436  T
Q  245 aacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51357435 aacctcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacgattattcaagtttgtactacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 51357349  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 8818985 - 8819261
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| | ||||     
T  8818985 ggataaaatccgtcacggacacgaagcggataccttaacggatattcatggataaaataaacggatattttaactatctgttaattaatggatatggatg 8819084  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaa 245  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8819085 cggatttaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaactaaataaattacataaataacattaatacctttcaaatttttaagctaaaa 8819184  T
Q  246 acttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    |  |||         ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8819185 atctcg---------gtgagttgttattagttattacacaactattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 8819261  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 331
Target Start/End: Original strand, 17119979 - 17120258
Alignment:
Q  48 ataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacg 147  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||  ||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  17119979 ataaaatccaccacgggcacagagcggatgccttaatagatattcgtggatgaaataaacgaatattttaactatccgctaattaatggatacgaatgcg 17120078  T
Q  148 gatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaac 247  Q
    || ||||||  ||||  || ||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||  ||||| ||||||    
T  17120079 gacttaatggcatccgcacgcgcggatatccatacccgatattaaaccgagtaaattacataagtaatcttaatatctttgaacttcctaagcaaaaaac 17120178  T
Q  248 ttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
     ||||||    ||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  17120179 atcggta----ttgtgagttgtaattagttattacacaacagttcaaatttgtattacgctcctttaaaaggaagtgaaagtgg 17120258  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19842166 - 19841973
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |  |||     
T  19842166 ggataaaatccgccacggacacggagtggataccttaatggatatccatggataaaataaacggattttttaactaatcgctaattaatggataaagatg 19842067  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||  |||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  19842066 cggatttaatggtttccacacccgcgaatatcaatacctgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcattcaattttctaag 19841973  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33340988 - 33340755
Alignment:
Q  93 atggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||   ||||||||||||||| || || |||||||    
T  33340988 atggataaaataaacggatattttaactacctactaattaatggatacggatgcagatttaatggtatatgtacccgcagatatccatatccactattaa 33340889  T
Q  193 actgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattc 292  Q
    |  || |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||     ||||||| ||||||||||||||||||| || ||     
T  33340888 atagagtaaaatatataaataacattaatacctttcaacttcctaagcaaaaaacctcagt----gttgtgag-tgttattagttattacacgactgttt 33340794  T
Q  293 aagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    || |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  33340793 aaatttgtattacgctcctttaaaaggaagtgaaagtgg 33340755  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29117401 - 29117274
Alignment:
Q  87 atatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgc 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||  | |||| ||||||| |  ||||    
T  29117401 atattcatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaacggtatccgcatccgcggatatccatttccgc 29117302  T
Q  187 tattaaactgaataaattacataaataa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29117301 tattaaactgaataaattacataaataa 29117274  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 40568631 - 40568741
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  40568631 ggataaaattcgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatg 40568730  T
Q  146 cggatttaatg 156  Q
    |||||||||||    
T  40568731 cggatttaatg 40568741  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 307
Target Start/End: Original strand, 40714518 - 40714771
Alignment:
Q  48 ataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacg 147  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||| |     
T  40714518 ataaaatccgtcacaggcacgaagcggatacattaatggatatttatcgataaaataaatggatattttaactacca-ctaattagtggatacagatgca 40714616  T
Q  148 gatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaac 247  Q
    |||||||||  ||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40714617 gatttaatggcatccgcacccgcggatatccatactcgctattaaaccgagtaaattacataaataactttaatacctttcaactttttaagcaaaaaac 40714716  T
Q  248 ttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacac 307  Q
     |  |||    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||    
T  40714717 ctaagta----ttgtgag-tgttattagttattacacgattgttcaaatctgtattacac 40714771  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38952058 - 38951882
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  38952058 ggataaaatccgccacaggtacggagcggatacattaatggatattcacggataaaataaacagattttttaactacccgctaattaatggatacagatg 38951959  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||  ||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  38951958 cggatttaatggtattcacacccgcatttatccatatccgctattaaaccgaggaaattacataaataacctcaata 38951882  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41041874 - 41041707
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || || |||     
T  41041874 ggataaaatccattacgggcacggagcggataccttaatggatatttatggataaaataaatggattttttaactacccgctaattaatagatacagatg 41041775  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaata 213  Q
    || ||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||    
T  41041774 cgaatttaatgatatccacacccgcggacatccatacccgctattaaaccgagtaagttacatcaata 41041707  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42555761 - 42555589
Alignment:
Q  58 ccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatga 157  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| | | | ||  |||||||||||    
T  42555761 ccacagacacagagcggataccttaatggatatcaatgaataaaataaacagatattttaactaccaactaattaatgaatatgaatgtggatttaatga 42555662  T
Q  158 tatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    |||||  |||| |  |||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42555661 tatccgcacccacgaatatccatactcgctattaaaccaagtaaattacataaatatccttaatacctttcaa 42555589  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43624732 - 43624606
Alignment:
Q  93 atggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaa 192  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||| |||||  || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43624732 atggataaaacaaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggat---atggtatccacactcgcggatatccatacccgctattaa 43624636  T
Q  193 actgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||    
T  43624635 accgagtaaattacataaataaccttaata 43624606  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22279438 - 22279277
