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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF13252_low_3 (Length: 390)
Name: NF13252_low_3
Description: NF13252
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF13252_low_3 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12931043 - 12930676
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn---tgaa |
116 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
12931043 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaa |
12930944 |
T |
|
| Q |
117 |
caccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930943 |
caccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattct |
12930844 |
T |
|
| Q |
217 |
ctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
316 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930843 |
ctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
12930744 |
T |
|
| Q |
317 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12930743 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
12930676 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12935786 - 12935422
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn---tgaacac |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12935786 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
12935687 |
T |
|
| Q |
120 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
219 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12935686 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
12935587 |
T |
|
| Q |
220 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935586 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
12935487 |
T |
|
| Q |
320 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12935486 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
12935422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Original strand, 26504985 - 26505055
Alignment:
| Q |
157 |
aaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctct |
227 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
26504985 |
aaaaccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatattctttcaactctct |
26505055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15589060 - 15588948
Alignment:
| Q |
113 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaata |
212 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
15589060 |
tgaacatcaatatttattttgaaaaaccctctattaatgagagaaaaatcaagtgacaaactctaaaaaatatttcactttatcaaacaatattacaaca |
15588961 |
T |
|
| Q |
213 |
ttctctccactct |
225 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
15588960 |
ttttctccactct |
15588948 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 26504850 - 26504895
Alignment:
| Q |
31 |
tcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa |
76 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26504850 |
tcgacgagtttaatggaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaa |
26504895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14179057 - 14178691
Alignment:
| Q |
22 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tgaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14179057 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaac |
14178958 |
T |
|
| Q |
118 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178957 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
14178858 |
T |
|
| Q |
218 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178857 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
14178758 |
T |
|
| Q |
318 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14178757 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
14178691 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14174305 - 14173937
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14174305 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaatga |
14174206 |
T |
|
| Q |
116 |
acaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattc |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174205 |
acaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattc |
14174106 |
T |
|
| Q |
216 |
tctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174105 |
tctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
14174006 |
T |
|
| Q |
316 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14174005 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
14173937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 384
Target Start/End: Original strand, 28611565 - 28611933
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tga |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28611565 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatga |
28611664 |
T |
|
| Q |
116 |
acaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattc |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611665 |
acaccaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattc |
28611764 |
T |
|
| Q |
216 |
tctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611765 |
tctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttataga |
28611864 |
T |
|
| Q |
316 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28611865 |
gatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
28611933 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 28606805 - 28607171
Alignment:
| Q |
22 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tgaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
28606805 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaattaac |
28606904 |
T |
|
| Q |
118 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606905 |
accaatatttaacgtgaaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
28607004 |
T |
|
| Q |
218 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607005 |
tccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagaga |
28607104 |
T |
|
| Q |
318 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28607105 |
tgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
28607171 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44161949 - 44161586
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tgaaca |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44161949 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
44161850 |
T |
|
| Q |
119 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44161849 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctct |
44161752 |
T |
|
| Q |
219 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161751 |
ccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
44161652 |
T |
|
| Q |
319 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
44161651 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcac |
44161586 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11104829 - 11104477
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn-tgaacacca |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11104829 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaatgaacacca |
11104730 |
T |
|
| Q |
122 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
221 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104729 |
atatttaacatagaaaatcctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctcca |
11104631 |
T |
|
| Q |
222 |
ctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgat |
321 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104630 |
ctctcttacacaca-aagagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatgat |
11104532 |
T |
|
| Q |
322 |
acccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattttt |
376 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104531 |
atccacccggtgtatttttcctacactctctggatttactcaacactctattttt |
11104477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Original strand, 48826701 - 48827000
Alignment:
| Q |
22 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnt--gaacac |
119 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48826701 |
ttgttgggatcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaagaacac |
48826798 |
T |
|
| Q |
120 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826799 |
caatatttaacgtggaaaatcctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctt |
48826897 |
T |
|
| Q |
220 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
319 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826898 |
cgctctcttacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
48826997 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726446
Alignment:
| Q |
134 |
gaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacaca |
233 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctcttaccga |
24726387 |
T |
|
| Q |
234 |
cacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatttta |
295 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
24726388 |
cac--gagatacactatattgttttccgtgagacc-actcctattcaaatgttattatttta |
24726446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
| Q |
118 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708155 |
accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc |
48708254 |
T |
|
| Q |
218 |
tc |
219 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
48708255 |
tc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34907503 - 34907139
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn---tgaacac |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
34907503 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacac |
34907404 |
T |
|
| Q |
120 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
219 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907403 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
34907304 |
T |
|
| Q |
220 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34907303 |
cactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatg |
34907204 |
T |
|
| Q |
320 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34907203 |
atacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
34907139 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 37040426 - 37040791
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tgaaca |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37040426 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaaca |
37040525 |
T |
|
| Q |
119 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctct |
218 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37040526 |
ccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttct |
37040625 |
T |
|
| Q |
219 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
318 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040626 |
ccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagat |
37040725 |
T |
|
| Q |
319 |
gatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37040726 |
gatacccacccgatgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcac |
37040791 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15290597 - 15290243
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa-gagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn----tg |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
15290597 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaattgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaatg |
15290498 |
T |
|
| Q |
115 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290497 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatatt |
15290398 |
T |
|
| Q |
215 |
ctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatag |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290397 |
ctctccactctcttacacacacaagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctattattt--cagcacctagaagttatag |
15290301 |
T |
|
| Q |
315 |
agatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatt |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15290300 |
agatgatacccacccggtgtattttt-ccacactttctggatttagtcaacactctatt |
15290243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12099361 - 12099060
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn-tgaacacca |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||| | || |
|
|
| T |
12099361 |
tgttgggctcgacgagtttaacgcgagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaatgaaaagca |
12099262 |
T |
|
| Q |
122 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
221 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099261 |
atattttacgtgaaaaaccctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctcca |
12099162 |
T |
|
| Q |
222 |
ctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgat |
321 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12099161 |
ctctcttacacgcacaagagacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatgat |
12099062 |
T |
|
| Q |
322 |
ac |
323 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
12099061 |
ac |
12099060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12082021
Alignment:
| Q |
170 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacct |
269 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaaagagatacaatatagtgtttctaatgagactc |
12082129 |
T |
|
| Q |
270 |
acttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactc |
369 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12082128 |
gctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacactc |
12082030 |
T |
|
| Q |
370 |
tatttttct |
378 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
12082029 |
taattttct |
12082021 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 2757307 - 2757448
Alignment:
| Q |
115 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||| |||| || | |||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||| || |||| |
|
|
| T |
2757307 |
aacaccaatatttaatatgaaaacccctttaatgcttaaggaaaaaccatgagacaaattttgaaaa-tattccactatatttaaaaatattgcactatt |
2757405 |
T |
|
| Q |
215 |
ctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgttt |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757406 |
ctctccactctctttcacactcaagagatacaatatagtgttt |
2757448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12084751 - 12084669
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
12084751 |
tgttgggctcaacgagcttaacacgagggtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagc |
12084669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 2757210 - 2757273
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattg |
83 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
2757210 |
acttgttgtgttcaacgagcttattacaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaattg |
2757273 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Original strand, 29106878 - 29107224
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn-tgaacacca |
121 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29106878 |
tgttgggatcgaggagcttaatgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaatgaacacca |
29106977 |
T |
|
| Q |
122 |
atatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106978 |
atatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcca |
29107077 |
T |
|
| Q |
222 |
ctctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgat |
321 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29107078 |
ctctcttacacacacaagagatacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatgat |
29107176 |
T |
|
| Q |
322 |
a-cccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacact |
368 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29107177 |
accccacccaatgtatttttcccacactctctggatttactcaacact |
29107224 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 22 - 376
Target Start/End: Original strand, 42910992 - 42911346
Alignment:
| Q |
22 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn-tgaacacc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
42910992 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaatgaacacc |
42911091 |
T |
|
| Q |
121 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctcc |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911092 |
aatatttaacatggaaaaccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctcc |
42911190 |
T |
|
| Q |
221 |
actctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatga |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911191 |
actctctcacacacacaaaagatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatga |
42911290 |
T |
|
| Q |
321 |
tacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctattttt |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911291 |
tacccacccagtgtattttttccacactctctggatttactcaacactctattttt |
42911346 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 38994696 - 38994779
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggta |
103 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38994696 |
acttgttgggcttgacgatcttaatgctagtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggta |
38994779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Original strand, 38997230 - 38997320
Alignment:
| Q |
114 |
gaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
204 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997230 |
gaacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Original strand, 38997134 - 38997193
Alignment:
| Q |
19 |
tacttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaga |
78 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38997134 |
tacttgttgggttcgaagggcttaatgcgggtgtaaattaaaattccagaatccaaaaga |
38997193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8539549 - 8539183
Alignment:
| Q |
22 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnn--tgaacac |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8539549 |
ttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaatgaacat |
8539450 |
T |
|
| Q |
120 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctc |
219 |
Q |
| |
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| T |
8539449 |
caatatttaacgtggaaaaccctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctc |
8539350 |
T |
|
| Q |
220 |
cactctctcacacacacaagagatacaa---tatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagag |
316 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
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| T |
8539349 |
cactctcttacacacacaagagatacaatattatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagag |
8539251 |
T |
|
| Q |
317 |
atgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcttctcac |
384 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |
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| T |
8539250 |
atgatacccatccgatgtatttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcac |
8539183 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 239 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302168
Alignment:
| Q |
239 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
338 |
Q |
| |
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| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
339 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttc |
377 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttc |
51302168 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 51303022 - 51302937
Alignment:
| Q |
20 |
acttgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
105 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
51303022 |
acttgttgggatcgacgagcttaatgcaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 51302344 - 51302308
Alignment:
| Q |
113 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac |
149 |
Q |
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| T |
51302344 |
tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaatac |
51302308 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Original strand, 2100199 - 2100379
Alignment:
| Q |
23 |
tgttgggctcgacgagcttaacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattgga-tcttgcagcgcagcggtagcnnnnnnnt-gaacacc |
120 |
Q |
| |
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| T |
2100199 |
tgttgggctcgacgagcttaacacaagtgtaaattaaaattccaaaattcataagagatttgaattttgcagcacaacgataatgataaaattgaacatc |
2100298 |
T |
|
| Q |
121 |
aatatttaacgtggaaaaccctctaatactgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
204 |
Q |
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| T |
2100299 |
aatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaaac---ggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 245
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100771
Alignment:
| Q |
197 |
aaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatac |
245 |
Q |
| |
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| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctccactctcttacatacacaagagatac |
2100771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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