View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF13256_high_6 (Length: 300)

Name: NF13256_high_6
Description: NF13256
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF13256_high_6
NF13256_high_6
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (18-293)||(26154769-26155044)
chr7 (50-293)||(26178681-26178924)
chr7 (59-275)||(19103871-19104087)
chr7 (70-293)||(26301429-26301652)
chr7 (59-293)||(26082337-26082571)
chr7 (59-293)||(26106124-26106358)
chr7 (56-293)||(26190869-26191106)
chr7 (89-293)||(26203531-26203735)
chr7 (50-266)||(26297043-26297259)
chr7 (55-293)||(26128164-26128408)
chr7 (26-287)||(26241971-26242232)
chr7 (95-293)||(26223175-26223373)
chr7 (26-266)||(26250410-26250659)
chr7 (56-188)||(26184876-26185008)
chr7 (95-197)||(26207078-26207180)
chr7 (120-209)||(26259567-26259656)
chr7 (95-197)||(26226613-26226715)
chr7 (205-266)||(26240040-26240101)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (60-290)||(44902849-44903079)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Original strand, 26154769 - 26155044
Alignment:
Q  18 acctacaattaaatatcaactctagcagtaatagaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatcca 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26154769 acctacaactaaatatcaactctagcagtaatagaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataaccaacttcatgtaacttttcttccacatcca 26154868  T
Q  118 agtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26154869 agtcctggccatatgaatcctatgattgacacagctagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacat 26154968  T
Q  218 tccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26154969 tccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcagctca 26155044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 293
Target Start/End: Original strand, 26178681 - 26178924
Alignment:
Q  50 agaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  26178681 agaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgttgtttttcttccatttccaactcctggtcatatgattcctatgatagacac 26178780  T
Q  150 agcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattca 249  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26178781 agcaagactattcgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcgctacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacagtgacttcaattca 26178880  T
Q  250 ggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26178881 ggatactccatcaaaactcatcttatacagttcccttcagctca 26178924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19104087 - 19103871
Alignment:
Q  59 caacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagact 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19104087 caacaatggaatctcaacaatcccataaccaacttcatgtaacttttcttccatatccaactccaggccatatgattcctatgatagacacagcaagact 19103988  T
Q  159 atttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccct 258  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19103987 atttgccaaacatggtgttaatgttacaatcattgctactcatgccaatgcttccacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggatactcc 19103888  T
Q  259 atcaaaacacatcttat 275  Q
    |||||||| || |||||    
T  19103887 atcaaaactcaacttat 19103871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 26301429 - 26301652
Alignment:
Q  70 tctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagc 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  26301429 tctcaacaatccaataaccaacttcatgtaatttttcttccatttccaactcctggtcatatgaatcctatgatagacacagcaagactatttgccaaac 26301528  T
Q  170 atggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacaca 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26301529 atggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaatctatagacgatgacttcaattcaggataccctattaaaactca 26301628  T
Q  270 tcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
     |||||  ||||||||||| ||||    
T  26301629 acttattcagttcccttcagctca 26301652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Original strand, 26082337 - 26082571
Alignment:
Q  59 caacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagact 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26082337 caacaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagact 26082436  T
Q  159 atttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccct 258  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  26082437 atttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacatttcaaaaagccattgacagtgacttcaattcaggatactcc 26082536  T
Q  259 atcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||||||    
T  26082537 atcaaaactcagcttattcagttcccgtcatctca 26082571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Original strand, 26106124 - 26106358
Alignment:
Q  59 caacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagact 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26106124 caacaatggagtctcaacaatctcataaccaacttcagataatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatccaatgatagccacagcaagact 26106223  T
Q  159 atttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccct 258  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  26106224 atttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaatgcttcaacatttcaaaaagccattgacagtgacttcaattcaggatactcc 26106323  T
Q  259 atcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||||||    
T  26106324 atcaaaactcagcttattcagttcccgtcatctca 26106358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 293
Target Start/End: Original strand, 26190869 - 26191106
Alignment:
Q  56 aagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaag 155  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26190869 aagcaataatgaaatctcaacaatcccataacccacttcatgtaacttttcttccatttccatctcctggccatatgattcctatgattgacactgcaag 26190968  T
Q  156 actatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggatac 255  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  26190969 actattagccaaacatggtgttaatgtaaccatcattactacacatgccaatgcttcaacattccaaaaaaccatagacagtgacttcagtttaggatac 26191068  T
Q  256 cctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
     | |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  26191069 tccatcaaaactcatcttattgaattcccttcagctca 26191106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 293
Target Start/End: Original strand, 26203531 - 26203735
Alignment:
Q  89 aacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccat 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26203531 aactgcatgtaacttttcttccatttccaactcctggccatatgattcctatgatagacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccat 26203630  T
Q  189 catcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttca 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  26203631 catcactacacatgctaatgcttcaaccttccaaaaagcgatagacagtgacttcaattcaggatactccatcaagactcatcttattcagttcccttca 26203730  T
Q  289 tctca 293  Q
     ||||    
T  26203731 gctca 26203735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Original strand, 26297043 - 26297259