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||     
T  22279438 ggataaaatccgccatggacacgaaacggatcccttaaaggatatccatggataaaataaatggat-ttttaactacccgttaattaatggatacagatg 22279340  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacat 208  Q
    | ||||||||  |||||  |||||| |||||||  | |||||||||||| || ||||||||||    
T  22279339 cagatttaatagtatccacacccgcggatatccaaatccgctattaaaccgagtaaattacat 22279277  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23627282 - 23627022
Alignment:
Q  64 acacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatcct 163  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||  || |  || ||||| ||||      
T  23627282 acacggagtggataccttaatggaaatacatggataaaataaacgaatattttaactacctgctaattaatggatacatatgcatatataatggtatctg 23627183  T
Q  164 tacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtg 263  Q
     | || |  |||| | |||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||| | | |     |||||    
T  23627182 catcctcgaatatgcatacttgctactaaaccgagtaaattacataaataaccttaatacttttcaactttctaatcaaaaaaccttgat----gttgtg 23627087  T
Q  264 agttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagt 329  Q
    || |||||||||||| ||||||  | | ||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23627086 ag-tgttattagttagtacacgattgtgcaaatctgtattacactccttcaaaagaaagtgaaagt 23627022  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Original strand, 40568750 - 40568799
Alignment:
Q  181 acccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  40568750 acccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 40568799  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 48747966 - 48747921
Alignment:
Q  70 agcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattt 115  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48747966 agcgaataccttaatggatatccaaggataaaataaacggatattt 48747921  T

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Target: chr7 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 323
Target Start/End: Original strand, 1052754 - 1053030
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||     
T  1052754 ggataaaattcgccacggacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggataaggatg 1052853  T
Q  146 cggatttaatgatatcctta---cccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagcta 242  Q
     |||||||||| |||||  |   || || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  1052854 tggatttaatggtatccgcacctcctgcggatatccatacccgctattataccgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattcctaagcaa 1052953  T
Q  243 aaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagt 323  Q
    ||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052954 aaaaaatcggta----ccctgagttgttattagttattacacgaattttcaagtttgtattacactcctttaaaagatagt 1053030  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36299238 - 36298955
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||     
T  36299238 ggataaaatctgccacggacacggagcggatatcttaatggatatccatggataaaataaatgaatattttaactacccgctaattaatggatacaaatg 36299139  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaa 245  Q
      ||||||||| |||||  |||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  36299138 ttgatttaatggtatccgcacccacggatattcatacccgctattaaac-caataaattacataaataaccttaatacatttcaaattcctaagcaaaaa 36299040  T
Q  246 acttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    || || ||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36299039 acctcagtagtac-tgtgagttgttattaattattacacgaccgttcaagtttgtattacattcctttaaaagatagtgaaagtgg 36298955  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7767429 - 7767254
Alignment:
Q  47 gataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatac 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  7767429 gataaaatccgccacggacatggagcggatactttaatggatatccatgaataaaataaacggattttttaactaccccctaattaatggacacggattc 7767330  T
Q  147 ggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
     ||||||||| |||||  ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7767329 agatttaatggtatccacacctgcggatatccatacccactattaaactgagtaaattacataaataaccttaata 7767254  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 11038881 - 11039058
Alignment:
Q  47 gataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatac 146  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
T  11038881 gataaaatccgccacggacatggagcagataccttaatggatattcatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatgaatatggatac 11038980  T
Q  147 ggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacc 224  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  11038981 ggatttaatggtatccacacccgcagatatccataccggctattaaaccgagtaaatttcataaataagcttaatacc 11039058  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33189754 - 33189570
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  33189754 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacagatg 33189655  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    || ||| |||| |||||  |||||| ||||  | || ||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33189654 cgaattcaatggtatccacacccgcggataaacatatccgttattacacagagtaaattacataaatatccttaataccattcaa 33189570  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 330
Target Start/End: Original strand, 2943735 - 2944024
Alignment:
Q  35 tccgcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaat 134  Q
    |||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||| |||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2943735 tccgcacccacggataaaatccgttacggatacggagcgaataccttaatggatatttatgggtaaaataaacggatattttaactacccgctaattaat 2943834  T
Q  135 ggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattt 234  Q
     || ||| || | ||||||||| |||||  | |||| ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||     
T  2943835 -gatacgaatgcagatttaatggtatccacatccgcggatatccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacattaatacatttcaacttc 2943933  T
Q  235 ttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtg 330  Q
     ||||| |||| | ||||||    ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| || | |||||||  ||||||||||    
T  2943934 ctaagcaaaaatcatcggta----ttgtga-atgttattagttattacatgactattcaaatctgtattacgcttccttaaaaggaagtgaaagtg 2944024  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 47925270 - 47925068
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |      
T  47925270 ggataaaatccgccacggacacggaacggataccttaatggatatccttagataaaataaatagatattttaactacccattaattaatggatacgaaag 47925171  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaa 245  Q
     |||||||||| |||||  |||| || |||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||    
T  47925170 tggatttaatggtatccgcacccacaaatatccatgcccgctattaaacttactaaa-tacataaataaccttaatatctttcaacttcttaagcaaaaa 47925072  T
Q  246 actt 249  Q
    ||||    
T  47925071 actt 47925068  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 239
Target Start/End: Original strand, 38440133 - 38440298
Alignment:
Q  74 gatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcaga 173  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||  ||| |||||    
T  38440133 gataccttaatggatatccatagataaaataaacgaattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttgatggtatccacacctgcaga 38440232  T
Q  174 tatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  38440233 tatccatacccactattaaaccgagtaaattacataaataatctcaatatcattcaactttttaag 38440298  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 284
Target Start/End: Original strand, 30541196 - 30541413
Alignment:
Q  61 cggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatat 160  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||    
T  30541196 cggacatggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacgaatattttaactacccgctaattaatggatatggatgccgatttaatggtat 30541295  T
Q  161 ccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgctt 260  Q
        |||||||||||||| || ||| |||||||| || |||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| |||| | | ||||    ||    
T  30541296 ttgcacccgcagatatccatatccgttattaaaccgagtaagatacataaataacc-taataactttcaacttcctaagcaaaaacccttggta----tt 30541390  T
Q  261 gtgagttgttattagttattacac 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  30541391 gtgag-tgttattagttattacac 30541413  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Original strand, 23809408 - 23809545
Alignment:
Q  85 ggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttaccc 184  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||      
T  23809408 ggatattcatggataaaataaacaggttttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatactt 23809507  T
Q  185 gctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  23809508 gctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 23809545  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 331
Target Start/End: Original strand, 22518891 - 22519149
Alignment:
Q  66 acggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatcctta 165  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||  || ||||||| |||||  |    
T  22518891 acggagcaaataccttaatggatatccatagataaaataaacaaatattttaactacctgcaaat-aatggatacggatgtgggtttaatggtatccgca 22518989  T
Q  166 cccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgag 265  Q
     | |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||  |||||| ||||||    |||||||    
T  22518990 tcagcagatatccatacacgttattaaattgaataaattacataaataaacttaatatctttc-aacttctaaggaaaaaacctcggta----ttgtgag 22519084  T
Q  266 ttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
      |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||    
T  22519085 -ggttattagttattacacgactatttaaatttgtattaaaatcccttaaaaggaagtgaaagtgg 22519149  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5973405 - 5973248
Alignment:
Q  65 cacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatcctt 164  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| |      
T  5973405 cacggaacggataccttaatggaaatccattgataaaataaacgaattttttaactatccactaattaatggatacagatgcggatttaatggtattcac 5973306  T
Q  165 acccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  5973305 acccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattacataaataacctcaata 5973248  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27337426 - 27337317
Alignment:
Q  53 atccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggattt 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  27337426 atccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacgaataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatagatacggatgcggattt 27337327  T
Q  153 aatgatatcc 162  Q
    |||| |||||    
T  27337326 aatggtatcc 27337317  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 15953895 - 15953945
Alignment:
Q  172 gatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  15953895 gatatccatacccgctattaaatcgagtaaattacataaataaccttaata 15953945  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 358
Target Start/End: Original strand, 32066352 - 32066386
Alignment:
Q  324 gaaagtggacatatgtttgattacttacaatcgtg 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32066352 gaaagtggacatatgtttgattccttacaatcgtg 32066386  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 358
Target Start/End: Original strand, 32066615 - 32066649
Alignment:
Q  324 gaaagtggacatatgtttgattacttacaatcgtg 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32066615 gaaagtggacatatgtttgattccttacaatcgtg 32066649  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27337314 - 27337265
Alignment:
Q  181 acccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  27337314 acccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 27337265  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 357
Target Start/End: Original strand, 32066102 - 32066135
Alignment:
Q  324 gaaagtggacatatgtttgattacttacaatcgt 357  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32066102 gaaagtggacatatgtttgagtacttacaatcgt 32066135  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Original strand, 43427079 - 43427127
Alignment:
Q  68 ggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatatttt 116  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43427079 ggagcggataccttaatggacatccatgaataaaataaatggatatttt 43427127  T

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Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 53 - 331
Target Start/End: Original strand, 2191491 - 2191764
Alignment:
Q  53 atccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggattt 152  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||| | |||||    
T  2191491 atccgccacggatatggagcggatactttaatggatatccatggataaaataaacggatattttatctacctgttaattaatggatacagatgcagattt 2191590  T
Q  153 aatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcgg 252  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  2191591 aatggtatccgcacccgcagatatccatacctgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaatacttttcaaatttctaag-aaaaaacctcgg 2191689  T
Q  253 tattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  2191690 ta----gtgtgagttgttattagttattacacgatttttcaagtttgtattacactcttttagaaggtagtgaaagtgg 2191764  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 25293744 - 25293928
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  25293744 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacagataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatg 25293843  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  25293844 cggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 25293928  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Original strand, 31584933 - 31585101
Alignment:
Q  47 gataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatac 146  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31584933 gataaaatccgccatggacacggaacggataccttaatggatatccatggataaaataaatgggttttttaactacccgctaattaatggatacggatgc 31585032  T
Q  147 ggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataac 215  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31585033 ggatttaatgatatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgattaaattacataaataac 31585101  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15379185 - 15378987
Alignment:
Q  38 gcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatgga 137  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15379185 gcacccgcggataaaatccgtcatggacaccgagcatatattttaatggatatccatggatcaaataaacggatattttaactgcccgctaattaatgga 15379086  T