Alignment:
Q  50 agaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| |||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26297043 agaaccaagcaacaatggagtctcaacaatccaataacaaacttcatgttgtctttcttccatatccatctgctggtcatatgaaccctatgattgacac 26297142  T
Q  150 agcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattca 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| || |    
T  26297143 agcaagactatttgcaaagcatggtgttgatgtaaccatcatcactacacatgccaatgcttcaaggttccaaaaatccatagatagtgacatcagttta 26297242  T
Q  250 ggataccctatcaaaac 266  Q
    |||||| | ||||||||    
T  26297243 ggatactccatcaaaac 26297259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 55 - 293
Target Start/End: Original strand, 26128164 - 26128408
Alignment:
Q  55 caagcaacaatggagtctcaa------caatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgaca 148  Q
    |||||||||||||||||||||      |||| ||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26128164 caagcaacaatggagtctcaatctctgcaattccataaccaacttcatgttgtttttctttcatatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgaca 26128263  T
Q  149 cagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattc 248  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||     
T  26128264 cagcaagactatttgccatgcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgctaatgcctcaacattccaaaaagccatagacagtgacaccagttt 26128363  T
Q  249 aggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||  ||||||||||| ||||    
T  26128364 aggatactccattaaaactcaacttattcagttcccttcagctca 26128408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 287
Target Start/End: Original strand, 26241971 - 26242232
Alignment:
Q  26 ttaaatatcaactctagcagtaatagaaccaagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctgg 125  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  |  |||    
T  26241971 ttaaatatcaattctcctagtaatagaaccaagcaacaatggaatctcaacaatcccataacaaacttcatgttgtttttcttccatatccagctattgg 26242070  T
Q  126 ccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaa 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  26242071 ccatatgaaccctatgattgacactgcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatacttacacatgccaatgcttcaaggttccaaaaa 26242170  T
Q  226 tccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttc 287  Q
    |||||||| |||||  ||| || ||||||| | |||||||| || ||| |  ||||||||||    
T  26242171 tccatagatagtgatgtcagtttaggatactccatcaaaactcaacttcttcagttcccttc 26242232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 293
Target Start/End: Original strand, 26223175 - 26223373
Alignment:
Q  95 atgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcac 194  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26223175 atgtcacttttcttccatttccaactcctggtcatatgatttcaatgattgacacagcaagactatttgccaaacatggtgttaatgttaccatcatcac 26223274  T
Q  195 tacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaacacatcttatcaagttcccttcatctca 293  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26223275 tacacatgccaatgcttccacattccaaaaatctgtagactgtgacttcaattcaggatactccatcaaaactcatcttatacagttcccttcagctca 26223373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 26250410 - 26250659
Alignment:
Q  26 ttaaatatcaactctagcagtaatagaaccaagcaacaatggagtctc---------aacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatcc 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||| ||||    
T  26250410 ttaaatatcaactctcttagtaatagaaccaagcaacaatggattctcctcaatctcaacaatccaataaccaacttcatgttgtttttcttccatatcc 26250509  T
Q  117 aagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaaca 216  Q
    |  | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  26250510 atctgctggtcatatgaaccctatgattgacactgcaagactatttgctaaacatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgctaatgcttcaagg 26250609  T
Q  217 ttccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaac 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| | ||||||||    
T  26250610 ttccaaaaatccatagatagtgacatcagtttaggatactccatcaaaac 26250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Original strand, 26184876 - 26185008
Alignment:
Q  56 aagcaacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaag 155  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  26184876 aagcaacaatggactcccaataatcccataacaaacttcatgtaatttttgttccatatccaactcctggccatatgaatcccatgatagccacatcaag 26184975  T
Q  156 actatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26184976 actatttgcaaagcatggtgttaatgtcaccat 26185008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 197
Target Start/End: Original strand, 26207078 - 26207180
Alignment:
Q  95 atgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcac 194  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26207078 atgttacttttctaccatatccaactcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcac 26207177  T
Q  195 tac 197  Q
    |||    
T  26207178 tac 26207180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 209
Target Start/End: Original strand, 26259567 - 26259656
Alignment:
Q  120 tcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26259567 tcctggccatatgaaccctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtattaatgttaccattatcactacacatgccaatgc 26259656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 197
Target Start/End: Original strand, 26226613 - 26226715
Alignment:
Q  95 atgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagactatttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcac 194  Q
    |||| |||||||| ||||||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26226613 atgttacttttctaccacatgtaactcctggtcatatgaaccctatgattgacacagcaaggctatttgcaaagcatggtgttgatgttaccatcatcac 26226712  T
Q  195 tac 197  Q
    |||    
T  26226713 tac 26226715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Original strand, 26240040 - 26240101
Alignment:
Q  205 aatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggataccctatcaaaac 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26240040 aatgcttcaacattccaaaaagccatagagagtgacttcaattcagcataccctattaaaac 26240101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 290
Target Start/End: Original strand, 44902849 - 44903079
Alignment:
Q  60 aacaatggagtctcaacaatcccataacaaacttcatgtaacttttcttccacatccaagtcctggccatatgaatcctatgattgacacagcaagacta 159  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  44902849 aacaatggattctcaacaatccaataaccaacttcatgtagtttttcttccatatccaactcctggccatatgattcccatggtagacacagcaagacta 44902948  T
Q  160 tttgcaaagcatggtgttaatgtgaccatcatcactacgcatgctaatgcttcaacattccaaaaatccatagacagtgacttcaattcaggatacccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44902949 tttgcaaagcatggtgttaatgttaccatcatcactacacatgccaacgcttcaactttccaagaatccatagacagtgacttcaattcaggatactcta 44903048  T
Q  260 tcaaaacacatcttatcaagttcccttcatc 290  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  44903049 tcaaaactcagcttattcagttcccttcatc 44903079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University