Q  138 aacggatacg------gatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
     |||||||||      ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15379085 tacggatacggatgcagatttaatagtatccacacccgcagatatccatacccgctattaaattgagtaaattacataaataaccttaatacctttcaa 15378987  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47141222 - 47141038
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| | | |||    
T  47141222 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataagcggatttttttactacccgttaattaatggataggaata 47141123  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    |  |||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  47141122 catatttaatggtatcagcacccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattaaataaataatcttaataccattcaa 47141038  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 48378778 - 48378954
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||     
T  48378778 ggataaaatccatcacgggcacggagcggatagcttaatgaatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacatatg 48378877  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||||||| |   ||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  48378878 cggatttaatgatattcacgcccgcggacatccataccctctattaaactgagtaagttacatcaataacctcaata 48378954  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 38264075 - 38264254
Alignment:
Q  100 aaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaat 199  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||  | |    
T  38264075 aaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatatggatgtgaatttaatggtatccgcacccgcagatatctatacccgctattaaaccaatt 38264174  T
Q  200 aaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattaca 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||| ||||     ||||||||||||||||| ||||||    
T  38264175 aaattacataaataaccttaatacgatccaaattcttaagcaaaaaactttggta----atgtgagttgttattagtaattaca 38264254  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Original strand, 29677304 - 29677492
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||     
T  29677304 ggataaaatctgcaacggacacggagctgataccttaatggatatccatggataaaataaatggattttttaactacccgcaaattaatggatacggatg 29677403  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||     |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||    
T  29677404 cggatttaatggtatccacacccgcggatatcc-----cgctattaaaccaggtaaattacataaataactttaatatcattcaacttcttaag 29677492  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11894695 - 11894519
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||| | ||||     
T  11894695 ggatataatccgtcacgggcacggagcggataccttaatggatatcaatggataaaataaatgaattttttaactacctgctaattaatggatatggatg 11894596  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||| | |||||  |||||  ||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11894595 cggatttaacggtatccacacccgtggatatccataccgactattaaaccgagtaaattacataaataaccttaata 11894519  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 42507314 - 42507375
Alignment:
Q  48 ataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacgg 109  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42507314 ataaaatctgccactgacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacgg 42507375  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25987789 - 25987667
Alignment:
Q  40 acccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaa 139  Q
    ||||| ||||| |||||  ||| | |||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  25987789 acccgcggatataatccgtcacaggcacgaagcagataccttaatggatatctatggataaaataaatgaattttttaactacccgctaattaatggata 25987690  T
Q  140 cggatacggatttaatgatatcc 162  Q
    |  ||  |||||||||| |||||    
T  25987689 caaatgtggatttaatggtatcc 25987667  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 106
Target Start/End: Original strand, 17562526 - 17562586
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaa 106  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  17562526 ggataaaatctgccatggacacggagcggataccttaatggatatccatagataaaataaa 17562586  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 36728558 - 36728622
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacgga 110  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||| || |||||||||||||||||||    
T  36728558 ggataaaatccgccacagacacggagcggatatcttcatggacatacatggataaaataaacgga 36728622  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 17562611 - 17562654
Alignment:
Q  172 gatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataac 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17562611 gatatccatacccgctattaaaccgattaaattacataaataac 17562654  T

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Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 28211598 - 28211793
Alignment:
Q  35 tccgcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaat 134  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28211598 tccgcacccgcggataaaatccgccacggacacagagcagatactttaatggatatctatggataaaataaacggatattttaactacccactaattaat 28211697  T
Q  135 ggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||| ||| || ||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211698 ggatacgaatgcggatttaatagtatccacacccgcagatatccatattcgctattaaaccaagtaaattacataaataaccttaatacctttcaa 28211793  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 257
Target Start/End: Original strand, 7986897 - 7987108
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||| ||||||     
T  7986897 ggataaaatccgctacggacatggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatttgtcaactacctgctaattaatggatacggatg 7986996  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaa 245  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||    
T  7986997 cggatttaatggtattcacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaataccattcaacttattaagaaaaaa 7987096  T
Q  246 acttcggtattg 257  Q
    || | |||||||    
T  7987097 acataggtattg 7987108  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31006470 - 31006187
Alignment:
Q  44 gtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacgga 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  31006470 gtggataaaatccgccacggacatggagcggatatcttaatggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaatggacacgaa 31006371  T
Q  144 tacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaa 243  Q
     |||||||||| | ||||   |||| || |||||| || | |||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  31006370 cacggatttaacggtatctgcacccacaaatatccatatcagctattaaaccgagtgaattatataaataactttaataccattcaaattcctaagcaaa 31006271  T
Q  244 aaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    |||  ||||||     | ||||||||||||| |||||||| | || ||||| | |||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  31006270 aaatatcggta----ctctgagttgttattatttattacatgactgttcaattatgtattatgttcctttaaaagaaagtgaaagtgg 31006187  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 8226935 - 8227111
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||     
T  8226935 ggataaaatccgtcacgggcacggagtggataccttaatggatatacatggataaaataaacggatcttttaactacccgctaattaatagatacggatg 8227034  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  8227035 cggatttaatggtatccacacccgcggatattcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 8227111  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 9762621 - 9762797
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| | ||||     
T  9762621 ggataaaatccgccacgggcacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacagattttttaactacctgctaattaatggatatggatg 9762720  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||| ||| |||||  | || | ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9762721 cggatttgatggtatccacatcctcggatatccatactcgctattaaatcgaataaattacataaataaccttaata 9762797  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 7968170 - 7968332
Alignment:
Q  60 acggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgata 159  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  7968170 acggatacgtagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatttttcaactacccgctaattaatggatacgcatgcggatttaatggta 7968269  T
Q  160 tccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    | |  ||||||  |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7968270 ttcacacccgcgtatatccatattcgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaata 7968332  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 36582626 - 36582802
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| ||||||     
T  36582626 ggataaaatccgccacgaacacggagcggatatcttaatggatatccatgaataaaataaacggattttttaactatccactaattaatggatacggatg 36582725  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||  ||| |  ||||||  |||||| |||||| |||||||| || |||  |||||||||||||| ||||    
T  36582726 cggatttaatagtatacacacccgcgaatatccatacccgttattaaaccgagtaagatacataaataacctcaata 36582802  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11481858 - 11481677
Alignment:
Q  42 ccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacgga-tattttgactacccgctaattaatggaaac 140  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |     
T  11481858 ccgtggataaaatctgccacgggtacggagcggatactttgatgaatatccatcgataaaataaacggatttttttaactacttgctaattaatggatat 11481759  T
Q  141 ggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||  |||||||| | |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||    
T  11481758 ggatgtggatttaacggtatccacatccgcgaatatccatacccgctattaaaccgagtaaattatgtaaataacctcaata 11481677  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 245
Target Start/End: Original strand, 6870294 - 6870501
Alignment:
Q  45 tggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggat 144  Q
    ||||||||||||  || ||| || || ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| || ||  ||    
T  6870294 tggataaaatccttcaaggatacagaacggatatcttaatggatatccatggataaaataaacatataatttaactacccgttaattaattgatacatat 6870393  T
Q  145 acggatttaatgatatc------cttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattaca-taaataaccttaatacctttcaaattttta 237  Q
     | ||||||||| ||||      |  || |||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  6870394 gcagatttaatggtatccgcactcgcactcgcatatatccatacccgctattaaaccgagtaagttaaattaaataactttaatacatttcaactttcta 6870493  T
Q  238 agctaaaa 245  Q
    ||| ||||    
T  6870494 agcaaaaa 6870501  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22410 - 22226
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  22410 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatg 22311  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  22310 cggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 22226  T

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Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 39800139 - 39800323
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  39800139 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatg 39800238  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  39800239 cggatttaatggtatctgcacccgcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 39800323  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 35188318 - 35188434
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  35188318 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatg 35188417  T
Q  146 cggatttaatgatatcc 162  Q
    |||||||| || |||||    
T  35188418 cggatttagtggtatcc 35188434  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 42878662 - 42878838
Alignment:
Q  63 gacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatcc 162  Q
    ||||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||| | | || ||||||||||| |||||    
T  42878662 gacacagagcagatactttaatgaatatccatagataaaataaacggattttttaaatacccattaattaatggatatgaatgcggatttaatggtatcc 42878761  T
Q  163 ttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
      |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  42878762 acacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaataccattcaactttctaag 42878838  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 39206827 - 39206943
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  39206827 ggataaaatccgccacgggcacagagcggataccttaatggatatcgatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatg 39206926  T
Q  146 cggatttaatgatatcc 162  Q
    ||||||||||| |||||    
T  39206927 cggatttaatggtatcc 39206943  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40057287 - 40057171
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  40057287 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatctacggataaaataaatagatattttaactacccgctaattaatggatacggatg 40057188  T
Q  146 cggatttaatgatatcc 162  Q
    ||||||||||| |||||    
T  40057187 cggatttaatggtatcc 40057171  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3926629 - 3926454
Alignment:
Q  47 gataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatac 146  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||   |||| |    
T  3926629 gataaaatccgccacaggcacggagcggatatcttaatggatatctatggataaaataaacggattttttaactacatgcttattaatggatgtggatgc 3926530  T
Q  147 ggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    |||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3926529 ggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctataaaatcgagtaaattacataaataacctcaata 3926454  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23429675 - 23429506
Alignment:
Q  42 ccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacg 141  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  23429675 ccgtagataaaatccgctacggacacggaacggatatcttaatggatatccatgaataacataaacggattttttaactactcgctaattaatggataca 23429576  T
Q  142 gatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataacct 217  Q
    ||| ||||||||||| ||| |  |||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23429575 gatgcggatttaatggtattcacacccgca------tttacccgctattaaactgagtaaattacataaataacct 23429506  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42837944 - 42837777
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||| ||  ||     
T  42837944 ggataaaacccgccacagacacagagcggatatcttaatggatatctatggataaaataaacggattttttaactatccgttaaataatggacac-tatg 42837846  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataa 214  Q
    | ||||||||  |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42837845 cagatttaatagtatccacacccgcagatatctatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataa 42837777  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26621811 - 26621543
Alignment:
Q  35 tccgcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaat 134  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||| ||| || ||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||     
T  26621811 tccgcaccccaggataaaatctgccaaggatacagagcgcataccttaatggatgtctatggataaaataaacaaatattttaactacccactaattaac 26621712  T
Q  135 ggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattt 234  Q
     || || ||| |  |||||||| ||||   | ||||| |||||| ||||  ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  26621711 agacacagatgcatatttaatggtatctccatccgcatatatccatacctactattaaatcgagtaaattacacaaataaccttaatacctttcaacttc 26621612  T
Q  235 ttaag-ctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacac 307  Q
     ||||   |||||| ||||||    ||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  26621611 ctaagaaaaaaaacctcggta----ttgtgag-tgttatcaattattacacgactgttcaagtttgtactacac 26621543  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39887104 - 39886925
Alignment:
Q  44 gtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacgga 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||    
T  39887104 gtggataaaatccgccacgaacacagaatggatatcttaatggatatacatggataaaataaacgaatatttcaactacctgctaattaatggatacaga 39887005  T
Q  144 tacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatac 223  Q
    | | ||||| ||| ||||   |||||| | ||||| |||||||||||| |  || ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  39887004 tgcagatttcatggtatctacacccgcgggtatccgtacccgctattatatagagtaaattacacaaacaacattaatac 39886925  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Original strand, 33742406 - 33742518
Alignment:
Q  42 ccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacg 141  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  || ||||||||||| ||     
T  33742406 ccgtggataaaatcctccacggacatggagtggataccttaattgatatccatggataaaataaatggattttttaacta-tcgttaattaatggataca 33742504  T
Q  142 gatacggatttaat 155  Q
    ||| ||||| ||||    
T  33742505 gatgcggatgtaat 33742518  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2209916 - 2209724
Alignment:
Q  118 actacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataacct 217  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| || ||  | |||  ||||||  | ||||||||||||  || ||||||  ||||||||| |    
T  2209916 actacccactaattaatggatacggatgcagatttaatggtacccgcatccggggatatctat-cccgctattaaatcgagtaaattttataaataactt 2209818  T
Q  218 taatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaa 317  Q
    ||||| | ||||||||  ||||| | |||||||| ||      |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2209817 taatatcattcaaattcctaagcaacaaacttcgtta------gtgagttgttattagttattgcacgactgttcaagtatgtattacgctcctttaaaa 2209724  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 2209972 - 2209916
Alignment:
Q  45 tggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaa 101  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209972 tggataaaatccgtcacggatatggagtggatactttaacggatatccatggataaa 2209916  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 33742528 - 33742569
Alignment:
Q  181 acccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33742528 acccgctattaaacagagtaaattacataaataaccttaata 33742569  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 35188437 - 35188478
Alignment:
Q  181 acccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  35188437 acccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 35188478  T

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Target: chr2 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5110644 - 5110451
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  5110644 ggataaaatctgccacggacacagagcggataccttaatggatatccatggataaaataaatgaattttttaactacccgctaattaatggatacgaatg 5110545  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  5110544 cggatttaatggtatccacacccgcagatatccatacccgctattaaaccaaataaattacataaataacctcaatatcattcaactttctaag 5110451  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Original strand, 45150925 - 45151109
Alignment:
Q  35 tccgcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaat 134  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||| ||  || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45150925 tccgcacccgtggata---tccgccacgggcatagaacggataccttaatagatatccatggataaaataaacggattttttaactatccgctaattaat 45151021  T
Q  135 ggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||| || ||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  45151022 ggatacagatgcggatttaatggtatccacacccacagatatccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 45151109  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 13626007 - 13626183
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  13626007 ggataaaattcaccacgggcgcgaagcggataccttaatggatatctatggataaaataaacagattttttaactacccgctaattaatggatacggatg 13626106  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||  |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13626107 cggatttaatggtatctacacccgcgaatatccataccctctattaaaccggataagttacataaataacctcaata 13626183  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5705033 - 5704857
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  5705033 ggataaaatccgccacgggcacggaacggataccttaatgtatatccgtggataaaataaatggattttttaactatccgctaattaatggatacggatg 5704934  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
     |||||||||| |||||  ||||||| |||| | || | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  5704933 tggatttaatggtatccacacccgcaaatattcatatctgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 5704857  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5939117 - 5938937
Alignment:
Q  42 ccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacg 141  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||     
T  5939117 ccgtagataaaatccgtcacggacatggagcgaataccttaatggatattcatggatataataaatggattttttaactacccgctaattaatggataca 5939018  T
Q  142 gatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
     || ||||||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  5939017 aatgcggatttaatggtatctacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtatattacataaattacctcaata 5938937  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 235
Target Start/End: Original strand, 31575637 - 31575824
Alignment:
Q  48 ataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacg 147  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31575637 ataaaatccgccactgacacagagtggatatcttaatggatatgcatggataaaataaacgaattttgtaactacccgctaattaatggatacggatgcg 31575736  T
Q  148 gatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttt 235  Q
    ||||||||  |||||  ||| || ||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  31575737 gatttaattgtatccacaccagcggatatccatatccgctattaaaccaagtaaattacataaataacctcaatatcattcaactttt 31575824  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 42622363 - 42622479
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||     
T  42622363 ggataaaatccgtcacggacacggaacggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatgaatacggatg 42622462  T
Q  146 cggatttaatgatatcc 162  Q
    ||||||||||| |||||    
T  42622463 cggatttaatggtatcc 42622479  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13807919 - 13807805
Alignment:
Q  108 ggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattaca 207  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |    
T  13807919 ggattttttaactacccgcttattaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccaagtaaattata 13807820  T
Q  208 taaataaccttaata 222  Q
    |||||||||| ||||    
T  13807819 taaataacctcaata 13807805  T

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Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7622738 - 7622545
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||     
T  7622738 ggataaaatccgccacggacgcggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggattttttatttacccgctaattaatggatacggatg 7622639  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 239  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||| | ||||| ||| ||||    
T  7622638 cggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattaagtaaataacattaatatcattcaactttctaag 7622545  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 641724 - 641907
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||     
T  641724 ggataaaattcaccacggacacggagcggatattttaatggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaatggatacatatg 641823  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
     |||||||||| || ||  | |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  641824 aggatttaatggtaaccgcatccgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaataacc-taataactttcaa 641907  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28582587 - 28582320
Alignment:
Q  59 cacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgat 158  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||  |||||||||||||  |    
T  28582587 cacggacacggagcggataccttgatggatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgttaattagtggatacaaatacggatttaatagt 28582488  T
Q  159 atccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgc 258  Q
    ||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||| ||||   | | ||        
T  28582487 atccacaccctcagatatccatactcgctattaaacaaaataaattacataaataattttgatacctttcaacttcctaagcaaaaattgttgata---- 28582392  T
Q  259 ttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
     |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| | || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28582391 ctgtgag-tgttattagttattacatgactagtcaaatatgcattacactcctttaaaagaaagtgaacgtgg 28582320  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 35166981 - 35167151
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||     
T  35166981 ggataaaatccaccacagacacaaagcggataccttaatagatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaattgatacggatg 35167080  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataacct 217  Q
     |||||||||| ||| ||   |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35167081 tggatttaatggtat-ctgcaccgcggatatccatacccgctactaaactgagtaaattacataagtaacct 35167151  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 10408637 - 10408820
Alignment:
Q  47 gataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatac 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | || || ||| |    
T  10408637 gataaaatccgccacggaaacggagcggataccttaatggatattcatggataaaataaacggatatttcaactacccgctaaatagtagatacagatgc 10408736  T
Q  147 ggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
     |||||| ||  ||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10408737 agatttattggcatccgcatccgcagatatccatacccactattaaaccgagtaaattacataaataacgttaataccattcaa 10408820  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10788911 - 10788736
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||  ||     
T  10788911 ggataaaattcgccacgggcacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacgaat-ttttaactacctgctaattaatggatacaaatg 10788813  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
     |||||||||  |||||  |||||  || |||| ||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  10788812 tggatttaatagtatccacacccgaggagatccatattcgctattaaaccaactaaattacataaataacctcaata 10788736  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8577127 - 8576998
Alignment:
Q  93 atggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaa 192  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||  |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8577127 atggataaaataaacggtttttttaaccaaccgttaattaatggatacagatgcagatttaatggtatccacacccgtggatatccatacccgctattaa 8577028  T
Q  193 actgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    || || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  8577027 accgagtaaattatataaataacctcaata 8576998  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 8965 - 9149
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  8965 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatggatacggatg 9064  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    | ||||||||| |||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  9065 ctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 9149  T

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Target: chr3 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12149420 - 12149236
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  12149420 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatggatacggatg 12149321  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    | ||||||||| |||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  12149320 ctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaatatccttaatgcctttcaa 12149236  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13826495 - 13826311
Alignment:
Q  38 gcacccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatgga 137  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  13826495 gcacccgtagataaaatccgccacgggcacggagcagatacattaatagatatccatggataaaataaacggattttttaactactcgctaattaatgga 13826396  T
Q  138 aacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
     | |||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||    
T  13826395 tatggatacagatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacattaataacctcaata 13826311  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 331
Target Start/End: Original strand, 48251182 - 48251462
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||  | ||||    
T  48251182 ggataaaatctgtcacggatacggagcagatactttaatggatatctatggataaaataaatggatattttaattaactgctaattaatggatgcagata 48251281  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaa 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || || ||  ||||| ||||    
T  48251282 cggatttaatggtatccctacccgcgtatatccatatccgctattaaaccgagtaaattagataaataaccttaataccattaaacttcctaagcaaaaa 48251381  T
Q  246 acttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    |||||| || |||      | ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||    
T  48251382 acttcgataatgc-----gggtgttattagttattatacgactgttcaaatttgtatcacgctcctctaaaagggagtgaaagtgg 48251462  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 25874396 - 25874574
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggata--aaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacgga 143  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25874396 ggataaaatccgtcacgagcacggagcggataccttaatggatatccatggatataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacgga 25874495  T
Q  144 tacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    | ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25874496 tgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgttattaaaccgaatatattacataaataacctcaata 25874574  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 27926328 - 27926512
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27926328 ggataaaatccgccacggacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaatagattttttaactacccgctaattaatggatacggatg 27926427  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaa 230  Q
    ||||||||||| |||||  ||  || ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27926428 cggatttaatggtatccacacatgcggatatctatatgcgctattaaaccgaataaattatgtaaataacctcaataccattcaa 27926512  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 3778672 - 3778847
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||     
T  3778672 ggataaaatccgccacgggcacggagcggataccttaatggatatccatgaataaaataaacagattttttaactatccgctaattaatggatacagatg 3778771  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||| | || || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3778772 cggatttaacggtatccatacccgcggatattcata-ccactattaaacagagtaaattacataaataaccttaata 3778847  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5295649 - 5295481
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| || |||     
T  5295649 ggataaaatctaccacgggcacggagcggataccttaatggatatccatgaataaaataaacgtattttttaactacccactaattaatggatacagatg 5295550  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataa 214  Q
    | ||||||||| ||||   ||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5295549 cagatttaatggtatctacacctgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaataa 5295481  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21288527 - 21288357
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttga-ctacccgctaattaatggaaacggat 144  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||    
T  21288527 ggataaaatacgtcacgggcacggagcggatatcttaatggatatctatggataaaataaacggatttttttaactacccgctaattaatggatagggat 21288428  T
Q  145 acggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataac 215  Q
     ||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21288427 gcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccaagtaaattacataaataac 21288357  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36585097 - 36585000
Alignment:
Q  109 gatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattac 206  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36585097 gatattttatctacccgctaattaatggatacggatgcagattaaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaaccgaataaattac 36585000  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26188184 - 26188022
Alignment:
Q  164 tacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagctaaaaacttcggtattgcttgtg 263  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| | | | |||||  |       
T  26188184 tacccgcagatatccatacccactattatactgagtaaattacataaataacattaatacccttcaactttctaagcaaaaatcctagctattgagt--- 26188088  T
Q  264 agttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
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T  26188087 --ttgttattagttgttacacgactgttcaaatctgtattacgctcttttaaaaggatgtgaaagtgg 26188022  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36584621 - 36584553
Alignment:
Q  263 gagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactcctttaaaagatagtgaaagtgg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36584621 gagttgttattagttattacaccacttttcaagtttgtatcgcactcttttaaaaggtagtgaaagtgg 36584553  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 27519860 - 27520000
Alignment:
Q  75 atactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggatacggatttaatgatatccttacccgcagat 174  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | || || ||||| | ||||  |||||| |||  ||||  | |||| |||    
T  27519860 atactttaatggacatccatggataaaataaacgaatattttaactagctgttattttatggatatggatgtggatttcatgggatccgcatccgcggat 27519959  T
Q  175 atccttacccgctattaaactgaataaattacataaataac 215  Q
    |||| | |||| ||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  27519960 atccgtgcccgttattaaattaagtaaaatacataaataac 27520000  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36585147 - 36585102
Alignment:
Q  44 gtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggata 89  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36585147 gtggataaaatctgccacggacatggagcggatactttaatggata 36585102  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24435376 - 24435316
Alignment:
Q  52 aatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggata 112  Q
    |||||| || ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  24435376 aatccatcatggacacggagcgggtagttaaacgggtatccatgggtataataaacggata 24435316  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26749217 - 26749153
Alignment:
Q  73 ggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatgga 137  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  |||| ||||||||    
T  26749217 ggataccttaatggatatcaatggataaaataaatggatatttcaactacttgctatttaatgga 26749153  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 66978 - 66717
Alignment:
Q  42 ccgtggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacg 141  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | | |    
T  66978 ccgtggataaaatctgtcacagacacggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatattttatctaccctctaattgatgaatatg 66879  T
Q  142 gatacggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaagct 241  Q
    |||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||| | ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||     
T  66878 gatacatatttaatggtatccctacccgtggatattcataccag-tattaaaccaaataaattacat-aatacccttaatacttttcaaattcctaagca 66781  T
Q  242 aaaaacttcggtattgcttgtgagttgttattagttattacacggctattcaagtttgtattacactc 309  Q
    |||||  | ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||    
T  66780 aaaaatattgg--ttg--tgtgagttattattagttattacacgatttttcaaatatgtattacactc 66717  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 6640 - 6816
Alignment:
Q  46 ggataaaatccaccacggacacggagcggatactttaacggatatccatggataaaataaacggatattttgactacccgctaattaatggaaacggata 145  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| || |||  |||| | |||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||  ||||||||||| || |||     
T  6640 ggataaaatccgtcacgggcacggaacgaatatcttaatgaatatccatggataaaataaatggattttctaactaaccattaattaatggatacagatg 6739  T
Q  146 cggatttaatgatatccttacccgcagatatccttacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaata 222  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  6740 cggatttaatggtatccacacccgtggatattcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaata 6816  T

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